分子生物学中使用的缓冲液和贮存液的配制 ph 缓冲液 酶贮存液 酶稀释缓冲液 酶反应缓冲液 杂交缓冲液 预杂交和杂交
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- 兹 尤
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1 ph 缓冲液 酶贮存液 酶稀释缓冲液 酶反应缓冲液 杂交缓冲液 预杂交和杂交溶液 抽提 / 裂解缓冲液和溶液 电泳和凝胶加样缓冲液 特殊的电泳缓冲液 凝胶加样缓冲液 ph 缓冲液 磷酸缓冲盐溶液 (PBS) 137 mol/l NaCl 2.7 mmol/l KCl 10 mmol/l Na 2 HPO 4 2 mmol/l KH 2 PO 4 用 800 ml 蒸馏水溶解 8 g NaCl, 0.2 g KCl, 1.44 g Na2HPO4 和 0.24 g KH2PO4 用 HCl 调节溶液的 ph 值至 7.4, 加水至 1L 分装后在 15 psi( 1.05 kg/cm 2 ) 高压蒸汽灭菌 20 min, 或通过过滤除菌, 保 存于室温 PBS 是一种通用试剂 值得指出的是本文列出的配方缺乏双价阳离子, 如果需要,PBS 可以补加成 1mmol/L CaCl2 和 0.5 mmol/l MgCl2 10 Tris EDTA(TE) ph mmol/l Tris-Cl (ph 7.4) 10 mmol/l EDTA ( ph 8.0 ) ph mmol/l Tris-Cl (ph 7.6) 10 mmol/l EDTA (ph 8.0) ph mmol/l Tris-Cl (ph 8.0)
2 10 mmol/l EDTA (ph 8.0) 分装后在 15psi (1.05kg/cm2) 的高压下蒸汽灭菌 20 min, 在室温保存 Tris-Cl(1mol/L) 用 800 ml 蒸馏水溶解 g Tris 碱, 加浓盐酸调 ph 至所需值 ph HCl ml ml ml 应使溶液冷至室温后, 方可最后调定 ph 值 加水定容至 1L 分装后高压蒸汽灭菌 如果 1mol/ L 溶液呈现黄色, 应予丢弃 并使用质量更好的 Tris Tris 溶液的 ph 值因温度而异, 温度每升高 1,pH 值大约降低 0.03 单位,0.05 mol/l 溶液在 5,25 和 37 时的 ph 值分别为 9.5, 8.9 和 8.6 Tris 镁盐缓冲液 (TM) 50 mmol/l Tris-Cl ( ph7.8) 10 mmol/l MgSO4 Tris 缓冲盐溶液 (TBS) 用 800 ml 蒸馏水溶解 8 g NaCl, 0.2 g KCl 和 3 g Tris 碱, 加入 g 酚红并用 HCI 调 ph 值至 7.4, 用蒸馏水定容至 1L 分装后在 15 psi (1. 05 kg/cm2)y 高压下蒸汽灭菌 20 min, 保存于室温 酶贮存液 溶菌酶 (10mg/ml) 使用前用 10 mmol/ltris-cl ( ph 8. 