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用他塔喇
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此處可選擇介面語言, 以下的範例以繁體中文版為例 1.1.3. 選單選項 1).

1 IPT 操作範例以下的說明將協助您利用 IPT 工具上傳計畫成果申請 IPT 帳號點選我要申請帳號, 填妥相關資料, 通過審核, 即可取得 IPT 帳號登入 IPT 1). 輸入帳號密碼並登入 2). 此處可選擇介面語言, 以下的範例以繁體中文版為例選單選項 1). 首頁 (Home) 在首頁可查看所有已公開發布的資源 2). 管理資源 (Manage Resources) 建立管理或刪除資源 3). 系統管理 (Administration) 系統及帳號管理, 僅具有管理員權限的使用者才能使用, 一般使用並無此權限 4). 關於 (About) 關於 IPT 主機的資訊 1

2 建立新資源進入管理資源選單, 在此處您也可以上傳儲存為 DarwinCore archive 形式的資源或上傳自既有 IPT 資料目錄中資源存放位置所下載的壓縮檔案, 本手冊將介紹如何建立一份新資源 1). 在資源簡稱 (Shortname) 輸入一個可辨識此份資源的簡稱, 以字母數字連字號 (-) 及底線 (_) 命名 2). 核心集類型 (Type) 暫不選取, 再填寫後設資料時在填入對應的類型 3). 點選建立 (Create), 即可建立新資源

1.1.5. 編輯 Metadata 在管理資源標籤下的元數據欄點選編輯, 以下以邵廣昭老師提供之底拖調查魚類資料為範例, 其資料發表在 Zookeys 1 1).

3 編輯 Metadata 在管理資源標籤下的元數據欄點選編輯, 以下以邵廣昭老師提供之底拖調查魚類資料為範例, 其資料發表在 Zookeys 1 1). 基本元數據 Basic Metadata 資料填寫的原則為若原始資料中有中英文, 則在填寫時須中英文並列方式填寫, 填寫的欄位中如有 * 則為必填欄位標題 * Title 輸入本資源名稱須中英文並列 A dataset from bottom trawl survey around Taiwan Bottom trawl fishery is one of the most important coastal fisheries in Taiwan both in production and economic values. However, its annual production started to decline due 摘要 * Description 計畫內容摘要敘述 to overfishing since the 1980s. Its bycatch problem also damages the fishery resource 須中英文並列 seriously. Thus, the government banned the bottom fishery within 3 nautical miles along the shoreline in To evaluate the effectiveness of this policy, a four year survey was conducted from , in the waters around Taiwan and Penghu (Pescadore) 1 ZooKeys 198: , doi: /zookeys

4 Islands, one region each year respectively. All fish specimens collected from trawling were brought back to lab for identification, individual number count and body weight measurement. These raw data have been integrated and established in Taiwan Fish Database ( They have also been published through TaiBIF ( FishBase and GBIF (website see below). This dataset contains 631 fish species and 3,529 records, making it the most complete demersal fish fauna and their temporal and spatial distributional data on the soft marine habitat in Taiwan. 元數據語言元數據文件編寫時所使 Metadata language 用的語言 English 資源語言描述此資源 ( 非元數據文 Resource language 件 ) 的主要語言 English 資源的類型此欄位的值核心集類型取決於此資源的核心對 Type 應類型, 若核心對應已完 Occurrence 成, 則將無法修改次類型資源的次類型此欄位的 Subtype 選項取決於核心集類型 Observation 聯絡資訊資源聯絡資訊是當有關於此資源的相關資訊或資料問題時, 應該聯絡的資源管理人或組織依照欄位要求, 依序填寫 Resource Contact 適合做為資源聯絡資訊的角色有 : 小提醒 : 12

