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1 生物多样性和生态工程 教育部重点实验室 2015 年度工作报告 复旦大学北京师范大学 二零一五年十一月

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3 实验室负责人 主任 : 李博教授复旦大学 副主任 : 张正旺教授北京师范大学 学术委员会 主任 : 张大勇教授北京师范大学 成员 : 郑光美 院士 北京师范大学 朱有勇 院士 云南农业大学 陈小勇 教授 华东师范大学 何芳良 教授 加拿大阿尔伯塔大学 贺金生 教授 北京大学 蒋志刚 研究员 中国科学院动物研究所 李博 教授 复旦大学 李德铢 研究员 中国科学院昆明植物研究所 卢宝荣 教授 复旦大学 马克平 研究员 中国科学院植物研究所 王刚 教授 兰州大学 杨桂山 研究员 中国科学院湖泊地理研究所 张正旺 教授 北京师范大学 钟扬 教授 复旦大学 I

4 实验室固定人员 孙儒泳 生态学 院士 顾问 郑光美 鸟类生态学 院士 顾问 陈家宽 保护生物学 教授 学科带头人 方长明 土壤生态学 教授 学科带头人 葛剑平 景观生态学 教授 学科带头人 李博 入侵生态学 教授 实验室主任 林魁 生物信息学 教授 学科带头人 卢宝荣 生态安全遗传多样性 教授 学科带头人 骆亦其 生态学 教授 学科带头人 肖向明 生态学 教授 学科带头人 杨继 分子进化 教授 学科带头人 张大勇 进化生态学 教授 学术委员会主任 张正旺 鸟类生态学 教授 实验室副主任 钟扬 植物学生物信息学 教授 学科带头人 成新跃 昆虫学 教授 学术带头人 邓文洪 鸟类生态学 教授 学术带头人 傅萃长 动物生态学 教授 学术带头人 郭延平 植物学 教授 学术带头人 廖万金 繁殖生态学 教授 学术带头人 刘定震 动物行为学保护生物学 教授 学术带头人 娄安如 植物生态学 教授 学术带头人 马志军 鸟类生态学 教授 学术带头人 牟溥 生态系统生态学 教授 学术带头人 牛翠娟 生理生态学水生生物学 教授 学术带头人 牛登科 进化生物学比较基因组学 教授 学术带头人 宋志平 植物学 教授 学术带头人 吴纪华 线虫生态学 教授 学术带头人 张金屯 植被生态学 教授 学术带头人 张立 保护生物学 教授 学术带头人 张全国 进化生态学 教授 学术带头人 II

5 张文驹 植物学 教授 学术带头人 张雁云 鸟类生态学 教授 学术带头人 赵斌 景观生态学 教授 学科带头人 周淑荣 理论生态学 教授 学术带头人 聂明 微生物生态学 青年研究员 学术骨干 白伟宁 进化生态学 副教授 学术骨干 董路 保护遗传学 副教授 学术骨干 韩洁 动物生态 副教授 学术骨干 寇晓军 景观生态学 副教授 学术骨干 米泽隆弘 动物分子进化 副教授 学术骨干 南蓬 生物信息学 副教授 学术骨干 潘晓云 生态学 副教授 学术骨干 庞尔丽 生物信息学 副教授 学术骨干 王红芳 生态学 副教授 学术骨干 王天明 景观生态学 副教授 学术骨干 王玉国 植物学 副教授 学术骨干 殷明波 进化生态学 副教授 学术骨干 周铜水 天然药物 副教授 学术骨干 冯利民 生态学 讲师 学术骨干 夏灿玮 生态学 讲师 学术骨干 鲍蕾 生态学 高级工程师 技术骨干 张玉芬 生态学 高级工程师 技术骨干 朱璧如 生态学 工程师 技术骨干 蔡星星 植物学 实验师 技术骨干 蒋如敏 植物学 实验师 技术骨干 陆帆 植物标本 实验师 技术骨干 屈云方 动物学 实验师 技术骨干 赵佳媛 生物信息学植物学 实验师 技术骨干 郭海强 生态学 科研助理 技术骨干 彭容豪 生态学 科研助理 技术骨干 朱永青 植物学 科研助理 技术骨干 III

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7 目录 年度主要研究进展... 1 方向一生物多样性与环境变化... 2 环境波动对进化拯救效应的负面影响... 3 结合物种均匀度和功能多样性能够最大程度地预测多宿主群落中的疾病风险... 4 不同生物基因组中减数分裂基因及其共表达关系的进化分析... 5 基于 PALSAR 和 LandsatTM/ETm+ 影像对海南热带森林空间分布研究... 6 长江口盐沼湿地双壳类物种分布及其食源的时空变化... 7 方向二生物入侵及其后果... 8 生物间正负交互作用与入侵植物乌桕的耐盐性... 9 专化天敌取食与光强对入侵植物防御性状进化没有交互效应 豚草的地理扩张与局域适应进化 均温升高和极端高温事件频发可能加重入侵昆虫种群的暴发 方向三生态工程的原理及其应用 东北虎和东北豹重大保护生态工程 政府有关部门应当果断禁止国内象牙贸易 多基因序列分析证实树鹧鸪 (Tropicoperdix) 是一个单独的属 迁徙停歇地对候鸟迁徙时间调节的作用 蒙古黄芪次生代谢产物及其分子调控机制 发表论文 科研项目 年度在研纵向项目 年度在研横向项目 年度获批准项目 获奖 著作与译著 授权专利 队伍建设 人才引进 人才培养 学术交流与合作 i

8 开放课题及自主创新课题 实验室运行管理 ii

9 年度主要研究进展 2015 年度, 根据学术委员会意见与建议并结合国家战略发展需求和国际前沿进展, 本实验室围绕着生物多样性与环境变化 生物入侵及其后果和生态工程的原理及其应用三个研究方向开展了系列研究, 在东北虎和东北豹重大保护生态工程 亚洲象保护政策性研究 环境波动对进化拯救效应的负面影响 宿主群落疾病风险预测 不同生物基因组中减数分裂基因及其共表达关系的进化分析 海南热带森林空间分布 长江口盐沼湿地双壳类物种分布及其食源的时空化 专化天敌取食与光强对入侵植物防御性状进化影响 迁徙停歇地对候鸟迁徙时间调节的作用 蒙古黄芪次生代谢产物及其分子调控机制等方面取得了重要研究进展, 尤其是葛剑平教授团队有关东北虎和东北豹重大保护生态工程方面的工作得到了习近平主席和李克强总理的重要批示, 对我国的珍稀濒危物种保护起到了重要的推动作用 张立教授就我国亚洲象的保护在 Nature 上发表了专家意见, 在国内外产生了重要影响 2015 年本实验室共发表 SCI 论文 100 篇, 其中在 Nature Science Ecology Letters Ecology Evolution 和 The American Naturalist 等本领域内 Top 期刊发表论文论文 8 篇, 在研纵向课题 64 项, 获批准自然科学基金面上项目 9 项 1

