2008,28(9) 杜丽等 : 从大容量噬菌体抗体库中筛选抗 DNAPKcs 人源单链抗体 2 的研究, 期望筛选到具有应用前景的治疗药物, 研究还处于实验室阶段随着人源抗体制备技术的发展, 治疗性单抗已成为发展最快的生物药物之一, 是生物制药的热点, 针对恶性肿瘤的治疗性抗体是开发最活跃的领域但

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1 中国生物工程杂志 ChinaBiotechnology,2008,28(9):20~26 从大容量噬菌体抗体库中筛选抗 DNAPKcs 杜 丽 杨陟华 人源单链抗体 2 周丽君 徐勤枝 潘秀颉 张士猛 王 朱茂祥 豫 2 王欲晓 周平坤 ( 军事医学科学院放射与辐射医学研究所 北京 00850) (2 中国人民解放军海军总医院中心实验室 北京 00037) 摘要目的 : 从单链大容量噬菌体抗体库中筛选特异性的抗 DNAPKcs 的人源抗体, 用于肿瘤治疗或诊断目的方法 : 经抗原性分析及 BLAST 比对, 选定人 DNAPKcs 蛋白中抗原性高且与其他蛋白没有同源性的片段, 进行原核表达及纯化后将其固定在抗原管上, 通过 4 轮 吸附 - 洗脱 - 扩增 过程从大容量抗体库中筛选特异性抗体, 转化 HB25 菌, 制备抗 DNAPKcs 的可溶性单链抗体 ;ELISA 检测抗原 抗体结合活性结果 : 经生物信息学分析, 确定抗原性高且与其他蛋白没有同源性的 DNAPKcs 片段 DPK3(250 个 AA) DPK4(257 个 AA) 经过 4 轮筛选, 获得 26 个特异性结合 DPK3 及 3 个特异结合 DPK4 的克隆, 指纹分析分别有 5 种和 2 种不同的可变区片段 ; 成功制备了可溶性抗体并做了抗原结合活性鉴定结论 : 利用单链大容量抗体库获得抗 DNA PKcs 的噬菌体抗体基因并且成功制备成可溶性抗体, 为今后的研究和应用奠定了基础关键词大容量噬菌体抗体库 DNA 依赖蛋白激酶催化亚单位单链抗体中图分类号 Q5 DNA 依赖蛋白激酶催化亚单位 (DNA dependent proteinkinasecatalyticsubunit,dnapkcs) 与 Ku70, Ku80 共同构成 DNA 依赖的蛋白激酶复合物 (DNA PK), 其中 DNAPKcs 是参与 DNA 双链断裂损伤修复的直接效应亚单位 [], 由 428 个氨基酸残基组成, 相对分子量约 470kDa DNAPKcs 与 ATM,ATR 等同属于磷脂酰肌醇 3 激酶相关蛋白激酶 (phosphoinositide3 kinaserelatedproteinkinase,pi3k) 家族成员, 具有丝氨酸 / 苏氨酸激酶活性, 在电离辐射所引起的 DNA 双链断裂 (doublestrandbreaks,dsbs) 的非同源末端连接 (nonhomologousendjoining,nhej) 修复中起主要作用, 而且还参与 V(D)J 重组过程,DNAPKcs 缺陷细胞对电离辐射敏感 [,2] 收稿日期 : 修回日期 : 国家 973 计划 (2007CB94603) 国家自然科学基金 ( ) 北京市自然科学基金 ( ) 资助项目 并列第一作者 通讯作者, 电子信箱 :zhoupk@nic.bmi.ac.cn 保持一定水平的 DNAPKcs 是维护细胞基因组稳定性所必需的, 但过高量 DNAPKcs 特别是癌细胞中过量表达 DNAPKcs, 会提高癌细胞对基因毒性抗癌药物或放射线产生抗性, 不利于肿瘤的治疗近年来发现 DNAPKcs 确实在某些类型癌组织细胞中普遍高表达 [3,4], 而且与癌组织恶性程度相关我们实验室用特异的 RNA 干扰技术成功的使 DNAPKcs 蛋白表达下降, 获得了 DNAPKcs 表达沉默且对 γ 射线敏感的稳定细胞模型同时发现,DNAPKcs 表达沉默细胞的生长速度和接种裸鼠后形成肿瘤的生长速度减慢而且, 抑制 DNAPKcs 表达和活性, 导致癌基因 cmyc 蛋白表达水平显著降低 [5,6] 表明 DNAPKcs 除通过其 DNA 修复功能影响细胞的辐射敏感性外, 还可能与肿瘤细胞增殖有关这些都提示 DNAPKcs 在肿瘤发生与细胞增殖分化过程中具有重要作用, 是一个肿瘤治疗的理想靶标或肿瘤标志物 [2,6] 目前国内外已开展针对 DNAPKcs 抑制剂 sirna

