In-house human immunodeficiency virus-1 genotype resistance testing to determine highly active antiretroviral therapy resistance mutations in Hong Kong

Similar documents
Analgesic effects of preoperative gabapentin after tongue reconstruction with the anterolateral thigh flap

Green pit viper antivenom from Thailand and Agkistrodon halys antivenom from China compared in treating Cryptelytrops albolabris envenomation of mice

Reviewing evidences on the management of patients with motor neuron disease

Cancellation of elective operations on the day of intended surgery in a Hong Kong hospital: point prevalence and reasons

ment group was more effective than that of the control group OR = % CI = Conclusion The clinical efficacy of Chinese medic

گزارش گمان شکن

======================================= 1 =======================================

Book2dic

¹ ¹ º ¹» ¹ º»

<4D F736F F D20E620DBE4F820DAE4CFE1EDC820C7E1C8E5C7C1>


公 Hygiene Pharmacy and Pharmacy Administration carbamazepine carbamazepine HLA-B*1502 SJS/TEN IC carbamazepine HLA-B*1502 carbamaz

AIDS???{???????P?P?V???????q\(100~08~13\)

1,000 copies/ml 為 定 義 值 然 而 第 三 代 的 病 毒 量 檢 測 方 式 可 以 偵 測 低 到 20 copies/ml 的 病 毒 量 ( 例 如 Roche Taqman v2), 所 以 是 否 要 根 據 儀 器 的 敏 感 度 把 低 量 病 毒 量 的 閥 值

Microsoft Word - ED-774.docx

平安(备案)[2009]N237号-平安全球医疗保险条款

肝炎的性传播途径和皮肤表现

1421 历 360 份, 局 部 使 用 抗 菌 药 物 不 进 行 统 计 1.2 方 法 统 计 分 析 2013 年 住 院 患 者 抗 菌 药 物 的 使 用 情 况 统 计 内 容 包 括 使 用 科 室 年 龄 体 质 量 住 院 时 间 诊 断 抗 菌 药 物 品 种 抗 菌 药 物

二零零六年香港愛滋病病毒感染者及愛滋病患者愛滋病防治社群評估及檢討報告

完成正副朝的形式

國立中山大學學位論文典藏.PDF

FAQ-CINESE

Microsoft Word - 2.v3n1.gjtm.docx

<4D F736F F D203035BA43A9CAB5C7B049BADCB177AACCAABAC0E7BE69B7D3C5402DB3AFBEE5AF5CA141B3AFA5C9B1D32E646F63>

2015医学版第六期

全球新型H7N9流行現況與因應之道

全球健康研究中心-中文

هندسة الحضارة تجليات العمران في فكر فتح االله كولن

03 年 8 月 Vol.5 No.8 支 气 管 哮 喘 ( 简 称 哮 喘 ) 是 儿 童 时 期 最 常 见 的 慢 性 呼 吸 道 疾 病 之 一 近 年 来, 随 着 人 类 文 明 的 发 展 社 会 化 进 程 的 加 快 经 济 水 平 的 提 高 和 科 技 的 进 步, 环 境

by mild (22.7%). Inhaled corticosteroids, systemic corticosteroids, and antibiotics were applied to 94.8% (292 cases), 74.7% (230 cases), and 90.9% (2

{ي ا ا ي ه ا ال ناس ات ق وا ر ب ك م ال ذ ي خ ل ق ك م م ن ن ف س و اح د ة و خ ل ق م ن ه ا ز و ج ه ا و ب ث م ن ه م ا ر ج الا ك ث يرا و ن س اء و ات ق وا ا

< 愛 滋 病 毒 感 染 者 的 新 陳 代 謝 異 常 相 關 問 題 > 因 子 包 括 : 1. 年 齡 : 年 紀 越 大, 得 糖 尿 病 風 險 越 高,40 歲 以 上 應 該 要 格 外 留 意 2. 性 別 : 男 性 愛 滋 病 毒 感 染 者 得 到 糖 尿 病 的 機 會,

综合报道

投影片 1

新英格兰杂志封面

Microsoft Word - GJPHV3N2-4.doc

211 better than those in the control group, with significant difference between two groups (P < 0.05). The ocular hypertension of patients in the cont

864 现 代 药 物 与 临 床 Drugs & Clinic 第 31 卷 第 6 期 2016 年 6 月 of apoptosis related factors, decrease the incidence of adverse reactions, which is of great

政院衛生署疾病管制局九十一年度自行研究計畫

非傳染病直擊2010年12月 - 汽水及兒童的健康

穨D03-02c-Annex.PDF

240 生 异 性 相 吸 的 异 性 效 应 [6] 虽 然, 心 理 学 基 础 研 [7-8] 究 已 经 证 实 存 在 异 性 相 吸 异 性 相 吸 是 否 存 在 于 名 字 认 知 识 别 尚 无 报 道 本 实 验 选 取 不 同 性 别 的 名 字 作 为 刺 激 材 料, 通

医学科研方法

600 现 代 药 物 与 临 床 Drugs & Clinic 第 31 卷 第 5 期 2016 年 5 月 were significantly decreased, but the levels of IL-12 in two groups were significantly increa

~ 10 2 P Y i t = my i t W Y i t 1000 PY i t Y t i W Y i t t i m Y i t t i 15 ~ 49 1 Y Y Y 15 ~ j j t j t = j P i t i = 15 P n i t n Y

第六章 結論

戊 酸 雌 二 醇 片 联 合 宫 颈 注 射 利 多 卡 因 用 于 绝 经 后 妇 女 取 环 的 临 床 效 果 评 价 陆 琴 芬, 等 371 Keywords groups, no removal difficulties and failure, was statistically s

卫生政策研究进展

i 2 ii 3 iii 4 ix 5 x 6 A xi B xvi C xvi D xvii E xviii F xviii

《俗話傾談》反映的1870年代粵方言特徵

标题

Microsoft Word - Chinese translation International SCI Male Sexual Fuction Basic Data Set.doc

rights and interests of doctors and patients. But it is insufficient jurisprudential basis and legitimacy crisis of legal forms through the form of mi

