2006年年报

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敦闪江
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1 生物多样性与生态工程教育部重点实验室 2006 年年报北京师范大学

2 目录目录... 1 前言... 2 组织机构... 5 年度大事记... 6 研究团队... 8 研究进展... 9 濒危物种保育方向研究进展... 9 进化与理论生态学方向研究进展种群生态与生物入侵研究进展计算分子生物学研究进展区域生态安全评价研究进展水生生物生理生态学研究进展动物种群和行为研究进展科研项目年在研项目年成功申请的项目学术交流与合作年实验室举办的国际国内学术会议实验室成员国外访学进修情况实验室成员参加国际会议情况发表论著年度 SCI 论文年发表的非 SCI 论文年出版译著

3 前言过去的一年里, 在各级领导和许多同行的关怀与支持下, 经全体工作人员和研究生的共同努力, 重点实验室以发展生物多样性科学满足我国生态环境建设的重大需要为目标, 围绕濒危物种保育进化与理论生态学种群动态与生物入侵计算分子生物学区域生态安全评价水生生物生理生态和行为生态等方面的关键科学问题展开了探索, 取得了一系列重要进展同时, 在科研项目申请人才培养队伍建设实验室基础条件建设国际交流与合作等方面也都取得了长足的进步与发展实验室年报总结了过去一年来实验室在各个方面的建设成就, 期望能对实验室内部以及实验室与其他单位的交流与合作有所帮助最后, 向各位同行和实验室全体人员致以诚挚的感谢, 并希望大家能一如继往的支持和关注生物多样性与生态工程教育部重点实验室! 2

4 组织机构实验室主任 : 张大勇教授北京师范大学实验室副主任 : 钟扬教授复旦大学实验室副主任 : 张正旺教授北京师范大学学术委员会学委会主任 : 卢宝荣教授复旦大学委员 ( 按姓氏笔划顺序 ) 王刚教授兰州大学方长明教授复旦大学方精云院士北京大学方盛国教授浙江大学陈家宽教授复旦大学陈小勇教授华东师范大学张大勇教授北京师范大学张正旺教授北京师范大学李博教授复旦大学郑光美院士北京师范大学钟扬教授复旦大学施苏华教授中山大学徐汝梅教授北京师范大学顾红雅教授北京大学葛颂研究员中国科学院植物研究所韩兴国研究员中国科学院植物研究所蒋志刚研究员中国科学院动物研究所魏辅文研究员中国科学院动物研究所 5

5 年度大事记 l 2006 年 3 月 23 日, 教育部发文任命卢宝荣教授为生物多样性与生态工程教育部重点实验室学术委员会主任, 张大勇教授为生物多样性与生态工程教育部重点实验室主任, 任期至 2007 年 10 月 l 2006 年 5 月 1 日 -6 月 3 日, 生物多样性与生态工程教育部重点实验室与中国科学院西双版纳植物园联合组织召开了国际植物繁殖生物学研讨会本次会议邀请了英国皇家学会院士加拿大研究首席 Spencer Barrett 教授等 5 位国际著名植物繁殖生态学科学家和李庆军教授等 5 位国内知名学者,10 位受邀请专家从理论到野外实验对与会研究生进行了全方位的指导 l 2006 年 5 月 8 日, 十一五 211 工程申报工作正式启动 l 2006 年 5 月 29-30, 十五 211 工程建设项目工作顺利通过教育部组织的专家验收检查 l 2006 年 7 月日, 中国青年鸟类学家研讨会暨第二届北京师大翠鸟论坛在北京师范大学生命科学学院成功举办本次研讨会由中国动物学会鸟类学分会主办, 北京市动物学会生物多样性和生态工程教育部重点实验室 ( 北京师范大学 ) 协办, 来自中科院动物所植物所, 兰州大学, 复旦大学, 中国林科院, 东北林业大学, 北京林业大学, 广西大学, 华南濒危动物研究所, 辽宁师范大学, 全国鸟类环志中心, 首都师范大学, 邢台学院, 沧 6

6 州师专, 北京师范大学的近 70 名青年学者研究生参加了本次会议本次活动旨在为鸟类学专业研究生搭建一个相互交流的平台, 拓广我国青年鸟类学者的视野鸟类学分会名誉理事长郑光美院士致了开幕词在两天的会议中, 共安排了 8 个专家讲座和 19 个学生报告, 内容涉及鸟类迁徙起源与进化濒危动物的分子生态生物统计方法繁殖生态行为和栖息地利用等 l 2006 年 9 月 12 日, 林魁课题组的文章在 Trends in Genetics (IF=12.0) 发表, 这是实验室首次在影响因子 10 以上的期刊发表文章 l 2006 年 11 月 20 日, 加拿大生物多样性与景观模拟研究首席加拿大 Alberta 大学副教授何芳良先生受聘为重点实验室 985 客座研究员, 并获得国家基金委杰青 B 资助 l 2006 年 11 月 16 日 -17 日, 生物多样性与生态工程教育部重点实验室第二届学术委员会委员第一次会议在北京召开会议由本届学术委员会主任卢宝荣教授主持, 实验室主任张大勇教授副主任钟扬教授分别代表北师大和复旦实验室分部向与会委员汇报了实验室年以来在队伍建设科学研究人才培养合作交流和实验室工作环境改善等方面所做的努力与取得的成绩, 提出了实验室进一步发展的主要研究方向和建设目标与会委员们在肯定了实验室过去一年建设成绩的同时, 还针对实验室建设存在的问题, 对未来的发展方向与目标提出了许多中肯宝贵的建议 7