0 ) 即刻溶解溶菌酶, 配制成 10 mg/ml 浓度的贮存液 配制时要确保 Tris 的 ph 值为 8.0, 如果溶液的 ph 值低于 8.0 则溶菌酶不能有效的工作 溶细胞酶 (67 mg/ml) 用前用含有 50% 甘油的 0.01 rnol/l 磷酸钠配制成 67mg/L(900 U/ml) 胰 DNase Ⅰ(1mg/ml) 用 1 ml 下述溶液溶解 2 mg 粗制胰 DNase I: 10 mmol/ L Tris-Cl ( ph7.5) 150 mmol/l NaCl 1 mmol/ L MgCl2 当 DNase I 溶解时, 加入 1 ml 甘油, 盖紧管口轻轻颠倒几次, 加以混合 避免产生气泡和泡沫 分装后保存于 -20 胰 RNase (1mg/ml) 用 2 ml TE ( ph7.6 ) 溶解 2 mg 粗制胰 RNase I 蛋白酶 K(20 mg/ml) 购来的蛋白酶 K 是冷冻干燥的粉未状物质, 用灭菌的 50 mmol/l Tris ( ph8.0),1.5 mmol/ L 乙酸钙溶解, 配制成浓度为 20 mg/ml 的溶液 将贮存液分装, 在 - 20 下保存 胰蛋白酶
3 用 200 mmol/ L 碳酸氢按 (ph8.9) 配制成 250 μg/ml 浓度 分装后在 -20 下保存 酶解酶 5000(2mg/ml) 使用前用含有 50% 甘油的 0.01 mo1/l 磷酸钠缓冲液配制成浓度为 2 mg/ml 的溶液 酶稀释缓冲液 DNase Ⅰ 稀释缓冲液 l0 mmol/l Tris-C1 (ph 7.5) 150 mmol/l NaCI 1 mmol/l MgCl2 聚合酶稀释缓冲液 50 mmol/l Tris-Cl ( ph 8.1) 1 mmol/l 二硫苏糖醇 (DTT) 0.1 mg/ml EDTA (ph8.0) 0.5 mg/ml 牛血清白蛋白 5% (V/V) 甘油现用现配 测序酶稀释缓冲液 10 mmol/l Tris-Cl ( ph 7.5 ) 5 mmol/l 二硫苏糖醇 (DTT) 0.5mg/ml BSA 贮存于 -20 Taq 稀释缓冲液 25 mmol/l Tris 一 Cl (ph 8. 8) 0.01 mmol/l EDTA ( ph8.0) 0.15%(V/ V)Tween %(V/ V) 乙基苯基聚乙二醇 (NP40) 酶反应缓冲液 重要 : 尽可能使用由厂家提供的 10x 反应缓冲液 否则, 使用下列配方 10 扩增缓冲液 500 mmol/l KCl 100 mmol/l Tris-Cl (ph8.3, 室温下 ) 15 mmol/l MgC12 在 15 psi (1.05 kg/cm2) 高压下蒸汽灭菌 10min 分装后贮存在 X 噬菌体 T4 DNA 连接酶缓冲液 200 mmol/l Tris-Cl (ph7.6) 50 mmol/l MgCl2 50 mmol/l 二硫苏糖醇 (DTT)
4 分装成若干小份 贮存在 -20 要进行反应时加入 ATP 至合适的浓度 ( 如 1mmol/L 10 噬菌体 T4 DNA 聚合酶缓冲液 330 mmol/l Tris- 乙酸 (ph8.0) 660 mmol/l 乙酸钾 100 mmol/l 乙酸镁 5 mmol/ L 二硫苏糖醇 (DTT) 1 mg/ml 牛血清白蛋白分装成小份, 冷冻贮存在 噬菌体 T4 多核苷酸激酶缓冲液 700 mmol/ L Tris-Cl (ph7.6) 100 mmol/l MgC12 50 mmol/l 二硫苏糖醇 (DTT) 分装成小份, 冷冻贮存在 BAL31 缓冲液 3 mol/l NaCl 60 mmol/ L CaCl2 60 mmol/ L MgCl2 100 mmol/ L Tris-Cl (ph8.0) 1 mmol/ L EDTA (ph8.0) 10 去磷酸化缓冲液 ( 用于 CIP) 100 mmol/l Tris-Cl (ph8.3) 10 mmol/l MgCl2 10 mmol/l