血流感染的碳青霉烯类耐药鲍曼不动杆菌的分子机制及临床研究马晓波等 alignment. The clinical data were analyzed. Results A total of 27 patients with CRAB bacteremia were studied f

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1 中国抗生素杂志 208 年 5 月第 43 卷第 5 期. 59. 文章编号 : (208) 血流感染的耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌的分子机制及临床研究 马晓波 黄朝阳 徐和平 房丽丽 李珣 胡祖凤 2 洪国粦,* ( 厦门大学附属第一医院检验科, 厦门 36003;2 厦门大学公共卫生学院, 厦门 3603) 摘要 : 目的 CRAB 的感染控制提供实验依据 方法 探讨血流感染的耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌 (CRAB) 耐药机制, 分析菌株同源性及患者的临床特征, 为 采用 Bact/Alert 3D 全自动血培养系统进行血培养, 细菌鉴定和药敏使用 Vitek-2 Compact 全自动微生物分析系统 对 200 年 6 月 206 年 5 月临床血流感染患者分离到的 27 株碳青霉烯类药物 ( 亚胺培南和 / 或美罗培南 MIC 6μg/mL) 耐药的 CRAB 复苏菌株, 重新采用 Vitek-MS 质谱分析仪鉴定, 采用改良 Hodge 试验检测碳青霉烯酶,PCR 法检测 B 类酶基因 (bla NDM ) 和 D 类酶基因 (bla OXA-23 bla OXA-24 bla OXA-5 ) 并测序比对 采用 MALDI-TOF 分析 菌株同源性, 并分析患者的临床资料及感染相关信息 结果 血流感染的 CRAB 绝大多数对常用抗生素耐药 27 株 CRAB 改良 Hodge 试验均阳性 所有 CRAB 均未检测到 B 类酶基因 (bla NDM );25 株 CRAB 同时检测到 bla OXA-23 和 bla OXA-5 ; 另 2 株 CRAB 则为 bla OXA-58 阳性 采用 Vitek-MS 进行同源性分析, 细菌分成 3 大簇 (Ⅰ 型 3 株 Ⅱ 型 2 株 Ⅲ 型 2 株 ) 85.2%(25/27) 患 者来自重症监护病房或专科的监护病床, 原发感染灶以肺部炎症最常见 ( 例 ) 所有的患者在血培养出 CRAB 前的 30d 内均有抗 菌药物使用史, 使用频率较高的抗菌药物有 : 碳青霉烯类 氟喹诺酮类 头霉素类 5 例 CRAB 血流感染患者死亡 结论 门地区的 CRAB 以 D 类产碳青霉烯酶 OXA-23 和 OXA-5 最为多见 CRAB 血流感染的原发感染多为肺部炎症 关键词 : 鲍曼不动杆菌 ; 碳青霉烯类耐药 ; 碳青霉烯酶 ; 血流感染 中图分类号 :R378 文献标志码 :A Clinical and molecular characterization of carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii isolated from bloodstream infections 厦 Ma Xiao-bo, Huang Chao-yang, Xu He-ping, Fang Li-li, Li Xun, Hu Zu-feng 2 and Hong Guo-lin ( Department of Clinical Lab Medicine, the First affiliated Hospital of Xiamen University Xiamen 36003; 2 School of health public, Xiamen University, Xiamen 3603) Abstract Objective To study the molecular mechanism of Acinetobacter baumannii resistant to carbapenem, to analyze the clinical features of carbapenem resistant A. baumannii (CRAB) bacteriaemia, and to provide evidence for infection control. Methods Blood culturing was carried out by the Bact/Alert 3D automated blood culture system. Then, identification and antimicrobial susceptibility tests were performed by the Vitek-2 compact system. CRAB isolates with MIC of