SciFinder Web使用介绍俞靓 SciFinder培训专员

Size: px

Start display at page:

Download "SciFinder Web使用介绍俞靓 SciFinder培训专员"

紊妈左
5 years ago
Views:

1 SciFinder Web 使用介绍刘霞妹 SciFinder 培训专员

2 提纲 SciFinder Web 介绍 1.1 SciFinder Web 内容 1.2 SciFinder Web 新功能 SciFinder Web 中的范例检索 2.1 SciFinder 的文献检索 2.2 SciFinder 的结构编辑器 2.3 SciFinder 的反应检索 SciFinder Web 注册 Q&A 2

3 提纲 SciFinder Web 内容 3

4 美国化学文摘社 Chemical Abstract Service ACS 的分支机构, 创立于 1907 年致力于跟踪索引并提炼全球化学相关的科技文献信息最先创立了纸本化学文摘 Chemical Abstracts TM 总部位于俄亥俄州的哥伦布市 1300 名博士, 精通 50 多种语言关注索引上万种期刊和 63 家专利客户覆盖全球 1900 所高校 500 强公司以及所有主要的专利局 4

5 什么是 SciFinder 二次文献是对一次文献进行加工整理后所产生的文献, 如书目题录简介文摘等形式的检索工具书它是查找一次文献的线索 SciFinder 覆盖化学界 98% 的文献, 内容由 CAS 编者人工编目, 文献中的重要信息被提炼总结, 成为可检索和分析的条目 SciFinder 提供丰富的分析精选分类功能, 根据用户需要筛选众多信息, 迅速锁定兴趣点 5

6 SciFinder 科学索引过程原始出版物 CAS 科学家 CAS 编辑发行题目摘要改写题目摘要改写索引词的编写索引词的编写物质索引的编写物质索引的编写 (CAS.No., CAS (CAS.No., CAS Role) Role) 信息检索者或用户 6

7 SciFinder 的覆盖内容 CAS REGISTRY SM >8300 万有机无机物质 >6400 万生物序列 >4 亿条实验和预测数据物质报道文献, 回溯到 1802 年每天更新 References References from CAplus SM >3800 万期刊, 专利, 学位论文记录. >1 万种科技期刊的覆盖 63 家专利发行机构的专利 1997 年以来的 3.65 亿条引文记录回溯到 1800 年每天更新 References from MEDLINE > 1900 万条生命科学相关文献 > 5600 期刊回溯到 1946 年每天更新 Markush Structures >100 万专利中的 Markush 结构回溯到 1961 年每天更新 CHEMLIST 全球范围内的法规信息 >30.8 万的化合物 1980 至今的数据每周更新 SciFinder Reactions CASREACT CAS 提供的反应信息包含 : 反应中的结构信息反应中所有物质的 CAS No 详细的反应条件实验过程 >5760 万单步多不反应 >1350 万物质合成制备信息反应回溯到 1840 反应条件起始于 2003 每天更新 CHEMCATS CHEMCATS 提供物质的供应商信息 >7500 万商业信息 >2600 万不同种类物质 >880 个全球范围内的供应机构 >1,005 商品目录的覆盖每周更新 7

8 提纲 SciFinder Web 新功能 8

9 SciFinder 新功能 - 美国专利的 PDF 链接 PDF 链接美国专利 PDF 链接新功能可以方便直接地从 SciFinder 获取美国专利的全文, 而不需要通过访问美国专利局官网 9

10 SciFinder 新功能 -Non-Java 结构编辑器不需要安装 Java 插件即可编辑物质结构 10

11 SciFinder 重要概念 Index Term Index Term Index Term 是 CAS 的文献编辑人员, 阅读完原文后用标准的词汇描述的一些概念, 这种概念的统一, 有利于避免因语种, 表达方式, 教育背景的不同而导致的词语上的差异 11

12 SciFinder 重要概念 CAS Role CAS Role CAS Role 俗称物质角色, 是 CAS 文献编辑人员索引物质时, 根据物质的被研究方向, 而赋予物质的特定的代码, 通过 CAS Role 的分类, 可以很快的找到和物质某特定研究直接相关的文献 12

13 提纲 SciFinder Web 文献检索 13

14 灯盏花 : 菊科植物短葶飞蓬 Erigeron breviscapus (Van t.)hand- Mazz 的干燥全草别名 : 灯盏细辛东菊分布 : 我国西南地区, 尤以云南较多临床应用 : 心脑血管系统疾病糖尿病肾病等 14

