研究工具 SciFinder 介绍 CAS 上海代表处高级培训专员俞靓 Tel:021-64453167 Email:Sam@igroup.com.cn www.cas.org 1
Chemical Abstract Service 化学文摘社 我们专注于 : 推动研究 发展与创新 为全球科技与创新领域提供领先的 整合的, 全面的信息 解决方案 To encourage the increase and diffusion of chemical knowledge for the benefit of industry and education 2
Chemical Abstract Service 化学文摘社今天 : 全球最大的学协会组织 本部拥有 800 多博士从 事文献编辑工作 为全球超过 1200 多个 学校提供 SciFinder 桌面 检索平台 3
提纲 SciFinder 介绍 SciFinder 注册及主界面 SciFinder 中的文献检索 SciFinder 中的物质检索 SciFinder 中的 Markush 检索 SciFinder 中的反应检索 4
SciFinder 介绍 ---- 背景 由 CAS 自主开发研究的. 一站式的信息检索平台, 可以检索全球最大的, 有关生物化学, 化学, 化学工程, 医药等化学相关学科的信息 从中可以检索来自专利, 期刊的文献. 最大的二次文献数据库. 全球最大的物质数据库 5
SciFinder 介绍 ---- 组成 期刊专利论文会议报告 Chemcats Chemlist CAPlus Medline 溶剂, 催化剂, 产率等 Registry CASReact 物质基因合成信息 6
SciFinder 介绍 --- 记录数 总数 ( 万 ) CAPlus Medline 有机无机物质生物序列单步多步反应合成制备信息 12000 11380 10000 8000 6000 4000 2000 0 4500 3200 1800 6200 5400 3900 3960 2600 1300 Literature Registry CASReact Chemlist Chemcats 28 7
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SciFinder 的注册和登陆 SciFinder Web 的系统要求 Windows 用户支持 IE 6.x,7.x 或者 FireFox 2.x Mac 用户支持 Firefox 和 Safari Java 安装 ( 初次使用结构时自动安装 ) 在图书馆相关页面上找到 SciFinder Web 注册用的网址 9
点击这个 URL 开始创建 SciFinder 帐号 10
每个用户必须输入各自的信息 确认 ID 的邮件 11
每一个用户都会收到确认函 点击链接完成 SciFinder 帐号的创建 Http://scifinder.cas.org 12
SciFinder 的注册和登陆 输入 SciFinder 帐号和密码 13
SciFinder 登陆后主界面 文献, 物质, 反应检索入口, 默认开始检索文献 在机构中寻找或添加联系人 可用的检索方法 保存过的结果集 邮件提醒结果集 14
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SciFinder 文献检索途径 主题词 作者名 机构名 期刊名 文献 物质 反应 16
文献相关数据库 CAPlus(Pre 1907-) 覆盖化学相关众多学科领域的参考文献 3200 万条文献信息 上万种期刊和 59 个专利发行机构的专利 ( 含专利族 ) 会议录 技术报告 图书 学位论文 评论 会议摘要日更新 3000 条以上的记录 Medline 美国国立医学图书馆出品生命科学医学相关毒理, 病理学报告期刊 临床报告 17
主题检索举例 获得石油裂解催化剂有关的参考文献 petroleum cracking with catalyst 使用介词来连接关键词, 点击 Search 检索前, 也可以提前限定一些内容, 比如年限, 文献类型等 18
Concept 表示做了同意词的扩展 Closely associated with one another 表示同时出现在一个句子中 were present anywhere in the reference 表示同时出现在一段话中 19
获得感兴趣主题的文献 文献记录数 可以快速阅览文献的内容, 是否符合要求 文献分析限定工具 检索命中的字段 20
Analyze 下的分析工具 分析工具提供 12 种分析方法, 包括索引词, 作者名, 机构名, 文献类型, 期刊名称, 出版年限等 在这些分析工具中, 索引词 (Index Term): 可以帮助我们对文献的内容进行大致的了解 学科分析 (CA Section Title): 可以帮助我们对文献进行学科分类 21
Analyze-----Index Term 分析 可以查看到文献中出现的重要的概念, 从而迅速定位文献 勾选感兴趣的概念, 点击 Apply 22