7 研究团队学术队伍研究组姓名专业技术职务最后学历备注濒危物种保育郑光美张正旺宋杰邓文洪张雁云教授教授教授级工程师副教授副教授研究生博士学士博士博士中国科学院院士 2006 年新世纪人才 985 团队研究员郭冬生研究生 32 人副高级工程师研究生理论与进化生张大勇教授博士长江学者态学姜新华张玉芬廖万金研究生 10 人讲师工程师博士后硕士博士博士种群生态与生物入侵徐汝梅教授学士曾任国务院学位委员会学科评议组成员成新跃研究生 6 人副教授博士计算分子生物学林魁牛登科副教授副教授博士博士 985 团队研究员 985 团队研究员庞尔丽钟兰研究生 20 人讲师讲师学士博士区域生态安全葛剑平教授博士教育部跨世纪人才评价牟浦寇晓军研究生 26 人教授副教授博士博士生理生态孙儒泳牛翠娟韩洁教授教授副教授博士博士博士中国科学院院士 985 团队研究员黄晨西研究生 17 人高级实验师研究生动物行为生态学刘定震张立研究生 23 人副教授副教授博士博士 8

研究进展濒危物种保育方向研究进展洪郑光美, 张正旺, 张雁云, 邓文在国家自然科学基金重点项目的支持下, 对黄腹角雉红腹角雉褐马鸡白腹锦鸡白冠长尾雉等珍稀濒危物种的扩散行为活动区种群遗传结构以及所在类群的系统发育等进行了深入研究, 探讨了濒危物种的生态适应扩散机制致危因素和保护对策主要进展与突破体现在以下两个方面 : 1 通过无线电遥测,

活动区等进行了研究 2 基于 mtdna cyt b 基因和控制区序列对角雉属鸟类的系统发育黄腹角雉不同地理种群的遗传亲缘度和系统发生进行了研究提出角雉祖种在演化过程中二歧分支 : 黄腹角雉和红腹角雉一支, 红胸角雉和灰腹角雉分为一支 ; 结合地理分布来看, 角雉属的系统发育模式倾向于异域成种, 祖先种群由位于喜马拉雅东部横跨缅甸及云南的雉类多样性起源中心逐渐片段化或扩散,

8 研究进展濒危物种保育方向研究进展洪郑光美, 张正旺, 张雁云, 邓文在国家自然科学基金重点项目的支持下, 对黄腹角雉红腹角雉褐马鸡白腹锦鸡白冠长尾雉等珍稀濒危物种的扩散行为活动区种群遗传结构以及所在类群的系统发育等进行了深入研究, 探讨了濒危物种的生态适应扩散机制致危因素和保护对策主要进展与突破体现在以下两个方面 : 1 通过无线电遥测, 获得了珍稀濒危雉类春季扩散的证据, 确定了扩散的距离 2006 年在山西芦芽山自然保护区继续对褐马鸡进行研究, 野外工作期间共捕获成体褐马鸡 10 只并对其中的 6 只 (2 4 ) 进行了长期无线电追踪在河南董寨自然保护区, 对白冠长尾雉春夏季之间的迁移和扩散进行了研究, 发现白冠长尾雉的个体扩散存在着三种模式对江西武夷山的黄腹角雉进行了研究, 对其数量分布栖息地利用活动区等进行了研究 2 基于 mtdna cyt b 基因和控制区序列对角雉属鸟类的系统发育黄腹角雉不同地理种群的遗传亲缘度和系统发生进行了研究提出角雉祖种在演化过程中二歧分支 : 黄腹角雉和红腹角雉一支, 红胸角雉和灰腹角雉分为一支 ; 结合地理分布来看, 角雉属的系统发育模式倾向于异域成种, 祖先种群由位于喜马拉雅东部横跨缅甸及云南的雉类多样性起源中心逐渐片段化或扩散, 形成了现今角雉分别沿喜马拉雅和中国中部东南分布的格局通过检测 4 个地理种群共 86 个样品的线粒体控制区高变 Ⅰ 区序列特征和 6 个微卫星位点信息, 发现白冠长尾雉控制区序列 442bp 中共有 39 个多态位点, 占研究序列长度 442bp 的 8.82%, 简约信息位点有 30 个, 占 6.79%, 单突变位点有 9 个, 占 2.04% 所研究的白冠长尾雉种群有 25 种单倍型, 占研究样本数的 29.1% 9

那么这些小个体或者不繁殖或者只表现出雄性功能 (Zhang 2006) 以多年生克隆生长山姜属植物云南草蔻 (Alpinia spp) 雌雄异型异熟植物核桃楸 ( Juglans mandshurica Maxim.

9 研究进展进化与理论生态学方向研究进展华不同处理授粉后云南草蔻花粉管生长情况张大勇, 姜新 1. 植物繁殖对策与适应进化探索了个体大小依赖的资源分配对策及其对植物繁育系统的影响, 研究发现如果植物雌性适合度趋于饱和的速率低于雄性适合度, 那么随个体大小增加资源分配将变得更加偏雌 ; 反之, 如果雄性适合度趋于饱和的速率低于雌性适合度 ( 就像在某些风媒植物中那样 ), 资源分配比率将会变得偏雄 ; 而且, 对于多年生草本植物, 如果种群内个体太小, 那么这些小个体或者不繁殖或者只表现出雄性功能 (Zhang 2006) 以多年生克隆生长山姜属植物云南草蔻 (Alpinia spp) 雌雄异型异熟植物核桃楸 ( Juglans mandshurica Maxim. ) 和藜芦属 (Veratrum) 植物为研究对象, 探讨了花性状的功能意义初步结论为 : 山姜属植物花粉管生长速率取决于授粉时柱头的位置 ; 花柱对花粉输出存在着干扰, 性别干扰是塑造花柱运动的重要选择压力 (Sun et al. 2007) 核桃楸花型内交配远远低于型间交配, 不存在自交, 雌雄异型异熟是一个有效的异交机制 (Bai et al. 2006) 藜芦雌性繁殖成功受资源限制, 雌雄功能间存在着资源权衡关系 2. 生物多样性维持机制与生态系统功能对 Hubbell 中性群落模型进行了扩展研究 (Zhou & Zhang 2006; 周淑荣张大勇 2006), 发现如果 Allee 效应纳入到中性群落模型, 那么物种多度分布将发生显著改变, 说明中性模型是很脆弱的以人工建造的水生藻类群落为实验系统, 考察了长期尺度上物种多样性与生态系统生产力及稳定性的关系 (Zhang & Zhang 2006a, b), 发现 :( 1) 物种丰富度对生产力有正效应, 这种正效应是抽样效应和互补效应共同作用的结果 (2) 物种丰富度对生态系统的空间稳定性 ( 可靠度 ) 没有显著影响 ; 不同物种对环境变化同步性响应可以导致物种数对群落抵抗性的负效应 (3) 互补效应在贫瘠环境中比在富养环境中更强烈, 环境资源水平的这种影响很有可能是通过改变物种互利关系而实现的收集了世界范围内来自 23 个实验地的关于多样性 - 生产力关系的数据, 分析了环境资源水平对多样性 - 生产力关系的影响, 发现在建立时间为一年的年轻样地中, 抽样效应非常普遍, 而在年龄超过一年的实验地中, 抽样效应的重要性下降 10

