国家生物医学分析中心核磁实验室

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1 国家生物医学分析中心核磁实验室 1 国家生物医学分析中心核磁实验 室 北京市 分析测试百科网 [ 文档生成时间 北京时间 : :23

2 国家生物医学分析中心核磁实验室 2 声明 本内容有 Antpedia 系统自动生成, 仅作参考, 我们不保证内容的正确性和有效性, 证实或者了解最新信息, 请联系国家生物医学分析中心核磁实验室 联系方式 单位 : 国家生物医学分析中心地址 : 北京市太平路 27 号邮编 : 联系电话 : fax: 网址 :

3 国家生物医学分析中心核磁实验室 3 实验室简介 核磁共振实验室目前有工作人员 4 人以及研究生数人, 其中高级职称 2 人 主要工作人员都具有多年的核磁共振工作经验, 在核磁共振方法学, 天然及合成小分子结构, 毒物分析, 活体核磁共振, 代谢组学以及生物大分子空间构象等领域开展了研究, 并在国内外发表多篇学术论文 该实验室承担并参与了多项国家自然科学基金和 863 课题的工作, 曾获得科技进步二 三等奖多项以及分析测试协会 CAIA 奖一等奖等奖项, 培养博士生 硕士生多名 联系电话 : 颜贤忠 yanxz@proteomics.com.cn 陈合兵 chenhb@proteomics.com.cn 张琪 zq@proteomics.com.cn

4 国家生物医学分析中心核磁实验室 4 实验室特色 主要工作人员都具有多年的核磁共振工作经验, 在核磁共振方法学, 天然及合成小分子结构, 毒物分析, 活体核磁共振, 代谢组学以及生物大分子空间构象等领域开展了研究 所获奖项 认证 曾获得科技进步二 三等奖多项以及分析测试协会 CAIA 奖一等奖等奖项 实验室人员组成 核磁共振实验室目前有工作人员 4 人以及研究生数人, 其中高级职称 2 人 人员简介 : 颜贤忠博士国家生物医学分析中心核磁实验室主任 ( 副研究员 ) 研究领域核磁共振波谱学, 代谢组学, 结构生物学电子信箱 yanxz@nic.bmi.ac.cn 办公电话

5 国家生物医学分析中心核磁实验室 5 科研背景 : 主要研究方向为代谢组学和结构生物学 以 NMR 和 LC- MS 技术为基础的代谢组学是研究生物整体功能和药物毒性及作用机理的强有力手段 将其应用到中医药现代化研究中, 能够在中药质量控制 中药毒性和药理作用机理 中医证候的生物学特征等方面发挥重要作用 研究蛋白质结构是研究其功能一个重要方面 核磁共振是目前唯一能够研究蛋白质在溶液中三维构象的技术手段, 是结构生物学的重要组成部分 目前承担国家自然科学基金项目和北京市科学基金项目各一项, 并参与了一项 863 课题和国家自然基金课题的研究工作 主要工作经历 : 1986 年中国科技大学应用化学系无机化学专业本科毕业,1989 年中国科学院武汉物理研究所应用波谱学专业硕士,2000 年香港科技大学生物化学系生物化学专业博士 现任国家生物医学分析中心副研究员, 核磁共振实验室主任, 从事代谢组学及结构生物学研究 2003 年任北京核磁共振中心学术委员会委员 主要研究成果及代表性论文 : 1. Yan X., Xue H., Liu, H., Hang, J., Wong J.T.F., Zhu, G. NMR studies of Bacillus subtilis trnatrp hyperexpressed in Escherichia coli -Assignment of imino proton signals and determination of thermal stability. J. Biol. Chem. 2000,275(10): Yan, X., Kong, X., Xia, Y., Sze, K.H., Zhu, G. Determination of Internucleotide hjhn Couplings by the Modified 2D JNN Correlated-[15N, 1H]-TROSY. J. Magn. Reson. 2000,147(2): Yao, Y.N., Zhang, Q.S., Yan, X.Z., Zhu, G., Wang, E.D. Substrate-induced conformational changes in Escherichia coli arginyl-trna synthetase observed by 19F NMR spectroscopy. FEBS Lett. 2003,547(1-3 ): Yao, Y.N., Zhang, Q.S., Yan X.Z., Zhu G., Wang E.D. Escherichia coli trnaarg4 (UCU) induces a constrained conformation of the crucial X-loop of arginyl-trna synthetase. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2004,313: Sze, K.H., Yan X., Kong, X., Che, C.T., Zhu, G. Phase sensitive 3D J-resolved HMBC experiment for spectral assignment and measurement of long-range heteronuclear coupling constants. Tetrahedron Lett.1999, 40(30): 颜贤忠, 杜泽涵, 现代仪器分析在生物医学研究中的应用 ( 钱小红, 谢剑炜主编 ), 第十章, 现代核磁共振及其在生物医学中的应用,pp , 北京 : 化学工业出版社, 王全军. 颜贤忠. 吴纯启. 赵剑宇. 余寿忠. 袁本利. 廖明阳. Z24 经口染毒大鼠尿液的核磁共振谱代谢组学研究. 中国药理学与毒理学杂志,2004,18(6): 王全军, 颜贤忠, 吴纯启, 赵剑宇, 盛和章, 余寿忠, 袁本利, 廖明阳.

