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1 目录 简介 原理 试剂盒组成 保质期 准备工作 方案 1: 动物软组织核酸和蛋白质总提取方案 方案 2: 难裂解动物组织核酸和蛋白质总提取方案 方案 3: 小分子 RNA 富集提取方案 常见问题回答 版本 : 第 1 页共 16 页

2 简介 AllPure Tissue Kit 是从动物组织样品中提取 RNA 小分子 RNA DNA 和蛋白质最为快速和简单的方法 试剂盒采用硅胶柱纯化技术, 抽提过程中无需用到危险的酚氯仿抽提, 也无需用到耗时的醇类沉淀 试剂盒适合从 5~50mg 动物组织样品中提取得总 RNA, 小分子 RNA DNA 和蛋白质 得到的 RNA 可直接用于 RT-PCR Northern Blot 核酸保护和体外翻译等实验 得到的 DNA 可直接用于 PCR Southern 杂交等 得到的 Protein 可直接用于 SDS-PAGE 电泳 Western 杂交等 原理 HiPure 硅胶柱以高结合力的玻璃纤维滤膜为基质 滤膜在高浓度离子化剂 ( 如盐酸胍或异硫氰酸胍 ) 条件下, 可通过氢键和静电等物理化学作用吸附核酸, 而蛋白质和其它杂质则不被吸附而去除 吸附了核酸的滤膜经洗涤去除残留的蛋白质和盐, 最后可以用低盐缓冲液 ( 如 Buffer TE) 或水, 洗脱出滤膜上吸附的核酸 得到的核酸纯度高, 可直接用于各种下游实验 AllPure Tissue Kit 基于硅胶柱纯化方式 细胞在含高浓度异硫氰酸胍裂解液中匀浆裂解,RNA 和 DNA 释放到裂解液中 由于裂解液中含有高浓度异硫氰酸胍, 内源性或外源性的核酸酶变性而失活,RNA 和 DNA 被保护起来 转移至 DNA 结合柱吸附 DNA, 滤液经酚氯仿抽提, 分别得到上清液 ( 含 RNA) 和下层有机相 ( 含酚氯仿 ) 上清加入乙醇调节结合条件, 转移至 RNA 柱子吸附 RNA DNA 和 RNA 柱子经 Buffer Buffer RWC 洗涤蛋白质和其它杂质, 经 Buffer RW2 洗涤去除盐分,RNA 被 RNase-Free Water (DEPC 处理水 ) 洗脱 DNA 被灭菌水洗脱 收集有机相溶液, 加入异丙醇沉淀回收蛋白质, 最后加入合适的缓冲液溶解蛋白质 第 2 页共 16 页

3 组成 AllPure Tissue Kit 产品编号 R R R 纯化次数 10 次 50 次 250 次 HiPure RNA Mini Columns HiPure DNA Mini Columns II ml Collection Tubes Buffer RL 10 ml 40 ml 180 ml Buffer PHC 10 ml 40 ml 180 ml Buffer PWB 2 ml 10 ml 2 x 25 ml Buffer DW1 6 ml 30 ml 150 ml Buffer RW2 10 ml 2 x 20 ml 3 x 50 ml RNase-Free Water 2 ml 20 ml 50 ml Buffer AE 2 ml 10 ml 50 ml 说明书 保质期 AllPure Tissue Kit 除 Buffer PHC 外, 其余组分可在室温下 (15-25 ) 干燥保存 12 个月 Buffer PHB 需置于 2-8 保存 低温下,Buffer RL 可能会有沉淀形成, 需 55 水浴让沉淀完全溶解后使用 因 RNase Free Water 处理水中不含任何抑菌因子, 室温放置或操作时可能会引入细菌或真菌污染 我们推荐分装 RNase Free Water 并保存于 -20, 以减少污染 若 RNase Free Water 受到污染, 请重新制配 RNase Free Water 的配制 : 在试剂瓶中装入适量去离子水, 加入 0.1% DEPC, 磁力搅拌器搅拌过夜, 于 120 灭菌 分钟 处理后, 分装保存于 2-8 或 -20 灭菌后 DEPC 处理水有乙醇气味, 属于正常现象 第 3 页共 16 页