10 研究进展种群生态与生物入侵研究进展徐汝梅, 成新跃 1. 松材线虫与拟松材线虫的种间竞争研究 a. 实验培养条件下的种间竞争实验在无竞争条件下, 松材线虫繁殖数量高于拟松材线虫的数量, 说明松材线虫的内禀生殖力大于拟松材线虫在竞争条件下, 松材线虫的繁殖量明显高于在非竞争条件下的繁殖量说明竞争对松材线虫有利而拟松材线虫的繁殖量比无竞争条件下的繁殖量小或者相等说明竞争对拟松材线虫不利或无明显影响 number of propagation GZ CQ ZJ group competition noncompetition b. 寄主体内的种间竞争实验松材线虫在竞争条件下, 繁殖数量明显增加, 差异性显著拟松材线虫在竞争条件下, 平均繁殖数量减少 number Bx Bm 20 0 non-competition competition c. 自然松林中松材线虫与拟松材线虫的种群数量检测 120% 在自然生态系统中, 松材线虫的入侵对拟松材线虫种群数量产生显著的影响, 导致拟松材线虫种群数量下降松材线虫对拟松材线虫有生态替代和排除作用 percentage 100% 80% 60% 40% 20% Bx Bm 2 申请和启动北京市科委首都生态圈外来入侵生物监测研究和信息交流项目 0% invasion years 11

11 研究进展计算分子生物学研究进展林魁, 牛登科, 钟锦, 庞尔丽由于原核生物基因组内水平基因转移现象的普遍性和基因顺序的极不保守性等非有序进化事件的存在, 传统的基于单个基因 ( 如 SSr RNA) 构建的物种系统发育树并不能全面地反应整个物种的进化关系我们利用原核生物基因组内普遍存在的重叠基因 (Overlapping genes) 的保守性和其产生速率的恒定性这一特征, 首次提出并实现了一种基于物种之间共有的同源重叠基因的个数而建立起来的反映基因组之间进化关系的度量, 从而弥补了其它基于全基因组序列构建物种系统发育树方法的许多不足之处 (Luo et al Trends in Genetics. 22(11): ) 尽管基于序列的蛋白质相似性的比较方法的应用取得了许多好的结果, 但是也存在着许多问题, 特别是对具有多结构域 (Multidomain) 的蛋白质进行比较时鉴于此, 我们首次提出并建立了在蛋白质结构域架构 (Protein domain architecture) 的水平上对蛋白质进行同源性比较的算法, 有效地避免了目前其它方法的缺陷 (Lin et al Bioinformatics. 22(17): ) 在全基因组水平上对蛋白质 - 蛋白质相互作用的研究不仅在理论上具有重大的科学研究价值, 而且具有很大的潜在的应用价值通过度量两个 Gene Ontology(GO) 结点之间相对特异的相似性 (RSS; Relative Specificity Similarity), 我们首次设计出可用于在全基因组水平上构建蛋白质与蛋白质相互作用网络的计算方法, 并已成功地应用于酵母菌基因组中结合已有的研究结果, 建立并公开发布了一个关于酵母蛋白质 - 蛋白质相互作用的数据库及其可视化查询系统 SPIDer ( ) (Wu et al Nucleic Acids Research.34: ; Wu et al BMC Bioinformatics. 7(Suppl):S16 在原核生物中, 基因组中 DNA 双链核苷酸组成的不对称性是一个普遍现象并已应用于 DNA 复制起始和终止位点的预测但真核生物中相关研究进展缓慢我们从七个已注释清楚的脊椎动物基因组中分析出大于 50kb 的基因间隔序列, 然后使用累积图的方法来分析它们的核苷酸组成发现脊椎动物基因组中, 存在着明显的复制相关的双链组成不对称性, 多数复制子大小在 kb 之间, 复制的起始位点和终止位点既不是一个单一的具体的位点, 也不是随机的, 而是一个从单一的具体的位点到具有一定宽度区域的频谱图 ( Hou et al Biochemical and Biophysical Research Communications 344: ) 12