6 国家生物医学分析中心核磁实验室 6 Z24 经口染毒大鼠血浆的代谢组学研究, 卫生毒理学杂志,2004,18(2): 颜贤忠, 赵剑宇, 彭双清, 廖明阳. 代谢组学在后基因组时代的作用. 波谱学杂志,2004,21(2): 仪器设备 美国 Varian 公司 UNITYINOVA 600 兆高分辨超导核磁共振谱仪日本 JEOL 公司 JNMGX400 核磁共振谱仪 美国 Varian 公司 UNITYINOVA 600 兆高分辨超导核磁共振谱仪 仪器负责人 : 颜贤忠 ( ,yxz@proteomics.com.cn) 测样联系人 : 陈合兵 ( ) 仪器简介

7 国家生物医学分析中心核磁实验室 7 Unity-Inova 600 超导核磁共振谱仪 : 磁场强度 14.1 特斯拉, 对应质子共振频率 600 兆赫兹 拥有三个射频通道, 每一通道均有脉冲波形发生器, 有 Z 轴脉冲梯度场和梯度波形发生器, 可进行氘去偶 备有 5 毫米 Z 梯度场反式检测三共振探头,5 毫米宽带探头,5 毫米氢 / 氟三共振探头 ( 可检测 1H, 同时对 19F 去耦 ) 精密温控组件和 FTS 冷却器使谱仪可以进行长时间的低温实验 随机软件带有 Varian 公司的标准脉冲序列, 蛋白质脉冲序列包, 潘多拉盒子 ( 产生任意选择激发脉冲 ) 等程序 主要应用 该谱仪可以观测 1H,13C,15N,17O,19F,31P 以及绝大多数可观测核素 ; 可以进行几乎所有的一维 二维和三维核磁共振实验 核磁共振可以测定液态或可溶的有机化合物的结构, 包括对有机合成药物和天然产物有效成分进行结构鉴定或结构确证, 是新药研究和天然产物研究不可缺少的重要技术手段, 也是目前研究生物大分子溶液三维构象的唯一手段 提供服务和研究范围 : 合成及天然药物结构解析 新药报批的结构确证 对映体纯度或对映体过量 (ee) 的测定 硫代寡核苷酸硫代纯度测定 蛋白质空间结构测定 ; 蛋白质 - 配体相互作用 ; 以生物大分子为靶标的新药研究 代谢组学方法及应用研究 在研究课题 国家自然科学青年基金 : 寡糖溶液构象的核磁共振研究国家自然科学基金 : 重大研究计划代谢组学方法在中药毒性研究中的应用北京市自然科学基金 : 微丝相关新蛋白 Lca295 的空间结构及其与蛋白质间的相互作用国家自然基金 : 代谢组学方法的建立及其在新药安全性评价中的应用 ( ) 论文著作 发表文章

