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- 补 赵
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1 1002 综述 东亚人群 2 型糖尿病易感基因的研究进展 高帆韩睿 宋滇平 摘要 2 型糖尿病是一种复杂的多基因遗传性疾病, 东亚人群全基因组关联研究 (GWAS) 使该地区 2 型糖尿病遗传易感性的研究进入一个崭新阶段 目前已鉴定出 20 余个东亚人群 2 型糖尿病易感基因, 本文对这些参与胰岛 β 细胞功能维持和外周胰岛素抵抗等方面的基因作一简介 关键词 糖尿病,2 型 ; 东亚人群 ; 易感基因 ; 全基因组关联研究 Progress on susceptibility genes of type 2 diabetes mellitus in East Asians Gao Fan, Han Rui, Song Dianping. Department of Diabetes, the First Affiliated Hospital of Kunming Medical University, Kunming , China Corresponding author: Song Dianping, drsongdp@sina. com Abstract Type 2 diabetes mellitus (T2DM) is a complicated polygenic hereditary disease. The research of the Genome Wide Association Study (GWAS) has entered the research of the local genetic susceptibility of T2DM into a new stage. At present, more than 20 genes which are associated with T2DM have been identified in East Asian populations. This paper provided a brief introduction on the genes which are involved in the function of pancreatic β cells and peripheral insulin resistance. Key words Diabetes mellitus, type 2; East Asian populations; Susceptibility genes; Genome wide association study 国际糖尿病联盟 (International Diabetes Federation, IDF) 最新统计数据显示 :2013 年全球糖尿病患病 人数已达 3.82 亿, 若不加以控制, 到 2035 年全球 将有近 5.92 亿人患糖尿病 在高达 8.3% 的患病率 中, 约 60% 的患者来自亚洲, 约 80% 的疾病负担来 自中等和低收入国家, 成为 21 世纪威胁人类健康最重要的慢性非传染性疾病之一 目前认为,2 型糖尿病 (type 2 diabetes mellitus, T2DM) 不仅与环境因素相关, 还与遗传因素高度 相关, 其发病机制的重要环节包括胰岛素抵抗 (insulin resistance,ir) 和 β 细胞功能缺陷 全基 因组关联研究 (Genome-wide Association Study, GWAS) 技术和 Meta 分析的进展, 为 T2DM 等复 杂疾病提供了重要的遗传研究策略 GWAS 是在全基因组范围内检测出复杂疾病 相关序列变异的一种新型群体关联分析法 其原理 与候选基因关联分析相类似, 即借助于单核苷酸多 态 (single nucleotide polymorphism,snp) 分子遗 传标记, 对比某一等位基因频率在病例组和对照组 DOI: /cma.j.issn 基金项目 : 云南省双项联合基金项目 ( ) 作者单位 : 昆明医科大学第一附属医院糖尿病科 通讯作者 : 宋滇平, drsongdp@sina.com 间的差异, 判断 SNP 与疾病的相关性 其优势包括研究前不需构建任何生物学假设, 不再局限于候选基因或候选染色体区域作为关联分析对象, 采用大样本的病例对照设计, 并有多个独立样本进行后期验证 2007 年,Sladek 团队揭开了 GWAS 的序幕, 以法国人群为研究对象, 首次对有关 T2DM 的 GWAS 结果进行报道 现已发现的 70 余个易感位点, 多数以研究欧洲人群为主导 而有研究显示, 东亚人群较白种人群对 T2DM 的易感性更高 由于 T2DM 有明显的种族和地域差异, 因此, 寻求与发病相关且针对东亚人群的基因变异, 有助于易感人群的早期发现与防治 现就近年来报道的以 GWAS 技术和 Meta 分析为研究策略, 在东亚人群中发现的 T2DM 遗传易感基因及其致病的功能背景简介如下 一 GWAS 与 T2DM 易感基因 1. 东亚人群的相关研究进展 : 现阶段大部分的易感基因主要是在欧洲人群的研究中被发现的, 但由于 T2DM 具有明显的遗传异质性, 即在不同种族人群内所获得的研究结果不能直接延伸和应用于另一人群, 必须在另一人群中重新进行验证 因此, 寻找和验证会影响东亚人群罹患 T2DM 的变异基因位点意义重大
