如何利用SciFinder提高研究效率

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鳗选颛谢
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1 如何使用 SciFinder 获取科技信息 ---- 中南大学基础培训汤健钊

2 提纲美国化学文摘社简介 SciFinder 简介及检索方式文献检索 (PatentPak) 物质检索 Markush 检索反应检索 (MethodsNow) SciPlanner 使用简介 SciFinder 常见问题及解决 2

3 美国化学文摘社 Chemical Abstracts Service ACS 的分支机构创建于 1907 年, 简称 CAS 最早创立了化学文摘密切关注, 索引和提炼着全球化学相关的文献和专利总部座落于俄亥俄州的哥伦布市 3

4 CAS 构建最高质量的化学数据库 Patents, journals, web, catalogs, etc. CAS Scientists

5 CAS 数据库源于化学, 超越化学生物化学 : 农化产品管控信息, 生化遗传学, 发酵, 免疫化学, 药理学有机化学各领域 : 氨基酸, 生物分子, 碳水化合物, 有机金属化合物, 类固醇大分子化学各领域 : 纤维素木质素造纸 ; 涂料墨水染料有机颜料 ; 合成橡胶 ; 纺织品纤维应用化学各领域 : 大气污染, 陶瓷, 精油化妆品, 化石燃料, 黑色金属合金物理无机分析化学各领域 : 表面化学, 催化剂, 相平衡, 核现象, 电化学 5

6 CAS 数据库最具价值的内容人工索引 Tips: 1. 98% 以上的文献, 都经过人工索引 2. 用 Index Term 标引文献中的重要技术术语 3. 用 CAS RN 标引出文献中的重要物质 6 4. 用 CAS Role 标引文献中重要物质的研究领域

7 CAS 人工标引解决的问题检索词的同义词拓展 : 解决不同科研人员由于教育背景语言表达习惯不同导致的对同一个技术术语描述的差异用名称分子式等检索化合物, 会导致检索不全不准的问题 CAS RN 很好的解决了该问题, 帮助检索人员实现精准定位化合物的目标利用 SciFinder 中的标引信息 (Index Term,CAS RN,CAS Role), 提高效率, 启发思路 7

8 提纲美国化学文摘社简介 SciFinder 简介及检索方式文献检索 (PatentPak) 物质检索 Markush 检索反应检索 SciPlanner 使用简介 SciFinder 常见问题及解决 8

9 SciFinder 覆盖的数据库 CAS REGISTRY >1.09 亿个独特物质 >6600 百万个基因序列 >61 亿条物质属性值 CAplus >4200 万篇杂志, 专利, 论文等 63 家专利授权机构的专利 Medline CASREACT >7250 万条单步多步反应 >1400 万条合成制备信息 MARPAT >111 万代表有机或者金属有机的马库什结构 CHEMLIST >34.5 万个化学管制品目录 15 个国际和国家目录 CHEMCATS >1.02 亿商用化学品 >3300 万独特的物质 >660 个全球化学品供应商 >750 化学品目录

10 SciFinder 登录网址 : 输入 SciFinder 账号和密码 10

11 SciFinder 主界面检索完, 请点击退出工具栏已保存的结果集检索入口定题追踪 11

12 SciFinder 检索文献检索文献检索方法主题检索作者名检索机构名检索文献标识符检索期刊名称和专利信息 ( 公开号, 申请号等 ) 从物质, 反应获得文献检索策略推荐关注某特定领域的文献 : 主题检索关注物质有关的文献 : 先获得物质, 再获得文献关注某科研人员的文献 : 作者名检索关注某机构科研进展 : 机构名检索 12

13 文献检索主题 : 光解水检索式 : water splitting with solar 关键词之间可用介词连接 :in, with, of 13

14 文献检索主题 : 光解水检索式 : water splitting with solar 提前限制出版年限, 语言, 文献类型等 14

15 主题检索的候选项 Concepts 表示对主题词做了同义词的扩展 ; Closely associated with one another 表示同时出现在一个句子中 ; were present anywhere in the reference 表示同时出现在一篇文献中 ; 15

16 文献检索结果检索结果处理工具获取原文链接涉及物质及引文链接 16

17 文献检索结果获得相关物质 / 反应 5 种排序方式, 可以按照进入数据库的时间作者名引文公开年限标题对文献检索结果进行重新排序 Citing Reference: 可能帮助找到最重要的文献 17

