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峥炫邱
5 years ago
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1 SciFinder Web 新平台, 新内容, 新功能天津工业大学 SciFinder Web 使用介绍唐蜜 SciFinder 培训专员

2 提纲介绍 SciFinder Web 中的内容 SciFinder Web 特色功能 SciFinder Web 的注册和登陆 SciFinder Web 中的检索和后处理 SciFinder Web 中的文献检索 SciFinder Web 中的物质检索 SciFinder Web 中的反应检索 SciFinder Web 使用常见问题和网络资源 2

3 美国化学文摘社 Chemical Abstract Service 创建于 1907 年 ACS 的分支机构密切关注索引和提炼全球化学相关的文献和专利最早创立了化学文摘总部坐落于俄亥俄州的哥伦布市 3

4 SciFinder Web 中的内容期刊专利论文会议报告 Chemcats CAPlus Medline Chemlist 溶剂, 催化剂, 产率, 反应实验过程等 Registry CASReact 物质基因合成信息 4

5 SciFinder Web 中的内容 CAS REGISTRY SM >6400 万有机无机物质 >6300 生物序列每天更新约新物质物质报道文献, 回溯到 1802 年物质信息包含了大量的实验数据, 预测数据, 以及物质标签和谱图 CASREACT >3870 万单步和多步反应 >1400 万物质合成制备信息源自专利和期刊文献每首更新 3-5 万条单步多步反应反应回溯到 1840 年 CAS Databases CAplus SM >3500 万专利和期刊信息 >10000 种期刊的覆盖 62 个专利发行机构每天更新 3000 条记录文献回溯到 19 世纪初引文信息回溯到 1997 年之前, 超过 3 亿条引文信息 CHEMCATS >6100 万条商业购买信息 >1,098 供应商 >1,222 化学产品目录 5

6 提纲介绍 SciFinder Web 中的内容 SciFinder Web 特色功能 SciFinder Web 的注册和登陆 SciFinder Web 中的检索和后处理 SciFinder Web 中的文献检索 SciFinder Web 中的物质检索 SciFinder Web 中的反应检索 SciFinder Web 使用常见问题和网络资源 6

7 SciFinder Web 特色功能 KMP 定题查询设定提醒, 一旦有新的记录, 会发邮件通知设置提醒文件名和失效时间 7

8 SciFinder Web 特色功能根据引文排序依据被引次数排序 8

9 SciFinder Web 特色功能 Markush 检索直接检索和结构有关的专利, 用于做初步的专利评估 9 9

10 SciFinder Web 特色功能物质的靶标和生物活性在物质详细信息栏, 可以查询到物质的生物活性信息和靶标信息 10

11 SciFinder Web 特色功能反应过程的获取 SciFinder 中的部分源自期刊和专利中的反应, 提供了反应过程信息, 使得科研工作者不需要阅读原文, 就可以获得对应的反应历程 11

12 SciFinder Web 特色功能 SciPlanner 12

13 提纲介绍 SciFinder Web 中的内容 SciFinder Web 特色功能 SciFinder Web 的注册和登陆 SciFinder Web 中的检索和后处理 SciFinder Web 中的文献检索 SciFinder Web 中的物质检索 SciFinder Web 中的反应检索 SciFinder Web 使用常见问题和网络资源 13

14 SciFinder Web 的注册和登陆 SciFinder Web 的系统要求 : Windows 用户支持 IE 7.x 或者 FireFox 2.x Mac 用户支持 Firefox 和 Safari Java 安装 ( 初次使用绘图面板时自动提示安装, 在图书馆相关页面上找到 SciFinder Web 注册用的网址 14

15 点击 URL 创建 SciFinder Web 账号开始创建 SciFinder Web 帐号创建 ID 所用的 IP 不能是代理服务器的 IP 现在可以使用 163, Gmail 等公共邮箱注册 SciFinder Web 15

16 设置用户名及密码注意事项用户名 : 必须是唯一的, 且包含 5-15 个字符它可以只包含字母或字母组合数字和 / 或以下特殊字符 : -( 破折号 ) _(( 下划线 ). ( 句点表示 at 的符号 ) 密码 : 必须包含 7-15 个字符, 并且至少包含三个以下字符 : 字母混合的大小写字母数字非字母数字的字符 ( # % & *) 密码设置小技巧 : 1: 不要和账号中有重复的字符 2: 密码格式最好是 abc@123 16