~ ~

国 际 中 医 中 药 杂 志 2014 年 2 月 第 36 卷 第 2 期 Int J Trad Chin Med, February 2014, Vol. 36, No 年 10 月, 笔 者 作 为 北 京 中 医 药 大 学 东 方 医 院 管 理 部 门 代 表,

彩色

2013国际营销科学与信息技术大会(MSIT2013)

( s y s t e m ) ( s t r e s s ) (stress model) ( s y s t e m ) [ ] [ 5 ] C o x [ 3 ] 1 [ 1, 2 ] [ 6-8 ] [ 9 ] Tw Fam Med Res 2003 Vol.1 No.1 23

計畫編號:DOH94-DC-2027

<4D F736F F D20C2CBC7D120D4E5D120C7E1C7DDE1C7D320DAE1EC20CDDEE6DE20C7E1CFC7C6E4EDE42E646F63>


香港促進健康飲食及體能活動參與的行動計劃書

EXCEL EXCEL

84 針 藥 併 施 治 療 偏 頭 痛 次 發 作 症 狀 為 左 顳 側 頭 脹 痛, 多 為 夜 間 發 作 影 響 睡 眠 或 工 作, 頻 率 為 一 天 發 作 一 次, 持 續 一 至 二 小 時, 疼 痛 指 數 7 分 (0 分 為 不 痛, 最 痛 為 滿 分 10 分 ), 需

DecouvrezLaFranceEnArabeVocabulaire

instillation therapy combined with Western medicine can reduce the levels of ALT, TBA, ALP, TBIL, DBIL and GGT, and improve the anti-cmv-igm negative

穆斯林每天的赞主词

研 发 前 沿, 相 关 报 道, Key Words: Laparoscopy; Early enteral nutrition; Colorectal cancer surgery Niu WB, Li ZY, Zhou CX, Wang GY, Yu YM. Clinical effects

<4D F736F F D20B2CCA3BA4542B2A1B6BE BFB9CCE5D3EBB1C7D1CAB0A9B7D6C6DAB5C4B9D8CFB52E646F63>

Vol. 22 No. 4 JOURNAL OF HARBIN UNIVERSITY OF SCIENCE AND TECHNOLOGY Aug GPS,,, : km, 2. 51, , ; ; ; ; DOI: 10.

Chin J Aesth Plast Surg, May 2018 Vol. 29 No [7] [8]


untitled

Microsoft Word - HKU_Scholars_Hub_2011.doc

Microsoft Word - 28-QM03.doc

. 運 用 社 交 技 巧 訓 練 於 一 位 重 鬱 症 役 男 之 護 理 經 驗. 壹 前 言 憂 鬱 症 是 本 世 紀 四 大 重 要 疾 病 之 一, 其 後 遺 症 會 造 成 調 適 能 力 人 際 關 係 職 業 能 力 社 會 角 色 和 認 知 行 為 下 降, 增 加 社 會

SARS综述_临床版.doc

清洁

拜功

Time Estimation of Occurrence of Diabetes-Related Cardiovascular Complications by Ching-Yuan Hu A thesis submitted in partial fulfillment of the requi

中 国 药 事 2016 年 5 月 第 30 卷 第 5 期 459 exclusion criteria, then data were extracted and finally the related studies were analyzed. Results: The varieties

(Microsoft Word - \325\335\315\345 \310\344\317\ )

标题

徐 小 平, 等. 封 闭 式 负 压 引 流 技 术 治 疗 Fournier 坏 疽 的 临 床 疗 效 349 结 果 : 治 疗 后 7 14 d 观 察 组 FGSI 均 较 对 照 组 低 (P <0.05), 观 察 组 平 均 清 创 次 数 为 3.8 次, 明 显 少 于 对 照

5-25袁宏钧.indd

P. C Evelyn. M. Duvall 2 quality of life cabana

中 国 肝 脏 病 杂 志 ( 电 子 版 ) 2010 年 第 2 卷 第 4 期 指 南 55 1 诊 断 1.1 临 床 表 现 肝 纤 维 化 患 者 的 临 床 表 现 无 特 异 性, 差 异 较 大 常 见 的 临 床 表 现 有 : 疲 倦 乏 力 食 欲 不 振 大 便 异 常 肝

% %

a b

Microsoft Word 定版

... (1)....(3)..(5)... (22) (22)......(22)... (22)... (23)....(33)... (33)....(34)....(47)....(51).....(52)......(61)......(62)

中國傳統醫學及養生保健學說中,與經脈及穴道有密不可分的關係

输电线路智能监测系统通信技术应用研究

®

附件1

伊斯兰关于真主的概念

untitled

<4D F736F F D20312D3120D5D0B9C9CBB5C3F7CAE9A3A8C9EAB1A8B8E5A3A92E646F63>

72-04.indd

Transcription:

Title Author(s) In-house human immunodeficiency virus-1 genotype resistance testing to determine highly active antiretroviral therapy resistance mutations in Hong Kong Chen, JHK; Wong, KH; Li, PCK; Chan, KKC; Lee, MP; To, SWC; Yam, WC Citation Hong Kong Medical Journal, 2012, v. 18 n. 1, p. 20-24 Issued Date 2012 URL http://hdl.handle.net/10722/157679 Rights Hong Kong Medical Journal. Copyright Hong Kong Academy of Medicine Press; This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.

