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执瑕弘
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cas.org Chemical Abstract Service 化学文摘社我们专注于

To encourage the increase and diffusion of

1 SciFinder 检索介绍 CAS 上海代表处高级培训专员俞靓 Tel: Chemical Abstract Service 化学文摘社我们专注于 : 推动研究发展与创新为全球科技与创新领域提供领先的整合的, 全面的信息解决方案 To encourage the increase and diffusion of chemical knowledge for the benefit of industry and education 1

2 Chemical Abstract Service 化学文摘社今天 : 全球最大的学协会组织本部拥有 800 多博士从事文献编辑工作为全球超过 1200 多个学校提供 SciFinder 桌面检索平台通过此次培训, 您可以掌握掌握 SciFinder 中文献检索方法与分析掌握 SciFinder 中结构检索的方法与分析掌握 SciFInder 中的反应检索与分析了解 SciFinder 最新的版本 SciFinder Web 2

3 提纲 SciFinder 介绍 SciFinder 中的文献检索与分析 SciFinder 中的物质检索与分析 SciFinder 中的反应检索与分析 SciFinder Web 介绍 SciFinder 介绍由 CAS 自主开发研究的. 一站式的信息检索平台, 可以检索全球最大的, 有关生物化学, 化学, 化学工程, 医药等化学相关学科的信息从中可以检索来自专利, 期刊的文献. 最大的二次文献数据库. 全球最大的物质数据库 3

4 SciFinder 介绍期刊专利论文会议报告 Chemcats Chemlist CAPlus Medline 溶剂, 催化剂, 产率等 Registry CASReact 物质基因合成信息 SciFinder 介绍 ---- 记录数 Literature Registry CASReact Chemlist Chemcats 总量 ( 万 ) 有机无机物 CAplus 生物序列 Medline 4

5 提纲 SciFinder 介绍 SciFinder 中的文献检索与分析 SciFinder 中的物质检索与分析 SciFinder 中的反应检索与分析 SciFinder Web 介绍 SciFinder 中和文献有关的数据库 CAPlus(Pre 1907-) 覆盖化学相关众多学科领域的参考文献 3200 万条文献信息上万种期刊和 59 个专利发行机构的专利 ( 含专利族 ) 会议录技术报告图书学位论文评论会议摘要日更新 3000 条以上的记录 Medline 美国国立医学图书馆出品生命科学医学相关毒理, 病理学报告期刊临床报告 5

6 SciFinder 文献检索途径主题词作者名机构名期刊名文献物质反应主题检索举例获得纳米磁材料应用的参考文献 Nano Magnetic Materials with using 6

7 使用介词来连接关键词 Concept 表示做了同意词的扩展 Closely associated with one another 表示同时出现在一个句子中 were present anywhere in the reference 表示同时出现在一段话中用蓝色显示出现的是命中的词条, 这里可以看到很多同义词, 近意词都被检索出来文摘信息全文链接分析限定 7

8 SciFinder 文献分析限定工具系统分类工具 Analyze 下的分析工具一共 11 种分析手段分析工具提供 11 种分析方法, 包括索引词, 作者名, 机构名, 文献类型, 期刊名称, 出版年限等在这些分析工具中, 索引词 (Index Term): 可以帮助我们对文献的内容进行大致的了解学科分析 (CA Section Title): 可以帮助我们对文献进行学科分类 8

9 Analyze-----Index Term 分析 Analyze-----Publication Year 分析 9

10 Refine 下的限定工具一共 7 种限定手段限定工具提供 7 种限定方法, 包括主题词, 作者名, 机构名, 文献类型等在这些限定工具中, 主题词 (Research Topics): 可以让我们用我们关心的主题词再次限定文献文献类型 (Document Type): 可以让我们直接获得我们感兴趣的文献类型通过这种方法, 可以获得来自中国的参考文献系统分类工具 Categorize 一级目录二级目录点击感兴趣的二级分类, 在这里可以出现一些索引词条 10

11 获得和给药有关的一些条目选择感兴趣的内容, 点击 Get Reference 通过,Save As 存储为 *.rtf 文件, 可打印修改类似 word 文档, 单次存储文献数量要 50, 千万不要过量下载存储文件名称, 所属文件夹都要为英文 11

