Order: 010-59822688 Toll-free: 800-990-6057 /400-810-6057 TIANGEN BIOTECH (BEIJING) CO., LTD 版本号 : DP151130 Magnetic Plant Genomic DNA Kit 磁珠法植物基因组 DNA 提取试剂盒 目录号 :DP342 产品内容 产品组成 DP342-01 DP342-02 ( 50 preps) ( 200 preps) 缓冲液 GPM(Buffer GPM) 25 ml 100 ml 缓冲液 GPM plus(buffer GPM plus) 25 ml 100 ml 缓冲液 GHB(Buffer GHB) 20 ml 80 ml 去蛋白液 RD(Buffer RD) 12 ml 48 ml 漂洗液 PWB(Buffer PWB) 15 ml 50 ml RNase A(10 mg/ml) 300 µl 1.25 ml 磁珠悬浮液 G (MagAttract Suspension G) 1 ml 3 1 ml 洗脱缓冲液 TB(Buffer TB) 15 ml 60 ml 储存条件该试剂盒置于室温 (15-25 ) 干燥条件下, 可保存 12 个月, 更长时间的保存可置于 2-8 2-8 保存条件下, 若溶液产生沉淀, 使用前应将试剂盒内的溶液在室温放置一段时间, 必要时可在 37 水浴中孵育 10 min, 以溶解沉淀 本产品仅供科研使用 请勿用于医药 临床治疗 食品及化妆品等用途
产品简介本试剂盒采用具有独特分离作用的磁珠和独特的缓冲液系统, 可以从多种植物组织中分离纯化高质量基因组 DNA 独特包埋的磁珠, 在一定条件下对核酸具有很强的亲和力, 而当条件改变时, 磁珠释放吸附的核酸, 能够达到快速分离纯化核酸的目的 整个过程安全 便捷, 提取的基因组 DNA 片段大, 纯度高, 质量稳定可靠, 尤其适合高通量工作站的自动化提取 使用本试剂盒纯化的 DNA 可适用于各种常规操作, 包括酶切 PCR 文库构建 Southern 杂交 芯片检测 高通量测序等实验 产品特点 简便快捷 : 1 h 内即可获得超纯的基因组 DNA 高通量 : 可整合移液法和磁棒法自动化仪器进行高通量提取实验 广 泛 : 适用于多种植物组织 安全无毒 : 无需酚 / 氯仿等有毒有机试剂 纯度高 : 获得的 DNA 纯度高, 可直接用于芯片检测 高通量测序等实验 提取得率 植物材料 提取量 平均 DNA 产量 OD 260 /OD 280 小麦 100 mg 18-25 µg 1.7-1.9 松树 100 mg 25-30 µg 1.7-1.9 马铃薯 100 mg 4-6 µg 1.7-1.9 番茄 100 mg 10-15 µg 1.7-1.9 烟草 100 mg 10-15 µg 1.7-1.9 水稻 100 mg 10-25 µg 1.7-1.9 大豆 100 mg 10-25 µg 1.7-1.9 玉米 100 mg 20-30 µg 1.7-1.9 棉花 100 mg 10-25 µg 1.7-1.9 注 : 不同来源植物材料中基因组会有差异, 以上所有材料均为幼嫩叶片 2