2 2008,28(9) 杜丽等 : 从大容量噬菌体抗体库中筛选抗 DNAPKcs 人源单链抗体 2 的研究, 期望筛选到具有应用前景的治疗药物, 研究还处于实验室阶段随着人源抗体制备技术的发展, 治疗性单抗已成为发展最快的生物药物之一, 是生物制药的热点, 针对恶性肿瘤的治疗性抗体是开发最活跃的领域但针对胞内 DNAPKcs 的人源抗体研究, 国内外还未见报道 材料与方法. 材料.. 细胞 菌株和质粒人宫颈癌上皮细胞 (HeLa) 为本室保存大肠杆菌菌株感受态 DH5α,BL2(DE3) 购自天根公司 ;XLBlue,Bs365, 无琥珀抑制子的大肠杆菌菌株 HB25 和 VCSM3 为海军总医院中心实验科保存 ; 载体 pgemteasy 及 pet22b(+) 分别购自 Promega 公司及 Novagen 公司..2 工具酶及试剂限制性内切酶 T4DNA 连接酶和 TaqDNA 聚合酶购自 NewEnglandBiolab 公司, 质粒提取和 PCR 产物回收试剂盒购自天根生物技术公司, HisTrapHP 亲和柱购自 Pharmacia 公司 MMLV 逆转录酶购自 Promega 公司异丙基硫代 βd 半乳糖苷 (IPTG) 氧化型谷胱甘肽 (GSSG) 及还原性谷胱甘肽 (GSH) 为 Merk 公司产品 ; 蛋白分子量标准购自上海生物化学研究所卵清蛋白和铁蛋白购自 Sigma 公司 ; 辣根过氧化物酶标记的羊抗鼠 IgG 兔抗鼠 IgG 为 Santa Cruz 公司产品 ;PCR 引物的合成以及 DNA 测序均由上海英骏生物技术有限公司承担..3 引物的设计与合成根据人 DNAPKcscDNA 序列及载体 pet22b(+) 酶切为点, 针对抗原性较高的两段片段 (AA96~220 及 AA226~257) 分别设计并合成两对引物, 引物 P,P2 用于克隆 DPK3 区, 引物 P3,P4 用于克隆 DPK4 区 P:5 CGCATATGTTTTAC CAAGGTTTTCTG3 ( 引入 NdeⅠ 酶切位点 );P2:5 CGCCTCGAGCACTTCATCTTTAGGGAC3 ( 引入 XhoⅠ 酶切位点 );P3:5 CGCATATGTCCGGTAAAGATCCTA AT3 ( 引入 NdeⅠ 酶切位点 );P4:5 CGCCTCGAGAAG TCCAGGGTTCTCATC3 ( 引入 XhoⅠ 酶切位点 ).2 方法.2. 抗原性分析及 BLAST 比对依据 NCBI 编号 AAB39925 (DNAdependentprotein kinase catalytic subunit[homosapiens]) 的蛋白序列, 利用生物分析软件 Biosun 中抗原表位分析程序, 采用包括亲水性 柔韧性 抗原性和电荷分布等多参数预测进行抗原性分析, 将所分析得到的抗原性高的基因序列进行 BLAST 比对选取抗原性高且与其他蛋白没有同源性的蛋白片段进行表达.2.2 细胞培养 HeLa 细胞以 0 5 接种于含 0% 胎牛血清的 DMEM 培养液中,5%CO 2 /95% 空气,37 孵育培养.2.3 总 RNA 提取及 RTPCR 收集指数生长期细胞,Trizol 提取总 RNA 定量后,MMLV 逆转录酶合成 cdna 第一链以反转录获得的 cdna 