幻灯片 1

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尹燕
5 years ago
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1 SciFinder 数据库使用介绍学科馆员 : 陈启梅中国科学院文献情报中心 2015 年 11 月

2 主要内容一 SciFinder 数据库背景文献检索物质检索反应检索三科学管理平台 SciPlanner

3 一 SciFinder 数据库背景 SciFinder Web, 即 CA(Chemical Abstract) 网络版由美国化学文摘社 (Chemical Abstract Service,CAS) 出版 ACS 的分支机构, 创立于 1907 年 ; 致力于跟踪索引并提炼全球化学相关的科技文献信息 ; 最先创立了纸本化学文摘 Chemical Abstracts TM ; 一千多名员工, 精通 50 多种语言 ; 关注索引上万种期刊和 63 家专利机构 ;

4 SciFinder 覆盖内容一 SciFinder 数据库背景

5 SciFinder 覆盖内容一 SciFinder 数据库背景 SciFinder 集成了以下 7 个数据库, 检索时能实现这 7 个数据库无缝链接的跨库检索 (1)CAplus:CAplus 是美国化学文摘数据库, 涵盖了来自全球 180 多个国家 50 多种不同语言的上万种期刊及 63 个专利发行机构专利的文献, 覆盖化学生物化学化学工程以及相关科学领域期刊专利技术报告书回忆论文学位论文等文献记录 (2)CASREACT:CASREACT 是世界上最大的更新速度最快的反应数据库, 是检索化学反应最权威的来源 (3)CAS REGISTRY:CAS REGISTRY 是世界上最大的化学物质数据库, 物质信息包含大量的实验数据预测数据以及物质标签和谱图

6 SciFinder 覆盖内容一 SciFinder 数据库背景 (4)MEDLINE:MEDLINE 是美国国家医学图书馆制作的世界上最权威的生物医学数据库, 包含来自 70 多个国家 5600 多种期刊的生物医学文献 (5)MARPAT:MARPAT 是专利物质数据库, 覆盖了 1988 年以来的英语日语法语德语 2000 年以来的俄语以及 2008 年以来的韩语专利里包含的关键物质信息 (6)CHEMCATS:CHEMCATS 是物质的商业来源信息数据库, 包括 2600 万不同种类物质的供应商的地址价格等信息 (7)CHEMLIST:CHEMLIST 是管制信息数据库, 包括从 1980 年到现在的全球范围内的法规信息, 包括物质的特征详细目录来源以及许可信息等

7 一 SciFinder 数据库背景 SciFinder(CA) 学科侧重药理药物化学药效 ; 与化学相关的体内成分检测 ; 检索优势在于有化学物质登记号检索, 标引概念词利于查全, 检索简单, 提供专利 ; 推荐为药学首检库受控词

8 SciFinder 登陆界面输入用户名和密码登陆 IP+ 账号密码方式登录 SciFinder Web

9 科学管理平台文献检索物质检索反应检索保存检索结果信息定制

10 文献检索

11 文献检索文献检索内容分类 : 研究主题作者机构文献标识符期刊专利文献标记

12 文献检索

13 文献检索文献检索方法推荐 : 关注某特定领域的文献主题检索关注物质有关的文献先获得物质, 再获得文献关注某科研人员的文献作者名检索关注某研究机构的文献机构名检索

14 文献检索检索示例 : 主题检索

15 文献检索术语之间最好用英文的介词连接, 如 of, with, beyond, in, on, as 等 ; 最多输入 5 个术语,2~3 个左右最好快速检索高级检索不勾选, 默认全部

文献检索每组代表一种检索策略, 按排列顺序从上到下检索范围逐级扩大 as entered

another 指多个检索词出现在同一检索字段中, present anywhere in the

containing the concept(s) 指做了同义词近义词扩展通常, 含有

16 文献检索每组代表一种检索策略, 按排列顺序从上到下检索范围逐级扩大 as entered 指与输入的检索短语完全一致, closely associated with one another 指多个检索词出现在同一检索字段中, present anywhere in the reference 指检索词出现在标题摘要索引重要概念重要物质等任一文献信息里, containing the concept(s) 指做了同义词近义词扩展通常, 含有 concept(s) 和 closely associated with one another 的选项是最佳的选择查全查准率的综合衡量

17 文献检索排序方式信息定制 : Keep Me Posted 关键词高亮显示可以输入中文

18 文献检索文献界面完整的文献界面包括 : 1. 题录信息 2. 摘要信息 3. 文献中重要的概念 4. 文献中重要的物质 5. 书目信息 6. 获得文献中的物质, 反应, 引文等 7. 文献中的引文信息