15 SciFinder 中文献检索文献多种检索方式 : 主题词检索作者名检索公司名检索文献标示符检索杂志名检索专利检索输入灯盏花的拉丁学名 Erigeron breviscapus 15

16 SciFinder 中文献检索如何筛选出我们感兴趣的文献 : 化学成分? 药理研究? 栽培种植? SciFinder 数据库提供了强大而便捷的分析筛选工具 : 主题分析 (Analyze) 自定义 (Refine) 学科方向分类 (Categorize) 灯盏花相关的 728 文献设置即时提醒功能出现文献的标题和摘要的关键词都会被标示出来, 检索时对关键词进行同义词和简写等扩展 16

17 快速查找综述文献 -Refine 工具灯盏细辛注射液药理和毒理作用研究进展灯盏花黄酮类物质的研究进展灯盏花的最新研究 17

18 本研究对灯盏细辛的化学成分, 包括黄酮类咖啡酸酯芳香酸等及其在舒张血管改善微循环等方面的应用进行了综述通过阅读综述文献, 熟悉该植物的研究概况 CAS Role 18

19 SciFinder 中文献分析 (Analysis) 工具文献多种分析方式 : CAS 号 CA 学科分类文献发布机构关键词分析 CA 学科方向杂志名文献语言发表年限学科分类 : 药物学药理学药学分析植物化学关键词 : 灯盏花天然产物药物注射人类溶剂提取心脑血管药物胶囊 19

20 灯盏花的化学成分研究方面的文献 -Categorize 工具提取物 : 黄芩素灯盏花素绿酸素黄酮类咖啡酸分析化学提取溶剂 : 甲醇磷酸乙腈乙酸乙酯氯仿分析手段 : 溶剂萃取 HPLC 液相色谱萃取 TLC 药物分析溶解质谱 20

21 获得灯盏花制剂方面的研究文献 -Categorize 生物技术药物胶囊冻干粉颗粒一级学科二级学科研究对象 21

22 获得灯盏花胶囊方面的研究文献灯盏花软胶囊的质量标准研究灯盏花软胶囊的质量标准研究灯盏花软胶囊的预防心脑血管疾病的研究 22

23 灯盏花的种植栽培技术的研究植物组织培养生物技术农业 23

24 获得灯盏花组织培养方面的研究文献药用植物灯盏花的组织培养灯盏花叶柄的愈伤组织诱导和不定芽再生灯盏花苗无糖组织培养的微环境控制效果 24

25 物质属性归属 - 案例 1 从石蒜 (Lycoris radiata) 植物中分离鉴定物质 1 的结构如图所示, 物质名称为 oxovittatine 利用 SciFinder 来确定它的属性 25

26 研究主题检索, 输入该物质名称 26

27 获得该物质仅有的 2 篇文献 27

28 点击文章标题, 进一步查看文摘信息该文献是我对该物质属性归属完之后发表的文献, 排除在外 28

29 文献报道该物质由生物合成得到所以从石蒜中分离得到的这个物质是一个新天然产物 29

30 物质属性归属 - 案例 2 从石蒜 (Lycoris radiata) 植物中分离鉴定物质 2 的结构如图所示, 物质名称为 : 9-O-demethylhomolycorine N-oxide 利用 SciFinder 来确定它的属性 30

31 研究主题检索, 输入该物质名称 31

32 获得该物质仅有的 2 篇文献 32

33 点击文章标题, 进一步查看文摘信息该文献是我对该物质属性归属完之后发表的文献, 排除在外 33

34 通过阅读标题和摘要, 发现该物质从植物 Narcissus papyraceus Key-Gawler 中分离得到, 故鉴定该物质为首次从石蒜属植物中分离得到 34

35 物质属性归属 - 案例 3 从石蒜 (Lycoris radiata) 植物中分离鉴定该物质 3 的结构如图所示, 物质名称为 : incartine 利用 SciFinder 来确定它的属性 35

36 研究主题检索, 输入该物质名称 36

37 获得该物质的所有文献 37

38 通过查看文献标题, 发现该物质已经从石蒜属植物 (lycoris incarnata) 中分离得到, 但是没有从石蒜中分离得到的相关报道, 所以该物质是一个种首分 38

39 小结利用 SciFinder 查看物质的属性 : 新物质 - 精确结构检索无记录新天然产物 - 研究主题检索输入物质名称属首分 - 研究主题检索输入物质名称或物质名称 with 属名种首分 - 研究主题检索输入物质名称或物质名称 with 种名具体情况具体分析 39