4 需要准备材料和工具 ( 可选 )14.3M β- 疏基乙醇 (β-me) 或 1M DTT: 使用前, 分装适量的 Buffer RL, 每 1ml Buffer RL 加入 20µl β- 疏基乙醇 Buffer RL/β-ME 混合液可室温稳定放置 1 个星期 β-me 有较强的气味, 可用 1 M DTT (Dithiothreitol) 代替 用 DEPC 处理水或灭菌水配制 1M DTT, 分装保存于 -20 按 1ml Buffer RL 加入 20µl 1M DTT, 该混合液可于室温放置 2 天 氯仿 无水乙醇 (96-100%) 无 RNase 酶的 1.5ml 离心管无 RNase 酶的枪头手套按瓶子标签所示, 加入适量的无水乙醇稀释 Buffer RW2, 并于室温保存 按瓶子标签所示, 加入适量的无水乙醇稀释 Buffer PWB, 并于室温保存 R 加入 38ml 无水乙醇 (100%) R 加入 190ml 无水乙醇 (100%) R 每瓶加入 475ml 无水乙醇 (100%) 第 4 页共 16 页

5 样品的打散和匀浆样品的打散及匀浆是所有 RNA 提取所必需的步骤 样品的打散是让组织或细胞块快速分散 细胞壁和细胞质膜破裂, 从而使核酸释放到裂解液中 匀浆是指用适当的方法打断高分子量的基因组 DNA 和细胞内高分子量的物质, 以降低溶液的粘稠度 打散和匀浆不充分都可能会导致 RNA 产量和纯度下降, 还有可能引起柱子的堵塞 A: 液氮处理在处理液氮的时候, 请戴上手套并小心处理 切出适量的组织置于预冷的研钵中, 迅速加入液氮, 将组织研磨成粉末, 然后将粉末倒入预冷的离心管中 ( 注意预先冷却离心管, 否则样品倒入时, 液氮沸腾而损失样品 ) 称重并加入适当的 RL Buffer/β-ME, 涡旋混匀 由于液氮研磨只能起到打散样品的作用, 所以最好再用注射器或机械匀浆器进行匀浆, 以减低裂解液的粘稠度 B: 机械匀浆器匀浆机械匀浆器能高效匀浆大部分的组织和细胞 把样品置于合适的玻璃管或离心管中, 加入裂解液, 把探头插入裂解液中, 高速间断匀浆, 每次为 秒直至样品完全匀浆 使用机械匀浆器时, 一般组织都可以在一分钟内达到理想的匀浆效果 大部分的机械匀浆器都带有不同大小的探头, 小体积的裂解液适合使用较小的探头 C: 玻璃匀浆器玻璃匀浆器是常用的匀浆工具 能有效处理软组织如肝脏 脾脏 肾 脑等 把样品和适量的裂解液转移至玻璃匀浆器中, 上下推磨至组织块被充分打散 由于破璃匀浆磨只能起到打散样品的作用, 所以最好再用注射器匀浆几次, 以减低裂解液的粘稠度 D: 注射器处理培养细胞或小量动物柔软组织, 如脑 胚胎等可用小型注射器 ( 带 20# 针头 ) 进行抽打 此外, 小型注射器还可以同时打断基因组 DNA 和其它高分子物质, 起到降低裂解液的粘稠度的作用 注射器匀浆方式是处理细胞最常用的方法 第 5 页共 16 页