为模板, 分别用两对引物 P,P2 和 P3,P4 对目的基因片段进行 PCR 扩增扩增反应的条件均为 :95 预变性 0min,94 变性 45s,55 退火 30s,72 延伸 min, 扩增 30 个循环 PCR 扩增产物经 % 琼脂糖凝胶电泳回收纯化.2.4 重组克隆载体 pgemtdpk3 和 pgemtdpk4 的构建与鉴定将纯化的两段 PCR 产物分别连入载体 pgemteasy, 构建重组质粒 pgemtdpk3 和 pgemt DPK4, 转化感受态 E.coliDH5α 后挑取阳性克隆, 用 NdeⅠ /XhoⅠ 双酶切质粒 pgemtdpk3 和 pgemt DPK4, 将两段目的基因片段分别回收纯化.2.5 重组表达载体 pet22bdpk3 和 pet22bdpk4 的构建与诱导表达将纯化的两段目的基因与经 Nde Ⅰ /XhoⅠ 双酶切的载体 pet22b( + ) 相连接, 分别构建重组表达载体 pet22bdpk3 和 pet22bdpk4, 转化感受态 E.coliDH5α 后挑取阳性克隆, 用 NdeⅠ /Xho Ⅰ 双酶切鉴定经测序分析正确的重组质粒 pet22b DPK3 和 pet22bdpk4 转化感受态 E.coliBL2 (DE3), 挑取阳性克隆, 接种于 0mlLB/Amp + 培养基中, 于 37 培养过夜按 % 比例将工程菌转接于 500ml 新鲜的 LB/Amp + 培养基中,37 培养至 OD 600 约 0.5 时, 加入终浓度为 0.8mmol/LIPTG 诱导表, 于 37 培养 3h 表达产物用 SDSPAGE 检测取 50ml 经诱导表达的工程菌超声裂解后, 分别取上清组分及沉淀组分 SDSPAGE 分析.2.6 融合蛋白 DPK3 和 DPK4 的纯化收获的工程菌经超声破菌后, 将沉淀物用 % TritonX00 漂洗后用缓冲液 A(2mol/L 尿素,20mmol/LPBS,pH7.5) 于 4 洗涤 2h, 离心收集沉淀经粗提的包涵体溶解于缓冲液 B(8mol/L 尿素,20 mmol/l PBS ph8.0, 0.5mol/LNaCl,20mmol/L 咪唑 ),4 搅拌 2h, 使其充分溶解离心后取上清以 ml/min 的流速上样于经缓冲液 B 平衡后的 HisTrapHP 亲和柱, 上样后以缓冲液 B 洗柱 ; 而后通过梯度混合器形成从缓冲液 B 到 C

3 22 中国生物工程杂志 ChinaBiotechnology Vol.28No (mol/l 尿素,20mmol/LPBSpH8.0,0.5mol/LNaCl, 3mmol/LGSH,0.3mmol/LGSSG,20mmol/L 咪唑 ), 尿素浓度从 8mol/L 到 mol/l 的线性梯度, 以 0.2ml/min 的流速, 总体积 50ml 缓冲液进行梯度柱上复性, 最后用缓冲液 D(20mmol/LPBSpH8.0,0.5mol/LNaCl, 500mmol/L 咪唑 ) 洗脱蛋白洗脱的蛋白再经 20 mmol/lpbs4 透析 24h, 每 4h 换液一次每一步留取样品以备 SDSPAGE 分析, 并用 Bradford 法测定蛋白质浓度 [7,8].2.7 工作库 ( 大容量噬菌体抗体库 ) 的制备原始噬菌体抗体库采用从成年健康人外周血及新生儿脐血分离淋巴细胞, 提取总 RNA, 通过 RTPCR 扩增出全套轻重链可变区基因, 克隆到噬菌体载体 pdf, 并通过 loxpcre 重组构建大容量抗体库, 最后以辅助噬菌体将抗体基因展示和表达在噬菌体表面, 构建成人源天然大容量噬菌体抗体库将原始噬菌体抗体库以 00: 的比例 (multiplicityofinfection,moi=00) 超感染 BS365 细胞,37 水浴保温 h, 使多副本载体进入同一个细胞再以 MOI 的比例感染对数生长期的 