The Growing Importance of Patinformatics

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钧乔
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1 SciFinder Web 源于化学, 超越化学 SciFinder Web 使用介绍 ---- 上海工程技术大学 SciFinder 产品专员朱传娴

2 提纲介绍 SciFinder Web 中的内容 SciFinder Web 的注册和登陆 SciFinder Web 中的检索和后处理 SciFinder Web 中的文献检索 SciFinder Web 中的物质检索 SciFinder Web 中的 Markush 检索 SciFinder Web 中的反应检索 SciFinder Web 使用常见问题和网络资源 2

3 美国化学文摘社 Chemical Abstract Service 创建于 1907 年 ACS 的分支机构密切关注, 索引和提炼着全球化学相关的文献和专利最早创立了化学文摘总部坐落于俄亥俄州的哥伦布市 3

4 SciFinder Web 中的内容期刊专利论文会议报告 Chemcats CAPlus Medline Chemlist 溶剂, 催化剂, 产率, 反应实验过程等 Registry Marpat CASReact 物质基因专利中的 Markush 结构合成信息 4

5 SciFinder Web 中的内容 CAS REGISTRY SM >7300 万有机无机物质 >6400 生物序列每天更新约新物质物质报道文献, 回溯到 1802 年物质信息包含了大量的实验数据, 预测数据, 以及物质标签和谱图 CASREACT >5350 万单步和多步反应 >1360 万物质合成制备信息源自专利和期刊文献每首更新 3-5 万条单步多步反应反应回溯到 1840 年 CAS Databases SciFinder Web 中的内容 CAplus SM >3700 万专利和期刊信息 >10000 种期刊的覆盖 63 个专利发行机构每天更新 3000 条记录文献回溯到 19 世纪初引文信息回溯到 1997 年之前, 超过 3 亿条引文信息 CHEMCATS >6800 万条商业购买信息 >1,098 供应商 >1,222 化学产品目录 5

6 CAplus SM +Medline 涵盖上万种期刊及 63 个专利发行机构专利 Japanese Patent Office (JPO) China (CN) Republic of Korea (KR) India (IN) Taiwan (TW) Hong Kong (HK) Philippines (PH) Singapore (SG) 6

7 CAS REGISTRY SM 是化学物质信息的黄金标准 7

8 CASREACT 是检索化学反应最权威的来源 CASREACT 是世界上最大的, 更新速度最快的反应数据库 8

9 MARPAT 全球专利文献中的 Markush 结构库 MARPAT 帮助最大程度的找到结构相关专利文献 9

10 提纲介绍 SciFinder Web 中的内容 SciFinder Web 的注册和登陆 SciFinder Web 中的检索和后处理 SciFinder Web 中的文献检索 SciFinder Web 中的物质检索 SciFinder Web 中的 Markush 检索 SciFinder Web 中的反应检索 SciFinder Web 使用常见问题和网络资源 10

11 SciFinder Web 的注册和登陆 SciFinder Web 的系统要求 : Windows 用户支持 IE 8.x 或 FireFox 2.x;Mac 用户支持 Firefox 和 Safari Java 安装 ( 初次使用结构时自动安装, 在图书馆相关页面上找到 SciFinder Web 注册用的网址

12 点击 URL 创建 SciFinder Web 账号一人只能注册一个账号开始创建 SciFinder Web 帐号创建 ID 不能用代理服务器的 IP 地址 12

13 设置用户名及密码注意事项用户名 : 必须是唯一的, 且包含 5-15 个字符它可以只包含字母或字母组合数字和 / 或以下特殊字符 : -( 破折号 ) _( 下划线 ). ( 句点表示 at 的符号 ) 密码 : 必须包含 7-15 个字符, 并且至少包含三个以下字符 : 字母数字非字母数字的字符 ( # % & *) 密码设置小技巧 : 1: 不要和账号中有重复的字符 2: 密码格式最好是 abc@123 13

14 对新 ID 的确认 40 分钟内查收邮件, 注意垃圾邮箱 48 小时内点击邮件中的确认链接

15 SciFinder Web 登陆界面输入 SciFinder 帐号和密码 15

16 SciFinder Web 主界面工具栏检索完, 请点击退出已保存的结果集检索页面检索入口邮件提醒结果集 16

17 在线帮助 17

18 提纲介绍 SciFinder Web 中的内容 SciFinder Web 的注册和登陆 SciFinder Web 中的检索和后处理 SciFinder Web 中的文献检索 SciFinder Web 中的物质检索 SciFinder Web 中的 Markush 检索 SciFinder Web 中的反应检索 SciFinder Web 使用常见问题和网络资源 18

