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1 40 4 Vol.40, No OCEANOLOGIA ET LIMNOLOGIA SINICA July, 2009 (Pelteobagrus eupogon) * 1, 2 1, 3 1, ( ; ; ) 40 (YL, 30 ) (SC, 30 ) (SH, 18 ) (YY, 30 ) (QQ, 30 ) 1 (TJ, 30 ) 6 (H o )(H e ) (PIC) (A e ), Nei, x 2 Hardy-Weinberg, (F ST ) (N m ), PHYLIP3.63 Nei UPGMA , bp, , 143, (1) 6, PIC , , (A e ) , , (H e ) , ; (2) YY QQ (0.9947), TJ SC (0.4846),,,, Q176 (Pelteobagrus eupogon) (Siluriformes) 鲿 (Bagridae) (Pelteobagrus),, (, 2001;, 2007),,,,,,,,,,,,,, (Microsatellite), *, 2004CB117405,, dayulee2003@yahoo.com.cn :,,, sunxw2002@163.com : , :

2 4 : (Pelteobagrus eupogon) 461 (, 2003;, 2007) (, 1997;, 2003) (, 2004;, 2007) (, 2006;, 2007) (, 2005;, 2006;, 2005), (, 2001;, 2005;, 2004;, 2006;, 2006) 40 5, PCR,, (Pelteobagrus eupogon) (YL, 30 ), (SC, 30 ), (SH, 18 ), (QQ, 30 ) (YY, 30 ), 1 (TJ, 30 ) PCR DNA ABI PE 9700, Eppendorf 5804 R ( 40 DNA, Primer 5,, 30 ) Promega, DNA, 70%,, DNA, DNA (2006) PCR PCR 25μl, (2006) PCR 94, 3min; PCR 94, 30s; 48 54, 30s; 72, 30s; 40, 72 5min PCR 2%, 5V/cm 2h, GoldView, Gene Genius Bio imaging system, Gel works (Version 3.0) PopGene (Version 3.2) (Allele Frequency, P)(Observed number of alleles, N a ) (Effective number of alleles, A e ) (Observed heterozygosity, H o ) (Expected heterozygosity, H e ) (Genetic similarity index, I), (Genetic Distance, D s ) (Polymorphism Information Content, PIC), Botstein (1980) PIC = n n 1 n Pi Pi Pj i= 1 i+ 1 j= i+ 1, P i P j 1 2 i j, n GenePop(Version 3.4), x 2 Hardy-Weinberg (F ST ) (N m ) PopGene PHYLIP V3.6 (Phylogeny Inference Package) gendist Nei, UPGMA (Unweighted Pair Group Method with Arithmetic means, ) , bp, (genotypic disequilibrium value), 0.92% P<0.05,,

3 表 1 部 分 黄 颡 鱼 引 物 序 列 情 况 Tab.1 Part of microsatellite marker sequences of P. eupogon GenBank (5 3 ) ( ) GenBank (5 3 ) ( ) HLJYC009 EU CTGAGGTAGAACAGCACA GACGATCTGTGGAGTTTG (TC) 8 (CA) 6 46 HLJYC059 EU GGCTCGGAGTCAGTTTCT TTGCGTTCTCAAGCTCAT (CA) HLJYC012 EU AGACTTGGTTTCAGGCTA CATTCCCATGGTACATATT (CA) HLJYC060 EU GATCAACGTCCAACAGAG GGAAAGAAAGATGGCTAG (CA) 28 (TTTG) 7 56 HLJYC013 EU GACCCAGTTCCCACATTG GGCTACCACATCCCTCAT (CA) HLJYC061 EU AAGCGATTTATCCATTTT TGACACCCTGATTACACC (GTT) HLJYC015 EU CACCTCCACTGAGAATGA CGATAAGCAGGTAAATAA (CA) HLJYC066 EU ACACTGACATACACTGGCATAA CTGGCAACGTGTTTCTTACT (TG) HLJYC017 EU ATGGTATAAACATGGTGCTA ATGATGCTGATAGGGTGA (TG) HLJYC067 EU TACCATTTACAGGCAAGA AACAGCAGGTTTACAATC (TG) HLJYC024 EU TCACAATGAGTTTGGAGCCT TCTGGAGAACTGGGTGGG (CA) HLJYC068 EU TTTTCTAATCAGCGTTTC CACAGACTCAATCAATCC (CA) HLJYC028 EU CCATTTGCTCCATTCCTC TCTCCACCTCCTCACTCC (CA) HLJYC074 EU CCTCTGCTGGTCTGTTAG CATCCTTATTCTATCTGAAATG (CA) HLJYC031 EU CAGGATGGAGGTGTAAAG ATAAAGCTGTGATGTGCC (CA) HLJYC075 EU GTCGACGATCAAATGCTT CTCACCTTTCACCTCCAG (TG) HLJYC035 EU ACGGCATGAATAAAGGAA GAGGAGGAGACGAGGTGT (CA) HLJYC081 EU AAATATGAGCTGCACAGA AACAAATAACAAGCCCTT (GA) 33 (TG) 4 56 HLJYC037 EU AAAGGTGGAACAGAAGGC ACCAACAAGCGAGAACTA (CA) HLJYC084 EU AGATGGTCTGTATGTGCC ATCTTTCAGCGTGTTTCA (CA) HLJYC039 EU TCCTACCAGCAGTAACCA GTCCCTCAACCAGAACAC (TG) HLJYC086 EU TAAGCCTTGTAAGTATTTTG CTGAAGCTATTTGCTCTT (GA) HLJYC040 EU CTGCGTGGTATCAGGTGG AAGGCACTGGATGAGTCAAT (CA) HLJYC087 EU TGTGGTGCTATCGGTAAA GAGATTCGCTTCTGTGCC (CA) 29 (GA) HLJYC045 EU TGGGTCTCCTCTGGGTTCA GCGGCTTCACTCACTTCC (TG) HLJYC089 EU CTACCGCTTATCAGAACTT CGATCTTTGCATCACTCA (CA) HLJYC050 EU CCTCCCACTCACCTTCCT GTTGCCACTTCAAACAGC (TG) HLJYC090 EU TGAGGCAACATTCAGAGC CCTTGATACAGGAGCAGAG (TG) 49 (GA) 9 48 HLJYC052 EU AGACTTGGCGTTGTTTGG GTGTCAGAGTCGGGTGCT (CA) HLJYC093 EU AAAGATGTTGGTTTTGGGTG AGGCCGAAAGATGGCTAA (TC) 30 56