12 作者名检索举例查找 2009 年诺贝尔化学奖得主之一 Thomas A. Steitz 发表的文章姓必须输入, 名只输入首字母在列表中将全部的可能性都选择出来 12

13 继续使用 Analyze 和 Refine 功能, 依据该作者的工作学习经历来获得他所发表的文献 13

14 来看一条记录引文被引文献中的物质文献中的反应 SciFinder 文献检索小结主题检索时, 使用介词作为连接尽量选择包含 Concept 和 Closed Associated with 的候选项通过 SciFinder 的 Analyze/Refine 功能来缩小检索的范围尝试将不同的 Analyze/Refine 功能组合起来用, 会有更多的收益使用 Categorize 可以让系统来实现自动分类注意作者名检索时的输入规则通过 Get Related 来获得更多的信息, 可以实现从文献到物质, 反应, 引文的链接 14

15 提纲 SciFinder 介绍 SciFinder 中的文献检索与分析 SciFinder 中的物质检索与分析 SciFinder 中的反应检索与分析 SciFinder Web 介绍 SciFinder 中和物质有关的数据库 Registry (Pre 1967-) 世界上最大的物质数据库 5300 万个物质 ;6100 万个序列无机物有机物聚合物混合物合金核酸蛋白质序列等所有具有 CAS No 物质日更新 4000 多个物质 ChemList 查询备案 / 管控化学信息的工具 Chemcats 3900 万化学物质提供商的联系信息包含价格情况运送方式质量等级等信息 15

16 SciFinder 物质检索途径物质名称, CAS 登记号文献分子式物质反应结构部分结构相似结构通过物质名称,CAS 登记号检索 ----Locate 使用 SciFinder 来检索二茂铁 CAS No: 物质名称 :ferrocene 16

17 通过这种方式, 可以实现从物质到文献, 或者从物质到反应的连接 17

18 通过物质结构检索举例 ---Explore 结构工具 18

19 结构相关工具铅笔元素周期表可变基团重复基团工具结构模版橡皮选择工具正电子原子锁定工具碳链工具常用基团 R 基团定义工具可变位置连接工具多元环工具索套选择工具旋转工具负电子环锁定工具通过结构检索物质精确结构检索通过物质类别, 来限定检索物质的种类, 不选, 则返回全部物质 19

20 最后一个物质, 就是和画进去的结构完全一致的物质精确结构检索, 可以检索到物质的盐, 聚合物, 混合物, 配合物等也可以通过 SciFinder 查询氨氯地平的所有的修饰物查询包含以下通式结构的物质 O O N Cl O N O O 20

21 亚结构检索亚结构检索可以通过这个选项将混合物都去除亚结构能帮您检索到所有的修饰物信息 O O N Cl O N O O 696 种修饰信息 21

22 Analyze 下的分析工具 6 大分析功能分析功能提供 6 大功能, 其中真实原子附属分析 (Real-atom attachments): 能够分析出原子的修饰情况可变基团分析 (Variable Group composition): 能分析结构中定义的可变基团 R 基团分析 (R-Group Composition): 可以分析结构中定义的 R 基团环骨架分析 (Ring Skeletons): 可以分析结构的环结构, 包括环上的原子和环上的单双键 22

23 使用 Real-Atom Attachment 分析衍生物的结构可以通过分析工具来分析每个开放位点的修饰情况 Refine 下的限定工具 7 大限定功能限定功能提供结构再次限定, 同位素是否包含限定, 金属是否包含限定, 理化性质限定等通常可以通过结构的再次限定 (Chemical Structure) 去对结构再次修饰修正结构 23

24 获得符合要求的物质结构类似物查询举例查找以下物质的相似物 O O 这是设计的一个全新的物质, 无法通过 SciFinder 找到, 可以通过查询它的类似物, 预测一下这个物质可能的性质, 或者应用 24

25 相似结构检索 SciFinder 只能给出与母体结构相似度在 60 分以上的物质, 通过选择不同阶段的分数, 来获得物质 25

26 O O 区别 : 取代基不同取代基位置不同母体结构略有不同 SciFinder 的 3 种结构检索包容关系亚结构检索相似结构检索精确结构检索精确结构检索 : 得到的是物质的盐, 本身, 聚合物, 混合物亚结构检索 : 画出来的结构必须存在相似结构检索 : 给出相似度在 60 分以上的物质 26