ZnC12 10 去磷酸化缓冲液 ( 用于 SAP) 200 mmol/l Tris-Cl(pH8.8) 100 mmol/l MgCl2 10 mmol/l ZnC12 1 EcoRI 甲基化酶缓冲液 50 mol/l NaCl 50 mmol/l Tris-Cl (ph8.0) 10 mol/l EDTA 80 µmol/l S- 腺苷甲硫氨酸分装成小份, 贮存于 外切核酸酶 Ⅲ 缓冲液 660 mmol/l Tris-Cl (ph8.0) 66 mmol/l MgCl2 100 mmol/l β- 巯基乙醇用时才加 β- 巯基乙醇 10 Klenow 缓冲液
5 0.4 mol/l 磷酸钾 (ph7.5) 66 mmol/l MgC12 10 mmol/l β- 巯基乙醇 10 接头激酶缓冲液 600 mmol/l Tris-Cl (ph7.6) 100 mmmol/l MgCl2 100 mmol/l 二硫苏糖醇 (DTT) 2 mg/ml 牛血清白蛋白 使用时现配 核酸酶 S1 消化缓冲液 0.28 mol/l NaCl 0.05 mol/l 乙酸钠 (ph4.5) 4.5 mmol/l ZnS04 7H2O 分装成小份, 贮存于 -20 用前加核酸 S1 至浓度为 500U/ml 10 蛋白酶 K 缓冲液 100 mmol/ L Tris-C1 (ph8.0) 50 mmol/ L EDTA (ph8.0) 500 mol/l NaCl 10 反转录酶缓冲液 500 mmol/l Tris-Cl ( ph8.3) 750 mmol/l KC1 30 mmol/l MgC12 RNA 酶 H 缓冲液 20 mmol/l Tris-Cl (ph7.6) 20 mmol/l KCl 0.1 mmol/l EDTA (ph8.0) 0.1 mmol/l 二硫苏糖醇 (DTT) 用时现配制 5 末端转移酶缓冲液 大多数厂家都提供 5 反应缓冲液, 典型的缓冲液含有下列试剂 : 500 mmol/l 二甲胂酸钾 (ph7.2) 10 mmol/l CoCl2 6H2O 1 mmol/l 二硫苏糖醇 (DTT) 5 末端转移酶缓冲液 ( 或加尾 ) 缓冲液 可按照下列方法 (Eschenfeldt et al. 1987) 配制 : 1. 用 10 ml 3mo1/L 乙酸钾在室温下平衡 5g Chelex min 后, 抽气过滤除去过剩的液体 用 10 ml 无离子水洗 Chelex3 次 3. 配制 1 mol/l 二甲胂酸钾溶液 用处理过的 Chelex 树脂平衡二甲胂酸盐溶液
6 4. 借以通过配有 Whatman 1 # 滤纸的漏斗回收二甲胂酸盐溶液 5. 依次将水 二硫苏糖醇和 CoCl2 加入回收的二甲胂酸盐溶液中, 配制成终浓度为 500 mmol/l 二甲 胂酸钾,1 mmol/l 二硫苏糖醇和 20 mmol/ L CoCl2 的溶液 10 通用 KGB( 限制性内切核酸酶 ) 缓冲液 1 mo1/l 乙酸钾 250 mmol/l Tris- 乙酸 (ph7.6) 100 mol/l 四氢乙酸镁 5 mmol/l β- 巯基乙醇 0.1 mg/ml 牛血清白蛋白 分装成小份, 贮存于 -20 杂交缓冲液 碱性转移缓冲液 ( 用于将 DNA 碱转移至尼龙膜上 ) 0.4 mol/l NaOH 1 mol/l NaCl Church 缓冲液 1% (m/v) 牛血清白蛋白 1 mmol/l EDTA 0.5 mol/l 磷酸盐缓冲液 7%(m/V) SDS 变性缓冲液 ( 中性转移, 仅用于双链 DNA) 1.5 mol/l NaCl 0.5 mmol/l NaOH HCl(2.5mol/L) 加 25 ml 浓 HCl(11.6 mol/l) 到 91 ml 蒸馏水中 于室温保存 用于 RNA 的含甲酰胺的杂交缓冲液 40 mmol/l PIPES (ph 6.8) 1 mmol/l EDTA (ph 8.0 ) 0.4 mol/l NaCl 80% (V/V) 去离子甲酰胺用 PIPES 的二钠盐配制缓冲液. 