LMS 计算机模型初步模拟示意图生物多样性与生态工程教育部重点实验室 2006 年年报研究进展人工落叶松

基于降水与植被时空动态耦合的生态脆弱性评价原始云冷杉针叶林, 吉林长白山葛剑平, 寇晓军

遭受了严重的水土流失尤其是人类活动产生的农田覆被与降水的年内动态表现出明显耦合偏离这种植被 -

Rainfall Energy K = 土壤侵蚀力 Soil Erodibility Factor LS = 坡长

根据黄土高原区域农业生态系统安全评价的宏观性分布式需求, 以此生态安全评价模式为基本框架, 将遥感技术 GIS

12 LMS 计算机模型初步模拟示意图生物多样性与生态工程教育部重点实验室 2006 年年报研究进展人工落叶松樟子松林, 吉林旺兴门附近原始红松阔叶混交林, 长白山生态保护站区域生态安全评价研究进展 1. 基于降水与植被时空动态耦合的生态脆弱性评价原始云冷杉针叶林, 吉林长白山葛剑平, 寇晓军黄土高原长期以来由于农业实践和各种人类活动对地表植被的干扰, 改变了自然植被的空间分布格局和年内动态变化, 遭受了严重的水土流失尤其是人类活动产生的农田覆被与降水的年内动态表现出明显耦合偏离这种植被 - 降水的动态耦合偏离改变了地表水文过程, 增加了土壤的侵蚀程度基于此, 我们建立了降水与植被时空动态耦合的农业生态环境与安全格局评价指标体系 S=F{Corre(P,NDVI),R,K,LS}, 其中,S= 生态安全综合指标 R = 降雨侵蚀力 Rainfall Energy K = 土壤侵蚀力 Soil Erodibility Factor LS = 坡长 Length-Slope Factor Corre(P,NDVI)= 降水与植被的季节性耦合根据黄土高原区域农业生态系统安全评价的宏观性分布式需求, 以此生态安全评价模式为基本框架, 将遥感技术 GIS 技术与现有的水土流失评价模型 (SWAT) 相结合, 构建了针对黄土高原区域农业生态系统面临的主要生态安全问题的显式空间评价模型采用此模型将对泾河流域农业生态环境的承载力 (Capacity) 脆弱性(Vulnerability) 和敏感性 (Sensibility) 进行了综合评价 2. 中国 - 俄远东地区景观变化及东北虎生境的评价开展了东北虎栖息地的现状评估及其栖息地在森林动态中的变化模拟利用 LMS 计算机模型初步模拟了东北虎关键栖息地的森林动态 ( 右图 ), 揭示东北虎的栖息地怎样随着森林面积和结构的变化而波动我们初步的分析认为森林面积缺失和破碎化空间结构的单一化和关键树种的丧失是限制着东北虎的数量, 但还需进一步论证对黑龙江吉林两省的种群动态变化调查发现在最近 5 年, 东北虎种群有恢复的迹象, 关于原因, 还需要进一步的研究 13

研究进展水生生物生理生态学研究进展 1 浮游动物分子进化研究 : 牛翠娟, 韩洁研究了 ph 对 5 种臂尾轮虫生活史的影响, 发现壶状和十指臂尾轮虫为广 ph 适应 ; 萼花和方形臂尾轮虫不耐受 ph6 以下的酸性环境 ; 角突臂尾轮虫为窄 ph 适应探讨了 ph 与氨氮对壶状臂尾轮虫种群增长的交互作用, 在适宜 ph 条件下 (ph 7 8),NH 3 -N 浓度小于 2mg/l

13 研究进展水生生物生理生态学研究进展 1 浮游动物分子进化研究 : 牛翠娟, 韩洁研究了 ph 对 5 种臂尾轮虫生活史的影响, 发现壶状和十指臂尾轮虫为广 ph 适应 ; 萼花和方形臂尾轮虫不耐受 ph6 以下的酸性环境 ; 角突臂尾轮虫为窄 ph 适应探讨了 ph 与氨氮对壶状臂尾轮虫种群增长的交互作用, 在适宜 ph 条件下 (ph 7 8),NH 3 -N 浓度小于 2mg/l 不影响轮虫种群增长 ; 高于 2mg/l NH 3 -N 浓度导致轮虫种群存活力降低, 繁殖力下降在非适宜 ph 条件下加入 NH 3 -N 后, 种群的内禀增长率变为负值, 净增殖率明显下降观测了萼花臂尾轮虫形态随环境 ( 是否有天敌 ) 世代变化不同形态型之间的转化, 发现种群中三种形态型共存, 并可相互转化 ; 天敌存在下带双长侧棘刺的形态型占绝对优势 2 环境胁迫对龟鳖类动物生理生态特性的影响 : 在不同氨氮胁迫条件下观测了水中氨氮对中华鳖生理特性免疫功能及摄食生长等能量收支参数的影响, 发现中华鳖在环境总氨氮水平高达 90mgTAN/l 的环境下 3 个月可保持能量收支不受影响, 但肝脏脾脏组织异常, 部分免疫指标活性下降水中氨氮对鳖冬眠影响较大高密度胁迫条件下中华鳖生长及免疫功能均受到抑制饥饿胁迫对乌龟中华鳖的影响有差异中华鳖对饥饿胁迫响应较乌龟快, 表现为部分补偿生长, 乌龟的补偿生长反应具时滞, 可能为部分或完全补偿 3 毛类小头虫 (Capitella capitata) 复合种亲缘地理学的研究对海洋姊妹种 (Sibling species) 或隐种 (Cryptic species) 的研究是近年来海洋生物多样性研究领域的热点问题之一多毛类动物小头虫是一个具有若干姊妹种的复合种, 也是海洋环境受有机质污染扰动的全球性指示物种 2006 年, 我们以 GenBank 公布的小头虫基因组序列数据为基础, 开展了其微卫星 DNA 标记的筛选工作, 并向 GenBank 提交了 15 个位点的 44 条微卫星 DNA 序列 ( 登录号为 EF EF107605), 对青岛种群进行了 12 个位点的微卫星特征分析, 该研究结果即将发表在 Molecular Ecology Notes 上同时我们还对渤海黄海和东海的 8 个小头虫种群进行了线粒体 COI 序列和核基因中 ITS1 序列的测定工作, 这些数据将结合已获得的 18S rdna 数据和即将获得的微卫星 DNA 标记数据以及形态学和生活史的数据, 共同分析得到对中国北部海域潮间带小头虫复合种亲缘地理学和不同污染背景下小头虫姊妹种的类型及其遗传结构的全面认识 14