O R I G I N A L A R T I C L E ١ تح ى ك مىكfiمل ى ف و م و- ة وهىو م ى م مل ه ى م مك ف ى م م مه ى ى ف مك ف ى م ف مو ف ى م ى ف م ى كف ه ث ه ب Jonathan HK Chen KH Wong Patrick CK Li Kenny KC Chan MP Lee Sabrina WC To WC Yam 陳漢坤黃加慶李頌基陳志偉李文寶杜維之任永昌 Key words Antiretroviral therapy, highly active; HIV-1; Drug resistance, viral; Genotype; Mutation, missense Hong Kong Med J 2012;18:20-4 Department of Microbiology, Queen Mary Hospital, The University of Hong Kong, Pokfulam, Hong Kong JHK Chen, BSc, PhD SWC To, MBiochem WC Yam, PhD, FRCPath Integrated Treatment Centre, Special Preventive Programme, Centre of Health Protection, Department of Health, Hong Kong KH Wong, MB, BS, FHKAM (Medicine) KKC Chan, MB, BS, FHKAM (Medicine) Department of Medicine, Queen Elizabeth Hospital, 30 Gascoigne Road, Hong Kong PCK Li, MB, BS, FHKAM (Medicine) MP Lee, MB, BS, FHKAM (Medicine) Correspondence to: Dr WC Yam Email: wcyam@hkucc.hku.hk ف ى م ى ف م ى كف وهىو ن ك م م ن مو م ى م مل ش Objective ف و ن م مه pol ف ى مو ى ى ف مك ف ى م ف مو ى م ف ك ىك فو م مه ( ١ -ضةب) ١ تح ى ك مىكمحمل ى. م ه ى مه ١ -ضةب م و- ى ف ن فم ق ه ث ه ب. ل م ى كم مز Design.ه ث ه ب ى كى ى ك ضةب 属 ش Setting لم ف属 م مك ف ى م ه ى مه م و- ى لممحىل ء Patients ٩٦٥ ن م ف ف ف ١١٦٥ ى م مه pol فى ف مو مك م م و ى属 لم ف ك- ك ف属 م ن مك ف ن م موش. مى ف ١ -ضةب مس ىض لم فتح ى ف ى ى لء ه ء ل ف ل ء سص مو لم ى ق م م属 ه ى مه ن م موش. م ه ى مه. ى ف ف ن م فقف فل مك ف ى م ه ل ١ -ضةب ل ن ف س مو ( ٤٠ $سص) م مك ف ى م كى مه م و- ى م ى كمننم- ك موش Results ل ف ل ء سص مو مك ف ن م م قف ف ك لم ف مل ى كم مل موش. م مس ىض لم فتح ى ف ى ى لء ه ء ٤٠٠ وكفم ل ك م مك ف ى م كى مه م و- ى ىو ن ى ى م م属 وكىو属 ء ٠١ ءز ل ف م ق ١ -ضةب و ق ن ج / مى ك مك ف ى م ه ء.ه ث ه ب ى م مه ف ى لم مو ن م ف م فم - ى لم كم مل م م属 ى ف فكمحى هى ف属 م مو م م属 ب. مى ف م ىفن- م فم مم属 مق ى ف مك ف ى م ه ل ن ك م م ن مو ى مك م مننىل. ء ٠١ ءز ل ف م ق لم كم مل م مك ف ى م كى مه م و- ى م ى كمننم- ك د Conclusion ى ف لم ف م تحمك ف ى م ه ل ى مك م مننىل فكمحى هى ه ب ى ء ٠١ ءز ل ف م ق ١ -ضةب مم属 مق مىك م م ن م مننىل ن م فقف فل ى ف لم ف م تحمك ف ى م ه ل ء.ه ث م ه ف ه ث ه ب ى لمو ى قف م مق ل و م مه ١ -ضةب. م فم ضةب ن مك فلى ه New knowledge added by this study ( ١ -ضةب) ١ تح ى ك مىكمحمل ى ف و ى ف م قفكى ف ف属 م لم م مل 属 م موش ط.ه ث ه ب ى ه ى ىف م م مه Implications for clinical practice or policy ن ى فى ى ى م نمق لمل م كم ى م مك ف ى م ه ى مه ١ -ضةب م و- ى مو ن م ص ط. ف مو ف ى م ى ف م ى كف وهىو م فى ف Introduction م ى كمننم قف ف م م فو (شزءءب) ف مو ف ى م ى ف م ى كف وهىو ن م موش و ل ف م فم ىل (ضةب) ى ك مىكمحمل ى ف و ن ى م ه مو ه ى ك ى ن م م مل مو ق لم ى ك مق فك محم مق م مو م م 属 ب ١. ف ى ه ىه ٢ ٣.مك ف ى م ه ل ف ى م ى ف لم محملتح(سءة) مىك س سءةء ف ى ف م ة ٦٠ فو م م ك م ف م موش و ى 属 لم فىك ف م ف وكىو 属 ( حزء) ى ف لم ف م تحمك ف ى م ه ل ف ى م ى ف لم فتح(ءءء) ى ف ى ى لء ه ء ل ف ل ء سص ى مو ه ىه مق ه ل مك ف ى م م ى ف لم ملى 属 ممق م فو ( شزا) م مك ف ى م كى ما ٤. م ف ك ف ى م ى ف وهىو مو م ء ٥. مى ك لم م مل مو ى ه ى ى مك ف ى م ه ل ١ -ضةب ن مكى م 20 Hong Kong Med J Vol 18 No 1 # February 2012 # www.hkmj.org