4 4期 李大宇等: 黄颡鱼(Pelteobagrus eupogon)不同生态地理分布群体遗传多样性的微卫星分析 图1 六个黄颡鱼群体在基因座 HLJ045 上的遗传差异 Fig.1 The genetic diversity at locus HLJ045 of 6 P. eupogon populations YL 月亮湖黄颡鱼群体; SC 四川黄颡鱼群体; SH 松花江黄颡鱼群体; YY 长湖子代黄颡鱼群体; QQ 长湖亲代黄颡鱼群体; TJ 天津黄颡鱼群体 2.3 群体遗传多样性分析 6 个黄颡鱼群体中, 检测到的有效等位基因数 间, 平均值为 和 0.40; 多态信息含量(PIC)在 之间, 平均值为 (Ae)在 个不等, 各个群体中平均值依次为 和 0.19 以上各个群体 和 1.47; 无偏期望杂合 多样性指标说明这几个黄颡鱼群体属于中度多态性, 度(He)在 之间, 平均值为 遗传多样性水平适中 由表 2 可见, 几种统计参数在 和 0.23; 观测杂合度(Ho)在 之 6 个群体间具有一定的差异, 但方差分析发现并未达

5 表 2 六 个 黄 颡 鱼 种 群 在 30 个 微 卫 星 基 因 座 的 多 样 性 指 数 Tab.2 The polymorphic information at 30 microsatellite loci of six P. eupogon populations YL SC SH YY QQ TJ A e H o H e PIC A e H o H e PIC A e H o H e PIC A e H o H e PIC A e H o H e PIC A e H o H e PIC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC : YL; SC ; SH; YY ; QQ ; TJ

6 4 : (Pelteobagrus eupogon) 465 (P>0.05, ) 2.4 Hardy-Weinberg (Markov chain method) Hardy-Weinberg P (multi-locus test), 6 ; (multi-group test), 7 ; (HW test for each locus in each population), %(0.01<P <0.05), 8.74% (P<0.01), 85.43% (P>0.05, 3) 2.5 (F ST ) (N m ), , 34 表 3 六 个 黄 颡 鱼 种 群 遗 传 平 衡 分 析 Tab.3 Genotypic equilibrium analysis on six P. eupogon populations YL SC SH YY QQ TJ HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC HLJYC YL; SC ; SH; YY ; QQ ; TJ

7 (F ST = )(Wright, 1978), , YY QQ, ( D s = ); TJ SC, ( D s = ) 4 MEGA 3 UPGMA ( 2),, YY QQ, YL SH, SC, TJ 3 3.1, A e H o H e PIC,,, 6 (A e = 1.96, H e = 0.40, H o = 0.49, PIC = 0.34) (2004) RAPD , 5 (2006) 6 SSR PIC 0.488, ; (2006) PIC H o = DeWoody (2000) , H e = 0.46 A e = 7.50, 6 H e, A e Botstein (1980) PIC 0.50, PIC 0.25, PIC PIC = 0.34,, YL (PIC = 0.40),, TJ, PIC 0.25, 4 (PIC = ), 6, (, 2004),,,, TJ, PIC,,,, PIC Tab.4 表 4 六 个 黄 颡 鱼 群 体 间 Nei 氏 标 准 遗 传 距 离 ( ) 与 遗 传 相 似 系 数 ( ) Nei s standard distance (below the diagonal) and genetic similarity coefficient (above the diagonal) among 6 P. eupogon populations YL SC SH YY QQ TJ YL SC SH YY QQ TJ YL; SC ; SH; YY ; QQ ; TJ