Analyze-----Publication Year 分析 可以选择不同的排列方式, 可以看到该课题的研究趋势 可以导出到 Excel 用于做更多的分析 800 700 600 500 400 300 200 100 0 23 1913 1917 1921 1927 1931 1935 1939 1943 1947 1951 1955 1959 1963 1967 1971 1975 1979 1983 1987 1991 1995 1999 2003 2007 2011
Refine 下的限定工具 限定工具提供 7 种限定方法, 包括主题词, 作者名, 机构名, 文献类型等 在这些限定工具中, 主题词 (Research Topics): 可以让我们用我们关心的主题词再次限定文献 文献类型 (Document Type): 可以让我们直接获得我们感兴趣的文献类型 可以通过 Company Name 限定来自中国的参考文献 24
获得来自中国的参考文献 设定 Email 提醒, 一旦有新的记录, 会发邮件通知 设置提醒文件名和失效时间 25
分析文献来源, 查看竞争对手情况 可以通过历史导航条返回历史检索界面 26
通过历史导航条返回到开始的检索界面 27
使用系统分类工具 Categorize 一级目录 二级目录 和二级目录有关的 Index Term 这里可以选择感兴趣的内容, 用于文献的筛选 28
获得感兴趣的参考文献 点击记录的 Title, 查看记录的详细信息 29
文献的详细记录 点击获取全文 专利信息, 专利中涉及的重要的概念, 重要的物质应用, 都在这里显现出来 30
SciFinder 文献检索小结 主题检索时, 使用介词作为连接 尽量选择包含 Concept 和 Closed Associated with 的候选项 通过 SciFinder 的 Analyze/Refine 功能来缩小检索的范围 尝试将不同的 Analyze/Refine 功能组合起来用, 会有更多的收益 使用 Categorize 可以让系统来实现自动分类 更多细节性操作, 请参考我们的网络资源平台 www.igroup.com.cn/cas 31
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SciFinder 物质检索途径 物质名称, CAS 登记号 文献 分子式 物质 反应 结构部分结构相似结构 33
物质相关数据库 Registry (Pre 1967-) 世界上最大的物质数据库 5400 万个物质 ;6200 万个序列无机物 有机物 聚合物 混合物 合金 核酸蛋白质序列等所有具有 CAS No 物质日更新 4000 多个物质 ChemList 查询备案 / 管控化学信息的工具 Chemcats 4000 万化学物质提供商的联系信息包含价格情况 运送方式 质量等级等信息 34
SciFinder 中的物质检索及后处理 可以通过化学结构, 分子式, 物质标示符来检索物质, 通过 Markush 检索和结构有关的专利 35
通过物质标示符找物质 通过 SciFinder 查询二茂铁 CAS 登记号 : 102-54-5 物质名称 : ferrocene 这里可以通过输入物质的名称,CA 号, 俗名, 商品名, 来进行检索 36
物质检索结果 点击 Substance Detail 获得该物质的详细信息 37
物质的详细信息 物质的结构,CAS 登记号, 俗名, 理化性质, 预测性质, 都能在这里检索到 38
物质的详细信息 二茂铁及其衍生物在各类研究文献中的角色分类 二茂铁的实验理化性质 39
实验谱图信息 二茂铁的质谱图的条件及文献出处 40
获得物质的相关文献 可以选择所有的文献, 或者根据分类获得特定研究方向的文献 41
获得物质的相关反应 可以选择物质在反应中的角色 42
通过结构找物质 点击画图版来进行结构输入, 初次使用时需要安装 Java 插件 43
结构相关工具 铅笔元素周期表可变基团重复基团工具碳链工具选择工具环锁定工具旋转工具正电子 橡皮常用基团 R 基团定义工具可变位置连接工具模版工具索套选择工具原子锁定工具镜面旋转工具 C 原子和单键恢复工具 结构和反应切换功能 结构检索选择 单双键,RS 构型, 不确定键定义工具 负电子 常见环, 多元环工具 44
精确结构检索 检索络活喜, 氨氯地平的苯磺酸盐, 通过氨氯地平可以直接检索到所有的盐类物质 选择精确结构检索方式, 点击确定 45
在主界面上可以看到输入的结构和检索方式 可以提前对物质的特性, 类型, 以及研究方向做一定的限定 46
精确结构检索, 可以检索到物质的盐, 聚合物, 混合物, 配合物等 可以看到检索到了氨氯地平的苯磺酸盐, 以及其他的盐的形式 47
亚结构检索 选择亚结构检索方式, 点击确定 48
在主界面上可以看到输入的结构和检索方式 49
亚结构检索, 可以检索到物质修饰信息 50
Analyze 下的分析工具 一共有 4 种分析功能 提供结构物质角色分析, 元素分析, 商业可购买性分析, 反应提供性分析等 通常可以通过物质角色分析 (Substance Role) 去看看这些物质都存在哪些应用 51
Refine 下的限定工具 一共有 8 种限定功能 提供结构再次限定, 同位素是否包含限定, 金属是否包含限定, 理化性质限定等 通常可以通过结构的再次限定 (Chemical Structure) 去对结构再次修饰 或者通过理化性质 (Property Date) 去找到符合理化性质要求的物质 还可以通过原子附属性 (Atom Attachment) 去分析一下结构上的信息 52