# HIV-1 genotype resistance testing # ١ -ضةب فىك م ك لم ف-ءءء مو ه ى ن ك ه ى م مل لم ى ى -مك م م ه ى مه ن ن ىو ملى لم ى ك ى مق ف مى ك.م ى ف ف ه ى م مو ل لمى م 属 ل ىو ن فم م ف ك ىك فو م مه ١ -ضةب ى حزء ن ك م م ن ١ -ضةب م و- ى م ى كمننم- ك ف ه ى ه ث ه ب ى - ل ف م ق و ق و ى 属 م ن م قف ى شزا. فى ف ١ -ضةب Methods Sample collection ن م ف ف ف ٢٠٠٩ ١١٦٥ ل ف ٢٠٠٥ مم 属 م 属 ى لم كم ك م م 属 مى ف لم كمن ى-ضةب ٩٦٥ م فم -م م ه ىس.ه ث ه ب ى كى ى ك ضةب م خف - م فم ٨٦٥ ن م قف ىف ف م م 属 م ف - ل ف م فم -م لم ىف فم مو 属 مى ف كىه ى ٢٠ ن م قف ىف ف م م 属 م ف م فم - م فم كىه ى ٨٠ ل ف م ى م - م فم م م 属 م ف م فم - ذ. مى ف م ىفن شزءءب ه ى ف م نف و ٢٤ ١٢ ن لم كم ك م ف ى ك ف م م م ملى م ك 属 مو ىم و ى 属 (ةذ) ىقىو ى م فم م ( ةشزخ) ىقىو ى م م م ملى م ك تح م ةشزخ 属 م فم كىه ىض.(ةشزخخ) ىقىو ى م ف ى ك ف ن ى ف مل ف لم محمل ف 属 م م ى م ٢٤ ىو ى 属 ج / مى ك ٤٠٠ فو م ن لف ف ى ف مك ملى م ف و ى 属 ل ف شزءءب ه ى فى ى ى ن مم 属 كىه ىض.م ىفن فكى ى ك فكىه ى ن مو ف لم محمل ف 属 مى ف ف ى م ىفن م فم ج / مى ك ١٠٠٠ فو م ن لف ف ى ف ن مك م م و ى 属 و ى 属 ى فكك 属 فو م.م ىفن فكى ى ك فكىه ى لم فىك ف Protease and reverse transcriptase nucleotide sequence determination جك ٥٠٠ مو ن وكفم ن لم كف م ف 属 ءخز ف ىض م م 属 م ف ف ف موش. م ف ف ف مى ف لم ن م ف 属 ى كف م ف ى ل ف ٨٠- ى لم ف لمه نى مك مح م م 属 م ف مو موك فق ى لم كف م مو ل ف م ى ٩٠ ن ٤ ل ف ه ٠٠٠ ٢٠ مهفىر) ىث ى كف ءخز ف ىض فءةر مو ه ى ل ف (زذ) م فم م ى م موش.( ف ما مل ىب م ف ى ك ف م م م مو ن ل ك ٤٠٠ مح مو - ى ف ق لم ف م مه م م 属 م ف ١١٦٥ ف ن (شز) ل ف ى فكمحى ف موش ٦.ل و م ه ى مه م و ل و م م و- ى مو ى لم م ى ه ىك م م ك ى م ن لممحىل ممق لفو وكىو 属 ضةب ن م ف كىو وهىو مو م ل ى م مو ن ك مىكمحنم ه ىل ىق مو لم م فم 属 لم ى ى م م 属 م ى لممحىل موش. م م ى ىهم كمحىكفذ فى ء مو ى ه ى ف ك ىك فى ف ١ -ضةب ن ة ء مو ق لم ف م مه مو م م 属 مك م مس.(١ م قفش) م ى لمى ء) م» ف ء كى م ما ٣١٣٠ حسةزذ - م فم ٣٥٠ م ف ١١٦٥ مو ه ء.(سص ء - م فم ٨٠ ل ف م ى م - م فم ٢٠ م خف 使用一套耐藥基因型的內部測試系統找出香港人類免疫缺陷病毒一型 (HIV-1) 高效抗逆轉病毒治療 (HAART) 耐藥基因變異的情況 目的使用 HIV-1 基因型耐藥檢測的內部測試系統找出香港 HIV-1 pol 基因中 HAART 耐藥基因變異的情況 設計回顧研究 安排香港兩間 HIV 診所 患者使用一個改良了的基因型耐藥檢測的內部測試系統, 把 965 名 HIV 患者中的 1165 個血漿樣本作 pol 基因序列分析 得出結果與美國食品藥品監督管理局 (FDA) 認可的基因變異測試系統 (ViroSeq HIV-1 genotyping system) 作比較 最後把測試結果呈報美國斯坦福大學 HIV-1 耐藥數據庫作分析用途 結果我們所使用的病毒基因型耐藥內部測試系統價值 40 美元, 其表現可媲美 FDA 認可的基因變異測試系統 (ViroSeq) 這內部測試系統對於本港最常見的兩種 HIV-1 亞型毒株 (HIV-1 subtype B and CRF01_ AE) 的檢測上限可達至每毫升 400 拷貝 耐藥變異只在治療失敗的病人經治療後的血漿樣本中檢測得到 至於兩種 HIV-1 亞型毒株 (subtype B and CRF01_ AE) 的耐藥變異頻率則無顯著分別 結論對於兩種 HIV-1 亞型毒株 (subtype B and CRF01_ AE) 耐藥基因變異的頻率, 經過高成本效益的病毒基因型耐藥內部系統測試, 發現並無顯著分別 香港必須要發展一套針對不同 HIV-1 基因型的數據庫, 以加強對於 HIV 病毒治療的指引 -ءءء ف ه ى لم مه ف م م 属 م ف م ىفن ى م ) م س ه ى ما ١ -ضةب مس ىض لم ف مو ن مك ف ن م مو ه ى ف ف م ن فم ف ف (٢.٠.شزا م و- ى TABLE 1. In-house primers used for reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR), nested PCR and cycle sequencing Primer name Sequence (5 > 3 ) HXB2 position First RT-PCR HIVGRT1F GCAAGRTTTTGGCBGARGCAATGAG 1867>1892 HIVGRT1R GACATTTATCACAGYWGGCTACTATTT 4359<4333 Nested PCR HIVGRT2F GGAAAAAGGGCTGTTGGAAATGTG 2015>2038 HIVGRT2R TTAGTYTCCCTRYTAGCTGCCCCATC 3901<3876 Sequencing HIVSEQF2 GCCTGAAAAYCCATAYAATACTCCA 2702>2726 HIVSEQF4 GAGAGACAGGCTAATTTTTTAGG 2071>2093 HIVSEQF5 ACACCTGCCAACATAATTGGA 2490>2510 HIVSEQR1 GGAGGGGTATTRACAAAYTCCCA 3811<3789 HIVSEQR2 TGGATTTTKTDHTCTAAARGGCTCT 3173<3099 HIVSEQR3 GGTACAGTGTCAATAGGACTAATTGGGAA 2575<2547 HIVSEQR4 CCATTCCTGGCTTTAATTTTACTG 2598<2575 Hong Kong Med J Vol 18 No 1 # February 2012 # www.hkmj.org 21