XLBlue 菌, 回收上清, 常规 PEG 沉淀, 获得工作库.2.8 抗 DNAPKcs 抗体的筛选将 DPK3 及 DPK4 分别用 0.05mol/L 碳酸盐缓冲液稀释至 00μg/ml 包被免疫管,4 过夜,3% 脱脂奶粉封闭 2h 后, 加入 ml 噬菌体抗体库 ( 约 0 3 个 CFU),37 孵育 2h, 以 0.05%Tween20PBS 洗 5 次, 用 2 种方法回收结合于固相的噬菌体抗体 : 先加入 ml 新鲜 XLBlue 菌直接感染,37 孵育 5min 后, 转入 0mlSB 培养液中 ; 再将细菌感染回收后的免疫管中加入 ml 甘氨酸 盐酸洗脱缓冲液 37 静置 5min 后洗脱回收将洗脱缓冲液吸出后, 加入 45μl2mol/LTris 中和, 再加入 2mlXLBlue 细胞 37 静置 5min 后, 加入 7ml 的 SB 培养液分别取 2 次回收的适量菌液铺盘测定 CFU, 其余细菌 37 培养 3h, 扩大体积到 00ml, 加入 pfu 辅助病毒 VCSM3,30 振荡培养过夜次日回收上清, 常规 PEG 沉淀, 所得次级噬菌体抗体库再进行下一轮的筛选.2.9 噬菌体抗体的制备从筛选第 3 第 4 的培养盘随机挑取集落在 2YT/Amp + 培养液中过夜, 第 2 天取 30μl 细菌到 mlsb 中,37 培养至对数生长期, 加入辅助病毒 VCSM3,30 培养过夜, 收取上清即得到噬菌体抗体.2.0 ELISA 试验鉴定噬菌体抗体将抗原稀释至 0μg/ml 包被 ELISA 板,h 后用 3% 脱脂奶粉封闭后加入噬菌体抗体液,37 孵育 h, 用 0.05%Tween20PBS 洗涤 3 次, 加入 HRP 抗 M3 鼠单抗进行反应, 洗涤后加入 OPD 底物显色, 读取 A 可变区基因的多样性分析 (DNA 指纹 ) 从筛选到的阳性克隆提取质粒, 以此为模板,PCR 扩增 ScFv 基因,PCR 产物用 CL6B 凝胶微型柱离心纯化, 再用限制性内切酶 MvaⅠ37 消化 2h, 取 0μl 进行聚丙烯酰胺凝胶电泳,EB 染色后根据酶谱分析其多样性.2.2 可溶性抗 DNAPKcs 抗体的表达及鉴定将 ELISA 鉴定出的特异性阳性的 DNAPKcs 噬菌体抗体一定倍数稀释后感染 E.coliHB25,37 孵育 5min 铺培养盘挑取单个集落在 2YT/Amp + 培养液中过夜, 第二天取 30μl 细菌到 mlsb 中,37 培养至对数生长期, 加入 IPTG 至 mmol/l,30 培养过夜, 收取上清即得到可溶性体抗体将抗原稀释至 0μg/ml 包被 ELISA 板,3% 脱脂奶粉封闭后加入噬菌体抗体液,37 孵育 h,0.05%tween20pbs 洗涤后加入抗 V5 二抗进行反应,0.05% Tween20PBS 洗涤后加入 HRP 鼠抗人 Fab,37 孵育 h 后 OPD 底物显色, 读取 A 竞争抑制性 ELISA 将抗原包被 ELISA 板, 3% 脱脂牛奶封闭后, 加入噬菌体抗体 25μl 的同时, 分别加入不同浓度 25μl 的 DNAPKcs 的抗原和无关抗原,37 孵育 2h,0.05% Tween20PBS 洗涤后, 加入 HRP 标记抗噬菌体抗体,37 孵育 h 后 OPD 显色读取 A 490 抑制率的计算 : 抑制率 (%)=( 对照 A 490 实验组 A490)/ 对照组 A % 对照组 A 490 为不加竞争抑制剂时所测值, 实验组为加抑制剂时所测值.2.4 抗体可变区基因测序挑取 DNA 指纹分析获得的克隆送上海英骏生物技术有限公司进行可变区基因序列测定.3 统计分析数据用 Mean±SD 表示, 分析用 t 检验进行分析 2 结果 2. 表达载体 pet22b(+)dpk3 和 pet22b(+) DPK4 的构建及鉴定应用 Biosun 软件及 Blast 比对, 我们得到 DNA PKcs 中抗原性较高且与其他蛋白无同源性的两段氨基酸片段 DPK3( 氨基酸 96~220,250 个 AA) 和 DPK4

