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Chemical Abstract Service 化学文摘社今天 : 全球最大的学协会组织 本部拥有 800 多博士从事文献编辑工作 为全球超过 1200 多个学校提供 SFS 桌面检索平台
提纲 SciFinder Scholar 数据库介绍 SciFinder Scholar 检索方法及信息挖掘手段 SciFinder Scholar 中的检索方式 SciFinder Scholar 中的文献检索及后处理 SciFinder Scholar 中的物质检索及后处理 SciFinder Scholar 中的反应检索及后处理 SciFinder Scholar 检索注意问题
SciFinder Scholar 数据库背景 纸本 1907 年 光盘 1977 年 1997 年 2002 年 2007 年 SciFinder Scholar 跨世纪工程 SciFinder Scholar 2007
SciFinder Scholar 数据库与 CACD/Print 区别 CA print CA on CD SciFinder 包含文献起始日期 1907 1977 1907( 上万条记录回溯到 1900 年以前 ) 得到最新信息的延迟几个月一个多月一天 主题检索 普通物质名称检索 分子式检索 结构式检索 亚结构式检索 相似结构式检索 反应式检索 类反应式检索 分析与二次检索 检索效率低不高高效 检索速度慢尚可快捷
SciFinder Scholar 包含的内容 期刊专利论文会议报告 Chemcats Chemlist CAPlus Medline 提炼出溶剂, 催化剂, 产率等反应信息 Registry CASReact 结构信息物性数据合成信息
SciFinder Scholar 包含的内容 10000 9900 8000 6000 6000 4000 2000 4500 3000 1700 3900 1600 2400 0 24 Literature Registry CASReact Chemlist Chemcats 总量 ( 万 ) 有机无机物 CAplus 生物序列 Medline CAplus: 每天更新 3000 条以上记录 Registry: 每天大约新增 4000 个新的物质 CASReact: 每周更新 30000 到 50000 条单步和多步反应 Medline: 每周更新 4 次
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SciFinder Scholar 的检索方式 主题机构名专利号作者名 文献 物质 反应 俗名分子式相似结构结构, 亚结构官能团
所以, 在 SciFinder Scholar 中, 只要得到一点信息, 就可以获得最为全面的文献 物质 反应
SciFinder Scholar 中文献检索及后处理 SciFinder Scholar 中文献检索的方法 通过文献标示符去找文献 浏览核心期刊 通过主题, 作者名, 机构名去找文献
通过文献标示符去找文献
浏览核心期刊
通过主题, 作者名, 机构名去找文献
主题检索举例
提出问题 获得关于电化学在废水处理方面的应用的参考文献 存在问题 : 查看一下, 历史上那个阶段对这样的一个主题研究最热门, 并获得 2005 年以后的文献查看一下文献类型, 获得 2005 年以后的专利这些专利都包含了那些概念是否可以用系统的方法对这些专利进行分类
我们用 electrochemical with wastewater treatment 来做初次的检索 Closely associated with one another 表示在同一个句子当中出现
我们注意到所列文献中出现了 sewage, treated water, Electrochemically 这样的词 那是 SciFinder 能够自动识别同义词, 近义词, 缩写, 并有截词, 断词等功能 获取文摘 获取全文 分析 / 限定
SFS2007 新功能 系统分类
一共 11 种分析手段 分析工具提供 11 种分析方法, 包括索引词, 作者名, 机构名, 文献类型, 期刊名称, 出版年限等 在这些分析工具中, 索引词 (Index Term): 可以帮助我们对文献的内容进行大致的了解 学科分析 (CA Section Title): 可以帮助我们对文献进行学科分类
一共 7 种限定手段 限定工具提供 7 种限定方法, 包括主题词, 作者名, 机构名, 文献类型等 在这些限定工具中, 主题词 (Research Topics): 可以让我们用我们关心的主题词再次限定文献 文献类型 (Document Type): 可以让我们直接获得我们感兴趣的文献类型
分析工具 ----Publication Year
限定工具 ----Publication Year
分析工具 ----Document Type 分析
限定工具 ----Document Type
分析工具 ----Index Term 分析