# Chen et al # لم ف ك مو م م 属 مك م م موش. ىهم كمحىكفذ Quality assurance of the in-house genotyping test. م ى فه مو ق لملى م مك م منم مو و ى 属 م ق ف ف م و- ى مو ن ى ى ى كم مل موش ف ف ه ى لم فهى م ى ف 属 ء ٠١ ءز ل ف ٠٠٠ ٢٠ ٠٠٠ ١٠ : 属 ن ف ى ىل فى م و ى 属 م ف.ج / مى ك ٢٠٠٠ ١٠٠٠ ٤٠٠ ٢٠٠ ١٠٠ شزا م و- ى مو ن ىكمحىكم ل ف ى ى ى م موش شء زش مو ى ى ف ىكى ف وه و لم ف ف م م م 属 مو ق ل مو (سءرءش) م موكس مك ف ء ى ف ر فى ء ن ف ء ٧.فى ف ء ف قفج ه مس ف ى فخ م ف ه ى م ك مىكمح ٢٥ و ى 属 م ف ه ى م م مح موش. م م و- ى مو ه ى لم مه م م 属 م مه ١ -ضةب م مننىل ن م ف فكى ى ك م م 属 -فى ء مو ن ف م مننىل ى مى ف ن لم كم ك TABLE 2. Frequency of the major drug resistance mutations in samples obtained from HIV-1 subtype B and CRF01_AE treatment-failure patients Mutation HIV-1 subtype* P value Reverse transcriptase Nucleoside reverse transcriptase inhibitors CRF01_AE M41I/L 6/37 (16.2) 7/28 (25.0) 0.54 D67N 11/37 (29.7) 9/28 (32.1) 1.0 K70G/R 5/37 (13.5) 5/28 (17.9) 0.73 L210W 3/37 (8.1) 4/28 (14.3) 0.45 T215C/E/F/I/S/Y 8/37 (21.6) 11/28 (39.3) 0.17 K219E/N/Q 7/37 (18.9) 6/28 (21.4) 1.0 K65R 1/6 (16.7) 1/7 (14.3) 1.0 L74V 5/9 (55.6) 2/7 (28.6) 0.36 Q151M 1/9 (11.1) 1/7 (14.3) 1.0 M184I/V 34/39 (87.2) 25/29 (86.2) 1.0 Non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors K103N 4/15 (26.7) 12/15 (80.0) 0.0092 V106A/M 1/15 (6.7) 0/15 (0) 1.0 Y181C/I 5/15 (33.3) 4/15 (26.7) 1.0 G190A/E/S 5/15 (33.3) 2/15 (13.3) 0.39 Entire protease L23I 0/26 (0) 1/24 (4.2) 0.48 D30N 0/26 (0) 5/24 (20.8) 0.0201 V32I 1/26 (3.8) 1/24 (4.2) 1.0 L33F 1/26 (3.8) 3/24 (12.5) 0.34 M46I/L 11/26 (42.3) 8/24 (33.3) 0.57 I47A/V 3/26 (11.5) 1/24 (4.2) 0.61 G48Q 0/26 (0) 1/24 (4.2) 0.48 I50L/V 1/26 (3.8) 0/24 (0) 1.0 I54A/L/M/V 5/26 (19.2) 5/24 (20.8) 1.0 L76V 2/26 (7.7) 0.24 (0) 0.49 V82A/F/T 3/26 (11.5) 4/24 (16.7) 0.70 I84V 5/26 (19.2) 1/24 (4.2) 0.19 N88D/S 3/26 (11.5) 4/24 (16.7) 0.70 L90M 4/26 (15.4) 7/24 (29.2) 0.31 B Drug resistance analysis مو ق لم ف م مه م هف ن مك م م ف لى ىل ى موش لم ىلم ف ف ل ف لم هى ف م م 属 م م و- ى زءشسءخء) م ٨.١ ى م م مه م فج مو و ى 属 لم ف م مهتح م مس ىض مو ء.(سص ى ك ىط م ف 属 ن س ه ى ما ١ -ضةب مس ىض مو مك م م. م هى ف ل ف ه ى ىلم مك م م ن لم ف 属 لم ىلم مو و ى 属 لم ف 属 مم كى م مه و ء ى ف ى ف ك- ك م م ف مك م م مو ء.ه ىك م م ءخء ى فكمحى ف ه ى ل ءا ز مو لم ى ق م م 属 مك م م لم ىلم ه ى مه ضةب ن ٢.٠ ى م ش ه ى ما.قل ىو//: و) م فقف فل قلضةب ل ن ف س مو ل ف ٨ ٩. ى ف م م ى مك ف ى م ه ل ن ( لم.ل ن ف م م 属 ه ل ف ى م ى ف ٢٠ ن مى ى ىقى مك موش (شغء) م ىل لى» :لمل ك ى موش.لم م م ى (ش ٤ ل) م ىل ف (ةلل) م ى فلىل ( ش ٣ ) م ىل ى ف (ءءش) ى ن م ( شء) م ىقف ىكى م ( ء) ى فكفقف (زش ) م ى ى ف م (ضء )» م ى فنم (ضجء) م ىل ى ف مل (ضزء) ى ف فل (ضشء) ى ف ف»ف ف (ذضخ) م ى ف ى م (ضذج) ى ف ى (ضءة) ى ف ىل ى (ضذء) ى ف م ف ن (ضرس) ى ف ى ف (ضءخ) ى ف مح م (ضشز) ى ف ى.(ضذش) ى ف ف ى ل ف Results Quality assurance of the in-house genotypic resistance test م ف ك مىكمح ١ -ضةب سءرءش م مح مو و ىط م ى ك م لم ف م مهتحشزا م و- ى مو مو و ى 属 مك فل ك ك ٩٥ م لم ف مل م ف سءرءش موش. م مك م م مك م منم م مه ١ -ضةب م ى و ى 属 م ف لمل ك ى لمى فك وكىو 属 ن م ( ء ٠١ ءز ل ف م ق ). ىهم شز/زذ مو ى حزء مس ىض ل ف م و- ى مو ن كم ف م مننىء ىو ى لم ف ك م م 属 م ه ى مه ١ -ضةب ه ى مك ن فل ٣ ٢ لم ى م م و. ل.ه ى مك ن لم ف 属 م ى م ف ى ى ل ف م ى م م ك م ف فكى ى ك ٤٥٠ ف كم م و ىط لممحى ملى ف 属 م ف حزء مو ى مك فل ك ك فى م مو ه ى مه. م 属 مو مم 属 مق م و- ى مو م ف ف ف م ى ى تح ١ -ضةب لم ىل لف ف ى و ى 属 م ف لممحى ف ن مكك شزا م ق فكى ى ك و ق ج / مى ك ٤٠٠ 属 ل لم ف مل وكىو 属 م ف ١ -ضةب ء ٠١ ءز ل ف مس ىض لم ف-ءءء مو م م قف ف ك و ى 属 م ف ن لمل م كم ) م ه ى مه مهفم مو م م 属 ب.(ج / مى ك ١٠٠٠ ڤ ن لف ف ى ل ف ف 属 م م و- ى مو ه ى ن ك ه ىل م ك ه ى ىمكم مى ف ن. خ ف مو ن م ف ن. خ ى 属 و م ف ف فء م كف ق ى و ى属 ه مو ى ه ل ف ى م ى ف ض م كف م لا مو ىء و ى属 لم ف ك فك م م属 م ف ذ 22 Hong Kong Med J Vol 18 No 1 # February 2012 # www.hkmj.org