5 a) 資源管理員 : 負責維護資料集文件的組織或個人 b) 擁有者 : 擁有此資料集的組織或個人 ( 可以是資源管理員, 也可以不是 ) c) 聯絡人 : 可進一步提供更多關於該資料集資訊的組織或個人 d) 計畫主持人 : 此資料集的主要學科聯絡人資源創建者為建立原始資源內容的組織或個人當有多位創建者時, 則紀錄其中負最大責 1) 姓氏與組織為必填選項姓氏欄位若填寫中文, 系統會判定姓氏過短, 可利用加上英文姓氏加長長度 2) 網頁需填上聯絡人 / 創任者, 其它則記錄為相關人員, 並指定角色為發起人或內容提供者建者 / 提供者個人網頁資源創建者 Resource 適合做為資源創建者的角色有 : 3) 若創建者或提供者與聯絡人 creator a) 發起人 : 一開始收集或準備此資料集的組織或個人相同時, 可點選從聯絡人 b) 內容提供者 : 原則上貢獻此資料集內容的組織或個人複製資訊細節元數據提供者為撰寫資源元數據的組織或個人元數據提供者適合做為元數據提供者的角色有 : Metadata Provider 元數據提供者 : 負責提供元數據的人員 2). 地理涵蓋範圍 Geographic Coverage 地理涵蓋範圍可拖曳在地圖上標記或是輸入十進位經緯度座標經度西界 West 此資料集最西邊界點經度東界 East 此資料集最東邊界點緯度南界 South 此資料集最南邊界點緯度北界 North 此資料集最北邊界點描述 Description 關於此資料集的採樣區域之地理涵蓋範圍描述 Seas around Taiwan 13

6 3). 分類群涵蓋範圍 Taxonomic Coverage 描述 Description 針對資料集或採集紀錄進行分類範圍的描述, 例如 : The coverage of this dataset includes Class Actinopterygii 所有維管束植物被辨識的等級是到科或是種, 地衣和蘚苔 (90%), Class Chondrichthyes (9%) and Class Myxini (1%). 類是被辨識為蘚苔或是地衣類學名 :Animalia 俗名 : 動物界階層 :kingdom 學名 :Chordata 俗名 : 脊索動物門階層 :phylum 學名 :Actinopterygii, Chondrichthyes, Myxini 階層 :class 學名 :Perciformes, Scorpaeniformes, Pleuronectiformes, 新增數個分類群列出您資料集中所處理的分類群為了在有意義的階層提供這些資料, 在較廣分類群的資料集提供至目至科的階層 ; 在科為主的資料集提供至屬的資料 Aulopiformes, Anguilliformes, Gadiformes, Ophidiiformes, Tetraodontiformes, Carcharhiniformes, Myctophiformes, Lophiiformes, Myliobatiformes, Rajiformes, Squaliformes, Stomiiformes, Beryciformes, Gasterosteiformes, Argentiniformes, Clupeiformes, Siluriformes, Zeiformes, Chimaeriformes, Torpediniformes, Myxiniformes, Orectolobiformes, Polymixiiformes, Ateleopodiformes, Gonorhynchiformes, Albuliformes, Heterodontiformes, Squatiniformes 階層 :order 14

7 4). 時間涵蓋範圍 Temporal Coverage 單一日期 single date: 此日期用來以示時間涵蓋範圍在一天以內適用格式為 YYYY-MM-DD 或 MM/DD/YYYY 生存期間 Living Time Period: 描述該物種存活的時期, 可包含古生物生存時期或其他期間的文字描述, 時間範圍類型 : 日期範圍時間範圍類型如 , 明朝, 更新世等起始日期 Start Date: Temporal Coverage Type 彙集時期 Fornation Period: 結束日期 End Date: 以文字描述採集品彙整的時間屬於哪個時期, 如維多利亞女王時代 c 使用此方法表示持續累積的採集蒐藏, 如 2010 年至今日期範圍 Date Range: 用來表示時間涵蓋範圍的起始與結束, 格式與單一日期相同 5). 其他關鍵詞 Keywords 欄位名稱說明範例關鍵字來源的關鍵字辭典名稱關鍵字辭典通常與領域有關, 可以客製化也可以是正式同義詞 * 使用的如果您的關鍵字不是從特定辭典中取得, 請輸入 n/a 例如: IRIS keyword n/a Thesaurus/ Vocabulary thesaurus 關鍵字清單 * Bottom Trawl, Taiwan, IPT, Darwin 可列出與此資源相關或可簡潔地描述此資源的關鍵字詞請用逗號分隔每個關鍵字 Keyword List Core, Fishery 15