用 1 mol/l HCl 调 ph 至 6.4 用于 RNA 的不含甲酰胺的杂交缓冲液 40 mmol/l PIPES (ph 6.4) 0.1 mmol/l EDTA (ph 8.0) 0.4 mol/l NaCl 用 PIPES 的二钠盐配制缓冲液. 用 1 mol/l HCl 调 ph 至 6.4 中和缓冲液 Ⅰ( 用于将 DNA 转移至不带电荷的膜上 ) 1 mol/l Tris-C1 (ph7.4)
7 1.5 mol/l NaCl 中和缓冲液 Ⅱ( 用于将 DNA 碱性转移至尼龙膜上 ) 0.5 mol/l Tris-Cl (ph7.2) 1 mol/l NaCl 中和液 ( 适于中性转移, 仅用于双链 DNA) 0.5 mol/l Tris-Cl (ph7.4) 1.5 mol/l NaCl 预杂交液 ( 用于斑点 狭缝和 RNA 杂交 ) 0.5 mol/l 磷酸钠 (ph7.2) 7%(m/V) SDS 1 mmol/l EDTA (ph7.0) 预杂交和杂交溶液 预杂交 / 杂交溶液 ( 用于噬菌斑和菌落 ) 50%(V/V) 甲酰胺 6 SSC( 或 6 SSPE ) 0.05 BLOTTO 使用 Church 缓冲液, 可以替代上述溶液 预杂交 / 杂交液 ( 适用于液体缓冲液中的杂交 ) 6 SSC( 或 6 SSPE ) 5 Denhardt's 液 0.5%(m/V ) SDS 1 µg/ml poly(a) 100 µg/ml 鲑鱼精 DNA 预杂交 / 杂交液 ( 适用于甲酰胺缓冲液中的杂交 ) 6 SSC( 或 6 SSPE ) 5 Denhardt's 液 0.5%(m/V ) SDS 1 µg/ml poly(a) 100 µg/ml 鲑鱼精 DNA 50% (V/V) 甲酰胺充分混合后, 用 0.45µm 乙酸纤维素膜过滤 为降低在非严格条件下 ( 如 20%-30% 甲酰胺 ) 杂交的背景, 重要的是使用的甲酰胺要尽量的纯 预杂交 / 杂交液 ( 适用于磷酸 -SDS 缓冲液中的杂交 ) 0.5 mol/l 磷酸缓冲液 (ph7.2) 1 mmol/l EDTA (ph8.0) 7% (m/v) SDS 1% (m/v) 牛血清白蛋白
8 使用电泳级的牛血清白蛋白 使用这种特殊的预杂交 / 杂交溶液不需要封闭剂或杂交率增强剂 20 SSC 用 800 ml H2O 溶解 g NaCl 和 88.2 g 柠檬酸钠, 用几滴 14 mol/l HCl 调 ph 值至 7.0, 用水定 容至 1L 分装后高压灭菌 该试剂的终浓度为 3.0 mol/l NaCl 和 0.3 mol/l 柠檬酸钠 20 SSPE 用 800 ml H2O 溶解 g NaCl,27. 