# HIV-1 genotype resistance testing # مو م ف م ف 属 وكىو 属 م ف م ٤٠ $سص.( ١٦٠ $سص) م مس ىض مو ه ى ن ك Subtype distribution in Hong Kong م ف ١١٦٥ ف ن مك م م ف ى ل ىو ة.شزا م و- ى مو ق لمك م م ن مكك م م 属 و ى 属 لم كمن ى م م ( ٤٦) 属 ٤٤٤ مى ف ٩٦٥ مو ه ء ء ٠١ ءز مو و ى ( ٤٣) 属 ٤١٥ ل ف ى م ق مو و ى 属 لم كمن ى م م 属 مى ف ٩٩ مو ء. ى مى ف ٤) ١ ء م ق ه ىل ك ى م مه لم محمل ٠.٢ ) مى ف (٢ ء ٤.١ ) مى ف (٤٠ ٠.٤ ) ( ٠.٧ مى ف ٧) اء ٠٢ ءز ( ٠.٣ مى ف ٣) ا مى ف ٦) ٠٨ ءز ( ٠.٧ مى ف ٧) ٠٧ ءز م ى مو ل ف ( ٠.٢ مى ف ٢) ٣٣ ٠١ ءز ( ٠.٦.( ٣.٦ مى ف ٣٥) ن ف ىق كم Frequency of major drug resistance mutations لم ىمكم لفو و 属 مى ف لم كمن ىتح ء ٠١ ءز ل ف. ةشزخخ لفو و 属 مى ف ٤٧ مو ف ه ىل فهمز ن ( ٥٧) ٢٧ م ىهم شزءءب ىمو ى ةذ لم ىمكم فم ف لم م مل لفو وكىو 属 م ى لمى فك مو ] ١٢/٢٤ [ ٥٠ : ) ى ف مك ف ى م ةذ يف م ن ح.(]١/٣[ ٣٣ : مو ] ١٤/٢٦ [ ٥٤ : ء ٠١ ءز لم 属 و ى ف مك ف ى م ةذ ف ى مو ى ل ف م ق مم 属 مق مك م مننىل فكمحى هى لمك ل ى-ضءخ ىوش.خ ٣٠ ء مك م م ى ء ٠١ ءز ٢١ ى لممحى ملى ف 属 ى ف مك ف ى م ةذ يف ه ى فك مى ف ف ى ق مى ف م ق ن ج/ة ٤٦ ح موش.( ٠.٠٢٠١ =ذ) م مه مو و ى ١ -ضةب 属 ةذ يف ل ن ك مو ف 属 ى ف لم م ق ف 属 ة. ل ىو ى ى ف مك ف ى م (١١/٢٦) ٤٢ ل ف لم كمن ىتح م ق ن (٨/٢٤) ٣٣ ى م م لفو و 属 مى ف لم كمن ىتح ء ٠١ ءز ن ى ف ح ٩٠ ج موش.ضرس ضشز ضءخ ضذج ضءة ل ف تح م ق ن (٧/٢٤) ٢٩ ى لم م ق ف ف 属 و 属 مى ف لم كمن ىتح ء ٠١ ءز ن (٤/٢٦) ١٥ يف مو د. م فم ضءة ضءخ لم ىمكم لفو ء ٣٣ ج ة ٣٢ ض ة ٢٣ ج ه ىل ك ى ى ف مك ف ى م ةذ ض ٨٤ ة ش/ء/ء ٨٢ ض ض ٧٦ ج ض/ح/ج/ء ٥٤ ة ض/ج ٥٠ ة ر ٤٨ ا ض/ء ٤٧ ة ن مك م م مو ى لم م ق ف م م 属 س/ء ٨٨ خ ل ف. م ف ء ٠١ ءز ل ف م ق مو - م فم ف ن م ف مو ن م شزا موش لم فم م مى ف م ى م - م فم ل ف م خف.م مه ف ى مو ى حزء يف لم محمل-سءة مى ف م ىفن- م فم ٨٠ مو ه ىل فهمز م ىهم شزءءب فى ى ى ىمو ى ةشزخ لم ىمكم مو تحمك ف ى م ةشزخ لم محمل-سءة م فم ف ل ف ن مك م م مو ى لممحى ملى ف 属 ى ف لم ف م مو ن ك م م ن موش. م ف م فم - ىمو مو ه ف ةذ ل ف ةشزخخ ةشزخ ن حزء يف ء ٠١ ءز ل ف م ق ن م ف م فم - ىهم شز مو ة.٢ م قفش ى لم م م م ف م ف ل ك وكىو 属 ( حءش) ى ف م ه ف ف م ىلى و ل ف ء ةلل ش ٤ ل شغء ى ىقى مك مو م فم كمل و 属 مى ف مو ن (٣١/٧٢) ٤٣ ى لممحى ملى م م 属 ءءش ف م مه م م 属 حءش موش.