10 方向一 生物多样性与环境变化 2

11 环境波动对进化拯救效应的负面影响 张全国 生物种群在环境退化过程中可能进化出对新环境的耐受性而实现长期续存 这一进化拯救效应得到了若干进化实验的证实 ; 很多进化生物学家对进化拯救在减慢生物多样性丧失方面发挥的作用持乐观态度 此前大部分研究在理论上借鉴了种群遗传学关于定向自然选择的思路, 在实证研究方面关注了实验种群在单调退化环境中的适应性进化 在真实环境中往往环境波动的生态后果比环境定向变化的影响更重要 与全球变化相关的环境因子的变化也往往既体现为环境参数均值的定向改变, 又表现为环境参数波动程度的加剧 对环境波动如何影响种群续存, 主要的不确定性因素是环境波动过程中短时段的环境好转事件的影响 若干工作表明这样的环境好转事件相当于为种群提供了一个避难所, 允许种群实现恢复增长, 进而促进种群的长期续存 这些研究仅仅考虑了生物种群的生态学响应 如果考虑进化影响在内, 间歇性的环境好转可能促进种群续存 ( 增加个体数量可以降低短期内灭绝风险, 也可能增加种群获得适应未来不良环境的有利突变的机会 ), 也可能不利于种群续存 ( 适应未来不良环境的有利突变在环境好转时段没有更高的适合度, 因而在种群内数量上升并固定的概率降低 ) 这两种相反的作用组合在一起的净效应不容易给出预测 本研究以侵染荧光假单胞菌 (Pseudomonas fluorescence) 的一种噬菌体病毒 (Φ2) 开展进化实验 该噬菌体的祖先型在温度上升到 30 C 后将失去侵染宿主细菌的能力 ( 其宿主细菌的温度耐受上限更高 ), 但是可以发生遗传决定的表型改变, 至少可以进化出对 31.4 C 的耐受性 在候选人开展的实验中, 培养温度在上升过程中, 如果存在间歇性的环境好转 ( 温度降低 ), 这些环境好转事件可以促进种群个体数量上升, 但是当环境的恶化状态恢复之后种群面临更大的灭绝风险 ; 而在温度逐步上升情形下种群有更大概率进化出高温耐受性 这表明间歇性环境好转事件通过种群遗传过程发挥的负面影响超过了通过种群动态过程发挥的正面影响 也就是说短期的环境好转事件构成了一个进化意义上的 陷阱 研究成果发表于 Ecology Letters(Hao YQ, et al. 2015, Ecology Letters, 18, ) 张全国博士为通讯作者, 研究生郝祎祺为第一作者 该工作得到了国家自然科学基金和 111 计划的支持 3

12 结合物种均匀度和功能多样性能够 最大程度地预测多宿主群落中的疾病风险 陈立范周淑荣 在全球生物多样性快速丧失的背景下, 生物多样性和疾病之间的关系不仅是一个重要的科学问题, 同时跟我们每个人的生活息息相关 尽管很多实验和理论研究表明, 生物多样性和疾病爆发风险之间是负相关的, 然而多样性对疾病的这种稀释效应仍然存在很大争议 到目前为止, 大部分多样性 - 疾病关系的研究是基于物种丰富度进行的 事实上不同物种在生理和生态存在很大差异, 从而导致不同的生态系统功能和服务 功能多样性不仅表明有多少生态位空间被占据, 而且表明这些空间被如何占据 目前在多样性 - 疾病关系的研究中很少考虑功能多样性的相对重要性 我们构建了多物种传染病模型, 通过计算机模拟群落中物种多样性的丧失, 结合物种多样性和功能多样性, 利用广义线性回归模型研究了生物多样性和疾病风险之间的关系 研究表明, 物种均匀度指标在解释疾病风险的差异时优于物种丰富度, 并且结合物种均匀度和功能多样性的广义线性模型是预测疾病风险的最佳组合 这一结果表明目前对于稀释效应的争议很可能由于其它的生物多样性指标, 如物种均匀度和功能多样性, 比物种丰富度更能反映出疾病风险 同时说明在自然群落中, 综合多个多样性指标可能能够更好地预测疾病风险 4

13 不同生物基因组中减数分裂基因及其共表达关系的进化分析 杨继 围绕减数分裂基因的功能和作用机制目前已开展很多研究, 从植物基因组中已克隆鉴定了 90 个减数分裂基因, 但从酵母 小鼠 人等生物基因组中已分别鉴定了约 200 个减数分裂相关基因 基于序列同源性进行预测, 并结合表达谱数据进行筛选, 确认了在拟南芥 水稻 江南卷柏和小金发藓中基因组中分别包含 597 个 319 个 502 个和 226 个潜在的减数分裂基因, 这些基因在植物减数分裂过程中的作用绝大部分未知, 而这些基因的进化保守性和表达特异性预示它们在调控减数分裂过程中的潜在作用, 因而是研究植物减数分裂分子调控机制值得关注的对象 以不同物种减数分裂表达谱数据为基础, 构建基因共表达网络, 通过网络比对和映射了解直系同源基因对之间共表达关系的动态变化式样, 结果显示不同物种之间直系同源基因对与其他基因稳定的 保守的共表达关系非常少 一些减数分裂关键调控基因在不同生物基因组中与不同的基因相互作用参与减数分裂不同核心过程, 导致在基因共表达网络中 在拓扑结构上不存在与减数分裂各核心过程一一对应的相对独立的基因共表达模块, 参与一个功能过程的基因可能分布于多个模块中 在网络映射过程中显示网络模块在不同类群之间或在不同进化阶段发生频繁的重组 (shuffling), 表明伴随不同生物类群的分化, 减数分裂调控网络不仅有新基因的加入和补充, 而且基因相互作用关系也表现一定的进化动态 5

14 基于 PALSAR 和 LandsatTM/ETm+ 影像对海南热带森林空间分布研究 肖向明 热带森林正面临着向人工林的显著转变, 利用遥感技术对热带森林的空间分布及变化过程进行准确识别, 对于森林转换生态效应的评估和森林资源的可持续管理都具有非常重要的意义 我们以海南岛为例, 结合森林冠层结构特征和物候变化规律, 开发了基于 25 米 PALSAR 雷达影像和 30 米多时相 Landsat TM/ETM+ 影像的热带森林和橡胶林准确识别算法, 提出利用年度最大值合成归一化植被指数 (NDVI) 和最小值水分指数 (LSWI) 来分别消除 PALSAR 森林分类结果中来自城市建筑和高生物量作物如甘蔗的误差像元, 显著提高了分类精度 应用该算法对海南岛 年森林变化过程和 2010 年橡胶林进行监测, 结果表 明海南岛 2010 年森林总面积为 2.04 x 10 6 公顷, 天然橡胶为 5.15 x 10 5 公顷, 其中 年间总面积呈递增趋势变化, 非森林转为森林面积为 4.07 x 10 5 公顷 (16.47%), 消 失的森林面积为 1.71 x 10 5 公顷 (6.93%), 其中超过 90% 的森林转换均发生在 400 米海拔 以内, 森林面积变化的其主要原因是橡胶林和桉树林等人工林的增加 6

15 长江口盐沼湿地双壳类物种分布及其食源的时空变化 吴纪华 底栖双壳类物种能够连接初级生产者和高营养级消费者如鱼类 蟹类 鸟类等, 在河口生态系统能流通道中起到重要的连接作用 然而, 由于河口水体中颗粒物来源复杂, 鉴别困难, 而双壳类物种作为机会主义取食者又受到水体环境较大的影响, 从而导致河口生态系统中双壳类物种的食性研究还鲜有报道 我们分别在夏季丰水期和冬季枯水期调查了双壳类物种在长江口盐沼湿地的分布情况, 同时采用稳定同位素与脂肪酸技术分析了双壳类物种的食物资源变化情况 结果表明, 中国绿螂 (Glauconome chinensis) 主要栖息在低潮滩海三棱藨草植被生境, 缢蛏 (Sinonovacula constricta) 主要分布在潮沟生境中 缢蛏比中国绿螂利用更多的硅藻和细菌, 而中国绿螂同化更多的维管植物 双壳类消费者主要从悬浮颗粒物中同化吸收硅藻 细菌 鞭毛藻 维管植物和浮游动物, 并且对各食源的利用具有季节差异, 夏季利用更多的维管植物, 而冬季则利用更多的细菌 鞭毛藻和浮游动物 另外, 虽然不同样点中缢蛏具有相似的脂肪酸组成, 但是 δ 13 C 的差异说明不同样点的食物来自于不同的碳源 (C4 植物互花米草与 C3 植物芦苇和海三棱藨草 ) 本研究的发现表明, 双壳类的物种特异性及其食源的时空变化都会影响到其在盐沼湿地中的生态功能, 在将来对河口生态系统食物网研究中应当考虑这些差异 7