系统分类工具 Categorize 一级目录 二级目录 点击感兴趣的二级分类, 在这里可以出现一些索引词条
引文情况被引情况文献中出现的物质文献中出现的反应科技网络上的信息
作者名检索举例 这里我们来查一下朱清时老师发表的文章 姓, 一定要写全 名, 只写首字母
选择所有的可能 Zhu Q Zhu Q S Zhu Qing S Zhu Qing Shi Zhu QingS
获得朱老师在中科大所发表的文献 可以用机构名称再次限定, 这里我们可以输入中科大的邮编
索引信息 引文信息
文献检索小结 SciFinder Scholar 文献检索小结 向 SciFinder Scholar 提一个最为广泛的问题 可以通过 SciFinder Scholar 的 Analyze/Refine 功能来不断的修正我们的检索思路 可以通过 SciFinder Scholar 的 Analyze/Refine 功能来缩小检索的范围 可以通过 SciFinder Scholar 的 Analyze/Refine 功能来获取新的知识点和灵感 尝试将不同的 Analyze/Refine 功能组合起来用, 会有更多的收益 使用 Categorize 可以让系统来实现自动分类 通过 Get Related 来获得更多的信息, 可以实现从文献到物质, 反应, 引文的链接
SciFinder Scholar 中物质检索及后处理 SciFinder Scholar 中物质检索的方法 通过物质标示符去找物质 通过结构和分子式找物质
通过物质标示符去找物质 可以输入物质名称, CAS No, 俗名, 商品名
通过结构和分子式找物质
结构检索举例
结构工具
结构相关工具 铅笔 元素周期表可变基团重复基团工具结构模版橡皮选择工具正电子原子锁定工具 碳链工具常用基团 R 基团定义工具可变位置连接工具多元环工具索套选择工具旋转工具负电子 环锁定工具
精确结构检索
得到物质的盐, 或者其他的混合物
亚结构检索
得到物质的修饰信息 33246 种修饰信息
强大的后处理功能 我们做科研往往是希望得到我们不知道的信息那么对于这 33246 种物质, 我们如何去分析来获得我们需要的信息呢?
6 大分析功能 分析功能提供 6 大功能, 其中 真实原子附属分析 (Real-atom attachments): 能够分析出原子的修饰情况 可变基团分析 (Variable Group composition): 能分析结构中定义的可变基团 R 基团分析 (R-Group Composition): 可以分析结构中定义的 R 基团 环骨架分析 (Ring Skeletons): 可以分析结构的环结构, 包括环上的原子和环上的单双键
7 大限定功能 限定功能提供结构再次限定, 同位素是否包含限定, 金属是否包含限定, 理化性质限定等 通常可以通过结构的再次限定 (Chemical Structure) 去对结构再次修饰 或者通过理化性质 (Property Date) 去找到符合理化性质要求的物质 对于上面的 3 万多种物质, 如果我只想获得具有红外光谱数据的物质, 那么, 我应该选择什么呢?
或得具有红外光谱信息的物质
实际上 我们有的时候, 更多关注的是结构上面的信息 修饰信息? 修饰上某一特定原子后该原子的修饰信息?
修正结构
对所得结果再次使用真实原子附属性分析
有的时候, 我们对我们关心的结构只有一定的了解, 不确定的信息太多 我们来看我们所要找的结构 : 结构中含有苯环, 苯环上含有一个杂环 杂环为 5 元环,6 元环或 7 元环, 且杂原子不能直接接在苯环上 杂环上原子必须是 O 或者 S 苯环上与杂环相邻的位置接个 Br 苯环上某 2 个处于间位的 C 必须有 1 个 C 接卤素, 但是接什么卤素不确定 该 2 个位置之间的 C 必须接一个基团, 该基团可以是 H,OH,X
得到具备一定条件的结构信息 问题 : 存在多少种环结构 X= F,Cl, Br,I 分别有多少种物质 R2=H,OH,X 分别有多少物质 R1= O,S R2= H,OH,X
环骨架分析
可变基团分析
R 基团分析
相似结构检索
得到相似结构信息
结构检索小结 精确结构检索, 获得物质的盐, 聚合物, 混合物, 配合物等 亚结构检索, 所输入的结构必须存在 相似结构检索, 获得相似度在 60 分以上的结构 亚结构检索 相似结构检索 精确结构检索
分子式检索举例
分子式输入规则 CH 写在前面, 其他按照字母顺序 对于多组分物质, 用. 将不同的组分分开 聚合物括号表示, 括号外用 x 表示起始物, 用 n 表示终产物 区分大小写
SciFinder Scholar 中反应检索及后处理
SciFinder Scholar 查询举例 ---- 反应信息的查询 反应查询工具
SciFinder Scholar 查询举例 ---- 反应信息的查询 反应位置标记工具 反应角色工具 反应箭头 反应原子标记工具 反应官能团列表
一共 10 种分析手段 分析工具提供反应中的催化剂 (Catalyst), 溶剂 (Solvent), 反应步数 (Number of steps), 产率 ( Product Yield) 等的分析