6 方案 1. 动物软组织核酸和蛋白质共提取该方案适合于从 5~30mg 动物软组织, 如肝脏 脾脏 肾脏, 脑等样品中提取基因组 DNA 总 RNA( 含小分子 RNA) 和总蛋白质 动物组织如肌肉, 结缔组织 皮肤富含高分子量的肌纤维, 需按方案 2 进行操作 以下离心均在室温下进行 组织用量正确的组织用量是获得理想 RNA 产量和纯度的关键 该试剂盒的组织用量可低至 0.1mg, 而最大的组织用量则取决于样品中 RNA 的含量 蛋白质和杂质的含量 肝脏含有大量蛋白质, 组织用量 20mg; 脾脏 胸胰组织含大量 DNA, 裂解液非常粘稠, 组织用量能太多 15mg; 若处理的组织没有相关的信息, 我们推荐第一次起始用量为 15mg, 根据获得的结果再调整组织用量 不管何种情况, 组织用量都不应超过 30mg 1. 组织的裂解和匀浆 : 5~15mg 动物软组织 : 使用 400µl RL Buffer/DTT; 15~30mg 动物软组织 : 使用 600µl RL Buffer/DTT; 选择合适的匀浆工具进行匀浆, 详细参照第 5 页的 样品的打散及匀浆 2. 室温下,14,000 x g 离心 5 分钟 按第 3 步进行操作 提取 DNA 3. 把 HiPure DNA Mini Column II 装在 2ml 收集管中 把第二步获得的上清液转移至 DNA 过滤柱中 14,000 x g 离心 1~2 分钟 转移滤液至新的 2ml 离心管中, 用于 RNA 和蛋白质的抽提 4. 把 HiPure DNA Mini Column II 装回 2ml 收集管中 加入 500µl Buffer DW1 至柱子中 10,000 x g 离心 30~60 秒 5. 倒弃流出液, 把柱子装回收集管中 加入 500µl Buffer RW2( 已用乙醇稀释 ) 至柱子中 10,000 x g 离心 30~60 秒 6. 倒弃流出液, 把柱子装回收集管中 加入 500µl Buffer RW2( 已用乙醇稀释 ) 至柱子中 10,000 x g 离心 30~60 秒 7. 倒弃流出液, 把柱子套回空的收集管 10,000 x g 离心空柱 1 分钟, 以甩干柱子的基质 第 6 页共 16 页

7 8. 将 DNA 柱子装在 1.5ml 离心管中 加入 50~100µl 预热至 70 C Buffer AE 至柱子的膜中央 室温静置 5 分钟,10,000 x g 离心 1 分钟 弃去 DNA 柱, 把 DNA 保存于 2~8 C 或 -20 C ( 可选 ) 若需获得更高产量 DNA, 再加入 50~100µl 预热至 70 Buffer AE 至柱子的膜中央 室温静置 5 分钟 10,000 g 离心 1 分钟 提取总 RNA( 含小分子 RNA) 9. 取第三步得到的滤液 加入等倍体积的 Buffer PHC, 涡旋混匀 20 秒 然后再加入总体积为 0.2 倍体积的氯仿, 涡旋混匀 20 秒 室温下,10,000 x g 离心 5 分钟 ( 举例 ) 若滤液体积为 500µl, 则需加入 500µl 的 Buffer PHC, 混匀后再加入 200µl 的氯仿 10. 转移上清液至新的 2ml 离心管中 保留下层溶液用于蛋白质抽提 11. 加入 1.5 倍体积的无水乙醇至上清液, 颠倒或涡旋混匀 若需分离大分子 RNA 和小分子 RNA, 按方案 3 进行操作 12. 把 HiPure RNA Mini Column 装在 2ml 收集管中 转移 700µl 混合液至柱子中 10,000 x g 离心 30~60 秒 13. 倒弃滤液, 把柱子装回收集管中 转移剩余的混合液至柱子 10,000 x g 离心 秒 14. 倒弃滤液, 把柱子装回收集管 加入 600µl Buffer RW2( 已用乙醇稀释 ) 至柱中,10,000 g 离心 秒 Buffer RW2 在使用之前, 须按瓶子标签指示加入无水乙醇进行稀释 15. 倒弃滤液, 把柱子装回收集管 加入 600µl Buffer RW2( 已用乙醇稀释 ) 至柱中,10,000 g 离心 秒 16. 倒弃流出液, 把柱子装回收集管 10,000 g 离心空柱 2 分钟, 以甩干柱子的基质 ; 这一步可彻底去除柱子中残留的乙醇 17. 将柱子转移至 1.5ml 离心管 加入 30-50µl RNase Free Water 至柱子膜中央 室温静置 2 分钟 10,000 g 离心 1 分钟 弃去柱子, 把 RNA 保存于 -80ºC 第 7 页共 16 页