16 方向二 生物入侵及其后果 8

17 生物间正负交互作用与入侵植物乌桕的耐盐性杨强李博 E Siemann 入侵植物 土壤反馈一直是入侵生态学研究的热点之一 乌桕 (Triadica sebifera) 本原产于中国,18 世纪引入美国, 现已成为美国最严重木本入侵植物, 已入侵不同土壤的生态系统 ( 图 1) 图 1. 乌桕在原产地 ( 左 ) 和入侵地 ( 中 ) 的分布以及入侵种群一偶 ( 右 ) 在原产地中国, 乌桕主要分布于内陆, 但在美国却能迅速入侵盐沼生态系统, 这可能是以下两大因素所导致 :1) 入侵种自身的适应性进化 ;2) 生物 ( 如昆虫和土壤微生物 ) 间互作的改变 我们通过在原产地和入侵地, 采用来自原产地和入侵地的不同乌桕种群进行同质园实验, 结果表明 : 1) 乌桕原产地种群与入侵地种群的耐盐性无显著差异 ( 表 1) 表 1. 实验地 种群来源 生物因子 盐分处理及其交互作用对乌桕生长性状的影响 图 2. 在原产地和入侵地, 盐分处理对乌桕存活率的影响 图 3. 盐分和模拟草食作用件下乌桕幼苗的存活率 图 4. 模拟草食作用条下乌桕的存活率 2) 乌桕在入侵地的耐盐性比在原产地高 ( 图 2) 9

18 3) 尽管模拟草食作用能显著降低乌桕的耐盐性 ( 图 3), 但其在入侵地受到的草食作用远小于原产地 ( 图 4) 4) 在高盐处理中, 土壤灭菌并不能显著影响乌桕的存活率 在低盐度处理中, 土壤灭菌降低了原产地乌桕的存活率, 但增加了入侵地乌桕种群的存活率 ( 图 5) 5) 在入侵地低盐处理中, 乌桕入侵地种群的菌根真菌侵染率高于原产地种群 ( 图 6) 图 5. 在盐分处理和模拟草食条件下乌 桕存活率比较 图 6. 乌桕在不同处理下菌根真菌的侵染率比较 总之, 在乌桕的入侵过程中, 其耐盐性可能没有发生适应性进化 ; 我们所观察到的耐 盐性增加, 可能是乌桕在入侵地的去负作用 ( 逃离了原产地专性天敌的影响 ) 和增强的正 作用 ( 加强了与共生真菌的关系 ) 共同作用的结果 相关论文 : Yang Q, Li B, Siemann E Positive and negative biotic interactions and invasive Triadica sebifera tolerance to salinity: a cross-continent comparative study. Oikos, 124:

19 专化天敌取食与光强对入侵植物防御性状进化没有交互效应 潘晓云 生物入侵严重威胁全球的生物多样性并造成大量经济损失, 研究入侵种的防御进化机制有利于制定有效的生物防治措施 大量研究发现天敌释放会使入侵植物进化出更低的抗虫性和更高的竞争能力, 但忽视了耐受性的研究 入侵植物在面临天敌释放的同时, 也经历了资源有效性的改变, 这两者可能协同影响入侵植物的进化 本研究以原产于阿根廷, 现已入侵北美中国等地的世界性入侵植物喜旱莲子草 (Alternanthera philoxeroides) 为研究系统, 在不同的光照 ( 遮阴与不遮阴 ) 以及有无专化天敌 ( 空心莲子草跳甲,Agasicles hygrophila) 取食条件下比较了原产地和入侵地各 10 个种群的生长, 资源分配和功能性状 结果表明 :(1) 与原产地种群相比, 喜旱莲子草入侵地种群有相似的生物量和对专化天敌的耐受性, 更低的分枝强度 比茎长和比叶面积 ;(2) 喜旱莲子草入侵地种群具有更高的耐阴性, 比茎长对光的可塑性更小 ;(3) 光的有效性并不影响喜旱莲子草对专化天敌耐受性的进化 这说明喜旱莲子草入侵后发生了快速进化, 入侵地种群通过减少分枝 降低可塑性降低了种内竞争形成更致密的种群, 而其保持的耐受性可能会减弱空心莲子草跳甲生物防治的效果 11

20 豚草的地理扩张与局域适应进化 廖万金张大勇 入侵植物在入侵地面临着新的环境和选择压力, 对植物性状, 尤其是繁育系统性状的快速适应进化机制的研究提供了非常理想的实验系统 本研究从植物繁育系统性状进化的角度研究了区域性恶性入侵杂草豚草 ( Ambrosia artemisiifolia ) 在我国的种群扩散机制, 揭示了植物繁育系统性状在新环境下的快速适应进化 同质生物园实验揭示了豚草开花时间和开花时株高与来源纬度之间显著的相关性 来自高纬度的植株开花较早, 开花时个体较小 说明不同纬度地区的豚草种群已经发生了开花物候的可遗传分化, 表现出了表型性状的纬度渐变性 进一步的交互移植实验表明, 不同地区的豚草种群产生了一定的局域适应性, 而开花时间的分化对于豚草的局域适应性具有重要意义 光依赖通路中的 CRY2 基因和赤霉素通路中的 SPY 基因表达与开花时间的分化紧密相关 12

21 均温升高和极端高温事件频发可能加重入侵昆虫种群的暴发 鞠瑞亭李博 鉴于外来物种入侵的频率可能因环境变化而增加, 有关外来物种对气候变化的响应规律, 正成为全球变化生态学和入侵生物学研究的焦点和热点问题 特别是, 关于入侵种群的时空动态如何在气候变化情景下作出可塑性转换是这一研究的核心科学问题 对该科学问题开展详细研究, 在理论上有助于提升人们对入侵种在未来气候变暖的情景下发生发展规律的科学认识, 在应用上可为外来有害生物的中长期预测预报提供有说服力的依据 我们基于我国长江流域夏季均温持续升高 极端高温事件频发等气候变暖的特点, 模拟了三种升温情景 ( 均温升高 2 C 午后出现 38 C 高温以及两者的叠加 ), 利用新近入侵我国城市生态系统的外来害虫悬铃木方翅网蝽为研究对象, 观察了不同升温情景对该网蝽在长江流域的三个地理种群 ( 上海 武汉 重庆 ) 的增值影响 结果发现, 在悬铃木方翅网蝽的夏季种群中, 无论是在均温升高 还是极端高温事件频发 亦或两者的叠加的情景下, 网蝽种群内禀增长率均比对照 (26 32 C 变温, 模拟当前夏季温度较为适宜的情景 ) 显著增加, 而种群的世代周期则显著缩短, 这一规律在长江流域的三个种群中未出现地理分化 这一结果表明, 耐热性较强的广布型外来害虫 ( 如在温带和亚热带广泛入侵的悬铃木方翅网蝽 ) 可能会在未来越来越热的夏天, 种群规模迅速扩张, 其中长期防控策略的制定上需格外注意高温对种群暴发的刺激作用 本研究得到国家自然科学基金和上海市科委基础研究重点项目资助, 成果于 2015 年 10 月 27 日在线发表在 Scientific Reports 上 13

22 方向三 生态工程的原理及其应用 14

23 东北虎和东北豹重大保护生态工程 葛剑平王天明冯利民牟溥徐汝梅当前, 濒危物种东北虎和极濒危物种东北豹仅残存于远东俄罗斯锡霍山脉 如果它们能够重返 100 多年前最主要分布区中国东北东部森林, 将是这两个物种走出濒危状态的根本之路 为此, 我们自 2006 年以来选择俄罗斯境内虎豹可能向中国扩散的关键区域和通道建立了大尺度生物多样性长期定位监测体系, 监测到了中国东北东部边境区域有 28 只东北虎和 42 只远东豹的活动, 多数虎豹个体的活动仅局限于边境狭窄区域 5 公里范围内, 呈现出明显的 边境集聚效应 但是, 值得关注的是一只雌虎已在中国境内定居并繁育 4 只幼崽, 两个豹家庭虎豹先锋个体或家庭已经深入中国境内 50 余公里繁育和定居虎, 存在着向中国境内强大的迁移和扩散趋势 我们进一步发现, 已经实施 10 余年的中国天然林保护工程, 正在有效地促进森林质量提高和食物链不断恢复, 然而, 边境区域严重放牧和人的活动严重抑制了虎豹种群向中国进一步迁移和定居, 他们也同时限制了主要猎物梅花鹿向中国内陆的扩散 为此我们提出了三期虎豹回归中国的计划 根据我们的研究成果形成的 中国野生东北虎和东北豹保护重大生态工程 得到了中共中央总书记习近平和国务院总理李克强的重要批示, 推动了中国野生东北虎 豹保护工程的实施, 这是首次由科学家研究成果启动的重大生态工程 经费资助 : 科技基础性工作专项和国家自然科学基金国际合作项目 Monitoring areas of long-term camera-trap survey network in NE China. 15