19 文献检索主题主题检索 : 具有抗癌作用的天然活性成分关键词 : Natural Active Component Anti Cancer 关键词之间用介词连接 19

20 主题检索的候选项只有 104 篇文献吗? Concept 表示做了同意词的扩展 Closely associated with one another 表示同时出现在一个句子中 were present anywhere in the reference 表示同时出现在一段话中 20

21 文献检索结果文献分析工具 21

22 文献检索结果的 Analyze Index Term 基于内容的分析工具, 发现 natural products, Pharmaceutical 这个和天然活性成分很相关的词是否用这个词去检索, 效果会更好? 22

23 尝试新的检索新的检索式 : Natural Product with anti cancer 更换检索词后, 结果放大了 70 倍 23

24 SciFinder 中的结果一些相关词同时被检索出来 24

25 文献检索结果的 Analysis 领域内主要专家主要研究机构, 合作伙伴, 竞争对手主要出版杂志 25

26 文献检索结果的 Refine Refine Document Type: 可以帮助我们迅速获得特定文献类型的文献 26

27 引文排序引文排序功能帮助查找重要的有影响力的文章 27

28 文献检索结果的 Categorize 一级目录二级目录和二级目录相关的 Index Term 选中的 Index Term Categorize 系统分类功能, 基于 Index Term, 根据大学科方向对文献进行自动分类 28

29 结果集的保存 --Save, Print, Export Save: 保存在服务器上, 方便以后登陆查看, 每次可存 1 万条记录文献详细信息 Export: 导出至本地电脑 Print: 打印成 PDF 格式 Citation manager: 保存成 RIS 等格式, 可导入 EndNote 等文献管理工具 Offline Review: 保存成 PDF,RTF 等格式, 用于脱机浏览 29

30 文献信息题录摘要索引重要概念重要物质 30

31 文献检索小结主题检索时, 使用介词作为连接尽量选择包含 Concept 和 Closed Associated with 的候选项通过 SciFinder 的 Analyze/Refine 功能来缩小检索的范围尝试将不同的 Analyze/Refine 功能组合起来用, 会有更多的收益使用 Categorize 可以让系统来实现自动分类更多细节, 请参考 31

32 提纲介绍 SciFinder Web 中的内容 SciFinder Web 的注册和登陆 SciFinder Web 中的检索和后处理 SciFinder Web 中的文献检索 SciFinder Web 中的物质检索 SciFinder Web 中的 Markush 检索 SciFinder Web 中的反应检索 SciFinder Web 使用常见问题和网络资源 32

33 物质检索 -- 标识符检索在 SciFinder 中查找 AZD7545 (AstraZeneca 公司开发的治疗糖尿病的前药 ) 输入 CAS RN 或名称提示 : 1. 一次最多可输入 25 个物质 2. 每行一个物质标示符物质标示符包括 CAS RN. 和化学名称化学名称可以是通用名称商品名俗名 33

34 SciFinder 中的物质记录 Substance Detail 获得和物质有关的所有信息在 SciFinder 中, 鼠标滑过物质, 可以打开物质的标准菜单, 通过标准菜单, 可以获得和物质有关的所有内容 34

35 Substance Detail 物质详情 CAS 号分子式结构式化学名别名物质信息来源按照 CAS Role 分类的专利非专利文献列表对某类文献感兴趣, 仅需点击交叉处的即可方便快捷地获取 35

36 预测数据与实验数据 36

37 物质检索 --Property explore 寻找分子量在之间的黄酮类物质 37

38 物质结果集的筛选 --Refine 2 千多万个结构, 如何筛选黄酮类物质? 38

39 物质结果集的筛选 --Refine 原子锁工具避免找到环结构变化的物质 39

40 物质结果集的筛选 --Refine 这些物质的结构特点? 40

41 物质结果集的筛选 --Refine Atom Attachemnt: 了解结构中原子修饰情况鼠标放在任意原子上, 显示?, 右侧列出该原子修饰基团 41

42 物质检索分子式已知起始原料的聚合物 (C8 H8 Br2. C4 H6 O4)x 42

43 物质检索分子式已知重复单元的聚合物 43

44 利用结构特征进行 Refine, 迅速查找需要的物质 44

45 物质检索 -- 结构无需安装 Java 版点击画图版来进行结构输入, 初次使用时需要安装 Java 插件 64 位系统 : 需同时安装 32 位和 64 位 Java