8 HiPure RNA Column 最小的洗脱体积是 30µl, 小于 30µl 会导致 RNA 的洗脱效率下降 若 RNA 产量超过 30µg, 推荐进行第二次洗脱 提取总蛋白质 18. 取第 10 步获得的下层有机相溶液, 并转移至合适的离心管中 19. 加入 3 倍体积的异丙醇至有机相溶液中, 涡旋混匀 20. 室温静置 10 分钟 21. 4ºC,12,000 x g 离心 10 分钟沉淀蛋白质 倒弃上清液 22. 加入 1.5ml Buffer PWB( 已加乙醇 ) 至蛋白沉淀中, 涡旋混匀 室温静置 20 分钟 23. 4ºC,7,500 x g 离心 10 分钟沉淀蛋白质 倒弃上清液 24. 重复第 22~23 步一次 25. 加入 1.5ml 无水乙醇至蛋白沉淀中, 涡旋混匀 室温静置 20 分钟 26. 4ºC,7,500 x g 离心 10 分钟沉淀蛋白质 倒弃上清液 27. 空气干燥 10 分钟 28. 加入适量体积的 1~5% SDS Buffer 或 SDS-PAGE Loading Buffer(100~200µl) 至沉淀物, 用移液枪反复吸打让沉淀充分分散 ( 可选 )55ºC 振荡温育 30~120 分钟让蛋白质充分溶解 29. 4ºC,10,000 x g 离心 5 分钟去除不溶解的物质 30. 转移上清至新的离心管中, 用于蛋白质分析实验 第 8 页共 16 页

9 方案 2. 难裂解动物组织核酸和蛋白质共提取该方案适合于从 30~50mg 肌肉, 皮肤, 结缔组织等富含高分子量的肌纤维样品中提取核酸和蛋白质 以下离心均在室温下进行 1. 称取 30~50mg 组织, 加入 500µl RL Buffer 和 500µl Buffer PHC 选择合适的匀浆工具进行匀浆, 详细参照第 6 页的 样品的打散及匀浆 2. 静置 5 分钟 室温下,14,000 x g 离心 3 分钟去除不溶解的物质 3. 转移上清液至新的离心管中, 加入 200µl 氯仿, 涡旋混匀 室温下,14,000 x g 离心 3 分钟 提取 DNA 4. 把 HiPure DNA Mini Column II 装在 2ml 收集管中 把第三步获得的上清液转移至 DNA 柱中 10,000 x g 离心 1 分钟 转移滤液至新的 2ml 离心管中, 用于 RNA 保留有机相溶液用于蛋白质的抽提 5. 取 HiPure DNA Mini Column II 装回 2ml 收集管中 加入 500µl Buffer DW1 至柱子中 10,000 x g 离心 30~60 秒 6. 倒弃流出液, 把柱子装回收集管中 加入 500µl Buffer RW2( 已用乙醇稀释 ) 至柱子中 10,000 x g 离心 30~60 秒 7. 倒弃流出液, 把柱子装回收集管中 加入 500µl Buffer RW2( 已用乙醇稀释 ) 至柱子中 10,000 x g 离心 30~60 秒 8. 倒弃流出液, 把柱子套回空的收集管 10,000 x g 离心空柱 1 分钟, 以甩干柱子的基质 9. 将 DNA 柱子装在 1.5ml 离心管中 加入 30~100µl 预热至 65 C Buffer AE 至柱子的膜中央 室温静置 5 分钟,10,000 x g 离心 1 分钟 弃去 DNA 柱, 把 DNA 保存于 2~8 C 或 -20 C ( 可选 ) 再加入 30~100µl 预热至 65 Buffer AE 至柱子的膜中央 室温静置 3 分钟 10,000 g 离心 1 分钟 第 9 页共 16 页