4 8 8 9 杜 丽 等 从大容量噬菌体抗体库中筛选抗 DNA PK 人源单链抗体 氨基酸 7 7个 AA 根据其 DNA序列 分别设计了两对引物 RT PCR反应后经琼脂糖凝胶电 b 和 77b 泳分析 结果获得分子大小分别为 7 的特异扩增片段 DNA长度与预期值一致 图 将 PCR产物分别连接 T载体后 转化细菌获得质粒 DNA 经 N Xh Ⅰ Ⅰ双酶切初步鉴定后 再将基因片段分别 连接入经 N Xh b 构 Ⅰ Ⅰ双酶切的载体 ET ET b K和 ETb K 用 N 建表达载体 Ⅰ 图 酶切鉴定重组质粒 Xh Ⅰ双酶切重组质粒 可分别切出大小约为 7b和 F Th z y m u h 77b 的 DNA 片 段 与 预 期 值 相 符 表 明 K和 u m K两段基因均插入到载体 ET b 中 图 进一步做 DNA序列测定 确认插入的目的基因无碱基 P m ET b K b P m ET b K M M P m P m w hni Xh I DNA m z y m 突变和读码框移位 重组表达载体 ET b K和 ET b K的表达及蛋白纯化 将重组表达载体分别转化感受态 E BL DE PTG诱导表达后用 S DSPAGE分析结果表明 在分 经I 子量约为 D处有一条明显的蛋白质表达带 与预期的 分子量位置相符超声破菌后 分别取离心后的上清组分 图 RT PCR扩增 DNA PK 基因 DNA片段的电泳结果 F RT PCR u DNA PK DNA m K K M M C C K 7b K 77b 和沉淀组分进行 S DSPAGE分析 结果表明 融合蛋白 K及 K均以包涵体形式存在经过8m L尿素变 的可溶性蛋白 图 性及柱上复性后 得到纯度达 9 测定复性后的蛋白质浓度 融合蛋白 K的浓度约为 m m K的浓度约为 m m 图 K A 及 K B 的表达纯化 F Ex Pu K K E M M Ly m b b u Ly m b u w h 8mm LI PTG I u b y u b z b y8m Lu P m w h u h7 9 W hw hbu B E u w hb u D b M M Ly m b b u Ly m b u u h 8mm LI PTG P m w h u h 7 8 W hw hbu B 9 E u w hbu D 工作库的制备 x 介导的定位重组使同一细胞内不同载体之间的轻 从原始噬菌体抗体库中取出 7 CFU的噬菌体 颗粒以高比例 MOI 感染 BS 菌 通过 重链随机交换配对 所获噬菌体上清再按低比例 MOI B u菌 获得库容为 7 的大容量人 感染 XL

5 中国生物工程杂志 Ch B h y V 8N 9 8 源噬菌体抗体库 所获抗体库滴度为 CFU m 相互作为对照鉴定特异性 其中抗 K有 个克隆 抗 DNA PK 噬菌体抗体的筛选 ELI SA检测有活性且特异性较高 抗 K有 个克 经过 轮吸附 洗脱 扩增的筛选 测定每轮洗脱回 S A检测有活性且特异性较高 表 隆 ELI 收的噬菌体滴度 发现有一定的富集从第 第 轮 洗脱回收菌落中随机挑取 个克隆 制备噬菌体抗 SA结果表明 个能与 K抗原结合 个 体ELI 能与 K抗原结合 阳性率分别为 随后 相互作为对照鉴定 其 用卵清蛋白 铁蛋白及 K 中特异性结合 K的克隆为 个 特异性结合 K 的克隆为 个 所获得的特异性抗体菌做 PCR扩增的基因多样 性结果 特异性结合 K的克隆进行了 DNA指纹分析 获得了 种不同的指纹图谱 图中 指纹相同 特 异性结合 K的克隆进行了 DNA指纹分析 获得了 种不同的指纹图谱 图 图 阳性克隆可变区基因的指纹图谱 