17 对新 ID 的确认需要点击邮件中的确认链接

18 SciFinder Web 登陆界面输入 SciFinder 帐号和密码 18

19 SciFinder Web 登陆后主界面文献, 物质, 反应检索入口, 默认开始检索文献检索完, 请点击退出可用的检索方法保存过的结果集邮件提醒结果集 19

20 提纲介绍 SciFinder Web 中的内容 SciFinder Web 特色功能 SciFinder Web 的注册和登陆 SciFinder Web 中的检索和后处理 SciFinder Web 中的文献检索 SciFinder Web 中的物质检索 SciFinder Web 中的反应检索 SciFinder Web 使用常见问题和网络资源 20

21 在 SciFinder 中检索光催化污水处理的相关文献输入关键词 photocatalysis with waste water 文献检索途径限制条件 Note: 多个关键词之间用介词 of, with, beyond 连接! 21

22 SciFinder 的候选项, 能让我们自由地做宽松或紧凑的选择 Concept 表示做了同义词的扩展 Closely associated with one another 表示同时出现在一个句子中 22

23 获取文献结果集按照引用次数排序, 将被引用次数较多的排在前面 23

24 对文献结果集的后处理操作 Analyze/Refine Analyze: 作者姓名学科名称所属数据库索引词期刊名称出版年代物质机构名称文献类型 CA 概念标题出版语言附加词 Refine: 主题词作者姓名机构名称出版年代语言所属数据库

25 对 Publication Year 进行分析, 帮助了解该领域的研究趋势 1200 研究趋势可将年份对应的文献数量 export 至 excel 表格, 做出趋势图 25

26 也可以直接限定 Publication Year, 获取 2011 年至今的文献记录导航条, 可点击返回之前任意一步的操作可以继续对 Company-Organization 进行分析, 寻找科研交流等 26

27 对文献结果集的后处理操作 Categorize 学科领域具体分类索引词 Categorize 系统分类工具, 对研究主题进行具体的分类, 帮助获得更加细节的内容 27

28 获得涉及 TOC 污染报导的文献 28

29 点击文章标题, 获取 SciFinder 对于文章的摘要记录 Original Title: 人工编目的摘要专利族信息 Original Abstract: 29

30 抽提了文献中出现的重要概念和物质, 形成概念索引和物质索引文献中出现的重要的概念, 帮助您对文献内容进行迅速把握点击每个概念, 还可以获得在 CAplus 中的记录 30 文献中涉及的重要物质, 给出了 CAS 号物质描述 CAS Role

31 Keep Me Posted 即时提醒功能设置有效期设置提醒频率

32 命中的文献会在 SciFinder 账户或者注册的中提醒 32

33 结果的保存和输出 Save: 保存到服务器上, 再次登录 SciFinder 的时候可以打开查看 ; 单次可保存 1 万条以下的记录, 最多可存储 100 条文件 ; Print: 保存成 PDF 文件, 可少量保存, 避免过量下载 ; Export: 导出成 RTF 或 PDF 格式 ; 单次可保存 50 条以下的记录, 避免过量下载 ; 导出成 AKX 格式文件, 可用 SciFinder 导入打开, 单次可保存 1 万条以下的记录

34 文献检索小结主题检索时, 使用介词作为连接尽量选择包含 Concept 和 Closed Associated with 的候选项通过 SciFinder 的 Analyze/Refine 功能来缩小检索的范围尝试将不同的 Analyze/Refine 功能组合起来用, 会有更多的收益使用 Categorize 可以让系统来实现自动分类更多细节化内容, 请参考 34

35 提纲介绍 SciFinder Web 中的内容 SciFinder Web 特色功能 SciFinder Web 的注册和登陆 SciFinder Web 中的检索和后处理 SciFinder Web 中的文献检索 SciFinder Web 中的物质检索 SciFinder Web 中的反应检索 SciFinder Web 使用常见问题和网络资源 35

36 物质检索界面检索途径 Note: 初次使用绘图面板时需安装 JAVA 插件

37 物质检索途径结构式检索 Markush 检索分子式检索物质标识 Chemical Structure Markush Molecular Formula Substance Identifier