10 提取 RNA( 含小分子 RNA) 10. 取第 4 步得到的滤液 加入 1.5 倍体积的无水乙醇至上清液, 涡旋混匀 若需分离大分子 RNA 和小分子 RNA, 按方案 3 进行操作 11. 把 HiPure RNA Mini Column 装在 2ml 收集管中 转移 700µl 混合液至柱子中 10,000 x g 离心 30~60 秒 12. 倒弃滤液, 把柱子装回收集管中 转移剩余的混合液至柱子 10,000 x g 离心 秒 13. 倒弃滤液, 把柱子装回收集管 加入 600µl Buffer RW2( 已用乙醇稀释 ) 至柱中,10,000 g 离心 秒 Buffer RW2 在使用之前, 须按瓶子标签指示加入无水乙醇进行稀释 14. 倒弃滤液, 把柱子装回收集管 加入 600µl Buffer RW2( 已用乙醇稀释 ) 至柱中,10,000 g 离心 秒 15. 倒弃流出液, 把柱子装回收集管 10,000 g 离心空柱 2 分钟, 以甩干柱子的基质 ; 这一步可彻底去除柱子中残留的乙醇 16. 将柱子转移至 1.5ml 离心管 加入 30-50µl RNase Free Water 至柱子膜中央 室温静置 2 分钟 10,000 g 离心 1 分钟 弃去柱子, 把 RNA 保存于 -80ºC HiPure RNA Column 最小的洗脱体积是 30µl, 小于 30µl 会导致 RNA 的洗脱效率下降 若 RNA 产量超过 30µg, 推荐进行第二次洗脱 提取总蛋白质 17. 取第 4 步获得的下层有机相溶液, 并转移至合适的离心管中 18. 加入 3 倍体积的异丙醇至有机相溶液中, 涡旋混匀 19. 室温静置 10 分钟 20. 4ºC,12,000 x g 离心 10 分钟沉淀蛋白质 倒弃上清液 21. 加入 1.5ml Buffer PWB( 已加乙醇 ) 至蛋白沉淀中, 涡旋混匀 室温静置 20 分钟 第 10 页共 16 页

11 22. 4ºC,7,500 x g 离心 10 分钟沉淀蛋白质 倒弃上清液 23. 重复第 22~23 步一次 24. 加入 1.5ml 无水乙醇至蛋白沉淀中, 涡旋混匀 室温静置 20 分钟 25. 4ºC,7,500 x g 离心 10 分钟沉淀蛋白质 倒弃上清液 26. 空气干燥 10 分钟 27. 加入适量体积的 1~5% SDS Buffer(100~200µl) 至沉淀物, 用移液枪反复吸打让沉淀充分分散 55ºC 振荡温育 30~120 分钟让蛋白质充分溶解 28. 4ºC,10,000 x g 离心 5 分钟去除不溶解的物质 29. 转移上清至新的离心管中, 用于蛋白质分析实验 第 11 页共 16 页

12 方案 3. 大分子和小分子 RNA 分离该方案适合于方案 1 或方案 2 中分别提取大分子 RNA 和小分子 RNA, 以下离心都在室温下进行 1. 按方案 1 的第 1~3 步 方案 2 的第 1~4 步进行操作获得含 RNA 的滤液 2. 加入等倍体积的 70% 乙醇至滤液中, 用移液枪吸打 3~5 次 大分子 RNA 的分离 3. 把 HiPure RNA Mini Column 装在 2ml 收集管中 转移第 3 步的混合液 ( 700µl) 至 RNA 柱子中 10,000 x g 离心 1 分钟 保留或收集滤液至新的离心管中, 用于小分子 RNA 的富集 4. ( 若混合液超过 700µl) 把柱子装回收集管中 把剩余混合液转移至 DNA 柱子中 10,000 x g 离心 秒 保留或收集滤液至新的离心管中, 用于小分子 RNA 的富集 5. 倒弃滤液, 把柱子装回收集管 加入 600µl Buffer RW2( 已用乙醇稀释 ) 至柱中,8,000 g 离心 秒 Buffer RW2 在使用之前, 须按瓶子标签指示加入无水乙醇进行稀释 6. 倒弃滤液, 把柱子装回收集管 加入 600µl Buffer RW2( 已用乙醇稀释 ) 至柱中,8,000 g 离心 秒 7. 倒弃流出液, 把柱子装回收集管 10,000 g 离心空柱 2 分钟, 以甩干柱子的基质 ; 这一步可彻底去除柱子中残留的乙醇 8. 将柱子转移至 1.5ml 离心管 加入 30-50µl RNase Free Water 至柱子膜中央 室温静置 2 分钟 10,000 g 离心 1 分钟 弃去柱子, 把 RNA 保存于 -80ºC HiPure RNA Column 最小的洗脱体积是 30µl, 小于 30µl 会导致 RNA 的洗脱效率下降 若 RNA 产量超过 30µg, 推荐进行第二次洗脱 小分子 RNA 的富集 9. 测量滤液体积 ( 第 3~4 步 ), 加入 0.65 倍体积的无水乙醇至滤液中, 用移液枪 第 12 页共 16 页