14 生物多样性与生态工程教育部重点实验室雌性大熊猫在做嗅为标记 2006 年年报研究进展动物种群和行为研究进展刘定震, 张立 1. 大熊猫个体和亲缘识别机制和不同环境胁迫对其行为的影响研究通过对圈养大熊猫尿液和肛周腺分泌物中挥发性成分的 GC-MS 分析, 发现雄性大熊猫的尿液中包含有关个体身份和亲缘关系的信息, 但是不包含有关个体性活跃能力的信息肛周腺分泌物和尿液分泌物都能够编码个体的年龄针对生境破碎化和不同程度的人类活动干扰, 分别在陕西佛坪大熊猫自然保护区四川唐家河大熊猫自然保护区小寨子沟大熊猫自然保护区平武大熊猫自然保护区开展大熊猫栖息地选择行为研究, 并对不同胁迫条件下的个体粪便糖皮质激素水平进行了比较研究同时, 在四川卧龙中国保护大熊猫研究中心和北京动物园, 通过人为丰富环境等方式, 研究不同环境丰富条件下, 大熊猫呆板行为 (stereotypic behavior) 变化, 并通过非损伤性取样的方法检测其粪便中糖皮质激素水平的变化初步发现, 糖皮质激素水平一般提前一天于呆板行为的发生 2. 亚洲象穿山甲种群及其分子生物学研究从分子个体和种群水平系统研究了中国野生亚洲象的种群现状数量分布行为习性和遗传状况根据个体形态特征和分子生物学方法明确提出中国亚洲象野生种群数量在 165~213 之间 ; 与国内同行合作, 在国际上首次开展了针对亚洲象个体数量精确计数的非损伤性分子粪便学研究, 并开展了一系列针对性别判定家族组成和遗传多样性等方面的分子生态学方法研究 ; 在行为学研究中, 在国内首次报道了亚洲象由于人类干扰而产生的行为适应性变化, 并对思茅和西双版纳野生亚洲象的栖息地选择行为活动节律觅食行为和食性等开展了深入细致的研究 ; 在对亚洲象行为和种群生态学研究的基础上, 还针对目前中国亚洲象的保护现状提出了缓解人象冲突栖息地廊道建设和打击盗猎的具体措施和建议同时, 与国外合作伙伴开展了穿山甲保护遗传学和分子进化的研究工作, 先后选派本组研究生蔡清秀和杨帆赴美国国家卫生研究所遗传多样性实验室开展了穿山甲微卫星纹库的筛选和基因谱分析, 首次合作完成发表了穿山甲的微卫星纹库文章 15

15 科研项目 2006 年在研项目项目名称项目来源起讫时间负责人备注区域农业生态环境安全评价 (2002CB111507) 主持 973 课题葛剑平国家重点基础研湿地系统生态功能退化及修复机理究发展计划项目 (2006CB ) (973 计划 ) 张正旺第五课题松材线虫种群遗传分化及演变机制研究 973 专题成新跃黄土高原典型区域农业生态环境评价国家科技攻关项 (2004BA5D8B22) 目中俄资源环境领东北亚生态系统演化及生物多样性研究域重大问题合作 (2005CB724800) 研究葛剑平葛剑平亚洲象行为学生态学及保护生物学的野外研究 Waterbird Survey along Bohai Bay in a Flyway Approach to China Crane Conservation ( ) 国际合作项目张立国际鹤类基金会项目野生动植物执法鉴定网上支持系统的建关键生态系统合立研究作基金张正旺张立中国珍稀濒危雉类遗传亲缘度及其扩散国家自然科学基模式研究 ( ) 金重点项目克隆植物资源分配生长构型与交配系国家自然科学基统相互关系的研究 ( ) 金重点项目圈养大熊猫亲缘辨别机制研究国家自然科学基 ( ) 金面上项目周期性孤雌繁殖动物种群遗传分化与其国家自然科学基生境生态性状关系的研究 ( ) 金面上项目红脂大小蠹入侵种群的遗传分化及其爆国家自然科学基发的分子机理金面上项目破碎化次生林中鸟类群落结构变化及其国家自然科学基稳定性研究金面上项目郑光美张大勇刘定震牛翠娟成新跃邓文洪教育部重大 ( 培入侵植物的生活史对策及适应性进化张大勇育 ) 项目蛋白质与蛋白质相互作用数据库及其生教育部重点项目林魁物信息学分析环境 16

16 基于蛋白质结构域插入事件的结构域国家自然科学基架构进化研究 ( ) 金委项目林魁白冠长尾雉 Syrmaticus reevesii 的婚配国家自然科学基制度研究 ( ) 张正旺金面上项目松材线虫入侵对拟松材线虫的竞争替代国家自然科学基及遗传侵蚀作用金面目项目白冠长尾雉不同地理种群的遗传分化研高等学校博士点究 ( ) 项目负基金成新跃张正旺科尔泌牛业有限半干旱地区柳枝稷栽培管理技术研究熊韶峻公司 2006 年成功申请的项目项目名称项目来源起讫时间负责人备注国家重点基础研重要物种的综合生态适应对策 ( 课题编究发展计划项目号 :2007CB106802) (973) 海外青年学者合群落与生态系统学 ( 项目号 : ) 作研究基金项目 ( 杰青 B) 张大勇第二课题国内合作者何芳良张大勇辽东湾中内分泌干扰物质的生态风险评国家自然科学基价金重点项目维生素 C 对龟鳖幼体温度应激反应与冬国家自然科学基眠的影响及其作用机理的研究 ( 项目号 : 金面上基金 ) 角雉属鸟类的分布格局和分子系统地理国家自然科学基学研究金面上项目入侵植物欧洲千里光的遗传变异与适应国家自然科学基进化 --- 原产和入侵地的比较研究 ( 项目金面上基金号 : ) 巢贡献者对繁殖鸟类群落结构及其动态国家自然科学基的调控作用研究 ( 编号 : ) 金面上基金牛翠娟牛翠娟张雁云廖万金邓文洪合作单位分项课题 17