6 g NaH2PO4 H2O 和 7.4 g EDTA 用 NaOH 调 ph 值至 7.4, 用水定容至 1 L 分装后高压灭菌 该试剂的终浓度为 3.0 mol/l NaCl,0.2 mol/l NaH2PO4 和 0.02 mol/l EDTA 抽提 / 裂解缓冲液和溶液 碱裂解溶液 Ⅰ( 制备质粒 ) 50 mmol/l 葡萄糖 25 mmol/l Tris-Cl (ph8.0) 10 mmol/l EDTA (ph8.0) 溶液 Ⅰ 一次可配制 100 ml, 在 15 psi(1.05kg/cm2) 压力下蒸汽灭菌 15 min, 保存于 4 碱裂解溶液 Ⅱ( 制备质粒 ) 0.2 N NaOH( 从 10N 贮存液中现用现稀释 ) 1% (m/v) SDS 溶液 Ⅱ 要现用现配制, 室温下使用 碱性裂解溶液 Ⅲ( 制备质粒 ) 5 mol/l 乙酸钾 60.0 ml 冰乙酸 11.5 ml H2O 28.5 ml 所配成的溶液中钾的浓度为 3mol/L. 乙酸根的浓度为 5 mol/l 保存于 4, 用时置于冰浴中 STET 10 mmol/l Tris-Cl (ph8.0) 0.1 mol/l NaCl 1 mmol/l EDTA (ph8.0) 5%(V/ V) Triton X-100 所有的成分加完后, 确保 STET 的 ph 值为 8.0 用前 STET 不需要灭菌 电泳和凝胶加样缓冲液 常用电泳缓冲液 缓冲液工作液贮存液 /L
9 Tris 乙酸 (TAE) 1 40 mmol/l Tris 乙酸 g Tris 碱 1 mmol/l EDTA 57.1 ml 冰乙酸 100ml 0.5mol/L EDTA (ph8.0) Tris 硼酸 (TBE) mmol/l Tris 硼酸 5 54g Tris 碱 1 mmol/l EDTA 27.5g 硼酸 20ml 0.5 mol/l EDTA (ph8.0) Tris 磷酸 (TPE) 1 90 mmol/l Tris 磷酸 lo 108g Tris 碱 2 mmol/l EDTA 15.5 ml 磷酸 (85%,1.679g/ml) 40 ml 0.5 mol/l EDTA (ph8.0) Tris 甘氦酸 l 25 mmol/l Tris-Cl 5 15.lg Tris 碱 250 mmol/l 甘氨酸 94g 甘氨酸 ( 电泳级 ) 0.1% SDS 50 ml 10% SDS( 电泳级 ) 注 :TBE 通常配制成 5 或 lo 贮存液 浓的贮存液的 ph 值应为 8.3, 用前稀释 由同一浓度贮存液配制凝胶液和电泳缓 冲液 某些人喜欢使用更浓的 TBE 贮存液 (10 而不是 5 ) 但是,5 贮存液更稳定, 在存放时不会出现沉淀 用 0.22 µm 滤膜将 5 或 1O 贮存液过滤可防止或推迟沉淀的形成 特殊的电泳缓冲液 10 碱性琼脂糖凝胶电泳缓冲液 500 mmol/l NaOH 10 mmol/l EDTA 将 50 ml 10N NaOH 和 20 ml 0. 5 mol/l EDTA (ph8.0 ) 加到 800ml 水中, 然后定容至 1L 用前即刻 将 lo 碱性琼脂糖凝胶电泳缓冲液用水稀释成 l 工作液 使用同一 10 贮存液配制喊性琼脂糖凝胶和电 泳工作液 10 BPTE 电泳缓冲液 100 mmol/l PIPES 300 mmol/l Bis-Tris 10 mmol/l EDTA 10 缓冲液的最终 ph 值是 缓冲液的配方如下 : 将 3 g PIPES 游离酸 ) 6g Bis-Tris( 游 离碱 ) 和 2ml 0.5 mol/l EDTA 加到 90m1 蒸馏水中, 然后用焦碳酸二乙酯处理 ( 终浓度为 0.1%) 10 MOPS 电泳缓冲液 0.2 mol/l MOPS (ph7.0) 20 mmol/l 