27 结构检索小结精确结构检索 : 获得物质的盐, 聚合物, 混合物, 配合物等, 母体结构不能修改, 不能修饰亚结构检索 : 所画的结构必须存在, 母体结构不能修改, 但可以被修饰相似结构检索 : 获得相似度在 60 分以上的结构, 母体结构可以修改, 也可以被修饰, 用相似度来控制获得的结果分子式检索举例 27

28 分子式输入规则同一组分中的元素, 必须有明确的分割符号, 可以用数字和空格来分割对于不含 C 的物质, 按照字母顺序书写对于含 C 物质,CH 写在前面, 其他按照字母顺序对于多组分物质, 用. 将不同的组分分开, 组分排列顺序按照 C 数的降序排列,C 数相同时, 按照 H 数降序排列,H 数在一样, 按照第三个元素的字母顺序排列, 依次类推聚合物括号表示, 括号外用 n 表示的是终产物的重复结构单元, 括号外用 x 表示起始物, 区分大小写分子式检索例一 O HO O n O O n OH (C3H6O)n(C2H4O)nC8H6O4 28

29 分子式检索例二 ABS 树脂 N (C8H8. C4H6.C3H3N)x 提纲 SciFinder 介绍 SciFinder 中的文献检索与分析 SciFinder 中的物质检索与分析 SciFinder 中的反应检索与分析 SciFinder Web 介绍 29

30 SciFinder 中的和反应有关的数据库 CAS React(1840-) 源自期刊, 专利中有机有机金属无机生化反应 2400 万单步, 多步反应周更新 SciFinder 反应检索途径文献官能团物质反应结构部分结构 30

31 SciFinder 中的反应检索和分析反应查询工具 31

32 与反应定义有关的功能键反应位置标记工具反应角色工具反应箭头反应原子标记工具反应官能团列表检索特定物质之间的反应 CHO COOH 32

33 使用精确反应检索获得特定的反应精确反应检索 33

34 Analyze 下的分析工具一共 10 种分析手段 Refine 下的限定工具一共 4 种限定手段 34

35 获得符合要求的反应类型点击, 可以直接获得包含这条反应的记录点击, 可以直接获得这些反应的记录, 实现从反应到文献的连接让一篇文献出现一条反应右击物质, 可以直接进行物质结构或者反应检索, 或者查看该物质的属性等等, 实现从反应到物质的连接 35

36 检索官能团变化的反应获得从仲醇转换成酮的反应, 同时要求反应中的伯纯不能参与反应 OH O R R R R R OH 通过官能团定义工具定义反应选择反应中需要出现的官能团定义每种不同官能团的角色, Non-reacting 只能定义官能团 36

37 获得符合官能团变化的反应检索类似物的反应获取反应物为非硫醇的缩醛化反应 S CHO HS HS S 通常使用的一些硫醇, 如甲硫醇乙硫醇和苄硫醇等不但有毒还具有恶臭气味, 不仅对环境造成污染, 而且危害使用者的健康现通过 SciFinder 来查询不含硫醇的缩醛化反应 37

38 通过亚结构反应检索将所有的反应都找到亚结构反应检索使用原子标记工具标记反应前后对应的原子看到类似的反应都查询出来类似的反应物和产物都用红色标记出来 38

39 将所有反应, 保存成书签格式使用结构限定工具, 将反应物定义为硫醇使用重复基团定义工具, 定义我们不希望检索到的反应物 39

40 这是我们不需要的反应使用 Combine 工具来去除这些反应这些都是我们不想要的反应物选择刚才保存过的书签这里可以看到保存的书签的详细情况 40

41 选择集合操作类型获得不含硫醇的缩醛化反应 41

42 COMBINE----- 组合答案集功能可以对于任意两个同类型的集合进行 AND,OR,NOT 的操作 O R AND NOT NOT *.SFR 格式保存书签格式保存功能将结果保存成书签, 可以使用 SFS 再次打开, 继续进行检索, 也可以对同类的书签进行 COMBINE 操作 42

43 SciFinder 反应检索小结多用 Analyze/Refine, 来获得催化剂, 溶剂, 产率等信息如果反应只涉及基团之间的变化, 用官能团反应可以获得更多的参考信息当无法找到具体反应, 或者检索结果并不满意, 尝试用亚结构反应查询, 可以获得更多的参考信息更多有关结构和反应的说明, 请参考提纲 SciFinder 介绍 SciFinder 中的文献检索与分析 SciFinder 中的物质检索与分析 SciFinder 中的反应检索与分析 SciFinder Web 介绍 43