F F b 可溶性抗体的表达 筛选出的特异性克隆感染 E HB 制备可 M DNAm DNA K F b b y b M DNAm DNA K F b by 溶性抗体用卵清蛋白 OA 铁蛋白 F 及 K 表 抗 K可溶性抗体与不同抗原反应的 ELI SA检测 T b Thb y ub K Fw h byeli SA K 7± ± ± OA ± ± 7± ± 8± ± 9 8± ± ± F ± ± ± ± ± ± K ± ± 8± ± ± ± C m w h P 表 抗 K可溶性抗体与不同抗原反应的 ELI SA检测 T b Thb y ub K F w h byeli SA K ± ± ± 7± ± OA ± ± ± ± ± F ± ± ± ± ± ± ± ± ± ± 7 8 9 K ± 8± ± ± 7 7 8± OA ± ± ± ± ± F ± ± ± ± 8± ± ± ± ± ± K ± ± ± ± ± OA ± ± ± ± ± F ± ± ± ± ± K ± ± ± ± ± C m w h P 7 ELI SA竞争抑制实验 为进一步确定所表达的 DNA PK 单链抗体的特异 性 我们进行了竞争抑制实验竞争抑制实验显示游离 的抗原产生与剂量相关的抑制效应 图 其中 K 及 K 8 的竞争抑制率较高 选择指纹图谱不同且竞争抑制率较高的克隆测定 其可变区基因的序列 分析发现 K抗 体 基 因 来源于不同的胚系 重链可变区基因分属 VH VH亚群 轻链可变区同属于 VL亚群 K抗 体基因重链可变区基因 8 分属 VH VH 亚群 轻链可变区分属于 VL VL亚群 讨 论 恶性肿瘤严重威胁着人类健康 其高死亡率 低治

6 8 8 9 杜 丽 等 从大容量噬菌体抗体库中筛选抗 DNA PK 人源单链抗体 成 具有较好的抗原 结 合 能 力 且 具 有 相 对 分 子 量 小 穿透能力强 体内循环半衰期短及免疫原性低等特 PK 定位于细胞核 小分子的单链抗体 性由于 DNA 可以更容易进入细胞发挥阻抑作用 DNA PK 的蛋白分子较大 7 D 很难实现全 比对 长蛋白的表达 因此我们采用抗原性分析及 B 结合的生物信息学方法筛选出抗原性较高且与其他蛋 白没有同源性的蛋白片段 通过原核表达相应的蛋白片 段原核表达系统具有操作简便 成本低 产量高等优 点 能够满足噬菌体抗体库筛选中抗原纯度高 需要量 较大的要求在实验过程中经过摸索诱导条件 选用 ET b载体经 7 诱导获得蛋白包涵体 而后经过柱 上复性过程得到纯度达到 9 以上的可溶性蛋白 符 合进一步筛选抗体的需要 将可溶性蛋白包被抗原管后 经过四轮 吸附 洗脱 扩增 的淘筛发现噬菌体抗体得到富集而后挑取克 图 不同抗体与游离抗原的竞争抑制率 隆通过 ELI SA检测与不同抗原的结合能力挑选特异 F Th m h b h 性结合的克隆进行基因多样性分析及可溶性抗体表达 b w h 后的活性分析经过分 析 K K分 别 筛 选 出 愈率使人们 谈癌色变 目前临床上主要采用手术 放射治疗与化学治疗相结合的治疗手段然而 肿瘤组 织细胞对放疗及化疗的易耐受性是导致恶性肿瘤治愈 率低 严重影响恶性肿瘤患者生活质量的原因之一研 究发现 多种恶性肿瘤细胞中 DNA依赖的蛋白激酶复 合物表达增多与恶性肿瘤的发生及放化疗敏感性降低 密切相关 包括本实验室在内的研究显示 某些类型肿瘤中具 有高转移特性和放化疗抗性的癌组织中 DNA PK 等 的 表 达 活 性 显 著 增 高 9 应 用 抑 制 剂 抑 制 DNA PK 活性或阻断剂阻止调节亚基功能可使细胞损伤修 复能力降低 对电离辐射的敏感性增高 促使肿瘤细胞 发生凋亡 本研究采用人源大容量噬菌体库筛选技术筛选针 PK 的单链抗体噬菌体抗体库技术是全套 对 DNA 个 个特异性较高且有活性的抗体可溶性表达后 活性与噬菌体表达不完全一致 可能是诱导条件发生了 