17 学术交流与合作年 5 月 24 日至 6 月 11 日, 应葛剑平教授的邀请, 美国耶鲁大学森林与环境学院 Chadwick Dearing Oliver 教授对生物多样性与生态工程教育部重点实验室进行了为期 20 天的讲学与合作研究系列学术活动访问期间,Oliver 教授为生命科学学院师生做了题为 The Scientific Basis for Managing Forests at the Stand, Landscape, and Global Scales, 和 Tree & Stand Measurement 的报告, 与实验室部分老师就有关生物多样性保护进行了座谈交流, 并与寇晓军副教授等一同赴东北开展有关东北虎生境破碎化方面的研究年 7 月 20 日至 8 月 20 日, 国际著名系统与进化植物学家奥地利科学院院士维也纳那大学终身教授 Friedrich Ehrendorfer 来我校讲学, 做了题为 Cycles of Differentiation and Hybridization: Key Phenomena of Evolution 的报告, 并针对我们目前的研究进行野外考察与实验指导年 8 月 22 日至 9 月 9 日, 俄罗斯科学院教授 Valery M. Neronov 教授 Tatiana Yu. Karimova 教授和莫斯科公立大学 Galina N. Ogureeva 教授等三人应葛剑平教授邀请来实验室访问与实验室徐汝梅教授葛剑平教授张大勇教授等就东北亚样带生物多样性格局机理保护和应用和东北虎的生境研究等交换了意见, 双方在合作开展东北亚生物多样性研究和联合培养研究生等方面达成了共识年 9 月 10 至 19 日, 应张大勇教授邀请, 集合种群和生物多样性科学方面的国际权威专家, 英国皇家学会外籍院士瑞典皇家科学院外籍院士欧盟科学院院士美国艺术与科学院外籍院士芬兰科学院院士芬兰赫尔辛基大学 Ilkka Hanski 教授和芬兰环境科学研究所 Eeva Rebekka Furman 科研主管对实验室进行了为期 10 天的访问活动在访问期间,Hanski 教授做了 5 个关于生物多样性与集合种群方面的精彩报告 :1). Introduction to metapopulation biology; 2). Spatially realistic metapopulation theory;3). From genes to landscapes:dispersal in the Glanville fritillary butterfly; 4).Conservation of biodiversity.;5). The 6 th mass extinction of species on Earth 吸引了包括中国科学院植物研究所动物研究所生态环境中心北京大学华东师范大学兰州大学与北京师范大学在内的百余名老师和学生前来参加报告会 Hanski 教授还向所有参加报告会的老师和同学赠送了他自己所著的 The Shrinking World: Ecological Consequences of Habitat Loss 一书的中译本参观了生物多样性与生态工程教育部重点实验室, 对实验室正在开展的一些研究给出了许多有益的建议年 10 月 8 日至 10 月 21 日, 受郑光美院士和张正旺教授邀请, 台湾中央研究院刘小如教授来实验室讲学讲学期间, 刘小如教授做了题为持续性开展鸟类生态学研究 18

18 的重要性兰屿角鸮的分子系统学研究风头蜂鹰的扩散和取食对策等学术报告与实验室鸟类学专业的研究生进行了座谈, 并亲自带鸟类学专业研究生到延庆野鸭湖进行了野外实验训练活动年 12 月 7 日 -12 月, 加拿大生物多样性与景观模拟研究首席加拿大 Alberta 大学副教授何芳良先生应张大勇邀请来实验室进行学术讲座与合作研究活动何芳良先生在讲学期间为实验室师生做了 The Evolution of Biodiversity Macroecological patternsoccupancy-abundance Relationships. Species- abundance distributions (SAD) Species-area relationshipsspecies-area relationships 等有关生物多样性与宏生态学方面的系列报告, 并与张大勇教授就共同开展的合作研究进行了讨论, 拟定了具体的工作计划 7. 应张正旺教授邀请, 世界雉类协会主任 Philip McGowan 博士于 2006 年 3 月 21 日至年 4 月 3 日来本实验室进行学术交流活动访问期间,Dr. McGowan 与我校师生就濒危物种的保护和研究进行交流 ; 对我校博士硕士研究生的论文工作进行指导 ; 并与郑光美院士和张正旺教授共同商讨国际学术研讨会的筹备工作 8. 我实验室张雁云副教授圆满完成在德国美因茨大学为期一年的进修, 于 2006 年 3 月按期回国刘定震副教授顺利结束在美国康奈尔大学为期两年的进修, 于 2006 年 9 月回国工作 9. 第 24 届国际鸟类学大会 (24th International Ornithological Congress) 于 2006 年 8 月 13 日至 19 日在德国汉堡举行本次大会由德国鸟类学会承办, 由欧洲鸟类学家联盟德国鸟类联盟德国联邦教育与研究部和汉堡市政府等组织和部门协办共有 30 多个国家的 1000 余名代表参加了本次大会我实验室郑光美院士张正旺教授张雁云副教授邓文洪副教授人出席了此次会议, 进行了学术交流 10. 第 43 届世界动物行为学大会于 2006 年 8 月 3 至 16 日在美国犹它州的盐湖城 Snowbird 宾馆召开本次大会由犹它州立大学承办, 世界动物行为学会 Snowbird 宾馆协办共有来自美国加拿大英国巴西德国印度和中国等国家的 500 余名代表参加我实验室刘定震副教授作为唯一中国代表参加了此次会议, 并在第三分会场作学术报告其间还同与会代表就共同参加 2008 年保护生物学大会以及组织 Symposium 等事宜召开小组会 19

19 2005 年实验室举办的国际国内学术会议序号学术会议名称举办时间总人数参加人数海外人员参加人数 1 国际繁殖生物学研讨会第二届中国青年鸟类学家研讨会第四届海峡两岸生命科学与技术发展论坛实验室成员国外访学进修情况姓名访问地点内容时间刘定震美国康奈尔大学博士后张雁云德国 Mainz 大学访问学者实验室成员参加国际会议情况序号姓名会议名称报告题目时间 1 郑光美第 24 届国际鸟类学大会主持濒危鸟类研究的圆桌讨论会并做了主题发言张正旺第 24 届国际鸟类学大会长尾雉性比研究张雁云第 24 届国际鸟类学大会黄腹角雉精液品质研究邓文洪第 24 届国际鸟类学大会红腹角雉巢址利用刘定震第 43 届国际动物行为学大会 Stereotypic Behavior and Fecal Cortisol Level in Captive Giant Pandas in Relation to Environmental Enrichment

20 实验室基础条件建设在 985 工程的大力支持下,2006 年为雉类中心购置了超低温冰箱多频道无线电遥测系统野鸟鸣声采集与监测系统红外自动照相机等 120 万元的仪器设备 21