19 文献检索 SAVED ANSWER SET 文献分析工具导入 Endnote 文献管理器离线阅览

20 文献检索分析功能 Analyze Refine Categorize

21 Analyze 文献检索 12 种分析方法

22 文献检索 Analyze- 作者姓名导出分析结果 2) 点击作者名获得该作者的文献 1) 点击 Apply 获得相应作者的文献

23 文献检索 Analyze-CA Section Title: 分析主要应用领域药学药理学

24 文献检索 Analyze-Index Term: 分析文献中出现的重要内容, 帮助我们对文献的内容进行大致的了解

25 Refine 文献检索 7 种限定方法

26 Refine- 主题词限定文献检索有 782 篇关于聚合物纳米粒子在癌症治疗方面的文献二次检索

27 Refine- 文献类型限定文献检索有 423 篇相关专利在 Refine 结果上分析研究生开题时获取综述型文章

28 文献检索 Categorize- 系统分类功能 : 依据学科自动分类

29 文献检索历史导航条 : 点击返回至之前的检索内容

30 物质检索

31 物质检索物质检索内容分类 : 化学结构马库什结构 ( 专利 ) 分子式理化性质物质名称

32 化学结构检索物质检索

33 物质检索马库什结构检索 : 用于检索专利 Claim 中的 Markush 结构, 用于初步专利评估马库什结构检索面板与化学结构检索类似

34 分子式检索物质检索分子式的检索, 根据 Hill 排序规则书写, C,H 写在前面, 其他元素按照字母顺序写

35 分子式检索 Hill 排序 : 单一组分物质对于不含 C 的物质, 按照字母顺序排序对于含 C 的物质,CH 写在前面, 其他的按照字母顺序排列相邻的两个元素之间必须有区分号, 即数字或者空格 ; 若数字为 1, 则用空格区分区分大小写多组分物质物质检索每一组分必须遵照单一组分物质的分子式来书写不同组分之间的排序按照各组分的首元素的字母顺序排序, 但是含 C 组分的一定排在不含 C 的组分前面若不同组分的首元素相同, 则看元素数量多少, 数量多的排在前面, 若元素数量一样, 则按次元素的顺序排列多组分物质 : 包含盐, 水合物, 合金, 混合物等, 用. 将不同组分点开

36 物质检索理化性质检索 : 通过实验性质预测性质检索物质实验性质预测数据来源于 ACD/Lab 软件预测性质?

37 物质名称检索物质检索? 输入物质的名称 CAS No 俗名或商品名都能检索, 一次最多检索 25 个物质, 一个物质名称占一行 ( 用 Enter 键断开 )

38 物质检索物质检索方法推荐 : 有机物, 天然产物及衍生物 --- 结构式检索 ; 无机物 --- 分子式检索 ; 专利中的 Markush 结构 Markush 检索 ; 高分子化合物 --- 分子式和结构式检索

39 文献检索检索示例 : 化学结构检索

40 物质检索精确结构检索 : 可以检索到具体结构的盐, 混合物, 配合物, 聚合物等, 母体结构不能取代, 不能修改亚结构检索 : 可以检索到结构的修饰结构, 母体结构可以被取代, 但不可以修改相似结构检索 : 可以检索到和母体结构相似度在 60 分以上的结构, 母体结构可以被取代, 也可以被修饰, 以相似度控制结构的输出 1) 打开结构面板, 绘制检索结构精确结构检索亚结构检索相似结构检索 2) 直接导入以 CXF 格式保存好的化学结构

41 结构面板物质检索需要安装 Java 插件, 才能启动结构面板

42 物质检索顺铂 ( Cisplatin,CDDP ): 第一个合成铂类的抗癌药物

43 物质检索

44 物质检索结果及页面物质检索

45 物质详细信息界面物质检索文献链接反应链接商品信息管制品信息物质详情物质的的 CAS 号分子式结构式化学名别名一个完整的物质结果界面包含 : 物质详情链接文献链接反应链接商品信息链接管制品信息链接谱图链接实验性质链接

46 物质详细信息界面物质检索按照 CAS Role 分类的专利非专利文献列表对某类文献感兴趣, 仅需点击交叉处的即可方便快捷地获取

47 物质检索与物质相关的文献信息一键获取文献, 可以勾选感兴趣的内容 ; 不勾选, 默认获得全部

48 物质检索与物质相关的反应信息选择化合物的反应角色

49 物质检索物质的商业信息可以直接 Export 到 Excel 中, 又或者使用分析工具, 对商业信息进行处理

50 反应检索

51 反应检索

52 结构面板反应检索

53 聚合反应检索反应检索变化只适用于结构中指定位置亚结构检索

54 反应检索检索结果界面获得 1449 条反应记录

55 反应检索反应检索结果界面 Group By Document, 使一篇文献出现一条反应

56 反应检索反应检索结果界面 Group ByTransformation, 帮助我们判断大部分的研究人员采用哪种合成方法

57 反应检索反应检索结果界面 Sort By Experimental Procedure, 出现合成方法及步骤

58 反应检索 Analyze 有 316 篇文献都用了 BuLi 试剂主要使用的溶剂有 H 2 O, 环己烷己烷

59 二 SciFinder 功能介绍反应检索 Refine 产率在 90% 以上的反应记录有 10 条

60 物质检索反应检索方法推荐 : 有明确反应中心或核心结构的反应 : 特定位点上的反应检索, 或亚结构反应检索寻找反应中心一样的单步反应 : 相似反应检索

61 三实验管理平台 SciPlanner

62 三科学管理平台 SciPlanner SciPlanner 是一个动态的工作界面, 可以用来设计合成路线将文献物质以及反应检索的结果进行组合

63 三科学管理平台 SciPlanner 物质操作方法反应文献

64 三科学管理平台 SciPlanner

65 物质点击拖拽反应点击拖拽

66 拖动, 让两个相同化合物重叠

67 文献

68 点击化合物出现, 启动物质标准菜单选择反应文献发送至 SciPlanner

69 每次使用 SciPlanner, 建议都新建一个文件, 以保证不被之前的文件所干扰

70 网络在线资源平台 : QQ 群 : SciFinder-China 北方当有疑惑时, 且周围有, 可以点击 ~~

71 参考文献沈湘,SciFinder 数据库介绍,ppt SciFinder 数据库商培训资料

72 有问题请联系学科馆员陈启梅中科院文献情报中心学科咨询部电话 :(010) 邮件

The Growing Importance of Patinformatics

The Growing Importance of Patinformatics SciFinder Web 源于化学, 超越化学的一站式检索平台 SciFinder Web 使用介绍李凤梅 SciFinder 培训专员 2013.11 提纲介绍 SciFinder Web 中的内容 SciFinder Web 中的检索和后处理 SciFinder Web 中的物质结果及相关文献处理 SciFinder Web 中的物质检索方法 SciFinder Web 中的主题检索 SciFinder