ش ٤ ل شغء لم ىمكم لفو م ق ١ -ضةب و ى 属 مى ف ى م ف م م م ق ء ٠١ ءز مو لم ف ك (١٤/٢٨ ٥٠ ) فكى ى ف ف 属 مك م مننىل ىو ق (١٣/٣٧ ٣٥ ) حءش م مننىل مو ه ء.( ٠.١٧-١.٠ =ذ) فكمحى هى ى ف ىوش. ك مو ف 属 ع/س/ة/ء/ / ٢١٥ ش لم م مل فو فو م ف م م ى ل ن ف ف 属. ى ف ج/ة ٤١ ح مو ىمو ى ش ٣ لم ىمكم لفو و 属 م و ه ىل فهمز م ق ن ى وهىو ف م ىهم شزءءب فى ى ى مى ف (٣٤/٣٩ ٨٧ ) ء ٠١ ءز ل ف (٢٥/٢٩ ٨٦ ) م فك فو ى ف ض/ة ١٨٤ ح مو لم 属 و م ف.مك ف ى م ش ٣ م م -وهىو ٣٣ مى ف م ىفن- م فم ٨٠ مو ه ء ٣ ل ف ء ٠١ ءز ١٥ م ق ١٥ ه ىل ك ى (٤١ ) ىمو ى ةشزخخ م م لفو م ق مو مك ف ى م ةشزخخ ف ى ء. م ىهم شزءءب فى ى ى ٣٣ م مو ن ١٦ ى لممحى ملى ف 属 خ ١٠٣ ث ى ف : ء ٠١ ءز ] ١٢/١٥ [ ٨٠ : ) مى ف لم فم -ةشزخخ م ى م ق ة.(]٢/٣[ ٦٧ : مو ] ٤/١٥ [ ٢٧ ى فو م فم ه فكمحى هى ف 属 م م مل خ ١٠٣ ث ةشزخخ ف ى مو د.( ٠.٠٠٩٢ =ذ) م ى ء ٠١ ءز ل ف ة/ ١٨١ ع ح/ء ١٠٦ ض ه ىل ك ى ى ف مك ف ى م تح م ق ى ل ن ف ى فكك م م 属 س/ /ء ١٩٠ ا Discussion ن فى م م ف م كمق فو شزا ه ى مز -ءءء مو وه و ء.ه ى ى مك ف ى م ه ل ١ -ضةب ى ف -وهىو لم ف مل فو ه ى مه لم ف ١ -ضةب - ل ف م ق و ق مك ف ن م مل ىو ف ف ىمو ن ك ه ى وهىو مو ىف ٦. مى ك ه ى م مل ى ى فكى ف م ى ىمو شزا م و- ى لممحىل ف لمك ل ى ل ىوش م قف ى ى ف ه ىل ىق م ى لم ى لفو وكىو 属 كى م مه ١ -ضةب ن مم همل لم فم ك ى مو ه ى م ن مك ف ن م ة ١٠. ى فك ى ل ن ى م ىل ف م ف ه ى م ك مىكمح سءرءش م مح مو ى م ى ه ى نى ملى ن ى ى ى م وهىو ى لم فكىل ى. م مه ١ -ضةب م و- ى ن ك ه ى 属 مو ه ى 属 د مو مك ف ن م م قف ف ك ل ف ( ٤٠ $سص) شزا ه ى مه ١ -ضةب مس ىض لم ف-ءءء فىك م ك ى فىكم م لمى ف ملى 属 مق ل ك ى م. مى ك ه ى م مل ى شزا م و- ى ن م مو وه وش ه ث ه ب ى م ف فكى ى ك ١١٦٥ ه ى مه ل ف م ق ١ -ضةب مو فو لم فم م ف م 属 ى م مه ف ى لم مو م م 属 ء ٠١ ءز و ك ف ن م ى م د.ه ث ه ب لمل مى ٢٠٠٤ ل ف ٢٠٠٠ مم 属 مق لم كم ك م م 属 ب ١١. م ى ء ٠١ ءز ل ف م ق ٢٠٠٥ ن لم كم ك ف 属 ل ىو ى و ك مو - ن مى ف م فم ه ف لمل ك ى ل ف ٢٠٠٩ م ك موش. ف ىق كم 属 م ١ -ضةب ل ف م ق كى م مه ه ى فم ك ى مو و ى 属 م ى ك ف ى ل Hong Kong Med J Vol 18 No 1 # February 2012 # www.hkmj.org 23