24 政府有关部门应当果断禁止国内象牙贸易 张立张立教授在 2015 年 11 月 12 日第 527 卷 自然 杂志上就全球大象保护和中国象牙贸易问题发表了观点文章 (World View):China must act decisively to eradicate the ivory trade, Nature 527: 135 (2015). 目前非洲象种群数量仅存 35 万 -47 万头, 而在过去 3 年中有超过 10 万头非洲象因盗猎象牙而遭到猎杀 ; 中国国内的合法象牙贸易也因为日益猖獗的走私和非法贸易而被逼入了死胡同 传统象牙雕刻做为中国非物种文化遗产有超过三千年历史, 然而目前的疯狂盗猎已经使得非洲大象种群面临绝灭的威胁 中美两国做为世界上两大非法野生动物贸易主要目的地国家, 致力合作打击象牙走私并承诺关闭各自的国内象牙市场 做为国际濒危野生动植物种国际贸易公约 非法猎杀大象监测项目 技术专家组的成员并长期研究中国野生动物贸易对濒危物种的影响, 张立教授在文章中提出中国政府可以通过赎买的办法尽快将企业拥有的合法象牙库存 去商品化, 通过合理的价格回购企业手中的合法象牙库存可以即保护合法企业的利益, 又可以推动国内全面禁止象牙贸易政策的顺利实施 文章最后指出 : 尽管牙雕的文化价值和商品价值很难严格地区分开, 但是为了保护大象物种, 我们必须放手一搏 16

25 多基因序列分析证实树鹧鸪 (Tropicoperdix) 是一个单独的属 陈德刘阳 Geoffrey W. H. Davison 董路常江高胜寒李寿先张正旺 树鹧鸪 (Tropicoperdix) 长期以来被认为是山鹧鸪属 (Arborophila) 的一个亚属, 虽然它与典型的山鹧鸪的羽毛颜色和头骨形态等存在一定差异, 但树鹧鸪能否单独成属一直存在争议 树鹧鸪内部的分类同样尚未解决, 多数研究认为树鹧鸪应分为 3 个种, 但也有研究认为其应该分为 1~4 个种 然而, 迄今为止仍没有专项研究来厘清树鹧鸪的分类与系统发育问题 本研究基于 2 段线粒体基因 (CYTB 和 ND2) 和 5 段核基因内含子 (CLTC CLTCL1 EEF2 OVOG 和 SERPINB14) 的分析显示, 树鹧鸪和山鹧鸪分别属于雉科系统发育树中的两大进化支, 彼此亲缘关系较远, 表明树鹧鸪应当单独构成一个属 此外, 本研究利用二代测序技术, 从标本脚垫样品中获得的线粒体序列分析表明树鹧鸪至少应分为两个独立的物种, 即绿脚树鹧鸪 (T. chloropus) 和栗胸树鹧鸪 (T. charltonii), 但进一步研究仍有待在大范围采样后继续开展 17

26 迁徙停歇地对候鸟迁徙时间调节的作用 马志军 迁徙行为是生物体应对季节性变化的环境条件所产生的规律性移动, 选择与最佳环境条件相匹配的日期对于完成生活史各阶段的活动至关重要 对于那些在高纬度地区繁殖的鸟类, 适合繁殖的日期有限, 它们需要在很窄的日期窗口抵达繁殖地, 过早或者过晚抵达繁殖地都可能降低个体的适合度 然而许多鸟类离开越冬地的日期跨度很大, 为了能在最优的日期抵达繁殖地, 鸟类个体需要在迁徙停歇地调整它们的迁徙日程 本研究通过比较大滨鹬在黄海南部 ( 崇明东滩 ) 和北部 ( 鸭绿江口 ) 区域的迁徙日期 能量积累以及繁殖羽换羽特征, 探讨大滨鹬在迁徙过程中的日程调节和不同日期抵达迁徙停歇地的潜在利弊 对大滨鹬在迁徙停歇地的 Length of stay at CMDT (day) Length of stay at Yalujiang (day) Mar 1- Apr 11- Apr 21- Apr Capture date at CMDT Apr 9- Apr 14- Apr 19- Apr 24- Apr 29- Apr Arrival date at Yalujiang Length of stay between CMDT and yalujiang Length of stay in the Yellow sea (day) Mar 1- Apr 11- Apr 21- Apr 1- May Capture date at CMDT Mar 1- Apr 11- Apr 21- Apr Arrival date at CMDT 无线电遥测结果表明, 大滨鹬在整个黄海区域停留 40.7 ± 9.2 天 (n = 11), 越早抵达黄海区域的个体在整个区域的停留日期越长 (F = 286.3, R 2 = 0.97, p < 0.001, n = 11) 不同日期抵达的个体在黄海南部的停留日期无显著差异 (p = 0.78, n = 40), 但越晚抵达的 个体从黄海南部飞往北部的日期越短 (F = 8.1, R 2 = 0.45, p = 0.02, n = 12), 并且晚抵达的 个体在黄海北部的停留日期更短 (F = 25.0,R 2 = 0.74, p = 0.001, n = 11) 崇明东滩大滨鹬的日均繁殖羽换羽指数与日期无明显相关性 (F = 0.4, R 2 = 0.01, p = 0.54, n = 39), 而鸭绿江口大滨鹬个体日均繁殖羽换羽指数随日期增加 (F = 39.4, R 2 = 0.49, p < 0.001, n = 43), 个体间的繁殖羽换羽指数差异随日期增加而不断减少 大部分个体在迁离前完成了繁殖羽换羽, 并积累了可以飞到繁殖地的足够能量 18

27 尽管不同个体抵达黄海区域的日期有较大差异 ( 一个月 ), 但是它们在较短的时间窗口 ( 一周 ) 离开黄海区域, 并且早到和晚到的个体都能黄海区域完成能量补充和繁殖羽换羽 迁徙日期的早晚可能表现了不同个体在迁徙策略上的差异, 早迁徙的个体有更充裕的时间来调整迁徙活动以应对迁徙途中恶劣的环境条件, 而晚迁徙的个体则需要高质量的迁徙停歇地支持其快速能量补给和换羽 在目前黄海区域大滨鹬迁徙停歇地不断丧失的背景下, 晚迁徙的个体可能会面临更大的环境压力, 这可能会导致种群的时间和能量积累模式的变化 19

28 蒙古黄芪次生代谢产物及其分子调控机制 南蓬 蒙古黄芪 (Astragalus membranaceus Bge. var. mongolicus (Bge.) Hsiao) 属于豆科 (Leguminosae) 黄芪属 (Astragalus L.) 多年生草本植物, 具有 补气 之功效, 是我国非常重要的中药材之一, 具有悠久的临床应用历史, 其主要有效成分为毛蕊异黄酮及其糖苷 黄芪皂甙 黄芪多糖以及多种微量元素等 主要研究成果 : 1. 蒙古黄芪异黄酮代谢途径中关键基因的功能研究 : 利用分子克隆技术和原核表达系统, 克隆了毛蕊异黄酮代谢途径中关键基因的 cdna 序列, 同时完成了 I2 H 蛋白酶的功能分析 (Chen J, Yuan H, Zhang L et al., 2015, Protein Expression and Purification 107: ) 图 1. AmI2 H 基因的不同质粒 (A: pcw, B: pet_28a) 表达和酶活性检测 2. 蒙古黄芪转录组研究 : 通过转录组研究过程中, 发现异黄酮代谢途径相关基因不同亚型的表达模式不同, 推测毛蕊异黄酮及其糖苷主要在叶组织合成, 并转运到根中贮存 ; 在三萜皂苷合成途径中, 发现 IPP & DMAPP 在蒙古黄芪的不同组织中经由两条不同的途径合成 ; 首次找到并克隆了黄芪三萜合成途径的限速酶 环阿屯醇合成酶 (AmCAS) 20

