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1 SciFinder Web 源于化学, 超越化学的一站式检索平台 中南大学 ---SciFinder Web 使用介绍 汤健钊 (James) CAS 中国代表处 SciFinder 培训专员

2 提纲 SciFinder Web 介绍 SciFinder Web 中的内容 SciFinder Web 中的范例检索 SciFinder Web 中的主题检索 SciFinder Web 中的物质检索 SciFinder Web 中的 Markush 结构检索 SciFinder Web 中的反应检索 SciFinder Web 特色功能 SciFinder Web 的注册和常见问题 2

3 美国化学文摘社 Chemical Abstract Service ACS 的分支机构, 创立于 1907 年致力于跟踪 索引并提炼全球化学相关的科技文献信息最先创立了纸本 化学文摘 Chemical Abstracts TM 总部位于俄亥俄州的哥伦布市 1300 名员工, 精通 50 多种语言 关注索引上万种期刊和 63 家专利客户覆盖全球 1900 所高校 500 强公司以及所有主要的专利局 3

4 SciFinder Web 中的内容 试剂订购信息 期刊专利论文会议报告 Chemcats CAPlus Medline Chemlist 溶剂, 催化剂, 产率, 反应实验过程等 物质管制信息 Registry CASReact 物质 基因 合成信息 4

5 SciFinder Web 中的几个主要数据库 CAS REGISTRY SM >6800 万有机无机物质 >6300 生物序列每天更新约 新物质物质报道文献, 回溯到 1802 年物质信息包含了大量的实验数据, 预测数据, 以及物质标签和谱图 CASREACT >4400 万单步和多步反应 >1400 万物质合成制备信息源自专利和期刊文献每周更新超过 15 万条单步多步反应反应回溯到 1840 年 CAS Databases CAplus SM >3600 万专利和期刊信息 >10000 种期刊的覆盖 63 个专利发行机构每天更新 3000 条记录文献回溯到 19 世纪初引文信息回溯到 1997 年之前, 超过 3 亿条引文信息 MARPART >92.7 万专利中的有机, 有机金属结构回溯至 1961 年每天更新 (60-75 篇专利引文, 以及 个 Markush 结构 ) 5

6 CAplus SM 涵盖了上万种期刊及 63 个专利发行机构专利 Japanese Patent Office (JPO) China (CN) Republic of Korea (KR) India (IN) Taiwan (TW) Hong Kong (HK) Philippines (PH) Singapore (SG) 6

7 CAplus SM 中的索引词帮助解决各种描述歧义问题 文献检索过程中经常遇到很多同义词 近义词 单复数 不同时态的情况, 科研人员常常花费大量的时间进行检索式的编辑 ; 全球科研人员对同一概念的描述, 受语种习惯, 教育背景的不同而不同 SciFinder Web 中的 Index term 是一种标准化的索引词, 配合智能化的检索模式, 保证检索的全面性 7

8 CAS REGISTRY SM 是化学物质信息的 黄金标准 8

9 CASREACT 是检索化学反应最权威的来源 9

10 MARPAT 全球专利文献中的 Markush 结构库 MARPAT 帮助最大程度的找到结构相关专利文献 10

11 提纲 SciFinder Web 介绍 SciFinder Web 中的内容 SciFinder Web 中的范例检索 SciFinder Web 中的主题检索 如何利用 SciFinder 紧跟学术前沿 SciFinder Web 中的物质检索 如何利用 SciFinder 设计物质结构 SciFinder Web 中的 Markush 结构检索 SciFinder Web 中的反应检索 如何利用 SciFinder 设计完整合成路线 SciFinder Web 特色功能 SciFinder Web 的注册和常见问题 11

12 SciFinder Web 登陆界面 输入 SciFinder 帐号和密码 12

13 SciFinder Web 登陆后主界面 文献, 物质, 反应检索入口, 默认开始检索文献 检索完, 请点击退出 可用的检索方法 保存过的结果集 邮件提醒结果集 搜索条件设置 13

14 SciFinder Web 中的主题检索 主题 : 聚集诱导发光 (aggregation-induced emission) 方面的研究进展 使用 with of by 等介词来连接关键词, 点击 Search 14

15 主题检索的候选项 Concept 表示做了同意词的扩展 Closely associated with one another 表示同时出现在一个句子中 present anywhere in the reference 表示同时出现在一段话中 15