8 4 : (Pelteobagrus eupogon) UPGMA Fig.2 The UPGMA cluster analysis on 6 P. eupogon populations YL; SC ; SH ; YY ; QQ ; TJ,,,,,,,, 3.2, YY QQ,,, YY, QQ ; TJ SC,, TJ 6, YY QQ, YL SH, SC, TJ Scribner (1986), (geographic proximity), 6, , Wright(1978) ; N m = (1 F ST ) / 4F ST, , 1, N m <1, ; N m >1, (Slatkin, 1987), 6,, 6 I = ( D s = ), ( I = , D s = ) (Thorp, 1982) (2004) RAPD (D s = ), 6,, RAPD,, DNA,,,, 3.3 ( ) 5,,, 5, 5,,,

9 468 40,,, ND4., 30(4): ,,, , 15(2): ,,, Paralichthys olivaceus 10., 35(6): ,,, DNA., 12(1): 56 61,,, (Pelteobagrus fulvidraco, Richardson). ( ), 39(3): 92 97,, , 26(5): , , 32(4): 10 16,, , 27(5): 23 25,,, , 26(3): ,,, DNA RAPD., 24(3): 84 89,,, RAPD. (), 47(2): ,,, , 25(5): ,,, RAPD SCAR., 27(3): 11 12,,, RAPD., 30(1): ,,, Sox9., 13(5): ,,, , 28(6): ,,, P-450arom., 12(5): ,,, , 28(3): 5 8,,, , 6: Botstein D, White R L, Skolnick M et al, Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms. American Journal of Human, 32: DeWoody J A, Avise J C, Microsatellite variation in marine, freshwater and anadromous fishes compared with other animals. Journal of Fish Biology, 56: Scribner K T, Evans J E, Morreale S J et al, Genetic divergence among populations of the yellow-bellied slider turtle (Pseudemys scripta) separated by aquatic and terrestrial habitats. Copeia, 3: Slatkin M, Gene flow and the geographic structure of natural populations. Science, 236: Thorp J P, The molecular dock hypothesis: Biochemical evolution, genetic differentiation, and systematic. Annual Review of Ecology Systematic, 13(1): Wright, Evolution and the genetics of populations. University of Chicago Press, 1 30

10 4 : (Pelteobagrus eupogon) 469 GENETIC DIVERSITY OF DIFFERENT ECOLOGO-GEOGRAPHICAL POPULATIONS OF YELLOW CATFISH PELTEOBAGRUS EUPOGON LI Da-Yu 1, 2, YIN Qian-Qian 1, 3, HOU Ning 1, 3, SUN Xiao-Wen 1, LIANG Li-Qun 1 (1. Key Open Laboratory for Bioengineering Breeding of Northern Fishing, Ministry of Aquaculture, Heilongjiang Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Harbin, ; 2. Key Open Laboratory for Genetic Breeding of Aquatic Animals and Aquaculture Biology, Ministry of Aquaculture, Freshwater Fishery Research Center, Chinese Academy Fishery Sciences, Wuxi, ; 3. College of Aqua-life Science and Technology, Dalian Fisheries University, Dalian, ) Abstract Forty microsatellite loci were used for analyzing six populations of yellow catfish Pelteobagrus eupogon: YL [the Yueliang (Moon) Lake, Jilin Province, 30 samples], SC (Sichuan Province, 30 samples), SH (Songhua River at Harbin, Heilongjiang Province, 18 samples), YY (the Changhu Lake, Jingzhou, Hubei Province, 30 samples), QQ (the parent generation of YY, from the Changhu Lake also), and TJ (Huanxin Breeding Farm, Tianjin, 30 samples). The observed (H o ), expected (H e ) heterozygosity, polymorphic information content (PIC), and number of effective alleles (A e ) were determined. Genetic similarity index and genetic distance were computed on the allele frequency. The Hardy-Weinberg Equilibrium was checked by x 2 Test. Genetic differentiation (F ST ) and hierarchical partition of genetic diversity (N m ) were used. A dendrogram was built on the UPGMA results using PHYLIP software package (Ver.3.63). A total of 5042 fragments ranging from 150bp and 650bp in length were obtained. One to eight alleles were amplified in 40 loci and 143 alleles in all six populations. The average number of alleles in each locus is The result shows that 1) the level of genetic variability is moderate in the six populations. The polymorphic information contents of the six populations are from 0.00 to 0.79, in average at 0.40, 0.37, 0.35, 0.39, 0.35 and 0.19, respectively. Effective alleles are from 1.00 to 5.44, in average of 2.05, 2.30, 1.93, 2.07, 1.93 and 1.47, respectively. The expected heterozygosity ranges from 0.00 to 0.83, in average at 0.45, 0.46, 0.36, 0.46, 0.41 and 0.23, respectively; 2) the highest genetic similarity index at was found between YY and QQ; and the lowest index at between SC and TJ. Correlation between the clustering result and the geographical distribution may exist. Key words Yellow catfish Pelteobagrus eupogon, Genetic diversity, Molecular marker, Microsatellite

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