2 1003 [1] [2] 2008 年 9 月,Yasuda 等及 Unoki 等在日本 人群中通过 GWAS 首次共同确认了 KCNQ1 与 T2DM 的相关性, 并将该结果在韩国 中国及欧洲 人群中进行验证, 这是东亚人群中关于 GWAS 最 [3] 早的报道 2009 年, 有研究公布了日本人群 T2DM 风险预测模型 2010 年 2 月, 有关台湾人群 T2DM 的 GWAS 研究, 通过 2 轮独立验证, 不仅证明了 KCNQ1 遗传位点, 还发现 PTPRD 和 SRR 两个新 的基因区域位点 [4], 这是国际上首次发现的汉族人 [5] 群特有致病基因 同年 Yamauchi 等在日本人群中 发现了东亚和欧洲人群共有的 T2DM 基因区域位点 C2CD4A/C2CD4B, 而 UBE2E2 基因区域位点被验证 [6] 仅为东亚人群特有 同一时期 Shu 等对中国汉族人群 T2DM 的 GWAS, 验证了 C2CD4A/C2CD4B 和 CDC123/CAMK1D 的基因区域易感位点 2011 年, [7] Cui 等对中国汉族人群再次验证了 KCNQ1 和 C2CD4A/C2CD4B 基因区域位点与 T2DM 的相关 性 之后, 在东亚人群进行的一项大样本 T2DM 的 GWAS, 成功筛选了八个新的易感基因区域 (GLIS3 PEPD FITM2/R3HDML/HNF4A KCNK16 MAEA GCC1/PAX4 PSMD6 和 ZFAND3) [8] [9] 2012 年,Imamura 等在日本人群中的 GWAS 发现 一个新的不同种族共有的 T2DM 易感基因 ANK1 [10] 2013 年,Li 等除在中国汉族人群中确认七个 T2DM 遗传易感位点 (CDKAL1 CDKN2A/B KCNQ1 CDC123 GLIS3 HNF1B 和 DUSP9) 在全基因组 的意义, 还在全球首次发现 GRK5-rs 与 RASGRP1-rs 两个新的基因区域, 且前者为 [11] 东亚人群所特有 同年,Ma 等在中国汉族人群 中发现 PAX4 为另一个新型 T2DM 的 GWAS 基因 区域 并在东亚和欧洲等人群中验证其为不同种族 共有的 T2DM 遗传易感基因 同一时期,MIR129- LEP SLC16A13 GPSM1 三个 T2DM 基因区域被 [12] Hara 等在东亚人群 GWAS 中找到 ( 表 1,2) 2. 中国人群的相关研究进展 : 至 2013 年, 中 国糖尿病患病人数为 万, 居全球之首 ; 预计 到 2035 年, 患病人数将升至 1.43 亿 T2DM 在中 国的快速增长, 已给社会和经济发展带来沉重的负 担 尽管目前中国发现的 T2DM 易感基因越来越 多, 但这些基因位点的功效相对较低, 且存在个体 差异, 仍不足以解释东西方人群在遗传易感性上的 差异 基于已发表的中国人群 T2DM 的 GWAS 结 果, 现对已报道的易感位点归纳为 :SLC30A8 HHEX CDKAL1 CDKN2A/B IGF2BP2 KCNQ1 GCKR GCK PPARG KCNJ11 PTPRD SRR MTNR1B PCSK1 TCF2 MADD GIPR DGKB CRY2 GLIS3 PROX1 IGF1 WFS1 JAZF1 TSPAN8/LGR5 MTHFR FTO C2CD4A/B ADRA2A VPS26A HNF1B GRK5 RASGRP1 PAX4 CDC123( 图 1) 二 T2DM 易感基因致病的功能背景 2006 年开始, 发达国家率先开展了复杂疾病的 GWAS 现阶段发现的易感区域一般都能在后续的 研究中被验证, 是目前公认的 T2DM 易感基因筛选 的有效途径 与之相比, 众多易感基因区域的功能 及其导致 T2DM 的分子机制则需进一步深入探讨 1. 与 β 细胞分泌胰岛素相关的 T2DM 易感基 因 :β 细胞的功能下降 ( 胰岛素分泌受损 ) 是 T2DM 的主要病理生理特征之一 目前在东亚人群 GWAS 发现的 T2DM 易感基因中, 确定与 β 细胞分泌胰岛 素有关的 9 个 (KCNQ1 SRR UBE2E2 C2CD4A/B CDC123/CAMK1D GLIS3 KCNK16 RASGRP1 表 1 东亚人群 T2DM 全基因组关联研究汇总 第一作者 发表时间 期刊 初筛样本量 ( 病例 / 对照 ) 涉及人群 基因分型平台 [SNP 个数 ] Yasuda K 2008 Nat Genet 187/1 504 日本人 Illumina[392935] Unoki H 2008 Nat Genet 194/1 558 日本人 Affymetrix[207097] Takeuchi F 2009 Diabetes 519/503 日本人 Illumina[482625] Tsai FJ 2010 PLoS Genet 995/894 中国人 Illumina[516737] Yamauchi T 2010 Nat Genet 4 470/3 071 日本人 Illumina[459359] Shu XO 2010 PLoS Genet 1 019/1 710 中国人 Affymetrix[590887] Cui B 2011 PLoS One 793/806 中国人 Illumina[474515] Cho YS 2011 Nat Genet 6 952/ 东亚人 Affymetrix and Illumina[ ] Imamura M 2012 Hum Mol Genet 4 470/3 071 日本人 Impute[ ] Li H 2013 Diabetes 8 569/8 923 中国人 Illumina[657366] Ma RC 2013 Diabetologia 955/684 中国人 Illumina[ ] Hara K 2013 Human Molecular Genetics 5 976/ 日本人 Illumina[ ]