46 SciFinder 结构绘制工具铅笔橡皮结构和反应切换功能元素周期表可变基团重复基团工具碳链工具选择工具环锁定工具旋转工具正电子负电子常用基团 R 基团定义工具可变位置连接工具模版工具索套选择工具原子锁定工具镜面旋转工具 C 原子和单键恢复工具结构检索选择单双键,RS 构型, 不确定键定义工具常见环, 多元环工具

47 达菲的 CAS No. 存为模板调用模板 47

48 精确结构检索精确结构检索 : 获得结构本身盐及混合物 48

49 亚结构检索单组分物质有机物质 49

50 亚结构检索达菲核心成分帕拉米韦亚结构检索 : 获得包含全部片段结构的所有物质 50

51 结构检索结构相似的检索 SciFinder 中的相似结构检索, 帮助获得在结构上存在相似的物质 HOOC COOH N Et

52 相似结构检索相似结构检索 : 取代基位置变化取代基变化母体结构变化

53 无文献的物质很多无文献的物质是有试剂供应商提供给 CAS 申请登记号, 并有证据表明其存在 53

54 结构检索小结精确结构检索 : 获得物质的盐, 聚合物, 混合物, 配合物等, 母体结构不能修改, 不能修饰亚结构检索 : 所画的结构必须存在, 母体结构不能修改, 但可以被修饰相似结构检索 : 母体结构可以修改, 也可以被修饰, 用相似度来控制获得的结果 54

55 提纲介绍 SciFinder Web 中的内容 SciFinder Web 的注册和登陆 SciFinder Web 中的检索和后处理 SciFinder Web 中的文献检索 SciFinder Web 中的物质检索 SciFinder Web 中的 Markush 检索 SciFinder Web 中的反应检索 SciFinder Web 使用常见问题和网络资源 55

56 具体物质 [Specific Substance]: 以具体化学结构所陈述的特定物质, 会被标示 CAS No. 预测性物质 [Prophetic Substance]: 使用 Markush 结构所陈述的预测物质, 一个 Markush 可以陈述上百或上千的化学物质 Patent 中所陈述的预测物质, 不会被标示 CAS No. Markush 检索, 能检索到通过结构检索检不到的专利 R1 R1 = H, Br, Cl, I R2 = Br, Cl, I, CH 2 halogen, CH halogen, R2 CH 3 56

57 SciFinder 中的 Markush 检索能帮助做初步的专利评估 57

58 全部是专利文献 58

59 提纲介绍 SciFinder Web 中的内容 SciFinder Web 的注册和登陆 SciFinder Web 中的检索和后处理 SciFinder Web 中的文献检索 SciFinder Web 中的物质检索 SciFinder Web 中的 Markush 检索 SciFinder Web 中的反应检索 SciFinder Web 使用常见问题和网络资源 59

60 Scifinder 中反应定义工具反应箭头反应角色工具反应原子标记工具反应位置标记工具反应官能团列表 60

61 反应检索检索 : 腈基的还原 61

62 反应检索精确反应检索 62

63 反应检索结果浏览记录, 发现很多反应来自同一篇文献, 通过反应分类进行合并 63

64 反应检索结果文献题目命中反应数一篇文献只出现一条反应记录 64

65 Experimental Procedure 不用阅读全文, 直接获得包含实验过程的反应记录 65

66 按照反应类型排序更精确的查找需要的反应 66

67 反应检索结果的筛选获得特定物质做还原剂的反应 67

68 提纲介绍 SciFinder Web 中的内容 SciFinder Web 的注册和登陆 SciFinder Web 中的检索和后处理 SciFinder Web 中的文献检索 SciFinder Web 中的物质检索 SciFinder Web 中的 Markush 检索 SciFinder Web 中的反应检索 SciFinder Web 使用常见问题和网络资源 68

69 SciFinder Web 使用注意事项一人注册一个账号严禁过量下载严禁账号分享严禁将账号用于非学术研究 69

70 SciFinder Web 常见问题并发用户数已满, 请稍后再试 70

71 SciFinder Web 常见问题账号或密码错误, 请在 username 处填写, 截图, 并与图书馆联系 71

72 SciFinder Web 常见问题任何需要反馈给图书馆的问题, 都请点击测试 IP 地址的链接将页面做成截图, 一并发给图书馆 72

73 SciFinder Web 网络在线资源平台资源下载 :PDF 文件在线演示 :Flash 演示网络培训 : 不定期的网络专题培训 73

74 Comprehensive Content Sophisticated Analysis Unprecedented Results Thank You 朱传娴 Tel: QQ 群 :

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