44 SciFinder Web 介绍 SciFinder Web 是通过 Web 来访问 SciFinder 数据库的方式友好的用户界面良好的沟通协作能力更加强大的反应检索能力即时跟踪特定研究领域的全球最新动态 SciFinder Web 是通过 Web 来访问 SciFinder 数据库的方式 44

45 友好的用户界面文献, 物质, 反应检索入口, 默认开始检索文献在机构中寻找或添加联系人可用的检索方法保存过的结果集邮件提醒结果集寻找和添加联系人 45

46 良好的沟通协作能力添加对文献的评论 (Comments) 和标记 (Tags), 可以和您的联系人分享评论, 或者使用标记检索被标记的文献即时跟踪特定研究领域的全球最新动态设定提醒, 一旦有新的记录, 会发邮件通知可以通过历史导航条返回历史检索界面设置提醒文件名和失效时间 46

47 强大的反应检索能力 --- 相似反应检索对于单步反应, 可以进行相似反应检索对于选择是全部反应中检索相似反应, 还是在当前结果集中检索相似反应选择相似反应的相似限制 Broad: 仅反应中心相似 Miedum: 反应中心及附属原子和健 Narrow: 反应中心及扩展的原子和健 47

48 强大的反应检索能力 --- 溶剂选择限定工具可以通过溶剂限定工具限定反应的溶剂点击下拉双箭头, 进行溶剂选择, 或通过查找功能, 查找溶剂 48

49 强大的反应检索能力 --- 设定不参与反应的基团可以设定不参与反应的基团点击下拉双箭头, 选择不参与反应的官能团, 通过勾选选择不参与反应的官能团 49

50 强大的反应检索能力 --- 获得更多的反应获得更多的反应用于查询包含了结构相匹配物质的文献, 同时文献中有有关该物质合成制备信息 50

51 请合理使用 SciFinder!!! 千万不要过量下载! 只下载自己要看的记录 ( 缩小范围 ) 不要用迅雷, 快车之类的工具下载记录不使用请关闭客户端程序一旦发生过量下载,CAS 将视情节严重采取不同的限制措施全 IP 范围内取消全部下载功能, 包括 *.SFR 格式的下载全 IP 范围内取消部分检索功能情况严重的, 将暂定 SciFinder 的使用那么, 当我们遇到大量记录时, 该怎么做? 这些记录真的是我们想要的吗? 如果真的都想要, 我们需要花多少时间把这些记录全部看完? 所以希望大家能够 : 多使用 Analyze/Refine 工具去分析限定文献遇到较多记录时, 使用 *.SFR 格式保存 51

$( 选择 No) site.prf (site) 文件只需将 site.prf 文件复制粘贴到 X:\ScholarCHLR 目录下还可安装 ViewerLite 用于查看 3D 结构可能 1:( 并发用户数限制 ) 解决方法 : 请耐心等候!$

52 SciFinder 的程序安装 SciFinder Scholar 客户端程序 : SciFinder Scholar2007.exe 安装过程中, 提示 : Do you have a disk labeled Custom Site Files? ( 选择 No) site.prf (site) 文件只需将 site.prf 文件复制粘贴到 X:\ScholarCHLR 目录下还可安装 ViewerLite 用于查看 3D 结构可能 1:( 并发用户数限制 ) 解决方法 : 请耐心等候! 52

53 可能 2:( 网络故障 ) 解决方法 : 检查网络可能 3: 网络故障解决方法 : 点击 OK, 再次运行 SciFinder/Scholar 53

54 可能 4: IP 地址未被授权解决方法 : 确认 IP 地址是否在校内, 并与图书馆管理员联系谢谢! CAS 中国代表处上海市肇嘉浜路 798 号 605 电话 : 传真 : Sam@igroup.com.cn 54

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Microsoft PowerPoint - 石油大学研究工具 SciFinder 介绍 CAS 上海代表处高级培训专员俞靓 Tel:021-64453167 Email:Sam@igroup.com.cn www.cas.org 1 Chemical Abstract Service 化学文摘社我们专注于 : 推动研究发展与创新为全球科技与创新领域提供领先的整合的, 全面的信息解决方案 To encourage the increase and