8 国家生物医学分析中心核磁实验室 8 1. 李桦, 颜贤忠, 王宁, 杜泽涵, 阮金秀,19F 体内核磁共振技术观测 5- 氟尿嘧啶在小鼠肝脏中的代谢, 中国药理学与毒理学杂志,8(2): 82, 1994.( 快讯 ) 2. 颜贤忠, 李桦, 杜泽涵, 阮金秀, 活体动物代谢过程的 31P NMR 研究 方法与初步结果, 波谱学杂志,11(3): , 朱好勤, 李桦, 颜贤忠, 体内 31P NMR 表面线圈探头的研制, 波谱学杂志,11(4):411--, 钟永利, 苏镜娱, 曾陇梅, 颜贤忠, 南海海棉 Dysidea fragilis 中两个倍半萜内酯的 NMR 研究, 波谱学杂志,12(1): 47-54, 易进海, 颜贤忠, 罗泽渊, 钟炽昌, 藏药独一味根化学成分研究, 药学学报,30(3): , Yi J., Chen Y., Luo Z.and Yan X., a novel iridoid glucoside isolated from lamiophlomis rotata, Cinese Chem. Letters, 6(9): , 颜贤忠, 李桦, 杜泽涵, 阮金秀, 利用体内 19F NMR 研究 5 氟尿嘧啶在小鼠肝脏及肿瘤组织中的代谢过程, 波谱学杂志,13(3): , 程增江, 杜泽涵, 董华进, 颜贤忠, 刘莹, 董希键, 缺血及再灌注大鼠心肌细胞内 ph 的 31P 核磁共振测定军事医学科学院院刊, 20(3): , 黄荣清, 杜泽涵, 颜贤忠, 李光玉, 冯锐,Molt 4 细胞内游离镁离子浓度的 31P NMR 测定, 波谱学杂志,13(5): , 程增江, 杜泽涵, 董华进, 颜贤忠, 冯锐, 灌流心脏的 31P NMR 谱测定, 波谱学杂志. 13( 5): , 马百平, 董俊兴, 王秉, 颜贤忠, 知母中呋甾皂甙的研究, 药学学报, 31(4): , 李桦, 颜贤忠, 阮金秀, 杜泽涵,19F 体内核磁共振技术观测 5--, 中国药理学与毒理学杂志, 11(4): , Ma B., Wang B., Dong J., Yan X., Zhang H. and Tu A New spirostanol glycosides from Anemarrhena asphodeloides. Planta Med. 63(4): Dong H. Zhan H. Yan X. and Yang X, Effects of tea polyphenols on cardiac function of isolated working heart in rat, calcium current in cultured rat sympathetic neuron and energy metabolism in mouse brain ( 英文 ), 中华航空航天医学杂志, 8(2): 69-73, 颜贤忠, 晏礼明, 徐家鸰, 杜泽涵, 吴本玠. 用 31P NMR 研究小鼠脑在缺氧状态下能量代谢的动态变化, 波谱学杂志,14(2): , 李桦, 颜贤忠, 魏昌华, 阮金秀, 杜泽涵, 19F 体内核磁共振技术观测 5- 氟尿嘧啶在小鼠植入肿瘤中的摄取与代谢, 中国药理学与毒理学杂志, 12(1): 52-57, 1998.

