SciFinder Web 使用介绍 李虹 SciFinder 培训专员 2014.10.28
提纲 SciFinder Web 介绍 SciFinder Web 中的内容 SciFinder Web 中的特色功能 SciFinder Web 中的检索答疑 SciFinder Web 中的物质记录及物质有关检索 SciFinder Web 中的反应记录及反应设计 SciFinder Web 中的 Sciplanner 的应用 SciFinder Web 中的文献记录及文献有关检索 SciFinder Web 检索注意事项 2
SciFinder 的覆盖内容 CAS REGISTRY SM >8300 万有机无机物质 >6400 万生物序列 >4 亿条实验和预测数据 物质报道文献, 回溯到 1802 年 每天更新 References References from CAplus SM >3800 万期刊, 专利, 学位论文记录. >1 万种科技期刊的覆盖 63 家专利发行机构的专利 1997 年以来的 3.65 亿条引文记录 回溯到 1800 年 每天更新 References from MEDLINE > 1900 万条生命科学相关文献 > 5600 期刊 回溯到 1946 年 每天更新 Markush Structures >100 万专利中的 Markush 结构 回溯到 1961 年 每天更新 CHEMLIST 全球范围内的法规信息 >30.8 万的化合物 1980 至今的数据 每周更新 SciFinder Reactions CASREACT CAS 提供的反应信息包含 : 反应中的结构信息 反应中所有物质的 CAS No 详细的反应条件 实验过程 >5760 万单步多不反应 >1350 万物质合成制备信息 反应回溯到 1840 反应条件起始于 2003 每天更新 CHEMCATS CHEMCATS 提供物质的供应商信息 >7500 万商业信息 >2600 万不同种类物质 >880 个全球范围内的供应机构 >1,005 商品目录的覆盖 每周更新 3
SciFinder Web 的登录界面 https://scifinder.cas.org 4
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Experimental Procedure 的获取 6
Group By Reaction 同一类反应被整合到一起并以通式结构集中显示 ; 未被分类的反应显示在结果集最后 7
Similar Reaction 选择相似反应的相似限制 Broad: 仅反应中心相似 Miedum: 反应中心及附属原子和健 Narrow: 反应中心及扩展的原子和健 8
SciPlanner 合成路线的设计 9
生物活性及靶点信息 物质的生物活性和靶点信息, 直接点击, 获得相关文献 10
Markush 检索用于初步专利评估 11
1998- 今 CAPLUS 中的美国专利直接下载 PDF 文档 1998 年至今的 CAPLUS 中的美国专利直接下载 PDF 文档 12
chemdraw 直接链接到 SciFinder
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SciFinder 中的物质结果界面 一个完整的物质结果界面包含 : 物质详情连接 文献连接 反应连接 商品信息连接 管制品信息连接 谱图连接 实验性质连接 15
Substance Detail 查看物质详细信息 物质的的 CAS 号 分子式 结构式 化学名 别名 按照 CAS Role 分类的专利 非专利文献列表 对某类文献感兴趣, 仅需点击交叉处的即可方便快捷地获取 16
Substance Detail 查看物质详细信息 物质的生物活性和靶点信息, 直接点击, 获得相关文献 17
Substance Detail 查看物质详细信息 18
Substance Detail 查看物质详细信息 19
Substance Detail 查看物质详细信息 物质的实验谱图 20
物质有关的反应 21
物质有关的商业来源 可以直接 Export 到 Excel 中, 又或者使用分析工具, 对商业信息进行处理 22 22
物质有关的文献信息 一键获得文献, 可以获得全部, 也可以勾选特别感兴趣的内容, 不勾选, 默认获得全部 23
SciFinder 中的物质检索方法 功能方面 物质名称,CAS No 分子式 结构式 理化性质 推荐的物质检索功能 有机物, 天然产物及衍生物 --- 结构比较方便 无机物 --- 分子式比较方便 高分子化合物 --- 首先分子式, 其次结构 24
物质名称检索 直接输入物质的名称,CAS No, 俗名, 都能检索, 一次最多检索 25 个物质, 用换行换开 25
理化性质检索 26
分子式检索 SciFinder 中的分子式的检索, 需要按照 HILL 排序方式输入, 简单来说,CH 写前面, 其他的按照字母顺序写 27
结构式检索 28
SciFinder 结构绘制工具 铅笔元素周期表可变基团重复基团工具碳链工具选择工具环锁定工具旋转工具正电子 橡皮常用基团 R 基团定义工具可变位置连接工具模版工具索套选择工具原子锁定工具镜面旋转工具 C 原子和单键恢复工具 结构和反应切换功能 结构检索选择 单双键,RS 构型, 不确定键定义工具 负电子 常见环, 多元环工具 29
精确结构检索 检索金属配合物 P t Bu t Bu N P Ni Cl BF 4 该结构中包含 : 配体金属阳离子阴离子 Bu t t Bu 30
检索界面 任何一种结构, 使用精确结构都可以检索到 31 31 31
我想获得以下的一系列物质 CHO N CHO N CHO N CHO Cl NH Cl NH Cl N H Cl N H N N O Cl N CHO Cl N CHO Cl N H H H CHO Cl N H CHO 32
结构定义 用亚结构检索获得所有的物质 33
亚结构检索结果 34
相似结构检索 这是一个不存在的化合物, 有没有办法通过寻找类似物的方法, 找到这个化合物的合成方法 35
相似结构检索 SciFinder 会依据相似度给出相似度表格, 选择高分值的看 36
