The Growing Importance of Patinformatics

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1 SciFinder Web 源于化学, 超越化学的一站式检索平台 苏州大学 SciFinder Web 使用介绍 杨四娟

2 提纲 SciFinder Web 介绍 SciFinder Web 中的内容 SciFinder Web 中的检索 SciFinder Web 中的文献检索策略 SciFinder Web 中的物质检索策略 SciFinder Web 中的反应检索策略 SciFinder Web 注册和常见问题 2

3 美国化学文摘社 Chemical Abstract Service ACS 的分支机构, 创立于 1907 年致力于跟踪 索引并提炼全球化学相关的科技文献信息最先创立了纸本 化学文摘 Chemical Abstracts TM 总部位于俄亥俄州的哥伦布市 1300 名员工, 精通 50 多种语言 关注索引上万种期刊和 63 家专利客户覆盖全球 1900 所高校 强公司以及所有主要的专利局

4 SciFinder Web 中的内容 期刊专利论文会议报告 Chemcats CAPlus Medline Chemlist 溶剂, 催化剂, 产率, 反应实验过程等 Registry Marpat CASReact 物质 基因 专利中的 Markush 结构 合成信息 4

5 SciFinder Web 中的几个主要数据库 CAS REGISTRY SM >8900 万有机无机物质 >6500 生物序列每天更新约 新物质物质报道文献, 回溯到 1802 年物质信息包含了大量的实验数据, 预测数据, 以及物质标签和谱图 CASREACT >5400 万单步和多步反应 >1400 万物质合成制备信息源自专利和期刊文献每天更新反应回溯到 1840 年 CAS Databases CAplus SM >3700 万专利和期刊信息 >10000 种期刊的覆盖 63 个专利发行机构每天更新 3000 条记录文献回溯到 19 世纪初引文信息回溯到 1997 年之前, 超过 3 亿条引文信息 MARPART >99.2 万专利中的有机, 有机金属结构回溯至 1961 年每天更新 (60-75 篇专利引文, 以及 个 Markush 结构 ) 5

6 CAS REGISTRY 是化学物质信息的 黄金标准 8700 万物质,6500 万序列, 每天更新 CAS REGISTRY 是化学信息唯一综合 全面的资源 6 Copyright 2014 American Chemical Society. All rights reserved.

7 CASREACT 是检索化学反应最权威的来源 CASREACT 是世界上最大的, 更新速度最快的反应数据库 CASREACT 能非常快速 精确 全面的回答您的化学反应问题 7

8 Caplus 收录上万种期刊和 63 家专利机构的专利 3900 万条文献记录, 每天更新 1907 年 至今 50 种语言,180 个国家 1 万多种期刊,1500 多种核心期刊 所有专利原文直接免费下载 8

9 chemlist 个化学管制品清单每周更新 CIN 170 万条化工出版物记录 chemcats 6500 万产品供应商信息 (2700 万具有 CAS No 的物质 ) 每周更新 Marpat Markush 结构 专利记录每周更新 9 CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2012 American Chemical Society. All rights reserved.

10 SciFinder Web 登陆后主界面 检索完, 请点击退出 文献 保存过的结果集 物质 邮件提醒结果集 反应 10

11 提纲 SciFinder Web 介绍 SciFinder Web 中的内容 SciFinder Web 中的检索 SciFinder Web 中的文献检索 SciFinder Web 中的物质检索 SciFinder Web 中的反应检索 SciFinder Web 注册和常见问题 11

12 埃博拉 (Ebola virus) 埃博拉病毒 (EBOV) 是引起人类和灵长类动物发生埃博拉出血热 (EBHF) 的烈性病毒, 由此引起的出血热是当今世界上最致命的病毒性出血热, 已造成 10 次具有规模的爆发流行 埃博拉病毒首次暴发就夺走了近 300 人的生命,2003 年又在刚果 ( 金 ) 让 100 多人命丧黄泉,2004 年 5 月下旬苏丹南部疫情再发, 已有 4 人死亡, 同时俄罗斯一实验室女科学家因针刺感染而丧命 2014 年病毒再度爆发, 已致 1552 不等人死亡, 确诊 可能感染和疑似病例 3069 不等例 埃博拉病毒, 生物安全等级为 4 级 ( 艾滋病为 3 级,SARS 为 3 级, 级数越大防护越严格 ) 病毒潜伏期可达 2 至 21 天, 但通常只有 5 天至 10 天 2014 年非洲爆发此病毒疫情为有记录以来最严重的埃博拉疫情 12

