PowerPoint Presentation

Size: px

Start display at page:

Download "PowerPoint Presentation"

珠盘经
4 years ago
Views:

1 TITLE OF PRESENTATION New Reaxys 使用介绍 Reaxys 解决方案咨询师吴鹏

2 TITLE OF PRESENTATION 2 提纲 Reaxys 中的内容和数据索引介绍 Reaxys 中的检索 Reaxys 的基本检索模式如何利用 Reaxys 结构面板实现复杂结构定义如何利用 Reaxys 进行物质检索和物质分析如何利用 Reaxys 进行反应检索和条件筛选如何利用 Reaxys 制作合成计划 Reaxys 检索小结

3 TITLE OF PRESENTATION 3 Elsevier 公司介绍 Elsevier 于 1880 年在荷兰成立, 成立之初致力于学术期刊杂志的发行和出版, 现已发展成为全球最大的科技文献出版社 Elsevier 是一家全球性公司, 总部在荷兰阿姆斯特丹, 在世界 25 多个国家雇有 7000 多名员工, 是励德爱思唯尔集团 (Reed Elsevier) 的成员

4 TITLE OF PRESENTATION 4 什么是 Reaxys? >105 M 物质记录 >500 M 实验数据物理的, 化学的, 光谱数据, 生态学, 生物活性数据 >42 M 反应记录以及这些反应的条件, 溶剂, 催化剂, 收率, 反应中心, 反应类型 Linked to >54 M 文献记录 >16,000 期刊, 专利涉及有机化学, 材料化学, 生物医药, 地球科学, 工程等多种领域 Chemistry fundamentals Uses across disciplines

5 TITLE OF PRESENTATION 5 Reaxys 收录的文献范围和涉及学科分类 Reaxys 总共收录 16,098 种期刊涵盖与化学相关 16 个学科领域农业及生命科学生物化学, 分子生物学化学工程 Chemical Engineering 化学 Chemistry 牙科学 Dentistry 宇宙科学 Earth and Planetary Science 能源 Energy 工程 Engineering 环境 Environmental Science 免疫学及微生物学 Immunology and Microbiology 材料科学 Materials Science 药学 Medicine 神经系统科学 Neuroscience 药理学毒理学 Pharmacology, Toxicology and Pharmaceutics 物理学和天文学 Physics and Astronomy 其中包括化学最核心期刊 426 种 ( 其中收录 ACS 旗下化学最核心期刊 31 种 ) 化学相关专利 (76 年以来的世界, 美国, 欧洲 ),2010 年以来的所有日本, 韩国以及 2015 年以后所有的中国, 中国台湾对于较早文献的收录比较好, 最早的一篇文章可以追溯到 1771 年兽医学 Veterinary 5

6 查看具体的生物数据 TITLE OF PRESENTATION 7

7 TITLE OF PRESENTATION 8 文献中的生物活性数据形式文献通过图表的形式表达一些列结构构在 EGFR,erbB2 以及不同的 5 种细胞系上的 IC50 构效关系专利中表达实施例化合物, 与多个靶点的 IC50 构效关系

8 TITLE OF PRESENTATION 9 Reaxys 中的生物活性数据呈现形式可转换成结构式且可导出 smile 式

9 TITLE OF PRESENTATION 10 提纲 Reaxys 中的内容和数据索引介绍 Reaxys 中的检索 Reaxys 的基本检索模式如何利用 Reaxys 结构面板实现复杂结构定义如何利用 Reaxys 进行物质检索和物质分析如何利用 Reaxys 进行反应检索和条件筛选如何利用 Reaxys 制作合成计划 Reaxys 检索小结

10 TITLE OF PRESENTATION 11 Reaxys 索引的内容文献内容 Reaxys 提炼了文献的书目信息, 摘要, 题录, 并用不同角度的索引词对文献内容进行描述 bibliographic Manual [digital] Indexing

11 TITLE OF PRESENTATION 12 Reaxys 索引的内容结构与反应 Reaxys 的反应记录, 抽提了所有相关的数据, 包括收率, 催化剂, 溶剂, 反应类型等

12 TITLE OF PRESENTATION 13 Reaxys 索引的内容文献中的数据 Reaxys 的物性记录, 抽提了超过 500 中不同的物性实验数据, 生物活性数据, 环境数据, 以及谱图数据等等

13 TITLE OF PRESENTATION 14 Reaxys 旨在弹指之间传递关键信息全文或者第三方数据库的有用数据过滤, 去重, 重塑对应 Reaxys 的数据结构直观数据分析统计重在索引文献中的有用信息

14 TITLE OF PRESENTATION 15 提纲 Reaxys 中的内容和数据索引介绍 Reaxys 中的检索 Reaxys 的基本检索模式如何利用 Reaxys 结构面板实现复杂结构定义如何利用 Reaxys 进行物质检索和物质分析如何利用 Reaxys 进行反应检索和条件筛选如何利用 Reaxys 制作合成计划 Reaxys 检索小结