8 6). 相關團體 Associated Parties 欄位名稱說明備註相關團體本處欄位與基本元數據聯絡人欄與此資源相關的團體, 如典藏機構 Associated Parties 位相同, 請參考基本元數據 7). 計畫資料 Project Data 欄位名稱說明備註計畫名稱 * Title 本資料集資料來源計畫名稱 Bottom trawl surveys of fishery resources in Taiwan 人員名字 Personnel First Name Kwang-Tsao 人員姓氏 * Personnel Last Name Shao 角色 Role 作者 : 編寫著作資料集或資料論文相關的人員內容提供者 : 對資料集內容提供有所貢獻的人員資料保管者 : 負責保管及給予資料的人員資料發布者 : 與公開發布此資料集有關之人員編輯 : 使用此資料集編輯相關出版品之人員元數據提供者 : 有責任提供資料集元數據的人員資料彙整者 : 負責彙整此資料集的人員資料擁有者 : 擁有此資料集之人員 ( 可能是或可能不是資料保管者 ) 聯絡人 : 可聯絡並獲得更多關於此資料集的人員主要研究人員 : 此資料集主要的科學研究人員 16

9 欄位名稱說明備註資料處理人員 : 負責進行資料後續處理分析的人員出版者 : 與出版此資料集出版品相關之人員使用者 : 使用此資料集之人員資訊工程師 : 提供資訊或應用程式支援之人員標本管理員 : 紀錄或維護標本的人員有些人的職務包含準備標本標籤以供鑑定以及保護標本經費來源 Funding 計畫經費來源的資訊 ( 例如 : 獎學金計畫契約編號經費來源的地址和單位名稱 ) 其他與經費相關的資訊皆可含括入內 Council of Agriculture, Executive Yuan, R.O.C.(Taiwan) 研究區域描述 Study Area Description 描述研究計畫的本質相關的文件, 可包含研究位置的地理範圍時間範圍和物種分類範圍的描述 China s continental shelf and the Okinawa Trough. Outside of the northeastern Taiwan stations is the Okinawa Trough. The western Taiwan stations and Pescadores are all on the shallow Taiwan Strait Shelf. The stations in southwestern Taiwan are near the slope of the South China Sea Basin. Three or four different water depth fixed stations were chosen in each region, except Penghu, for seasonal sampling. In principle, the sampling 研究設計描述 methods were planned for different locations at 關於研究領域面向的一般性描述 Design Description different depths of the stations in accordance with sediment, topography, water depth, and the ability of fishing vessel. Sampling was conducted four times a year (quarterly). After sampling, the species 17

10 欄位名稱說明備註 composition between different locations, depths, and seasons were compared and analyzed. 8). 取樣方法 Sampling Methods 欄位名稱說明範例 The offshore waters around Taiwan was separated into 4 regions. 此欄位紀錄特定的取樣區域以及取樣頻率 ( 時間範研究範圍 * Three to four fixed stations were further selected in each region. 圍出現頻率 ) 地理上的研究範圍通常是計畫元數 Study Extent From 2000 to 2003, fish samplings were collected in one region 據研究範圍描述中一個較大區域的代表 each year using bottom trawl fishing boats. The sampling design for collecting bottom trawl harvest from coastal and offshore waters around Taiwan was to separate the waters into four regions and collect one region each year during (Figure 2a). In each region, 3-4 fixed stations with various water depths were chosen according to different 此欄位用以記錄研究計畫採樣步驟的描述此欄位的採樣方法描述 * topography and traditional fishing ground in that region. Eastern 內容與期刊文獻上方法章節的中的採樣步驟描述類 Sampling Description Taiwan was excluded because it belongs to open ocean and 似 deep-sea environment and there was no bottom trawl fishery in the region. The locality names (or nearest fishing harbours) and water depths in each region were outlined below (Figure 2a, Figure 2b): 2000 Northern Taiwan (Jinshan: 100 m; mixed with pebbles and 18