16 SciFinder 中的文献检索结果 搜索导航条 文献分析筛选工具 获得文献工具栏 如何在大量文献中发现最关键信息? 16

17 SciFinder 中的 Analysis 文献分析功能 文献分析工具 : 作者名称 CAS.RN 数据库来源 Index Term 杂志名称文献语言发表年限 17

18 SciFinder 中的 Analysis 索引词 (Index Term): 为文献的主题, 可以帮助我们挑选感兴趣的文献 荧光聚集态发冷光 UV 和可见光谱晶体研究 选择感兴趣的内容, 点击 Apply 18

19 本课题的核心研究人员是谁? 主要研究机构? 核心期刊? 领域内主要研究人员, 专家 主要研究机构, 合作伙伴, 竞争对手 主要出版杂志, 机构, 潜在投稿期刊 19

20 课题的发展趋势? 出版年限分析, 了解近年来发展趋势 依据出版年限排序 20

21 SciFinder 中的 Refine Refine : 帮助用户根据自己的需要迅速获得相关类型文献, 如课题综述 专利等 21

22 SciFinder 中的 Refine Refine : 帮助用户根据自己的需要迅速获得文献, 如池振国老师发表的文献 22

23 SciFinder 中的 Categorize Categorize: 为系统分类功能, 对文献依学科方向进行分类通过索引条目和 CAS RN 更深入分析结果 23

24 SciFinder 中的 Categorize- 学科分类功能 一级目录二级目录与二级目录有关的研究主题 选中的主题或物质 24

25 SciFinder 中的 Categorize 设计的交叉学科 环境化学二级目录具体的污染物 选中的主题或物质 25

26 文献排序 获得最有参考价值信息 文献排序原则 : 登记号码作者名称文献引用次数发表年限主题题目 引文数量排序, 帮助获得最有参考价值的文献 26

27 结果集的保存 Export: Citation manager: 保存成 RIS 格式, 用于导入 EndNote 等文献管理工具 Offline Review: 保存过成 PDF, RTF 格式, 用于脱机浏览 Save: 保存在服务器上, 可登陆后查看 27

28 感兴趣的结果集 查看文献详细信息 28

29 文摘的详细信息 当前文献涉及到的物质 反应 引用文献等 当原文摘不足以反映全文内容时, 重新编写摘要 SciFinder 收录的 70% 的文献和专利都是重新编写摘要 文献涉及的重要物质的详细信息, 如 CAS 号 物质名称 物质用途等 通过文献所标注的概念可以了解文献的主题和主要内容 29

30 文摘的详细信息 30

31 具体物质的详细信息 物质的名称 别名 CAS.RN 等 按照 CAS Role 分类的专利 非专利文献列表 对某类文献感兴趣, 仅需点击交叉处的即可方便快捷地获取 31

32 理化性质及谱图 物质的实验数据 物质的实验谱图信息 32

33 物质的合成信息 33

34 反应的详情及实验过程 34

35 主题搜索小结 主题搜索时, 使用 With, Of,By 等介词为连接 尽量选择包含 Concept 和 Closed Associated with 的候选项 通过 SciFinder 的 Analyze/Refine 功能来缩小检索的范围 尝试将不同的 Analyze/Refine 功能组合起来用, 会有更多的收益 使用 Categorize 可以让系统来实现自动分类 通过查看文献相关物质反应, 获取更多信息 更多细节化内容, 请参考 35

36 提纲 SciFinder Web 介绍 SciFinder Web 中的内容 SciFinder Web 中的范例检索 SciFinder Web 中的主题检索 如何利用 SciFinder 紧跟学术前沿 SciFinder Web 中的物质检索 如何利用 SciFinder 设计物质结构 SciFinder Web 中的 Markush 结构检索 SciFinder Web 中的反应检索 如何利用 SciFinder 设计完整合成路线 SciFinder Web 特色功能 SciFinder Web 的注册和常见问题 36