注意事项请务必在使用本试剂盒之前阅读此注意事项 1. 本产品适用于手工提取或自动化仪器整合 2. 自备试剂 : 异丙醇, 无水乙醇 3. 样品应避免反复冻融, 否则会导致提取的 DNA 片段较小且提取量也下降 4. 若缓冲液 GHB 中有沉淀, 可在 37 水浴中重新溶解, 摇匀后使用 操作步骤 使用前请先在去蛋白液 RD 和漂洗液 PWB 中加入无水乙醇, 加入体积请参照瓶子上的标签 一 手工操作步骤 : 1. 取植物新鲜组织约 100 mg 或干重组织约 30 mg, 加入液氮充分碾磨 2. 将研磨好的粉末迅速转移到预先装有 400 µl 缓冲液 GPM 和 5 µl RNase A(10 mg/ml) 的离心管中, 迅速颠倒混匀后, 将离心管放在 70 水浴 10 min, 水浴过程中颠倒离心管以混合样品数次 注 : 若提取富含多糖多酚的植物组织, 可使用缓冲液 GPM plus 3. 12,000 rpm (~13,400 g ) 离心 4 min, 转移 300 µl 上清至新的离心管中 4. 加入 300 µl 缓冲液 GHB,300 µl 异丙醇和 15 µl 磁珠悬浮液 G, 振荡混匀 5 min 5. 将离心管放置于磁力架上静置 1 min, 待磁珠完全吸附时小心去除液体 6. 将离心管从磁力架上取下, 加入 500 μl 去蛋白液 RD( 使用前请先检查是否已加入无水乙醇 ), 振荡混匀 30 sec 7. 将离心管放置于磁力架上静置 30 sec, 磁珠完全吸附后, 小心吸去液体 8. 加入 600 µl 漂洗液 PWB( 使用前请先检查是否已加入无水乙醇 ), 振荡混匀 30 sec 9. 将离心管放置于磁力架上静置 30 sec, 磁珠完全吸附后, 小心吸去液体 10. 重复步骤 8 和 9 11. 将离心管于磁力架上, 室温晾干 10-15 min 注意 : 乙醇残留会抑制后续的酶反应, 所以晾干时要确保乙醇挥发干净 但也不要干燥太长时间, 以免难以洗脱 DNA 3
12. 将离心管从磁力架上取下, 加入 50-100 μl 洗脱缓冲液 TB, 振荡混匀, 置于 65 孵育 3 min 13. 将离心管放置于磁力架上静置 1 min, 磁珠完全吸附后, 小心将 DNA 溶液转移至一个新离心管中, 并于适当条件保存 4
二 移液法自动化仪器提取步骤准备工作及注意事项 : 1. 本产品可整合 Hamilton Microlab STAR Beckman Coulter Biomek FX 和 Capitalbio LabKeeper 等移液法自动化仪器进行高通量基因组提取工作 2. 植物样本的处理 : 同手工操作步骤 1-3, 裂解完成后转移 300 µl 上清至 96 孔深孔板内 3. 磁珠稀释液的配制 : 按照 15 µl 磁珠悬浮液 G 加入 85 µl 异丙醇的比例混合, 混合后每个样本用量为 100 µl 4. 对于 Hamilton Microlab STAR 类的仪器, 有放置 2 ml 离心管的板位, 可以不使用异丙醇来稀释磁珠, 异丙醇的加入体积仍为 300 μl 每个离心管可以放入 1 ml 左右的磁珠, 吸取磁珠前吹打混匀 5 次, 直接进行 15 μl 磁珠的分液操作, 分液完成后将磁珠管盖盖好保存 5. 考虑仪器设定温度和 96 孔板内的实际温度有一定的偏差, 在裂解和洗脱时建议仪器设定温度比实际使用温度高出 10 提取步骤 : 1. 在 96 深孔板 ( 自备 ) 中加入 300 μl 处理好的植物样本上清液 2. 每孔加入 300 μl 裂解液 GHB, 吹吸 6 次 3. 每孔加入 215 μl 的异丙醇, 吹吸 6 次 4. 每孔加入 100 μl 磁珠稀释液, 吹吸 6 次, 然后振荡混匀 10 min 5. 将深孔板放置于磁力架上静置 2 min, 磁珠完全吸附后, 吸去液体 6. 将深孔板从磁力架上取下, 加入 500 μl 去蛋白液 RD, 吹吸 6 次, 振荡混匀 2 min 7. 将深孔板放置于磁力架上静置 30 sec, 磁珠完全吸附后, 吸去液体 8. 将深孔板从磁力架上取下, 加入 600 μl 漂洗液 PWB, 吹吸 6 次, 然后振荡混匀 2 min 9. 将深孔板放置于磁力架上静置 30 sec, 磁珠完全吸附后, 吸去液体 10. 重复步骤 8 和 9 一次 5