imipenem and meropenem higher than 6μg/mL were collected, and were re-identified by the Vitek-MS system (Matrix-assisted Laser Desorption/Ionization Time-of-flight Mass Spectrometry, and MALDI-TOF MS). The presence of carbapenemase was screened by modified Hodge test. Carbapenemase genes (bla NDM, bla IMP, bla VIM, bla OXA-23, bla OXA-24, bla OXA-5 and bla OXA-58 ) were identified by PCR amplification and sequenced 收稿日期 : 基金项目 : 福建省卫生联合资金面上项目 (No. 206J0643) 作者简介 : 马晓波, 男, 生于 980 年, 硕士, 副主任技师, 研究方向 : 临床微生物及病原检测 细菌耐药机制, maxiaoboxm@26.com * 通讯作者, xmhgl9899@sina.com

2 血流感染的碳青霉烯类耐药鲍曼不动杆菌的分子机制及临床研究马晓波等 alignment. The clinical data were analyzed. Results A total of 27 patients with CRAB bacteremia were studied from June 200 to May 206. All strains of CRAB were resistant to most of the common antibiotics and were positive by modified Hodge test. Both bla OXA-23 and bla OXA-5 were detected in 25 strains of CRAB, while 2 strains harboring bla OXA-58. Strains were divided into three clusters by the Vitek-MS system (typeⅠ-3 isolates, typeⅡ-2 isolates, typeⅢ-2 isolates). Eighty-five percent of patients were hospitalized in intensive care units/beds. The primary source of infection was pulmonary inflammation ( cases). All patients had a history of antibiotics use during 30 days before CRAB was isolated. The main antibiotics used were carbopenems, fluoroquinolones and cephamycins. The prognosis was not good and 5 patients died. Conclusion The resistance carbapenemase gene of CRAB in Xiamen area were mainly bla OXA-23 and bla OXA-5. CRAB bacteriaemia was mainly secondary to pulmonary inflammation. Key words Acinetobacter baumannii; Carbapenem resitance; Carbapenemase; Bacteriaemia 作为医院感染重要的条件致病菌之一, 鲍曼不动杆菌的检出率逐年在增加, 值得重视的是鲍曼不动杆菌对抗生素的耐药情况并不容乐观, 碳青霉烯类耐药鲍曼不动杆菌 (carbapenem-resistant A. baumannii, CRAB) 甚至全耐药菌株的出现, 使临床治疗选药陷入棘手的境地 目前研究显示 CRAB 对碳青霉烯类的耐药机制包括产生碳青霉烯酶 外膜蛋白表达下调或缺失 靶位蛋白的改变 主动外排系统 [] 过度表达和生物膜的形成等, 其中细菌产 OXA 型碳青霉烯酶是主要机制 CRAB 为临床重要的耐药菌, 在世界卫生组织 (World Health Organization, WHO) 于 207 年列出的重点关注的耐药菌列表上属于优先 级 危急级别 (Critical) 的耐药菌 ( news/releases/207/bacteria-antibiotics-n.) 