3 1004 表 2 东亚人群 T2DM 全基因组关联研究识别的遗传易感位点 确定年份 基因 ( 区域 ) 发现年份 染色体 位置 SNP 危险 / 参考等位基因 RAF OR(95% CI) 2008 KCNQ rs C/T (1.34~1.47) 2010 CDC123/CAMK1D rs G/A (1.18~1.39) PTPRD rs T/C (1.36~1.82) SRR rs G/A (1.18~1.39) UBE2E rs C/A (0.94~1.09) C2CD4A/4B rs G/A (1.08~1.14) SPRY rs G/A (1.10~1.20) 2011 ZFAND rs G/A (1.04~1.08) GLIS rs A/G (1.07~1.13) PEPD rs T/C (1.36~1.82) FITM2-REHDML-HNF4A rs G/T (1.07~1.12) KCNK rs T/G (1.05~1.11) MAEA rs C/G (1.10~1.16) GCC1/PAX rs G/A (1.07~1.14) PSMD rs C/T (1.06~1.12) 2012 ANK rs C/T (1.12~1.25) 2013 GRK rs C/T (1.08~1.16) RASGRP rs T/C (1.06~1.13) PAX rs G/A (1.07~1.14) MIR129-LEP rs A/G (1.12~1.22) SLC16A rs G/A (1.10~1.20) GPSM rs A/G (1.14~1.26) ANK1) 易感位点 [13] 其中,KQT 亚科 - 钾离子电压门控通道 1 基因 (potassium voltage-gated channel,kqt-like subfamily member 1,KCNQ1) 为编码膜电位控制钾离子通道 (IKs) 的 α 亚单位, 通常称为 KvLQT1, 由该蛋白 构成的 IKs 与胰岛素的分泌有关, 遗传位点 rs rs 和 rs 被认为与 2 型糖 [14] 尿病致病相关 有研究在高葡萄糖钳夹试验中发 现 rs 位点与葡萄糖刺激的第二时相胰岛素 分泌有关, 且认为亦与脂类代谢有关 含钙离子依赖性 C2 结构域的蛋白质 4A/4B 基 因 (C2 calcium-dependent domain containing 4A, C2CD4A/C2CD4B) 是一种依赖 C2 结构域的含钙 [15] 离子蛋白质 Grarup 等发现 C2CD4A/C2CD4B 基因可能通过损害胰岛 β 细胞功能而引发糖尿病, 其 SNP 位点 rs 能降低非糖尿病正常人群葡 萄糖刺激引起的胰岛素反应 (GSIR) 空腹血糖水 平 (FBG) 可反映 β 细胞的基础分泌能力 2010 年, [16] Dupuis 等发现了 16 个与空腹血糖水平关联的基 因位点, 后续的 Meta 分析进行了重复验证, 其中 GLIS3 C2CD4B 为已知东亚人群 T2DM 的易感基 因 胰岛素原 (Proinsulin) 是胰岛素的前体物质, 由胰岛素和 C 肽组成, 具有双重免疫活性 胰岛 β 细胞功能障碍 高血糖 IR 及 T2DM 会使血液中 [17] 的 Proinsulin 水平升高 2011 年,Strawbridge 等 发现了 9 个与血 Proinsulin 水平关联的基因并证实 C2CD4A/C2CD4B 与高 Proinsulin 水平和低胰岛素 分泌指数 (HOMA-B) 相关 丝氨酸消旋酶基因 (serine racemase,srr) 是 新的吡多醛 -5' 磷酸依赖酶, 主要存在于胶质细胞 中, 其异型可改变胰腺的谷氨酸盐信号, 调控胰岛 素和胰高血糖素分泌 细胞周期相关蛋白 (cell division cycle 123 homolog, CDC123 ) / 钙调蛋白激酶 (calcium/ calmodulin-dependent protein kinase 1D,CAMK1D) 基因层 CDC123 编码细胞周期相关蛋白, 而 CAMK1D 编码钙调蛋白激酶 在印度人群中的研 究发现该基因变异可导致 β 细胞功能下降和 β 细胞 凋亡增加, 从而影响胰岛素的分泌 [18] 2. 与胰岛素敏感性相关的 T2DM 易感基因 : 机 体外周组织对胰岛素敏感性降低是 T2DM 的另一主 要病理生理特征 东亚人群中共发现 5 个 T2DM 易感 基因 (PTPRD PEPD GRK5 ZFAND3 SPRY2) 可影响胰岛素敏感性 [13] 蛋白酪氨酸磷酸酶受体 D 型基因 (protein tyrosine phosphatase receptor type D,PTPRD) 与白 细胞共同抗原相关蛋白 (leukocyte antigen-related protein,lar) 和蛋白酪氨酸磷酸酶受体 S 型