18 文献检索结果 :Analyze 12 种文献分析选项主要研究人员主要研究机构, 合作伙伴, 竞争对手主要发表期刊 18

19 文献检索结果 :Analyze Index Term: 帮助用户全景了解本领域涉及的重要技术术语, 精选文献选择感兴趣的词语, 点击 Apply 19

20 文献检索结果 :Refine 六种限定选项, 包括主题词作者姓名机构名称出版年代语言所属数据库在结果中筛选主题带有 titania 的文献 20

21 文献检索结果 :Refine 在结果中筛选专利文献 21

22 文献检索结果 :Categorize 学科主分类学科副分类学科副分类涉及的重要技术术语选中的重要技术术语基于学科对文献进行自动分类, 22 帮助用户精准定位所关注的学科和技术术语

23 文献信息详情重要技术术语重要物质文献详情界面包括 : 1. 标题 2. 摘要 3. 文献中重要的技术术语 4. 文献中重要的物质 5. 书目信息 6. 获得文献中的物质, 反应 7. 参考文献 8. 链接原文 23

24 提纲美国化学文摘社简介 SciFinder 简介及检索方式文献检索 (PatentPak) 物质检索 Markush 检索反应检索 SciPlanner 使用简介 SciFinder 常见问题及解决 24

25 专利工作流程解决方案 25

26 Percentage of Total 越来越多的新化合物倾向于首先通过专利公布 100% Percentage of New Compounds from Patents 80% 60% 40% 77% 20% 00% 14% Year 26

27 PatentPak 专利工作流程解决方案在 SciFinder 检索结果中, 看到 PatentPak 图标即可点击点击 PatentPak, 获取 PatentPak Viewer 27

28 PatentPak 专利工作流程解决方案 PatentPak 浏览器下载带有物质信息汇总表格的专利 PDF 文件下载专利 PDF 文件专利 PDF 文件在 PatentPak Viewer 中点击物质下面的灯泡, 快速定位到 PDF 文件中的物质信息 28

29 PatentPak 专利工作流程解决方案也可从 PDF 文件中与 PatentPak 进行互动

30 PatentPak 专利工作流程解决方案可在 PatentPak Viewer 中直接返回 SciFinder 进行结构马库什和反应检索

31 PatentPak 专利工作流程解决方案从 PatentPak Viewer 直接跳转到结构检索界面, 同时无需绘制, 系统会自动将相应的结构直接导入到绘图面板, 点击 Search 即开始 SciFinder 检索, 拓展新的研究方向 31

32 节省您最宝贵的资源时间即时获得来自世界上主要专利授权机构的专利 PDF 文件专利族涵盖了多种语言通过 CAS 登记号获得物质在专利文献中的相关信息专利研究安全保密每日更新 SciFinder 检索功能中内置交互式浏览器 32

33 提纲美国化学文摘社简介 SciFinder 简介及检索方式文献检索 (PatentPak) 物质检索 Markush 检索反应检索 SciPlanner 使用简介 SciFinder 常见问题及解决 33

34 SciFinder 检索选项物质检索物质检索方法结构式检索 Markush 结构检索分子式检索理化性质检索物质标识符检索 : 化学名称,CAS RN 物质检索策略推荐有机物化合物天然产物 : 结构检索无机化合物合金 : 分子式检索高分子化合物 : 分子式检索和结构检索 34

35 物质检索标识符检索提示 : 1. 一次最多可输入 25 个物质 2. 每行一个物质标识符物质标识符包括 CAS RN 和化学名称, 化学名称可以是通用名称商品名俗名 35

36 SciFinder 中的物质记录点击 CAS RN 获得物质详细信息在 SciFinder 中, 鼠标滑过物质, 即可打开物质标准菜单, 获得与物质相关的所有内容 36

37 SciFinder 中的物质记录由物质获得文献, 反应, 供应商等信息物质详情 37

38 通过物质获得文献制备分析化学生物研究工艺用途谱图性质 38

39 实验数据与实验谱图预测数据与预测谱图

40 物质检索 Property explore 40

41 物质检索 Property explore 寻找分子量在之间的物质 41

42 物质结果集的筛选 Refine 3500 多万个结构, 如何筛选黄酮类物质?