15 TITLE OF PRESENTATION 16 New Reaxys 的界面 Quick Search Query Builder

16 TITLE OF PRESENTATION 17 Reaxys 的检索方式 Quick Search Quick Search 中可以使用的方式 : 1. 物质名称, Gefitinib 2. 反应名称, Wittig Reaction 3. 物质理化性质, Solubility of Gefitinib 4. 物质的谱图, NMR of Gefitinib 5. 分子式, C22H24ClFN4O3 6. 反应类型, Substitution 7. 关键词, nano fiber 8. 反应结构, 物质结构

17 TITLE OF PRESENTATION 18 Reaxys 的检索方式 Query Builder Query Builder 模块下,Fields 中可以选择不同类型的字段进行自由组合检索

18 TITLE OF PRESENTATION 19 Reaxys 中的字段检索 Tips: Reaxys 提供 8 种不同的分类, 每种分类中拥有和这种分类相关的多种字段, 可以依据这些字段自由组合进行检索

19 TITLE OF PRESENTATION 20 Reaxys 检索方式 Query Builder Forms Query Builder 模块下,Forms 中 Reaxys 的预设模块检索

20 TITLE OF PRESENTATION 21 Reaxys Form 中的预设模块反应结构反应收率反应溶剂试剂催化剂反应时间反应温度反应压力反应类型

21 TITLE OF PRESENTATION 22 提纲 Reaxys 中的内容和数据索引介绍 Reaxys 中的检索 Reaxys 的基本检索模式如何利用 Reaxys 结构面板实现复杂结构定义如何利用 Reaxys 进行物质检索和物质分析如何利用 Reaxys 进行反应检索和条件筛选如何利用 Reaxys 制作合成计划 Reaxys 检索小结

22 TITLE OF PRESENTATION 23 Reaxys 中 Marvin JS 结构编辑器使用选择工具, 橡皮, 健定义, 链, 正负电子元素周期表以及常用原子重复基团, R 基团,R 基团链接端, 反应定义工具 A: 原子属性定义工具常见的环, 官能团,Reaxys 的 Generic Group 定义 Ctl+Alt+C= 复制,Ctrl+V= 黏贴

23 TITLE OF PRESENTATION 24 结构定义案例 1 Not List 的应用案例 : 定义某位点上不能发生 F, Cl, Br, I 取代

24 TITLE OF PRESENTATION 25 自定义 R 基团案例定义一个结构 A R1 分别是下面的这些结构, 结构中绿色原子与 A 结构相连接 A

25 TITLE OF PRESENTATION 26 绘制方法定义步骤 : 使用 R 基团末端定义工具定义绿色原子使用 R 基团定义工具, 选择全部片段, 即可完成 R1 的定义

26 TITLE OF PRESENTATION 27 提纲 Reaxys 中的内容和数据索引介绍 Reaxys 中的检索 Reaxys 的基本检索模式如何利用 Reaxys 结构面板实现复杂结构定义如何利用 Reaxys 进行物质检索和物质分析如何利用 Reaxys 进行反应检索和条件筛选如何利用 Reaxys 制作合成计划 Reaxys 检索小结

27 TITLE OF PRESENTATION 28 Case Study 1 结构检索物质 Reaxys 可以直接通过物质名称直接导入结构

28 New Reaxys 给出的结果 TITLE OF PRESENTATION 29

29 TITLE OF PRESENTATION 30 New Reaxys 中的结果集 Tips: 1. 每一个结构结果中, 存在的理化性质数据可以直接打开, 且可以直接看到对应文献的出处, 2. 物质对应的文献, 可以进行进一步的分析, 筛选

30 New Reaxys 中的物质理化性质 TITLE OF PRESENTATION 31

31 TITLE OF PRESENTATION 32 New Reaxys 中的谱图 Tips: Reaxys 直接摘录原文中的 NMR 谱图描述, 并提供原文中的位置

32 TITLE OF PRESENTATION 33 Reaxys 中的分析文献的获取 Tips: 获得文献后, 可以通过 Reaxys 的文献过滤工具对文献进行后处理

33 TITLE OF PRESENTATION 34 Index Term Reaxys Tree 的应用 Reaxys 通过 Index Term Reaxys Tree 的方式, 将文献进行精确分类, 帮助大家快速定位所需分析文献物理化学分析方法