11 sand); Northeastern Taiwan (Aodi: 100m, 150m and 200 m; and Dasi: 50, 100, 200, 400, 600 and 800 m; all sandy bottoms); 2001 Southwestern Taiwan (Xingda Harbor: 10, 30, 50, 70 and 100 m; Kaohsiung Harbor: 100, 200 and 300 m; Donggang: 100, 200 and 300 m; Fenggang: 100, 200 and 300 m; sandy and muddy bottoms); 2002 Western Taiwan (Hsinchu: 60, 65 and 70 m; Miaoli: 10, 30 and 50 m; Changhua: 10, 20 and 40 m; all sandy bottoms); 2003 Penghu Islands (16 depths ranging from 25 to 95 m; all sandy and muddy bottoms) Different bottom trawl fishing boats were used in different regions or harbours with slightly different fishing gears designed for our samplings. Basically at each station, the sampling was with an otter trawl towing at 3 nm/hr for one hour. The longitude and latitude data were recorded using the GPS system on the boat. After the recovery of trawl, all the specimens were identified to the species level and their weight measured 品質控管 Quality Control 此欄位提供關於控制或評估資料品質方法步驟的描述 All the scientific names of fish samples were validated by the updated fish checklist in our Taiwan Fish Database or TaiBNET ( before they are added into database. Afterward, they were validated again by matching them against FishBase and Catalog of Fishes, California Academy of Sciences, for further correction. If a specimen was rare or it might belong to an 19

12 undescribed or new species, it was photographed in fresh and then the specimen and its tissue sample were both catalogued and deposited at the Biodiversity Research Museum of Biodiversity Research Center (ASIZP of BRCAS). The latitude and longitude of trawling routes were plotted on Google Maps and outliers detected. 此欄位提供一系列的表單用以紀錄產生資料的步實驗步驟描述 * 驟這些包含步驟本身的說明相關文獻軟體儀 Step Description 器, 來源資料以及任何的品質控管工作 9). 引用文獻 Citations 此部分共分成兩部分, 一部份為此資料集的引用方法, 另一部份為生產此資料集時, 所參考文獻的列表資料集的引用 : 您可在此部分填上他人若引用您這份資料時, 所希望 ( 或建議 ) 的引用方式填寫方式如下 : 引用識別碼 Citation Identifier 引用文獻的 URI DOI 或其他永久識別碼引用資料集時之引用文字當資料集為組織或機構所擁有之範例 : Shao, Kwang-Tsao, et al. (2012) A dataset from 資源引用文字 "Bombay Natural History Society (2011). Literature based bottom trawl survey around Taiwan. ZooKeys Resource Citation* species occurrence data of birds of northeast India : records, Contributed by Narwade S, Karla M, and Varier D, 20

13 Online: released on 01/09/2011, doi: /ibif " 當資料集為數人所擁有之範例 : "Narwade S, Karla M, Varier D (2011) Literature based species occurrence data of birds of northeast India records. Online: released on 01/09/2011, doi: /ibif " 參考文獻的引用 : 您可在此部分填上您生產這份資料時, 所參考的文獻填寫方式如下 : 引用文獻識別碼資料集所引用文獻的 URI DOI 或其他永久識別碼 Citation Identifier 引用文獻 * Citation 資料集所引用文獻 Wu Chung-Han (2002) Community structure of bottom trawl fishes in the coastal waters of northern and north-eastern Taiwan. Master thesis of National Taiwan Ocean University. Yeh H.M, M.L. Chiou, Y.C. Liao, H.C. Ho, T.H. Wu, P.F. Lee, C.H. Chang, K.T. Shao (2006) Deep-sea fish diversity around Taiwan. In Deep Sea 2003: Conference on the Governance and Management of Deep-sea Fisheries. FAO 21

14 Fisheries Proceedings (3/2): Shao, K. T., H. C. Ho*, P. L. Lin, P. F. Lee, M. Y. Lee, C. Y. Tsai, Y. C. Liao, Y. C. Lin, J. P. Chen & H. M. Yeh (2008) A checklist of the fishes of southern Taiwan, northern South China Sea. Raffl. Bull. Zool. Supplement No. 19: * 引用識別碼與資源引用文字是要讓引用本資料集的人參考用的參考文獻格式, 引用文獻識別碼及引用文獻則是填寫本資料集所引用的相關文獻 10). 採集蒐藏資料 Collection Date 此單元為紀錄所提供資料其歸屬的資料庫及標本保存的方法蒐藏名稱 * Collection Name 以原始語言記載的蒐藏名稱蒐藏編號 * Collection Identifier 蒐藏的 URI (LSID 或 URL) 若為 RDF 使用蒐藏資源的 URI 上層採集品識別碼 * Parent Collection Identifier 此蒐藏之上層蒐藏的識別碼, 用以建立蒐藏的階層關係如果此蒐藏無所屬上層蒐藏, 請選擇不適用取自 GBIF 標本保存方法詞彙的關鍵字, 該詞彙指出防止標本蒐藏腐敗的保存技標本保存方式術假如採用多種方法, 請選擇其中主要的方法請注意, 透過達爾文保存方法延 Specimen preservation 伸集 ( 您可為一標本記錄多種方 method 法若為活體蒐藏, 請勿選擇任何選項 22