43 物质结果集的筛选 Refine 锁环工具 : 避免在被锁定的环结构上出现新的环结构 43

44 物质结果集的筛选 Refine 从 3500 多万个结构中筛选出 7800 个黄酮类物质 44

45 物质检索分子式无机金属盐 : 金属离子和阴离子间用点 (.) 分开分子式输入需要遵守 Hill 排序规则 : 不含碳化合物, 按元素符号的字母顺序排列 ; 分子式为含碳化合物时, 则 C 在前 ; 如有 45 氢则紧随其后, 其它元素符号按字母顺序排在氢的后面

46 物质检索结构 46

47 铅笔橡皮结构和反应切换功能元素周期表可变基团重复基团工具碳链工具选择工具环锁定工具旋转工具常用基团 R 基团定义工具可变位置连接工具模版工具索套选择工具原子锁定工具镜面旋转工具结构检索选择正电子 C 原子和单键恢复工具负电子单双键,RS 构型, 不确定键定义工具常见环, 多元环工具 47

48 物质检索精确结构检索可以通过 CAS RN 转换结构 : CAS RN: 精确结构检索 48

49 浏览精确结构检索结果可以通过分析 / 限定筛选结果集可卡因盐酸可卡因可卡因组合物 49

50 物质检索精确结构检索精确结构检索 : 获得被检索结构的盐, 混合物, 配合物, 聚合物等, 被检结构不能被取代 50

51 物质检索亚结构检索 51

52 物质检索亚结构检索 52

53 浏览亚结构检索结果取代物离子稠环物质 53

54 亚结构检索结果的限定工具化学结构的再次限定环锁定原子锁定 54

55 化学结构的再次限定 55

56 同位素去除 56

57 物质检索亚结构检索亚结构检索 : 包括精确结构检索结果, 及被检索结构的修饰结构 57

58 物质检索相似结构检索 58

59 相似结构检索候选项相似度越高, 结构越相似相似结构检索结果取代基变化取代基位置变化母体结构变化 59

60 物质检索相似结构检索相似结构检索 : 获得片段或整体结构与被检索结构相似的结果, 母体结构可以被取代, 也可以被改变 60

61 无机物及合金的检索分子式书写规则 Hill 规则单一组分物质 : 对于不含 C 的物质, 按照字母顺序排序对于含 C 的物质,C H 写在前面, 其他的按照字母顺序排列相邻的两个元素之间必须有区分号, 即数字或者空格, 倘若数字为 1, 那么可以用空格来区分区分大小写多组分物质 : 每一组分必须遵照单一组分物质的分子式来书写不同组分之间的排序按照各组分的首元素的字母顺序排序, 但是含 C 组分的一定排在不含 C 的组分前面用点将不同的组分分开倘若不同组分的首元素相同, 则看元素数量多少, 数量多的排在前面, 若元素数量一样, 则按次元素的顺序排列 61

62 无机物及合金的检索检索铁锰镍合金合金物质以列表形式呈现 62

63 无机物及合金的检索检索参杂铁锰镍原子的合金 63

64 聚合物的检索已知起始原料的聚合物 (C8 H8 Br2. C4 H6 O4)x 分子式检索后会得到同分异构体 64

65 聚合物的检索单一组分聚合物 65

66 聚合物的检索已知重复单元的聚合物 66

67 聚合物的检索利用结构特征进行 Refine, 迅速查找需要的物质 67

68 聚合物的检索单一组分聚合物绘制好 SRU 后用亚结构检索因为两段为开放状态 68

69 聚合物的检索含端基和 SRUs 的聚合物 (C2 H4 O)n C3 H6 O SRU 部分两端部分 69

70 提纲美国化学文摘社简介 SciFinder 简介及检索方式文献检索物质检索 Markush 检索反应检索 SciPlanner 使用简介 SciFinder 常见问题及解决 70

71 Markush 检索具体物质 [Specific Substance]: 以具体化学结构陈述的特定物质, 会被分配 CAS RN 预测性物质 [Prophetic Substance]: 使用 Markush 结构陈述的预测物质, 一个 Markush 可以陈述上百或上千个化学物质专利中所陈述的预测物质, 不会被分配 CAS RN Markush 检索, 能检索到通过结构检索检不到的专利 R1 R2 R1 = H, Br, Cl, I R2 = Br, Cl, I, CH 2 halogen, CH halogen, CH 3 71

72 可用 SciFinder 中的 Markush 检索查看专利中化合物结构保护范围 72

73 提纲美国化学文摘社简介 SciFinder 简介及检索方式文献检索物质检索 Markush 检索反应检索 SciPlanner 使用简介 SciFinder 常见问题及解决 73