38 SciFinder 结构绘制工具铅笔元素周期表可变基团重复基团工具碳链工具选择工具环锁定工具旋转工具正电子橡皮常用基团 R 基团定义工具可变位置连接工具模版工具索套选择工具原子锁定工具镜面旋转工具 C 原子和单键恢复工具结构和反应切换功能结构检索选择单双键,RS 构型, 不确定键定义工具负电子常见环, 多元环工具

39 SciFinder 中的反应定义工具反应箭头反应角色定义工具反应原子标记工具反应位置标记工具反应官能团列表 39

40 元素周期表可变基团常用官能团 R 基团 40

41 可变位置连接工具重复基团定义工具环锁定工具 ( 保证环结构不成为别的环系的一部分 ) 原子锁定工具 ( 保证原子不发生别的取代 ) 可以检索到不能检索到 41

42 反应角色定义工具原子标记工具 ( 标记反应前后相对应的原子 ) 反应位置标记工具 ( 标记反应过程中形成或断裂的键 ) 代表任意的键, 可以是单键双键或者三键 42

43 结构式检索有三种类型精确结构检索 : 获得物质的盐, 聚合物, 混合物, 配合物等, 母体结构不能修改, 不能修饰亚结构检索 : 所画的结构必须存在, 母体结构不能修改, 但可以被修饰相似结构检索 : 获得相似度在 60 分以上的结构, 母体结构可以修改, 也可以被修饰, 用相似度来控制获得的结果 43

44 亚结构检索失水山梨醇酯的衍生物失水山梨醇酯类化合物 ( 失水山梨醇脂肪酸酯又称司盘 ), 非离子表面活性剂, 常用作药物制剂辅料乳化剂抗静电剂等, 在医药和化工领域有着极广的应用常见的种类有失水山梨醇月桂酸酯失水山梨醇硬脂酸酯等 A 代表除 H 之外的任意原子将失水山梨醇酯的结构绘入画图面板, 并放开可取代位点, 进行亚结构检索 44

45 物质检索界面 45

46 亚结构检索结果碳链成为别的环系的一部分, 不是我们需要的结果 46

47 物质结果集的 Analyze/ Refine 功能 Refine 功能 : 物质结构式是否包含同位素是否包含金属元素是否有商业品来源信息是否有性质物性参数是否有相关文献原子取代基 Analysis 功能 : 是否有商业品来源物质所有的元素是否有反应信息物质的职能符 (CAS Role) 生物活性靶标 47

48 用 Refine 对结构式进行进一步限定环锁定工具锁定环系或者碳链, 保证环系不会成为别的环系的一部分, 保证碳链不会成环 48

49 限定之后的结果集在失水山梨醇环上都出现了取代, 也不是我们需要的结果 49

50 继续用 Refine 对结构式进行进一步限定使用原子锁定工具锁定之后的原子, 不会发生任何的取代 50

51 再次限定之后的结果集 51

52 对 Substance Role 分析, 选择涉及用途报导的物质 52

53 输入结构片段也可以进行结构式检索有机无机杂化 : 带双键的硅烷偶联剂 MPS 与丙烯酸脂类单体 EHA 的共聚物 MPS: ( 甲基丙烯酰氧基丙基三甲氧基硅烷 ) EHA: ( 丙烯酸异辛酯 ) 将单体的结构绘入画图面板, 进行精确结构结构检索 53

54 物质检索界面 54

55 物质检索结果 55

56 获取其中一个单体的更多信息可以查看物质详细信息该单体参与的反应合成方法商业来源信息管制信息文献等, 也可以再次在 SciFinder 中进行结构反应或 Markush 检索 56

57 合成该单体的反应 57

58 物质检索途径结构式检索 Markush 检索分子式检索物质标识 Chemical Structure Markush Molecular Formula Substance Identifier

59 分子式书写规则同一组分中的元素, 必须有明确的分割符号, 可以用数字和空格来分割对于不含 C 的物质, 按照字母顺序书写对于含 C 物质,CH 写在前面, 其他按照字母顺序对于多组分物质, 用. 将不同的组分分开, 组分排列顺序按照 C 数的降序排列,C 数相同时, 按照 H 数降序排列,H 数在一样, 按照第三个元素的字母顺序排列, 依次类推区分大小写 59