13 吸打混匀 3~5 次 ( 举例 : 若滤液体积为 1ml, 则需加入 0.65ml 无水乙醇 ) 10. 把 HiPure RNA Mini Column 装在 2ml 收集管中 转移 700µl 混合液至 RNA 柱子中 10,000 x g 离心 30~60 秒 收集滤液并转移至合适的离心管中或倒弃滤液 11. 把柱子装在收集管中 继续把混合液转移至 RNA 柱子中 10,000 x g 离心 30~60 秒 收集滤液并转移至离心管或倒弃滤液 重复此步直至所有混合液转移至柱子中并离心 若需提取蛋白质, 把收集滤液保存起来, 按附加方案 4 进行总蛋白质的提取 若不需要提取蛋白质, 倒弃滤液 12. 倒弃流出液, 把 RNA 柱子装回收集管中 加入 600µl Buffer RW2( 已用乙醇稀释 ) 至柱子中 10,000 g 离心 秒 Buffer RW2 在使用之前, 必须用无水乙醇进行稀释 按瓶子标签或说明书进行稀释 13. 倒弃流出液, 把 RNA 柱子装回收集管中 加入 600µl Buffer RW2( 已用乙醇稀释 ) 至柱子中,10,000 g 离心 秒 14. 倒弃流出液, 把 RNA 柱子装回收集管中 10,000 g 离心空柱 3 分钟 15. 把柱子装在新的 1.5ml 离心管中 加入 15~50µl DEPC 水至柱子的膜中央 室温静置 2 分钟 10,000 g 离心 1 分钟 16. 弃去 RNA 柱子, 把 mirna 保存于 -80 C 第 13 页共 16 页

14 常见问题回答该列表可能有利于解决提取过程所碰到的问题 Magen 技术人员可以随时为您提供服务, 若您对试剂盒存在问题或建议, 或您在分子生物学上碰到问题, 都请您联系我们 我们将竭尽所能为您排忧解难 现象柱子堵塞样品匀浆不充分样品起始用量太多低温离心 原因及解决方法用匀浆器进一步匀浆, 提高样品的裂解效果 ; 减少样品用量或增加裂解液 RL 的用量 ; 减少样品用量 正确的样品用量是获得理想结果的先决条件 ; 过多的细胞用量反而会造成产量和纯度的下降 试剂盒中除特别指明, 所有的离心操作都必须在室温 (20-25 ) 离心条件低于 20 时, 可能会导致沉淀的形成而引起柱子堵塞 RNA 产量低 样品匀浆不充分样品起始用量太多 RNA 的洗脱效率低培养液没彻底去除 Buffer RW2 没有加入乙醇稀释 参照上面参照上面 DEPC 水需直接加到膜上, 并静置 2 分钟后, 再离心洗脱 ; 加入 DEPC 水太少 建议进行第二次或第三次洗脱从细胞中提取 RNA 时, 要把培养液彻底吸弃 Buffer RW2 使用前, 必须加入无水乙醇进行稀释 RNA 降解 样品用量太多 RNA 酶污染 β- 疏基乙醇或 DTT 减少样品用量 正确样品用量是获得理想结果的先决条件操作过程引入 RNA 酶的污染或溶液污染使用前, 分装适量的 Buffer RL, 每 1ml Buffer RL 加入 20µl β- 疏基乙醇或 1M DTT, 以提高裂解液的抑制能力 第 14 页共 16 页

15 DNA 污染 样品用量太多 样品匀浆不充分 减少细胞用量 提高匀浆效果打断高分子量基因组 DNA, 降解裂解液的粘 稠度 下游实验结果不理想 盐类污染 乙醇污染 加入 Buffer RW2 后, 静置 3 分钟再离心 确保空柱离心时速度 12,000xg, 离心时间为 2 分钟 膜材料脱落 A260/230 太高 硅胶膜在离心过程中可能会发生脱落 脱落的颗粒是不溶解的, 可通过 12,000 x g 离心 2 分钟去除 由于异硫氰酸胍在 A230 中有较高的本底吸收峰 当核酸浓度低于 50ng/ul 时, 较高的本底 A230 吸收峰, A260/230 有可能小于 1.0, 但不会影响抑制下游应用 第 15 页共 16 页

16 Note: 第 16 页共 16 页

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