40 提纲 SciFinder Web 结构编辑器 40

41 SciFinder 结构绘制工具铅笔元素周期表可变基团重复基团工具碳链工具选择工具环锁定工具旋转工具正电子橡皮常用基团 R 基团定义工具可变位置连接工具模版工具索套选择工具原子锁定工具镜面旋转工具 C 原子和单键恢复工具结构和反应切换功能结构检索选择单双键,RS 构型, 不确定键定义工具负电子常见环, 多元环工具 41

42 SciFinder 中的反应定义工具反应箭头反应角色定义工具反应原子标记工具反应位置标记工具反应官能团列表 42

43 元素周期表可变基团常用官能团 R 基团 43

44 可变位置连接工具重复基团定义工具环锁定工具 ( 保证环结构不成为别的环系的一部分 ) 原子锁定工具 ( 保证原子不发生别的取代 ) 可以检索到不能检索到 44

45 反应角色定义工具原子标记工具 ( 标记反应前后相对应的原子 ) 反应位置标记工具 ( 标记反应过程中形成或断裂的键 ) 代表任意的键, 可以是单键双键或者三键 45

46 练习 : 我想获得以下的一系列物质 CHO N CHO N CHO N CHO Cl NH Cl NH Cl N H Cl N H N N O Cl N CHO Cl N CHO Cl N H H H CHO Cl N H CHO 要求 :1 4~6 元的饱和或不饱和的碳环或杂环 2 该环不能发生并环 46

47 结构定义 R=C N O 1-3 任意键锁定环用亚结构检索获得所有的物质 47

48 亚结构检索结果 48

49 提纲 SciFinder Web 反应检索 49

50 反应中生成键的定义检索要求 : 环上的单键一定要被还原其他具体取代不限 50

51 将反应式画入, 进行亚结构检索 51

52 进行亚结构检索, 得到初步的反应结果集设置一篇文献出现一条反应, 方便对反应的筛选 52

53 使用 Refine 限定结构式, 使检索更加精确 1. 加上环锁定, 避免并环现象 ; 2. 使用原子标记工具, 增强精准性 3. 若要求双键两端碳原子不发生取代, 加上原子锁定 ; 53

54 限定之后的结果集, 来自于 7 篇文献 54

55 提纲 SciFinder Web 注册和常见问题 55

56 SciFinder Web 的注册和登陆 SciFinder Web 的系统要求 Windows 用户支持 IE 9.x 或者 FireFox 2.x Mac 用户支持 Firefox 和 Safari Java 安装 ( 初次使用结构时自动安装, 建议安装 Java 7) 在图书馆相关页面上找到 SciFinder Web 注册用的网址 56

57 注册

58 注册

59 注册

60 点击 URL 创建 SciFinder Web 账号用公共邮箱注册即可开始创建 SciFinder Web 帐号创建 ID 所用的 IP 不能是代理服务器的 IP 60

61 设置用户名及密码注意事项用户名 : 必须是唯一的, 且包含 5-15 个字符它可以只包含字母或字母组合数字和 / 或以下特殊字符 : -( 破折号 ) _( 下划线 ). ( 句点表示 at 的符号 ) 密码 : 必须包含 7-15 个字符, 并且至少包含三个以下字符 : 字母混合的大小写字母数字非字母数字的字符 ( # % & *) 密码设置小技巧 : 1: 不要和账号中有重复的字符 2: 密码格式最好是 abc@123 61

62 对新 ID 的确认需要点击邮件中的确认链接

63 SciFinder Web 常见问题并发用户数已满, 请稍后再试

64 SciFinder Web 常见问题账号或密码错误, 请在 username 处填写, 截图, 并与图书馆联系 64

65 SciFinder Web 常见问题任何需要反馈给图书馆的问题, 都请点击测试 IP 地址的链接将页面截图下来, 一并发给图书馆 65

66 SciFinder Web 网络在线资源平台资源下载 :PDF 文件在线演示 :Flash 演示网络培训 : 不定期的网络专题培训 SciFinder QQ 答疑群

67 Thank You 刘霞妹 SciFinder 培训专员 Tei: 答疑 QQ:

The Growing Importance of Patinformatics

The Growing Importance of Patinformatics SciFinder Web 源于化学, 超越化学的一站式检索平台 SciFinder Web 使用介绍李凤梅 SciFinder 培训专员 2013.11 提纲介绍 SciFinder Web 中的内容 SciFinder Web 中的检索和后处理 SciFinder Web 中的物质结果及相关文献处理 SciFinder Web 中的物质检索方法 SciFinder Web 中的主题检索 SciFinder

SciFinder Web使用介绍 俞靓 SciFinder培训专员

SciFinder Web使用介绍俞靓 SciFinder培训专员