29 图 2. 蒙古黄芪异黄酮代谢途径相关基因不同亚型的表达模式不同 图 3. 三萜皂苷合成途径和起始阶段相关基因的组织差异表达 相关论文 : 1. Chen J, Yuan H, Zhang L, Pan HY, Xu RY, Zhong Y, Chen JK, Nan P* Cloning, expression and purification of isoflavone-20-hydroxylase from Astragalus membranaceus Bge. Var. mongolicus (Bge.) Hsiao. Protein Expression and Purification. 107: Chen J, Wu XT, Xu YQ, Zhong Y, Li YX, ChenJK, Li X*, Nan P* Global transcriptome analysis profiles metabolic pathways in traditional herb Astragalus membranaceus Bge. var. mongolicus (Bge.) Hsiao. BMC Genomics.16 (Suppl 7): S15. 21

30 发表论文 序号论文 ( 专著 ) 名称类别期刊名称年 卷 期 页作者 ( 第一作者 #) 通讯作者 重点实验室署名顺序 类别 影响因子 1 China must act decisively to eradicate the ivory trade Nature 2015, 527: 135 Zhang L 张立 1 SCI Complex ecology of China s seawall-response Science 2015, 347 (6226): 1079 Ma ZJ, Li B 马志军 1 SCI Evolutionary rescue can be impeded by temporary environmental amelioration Ecology Letters 2015, 18 (9): Hao YQ, Brockhurst MA, Petchey OL, Zhang QG 张全国 2 SCI Avian influenza H5N1 viral and bird migration networks in Asia Proceedings of the National Academy of Sciences USA 2015, 112 (1): Tian HY, Zhou S, Dong L, Van Boeckel TP, Cui YJ, Newman SH, Takekawa JY, Prosser DJ, Xiao XM, Wu YR, Cazelles B, Huang SQ, Yang RF, Grenfell BT, Xu B Bryan T. Grenfell, Bing Xu 4 SCI China s collective forest tenure reform and the future of the giant panda Conservation Letters 2015, 8 (4): Yang B, Busch J, Zhang L, Ran J, Gu X, Zhang W, Du B, Xu Y, Mittermeier R 张立 3 SCI Comparison of four EVI-based models for estimating gross primary production of maize and soybean croplands and tallgrass prairie under severe drought Tracking the dynamics of paddy rice planting area in through time series Landsat images and phenology-based algorithms Remote Sensing of Environment Remote Sensing of Environment 2015, 162: , 160: Dong JW, Xiao XM, Wagle P, Zhang GL, Zhou YT, Jin C, Torn MS, Meyers TP, Suyker AE, Wang JB, Yan HM, Biradar C, Moore B Dong JW, Xiao XM, Kou WL, Qin YW, Zhang GL, Li L, Jin C, Zhou YT, Wang J, Biradar C, Liu JY, Moore B Jinwei Dong, 肖向明 未标注 SCI 肖向明未标注 SCI 6.393

31 8 A modelling methodology to assess the effect of insect pest control on agro-ecosystems Scientific Reports 2015, 5: 9727 Wan NF, Ji XJ, Jiang JX, Li B 李博通讯作者单位 SCI Increases in both temperature means and extremes likely facilitate invasive herbivore outbreaks Mapping paddy rice planting area in wheat-rice doublecropped areas through integration of Landsat-8 OLI, MODIS, and PALSAR images Using functional trait diversity to evaluate the contribution of multiple ecological processes to community assembly during succession Scientific Reports Scientific Reports Ecography 2015, 5: , , 38: Ju RT, Zhu HY, Gao L, Zhou XH, Li B Wang J, Xiao XM, Qin YW, Dong JW, Zhang GL, Kou WL, Jin C, Zhou YT, Zhang Y Zhang H, Qi W, John R, Wang WB, Song FF, Zhou SR 李博 1 SCI Jie Wang, 肖向明 未标注 SCI 周淑荣 1 SCI Imprecise intron losses are less frequent than precise intron losses but are not rare in plants Biology Direct 2015, 10: 24 Ma MY, Zhu T, Li XN, Lan XR, Liu HY, Yang YF, Niu DK 牛登科 1 SCIE Explaining maximum variation in productivity requires phylogenetic diversity and single functional traits Ecology 2015, 96: Liu JJ, Zhang XX, Song FF, Zhou SR, Cadotte M, Bradshaw CJA 周淑荣 1 SCI The incidence and pattern of copollinator diversification in dioecious and monoecious figs Spatial distribution of bacterial communities driven by multiple environmental factors in a beach wetland of the largest freshwater lake in China Evolution Frontiers in Microbiology 2015, 69: , 6: 129 Yang LY, Machado, CA, Dang XD, Peng YQ, Yang DR, Zhang DY, Liao WJ Ding X, Peng XJ, Jin BS, Xiao M, Chen JK, Li B, Fang CM, Nie M 廖万金 2 SCI 聂明通讯作者单位 SCI

32 Global transcriptome analysis profiles metabolic pathways in traditional herb Astragalus membranaceus Bge. var. mongolicus (Bge.) Hsiao Gene expression reaction norms unravel the molecular and cellular processes underpinning the plastic phenotypes of Alternanthera philoxeroides in contrasting hydrological conditions Molecular phenotypes associated with anomalous stamen development in Alternanthera philoxeroides Was the exposed continental shelf a long-distance colonization route in the ice age? The Southeast Asia origin of Hainan and Taiwan partridges Dispersal limitation favors more fecund species in the presence of fitness-equalizing demographic tradeoffs Effects of in-situ and reanalysis climate data on estimation of cropland gross primary production using the vegetation photosynthesis model Biotic and climatic controls on interannual variability in carbon fluxes across terrestrial ecosystems. BMC Genomics Frontiers in Plant Science Frontiers in Plant Science Molecular Phylogenetics and Evolution The American Naturalist Agricultural and Forest Meteorology Agricultural and Forest Meteorology 2015,16 (Suppl 7) S , 6: , 6: , 83: , 185: , 213: , 205: Chen J#, Wu XT#, Xu YQ, Zhong Y, Li YX, ChenJK, Li X, Nan P Gao LX, Geng YP, Yang HX, Hu YH, Yang J 南蓬 1 SCI 杨继未标注 SCI Zhu Z, Zhou CC, Yang J 杨继 1 SCI Chen D, Chang J, Li SH, Liu Y, Liang W, Zhou F, Yao CT, Zhang ZW Zhou SR, Peng ZC, Zhang DY Jin C, Xiao XM, Wagle P, Griffis T, Dong JW, Wu CY, Qin YW, Cook DR Shao JJ, Zhou XH, Luo YQ, Li B, Aurela M, Billesbach D, Blanken PD, Bracho R, Chen JQ, Fischer M, Fu YL, Gu LH, Han SJ, He YT, Kolb T, Li YN, Nagy Z, Niu SL, Oechel WC, Pinter K, Shi PL, 张正旺 1 SCI 周淑荣 1 SCI 肖向明未标注 SCI 周旭晖 1 SCI

33 Suyker A, Torn M, Varlagin A, Wang HM, Yan JH, Yu GR, Zhang JH 23 An ecological indicator to evaluate the effect of chemical insecticidepollution management on complex ecosystems Ecological Indicators 2015, 53: Wan NF, Ji XY, Jiang JX, Zhang YM, Liang JH, Li B 李博通讯作者单位 SCI Detecting soil salinity with MODIS time series VI data Ecological Indicators 2015, 52: Zhang TT, Qi JG, Gao Y, Ouyang ZT, Zeng SL, Zhao B 赵斌通讯作者单位 SCI Positive and negative biotic interactions and invasive Triadica sebifera tolerance to salinity: a cross-continent comparative study Future vegetation patterns and primary production in the coastal wetlands of East China under sea level rise, sediment reduction and saltwater intrusion Plant invasion impacts on the gross and net primary production of the salt marsh on eastern coast of China: insights from leaf to ecosystem Patterns in species persistence and biomass production in soil microcosms recovering from a disturbance reject a neutral hypothesis for bacterial community assembly Territory tenure increases with repertoire size in brownishflanked bush warbler Oikos Journal of Geophysical Research - Biogeosciences Journal of Geophysical Research - Biogeosciences PLoS ONE PLoS ONE 2015, 124: , DOI: /2015JG , 120: , 10: e , 10 (3): e Yang Q, Li B, Siemann E 李博 1 SCI Ge ZM, Cao HB, Cui LF, Zhao B, Zhang LQ Ge ZM, Guo HQ, Zhao B, Zhang LQ Zhen-Ming Ge Zhen-Ming Ge 3 SCI SCI Zhang FG, Zhang QG 张全国 1 SCI Xia CW, Wei CT, Zhang YY 张雁云 1 SCI