21 发表论著 2006 年度 SCI 论文 1. Luo, Y.Q., Fu, C., Zhang, D.Y. and Lin, K.* (2006). Overlapping genes as rare genomic markers: the γ-proteobacteria phylogeny as a case study. Trends in Genetics, 22(11): (IF=12.0) 2. Lin, K.*, Zhu, L. and Zhang, D.Y. (2006). An initial strategy for comparing proteins at the domain architecture level. Bioinformatics, 22: (IF=6.0) 3. Wu, X.M, Zhu, L, Guo, J, Zhang,D.Y and Lin, K.* (2006). Prediction of yeast protein protein interaction network: insights from the Gene Ontology and annotations. Nucleic Acids Research 34: (IF =7.55) 4. He, Y.W., Xu, M., Lin, K., Ng, Y.J., Wen, C.M., Wang, L.H., Liu, Z.D., Zhang, H.B., Dong, Y.H., Dow, J.M. and Zhang, L.H. (2006). Genome scale analysis of diffusible signal factor regulon in Xanthomonas campestris pv. campestris: identification of novel cell-cell communication-dependent genes and functions. Mol Microbiol 59(2): (IF=6.203). 5. Zhang, Q. G. & Zhang, D.Y.* (2006) Resource availability and biodiversity effects on the productivity, temporal variability and resistance of experimental algal communities. Oikos, 114: (IF=3.2) 6. Zhang, Q. G. & Zhang, D.Y.* (2006) Species richness destabilizes ecosystem functioning in experimental aquatic microcosms. Oikos, 112: (IF=3.2) 7. Bai, W. N., Zeng, Y. F., Liao, W. J. & Zhang, D. Y.* (2006) Flowering phenology and wind-pollination efficacy of heterodichogamous Juglans mandshurica Maxim. (Juglandaceae). Annals of Botany, 98: (IF=2.66) 8. Zhou, S. R. & Zhang, D.Y.* (2006) Allee effects and the neutral theory of biodiversity. Functional Ecology, 20: (IF=3.3) 9. Zhang, D.Y.* & Jiang, X. H. (2006) Interactive effects of habitat productivity and herbivore pressure on the evolution of anti-herbivore defense in invasive plant populations. Journal of Theoretical Biology, 242: (IF=1.98) 10. Zhang, D.Y. (2006) Evolutionarily stable reproductive investment and sex allocation in plants. In: L. Harder & S.C.H. Barrett, eds. Ecology and Evolution of Flowers. Oxford University Press, Oxford. pp Liao, W. J.*, Song, Q. F. and Zhang, D.Y. (2006) Pollen and Resource Limitation in Veratrum nigrum L. (Liliaceae), an Andromonoecious Herb. Journal of Integrative Plant Biology, 48 (12): (IF=0.053) 12. Hou WR, Wang HF and Niu DK (2006). Replication-associated strand asymmetries in vertebrate genomes and implications for replicon size, DNA replication origin and termination. Biochemical and Biophysical Research Communications 344:

22 (IF=3.0). 13. Zhang YY Characteration, storage of the semen of Cabot's Tragopan. Poultry Science, 85: (IF=1.747) 14. Dongxia Yue, Xiaofeng Xu, Zizhen Li, Cang Hui, Wenlong Li, Hequn Yang and Jianping Ge Spatiotemporal analysis of ecological footprint and biological capacity of Gansu, China : down from the environmental cliff. Ecological Economics 58(2), (IF=1.179) 15. Liu DZ, Yuan H., Tian H., Wei RP, Zhang GQ, Sun L, Sun RY Do anogenital gland secretions of giant panda code for their sexual ability? Chinese Science Bull 51(16): (IF=0.783) 16. Liu J, Chen Y, Guo LR, Gu B, Liu H, Hou AY, Liu XF, Sun L, Liu DZ 2006 Stereotypic Behavior and Fecal Cortisol Level in Captive Giant Pandas in Relation to Environmental Enrichment. Zoo Biology. (IF=0.471) 17. Yang Liu, Paul I. Holt, Jin-Yu Lei, Yu Zhang and Zhengwang Zhang. (2006) Distribution, Numbers and Age Structure of Relict Gull Larus relictus in Bohai Bay, China. Waterbirds 29(3): (IF=0.504) 18. Liu JS, Sun RY, Wang DH. (2006) Thermogenic properties in three rodent species from Northeastern China in summer. Journal of Thermal Biology, 31: (IF=0.871) 19. 王义飞, 陈洁君, 刘文华, 徐汝梅. (2006). 华北山区干草地生境中耕作和放牧对网蛱蝶保育的作用. 中国科学 C 辑. 36(5): Gong Shiping, Wang Jichao, Shi Haitao, Song Riheng, Xu Rumei. (2006) Illegal trade and conservation requirements of freshwater turtles in Nanmao, Hainan Province, China. Oryx, 40(3): (IF=1.392) 21. Liu Wenhua, Wang Yifei & Xu Rumei. (2006). Habitat utilization by ovipositing females and larvae of the Marsh fritillary (Euphydryas aurinia) in a mosaic of meadows and croplands. Journal of Insect Conservation, 10: Deng WH. Breeding habitat selection by sympatric Grey-faced Buzzards and Northern Goshawks in northeast China. Journal of Raptor Research, 2006, 40 (4): (IF=0.333) 23. Z. Xie and C. Niu, 2006 Dietary ascorbic acid requirement of juvenile ayu (Plecoglossus altivelis). Aquaculture Nutrition, 12: (IF=1.441) 24. Z. Xie, C.Niu, Z. Zhang and L.Bao,2006 Dietary ascorbic acid may be necessary for enhancing the immune response in Siberian sturgeon (Acipenser baerii), a species capable of ascorbic acid biosynthesis. Comparative Biochemistry and Physiology, Part A, 145(2): (IF=1.351) 25. Kou, XJ, Baker, WL, A landscape model quantifies error in reconstructing fire history from scars, Landscape Ecology, 27: (IF=2.173) 23