4 1005 ( proteintyrosine phosphotase receptor type S, PTPRS ) 共同构成蛋白酪氨酸磷酸酶 ( protein tyrosine phosphatase,ptp) 受体类型 ⅡA(receptor [4] type ⅡA,R2A) Tsai 等研究发现 LAR 和 PTPRS 可参与胰岛素信号传导和调控 研究显示, 骨骼肌 过度表达 LAR 的转基因小鼠胰岛素抵抗增高,R2A 亚型成员间的结构较类似, 所以,PTPRD 也可能是 通过参与胰岛素对靶细胞的调控而影响 T2DM G 蛋白耦联受体激酶基因 (G-protein-coupled receptor kinase,grks) 是丝 / 苏氨酸蛋白激酶家族 成员之一, 其亚型分布于各种组织, 使活化的 GPCR [19] 发生丝 / 苏氨酸磷酸化 林旭等发现 GRK5- rs 的危险等位基因与血浆空腹胰岛素水平 的升高和胰岛素敏感指数的降低相关联 因此, GRK5 使 T2DM 患病风险增加可能与胰岛素敏感性 的降低有关 3. 与肥胖相关的 T2DM 易感基因 : 肥胖是导 致胰岛素抵抗的最重要的因素 与欧洲人群相比, 亚洲人群具有向心性肥胖和肌肉组织较少的倾向, β 细胞功能受损更早且更严重 BMI 正常但伴有向 心性肥胖的体型, 被认为是亚洲人群 T2DM 易感性 高的因素之一 萌芽同源物 2 基因 (Sprouty2,SPRY2) 是信 号通路特异性的抑制蛋白 (Sprouty,SPRY)4 种亚 [20] 型成员之一, 即 SPRY1~ 年,Urs 等发 现 SPRY1 SPRY2 是小鼠体内脂肪组织分化的关 键调节器,Spry1 功能的缺失将导致低骨密度和高 [21] 血脂 2011 年,Kilpeläinen 等证实 SPRY2 与胰 岛素抵抗和体脂率 ( 即人体内脂肪含量占人体体重 的百分数 ) 有关, 可能在脂肪组织中起分化调控作 用 综上所述, 近年来对东亚地区 T2DM 易感基因的研究取得了令人欣喜的成绩 但由于种群差异 生活环境等因素的差异, 以及受当前基础研究技术水平所制约, 许多基因的研究也只是揭示了 冰山一角 因此, 进一步深入探讨有关 T2DM 易感基因的功能及在 T2DM 发病机制中的作用任重而道远 参考文献 [1] Yasuda K, Miyake K, Horikawa Y, et al.variants in KCNQ1 are associated with susceptibility to type 2 diabetes mellitus[j]. Nat Genet, 2008, 40(9): [2] Unoki H, Takahashi A, Kawaguchi T, et al. SNPs in KCNQ1 are associated with susceptibility to type 2 diabetes in East Asian and European populations[j]. Nat Genet, 2008, 40(9): [3] Takeuchi F, Serizawa M, Yamamoto K, et al.confirmation of multiple risk Loci and genetic impacts by a genome-wide association study of type 2 diabetes in the Japanese population[j]. Diabetes, 58(7): [4] Tsai FJ, Yang CF, Chen CC, et al. A genome-wide association study identifies susceptibility variants for type 2 diabetes in Han Chinese[J]. PLoS Genet, 2010, 6(2): e [5] Yamauchi T, Hara K, Maeda S, et al. A genome-wide association study in the Japanese population identifies susceptibility loci for type 2 diabetes at UBE2E2 and C2CD4A-C2CD4B[J]. Nat Genet, 2010, 42(10): [6] Shu XO, Long J, Cai Q, et al. Identification of new genetic risk variants for type 2 diabetes[j]. PLoS Genet, 2010, 6(9): e [7] Cui B, Zhu X, Xu M, et al. A genome-wide association study confirms previously reported loci for type 2 diabetes in Han Chinese[J]. PLoS One, 2011, 6(7): e [8] Cho YS, Chen CH, Hu C, et al. Meta-analysis of genome-wide association studies identifies eight new loci for type 2 diabetes in east Asians[J]. Nat Genet, 2011, 44(1): [9] Imamura M, Maeda S, Yamauchi T, et al. A single-nucleotide polymorphism in ANK1 is associated with susceptibility to type 2
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