变化 可溶性表达结合活性发生了改变另外 可溶性 表达抗体蛋白主要在细菌的周质腔中 其立体构象发生 了变化 因此可能造成可溶性表达活性不同进一步的 竞争抑制实验目的是筛选活性较好的抗体 最终结果 K 及 K 8 的竞争抑制率 较高 由此选出进行进一步的基因分析下一步我们还 将就所筛选出抗体的生物学效应进行深入的研究 参考文献 孙敬芬 周平坤 吴德昌DNA修复与人类疾病研究进展 癌变 突变 畸变 Su JF Zh upk WuDCC T Mu S JC Th LD J PA Th 抗体基因展示在噬菌体表面 并能在体外模拟抗体免疫 PKO 9 9 9 h DNA 系统的选择作用 呈现在噬菌体表面的抗体能够在体外 余子建 徐勤枝 周丽君 等肝癌组织中 DNA PK 的过量 用固相化抗原进行筛选经过几轮 吸附 洗脱 扩增 的淘筛 可使特异性噬菌体抗体得到富集利用噬菌体 抗体库技术借助高效筛选系统 可以不经免疫方便地制 备 出 人 源 抗 体 单 链 抗 体 h b m F 是 由 VH 和 VL中 间 加 一 段 L 构 表达及其靶向 RNA分子的抗增殖作用世界华人消化杂 志 7 8 8 YuZJ XuQZ Zh ulj W JG 7 8 8 H Y T b W N wk U u DNA y S

7 26 中国生物工程杂志 ChinaBiotechnology Vol.28No cancer.intjoncol,2004,25(2):46~468 [5] 安静, 隋建丽, 徐勤枝, 等.siRNA 抑制 DNAPKcs 表达及对 HeLa 细胞增殖的影响. 癌变 突变 畸变,2005,7(6): 327~33 AnJ,SuiJL,XuQZ,etal.Carcinogenesis,Teratogenesisand Mutagenesis,2005,7(6):327~33 [6]AnJ,XuQZ,SuiJL,etal.Downregulationofcmycprotein bysirnamediatedsilencingofdnapkcsinhelacels.intj Cancer,2005,7(4):53~537 [7] SblateroD,BradburyA.Exploitingrecombinationinsingle bacteriatomakelargephageantibodylibraries.natbiotechnol, 2000,8():74~80 [8] 乔媛媛, 王琰, 陈晓穗, 等. 大容量噬菌体抗体库的构建及鉴定. 中华微生物学和免疫学杂志,2004,24(3):94~ 97 QiaoY Y, WangY, ChenX H, etal.chin JMicrobiol Immunol,2004,24(3):94~97 [9]AnJ,XuQZ,SuiJL,etal.SilencingofDNAPKcsaltersthe transcriptionalprofileofcertainsignaltransductiongenesrelated toproliferationanddiferentiationinhelacels.intjmolmed, 2005,6(3):455~462 [0]MondonP,DubreuilO,BouayadiK,etal.Humanantibody libraries:aracetoengineerandexplorealargerdiversity.front Biosci,2008,3:7~29 []BeckmanRA,WeinerLM,DavisHM.Antibodyconstructs in cancertherapy: protein engineeringstrategiestoimprove exposureinsolidtumors.cancer,2007,09(2):70~79 [2]NguyenDC,ParsaB,CloseA,etal.Overexpresionofcel cycleregulatoryproteinscorelateswithadvancedtumorstagein headandnecksquamouscelcarcinomas.intjoncol,2003, 22(6):285~290 ScreeningofHumanAntiDNAPKcsscFvfrom LargeScalePhageLibrary DULi ZHOULijun 2 PANXiujie WANGYu WANGYuxiao 2 YANGZhihua XUQinzhi ZHANGShimeng ZHUMaoxiang ZHOUPingkun (BeijingInstituteofRadiationMedicine,Beijing 00850,China 2NavyGeneralHospital,Beijing 00037,China) Abstract Objective:ToclonethegenesencodinghumanantiDNAPKcsantibodiesfrom largephage antibodylibraryfortheuseofcancertherapyordiagnosisinfuture.method:humandnapkcsprotein fragmentswithhighantigenicityandlowhomologoustootherproteinsweredefinedthroughantigenicityanalysis andblastsearching.afterprokaryoticexpresionandpurification,theproteinsegmentswerecoatedonto immunotube.panningoflargescalephagelibraryagainstantigenwasconductedtoselectspecificantibodies againstdnapkcs.thebindingactivityandspecificityweretestedbyelisamethod.solublescfvwasprepared throughtransfectinghb25withtheselectedphageantibodygenes.result:250aaofdpk3and257aaof DPK4segmentsweredefinedashighantigenicityandlow homologytootherproteinthroughbioinformatic analysis.after4roundsofpanning,26cloneswereidentifiedwiththespecificbindingabilitywithdpk3,and 3cloneswithDPK4.DNA fingerprintingrevealed5individualpositiveclonestodpk3and2individual positiveclonestodpk4.sequencinganalysisshowedthatvariableregionsofthesescfvsbelongtodiferent subgroups.conclusion:humandnapkcsantibodygenesweresuccesfulyobtainedfrom largescalephage antibodylibrary. Keywords Largescalephagelibrary DNAPKcs scfvantibody

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