34 TITLE OF PRESENTATION 35 物理化学分析方法中的细节性分类谱图分析方法分离方法热力学分析晶型结构鉴定

35 TITLE OF PRESENTATION 36 Case Study 2 快速获得物质的理化性质检索吉非替尼的溶解性数据直接用自然语言在输入,solubility of gefitinib, 检索

36 组合检索 TITLE OF PRESENTATION 37

37 Reaxys 直接给出结果 TITLE OF PRESENTATION 38

38 TITLE OF PRESENTATION 39 最后的结果 Hit Data 直接给出具体的实验数据, 以及检测条件和全文链接

39 TITLE OF PRESENTATION 40 Case Study 3 母核结构检索检索包含以下母核的结构

40 As Substructure 检索结果 TITLE OF PRESENTATION 41

41 TITLE OF PRESENTATION 42 Reaxys 中的筛选过程结构的筛选工具,Substance Class 帮助了解结构中的特殊片段

42 TITLE OF PRESENTATION 43 Reaxys 中的结构分析环系分类不同的 5 元环系

43 TITLE OF PRESENTATION 44 提纲 Reaxys 中的内容和数据索引介绍 Reaxys 中的检索 Reaxys 的基本检索模式如何利用 Reaxys 结构面板实现复杂结构定义如何利用 Reaxys 进行物质检索和物质分析如何利用 Reaxys 进行反应检索和条件筛选如何利用 Reaxys 制作合成计划 Reaxys 检索小结

44 TITLE OF PRESENTATION 45 Case Study 4 关键词检索反应 Synthesis of 3-hydroxy-indole Reaxys 中的智能解析直接将短语转换成反应式

45 TITLE OF PRESENTATION 46 Reaxys 中的结果相同反应的所有报道的反应条件收集在一起, 便于查看和筛选

46 TITLE OF PRESENTATION 47 Case Study 5 基本反应结构检索检索以下的反应吡啶环 2,3,4 位上存在一个硝基还原成氨基吡啶环 6 位上存在一个 Cl 检索 Tips: 在 Quick Search 界面启动 Marvin JS 结构编辑器, 进行结构编辑

47 TITLE OF PRESENTATION 48 结构的定义结构绘制步骤 : 1: 用套索选择工具选择吡啶上的 3 个 C 原子 2: 用链工具中的不定位取代健将吡啶和 NO2,NH2 相接

48 TITLE OF PRESENTATION 49 检索功能的选择和检索检索 Tips: 1:As Drawn, 和所画结构完全一致的反应 2:Substructure, 亚结构反应检索, 会展开所有 H, 可以设定所有原子开放还是杂原子开放