60 聚合物分子式检索如果不知道物质名称, 首选为分子式检索, 再用结构式限定脚标 n 和 x 检索到的物质结果不同! 括号外用 n 表示重复单元结构确定,x 表示重复单元结构不确定如(C10H8O4)n 和 (C10H8O4)x 先写聚合的部分, 用括号括住加 n; 头尾部分元素数目加在一起写在后面, 先写碳氢和氧的数目, 其他元素按照英文字母的排列顺序依次写上如 (C2H4O)nC12H26O 如果为多种单体聚合而成分别写出单体的分子式用间隔开如果为多种单体聚合而成, 分别写出单体的分子式, 用. 间隔开, 加上括号, 外面加 x 单体顺序按照 C 的数目的多少排列, 如果碳的数目相同,H 数量大的排在前面如 (C8H8. C4H6. C3H3N)x

61 在 SciFinder 中检索 SAM 树脂的相关信息由苯乙烯 (S) 丙烯腈(AN) 和马来酸酐 (MA) 三种单体共聚而成的三元共聚物 (SAM) 是一种耐热透明相容性好的热塑性树脂具有良好的加工流动性, 适合于注射成型具有高透光性较佳的抗环境致裂性能, 适合用作光学透镜的材料 (C8H8.C4H2O3.C3H3N)x 61

62 物质检索结果可以按分子量升序或降序排列 62

63 物质检索途径结构式检索 Markush 检索分子式检索物质标识 Chemical Structure Markush Molecular Formula Substance Identifier

64 通过物质英文名称检索脱硫剂 MDEA 的信息输入物质的英文名称物质详细信息物质所涉及的文献物质所涉及的反应物质的商业来源信息物质的管制信息 64 谱图实验性质

65 物质详细信息物质 CAS 号分子式化学名别名结构式已删除的 CAS 号以物质 CAS Role 分类的专利及非专利文献 65

66 物质的理化性质谱图等信息物质的计算性质物质的实验性质每个数据的后面都对应标出了出处文献的来源, 方便查找 66

67 Get References 由物质得到文献 67

68 Get Reactions 由物质得到反应 68

69 物质检索小结物质的检索途径包括 : 结构式 Markush 分子式名称 CAS No. 结构检索分为精确结构亚结构和相似结构检索三种检索物质, 能得到物质的基本信息物化性质谱图等物质检索还是非常好的获取文献和反应的途径 Markush 检索可以帮助获取通式结构的专利保护信息更多细节化内容, 请参考 69

70 提纲介绍 SciFinder Web 中的内容 SciFinder Web 特色功能 SciFinder Web 的注册和登陆 SciFinder Web 中的检索和后处理 SciFinder Web 中的文献检索 SciFinder Web 中的物质检索 SciFinder Web 中的反应检索 SciFinder Web 使用常见问题和网络资源 70

71 反应检索界面 71

72 将反应式画入绘图面板, 进行精确结构检索 Allow variability only as specified: 仅在特定位点发生变化 Substructure: 亚结构检索, 允许有更多取代情况 72

73 精确结构检索结果可按反应相关度进行排序 73

74 对于单步反应, 可获取相似反应 Similar Reactions 可根据自己的需求或提示数量选择不同的相似级别 74

75 相似反应检索结果按照相似度排序 75

76 反应结果集的 Analyze/ Refine 功能 Analyze: 作者姓名出版语言溶剂出版年代机构名称反应步数文献类型产率期刊名称催化剂实验步骤 Refine: 反应式产率反应步数反应类型排除的反应类型不参与反应的基团

77 用 Analyze 分析反应的溶剂得到 DMF 做溶剂的反应结果集新增了实验步骤描述 77

78 用 Refine 限定反应的收率得到收率在 90% 以上的反应结果集链接至出处文献 78

79 设置让一篇文献出现一条反应反应结果集的显示方式这 109 条反应来源于 48 篇文献, 每篇文献命中的反应条数都显示在上方 79

80 获取附加反应信息 Find Additional Reactions 80

81 附加反应信息检索结果会合并入现有反应结果集, 并出现在最后对于这些反应, 在文献中只有文字描述而没有反应式 81

82 SciPlanner 辅助进行逆合成路线设计什么是 SciPlanner? 1. SciPlanner 是一个特定的工作区域, 可以让用户用一种更加直接的方式去组织管理检索结果 2. 文献物质反应信息都可以传送到 SciPlanner, 并在其中进行自由组织, 增强可视化效果 3. SciPlanner 可以辅助进行逆合成路线的制定 82