37 衍生物?热点研究的取代基?CAS.RN: 四氢 -β- 咔啉羧酸是从小根蒜或薤 (xiè) 中分离到的一种生物碱, 具有安全 便宜等优点, 文献报道, 它具有优秀的抗血小板活性, 疗效是阿司匹林的 6 倍 同时, 文献报道了四氢 -β- 咔啉中 1,3 位上取代衍生物表现出良好的抗肿瘤活性 37

38 SciFinder web 中的物质搜索方式 物质结构检索 --- 精确结构检索 (Exactsearch) 亚结构检索 (Substructuresearch) 相似结构检索 (similaritystearch) 分子式检索 物质标识符检索 ----CAS.RN, 化学名称 ( 通用名 商品名 俗名 ) 38

39 物质搜索 --- 四氢 -β- 咔啉类药物 单击进入反应检索界面 点击画图版来进行结构输入, 初次使用时需要安装 Java 插件 39

40 SciFinder 结构绘制工具 铅笔 结构翻译工具 橡皮 结构和反应切换功能 元素周期表可变基团重复基团工具碳链工具选择工具环锁定工具旋转工具正电子 常用基团 R 基团定义工具可变位置连接工具模版工具索套选择工具原子锁定工具镜面旋转工具 C 原子和单键恢复工具 结构检索选择 单双键,RS 构型, 不确定键定义工具 负电子 40 常见环, 多元环工具

41 通过结构翻译工具绘制四氢 -β- 咔啉类药物的母核结构 输入 CAS.RN 41

42 三种检索方式 : 物质结构检索 --- 精确结构检索 (Exactsearch) 亚结构检索 (Substructuresearch) 相似结构检索 (similaritystearch) 42

43 与已绘画的化学结构相同 : 构造异构体 互变异构 ( 包括酮 - 烯醇互变异构 ) 配位化合物 离子化合物 原子基和离子基 含同位素的物质 单体组成之聚合物 43

44 亚结构检索方式 : 44

45 SciFinder 自动识别结构中的互变异构体和衍生物亚结构 45

46 查看具有四氢 -β 咔啉羧酸母核的所有已经报道的物质结构 : 46

47 相似结构检索方式 : 47

48 相似结构检索方式 : 相似度越高, 结构越相近 48

49 与原结构存在的区别 取代基不同 取代基位置不同 母核结构不同 49

50 如何获得最想要的目标物质? 物质的分析筛选功能 50

51 一共有 4 种分析功能 提供结构物质角色分析, 元素分析, 商业可购买性分析, 反应提供性分析等 通常可以通过物质角色分析 (Substance Role) 去看看这些物质都存在哪些应用 一共有 7 种限定功能 提供结构再次限定, 同位素是否包含限定, 金属是否包含限定, 理化性质限定等 通常可以通过结构的再次限定 (Chemical Structure) 去对结构再次修饰 或者通过理化性质 (Property Date) 去找到符合理化性质要求的物质 还可以通过原子附属性 (Atom Attachment) 去分析结构上的修饰情况 51

52 分析母核结构上的不同取代情况 获得指定原子取代的物质结构 52

53 获得已被报道过符合设计要求的化合物 53

54 从感兴趣的结构出发, 我们获得了什么? 感兴趣结构的物质及其衍生物 活性母环结构物质各取代位的衍生情况 自主设计的结构物质 母核结构相关的研究文献 我们可以根据自己的想法设计化合物 SciFinder 识别我们设计的结构, 并提供多种选择结果 SciFinder 的检索是一种人机交流的过程, 是探索而不仅仅是检索 54