13 SciFinder Web 中的文献检索 主题检索 :Ebola Virus 使用 at in by with of 等介词来连接术语, 点击 Search 13

14 主题检索的候选项 Concepts 做了同义词 单复数 不同时态的扩展 14 Copyright 2013 American Chemical Society. All righ

15 SciFinder 提供的引文排序 Citing Reference 把历史上被引最多的文献排在前面 15

16 SciFinder 中的文献处理策略 文献分析工具 (analyze,refine,categorize) 16

17 SciFinder 中的 Analyze 领域内主要研究人员, 专家 主要研究机构, 合作伙伴, 竞争对手 主要出版杂志, 机构, 潜在投稿期刊 17 Copyright 2013 American Chemical Societ

18 SciFinder 中的 Analyze By Index Term 索引词 (Index Term): 可以帮助我们对文献的内容进行大致的了解 选择感兴趣的内容, 点击 Apply 18

19 文献检索结果的 Analysis 点击 Keep Analysis 进入分析后的结果集 19

20 Refine Document Type: 可以帮助我们迅速获得特定文献类型的文献 临床试验 专利 综述 20

21 SciFinder 中的 Categorize 一级学科二级目录和二级目录相关的 Index Term 选中的 Index Term 21

22 结果集的保存 Save: 保存在服务器上, 可登陆后查看 22

23 练习 : 1 金纳米材料的改进 的相关专利文献 2 检索到 具有抗癌作用的天然产物 的相关物质 23

24 提纲 SciFinder Web 介绍 SciFinder Web 中的内容 SciFinder Web 中的检索 SciFinder Web 中的文献检索 SciFinder Web 中的物质检索 SciFinder Web 中的反应检索 SciFinder Web 注册和常见问题 24

25 SciFinder Web 中的物质检索 物质标识符 直接输入物质的名称, CAS No, 俗名, 都能检索, 一次最多检索 25 个物质, 用换行换开 25

26 获得物质相关的文献 反应 供应商 管制信息 点击小勾选中相应文献 26

27 预测数据 实验数据 27

28 实验数据 理化性质 直接点击获得实验光谱 参考文献 28

29 实验数据 光谱来源 实验光谱 1 H NMR, 13 C NMR,IR, MS, UV 29

30 获得和物质相关文献 获得与副作用 毒性研究相关的文献 活性 制备 用途 236 篇与副作用 毒性研究相关的文献 30

31 获得和物质相关反应 277 条合成信息 31

32 获得和物质相关供货商信息 93 家供货商信息获得公司 纯度 规格 价格 联系方式等信息 查询谱图信息和实验信息 32

33 物质检索 --Property 实验性质 预测性质 可输入一个具体的数据或者一个范围 寻找分子量在 之间的黄酮类物质? 33

34 物质结果集的筛选 --Refine 2 千多万个结构, 如何筛选黄酮类物质? 34

35 物质结果集的筛选 --Refine 原子锁工具避免找到环结构变化的物质 35

36 物质结果集的筛选 --Refine 这些物质的结构特点? 36

37 物质结果集的筛选 --Refine Atom Attachemnt: 了解结构中原子修 饰情况 鼠标放在任意原子上, 显示?, 右侧列 出该原子修饰基团 37

38 结构式检索 38

39 SciFinder 结构绘制工具 铅笔 橡皮 结构和反应切换功能 元素周期表可变基团重复基团工具碳链工具选择工具环锁定工具旋转工具正电子 常用基团 R 基团定义工具可变位置连接工具模版工具索套选择工具原子锁定工具镜面旋转工具 C 原子和单键恢复工具 结构检索选择 单双键,RS 构型, 不确定键定义工具 负电子 39 常见环, 多元环工具

40 绘制结构的方法? 40

41 精确结构检索 马钱苷 物质结构的导入方法 : 1 在绘图面板中直接绘制 2 其他绘图结构中导入, 比如 chemdraw 等 3 通过 CAS 号等导入 4 通过保存模板, 下次使用时导入 5 保存其他格式, 下次直接打开 46 Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved.