9 国家生物医学分析中心核磁实验室 黄荣清, 杜泽涵, 杨志刚, 冯锐, 李光玉, 颜贤忠,31P 核磁共振观察 γ- 干扰素对 Mol- -4 细胞作用后含磷代谢物及 ph 变化, 分析测试学报, 17(2): 57-59, Zhu, G., Kong, X., Yan, X. and Sze, K.H. Sensitivity enhancement in transverse relaxation optimized NMR spectroscopy. Angew. Chem. Int. Edt. 37(20), , Sze, K.H., Yan X., Kong, X., Che, C.T. and Zhu, G. Phase sensitive 3D J-resolved HMBC experiment for spectral assignment and measurement of long-range heteronuclear coupling constants. Tetrahedron Lett. 40(30), , Zhu, G., Xia, Y., Sze, K.H. and Yan, X. 2D and 3D TROSY-enhanced NOESY of N-15 labeled proteins. J. Biomol. NMR 14(4), , Zhang, Q., Ye, W., Yan, X., Zhu, G., Che, C.T. and Zhao, S. Cernuosides A and B, two sucrase inhibitors from Pulsatilla cernua. J. Nat. Prod. 63(2), , Yan X., Xue H., Liu, H., Hang, J., Wong J.T.F. and Zhu, G. NMR studies of Bacillus subtilis trnatrp hyperexpressed in Escherichia coli -Assignment of imino proton signals and determination of thermal stability. J. Biol. Chem. 275(10), , Yan, X., Kong, X., Xia, Y., Sze, K.H. and Zhu, G. Determination of Internucleotide hjhn Couplings by the Modified 2D JNN Correlated-[15N, 1H]-TROSY. J. Magn. Reson. 147(2), , 黄荣清, 舒融, 颜贤忠, 骆传环, 杜泽涵, 白血病细胞内磷酸单酯的 ~(31)P 核磁共振分析, 分析测试学报,21(4): 5-7, Wang, YQ., Yan, XZ., Gong, SS., Fu, WH. Two New C -21 Steroidal Glycosides from Cynanchum aurichulatum. Chinese Chem. Lett. 13(6): , Yao YN, Zhang QS, Yan XZ, Zhu G, Wang ED. Substrate-induced conformational changes in Escherichia coli arginyl-trna synthetase observed by 19F NMR spectroscopy. FEBS Lett. 547(1-3): , Yao YN, Zhang QS, Yan XZ, Zhu G, Wang ED. Escherichia coli trnaarg4 (UCU) induces a constrained conformation of the crucial X-loop of arginyl-trna synthetase. Biochem. Biophys. Res. Commun. 313: , 王全军, 颜贤忠, 吴纯启, 赵剑宇, 盛和章, 余寿忠, 袁本利, 廖明阳.Z24 经口染毒大鼠血浆的代谢组学研究. 卫生毒理学杂志,18(2): 73-75, 颜贤忠, 赵剑宇, 彭双清, 廖明阳. 代谢组学在后基因组时代的作用. 波谱学杂志,21(2): , 彭双清, 廖明阳, 颜贤忠. 代谢组学方法的建立及其在药物安全评价中的应用, 卫生毒理学杂志,18(3): , 赵剑宇, 颜贤忠, 基于核磁共振的代谢组学研究进展. 国外医学. 药学分册. 31(5): ,2004.

10 国家生物医学分析中心核磁实验室 赵剑宇, 颜贤忠, 彭双清. 中药关木通肾毒性的代谢组学研究, 已投稿. 33. 王全军. 颜贤忠. 吴纯启. 赵剑宇. 余寿忠. 袁本利. 廖明阳. Z24 经口染毒大鼠尿液的核磁共振谱代谢组学研究. 中国药理学与毒理学杂志,2004,18(6): Liao Y, Peng SQ, Yan XZ, and Zhang LS. NMR and pattern recognition studies on enhanced hepatotoxicity caused by co-administration of isoniazid and rifampicin. submitted 专著 1. 颜贤忠, 杜泽涵, 现代仪器分析在生物医学研究中的应用 ( 钱小红, 谢剑炜主编 ), 第十章, 现代核磁共振及其在生物医学中的应用,pp , 北京 : 化学工业出版社, 张建中, 杜泽涵, 生物医学中的磁共振, 北京 : 科学出版社, 田建广, 夏照帆, 杜泽涵, 生物核磁共振, 上海 : 第二军医大学出版社,2001. 会议文摘 1. 颜贤忠, 杜有如 H, 13C and 17O NMR study of hydrogen bonding of alcohols with aprotic solvents. Proc. of the Intl. 3rd. BCEIA. 2. 颜贤忠, 李德有.Tritium NMR studies on some tritiated compounds. Proc. of the 7th Natl. Magn. Reson. Conference,295, 颜贤忠, 李桦, 杜泽涵, 缺氧状态下小鼠大脑代谢的体内 31P NMR 研究, 第八届全国波谱学学术会议论文集,C2-10, 颜贤忠, 李桦, 杜泽涵, 阮金秀,5- 氟尿嘧啶在小鼠肝脏及肿瘤组织中代谢过程的体内 19F NMR 研究, 云南大学学报 ( 自然科学版 )16( 增刊 ):67, Yan, X., Li, H. and Du, Z., metabolism of 5-fluorouracil in murine liver and tumor observed by in vivo 19F NMR spectroscopy, Proc. 6th. International BCEIA, E29, 颜贤忠, 晏礼明等, 用 31P 体内核磁共振方法检测与能量代谢有关的含磷化合物的动态变化, 医用生物力学,10( 增刊 ): 316, 马百平, 王秉, 董俊兴, 颜贤忠, 张慧娟, 屠爱萍, 中药知母中活性甾体皂甙的研究. 第十一次全国中青年医学 ( 放射医学与防护 ) 学术交流会论文摘要汇编,pp49-50, 程增江, 杜泽涵, 董华进, 颜贤忠, 冯锐, 李光玉, 离体灌流心脏的 31P - NMR 测定 ¾ 评价物心脏保护作用的良好模型, 第九届全国波谱学学术会议论文摘要集,pp , 朱广, 孔祥铭, 颜贤忠, 时港洪, 异核多量子相关谱及其在生物核磁共振上的应用. 第十届全国波谱学学术会议论文摘要集,pp8,1998.