49 TITLE OF PRESENTATION 50 最终的结果 Tips: 检索到结果后, 可以通过旁边的工具进行筛选

50 TITLE OF PRESENTATION 51 Case Study 5 特定位点反应条件检索及其条件筛选参与反应的分子结构太复杂参与反应的分子结构太新颖需要选择性反应条件, 如, 选择性还原, 氧化, 脱保护基等

51 TITLE OF PRESENTATION 52 干扰反应产生 Substructure, 亚结构反应检索, 会随机开放隐藏 H 的取代, 可以设定所有原子开放还是杂原子开放

52 检索结果 TITLE OF PRESENTATION 53

53 TITLE OF PRESENTATION 54 反应条件限定检索包含以下结构的反应, 并对条件进行筛选亚结构开放 H 取代关闭允许环取代减少稠环化合物原子映射标定反应前后相同原子位置 S* 用于锁定 H, 使其不发生取代

54 TITLE OF PRESENTATION 55 Reaxys 中的结果同一条反应的不同条件, 点开进行对比

55 TITLE OF PRESENTATION 56 通过碎片结构筛选 pyrimidine Tip: 通过结构筛选时 : 1. 画好结构 2. 检索逻辑选择亚结构

56 筛选结果 TITLE OF PRESENTATION 57

57 TITLE OF PRESENTATION 58 更多的筛选条件 Reaxys 提供多种反应条件过滤工具

58 TITLE OF PRESENTATION 59 类别条件筛选溶剂类别, 催化剂类别可以通过一些溶剂的类型进行筛选, 高沸, 中沸, 低沸的溶剂, 质子溶剂等等

59 TITLE OF PRESENTATION 60 Reaxys 中独有的催化剂类别筛选工具催化剂分类工具活性中心非均相催化生物催化葡萄糖脱氢酶碱性磷酸酶

60 TITLE OF PRESENTATION 61 活性中心分类不同的活性中心硼氢化钠硼氢化氰钠

61 TITLE OF PRESENTATION 62 选择性条件检索 Tip: Rx 支持多种碎片画入检索, 并可以把碎片融合到一个分子当中

62 检索结果 TITLE OF PRESENTATION 63

63 TITLE OF PRESENTATION 64 Case Study 6 反应组合检索, 关键词联合反应检索检索涉及以下反应机理的文献通过 Query Builder 创建组合检索式

64 TITLE OF PRESENTATION 65 反应结构的添加 Tips: S* 的定义原子的匹配

65 TITLE OF PRESENTATION 66 添加关键词后的检索式检索文献添加机理单词

66 TITLE OF PRESENTATION 67 最后的结果检索到的文献

67 TITLE OF PRESENTATION 68 文献中更多的内容利用反应中心对文献进行筛选 Reaction Classes 可以利用反应中心的类型进行筛选 Reaxys 抽提出文献中所有的反应类型, 帮助做进一步的筛选

68 TITLE OF PRESENTATION 69 更加细节性内容 C=C 还原酮到醇 Reduction 下的反应类型醛到醇涉及到 C=C 双键还原的不同反应类型

69 TITLE OF PRESENTATION 70 提纲 Reaxys 中的内容和数据索引介绍 Reaxys 中的检索 Reaxys 的基本检索模式如何利用 Reaxys 结构面板实现复杂结构定义如何利用 Reaxys 进行物质检索和物质分析如何利用 Reaxys 进行反应检索和条件筛选如何利用 Reaxys 制作合成计划 Reaxys 检索小结

70 TITLE OF PRESENTATION 71 Case Study 7 如何利用 Reaxys 制作合成计划给吉非替尼制定合成计划 Step1: 检索到吉非替尼 Step2: 导入合成计划 Tips: 1: 通过前述的操作找到物质 2: 鼠标悬停在结构上, 看到 Synthesize 3: 点击, 打开 Synthesis Plan, 这里选择手动

71 TITLE OF PRESENTATION 72 Synthesis Plan 添加感兴趣的反应可以添加多条反应在一个 Plan 中, 用于比较

72 TITLE OF PRESENTATION 73 添加好的结果界面 Tips: 1: 通过添加多条反应, 可以用来评估反应信息 2: 点击虚线的地方, 可以查看条件, 或者隐藏, 移除反应

73 TITLE OF PRESENTATION 74 继续的扩充反应路线 Tips: 在 Synthesis Plan 上可以对任意一个物质进行同样的 Synthesis 的操作, 可以将更多的反应添加进来

74 TITLE OF PRESENTATION 75 最后的结果可以对 Synthesis Plan 进行导入, 导出或者保存等操作

75 TITLE OF PRESENTATION 76 提纲 Reaxys 中的内容和数据索引介绍 Reaxys 中的检索 Reaxys 的基本检索模式如何利用 Reaxys 结构面板实现复杂结构定义如何利用 Reaxys 进行物质检索和物质分析如何利用 Reaxys 进行反应检索和条件筛选如何利用 Reaxys 制作合成计划 Reaxys 检索小结

76 TITLE OF PRESENTATION 77 Reaxys 中的检索小结 Reaxys 中的物质检索方法 Quick Search 物质名称 Quick Search 结构检索 Query Builder 组合检索 Quick Search 理化性质 + 物质名称 / 结构 Reaxys 中反应检索方法 Quick Search 关键词 Quick Search 结构式检索 Query Builder 组合检索

77 TITLE OF PRESENTATION 78 Reaxys 检索小结 New Reaxys 从大量文献中摘取和物质性质相关的所有数据, 帮助科研人员获得标准化, 规范化, 格式化的物性数据列表及参考文献 New Reaxys 中的 Query Builder 检索帮助科研人员通过简便的方式, 获得精准, 跨学科的精确答案 New Reaxys 中的结构面板, 能实现科研人员绝大部分的结构绘制要求, 帮助科研人员用最直接的方式获得相应的物质和反应

PowerPoint Presentation

PowerPoint Presentation TITLE OF PRESENTATION New Reaxys 使用介绍 Introduction to new Reaxys Value Tree Ver_2 Presented By Markus Bussen Date TITLE OF PRESENTATION 2 提纲 New Reaxys 介绍 New Reaxys 中包含内容 New Reaxys 中的新增内容和检索功能 New Reaxys