34 30 31 Asian elephants in China: estimating population size and evaluating habitat suitability Extreme environments facilitate hybrid superiority-the story of a successful Daphnia galeata longispina hybrid clone PLoS ONE 2015, 10 (5): e PLoS ONE 2015, 10 (10) Zhang L, Dong L, Lin L, Feng L, Yang F, Wang L, Guo X, Luo A. Griebel J, Gießler S, Poxleitner M, Navas FA, Yin M, Wolinska J 张立 1 SCI Johanna Griebel 3 SCI Genetic structure of Daphnia galeata populations in Eastern China PLoS ONE 2015, 10 (3) Wei W, Gießler S, Wolinska J, Ma X, Yang Z, Hu W, Yin M 殷明波 4 SCI Specialist insect herbivore and light availability do not interact in the evolution of an invasive plant PLoS ONE 2015, 10 (9): e Zhang Z, Pan X, Zhang Z, He KS, Li B 潘晓云 1 SCI Trophic dynamics of filter feeding bivalves in the Yangtze Estuarine intertidal marsh: stable isotope and fatty acid analyses Assessing vegetation cover dy namics induced by policydriven ecological restoration a nd implication to soil erosion i n Southern China PLoS ONE PLoS ONE 2015, 10 (8): e , 10 (6): e Wang S, Jin B, Qin H, Sheng Q, Wu J 吴纪华 1 SCI Zhang J, Wang TM, Ge JP 王天明未标注 SCI Effects of Spartina alterniflora invasion on soil respiration in the Yangtze River Estuary, China PLoS ONE 2015, 10 (3): e Bu NS, Qu JF, Li ZL, Li G, Zhao H, Zhao B, Li B, Chen JK, Fang CM 方长明 1 SCI The distribution pattern of genetic variation in the transcript isoforms of the alternatively spliced proteincoding genes in the human genome Molecular Biosystems. 2015, 11 (5): Liu T, Lin K 林魁未标注 SCI

35 38 Mapping deciduous rubber plantation areas and stand ages with PALSAR and landsat images Remote Sensing 2015, 7: Kou W, Xiao XM, Dong J, Gan S, Zhai D, Zhang G, Qin YW, Li L 肖向明未标注 SCI Estimation and analysis of gross primary production of soybean undervarious management practices and drought conditions Forest cover maps of China in 2010 from multiple approaches and data sources: PALSAR, Landsat, MODIS, FRA, and NFI Mapping paddy rice planting area in cold temperate climate region through analysis of time series Landsat 8 (OLI), Landsat 7 (ETM+) and MODIS imagery Mapping paddy rice planting areas through time series analysis of MODIS land surface temperature and vegetation index data Sensitivity analysis of vegetation indices to drought over two tallgrass prairie sites Life history trait differentiation and local adaptation in invasive populations of Ambrosia artemisiifolia in China ISPRS Journal of Photogrammetr y and Remote Sensing ISPRS Journal of Photogrammetr y and Remote Sensing ISPRS Journal of Photogrammetr y and Remote Sensing ISPRS Journal of Photogrammetr y and Remote Sensing ISPRS Journal of Photogrammetr y and Remote Sensing Oecologia 2015, 99: , 109: , 105: , 106: , 108: , 177: Wagle P, Xiao XM, Suyker AE Qin YW, Xiao XM, Dong JW, Zhang G, Shimada M, Liu J, Li C, Kou W, Moore III B Qin YW, Xiao XM, Dong JW, Zhou YT, Zhu Z, Zhang GL, Du GM, Jin C, Kou WL, Wang J, Li XP Zhang GL, Xiao XM, Dong JW, Kou WL, Jin C, Qin YW, Zhou YT, Wang J, Menarguez MA, Biradar C Bajgain R, Xiao XM, Wagle P, Basara J, Zhou YT Li XM, She DY, Zhang DY, Liao WJ 肖向明 未标注 SCI 肖向明 未标注 SCI 肖向明 未标注 SCI 肖向明 未标注 SCI 肖向明 未标注 SCI 廖万金 2 SCI

36 45 The effects of fertilization on plant-soil interactions and salinity tolerance of invasive Triadica sebifera. Plant and Soil 2015, 394: Yang Q, Li B, Siemann E 李博 1 SCI Positive selection and functional divergence of R2R3-MYB paralogous genes expressed in inflorescence buds of Scutellaria Species (Labiatae) Phylogeography of Thlaspi arvense (Brassicaceae) in China inferred from chloroplast and nuclear DNA sequences and ecological niche modeling Acute cold stress improved the transcription of proinflammatory cytokines of Chinese soft-shelled turtle against Aeromonas hydrophila Effects of water management practices on residue decomposition and degradation of Cry1Ac protein from crop-wild Bt rice hybrids and parental lines during winter fallow season. Analysis of the complete mitochondrial genome of Pochonia chlamydosporia suggests a close relationship to the invertebrate-pathogenic fungi in Hypocreales. International Journal of Molecular Sciences International Journal of Molecular Sciences Developmental and Comparative Immunology Ecotoxicology and Environmental Safety BMC Microbiology 2015, 16 (3): , 16 (6): , 4 (1): , 122: ,15: 5 Huang BH, Pang E, Ruan Y, Liao PC An M, Zeng L, Zhang T, Zhong Y Zhang ZB, Chen BJ, Yuan L, Niu CJ Xiao MQ, Dong SS, Li ZL, Tang X, Chen Y, Yang SM, Wu CY, Ouyang DX, Fang CM, Song ZP Lin RM, Liu CC, Shen BM, Bai M, Ling J, Chen GH, Mao ZC, Cheng XY*, Xie BY* 廖培军 未标注 SCI 钟扬 未标注 SCI 牛翠娟 2 SCI 宋志平 1 SCI 成新跃 未标注 SCI Revival of the genus Tropicoperdix Blyth 1859 (Phasianidae, Aves) using multilocus sequence data Zoological Journal of the Linnnean Society 2015, 175(2): Chen D, Liu Y, Davison GWH, Dong L, Chang J, Gao SH, Li SH, Zhang ZW 张正旺 1 SCI

37 52 53 Variation in morphological traits in a recent hybrid zone between closely related Quercus liaotungensis and Q. mongolica (Fagaceae) The rhythmic expression of genes controlling flowering time in southern and northern populations of invasive Ambrosia artemisiifolia. Journal of Plant Ecology Journal of Plant Ecology, 2015, 8: , 8: Wei L, Li YF, Zhang H, Liao WJ Li XM, Zhang DY, Liao WJ 廖万金 2 SCI 廖万金 2 SCI The functional significance of a stigma color polymorphism in Acer pictum subsp mono (Aceraceae) Journal of Plant Ecology 2015,8 (2): Yang ZQ, Zhang DY, Bai WN 白伟宁 1 SCI Spatial, temporal and genetic dynamics of highly pathogenic avian influenza A (H5N1) virus in China., BMC Infectious Diseases 2015, 15: 547 Tian H, Cui Y, Dong L, Zhou S, Li XW, Huang SQ, YangRF, Xu B 徐冰 3 SCI Invasive cordgrass facilitates epifaunal communities in a Chinese marsh Biological Invasions 2015, 17: Chen HL, Zhang P, Li B, Wu JH 吴纪华 1 SCI Invasion of Spartina alterniflora in China is greatly facilitated by increased growth and clonality: a comparative study of native and introduced populations Biological Invasions 2015, 17: Shang L, Qiu SY, Huang JX, Li B 李博 1 SCI Giant pandas failed to show mirror self-recognition Animal Cognition 2015, 18: Ma X, Jin Y, Luo B, Zhang G, Wei R, Liu D 刘定震 1 SCI