55 Markush 结构检索 --- 帮助获取和结构有关的专利 精确结构检索 无记录, 证明是新物质, 专利? 55

56 的 Markush 检索 --- 专利初步评估 56

57 的 Markush 检索 --- 专利初步评估 获取专利全文的链接 57

58 查看专利权利要求说明书 58

59 X1,X2,X3 为 C N 原子, 至少有两个是 N 原子 R1 包括 COOH 基团,R6 包括 SH 基团保护了我们设计的目标化合物 59

60 提纲 SciFinder Web 介绍 SciFinder Web 中的内容 SciFinder Web 中的范例检索 SciFinder Web 中的主题检索 如何利用 SciFinder 紧跟学术前沿 SciFinder Web 中的物质检索 如何利用 SciFinder 设计物质结构 SciFinder Web 中的 Markush 结构检索 SciFinder Web 中的反应检索 如何利用 SciFinder 设计完整合成路线 SciFinder Web 特色功能 SciFinder Web 的注册和常见问题 60

61 SciFinder Web 的其他应用举例 主题 : 由谷氨酸制备四氢 --β- 咔啉类生物碱药物 谷氨酸 四氢 -β- 咔啉 四氢 -β- 咔啉羧酸是从小根蒜或薤 (xiè) 中分离到的一种生物碱, 具有安全 便宜等优点, 文献报道, 它具有优秀的抗血小板活性, 疗效是阿司匹林的 6 倍 同时, 文献报道了四氢 -β- 咔啉中 1,3 位上取代衍生物表现出良好的抗肿瘤活性 61

62 SciFinder Web 的应用举例主题 : 四氢 --β- 咔啉类生物碱药物的合成 单击进入反应检索界面 62

63 利用结构编辑器绘制反应式 反应箭头 反应角色工具 反应原子标记工具 反应官能团列表 反应位置标记工具 绘制出反应结构式 63

64 利用结构编辑器画出目标物质结构 64

65 SciFinder Web 的应用举例 : 四氢 --β- 咔啉类生物碱药物的合成 限定功能 反应排序 : 相关性 登记序号 反应过程 反应步骤 产率 发表年份 形成稠环不合条件 反应基本信息 反应详细信息 反应步骤 条件和参考文献 65

66 SciFinder Web 的应用举例 : 四氢 --β- 咔啉类生物碱药物的合成 环锁定功能 66

67 SciFinder Web 的应用举例 : 四氢 --β- 咔啉类生物碱药物的合成 得到目标反应信息 67

68 SciFinder Web 的应用举例 : 四氢 --β- 咔啉类生物碱药物的合成 得到详细的反应信息 得到目标反应信息 68

69 SciFinder Web 的应用举例 : 四氢 --β- 咔啉类生物碱药物的合成 具体反应信息 每一步反应的详细信息 69

70 SciFinder Web 的应用举例 : 四氢 --β- 咔啉类生物碱药物的合成 并非一个容易获得的原料 如何通过复杂的反应物向前延伸, 推导最简单的起始原料? 如何编写完整的合成路线报告? 物质的基本理化性质 合适的起始原料, 详细的反应条件 具体的反应操作步骤 参考文献 70