74 SciFinder 检索选项反应检索检索选项结构式常用获取方法已知物质 : 由物质获取反应已知文献 : 从文献中获取反应精确结构反应检索亚结构反应检索 74

75 反应箭头反应角色工具反应原子标记工具官能团列表反应位置标记工具 75

76 SciFinder 反应检索精确反应检索精确反应检索 76

77 反应检索结果浏览记录, 发现很多反应来自同一篇文献, 通过 Group by Document 合并获取相似反应 77

78 获取相似反应选择相似反应的相似限制 : Broad: 仅反应中心相似 Miedum: 反应中心及附属原子和键 Narrow: 反应中心及扩展的原子和键 78

79 按照反应类型排序更精确的查找需要的反应 79

80 反应检索结果的筛选获得特定物质做还原剂的反应 80

81 SciFinder 囊括最大的反应实验过程合集不用阅读全文, 直接获得包含实验过程的反应记录 81

82 SciFinder 囊括最大的反应实验过程合集 Experimental Procedure: 我们可以做得更好更好的阅读体验? 这些数字代表什么? 去免费的 Supporting Information 查? 可能只有图谱 82

83 多步反应中, 原文没有描述的实验过程以灰色展示物质信息实验过程图谱信息保存 / 导出方法 83

84 SciFinder 反应检索亚结构反应检索 84

85 SciFinder 反应检索亚结构反应检索

86 亚结构反应检索结果通过 Analyze 或者 Refine 处理检索结果 86

87 亚结构反应检索结果通过 Analyze 或者 Refine 处理检索结果 87

88 提纲美国化学文摘社简介 SciFinder 简介及检索方式文献检索物质检索 Markush 检索反应检索 SciPlanner 使用简介 SciFinder 常见问题及解决 88

89 关于 SciPlanner 使用简介勾选想要的反应点击 Send to Sciplanner workspace 下新建一个文件进入 Sciplanner, 将刚推送过来的反应拖动到屏幕中间 89

90 点击反应中的一个中间产物, 单击上面的双向箭头, 选择 Synthesis this 在检索到的反应中, 选择感兴趣的一条反应将该条反应继续推送到 Sciplanner 中 90

91 关于 SciPlanner 使用简介同前页步骤, 将推送过来的反应拖动到 SciPlanner 中, 可以看到两条反应中存在同样的结构 91

92 点击 Workspace, 选择其中的 Export 输出结果用鼠标将两个同样的结构拖动至重叠状态, 两条反应合并选择适当的输出格式, 输出结果 92

93 SciPlanner 导出结果 93

94 提纲美国化学文摘社简介 SciFinder 简介及检索方式文献检索物质检索 Markush 检索反应检索 SciPlanner 使用简介 SciFinder 常见问题及解决 94

95 SciFinder 浏览器选择建议 Windows 7 以上用户建议升级 IE 到 10 以上 Chrome 和 FireFox 浏览器在所有系统上的表现都优于 IE 浏览器不建议使用 360 浏览器检索 SciFinder, 会被自动拦截相关功能或插件 95

96 如何获取 SciFinder 账号请注意 : 1. 必须输入真实姓名和域名邮箱 2. 用户名必须是唯一的, 且包含 5-15 个字符它可以只包含字母或字母组合数字和 / 或以下特殊字符 : -( 破折号 ) _( 下划线 ). ( 句点表示 at 的符号 ) 3. 密码必须包含 7-15 个字符, 并且至少包含三种以下字符 : 字母混合的大小写字母数字非字母数字的字符 ( # % & *) 4. 从下拉列表中选择一个密码提示问题并给出答案单击 Register( 注册 ) 96

97 如何获取 SciFinder 账号 97 打开并阅读 CAS 的电子邮件 ( 必须在 48 小时内点击, 否则需要重新注册 )

98 如何获取 SciFinder 账号至此, 账号注册成功, 登录 scifinder.cas.org 开始使用 SciFinder 98

99 SciFinder 使用注意事项一人注册一个帐号严禁过量下载严禁账号分享严禁将账号用于非学术研究 99

100 谢谢! 汤健钊美国化学文摘社 QQ:

The Growing Importance of Patinformatics

The Growing Importance of Patinformatics 如何利用 SciFinder 提高研究效率钱欣 cqian@acsi.info 美国化学文摘社北京代表处提纲美国化学文摘社简介 SciFinder 简介及检索方式文献检索物质检索 Markush 检索反应检索 SciPlanner 使用简介 SciFinder 常见问题及解决 2 美国化学文摘社 Chemical Abstracts Service ACS 的分支机构创建于 1907