15 欄位名稱說明範例請輸入本資源涵蓋的管理單位的件數您可以輸入一個範圍, 或是一個帶有不確定管理單位性的數字管理單位包括了件 ( 皮毛 ) 張( 植物標本 ) 針( 昆蟲標本 ) 箱罐( 組織 Curatorial Units 等 ) 11). 外部連結 External links 欄位名稱說明範例資源網頁連至您資源首頁或其他可利用的資料格式 ( 如資料庫的轉出資料試算表 Resource Homepage nexus 鍵連資料等) 的外部連結 12). 其他元數據 Additional Metadata 層級 Hierarchy Level 在元數據申請時的須註明資料集層級在 GBIF 的預設值是資料集 dataset 發表日期 Date Published 資源發布的日期此日期自動於該資源每次重新發布時更新資源標誌網址 Resource logo URL 可輸入一個與資料相關 logo 圖像網址如果沒有資料 logo 圖像網址, 也可以上傳由你的磁碟所選取的一個圖片檔案目的 Purpose 關於此資料集發展動機的概要描述, 可包含建立資料集之目的和此資料集所支持的項目智慧財產權授權關於此資源的權利宣告, 或可取得此資訊的參照資訊來源例如 : 資料引用來源 : 邵廣昭,2013, 23

16 IP right 他人引用此資料集時, 建議的引用格式說明, 註明引用格式中建議, 包含資料名臺灣沿海底拖網調查資料集稱資料擁有者資料發表年份資料提供單位 ( 科技部生物多樣性資料 ) 其他額外資訊 Additional Information 替代的識別碼 Alternative Identifiers 或可自預設選項中選取標準授權方式,IPT 將為您生成授權樣版授權選項有 : - 創用授權 CCZero (Creative Commons 0) - 公眾領域貢獻授權 (Open Data commons Public Domain Dedication and License) - 開放資料共享姓名標示授權 (Open Data commons Attribution License) - 開放資料庫授權 (Open Data commons Open Database License) 任何無法在其它元數據欄位說明的資料, 例如計畫沿革, 使用該資料的發表文獻, 發布於其它地方資料的相關資訊等等此處可列舉被用來標記此資源的替代識別碼, 此識別碼可能來自於不同的資料管理系統 24

17 上傳來源資料 (Source Data) ( 一 ) 上傳文字檔案以新增來源資料 1 1). 在來源資料點選選擇檔案上傳以達爾文核心集標準建置好的檔案, 按下增加進行下一步 * 請注意檔案須為 UTF-8 編碼的 CSV 格式

$標頭列數 Number of Header Rows 匯入資料時, 檔案開頭將被略過的列數, 如第一列通常為資料欄位, 有資料欄位填 1, 無則填 0 II. 欄位分隔字元 Field Delimiter 依據資料內容, 從定位碼 Tab(\t) 逗號(,) 分號(;) 豎線( ) 四者中擇一 III.$