# Chen et al # شزا م و- ى م ى كمننم- ك ى ك ك ة وهىو ل ف لف ف ى 属 ن ى كم مل مو ن م قف ى ى ه ف ه ى ف ك ىك م ف ١ -ضةب ى م ىل كى م مه ى م مو وه و ء.فى ء ى مى ك ه ى م مل مم 属 مق مىك م م ن حزء ى مك م مننىل فكمحى هى ن م فقف فل حزء ف ء ٠١ ءز ل ف م ق ف لمو ى قف م مق ل و م مه ١ -ضةب م مننىل. ىهم ى ى كمن ى ضةب ن م مهف ف ن ملى ه ه ب ى لم م ى م ١ -ضةب ن ى م ىل ١٠.ه ث ف ى ى ف مك ف ى م ن مك م قف موش م ف مى ف م فم -م ل ف م خف - م فم ف ى ن مك م ف م 属 مو م ف مل ف ١٢.ه ث ه ب ى مى ف ١ -ضةب ه ف مك ف ى م لم م مل ى ف مك ف ى م ه ل ف ملى.شزءءب ه ى ف م نف ى حزء ن ك م م ن مو ى مك م مننىل موش لم فقمل ف ممق فو م ى - ل ف م ق ١ -ضةب مو ن ف م ما ١٧-١١ ١٣. فم ف م م ن كى ك م م ن ى مك م مننىل فكمحى هى ىقىو م حزء ل د. م ى ء ٠١ ءز ل ف م ق ى ةشزخ لم م مو属 فو لم ف مل م م属 و مك فوك موهىو ف لفو م ف ف م ق ١ -ضةب مو. ء ٠١ ءز ١ -ضةب لم ف ك حءش ه ى م مل ن خ ١٠٣ ث ن م ف موهىو فكمحى هى ف ى ىللف ة.م ق م ن مو ى لم م ق ف属 م م مل Acknowledgements ل ء ش سءةء مو ق لم ف 属 ل موش ىهمز م ى ف ى ى لء فىكم س ه ث ه ب مو ن موش.(ز ١٦٤ -سسح ل ف ز ١٥٥ -سسح ف ا) م م ا م ف ى م ف ىم مو لم ىف ك ى م ف ل ف ى ى كممخم ى ف مكم ل ل ف و ف مو ن 属 مى ه ث ه ب ى كم ذ و فمب ن م م مو ن م و.و فمب ن م ف مء References 1. Palella FJ Jr, Delaney KM, Moorman AC, et al. Declining morbidity and mortality among patients with advanced human immunodeficiency virus infection. HIV Outpatient Study Investigators. N Engl J Med 1998;338:853-60. 2. DeGruttola V, Dix L, D Aquila R, et al. The relation between baseline HIV drug resistance and response to antiretroviral therapy: re-analysis of retrospective and prospective studies using a standardized data analysis plan. Antivir Ther 2000;5:41-8. 3. Ledergerber B, Egger M, Erard V, et al. AIDS-related opportunistic illnesses occurring after initiation of potent antiretroviral therapy: the Swiss HIV Cohort Study. JAMA 1999;282:2220-6. 4. Johnson VA, Brun-Vezinet F, Clotet B, et al. Update of the drug resistance mutations in HIV-1: December 2009. Top HIV Med 2009;17:138-45. 5. Hirsch MS, Richman DD. The role of genotypic resistance testing in selecting therapy for HIV. JAMA 2000;284:1649-50. 6. Chen JH, Wong KH, Chan K, et al. Evaluation of an inhouse genotyping resistance test for HIV-1 drug resistance interpretation and genotyping. J Clin Virol 2007;39:125-31. 7. Land S, Cunningham P, Zhou J, et al. TREAT Asia Quality Assessment Scheme (TAQAS) to standardize the outcome of HIV genotypic resistance testing in a group of Asian laboratories. J Virol Methods 2009;159:185-93. 8. de Oliveira T, Deforche K, Cassol S, et al. An automated genotyping system for analysis of HIV-1 and other microbial sequences. Bioinformatics 2005;21:3797-800. 9. Rhee SY, Gonzales MJ, Kantor R, Betts BJ, Ravela J, Shafer RW. Human immunodeficiency virus reverse transcriptase and protease sequence database. Nucleic Acids Res 2003;31:298-303. 10. Chen JH, Wong KH, Chen Z, et al. Increased genetic diversity of HIV-1 circulating in Hong Kong. PLoS One 2010;5:e12198. 11. Yam WC, Chen JH, Wong KH, et al. Clinical utility of genotyping resistance test on determining the mutation patterns in HIV-1 CRF01_AE and subtype B patients receiving antiretroviral therapy in Hong Kong. J Clin Virol 2006;35:454-7. 12. Wong KH, Chan WK, Yam WC, Chen JH, Alvarez-Bognar FR, Chan KC. Stable and low prevalence of transmitted HIV type 1 drug resistance despite two decades of antiretroviral therapy in Hong Kong. AIDS Res Hum Retroviruses 2010;26:1079-85. 13. Ariyoshi K, Matsuda M, Miura H, Tateishi S, Yamada K, Sugiura W. Patterns of point mutations associated with antiretroviral drug treatment failure in CRF01_AE (subtype E) infection differ from subtype B infection. J Acquir Immune Defic Syndr 2003;33:336-42. 14. Marconi VC, Sunpath H, Lu Z, et al. Prevalence of HIV-1 drug resistance after failure of a first highly active antiretroviral therapy regimen in KwaZulu Natal, South Africa. Clin Infect Dis 2008;46:1589-97. 15. Martinez-Cajas JL, Pai NP, Klein MB, Wainberg MA. Differences in resistance mutations among HIV-1 nonsubtype B infections: a systematic review of evidence (1996-2008). J Int AIDS Soc 2009;12:11. 16. Montes B, Vergne L, Peeters M, Reynes J, Delaporte E, Segondy M. Comparison of drug resistance mutations and their interpretation in patients infected with non-b HIV-1 variants and matched patients infected with HIV-1 subtype B. J Acquir Immune Defic Syndr 2004;35:329-36. 17. Shafer RW, Schapiro JM. HIV-1 drug resistance mutations: an updated framework for the second decade of HAART. AIDS Rev 2008;10:67-84. 24 Hong Kong Med J Vol 18 No 1 # February 2012 # www.hkmj.org