在临床上,CRAB 常分离自重症病房, 与呼吸机相关肺炎 (ventilator associated pneumonia, VAP) 关系密切, 但很多时候难于区分 CRAB 定植的问题 而 CRAB 相关的血流感染患者也越来越多, 其对临床抗菌药物选择带来了困难, 同时增加了患者的痛苦导致了较高 [2] 的病死率 因此对血流感染患者分离的 CRAB 的耐药机制的研究和临床分析, 以及对 CRAB 分子流行病学的研究, 可为感染控制及抗菌药物合理使用提供实验依据 本研究对 6 年间 (200 年 6 月 206 年 5 月 ) 临床血流感染患者分离的 27 株 CRAB, 进行表型检测 耐药基因扩增 同源性分析及临床资料回顾, 报道如下 材料和方法. 菌株及来源纳入研究的 27 株非重复 CRAB, 分离自厦门地区 200 年 6 月 206 年 5 月期间住院患者的血液标本 患者的诊断参照中华医学会检验医学分会 临床微生物学血培养操作规范 [3] 和 血流感染实验诊断与 临床诊治 [4], 患者体温 >38 或 <36, 同时血培养分离到鲍曼不动杆菌 收集患者的临床资料及病原学资料纳入分析 细菌对亚胺培南和美罗培南的最低抑菌浓度 (minimal inhibitory concentration, MIC) 均 6μg/mL 血液标本采用 Bact/Alert 3D 全自动血培养系统 ( 法国 Bio Mérieux 公司 ) 进行培养, 细菌的鉴定和药敏使用 Vitek-2 Compact 全自动微生物分析系统 ( 法国 Bio Mérieux 公司 ), 复苏菌株的重新鉴定采用 Vitek-MS 质谱分析仪 ( 法国 Bio Mérieux 公司 ) 再次确认 质控菌株包括大肠埃希菌 (Escherichia coli) ATCC8739 铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa) ATCC27853 肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae) ATCC BAA-705 和 ATCC BAA-706 均来自卫生部临床检验中心, 包含 bla NDM bla OXA-23 bla KPC 和 bla VIM 等基因的阳性对照菌株由复旦大学华山医院胡付品教授赠予.2 培养基哥伦比亚血平板和 MH 平板购自郑州安图生物科技公司.3 改良 Hodge 试验检测碳青霉烯酶参照美国临床实验室标准化协会 (the Clinical and Laboratory Standards Institute, CLSI) 对肠杆菌科细菌的推荐, 细菌碳青霉烯酶的检测以美洛培南纸片采用改良 Hodge 试验进行 被测菌株与美罗培南抑菌圈交界处出现向内矢状的增强生长, 判读为改良 Hodge 试验阳性.4 引物 试剂及耐药基因检测细菌 D N A 的提取采用煮沸法 扩增所用的 Premix 试剂购自日本 TakaRa 公司 引物由 TakaRa 公司合成, 反应体系共 25μL, 扩增的反应条件参照文献 [5-7], 见表, 检测碳青霉烯酶耐药基因包括 B 类酶基因 (bla NDM ) 和 D 类酶基因

3 中国抗生素杂志 208 年 5 月第 43 卷第 5 期. 52. (bla OXA-23 bla OXA-24 bla OXA-5 ) PCR 扩增仪为 MyCycler PCR 仪 ( 美国 Bio-Rad), 产物使用 owerpac TM Basic 电泳仪经 2% 琼脂糖凝胶电泳, 结果在 Universal Hood Ⅱ 型凝胶成像系统 ( 美国 Bio-Rad) 中观察 对阳性扩增电泳后的产物送至 TaKaRa 公司采用 ABI 377XL 测序仪进行基因序列测定, 结果在 GenBank 网站进行 Blast 比对.5 菌株同源性比较采用 Vitek-MS 质谱分析仪科研库比较细菌的同源性 用无菌塑料环挑取待测单菌落, 均匀点样至靶板上, 置于室温, 待干燥后加上 μl 基质液涂布于样品点上, 室温干燥后上机 Vitek-MS 质谱分析仪, 采用 RUO 软件检测, 然后采用 SARAMIS Premium 软件进行同源性分析.6 CRAB 血流感染的临床资料收集与分析对 27 例 CRAB 血流感染患者, 收集并分析患者的一般信息及临床资料等, 包括患者的性别 年龄 科别 基础疾病 侵入性操作及其他危险因素 血培养的感染来源 抗生素使用情况 感染性休克的发生情况及治疗预后 2 结果 2. 