42 1 在绘图面板中直接绘制 42

43 2 其他绘图结构中导入, 比如 chemdraw 等 在 chemdraw 中 复制,scifinder 绘图面板中 粘贴 43

44 SciFinder & ChemDraw( 正版 ) 用户可从 ChemDraw 直接访问 SciFinder 44 Copyright 2012 American Chemical Society. All rights reserved.

45 用户可从 ChemDraw 直接访问 SciFinder 45

46 3 通过 CAS 号等导入马钱苷的 CAS 号为 : 输入物质 CAS 号 46

47 4 通过保存模板, 下次使用时导入 保存模板 调用模板 47

48 5 保存其他格式, 下次直接打开 打开 保存保存 打开 48

49 亚结构检索 亚结构检索 : 有机物质 49 获得包含该母核结构的所有物质 Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved.

50 结构检索 结构相似的检索 HOOC COOH SciFinder 中的相似结构检索, 帮助获得在结构上存在相似的物质 N Et 52 Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved.

51 相似结构检索 相似结构检索 : 取代基位置变化取代基变化母体结构变化 53 Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved.

52 精确结构检索 检索金属配合物 P t Bu N P Ni Cl t Bu BF 4 该结构中包含 : 配体金属阳离子阴离子 Bu t t Bu 46 Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved.

53 结构检索方法 任何一种结构, 使用精确结构都可以检索到 47 Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved.

54 检索的定义 同位素 立体异构 盐都能被检索到 精确结构检索 48 Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved.

55 我想获得以下的一系列物质 CHO N CHO N CHO N CHO Cl NH Cl NH Cl N H Cl N H N N O Cl N CHO Cl N CHO Cl N H H H CHO Cl N H CHO 55

56 结构定义 用亚结构检索获得所有的物质 56

57 亚结构检索结果 57

58 聚合物检索 只知道起始原料的聚合物检索 检索策略 : 组分间用点分开, 每个组分采用 Hill 排序, 括号外用 x 表示 (C4H6O2.C2H3Cl.C2H3F)x 58 Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved.

59 聚合物检索 知道结构重复单元 (SRU) 的聚合物检索 检索策略 : 采用 Hill 排序, 括号外用 n 表示 (C12H22N2O2)n 注意区分 n 与 x 的区别 59 Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved.

60 亚结构检索 单组分物质 有机物质 60

61 亚结构检索 达菲核心成分 帕拉米韦 亚结构检索 : 获得包含全部片段结构的所有物质 61

62 Markush 检索 62

63 Markush 检索 具体物质 [Specific Substance]: 以具体化学结构所陈述的特定物质, 会被标示 CAS No. 预测性物质 [Prophetic Substance]: 使用 Markush 结构所陈述的预测物质, 一个 Markush 可以陈述上百或上千的化学物质 Patent 中所陈述的预测物质, 不会被标示 CAS No. Markush 检索, 能检索到通过结构检索检不到的专利 R1 R1 = H, Br, Cl, I R2 = Br, Cl, I, CH 2 halogen, CH halogen, R2 CH 3 63 Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved.

64 SciFinder 中的 Markush 检索 能帮助做初步的专利评估 64 Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved.

65 全部是专利文献 65 Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved.

66 提纲 SciFinder Web 介绍 SciFinder Web 中的内容 SciFinder Web 中的检索 SciFinder Web 中的文献检索 SciFinder Web 中的物质检索 SciFinder Web 中的反应检索 SciFinder Web 注册和常见问题 66

67 SciFinder 中的反应检索 反应箭头 反应角色工具 反应原子标记工具 反应位置标记工具 反应官能团列表 67

68 反应精确检索 槲皮素 通过 CAS 号将槲皮素的结构式导入 68

69 共查找到合成反应 83 条 Sort by document 让一篇文献只显示一条反应 该文献共有 4 条反应 69

70 初步浏览反应信息 可按收率 年限 实验过程 步骤等 文章题目期刊信息作者信息反应步骤 条件 催化剂信息收率 ACS 中具有实验步骤的反应 查看实验步骤 70