11 国家生物医学分析中心核磁实验室 Yan, X., Liu, H., Xue, H., Wong, J. T. F., Zhu, G. NMR studies of Bacillus subtilis trnatrp hyperexpressed in Escherichia coli,xviii International Conference on Magnetic Resonance of Biological Systems, Tokyo, Japan, Yan, X., Kong, X., Xia, Y., Sze, K. H. and Zhu, G. Determination of Scalar coupling Constants across the Hydrogen Bonds in trna. the 41st Experimental Nuclear Magnetic Resonance Conference, Pacific Grove, CA, USA, Yan X., Xia Y., Kong X. and Zhu G Characterization of the hydrogen bond network in trnatrp by nmr spectroscopy, the 9th BCEIA, Beijing. 13.Yan X., Xue H., Wong J.T.F. and Zhu G NMr studies on the Mg2+ binding property of Bacillus subtilis trnatrp, the 12th Natl. Magn. Reson. Conference, Dalian. 14.Yan X, Liang Y., Wu J, Xu X, Liu K., Structural characterization of the amino -ethylpropyl PNA and its binding with DNA by NMR spectroscopy, the 10th BCEIA, Beijing. 15. 赵剑宇, 颜贤忠, 彭双清, 廖明阳, 用基于核磁共振的代谢组学方法研究中药关木通的肾毒性, 第 24 届化学年会, 长沙, 赵剑宇, 颜贤忠, 陈合兵等, 中药关木通肾毒性的代谢组学研究, 第十三届全国波谱学学术会议, 2004, 乌鲁木齐 17. 陈合兵, 颜贤忠, 赵剑宇等, 核磁共振实验参数对代谢组学数据分析的影响, 第十三届全国波谱学学术会议,2004, 乌鲁木齐 研究技术与服务项目 合成及天然药物结构解析 新药报批的结构确证 对映体纯度或对映体过量 (ee) 的测定 硫代寡核苷酸硫代纯度测定 药物杂质和残余溶剂测定 以生物大分子为靶标的新药研究 代谢组学应用 蛋白质空间结构测定 蛋白质 - 配体相互作用 一维 1H 13C 19F 31P 谱 一维 TOCSY NOESY 弛豫时间 (T1 T2) 测定 13C DEPT 其它杂核 ( 如 7Li 17O) 的一维谱 二维 1H-1H COSY,TOCSY,NOESY,1H-13C HSQC,HMQC,HMBC,HMQC-TOCSY 等 蛋白质三维核磁共振实验 生物体液的代谢组学分析

12 国家生物医学分析中心核磁实验室 12 以下无内容

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