一共 4 种限定手段 限定工具, 可以根据进一步的条件去限定反应中出现的物质 (Reaction Structure), 以及反应类型 (Reaction Classification) 等
溶剂分析
拓展思路的反应检索 通常 我们需要一些对我们科研有参考意义的反应 官能团之间的反应 亚结构反应检索 对反应位置和原子有特定要求的反应
官能团之间的反应
假如我们只想得到一步反应
假如我们规定反应物必须是乙酰氯
亚结构反应检索 想获得 1 步合成该物质的反应
亚结构反应检索 必须的条件 : 羟基接的 C 必须是 CH2 整个 C 链不允许是某个环结构的部分结构 其余的 3 个 C 原子链接什么基团对反应没有影响 据此, 我们修改我们的检索方式
亚结构反应检索 用环锁定功能, 锁定 C 链, 保证其不成为环结构的一部分 用原子锁定功能, 锁定 C 原子, 保证 C 原子上两个 H 不被取代
对反应位置和原子有特定要求的反应 O 原子反应前后必须配对 C=O 键必须发生反应 除已有的环外, 不能成环
对反应作出条件限定 用 mapping tool 键标示 O 原子反应前后位置 用 site marking tool 键标示 C=O 键反应的位置 用 Lock out ring tool 键锁定环
SciFinder Scholar 反应检索小结 多用 Analyze/Refine, 来获得催化剂, 溶剂, 产率等信息 如果反应只涉及基团之间的变化, 用官能团反应可以获得更多的参考信息 当无法找到具体反应, 或者检索结果并不满意, 尝试用亚结构反应查询, 可以获得更多的参考信息
提纲 SciFinder Scholar 数据库介绍 SciFinder Scholar 检索方法及信息挖掘手段 SciFinder Scholar 中的检索方式 SciFinder Scholar 中的文献检索及后处理 SciFinder Scholar 中的物质检索及后处理 SciFinder Scholar 中的反应检索及后处理 SciFinder Scholar 检索注意问题
SciFinder Scholar 检索注意问题 Explore by Research Topic Explore by Document Identifier Explore by Substance Identifier
Explore by Research Topic ----Tips 一般最佳在 2-3 个 Concepts( 关键词 ), 最多不超过 5 个 最好使用介词而不用 Boolean 运算符, 如 AND OR NOT; 介词能被识别 ; 识别常用缩写 单复数 过去式等 ; 支持同意词, 近义词检索 ; 不能用! 或 *( 删减字符或通配符 ) 可用括号, 括号内为前词的同义词 ; 修饰语不能自行分配, 需各自写明 ;
Explore by Document Identifier----Tips
Explore by Substance Identifier----Tips 最多输入 25 条 ; Read File 必须是.txt 文件 ; 每个条目输入 <200 字符 ; 可以有空格, 不区分大小写 ; 如果检索结果不理想, 也可在主题检索中再检 ; 支持俗名, 商品名检索
SciFinder Scholar 的程序安装 SciFinder Scholar 客户端程序 : SciFinder Scholar2007.exe 安装过程中, 提示 : Do you have a disk labeled Custom Site Files? ( 选择 No) site.prf (site) 文件只需将 site.prf 文件复制粘贴到 X:\ScholarCHLR 目录下还可安装 ViewerLite 用于查看 3D 结构
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可能 3: 网络故障 解决方法 : 点击 OK, 再次运行 SciFinder/Scholar
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合理使用 CAS 会监控与每个授权 IP 地址相关联的日常的检索和下载活动, 目的是 (1) 确定授权 IP 地址之间的平均使用标准 ; (2) 关注个别授权 IP 地址上使用状况的显著变化 CAS 可能会要求主要联系人和相关的授权用户对 CAS 提出质疑的使用状况进行讨论, 如果有必要, 与 CAS 一起针对已发现的问题找出解决办法 此类使用问题包括但不限于 : 用作商业目的, 非授权用户的使用, 超出限定, 大量的下载和储存数据 CAS 会积极和获许可人以及成员单位配合解决任何过量或非正常使用的问题 如果这样的过量或非正常使用的状况继续发生,CAS 会要求成员单位禁止滥用者使用 SciFinder/Scholar 如果滥用的情形仍旧继续, 在经过所有的努力和解决方法都尝试无效时,CAS 将禁止该成员使用 SciFinder/Scholar
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