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1 一般实验室使用, 仅用于体外 通用植物总 RNA 大量提取试剂盒 ( 离心柱型 ) 用于快速提取各种动植物细胞 / 组织基因组和 RNA 目录号 :RP3311(5 次 ) RP3312(10 次 ) 使用手册 2008 年 11 月, 第 1 版 北京百泰克生物技术有限公司 BioTeke Corporation 地址 : 北京海淀区留学人员创业园 电话 : 传真 : 网址 : info@bioteke.com 北京百泰克生物技术有限公司 Bioteke Corporation

2 目 录 一 试剂盒组成 储存 稳定性 一 试剂盒组成 储存 稳定性 1 二 原理简介 2 三 试剂盒特点 2 四 注意事项 2 五 操作步骤 4 六 疑难解答 6 试剂盒组成 保存 5 次 (RP3311) 10 次 (RP3312) 裂解液 PL 室温 (-20 长期 ) 55 ml 110 ml 去蛋白液 RE 室温 50ml 100ml 漂洗液 RW 4 一个月 (-20 25ml 25ml*2 长期 ) 第一次使用前按说明加指定量乙醇 RNase-free H 2 O 室温 10ml 20ml 22.5ml RNase-free H 2O 45mlRNase-free H 2O 70% 乙醇 室温 第一次使用前按说明加指定量乙醇 RNase-free 过滤柱 室温 5 个 10 个 RNase-free 吸附柱 RA 室温 5 个 10 个 收集管 (50ml) 室温 10 个 20 个 本试剂盒在室温储存 12 个月不影响使用效果 注意事项 1. 第一次使用前请先在漂洗液 RW 瓶和 70% 乙醇瓶中加入指定量乙醇, 加入后请及时打钩标记已加入乙醇, 以免多次加入! 2. 所有的溶液应该是澄清的, 如果环境温度低时溶液可能形成沉淀, 此时不应该直接使用, 可在 37 水浴加热几分钟, 即可恢复澄清 3. 不合适的储存于低温 (4 或者 -20 ) 会造成溶液沉淀, 影响使用效果, 因此运输和储存均在室温下 (15-25 ) 进行 4. 避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发 氧化 PH 值变化, 各溶液使用后应及时盖紧盖子