和原本结构相似的结构 结构存在相似, 但又不一样, 可依据这些化合物的制备方法, 制备目标化合物 37
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SciFinder Web 中的反应记录 1. 反应分组功能 2. 反应排序功能 3. 反应后处理功能 4. 反应全景及实验过程 5. SciPlanner 39
SciFinder 中的反应设计 检索要求 单一环上存在 Br 或者 I 寻找脱 Cbz 的反应条件 一步反应 定义困难 : 如何定义这个环系, 杂环?C 环? Cbz 和环的连接方法 40
有些人会这么定义 反应中心定义正确, 但是会出现问题 41
检索出来的结果 存在我们想要的结果集 42
但是, 更多的是 存在大量的环与 Cbz 不在一个结构上的反应 43
SciFinder 中的碎片反应检索 这种类型的反应, 需要先去检索和反应相关的物质 44
亚结构物质检索, 获得所有可能的反应物 需要定义为单一组分和具备反应物或者试剂角色的物质 45
所有可能的反应物 获得所有的可能的反应物, 并获得这些物质作为反应物的反应 46
可能反应物所参与的反应 这里的反应中的反应物都包含我们要求的结构, 但是还缺少反应中心的定义 47
第一次限定, 获得单步反应 限定反应步数为一步反应 48
第二次限定, 限定反应中心 反应中心沿用之前的定义 49
限定后的结果 都是我们想要的反应结果 50
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SciPlanner 更加直接的管理结果的方法 勾选感兴趣的反应 点击 Send to SciPlanner 52
SciPlanner 创建新的 SciPlanner 文件 每次使用 SciPlanner, 建议都新建一个文件, 以保证不被之前的文件所干扰 53
SciPlanner 拖入反应, 并尝试中间体反应检索 将右侧的反应, 拖入 SciPlanner 中 如对其中一个物质的合成很感兴趣, 可以直接点击, 使用物质标准菜单, 获得它的合成方法 54
SciPlanner 拼合反应 获得感兴趣物质的合成路线 并将感兴趣的反应和上述的步骤一样, 推送到 SciPlanner 中 用鼠标将这两个结构拖至重贴状态 55
SciPlanner 设计好的路线 可以将该结果保存成 PDF, 用于组内分享 56
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SciFinder 中的文献记录 一篇完整的文献界面包括 : 1. 题录信息 2. 摘要信息 3. 文献中重要的概念 4. 文献中重要的物质 5. 书目信息 6. 获得文献中的物质, 反应, 引文等 7. 文献中的引文信息 58
SciFinder Web 中的主题检索 主题 : activator of AMPK ( 腺苷酸活化蛋白激酶激活剂 ) 使用介词来连接关键词, 点击 Search 59
主题检索的候选项 Concept 表示做了同意词的扩展 Closely associated with one another 表示同时出现在一个句子中 present anywhere in the reference 表示同时出现在一段话中 60
SciFinder 中的文献检索结果 文献分析工具 61
SciFinder 中的 Analysis 领域内主要研究人员, 专家 主要研究机构, 合作伙伴, 竞争对手 主要出版杂志, 机构, 潜在投稿期刊 62
SciFinder 中的 Analysis 索引词 (Index Term): 可以帮助我们对文献的内容进行大致的了解 选择感兴趣的内容, 点击 Apply 63
SciFinder 中的 Refine Refine : 帮助用户迅速获得需要的文献中科院 64
SciFinder 中的 Categorize 通过历史导航条回到任一检索界面 Categorize 系统分类功能, 基于 Index Term, 对文献依学科方向进行分类 65
SciFinder 中的 Categorize 一级目录二级目录和二级目录相关的 Index Term 选中的 Index Term 66
SciFinder 主题检索小结 关键词之间用介词连接,with,of,in,on 建议 2-3 个关键词, 最多不超过 5 个 候选项选择包括包含 Concept 和 Closed associated with 的选项 可以使用 KMP 时时跟踪文献 可以使用 Citing Reference 排序获得被引次数最多的文献 尽可能多的使用 Analyse,Refine 功能对文献进行处理 使用 Categorize 对文献进行系统分类 可以使用历史导航条返回任意检索界面 67
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SciFinder Web 常见问题 账号或密码错误, 请在 username 处填写, 截图, 并与图书馆联系 69
SciFinder Web 常见问题 任何需要反馈给图书馆的问题, 都请点击测试 IP 地址的链接 http://www.cas.org/cgi-bin/casip 将页面截图下来, 一并发给图书馆 70
SciFinder Web 的注意事项 SciFinder Web 的系统要求 Windows 用户支持 IE 9.x 或者 FireFox 2.x Mac 用户支持 Firefox 和 Safari Java 安装 ( 初次使用结构时自动安装, 建议安装 Java 7) 鉴于 360 浏览器, 及 360 安全卫士会对 SciFinder Web 的使用造成一定的影响, 如打不开全文链接, 无法下载, 并会对 SciFinder 的一些功能进行屏蔽, 我们建议不要使用 360 浏览器访问 SciFinder, 即使在用其他浏览器的时候, 也请关闭 360 安全卫士 71
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Thank You 李虹 SciFinder 培训专员 Mail:Della@igroup.com.cn Tel:010-82318288-807 73