11. 将深孔板置于磁力架上,37 晾干 5 min 12. 将深孔板从磁力架上取下, 加入 50-100 μl 洗脱缓冲液 TB, 置于 65, 振荡混匀 10 min 13. 将深孔板放置于磁力架上静置 2 min, 磁珠完全吸附后, 小心将 DNA 溶液转移至收集板中, 并于适当条件保存 6
三 磁棒法自动化仪器提取步骤准备工作及注意事项 : 1. 本产品在 Thermo KingFisher Flex 等自动化仪器上整合成功 2. 植物样本的处理 : 同手工操作步骤 1-3, 裂解完成后转移 290 µl 上清至含有 290 µl 缓冲液 GHB 和 290 µl 异丙醇的 96 孔深孔板内 3. 将含有植物样本上清液, 缓冲液 GHB 和异丙醇 500 µl 去蛋白液 RD 600 µl 漂洗液 PWB 和 50-100 µl 洗脱缓冲液 TB 分别加到 96 孔板相应的位置上, 将 15 µl 磁珠 G 加入到 500 µl 去蛋白液 RD 中 提取步骤 : 1. 将处理好的植物样本上清液加入到含有缓冲液 GHB 和异丙醇的 96 孔样品板里 2. 将 96 孔板置于自动化提取仪中, 室温孵育 5 min, 期间中速和快速间隔拍打混匀 3. 使用磁力套深入到含有磁珠的去蛋白液 RD 的孔中, 快速拍打混匀 1 min, 吹散磁珠 4. 磁力棒深入到磁力套中, 吸附磁珠 3 次, 每次 20 sec 5. 将磁珠转移到含有植物样本上清液, 缓冲液 GHB 和异丙醇的孔中, 释放磁珠, 中速和快速间隔拍打混匀 10 min 6. 磁力棒深入到磁力套中, 吸附磁珠 3 次, 每次 20 sec 7. 将磁珠转移到含有去蛋白液 RD 的孔中, 释放磁珠, 快速拍打混匀 3 min 8. 磁力棒深入到磁力套中, 吸附磁珠 3 次, 每次 20 sec 9. 将磁珠转移到含有第一遍漂洗液 PWB 的孔中, 释放磁珠, 快速拍打混匀 3 min 10. 磁力棒深入到磁力套中, 吸附磁珠 3 次, 每次 20 sec 11. 将磁珠转移到含有第二遍漂洗液 PWB 的孔中, 释放磁珠, 快速拍打混匀 3 min 12. 磁力棒深入到磁力套中, 吸附磁珠 3 次, 每次 20 sec 13. 磁力棒吸附磁珠后悬空晾干 5 min 7
14. 将磁珠转移到含有洗脱缓冲液 TB 的孔中,75 孵育, 快速拍打混匀 10 min 15. 磁力棒深入到磁力套中, 吸附磁珠 3 次, 每次 30 sec 16. 将吸附的废弃磁珠转移到含有去蛋白液 RD 的孔中, 拍打混匀 1 min 17. 程序结束后, 小心将 DNA 溶液转移至收集板, 并于适当条件保存 DNA 浓度及纯度检测得到的基因组 DNA 片段的大小与样品保存时间 操作过程中的剪切力等因素有关 得到的 DNA 片段可用琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计检测浓度与纯度 DNA 应在 OD 260 处有显著吸收峰,OD 260 值为 1 相当于大约 50 μg/ml 双链 DNA 40 μg/ml 单链 DNA OD 260 /OD 280 比值应为 1.7-1.9, 如果洗脱时不使用洗脱缓冲液, 而使用去离子水, 比值会偏低, 因为 ph 值和离子存在会影响光吸收值, 但并不表示纯度低 8