3 二 原理简介本产品是 BioTeke 自主开发的独特产品, 其原理完全不同于异硫氰酸胍 / 酚 / 氯仿提取方法, 克服了后者不能区分 RNA ( 本质上是多糖 ) 和其他植物多糖的缺点, 能高效将 RNA 和其他植物多糖分开, 同时还能有效去除多酚和其他植物次级代谢成份, 适合于绝大部分用 TRIZOL 和 QIAGEN Rneasy mini kit 无法提取的植物, 并在近一百多种各类植物 ( 包括十分棘手的松柏类植物 ) 中得到验证 本产品还可以用于富含粘性糖蛋白的动物组织 三 试剂盒特点 1. 离心吸附柱内硅基质膜全部采用进口世界著名公司特制吸附膜, 柱与柱之间吸附量差异极小, 可重复性好 克服了国产试剂盒膜质量不稳定的弊端 2. 稳定性好 纯度高 方便快捷的优点, 不需要异丙醇沉淀和乙醇洗涤过程,RNA 可以直接从离心柱上洗脱避免了过度干燥不易溶解问题 3. 多次漂洗去蛋白过程, 提取 RNA 纯度更高 四 注意事项 ( 实验前必须首先阅读这部分!) 1. 为防止 RNA 降解, 所有离心步骤如未加说明, 均在 4 低温进行 使用转速可以达到 10,000 rpm 的传统台式离心机. 2. 裂解液 PL 和去蛋白液 RE 中含有刺激性有害化合物, 操作时要戴乳胶手套, 避免沾染皮肤 眼睛和衣服 若沾染皮肤 眼睛时, 要用大量清水或者生理盐水冲洗 3. 预防 RNase 污染, 在实际的操作中应遵循以下指南 ( 参见 分子 克隆 ) * 全程佩戴一次性手套 皮肤经常带有细菌和霉菌, 可能污染 RNA 的抽提并成为 RNA 酶的来源 培养良好的微生物实验操作习惯预防微生物污染 * 使用灭菌的 一次性的塑料器皿和自动吸管抽提 RNA, 避免使用公共仪器所导 致的 RNA 酶交叉污染 * 使用无 RNA 酶的非一次性的玻璃器皿或塑料器皿 玻璃器皿可以在 150 C 的 烘箱中烘烤 4 小时, 塑料器皿可以在 0.5 M NaOH 中浸泡 10 分钟, 用水彻底漂 洗干净后高压灭菌备用 4. 常规的琼脂糖凝胶电泳和变性胶电泳均可以用来分析 RNA 的质 量 好的 RNA 产物在电泳后应该可以看到明显的二条优势核糖体 RNA 带, 分别为 ~5Kb(28S),~2Kb(18S), 条带亮度比值约为 2:1 有时候也可以看到 ~0.1kb 和 0.3Kb(5S,tRNA) 带 但有时候 根据不同的物种如某些植物组织可以看到 4,5 条带也属于正常现 象, 如果 RNA 未成熟的前体或者不均一核 RNA 小核 RNA 提取 出来也可能看到介于 7Kb 和 15Kb 之间的不连续的高分子量条带 5. 检测 OD 260 /OD 280 吸光度比值时,RNA 样品应该溶于 TE 后检测, 如 果用水稀释后检测, 由于一般水离子强度和 PH 值低, 会使 OD 280 升高, 从而使比值降低 五 操作步骤 * 第一次使用前请先在漂洗液 RW 瓶和 70% 乙醇瓶中加入指定量乙醇! 事先将裂解液 PL 65 C 预热, 使用前加入 β- 巯基乙醇到终浓度 0.2% 1. 匀浆处理 取 1~2g 植物组织于液氮中研磨, 时间要短, 要保持研钵中有液氮 组 织样品容积不能超过 PL 容积的 10%) 2. 转移样品至已事先加入 10ml 裂解液 PL 的 50ml RNase free 离心管中, 涡旋振荡混匀, 避免有团块存在, 在 65 C 条件下孵育 10 分钟以使核

4 蛋白体完全分解, 期间颠倒混匀几次 3. 室温 (15-20 C ) 条件下 10,000rpm 离心 10 分钟, 小心取上清转入一个新的 RNase free 过滤柱中 ( 若上清表面有漂浮物, 用枪头挑开吸取下面液体即可 ) 4. 室温 8,000rpm 离心 60 秒 收集下滤液 ( 含有总 RNA) 于收集管中, 进行下一步操作 5. 在收集管中加入 1 倍体积 70% 乙醇 ( 请先检查是否已加入无水乙醇!), 上下颠倒混匀 ( 在富含淀粉或者多糖的样品中会出现混匀后溶液浑浊现象, 此时过柱会出现堵柱情况, 请在混匀后先 8,000rpm 离心 60 秒, 取上清液转入吸附柱 RA 中 ) 将得到的溶液转入吸附柱 RA 中 ( 吸附柱套在收集管内, 柱容 10ml), 溶液太多可以分次过柱 6.4 C 10,000rpm 离心 60 秒, 弃掉废液, 将吸附柱重新套回收集管 7. 加 10ml 去蛋白液 RE,4 C 10,000rpm 离心 60 秒, 弃掉废液 8. 加入 10ml 漂洗液 RW( 请先检查是否已加入无水乙醇!),4 C 10,000 rpm 离心 60 秒, 弃掉废液 9. 加入 10ml 漂洗液 RW,4 C 10,000 rpm 离心 60 秒, 弃掉废液 10. 将吸附柱 RA 放回空收集管中,4 C 10,000 rpm 离心 3 分钟, 尽量除去漂洗液, 以免漂洗液中残留乙醇抑制下游反应 11. 取出吸附柱 RA, 放入一个新的 50ml RNase free 离心管中, 根据预期 RNA 产量在吸附膜的中间部位加 μl RNase free water( 事先在 水浴中加热效果更好 ), 室温放置 3 分钟,10,000 rpm 洗脱体积越大, 洗脱效率越高, 如果需要 RNA 浓度较高, 可以适当减少洗脱体积, 但是最小体积最好不少于 500μl, 体积过小降低 RNA 洗脱效率, 减少 RNA 产量 12. DNA 去除, 请参考相关说明书 以 Promega RQ1 RNase-Free Dnase 为例 在 2ml RNase free 离心管加入下列溶液 RQ1 RNase-Free DNase 50μl RQ1 DNase 10 Reaction Buffer 50μl RNA 400μl a. 37 反应 30 分钟 b. 加入等体积的苯酚 / 氯仿 / 异戊醇 (25:24:1) 涡旋混匀 室温,10,000 rpm 5 min 离心, 取上清 c. 加入 50 μl 3 M 醋酸钠,1250 μl 冷乙醇, 冰上放置 10 min d. 4,10,000 rpm 15 min 离心, 弃上清 e. 加入 70% 冷乙醇洗净,4,10,000 rpm 5 min 离心, 弃上清 f. 沉淀干燥 g. 用适量的 RNase Free dh2o 溶解后, 进行 Agarose 电泳检测 六 疑难解答 (Trouble shooting) 见后页表格 离心 3 分钟 如果需要更多的 RNA, 可将得到的溶液重新加入离心 吸附柱中, 离心 3 分钟, 或者另外再加 500μl RNase free water, 离心 1 分钟, 合并两次洗脱液