71 CAS 与 Springer 在实验步骤信息提供方面的强强联手 新闻稿 实验步骤信息可以帮助科学家们更迅速地做出更好的决定 2013 年 3 月 28 日 美国化学文摘社 (CAS) 与 Springer 强强联手, 使 Springer 期刊里数以千计的实验步骤信息收录至 CAS 数据库中 该合作将使 165 本 Springer 化学期刊 ( 最早追溯至 1985 年 ) 里的具体实验步骤信息更具可视化和变得更易获取.. 我们非常高兴 Springer 期刊中的实验步骤信息可以更轻松地通过 SciFinder 为全球用户所获取 Springer 公司特殊授权部门权利与许可团队负责人 Berendina van Straalen 如是说, 科学家们现在可以更容易地找到相关的 Springer 文献帮助他们的实验室科研工作 71

72 反应结果的 Analyze 催化剂收率研究趋势 72

73 研究趋势的导出和分析 73

74 反应亚结构检索 槲皮素 6389 条反应结果 反应检索结果包含 : 红色部分为绘制面板中绘制进去的部分, 多出取代基, 或者参与成环 74

75 在 SciFinder 中, 鼠标滑过一个物质, 可以打开物质的标准菜单, 从而获得与物质相关的所有内容 75

76 Transformation 反应类型分类 Transformation 帮助我们分析研究人员通常通过什么方式合成该物质 76

77 方法学研究 官能团反应 伯醇氧化成醛, 仲醇不发生反应 77

78 方法学研究 官能团反应 78

79 作业 : 检索符合以下要求的反应 X Ph O 2 N H 2 N

80 提纲 SciFinder Web 介绍 SciFinder Web 中的内容 SciFinder Web 中的检索 SciFinder Web 中的文献检索 SciFinder Web 中的物质检索 SciFinder Web 中的反应检索 SciFinder Web 注册和常见问题 80

81 SciFinder Web 的注册和登陆 SciFinder Web 的系统要求 Windows 用户支持 IE 9.x 或者 FireFox 2.x 以上 Mac 用户支持 Firefox 和 Safari Java 安装 ( 初次使用结构时自动安装, 建议安装最新版 Java) 64 位系统 : 需同时安装 32 位和 64 位 Java 在图书馆相关页面上找到 SciFinder Web 注册用的网址 81

82 SciFinder Web 的注册和登陆 SciFinder Web 的系统要求 Windows 用户支持 IE 8.x 或者 FireFox 2.x 以上 Mac 用户支持 Firefox 和 Safari Java 安装 ( 初次使用结构时自动安装, 建议安装最新版 Java) 在图书馆相关页面上找到 SciFinder Web 注册用的网址 82

83 点击 URL 创建 SciFinder Web 账号 开始创建 SciFinder Web 帐号 创建 ID 所用的 IP 不能是代理服务器的 IP 或是 83

84 设置用户名及密码注意事项 用户名 : 必须是唯一的, 且包含 5-15 个字符 它可以只包含字母或字母组合 数字和 / 或以下特殊字符 : -( 破折号 ) _( 下划线 ). ( 句点 表示 at 的符号 ) 密码 : 必须包含 7-15 个字符, 并且至少包含三个以下字符 : 字母混合的大小写字母数字非字母数字的字符 ( # % & *) 密码设置小技巧 : 1: 不要和账号中有重复的字符 2: 密码格式最好是 abc@123 84

85 对新 ID 的 确认 40 分钟内查收邮件, 注意垃圾邮箱 48 小时内点击邮件中的确认链接 Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved.

86 SciFinder Web 登陆界面 输入 SciFinder 帐号和密码 86

87 SciFinder Web 常见问题 并发用户数已满, 请稍后再试 87

88 SciFinder Web 常见问题 账号或密码错误, 请在 username 处填写, 截图, 并与图书馆联系 88

89 SciFinder Web 常见问题 任何需要反馈给图书馆的问题, 都请点击测试 IP 地址的链接 将页面截图下来, 一并发给图书馆 89

90 ifinder Web 网络在线资源平台 资源下载 :PDF 文件 在线演示 :Flash 演示 网络培训 : 不定期的网络专题培训 90

91 SciFinder Web 使用注意事项 一人注册一个账号 禁止过量下载 严禁账号分享 严禁将账号用于非学术研究 91

92 Comprehensive Content Sophisticated Analysis Unprecedented Results 杨四娟 QQ 群 Thank You 92

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