实验菌株的一般资料及药敏情况血流感染的绝大多数 CRAB 对常用抗生素均耐 药 仅 株细菌对喹诺酮类 ( 环丙沙星 0.5μg/mL 和左 氧氟沙星 μg/ml) 氨基糖苷类 ( 庆大霉素和妥布霉 素均 μg/ml) 和复方磺胺甲噁唑 ( /9μg/mL) 敏感 2.2 碳青霉烯酶的检测及 B 类 D 类酶基因检测 27 株 CRAB 均为改良 Hodge 试验阳性 所有 CRAB 均未检测到 B 类酶基因 (bla NDM ) PCR 扩增产物电泳结果显示, 所有 27 株 CRAB 均包含 D 类碳青霉烯酶基因 且其中 25 株 CRAB 同 时检测到 bla OXA-23 和 bla OXA-5, 株 CRAB 包含 bla OXA-5, 而另外 株 CRAB 仅检测到 bla OXA-58 而并 不包含 bla OXA-23 和 bla OXA-5 ( 该菌株正是该株对喹诺酮 类 氨基糖苷类和复方磺胺甲噁唑敏感的 CRAB 菌 株 )( 图 ) bla OXA-23 bla OXA-5 扩增阳性产物测序 结果经与 BLAST 比对, 与目的基因一致 2.3 菌株同源性的质谱分析 采用 Vitek-MS 的 SARAMIS Premium 软件对 27 株 CRAB 进行同源性分析, 将细菌分成 3 大簇 (Ⅰ 型 3 株 Ⅱ 型 2 株 Ⅲ 型 2 株 ), 见图 2 Ⅰ 型主要分离 自 Ⅱ 型主要分布于重症监护室 () 及呼吸内 科,Ⅰ 型和 Ⅱ 型为 bla OXA-23 和 bla OXA-5 阳性株 Ⅲ 型为 bla OXA-58 阳性株, 分离自心内科及 患者 2.4 CRAB 血流感染患者的临床资料分析 回顾 CRAB 血流感染患者的临床资料, 绝大多数 表 扩增所用引物 [5-7] Tab. Primers for PCR [5-7] 目的基因引物名称引物序列 (5' 3 ) 扩增片段 /bp PCR 反应条件 bla OXA-23 OXA-23-F 5'-GATCGGATTGGAGAACCAGA-3' s, 52 40s, 72 50s, 30cycles OXA-23-R 5'- ATTTCTGACCGCATTTCCAT-3' bla OXA-24 OXA-24-F 5'- GGTTAGTTGGCCCCCTTAAA-3' OXA-24-R 5'-AGTTGAGCGAAAAGGGGATT-3' bla OXA-5 OXA-5-F 5'- TAATGCTTTGATCGGCCTTG-3' OXA-5-R 5'- TGGATTGCACTTCATCTTGG-3' bla OXA-58 OXA-58-F 5'- AAGTATTGGGGCTTGTGCTG-3' s, 52 40s, 72 50s, 30cycles 94 45s, 52 40s, 72 50s, 30cycles 94 45s, 52 40s, 72 50s, 30cycles OXA-58-R 5'-CCCCTCTGCGCTCTACATAC-3' bla NDM- NDM--F 5'- GGGCAGTCGCTTCCAACGGT-3' s, 58 40s, 72 50s, 35cycles NDM--R 5'- GTAGTGCTCAGTGTCGGCAT-3' bla IPM IPM-F 5'-CTACCGCAGCAGAGTCTTTG-3' s, 55 30s, 72 60s, 35cycles IPM-R 5'-AACCAGTTTTGCCTTACCAT-3' bla VIM VIM-F 5'-ATTGGTCTATTTGACCGCGTC-3' s, 55 30s, 72 60s, 35cycles VIM-R 5'-TGCTACTCAACGACTGAGCG-3'

4 血流感染的碳青霉烯类耐药鲍曼不动杆菌的分子机制及临床研究 马晓波等 患者(23/27, 85.2%)来自重症监护病房(9例)或专科的 60岁 从入科到血培养分离CRAB的时间从0~6d 监护病床 年龄分布上 70%的患者(9/27)年龄超过 平均为7.5d 基础疾病包括肺疾病 肿瘤 急性化脓 bp M bp 5 M - a b c M: DL2000 DNA Ladder Marker; "-": negative control; "+": positive control; ~5: CRAB -094/6-028/4-0/3-027/33-073; a: blaoxa-5 harbering CRAB-094; b: blaoxa-23 harbering CRAB7-027); c: blaoxa-58 harbering CRAB22-02 图 PCR扩增碳氢霉烯酶基因 Fig. PCR screening for carbapenemase genes % Nr 菌株号 OXA-23 OXA-5 OXA-58 科别 新生儿室 烧伤科 呼吸内科 呼吸内科 泌尿外科 呼吸 呼吸内科 心内科 图2 CRAB质谱蛋白质系统同源性分析图 Fig. 2 Homology analysis of CRAB byvitek-ms