38 59 Vegetation alters the effects of salinity on greenhouse gas emissionsand carbon sequestration in a newly created wetland Ecological Engineering 2015, 84: Sheng Q, Wang L, Wu JH 吴纪华 1 SCI Plant effects on burrowing crab morphology in a Chinese salt marsh: native vs. exotic plants Ecological Engineering 2015, 74: Wang JQ, Bertness MD, Li B, Chen JK, Lu WG 李博 1 SCI Reclamation of coastal salt marshes promoted carbon loss from previously-sequestered soil carbon pool Ecological Engineering 2015, 81: Bu NS, Qu JF, Li G, Zhao B, Zhang RJ, Fang CM 赵斌通讯作者单位 SCI Revegetation of a native species in a newly formed tidal marsh under varying hydrological conditions and planting densities in the Yangtze Estuary Ecological Engineering 2015, 83: Hu ZJ, Ge ZM, Ma Q, Zhang ZT, Tang CD, Cao HB, Zhang TY, Li B, Zhang LQ Ge ZM 3 SCI Diversity of the Daphnia longispina species complex in Chinese lakes: a DNA taxonomy approach Journal of Plankton Research 2015, 1: Ma X, Petrusek A, Wolinska J, Gießler S, Zhong Y, Yang Z, Hu W, Yin M 殷明波 1 SCI Climate change suggests a shift of H5N1 risk in migratory birds Ecological Modelling 2015, 306: 6-15 Tian HY#, Zhou S#, Dong L, Boeckeld T, Pei Y, Wu QZ, Yuan WP, Guo Y, Huang SQ, Chen WH, Lu XL, Liu Z, Bai YQ, Yue TX, Grenfell B, Xu B Bing Xu 3 SCI Experimental analysis of mating patterns in a clonal plant reveals contrasting modes of self-pollination Ecology and Evolution 2015, 5 (22): Hu Y, Barrett SCH, Zhang DY, Liao WJ 廖万金 1 SCI

39 66 Reed Parrotbill nest predation by tidal mudflat crabs: Evidence for an ecological trap? Ecosphere 2015, 6 (1): Article 20 Li DL, Sun XH, Lloyd H, Que PJ, Liu Y, Wan DM, Zhang ZW 李东来 2 SCI Genetic diversity, temporal dynamics, and host specificity in blood parasites of passerines in north China Parasitology Research 2015, 114(12): Huang X, Dong L, Zhang CL, Zhang YY 董路未标注 SCI Import and export fluxes of macrozooplankton are taxaand seasondependent at Jiuduansha marsh, Yangtze River estuary Ascorbic acid regulation in stress responses during acute cold exposure and following recovery in juvenile Chinese soft-shelled turtle (Pelodiscus sinensis) Taxonomy of the Narcissus Flycatcher Ficedula narcissina complex: an integrative approach using morphological, bioacoustic and multilocus DNA data Long-distance dispersal of an Amur tiger indicates potential to restore the North-east China/Russian Tiger Landscape Estuarine, Coastal and Shelf Science Comparative Biochemistry and Physiology, Part A Ibis ORYX 2015, 163: , 184: , 157: , 49 (4): Qin HM, Sheng Q, Chu TJ, Wang SK, Wu JH 吴纪华 1 SCI Chen BJ, Niu CJ, Lin Y 牛翠娟 1 SCI Dong L, Wei M, Alstom P, Huang X, Olsson U, Shigeta Y, Zhang YY, Zheng GM Wang TM, Feng LM, Mou P, Ge JP, Li C, Smith JLD 张雁云 1 SCI 王天明未标注 SCI Dramatic decline of the Vulnerable Reeves s pheasant Syrmaticus reevesii, endemic to central China Oryx 2015, 49(3): Zhou CF, Xu JL, Zhang ZW 张正旺 1 SCI

40 73 Tidal flats of the Yellow Sea: A review of ecosystem status and anthropogenic threats. Austral Ecology 2015, 40: Murray NJ, Ma ZJ, Fullar RA Nicolas Murray 4 SCI Key research issues concerning the conservation of migratory shorebirds in the Yellow Sea region. Bird Conservation International 2015, 25: Hua N, Tan K, Chen Y, Ma ZJ 马志军 1 SCI The importance of Yalu River coastal wetland in the north Yellow Sea to Bar-tailed Godwits Limosa lapponica and Great Knots Calidris tenuirostris during northward migration Bird Conservation International 2015, 25: Choi CY, Battley PF, Potter MA, Rogers KG, Ma ZJ Chi-yeung Choi 3 SCI Nematode communities response to long-term grazing disturbance on Tibetan plateau European Journal of Soil Biology 2015, 69: Hu J, Wu JH, Ma MJ, Nielsen UN, Wang J, Du GZ Du GZ 未标注 SCI Adjusting migration schedules at stopping sites: Time strategy of a long-distance migratory shorebird during northward migration Geographic variation in the calls of the common cuckoo (Cuculus canorus): isolation by distance and divergence among subspecies Cloning, expression and purification of isoflavone-20- hydroxylase from Astragalus membranaceus Bge. var. mongolicus (Bge.) Hsiao. Journal of Ornithology Journal of Ornithology Protein Expression and Purification 2015, 156: , 156 (2): , 107: Peng HB, Hua N, Choi CY, Melville DS, Gao Y, Zhou QY, Chen Y, Xue WJ, Ma Q, Wu W, Tang CD, Ma ZJ Wei CT, Jia CX, Dong L, Wang DP, Xia CW, Zhang YY, Liang W Chen J, Yuan H, Zhang L, Pan HY, Xu RY, Zhong Y, Chen JK, Nan P 马志军 1 SCI 粱伟 1 SCI 南蓬 1 SCI

41 80 81 Efficacy of insect-resistance Bt/CpTI transgenes in F5 F7 generations of rice crop-weed hybrid progeny: implications for assessing ecological impact of transgene flow Genetic divergence of weedy rice populations associated with their geographic location and coexisting conspecific crop: Implications on adaptive evolution of agricultural weeds Chinese Science Bulletin Journal of Systematics and Evolution 2015, 60: , 53(4): Yang X, Li L, Cai XX, Wang F, Su J, Lu BR Song ZJ, Wang Z, Feng Y, Yao N, Yang J, Lu BR 卢宝荣 1 SCI 卢宝荣 1 SCI Small effective population size in microrefugia? Journal of Systematics and Evolution 2015, 53(2): Bai WN, Zhang DY 张大勇 2 SCI Behind the diversity: Ontogenies of radiate, disciform, and discoid capitula of Chrysanthemum and its allies Journal of Systematics and Evolution 2015, 53 (6): Ren JB; Guo YP 郭延平 1 SCI Structural and functional diversification of HORMA domain-containing proteinsrevision Journal of Systematics and Evolution 2015, 53 (4): Zhang LY, Zhu Z, Yang J 杨继 1 SCI Communities of ammonia oxidizers at different stages of Spartina alterniflora invasion in salt marshes of Yangtze River estuary Predicting hybrid fertility from maker-based genetic divergence index of parental varieties: implications for utilizing inter-subspecies heterosis in hybrid rice breeding Journal of Microbiology Euphytica 2015, 53 (5): , 203: Xia F, Zeleke J, Sheng Q, Wu JH, Quan ZX Liu P, Dan ZW, Wang Z, Li SQ, Li NW, Yan HX, Cai XX, Lu BR 全哲学 2, 院 1 SCI 卢宝荣 1 SCI