理化性质限定工具 可以通过理化性质限定物质, 选择特定的理化性质, 输入数值范围, 点击 Refine 53
原子附属限定工具 可以限定某原子附属的情况, 根据限定结果, 选择感兴趣的附属原子, 点击 Refine 倘若要求 6 元环上的 N 没有修饰, 同时直链 N 接杂环的物质 54
结构限定工具 直接点击结构, 启动结构编辑, 修改结构, 修改好后点击确定, 55
可以发现结构输入框中的结构也得到适当的变化, 点击 Refine 进行限定 56
相似结构检索 选择相似结构检索方式, 点击确定 57
选择适当的相似分值 分值越高, 相似度越高, SciFinder 只能给出相似度在 60 分以上的物质 58
获得物质的相似结构 取代基不同, 取代基位置不同, 母体结构略有不同得物质 59
结构检索小结 精确结构检索 : 获得物质的盐, 聚合物, 混合物, 配合物等, 母体结构不能修改, 不能修饰 亚结构检索 : 所画的结构必须存在, 母体结构不能修改, 但可以被修饰 相似结构检索 : 获得相似度在 60 分以上的结构, 母体结构可以修改, 也可以被修饰, 用相似度来控制获得的结果 60
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在专利中描述物质的方式 特定物质 [Specific Substance]: 以特定化学结构所陈述的特定物质, 会被标示 CAS No. 预测性物质 [Prophetic Substance]: 使用 Markush 结构所陈述的预测物质, 一个 Markush 可以陈述上百或上千的化学物质 Patent 中所陈述的预测物质, 不会被标示 CAS No. Markush 检索, 能检索到通过结构检索检不到的专利 R1 R1 = H, Br, Cl, I Br, Cl, F, I Br, Cl, F, I R2 = Br, Cl, I, CH 2 halogen, CH halogen, R2 CH 3 62
SciFinder 中的 Markush 检索 SciFinder 中的 Markush 检索能帮助做初步的专利评估 63
Markush 直接检索包含该通式结构的专利 64
其中一篇专利的 Claim 部分 这里描述了 RZ R,Z 的修饰当 : Z=SO2 R=C3-C10 有取代的 C 环时, 符合我们的检索要求 65
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SciFinder 反应检索途径 文献 官能团 物质 反应 结构部分结构 67
反应相关数据库 CAS React(1840-) 源自期刊, 专利中有机 有机金属 无机 生化反应 2600 万单步, 多步反应 1300 万制备信息周更新 68
SciFinder Web 主界面 反应检索入口 69
SciFinder Web 反应界面 点击, 进入画图版 70
SciFinder Web 反应工具 反应箭头 反应角色工具 反应原子标记工具 反应位置标记工具 反应官能团列表 71
检索特定物质之间的反应 CHO COOH 精确反应检索帮助获得特定物质之间的反应, 点击确定 72
可以提前设定反应的溶剂以及不参与反应的官能团 可以自定义一些反应溶剂以及不参与反应的官能团 73
反应检索结果 点击 Overview 查看具体信息 74
反应结果的分析 催化剂分析, 用于找到经济型催化剂实验过程分析, 用于找到有实验过程描述的反应 75
查看实验过程 76
返回最开始的检索结果 77
反应结果的限定 产率限定 反应类型限定 78
一篇文献出现一条反应 选择反应显示方式 这篇记录中包含了 6 条命中的反应 79
相似反应的获取 相似反应检索, 依据和反应中心的相似程度, 查询反应中心彼此相似的反应 80
选择相似级别 对于选择是全部反应中检索相似反应, 还是在当前结果集中检索相似反应 选择相似反应的相似限制 Broad: 仅反应中心相似 Miedum: 反应中心及附属原子和健 Narrow: 反应中心及扩展的原子和健 81
反应检索举例 --- 检索对反应位置和原子有特定要求的反应 O 原子反应前后必须配对 C=O 键必须发生反应 除已有的环外, 不能成环 82
对反应作出条件限定 用 mapping tool 键标示 O 原子反应前后位置 用 site marking tool 键标示 C=O 键反应的位置 用 Lock out ring tool 键锁定环 83
获得符合要求的反应 84
检索注意事项 请合理使用 SciFinder, 千万不要过量下载里面的记录检索完, 请及时退出, 避免资源浪费 检索中遇到任何问题, 请发邮件至 SciFinder@igroup.com.cn 寻求帮助或至 www.igroup.com.cn/cas 下载培训资料以及演示视频 85
谢谢! CAS 中国代表处上海市肇嘉浜路 798 号 605 电话 : 021-64453167 传真 : 021-64155180 Email:Sam@igroup.com.cn 86