5 中国抗生素杂志 208 年 5 月第 43 卷第 5 期性炎症继发 MODS 糖尿病 烧伤 早产儿 胆道疾病 泌尿道感染等 有 6 例患者有从其他部位标本分离到 CRAB( 包括痰液 例 胆道引流液 例 胸水 例 中心静脉导管 例 伤口 例 尿液 例 ) 所有的患者在血培养出 CRAB 前的 30d 内均有抗菌药物使用史, 使用频率较高的抗菌药物有 : 碳青霉烯类 (22 例 ) 氟喹诺酮类( 莫西沙星,2 例 ) 头霉素类(5 例 ) β- 内酰胺 / 酶抑制剂复合制剂 ( 哌拉西林 / 三唑巴坦,4 例 ) 3 代头孢菌素 (7 例 ) 6 例患者的抗感染方案根据药敏结果进行调整, 主要采用以替加环素为主的联合用药, 其中 0 例患者病情好转 bla OXA-58 阳性的 CRAB 患者未更换抗菌方案, 采用莫西沙星治疗后病情好转 所有血流感染患者中,5 例 (55.5%) 患者自动出院或死亡 3 讨论不动杆菌属细菌分布广泛, 存在于自然环境和医院环境, 是临床上重要的非发酵菌 鲍曼不动杆菌为条件致病菌, 毒力较低, 可导致多种感染, 包括肺部感染 尿路感染 伤口感染 血流感染 皮肤软组织感染以及继发性脑膜炎等 鲍曼不动杆菌相关的肺部感染主要是医院获得性肺炎 ( 尤其以呼吸及相关肺炎多见 ), 社区获得性肺炎不常见 其中鲍曼不动杆菌引起的呼吸机相关肺炎和血流感染具有 [8] 较高的发病率和死亡率 本研究资料表明,CRAB 血流感染患者均入住 或专科的监护病床, 年龄上多见于老年患者, 大多有严重的基础疾病并接受不同的侵入操作 患者的 CRAB 的原发感染最多见肺部炎症, 这表明肺炎是患者 CRAB 血流感染最常见的原 [9] 发感染来源 研究显示,CRAB 血流感染患者的预后不良跟大剂量糖皮质激素应用 糖尿病 机械通气 黏菌素和替加环素使用史 感染性休克的发生和入住监护病房等因素有关, 尤其是大剂量糖皮质激素应用 感染性休克的发生 患者的病情严重, 进展迅速, 部分患者甚至在抗感染方案更换前已死亡, CRAB 血流感染者的死亡率为 48.%, 与 Ballouz [9] [9] 等报道类似 报道显示, 血流感染的 CRAB 菌株, 对黏菌素全部敏感而替加环素的敏感率亦高达 83.3%, 我们的结果显示 株 bla OXA-58 阳性菌株对喹诺酮类 氨基糖苷类和复方磺胺甲噁唑仍敏感, 临床采用莫西沙星抗感染后患者好转 导致血流感染的常见病原菌中, 非发酵糖革兰阴性菌以鲍曼不动杆菌和铜绿假单胞菌为主 但血 流感染分离的鲍曼不动杆菌耐药情况不容乐观 [0], 来自 Chinet 的资料显示, 鲍曼不动杆菌对常用抗菌药 物耐药严重, 对碳青霉烯类药物的耐药率在近 0 年 间从 3% 增加到 66.7% [] CRAB 的耐药机制 [2] : 产碳青霉烯酶, 最常见的是 D 类 OXA 型酶和 B 类金属 酶 ;2 外排机制如 AdeABC AdeIJK 和 AdeFGH 等 ; 3 外膜蛋白丢失如 CarO Omp33-36 OprD 样蛋白 等 其中 OXA 型酶是最常见的, 尤其是 OXA-23 OXA-24/40 和 OXA-58 亚型以及自有的 OXA-5 型酶 我们对血培养分离的 CRAB 的分析显示, 产 D 类酶 (bla OXA-23 和 bla OXA-5 ) 是厦门地区血流感染 CRAB 的最 常见的碳青霉烯类耐药基因, 这与 Fu 等 [3] 学者对我 国 6 个城市的 CRAB 的分析相似 此外 bla OXA-58 基因 也是 CRAB 的一种重要的耐药基因, 但其耐药表型有 自己的特点, 对喹诺酮类 氨基糖苷类和复方磺胺 甲噁唑仍敏感, 其所在质粒的结构还有待研究 通过使用 MALDI-TOF MS 快速 灵敏地识别医 院内的工具, 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 技术 (MALDI-TOF MS) 在鉴定细菌上快速而精准, 研究显示, 对鲍曼不动杆菌的质谱技术进行同源性 分析十分便捷, 结果可与多位点序列分型 (multilocus sequence typing, MLST) 重复序列 PCR(repetitive sequence-based PCR) ERIC-PCR 等结果相比拟 [4-5] MALDI-TOF MS 在院内感染暴发的监控中具有很好的 实时性 本次研究的 CRAB 细菌分成 3 大簇,Ⅰ 型和 Ⅱ 型在院内存在流行, 尤其是, 而 Ⅲ 型为散发分布 总之,CRAB 血流感染的原发感染多为肺部炎 症, 且患者的病情严重, 进展迅速, 易导致感染性 休克, 具有较高的死亡风险 厦门地区的 CRAB 耐药 主要是产 D 类碳青霉烯酶 致谢 : 感谢华山医院胡付品教授惠赠参考菌株 参考文献 [] 刘赫, 多丽波. 鲍曼不动杆菌 A 类碳青霉烯酶的研究进展 [J]. 中国抗生素杂志, 205, 40(4): [2] Chopra T, Marchaim D, Awali R A, et al. Epidemiology of bloodstream infections caused by Acinetobacter baumannii and impact of drug resistance to both carbapenems and ampicillin-sulbactam on clinical outcomes[j]. Antimicrob Agents Chemother, 203, 57(2): [3] 中华医学会检验医学分会. 临床微生物学血培养操作规范 [J]. 中华检验医学杂志, 2004, 27(2): [4] 周庭银, 倪语星, 王明贵, 等. 血流感染实验诊断与临床诊

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