5 出现的问题可能的原因建议解决方法 产量低样品裂解或者匀浆不彻底液氮研磨的时候尽量研磨完全, 加入裂解液 PL 后剧烈震荡或者 接前表 出现的问题可能的原因建议解决方法 用枪头吹打帮助裂解 匀浆步骤 污染了蛋白或者苯酚 可以提高产量 新鲜组织或者植 RNA 降解, 完整性不 RNA 提取所用各种物品 按照注意事项准备 RNA 提取的各种 物组织可以不需液氮, 直接在干 佳 和试剂没有灭活 RNA 酶 用品 净研钵内加入适量裂解液 PL 直 组织取出后没有马上处理 组织应该尽量立刻处理, 不能及时处 接研磨 或冷冻, 提取前已经降解 理的应该尽快保存于 RNAfixer 液 使用的样品或者裂解物在 存放时间过长可能降低 RNA 产 氮或者 或者 -70 存放太 量, 应尽快的处理样品或者裂解 提取的 RNA 样品没有保 尽可能的将 RNA 保存在 -70 的低 久 物 存在 -20 或 -70 低温 温 组织本身含 RNA 少 不同类型的组织和细胞含有不同 样品提取过程中降解 提取动作应该尽可能的快, 离心应该 量的 RNA, 对于含量少的组织应 低温进行, 取用 RNA 时尽量冰上进 该适当提高起始处理量 行 超过了吸附柱的最大吸附 同一个样品使用多个吸附柱, 然 下游的 RT-PCR 实验 忘记做步骤 10, 或者将吸 确保做了步骤 10, 然后小心取出吸 能力 后合并得到 RNA 不成功 附柱取出时下端碰到了收 附柱, 可以在空气中晾几分钟, 让残 漂洗液 RW 内忘记加乙醇 第一次实验时, 漂洗液 RW 瓶和 集管里面的漂洗液, 造成 留乙醇挥发 70% 乙醇瓶中加入指定量无水乙 洗脱下来的 RNA 含有乙 醇 醇, 乙醇抑制了逆转录反 OD 260/OD 280 吸光度比 分光光度计检测吸光度 检测时用 TE 稀释样品 应 值 <1.6 时,RNA 样品不是溶于 TE, 而是溶于水 低离子 浓度和低 ph 条件下, OD 280 值会较高, 造成比 值低

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