18 2). 資料庫來源名稱由系統自動產生, 無法做更改 3). 此處可瀏覽上傳資料的基本資訊 ; 分析功能是讓 IPT 偵測資料庫的連線狀況之用, 只有來源資料來自資料庫時有效預覽可檢視上傳資料的狀況, 一般而言有兩件事情要注意 :(1) 中文編碼是否正確, 若不正確中文字元將會變成亂碼 ;(2) 資料欄位標頭與內容是否一致以下為格式設定正確資料的預覽畫面 4). 資料內容設定 I. 標頭列數 Number of Header Rows 匯入資料時, 檔案開頭將被略過的列數, 如第一列通常為資料欄位, 有資料欄位填 1, 無則填 0 II. 欄位分隔字元 Field Delimiter 依據資料內容, 從定位碼 Tab(\t) 逗號(,) 分號(;) 豎線( ) 四者中擇一 III. 欄位包圍字元 Field Quotes 在每一列中圍繞每一欄位的單一字元符號, 通常為空, 但 CSV 檔中使用雙引號 (") 使用此選項時, 請確認不管是否為文字, 每一欄位內容皆包含於引號中 IV. 日期格式 Date Format 資料庫使用日期的紀錄格式 V. 字元編碼資料庫字元編碼系統若不知何種編碼, 嘗試使用 UTF-8,Latin-1 或 Windows-1252 以上設定, 請點藍色 i 記號獲得更多的說明 26

19 ( 二 ) 利用資料庫連線新增來源資料上傳的資料除了使用上述步驟上傳文字檔外, 亦可透過下面的步驟連結至您的資料庫 ). 點選連結資料庫 2). 填入資料庫伺服器及資料庫, 並輸入資料庫使用者及資料庫密碼 3). 填入適當的 SQL 語法, 如下 SELECT `GUID` as `occurrenceid`, `InstitutionCode`, `CollectionCode`, `CatalogNumber`, `ScientificName`, `scientificnameinchinese` as `vernacularname`, FROM `TableName` 27

4) 點選分析, 以偵測資料庫連線狀況, 確認無誤後, 點選儲存, 完成此步驟 1.1.7.

1). 選擇對應欄位類別 (Darwin Core Occurrence 或 Darwin

20 4) 點選分析, 以偵測資料庫連線狀況, 確認無誤後, 點選儲存, 完成此步驟 Darwin Core 欄位對應 DarwinCore 欄位對應旨在將相同內容但不同名稱的欄位, 對應到一個公開且普遍被使用的標準 - 達爾文核心集 DwC, 資料將更容易被科學及科普目的分享使用交換資料收集及整理者的努力也因此可被所有人看見, 進而發表資料論文選擇要對應的資料來源 1 2 1). 選擇對應欄位類別 (Darwin Core Occurrence 或 Darwin Core Taxon), 按增加進入下一步 2). 選擇先前建立的資料來源, 按下儲存繼續下一步 28

21 欄位對應 DwC 的欄位上傳資料欄位 1). 資料欄位名稱若與 DwC 相同則會自動對應, 此處會顯示已對應到的欄位數 2). 點選此連結觀看 DwC 欄位說明 3). 定義過濾器 (filter), 篩選出符合此處設定條件的資料, 排除不符合的部分 29

22 4). 點選此區的類別名稱, 以快速跳至所選特定類別之欄位對應操作區 5). 左側為 DwC 欄位, 將資料來源的欄位對應至左側的 DwC 欄位 6). 此處可填入固定值覆寫資料來源中的值, 或補上缺少對應欄位的值發布及公開資源 ). 點選發布 (publish) 以產生 EML 文件與 DwC-A 檔案, 本資料來源的 Metadata 資料與欄位對應都會包含在這個壓縮檔中 2). 點選公開 (public), 可讓資源管理者以外的使用者查看此資源 3). 發布之後即可取得該資料來源的 DwC-A EML 與資料文章 (data paper) 雛形的 RTF 檔 30

2 : 111 ( Pinctada maxima), 13, 11,,,,,, 15, 25 cm, cm, 4 5 kg 1-2],,, 3-7] 24] 25-26],,, ] min, 1, 5 m 4 m, 20 m , 9-22],,, (

2 : 111 ( Pinctada maxima), 13, 11,,,,,, 15, 25 cm, cm, 4 5 kg 1-2],,, 3-7] 24] 25-26],,, ] min, 1, 5 m 4 m, 20 m , 9-22],,, ( 12 2 2 0 1 6 4 South China Fisheries Science Vol. 12, No. 2 Apr., 2016 doi: 10. 3969/ j. issn. 2095-0780. 2016. 02. 016,,,, (,,, 510300) : ( Pinctada maxima),,,, 54. 55%, 0 0. 25 m - 2, 0 70. 31 gm - 2,

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