23 26. Kou, XJ, Baker, WL, Accurate estimation of mean fire interval for managing fire, International Journal of Wildland Fire, 15: (IF=1.81) 2006 年发表的非 SCI 论文 1. Li Chongwei, Ge Jianping, Liu Shirong, Sun Pengsen Landscape pattern and eco-hydrological characteristics at the upstream of Minjiang River, China. Frontiers of Biology in China 1(4), 卢爱刚, 葛剑平, 庞德谦, 何元庆, 庞洪喜 a 来中国旱灾对 ENSO 事件的区域差异响应研究. 冰川冻土, 28(4): 王兮之, 索安宁, 洪军, 毕晓丽, 葛剑平泾河典型流域水沙变化及其景观格局分析. 水土保持学报, 13(4): 杨娟, 葛剑平, 洪军卧龙地区流域土地覆盖变化及其对大熊猫潜在生境的影响. 生态学报, 26(6): 索安宁, 王兮之, 胡玉喆, 熊颖, 葛剑平 DCCA 在黄土高原流域径流环境解释中的应用. 地理科学, 26(2): 王兮之, 索安宁, 洪军, 毕晓丽, 葛剑平黄土高原泾河流域水沙特征分析. 水土保持学报, 13(2): 高新宇, 刘阳, 刘定震, 魏辅文秦岭大熊猫冬春季节对巴山木竹竹林生长指标的选择. 动物学研究 27(2): 王宁, 张雁云, 郑光美. 黄眉姬鹟和白眉姬鹟繁殖期的栖息地与活动区特征北京师范大学学报 ( 自然科学版 ) 42(3): Zhang YY, Wang N, Zhang J and Zheng GM. Acoustic distinct of Narcissus Flycatcher complex. Acta Zoologica Sinica. 2006,52(4): 张玉芬, 张大勇 (2006) 克隆植物的无性与有性繁殖对策植物生态学报, 30(1): 周淑荣, 张大勇 (2006) 群落生态学的中性理论植物生态学报, 30(5): Zhang Zhengwang Conservation of sites important for birds in China. Acta Zoologica Sinica 52(Supplement): Xu Jiliang, Zhang Xiaohui, Zhang Zhengwang, Zheng Guangmei,Ruan Xiangfeng, Zhang Keyin, Xi Bo (2006) Home range and habitat use of male Reeves s Pheasant (Syrmaticus reevesii) during winter in Dongzhai National Nature Reserve, Henan Province, China. Frontiers of Biology in China 2: 刘文华王义飞徐汝梅两种共存网蛱蝶的卵块特征及其雌性成虫对产卵地的选择. 应用生态学报, 7(17): 刘文华王义飞徐汝梅两种共存网蛱蝶幼期的生命表研究. 昆虫学报, 49(4): 龚世平史海涛徐汝梅王志伟徐建平张远富海南尖峰岭自然保护区淡水龟类调查. 动物学杂志, 41(1):

24 17. 蒲丽君, 牛翠娟, 陈欣然慢性氨暴露对中华鳖幼鳖血浆总氨氮皮质酮浓度及组织氨代谢酶活性的影响. 动物学报 52(5):878~ 陈欣然, 牛翠娟, 蒲丽君慢性氨暴露对中华鳖幼鳖生长及非特异性免疫反应的影响 ( 英文 ). 动物学报 52(5): 885~ 国艳莉, 张立 *, 董永华西双版纳野生亚洲象的觅食行为. 兽类学报, 26(1): 王丽红, 张立 *, 贺倩, 张金国亚洲象野外及圈养条件下食物成分分析. 北京师范大学学报 ( 自然科学版 ), 42(2): 林柳, 冯利民, 赵建伟, 郭贤明, 刀剑红, 张立 * 在西双版纳国家级自然保护区用 3S 技术规划亚洲象生态走廊带初探. 北京师范大学学报 ( 自然科学版 ), 42(4): 袁志强, 张立 * 西双版纳三岔河地区野生亚洲象的个体识别种群数量和活动特点. 兽类学报, 26(4): 张立中国亚洲象现状及研究进展. 生物学通报, 41(11):1~ 黄晨西林琳李庆芬,2006 短光照诱导达乌尔黄鼠产热, 兽类学报 26(4): 周睿, 王辉, 葛剑平 *, 熊友才, 吴记贵松山自然保护区各功能区植被动态及变化格局. 生物多样性, 14 (6): Yang H. Y. and Z. W. Zhang 2006 Shorebirds wintering in northern Bohai Bay. The Stilt 49: Ding Wei, Zhang Zhengwang, Chang Jiang, Zhang Er,Wu Xiushan, Zhang Jinguo Intra-specific relationships among Tibetan Eared-Pheasants based on randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis. Frontiers of Biology in China 2: 杨洪燕张正旺渤海湾地区红腹滨鹬迁徙动态的初步研究动物学杂志 41(3): 常崇艳张正旺陈晓端刘金英孙全辉 2006 白冠长尾雉 (Syrmaticus reevesii) 卵壳的超微结构及元素组成研究北京师范大学学报 ( 自然科学版 )42(1): 刘阳张洁雷进宇张正旺 2006 白喉林鹪在河南的新分布及鸣声分析北京师范大学学报 ( 自然科学版 )42(1): Wu, X.M, Zhu, L., Guo, J., Fu, C., Zhou, H.J, Dong, D., Li, Z.B, Zhang, D.Y. and Lin, K. (2006) SPIDer: Saccharomyces protein-protein interaction database. BMC Bioinformatics, 7, S 年出版译著 1. 张大勇, 陈小勇等译萎缩的世界生境丧失的生态学后果 (Ilkka Hanski 著 ) 北京 : 高等教育出版社 2. 张正旺主译,2006. 生物多样性教程 (K. V. 克里施纳默西著 ) 北京: 化学工业出版社 25

引言

利手与两半球的听觉词汇语义加工蔡厚德徐艳引言方法结果讨论结论年度江苏省生物多样性与生物技术重点实验室学术委员会会议暨学术研讨会于月日在我校隆重召开中国科学院昆明动物所张亚平院士华东师范大学副校长王小明教授中国科学院动物研究所魏辅文研究员中国科学院微生物所周培瑾教授中国药科大学李萍教授南京师范大学周开亚教授袁生教授杨光教授邵蔚蓝教授计翔教授丁小余教授等学术委员会的成员