71 SciFinder Web 的应用举例 :sciplanner 编写完整的合成报告 点击获得合成该物质的反应 71

72 SciFinder Web 的应用举例 :sciplanner 编写完整的合成报告 获得反应 132 条 获得最简单的反应起始原料 72

73 SciPlanner 主面板 点击屏幕右上方的 SciPlanner, 可以看到 SciPlanner 的面板, 刚才推送的反应, 就在这里 创建一个新的 SciPlanner 文件 73

74 SciPlanner 拖入反应, 编写完整反应路线 将右侧的反应, 拖入 SciPlanner 中 将中间产物叠加就可得到完整的合成路线 74

75 SciFinder Web 的应用举例 :sciplanner 编写完整的合成报告 75

76 SciFinder Web 的应用举例 :sciplanner 编写完整的合成报告 76

77 SciFinder Web 的应用举例 :sciplanner 编写完整的合成报告 选择打印的内容 : 反应详细内容物质具体信息文献详细信息 合成路线图 77

78 SciFinder Web 的应用举例 :sciplanner 编写完整的合成报告每步反应的条件,详细操作步骤 78

79 SciFinder Web 的应用举例 :sciplanner 编写完整的合成报告每步反应涉及到的参考文献 79

80 SciPlanner 小结 针对研究的物质, 快速查找合成路线并找到支持的文献信息 简洁方便的工作平台, 帮助对合成路线进行整理 所有文献 物质 反应信息都可以导出至一张工作表中 节省大量的文献整理时间, 提高工作效率 80

81 提纲 SciFinder Web 介绍 SciFinder Web 中的内容 SciFinder Web 中的范例检索 SciFinder Web 中的主题检索 如何利用 SciFinder 紧跟学术前沿 SciFinder Web 中的物质检索 如何利用 SciFinder 设计物质结构 SciFinder Web 中的 Markush 结构检索 SciFinder Web 中的反应检索 如何利用 SciFinder 设计完整合成路线 SciFinder Web 特色功能 SciFinder Web 的注册和常见问题 81

82 SciFinder Web 特色功能 KMP 定题更新提醒 设定 提醒, 一旦有新的记录, 会发邮件通知 设定研究主题名和失效时间 82

83 SciFinder Web 特色功能 根据引文排序 依据被引次数排序 83

84 SciFinder Web 特色功能 Quick View (Reference) 84

85 SciFinder Web 特色功能 物质的靶标和生物活性 在物质详细信息栏, 可以查询到物质的生物活性信息和靶标信息 85

86 SciFinder Web 特色功能 Markush 结构检索 直接检索和结构有关的专利, 用于做初步的专利评估 86

87 SciFinder Web 特色功能 Explore by Property 87

88 SciFinder Web 特色功能 SciPlanner 88

89 SciFinder Web 特色功能 反应过程的获取 SciFinder 中的部分源自期刊和专利中的反应, 提供了反应过程信息, 使得科研工作者不需要阅读原文, 就可以获得对应的反应历程 89

90 提纲 SciFinder Web 介绍 SciFinder Web 中的内容 SciFinder Web 中的范例检索 SciFinder Web 中的主题检索 SciFinder Web 中的物质检索 SciFinder Web 中的 Markush 结构检索 SciFinder Web 中的反应检索 SciFinder Web 特色功能 SciFinder Web 的注册和常见问题 90

91 SciFinder Web 的注册和登陆 SciFinder Web 的系统要求 Windows 用户支持 IE 7.x 或者 FireFox 2.x Mac 用户支持 Firefox 和 Safari Java 安装 ( 初次使用结构时自动安装 ) 在图书馆相关页面上找到 SciFinder Web 注册用的网址 91

92 中南大学 SciFinderWeb 注册链接 92

93 点击 URL 创建 SciFinder Web 账号 开始创建 SciFinder Web 帐号 创建 ID 所用的 IP 不能是代理服务器的 IP 现在可以使用 163,Gmail 等公共邮箱注册 SciFinder Web 93

94 设置用户名及密码注意事项 用户名 : 必须是唯一的, 且包含 5-15 个字符 它可以只包含字母或字母组合 数字和 / 或以下特殊字符 : -( 破折号 ) _( 下划线 ). ( 句点 表示 at 的符号 ) 密码 : 必须包含 7-15 个字符, 并且至少包含三个以下字符 : 字母混合的大小写字母数字非字母数字的字符 ( # % & *) 密码设置小技巧 : 1: 不要和账号中有重复的字符 2: 密码格式最好是 abc@123 94

95 对新 ID 的 确认 需要点击邮件中的确认链接 95

96 SciFinder Web 使用注意事项 禁止过量下载 严禁账号分享 严禁将账号用于非学术研究 96

97 SciFinder Web 常见问题 并发用户数已满, 请稍后再试 97

98 SciFinder Web 常见问题 账号或密码错误, 请在 username 处填写, 截图, 并与图书馆联系 98

99 SciFinder Web 常见问题 任何需要反馈给图书馆的问题, 都请点击测试 IP 地址的链接 将页面截图下来, 一并发给图书馆 99

100 SciFinder Web 网络在线资源平台 资源下载 :PDF 文件 在线演示 :Flash 演示 网络培训 : 不定期的网络专题培训 100

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