83 SciPlanner 面板编辑面板检索结果 1. Ctrl+ 点击拖动即可将检索结果复制到编辑面板中 ; 直接拖动可将检索结果移动到编辑面板中 2. 将鼠标放到结构式上方, 点击右上方箭头, 选择 Synthesize this, 即可返回检索页面, 得到合成路线 83

84 例 : 对下面的物质进行合成, 并制定出合成路线首先在 SciFinder 中进行物质精确检索, 链接到它的合成反应 ; 或直接进行反应检索 ; 再利用 SciPlanner 进行逆合成分析及反应路线设计 84

85 在反应结果集中选中感兴趣的目标反应中, 并发送至 SciPlanner 点击这里返回 SciPlanner 85

86 返回 SciPlanner 面板 1. Ctrl+ 点击拖动即可将检索结果复制到编辑面板中 ; 直接拖动可将检索结果移动到编辑面板中 2. 将鼠标放到结构式上方, 点击右上方箭头, 选择 Synthesize this, 即可返回检索页面, 得到合成路线将反应复制到编辑面板上 86

87 同样获取中间体的合成路线同样, 选中自己感兴趣的反应, 并点击 Send to SciPlanner 87

88 返回 SciPlanner 面板两次链接得到的产物和中间体的反应路线对这两条路线进行组合整理将相同的物质拖动到一起进行重叠 88

89 将中间体进行重叠, 形成一条完整的合成路线直接拖动使相同的结构式重叠 89

90 获取这条路线涉及到的文献信息用鼠标选中需要获取文献的路线, 点击 GoTo, 选择 Selected References 90

91 链接到文献信息, 全部选中, 并点击 Send to SciPlanner 点击这里返回 SciPlanner 91

92 文献信息也显示在右侧的检索结果中 92

93 可以把文献结果也拖动至编辑面板中 93

94 把鼠标放在每一步反应的数字上, 可以查看具体反应条件或者链接到详细的文献或反应信息 94

95 SciPlanner 结果的保存发送到 SciPlanner 的文献物质反应会被自动保存, 但是编辑面板上的内容需要人工点击进行保存 95

96 SciPlanner 结果的导出 96

97 在导出的 PDF 文件中, 你可以看到整条合成路线 SciPlanner 助力逆合成分析, 帮助设计合成路线 97

98 以及详细的反应信息物质信息和文献信息 98

99 反应检索小结画出完整的或部分的反应式进行检索可进行精确检索或亚结构检索通过 Analyze/Refine 功能来分析反应条件或限定收率等可以获取相似反应信息及附加反应信息 SciPlanner 帮助进行逆合成路线设计更多细节化内容, 请参考 99

100 提纲介绍 SciFinder Web 中的内容 SciFinder Web 特色功能 SciFinder Web 的注册和登陆 SciFinder Web 中的检索和后处理 SciFinder Web 中的文献检索 SciFinder Web 中的物质检索 SciFinder Web 中的反应检索 SciFinder Web 使用常见问题和网络资源 100

101 SciFinder Web 使用注意事项禁止过量下载严禁账号分享严禁将账号用于非学术研究 101

102 SciFinder Web 常见问题并发用户数已满, 请稍后再试 102

103 SciFinder Web 常见问题账号或密码错误, 请在 username 处填写, 截图, 并与图书馆联系 103

104 SciFinder Web 常见问题任何需要反馈给图书馆的问题, 都请点击测试 IP 地址的链接将页面截图下来, 一并发给图书馆 104

105 SciFinder Web 网络在线资源平台 cn/cas 资源下载 :PDF 文件在线演示 :Flash 演示网络培训 : 不定期的网络专题培训 105

106 Comprehensive Content Sophisticated Analysis Unprecedented Results Thank You 唐蜜 SciFinder 培训专员 Tel: 答疑 QQ:

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The Growing Importance of Patinformatics SciFinder Web 源于化学, 超越化学的一站式检索平台 SciFinder Web 使用介绍李凤梅 SciFinder 培训专员 2013.11 提纲介绍 SciFinder Web 中的内容 SciFinder Web 中的检索和后处理 SciFinder Web 中的物质结果及相关文献处理 SciFinder Web 中的物质检索方法 SciFinder Web 中的主题检索 SciFinder