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1 Vol 28 Journal of the Graduate School of the Chinese Academy of Sciences January No G PaAGAP * Liu F Wu L Q Wang H et al Cloning and expression analysis of PaAGAP gene from Phytolacca acinosa in response to various kinds of stress J Journal of the Graduate School of the Chinese Academy of Sciences RACE Phytolacca acinosa G ArfGTPase ArfGAP ArfGTPase activating protein cdna PaAGAP PaAGAP 332 CX 16 C C2 PCR PaAGAP PaAGAP ARF ArfGAP Q943 2 clathrin COPI COPII 3 1 GTP GTP G GDP GTP ADP- ribosylation factor Arfs G Arf COPI 2 Arf GEFs ARFGTP ARFGAP ARFGTP KDEL- ARFGTP KKXX KXKXX C COPI ARFGTP ARFGAP 3 GCS1 ArfGAP1 1 ArfGAP 4 ADP- Arf1 Arf1 Arl GTPase Arf GTPase Arf 40% ~ 60% Arf 2 ArfGTPase 5 ArfGAP Arf GTPase Sar1p COPII * AA10Z AA B FN00 wulqi@ gucas ac cn
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3 PaAGAP PCR ArfGAP PaAGAP f TGGGCGTCAGCTAATATTGGAGT PaAGAP r TCTCAGCTTCTCCCATTATGTCATC PCR 50 L 94 5min 94 30s 55 45s 72 90s min PCR cdna 3 - RACE 5 - RACE gene specific primer GSP PaAGAP3 GSP1 CCCGTAAAAGTGAAAGTGTTTGATT PaAGAP5 GSP1 GATGAATTTGAACTTCGGAAACTAT PaAGAP5 GSP2 TGGCATTAGCCGCAGCATTTCCT PaAGAP5 GSP3 GATGTGTGTTCCAAGGCTTCTGTGC 3 RACE PCR 3 -CDS primer A Oligo dt 1 3 RACE PCR cdna 3 3 RACE PCR 50 L 10 PCR Ex2 Taq buffer 5 0 L 10 mol / L PaAGAP3 GSP1 1 L long universal primer short universal primer 1 L 2 5mmol / L dntp 2 L 5U / L Ex-Taq polymerase 0 5 L DNA 1 0 L ddh 2 O min 94 30s 55 30s 72 90s min 5 RACE PCR L PaAGAP 5 GSP1 Oligo dt 6 5 L DEPC Diethypyrocarbonate 5 L 2 5 L dctp 2 -deoxycytidine 5 -triphosphate 2mmol / L 10 L S N A P 24 L 94 2 ~ 3min 1min 1 L TdT 37 10min 65 5 RACE PCR 5 RACE 50 L 10 PCR Ex- Taq buffer 5 0 L 10 mol / L PaAGAP5 GSP mmol / L dntp 2 L 5U / L Ex-Taq polymerase 0 5 L DNA 2 0 L abridged anchor primer AAP 3 L ddh 2 O 36 5 L L 94 5min 94 30s 55 30s 72 90s min 5 RACE 2 1 PaAGAP5 GSP3 abridged universal amplification primer AUAP PaAGAP5 GSP2 AAP PCR cdna 5 PCR PCR 1 0% PCR DNA peasy-t Topo mg / L LB 4 L 1mol / L - -D- 40 L 20g / L D PaAGAP ORF PaAGAP ORF Primer 5 0 PaAGAP F 5 - GATGACTAGCCGCATGGAGCTTGGT -3 PaAGAP R 5 - GGGGGAGGAGGGTTGTTTAGTTTTA-3 PCR PaAGAP 94 5min 94 30s 55 30s 72 1min 30s min T-vector PaAGAP DNAMAN PaAGAP ScanProsite http www expasy ch / tools / scanprosite / TMHMM2 0 http genome cbs dtu dk / services / TMHMM
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8 1 G PaAGAP Triiodobenzoic acid TIBA 16 PCR PaAGAP PaAGAP ARF PaAGAP PaAGAP 300mmol / L NaCl 48h PaAGAP 2 2 PaAGAP h Arf GTPase G G Arf GTPase PaAGAP mirna PaAGAP G ArfGTPase 1 Cordulah COP-coated vesicles in intracellular protein transport J C Harter / FEBS Letters Tomas K Three ways to make a vesicle J Molecular Cell Biology Joel Moss Martha Vaughan Molecules in the ARF orbit J The Journal of Bioligical Chemistry Carolin W Rainer B Priska E et al Differential roles of ArfGAP1 ArfGAP2 and ArfGAP3 in COPI trafficking J J Cell Biol G J Jensen R B Lykke-Andersen K Frandsen G I et al Promiscuous and specific phospholipid binding by domains in ZAC a membraneassociated Arabidopsis protein with an ARF GAP zinc finger and a C2 domain J Plant Molecular Biology Chong K Zhuang X ARF-GTPase as a molecular switch for polar auxin transport mediated by vesicle trafficking in root development J Plant Signaling & Behavior Zhuang X Xu Y Chong K et al OsAGAP an ARF-GAP from rice regulates root development mediated by auxin in Arabidopsis J Plant Cell and Environment Xue S G Chen Y X Lin Q et al Phytolacca acinosa Roxb Phytolaccaceae A new manganese hyperaccumulator plant from Southern China J Acta Ecologica Sinica in Chinese J Tie B Q Yuan M Tang M Z Phytolacca americana L A new manganese accumulator plant J Journal of Agro-Environment Science in Chinese Phytolacca ameircaca L Mn J Nie F H Wu C B Wu S T Characteristics of Phytolacca acinosa accumulating Cd J Journal of Zhejiang Forestry College in Chinese J Bendtsen J D Nielsenh Vonh G et al Improved prediction of signal peptides SignalP 3 0 J J Mol Biol Nielsenh Engelbrecht J Brunak S et al Identification of prokaryotic and eukaryotic signal peptides and prediction of their cleavage sites J Protein Eng
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