乙酸钠 10 mmol/l EDTA (ph8.0) 用 700 ml 用 DEPC 处理灭菌水溶解 41.8g MOPS 用 2mol/L NaOH 调 ph 值至 7.0 加 20ml DEPC 处 理的 1 mol/l 乙酸钠和 20 m1 DEPC 处理的 0.5 mol/l EDTA (Ph8.0) 用 DEPC 处理的水定容至 1L 用 0.45 µm 的滤膜过滤除菌, 室温避光保存 如果缓冲液暴露于可见光或被高压灭菌则会变黄, 淡黄色的缓冲液完 全可用, 但颜色变深的缓冲液不能使用 TAFE 凝胶电泳缓冲液
10 20 mmol/l Tris 乙酸 (ph8.2) 0.5 mmol/l EDTA 用乙酸调 ph 值至 8.2, 使用 EDTA 的游离酸而不是钠盐 重要 :TAFE 凝胶缓冲液在用前必须冷却至 14 凝胶加样缓冲液 6 碱性凝胶加样缓冲液 300 mmol/l NaOH 6 mmol/l EDTA 18%(m/V) 聚糖体 (Ficoll) (400 型,Pharmacia) 0.15%(m/V) 溴甲酚绿 0.25%(m/V) 二甲苯青 溴酚蓝溶液 (0.4%,m/V) 用 1 ml 灭菌水溶解 4 mg 固体澳酚蓝 室温保存 6 凝胶加样缓冲液 缓冲液类型 6 缓冲液 贮存温度 Ⅰ 0.25%(m/V) 溴酚蓝 % (m/v) 二甲苯青 FF 40 %(m/v) 蔗糖水溶液 Ⅱ 0.25%(m/V) 溴酚蓝 室温 0.25% (m/v) 二甲苯青 FF 15%(m/V) 聚糖体 (Ficoll)(400 型,Pharmacia) 水溶液 Ⅲ %(m/v) 溴酚蓝 % (m/v) 二甲苯青 FF 30%(m/V) 甘油水溶液 Ⅳ 0.25%(m/V) 溴酚蓝 4 40 %(m/v) 蔗糖水溶液 溴酚蓝蔗糖溶液 0.25%(m/V) 溴酚蓝 40%(m/V) 蔗糖 甲酚红溶液 (10 mmol/l) 用 1 ml 灭菌水溶解 4 mg 甲酚红的钠盐 (Alarich ), 室温保存 10 甲醛凝胶加样缓冲液 50% (V/V) 甘油 ( 用 DEPC 处理的水稀释 ) 10 mmol/l EDTA (ph8.0) 0.25%(m/V) 溴酚蓝 0.25%(m/V) 二甲苯青 FF
11 甲酰胺加样缓冲液 80%(m/V) 去离子化甲酰胺 10 mmo1/l EDTA (ph8.0) 1 mg/ml 二甲苯青 FF 1 mg/ml 溴酚蓝 购买蒸馏的去离子化甲酰胺, 分装成小份充氮贮存于 -20 RNA 凝胶加样缓冲液 95 % (V/V) 去离子化甲酰胺 0.025%(m/V) 溴酚蓝 0.025%(m/V) 二甲苯青 FF 5 mmol/l EDTA(pH8.0) %(m/v) SDS 2 SDS 凝胶加样缓冲液 100 mmol/l Tris-Cl (ph6.8) 4% (m/v) SDS( 电泳级 ) 0.2%(m/V) 溴酚蓝 20%(V/V) 甘油 200 mmol/l 二硫苏糖醇 (DTT) 或 β- 巯基乙醇 不含硫代试剂的 1 和 2 SDS 凝胶加样缓冲液可在室温保存 二硫苏糖醇或 β- 巯基乙醇分别配成 1mol/L 或 14 mol/l 的贮存液, 临用前加入 2.5 SDS-EDTA 染料混合液 0.4%(m/V)SDS 30 mmo1/l EDTA 0.25% 溴酚蓝 0.25% 二甲苯青 FF 20% (m/v) 蔗糖
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