42 87 Effects of semi-lunar tidal cycling on soil CO 2 and CH 4 emissions: a case study in the Yangtze River estuary, China Wetlands Ecology and Management 2015, 23(4): Bu NS, Qu JF, Zhao H, Yan QW, Zhao B, Fan JL, Fang CM, Li G 方长明 1 SCI Status of soil nematode communities during natural regeneration of a subtropical forest in southwestern China Nematology 2015, 17: Li YJ, Yang GP, Neher DA, Xu CY, Wu JH Li YJ 1 SCI Low nest survival of a breeding shorebird in Bohai Bay, China Journal of Ornithology 2015,156 (1): Que PJ, Chang YJ, Eberhart-Phillips L, Liu Y, Szekely T, Zhang ZW 张正旺 1 SCI Roles of phenotypic and genetic characteristics in the social mating pattern of Silverthroated Tits (Aegithalos glaucogularis) Oriental reed warbler (Acrocephalus orientalis) nest defence behaviour towards brood parasites and nest predators Journal of Ornithology Behaviour 2015,156 (3): , 152 (12-13): Li JQ, Lv L, Wang PC, Zhang ZW, Wang Y Li DL, Wei HW, Zhang ZW, Liang W, Stokke BG 李建强 2 SCI 1.23 粱伟 2 SCI Shorebirds along China s Yellow Sea coast face an uncertain future: a review of threats Emu 2015, /MU15045 Melville DS, Chen Y, Ma ZJ David Melville 2 SCI Temporal patterns of migratory shorebird communities at a stopover site along the East Asian- Australasian Flyway Emu 2015, /MU14094 Zhou QY, Xue WJ, Tan K, Ma Q, Jin X, Wu W, Tang CD, Ma ZJ 马志军 1 SCI

43 94 95 Molecular evidence reveals a closer relationship between Japanese and mainland subtropical specimens of a widespread tree species, Acer mono Effects of sexual reproduction of the inferior competitior Brachionus calyciflorus on its fitness anainst Brachionus angularis Biochemical Systematics and Ecology Chinese Journal of Oceanology and Limnology 2015, 60: , 33(2): Ye JW, Guo XD, Wang SH, Bai WN, Bao L, Wang HF, Ge JP 王红芳 2 SCI Li C, Niu CJ 牛翠娟 1 SCI Removal of the vomeronasal organ impairs predator odor detection in female golden hamsters Animal Biology 2015,65: 1-12 Zhao X, Liu D 刘定震 1 SCI Attributes of forest diversity in the Yunmeng Mountain National Forest Park in Beijing, China Applied Ecology and Environmental Research 2015, 13 (3): Zhang JT, Shao D 张金屯未标注 SCI Variation of plant functional diversity along a disturbance gradient in mountain meadows of the Donglingshan Reserve, Beijing, China Russian Journal of Ecology 2015, 46 (2): Zhang JT, Xiao J, Li LF 张金屯未标注 SCI Nest-site selection and nesting success of Eurasian Nuthatch in China Russian Journal of Ecology 2015, 46 (2): Deng WH, Liu TT 邓文洪 1 SCI Functional diversity of Cercidiphyllum japonicum, communities in the Shennongjia Reserve, central China Journal of Forestry Research 2015, 26 (1): Zhang JT, Zhang B, Qian ZY 张金屯未标注 SCI 35

44 科研项目 2015 年度在研纵向项目 序号 项目或课题编号 项目或课题名称 项目或课题类别 批准经费 ( 万元 ) 项目或课题负责人 课题来源 课题开始时间 课题结束时间 CB CB FY ZX 作物多样性种植的种质资源筛选和组配原理 湿地生态完整性对围填海的响应和生物多样性保育 东北温带针阔混交林区生物多样性调查 青藏高原极端环境下的植物基因组变异及适应性进化机制 转基因植物环境生物安全性关键技术 973 计划课题 453 卢宝荣科技部 2011/1/1 2015/12/ 计划课题 489 李博科技部 2013/1/1 2017/12/31 科技基础性工作专项 845 葛剑平科技部 2012/5/1 2017/5/1 重大研究计划 280 钟扬科技部 2011/12/ /12/30 国家科技重大专项 卢宝荣科技部 2014/1/1 2015/12/31 6 无中组部拔尖人才计划万人计划人才项目 240 张全国中组部 2013/1/1 2016/12/ 生物多样性的维持机制 转基因渐渗对水稻野生近缘种的进化和生态影响机制研究 9 J 理科基地野外实践能力提高项目 亚洲温带针阔混交林生物多样性起源和维持机制研究 群落与生态系统生态学 基因组大小与内含子进化的比较研究 东北虎生境动态与生境选择研究 创新研究群体科学基金国家自然科学基金重点项目国家基础科学人才培养基金国家自然科学基金国际合作项目 国家自然科学基金委优秀青年项目 国家自然科学基金面上项目国家自然科学基金面上项目 张大勇 295 卢宝荣 430 张雁云 294 葛剑平 100 张全国 80 牛登科 87 王天明 国家自然科学基金委国家自然科学基金委国家自然科学基金委国家自然科学基金委 国家自然科学基金委 国家自然科学基金委国家自然科学基金委 2015/1/1 2017/12/ /1/1 2018/12/ /1/1 2016/12/ /1/1 2017/12/ /1/1 2015/12/ /1/1 2017/12/ /1/1 2016/12/31

45 同域分布的辽东栎和蒙古栎的强化选择与合子后繁殖隔离机制研究 国家自然科学基金面上项目 82 廖万金 国家自然科学基金委 2014/1/1 2017/12/ 蓍草属植物叶形变异的演化发育研究 国家自然科学基金面上项目 62 郭延平 国家自然科学基金委 2012/1/1 2015/12/ 利用保护遗传学方法开展中国亚洲象种群状况评估和预测研究 国家自然科学基金面上项目 60 张立 国家自然科学基金委 2012/1/1 2015/12/ 绿背姬鸣声和羽饰延迟成熟及其适应性研究 国家自然科学基金面上项目 88 张雁云 国家自然科学基金委 2015/1/1 2018/12/ 强脚树莺鸣唱的分化及其机制研究 国家自然科学基金面上项目 65 张雁云 国家自然科学基金委 2013/1/1 2016/12/ 整合 RNA-Seq 分析的植物基因组注释系统研究 - 以黄瓜属近缘基因组进化分析为例 国家自然科学基金面上项目 60 林魁 国家自然科学基金委 2012/1/1 2015/12/ 共生细菌与松材线虫协同解毒寄主防御性化合物的机制研究 国家自然科学基金面上项目 80 成新跃 国家自然科学基金委 2014/1/1 2017/12/ 配偶选择过程中不同模态信号交互变化通讯的整合研究 国家自然科学基金面上项目 63 刘定震 国家自然科学基金委 2012/1/1 2015/12/ 大熊猫嗅味标记的功能 配偶选择与 MHC 变异的关系 国家自然科学基金面上项目 85 刘定震 国家自然科学基金委 2015/1/1 2018/12/ 红腹锦鸡和白腹锦鸡的物种分化及生殖隔离机制研究 国家自然科学基金面上项目 87 董路 国家自然科学基金委 2015/1/1 2018/12/ 马鸡属鸟类物种分化研究 国家自然科学基金面上项目 88 张正旺 国家自然科学基金委 2013/1/1 2016/12/ 外来植物互花米草的地上和地下碳输入对土壤食物网的影响 国家自然科学基金面上项目 80 吴纪华 国家自然科学基金委 2014/1/1 2017/12/ 基于群落构建机制研究生物多样性与疾病之间的关系 国家自然科学基金面上项目 80 周淑荣 国家自然科学基金委 2015/1/1 2018/12/ 具有年龄结构的集合种群中若干进化问题研究 国家自然科学基金面上项目 60 周淑荣 国家自然科学基金委 2012/1/1 2015/12/ 耦合湿地生态系统二氧化碳与甲烷通量的微气象学同步观测 国家自然科学基金面上项目 54 赵斌 国家自然科学基金委 2012/1/1 2015/12/31 37

46 A 基于 转换防御假说 研究入侵植物的诱导防御进化 外来植物互花米草入侵盐沼湿地对繁殖鸟类的影响及其机理基于模拟种群转基因频率和种群动态监测评价水稻转基因漂移对普通野生稻的影响 植物群落物种功能多样性分析方法与应用研究 丹参根中水苏糖积累与采后干燥过程中丹酚酸 B 形成相关性及其转化通路和调控机制 龟鳖抗氧化防御系统应激响应的整合生物学研究 孤雌繁殖轮虫生活史对策中母体效应的作用的研究 杂草稻响应环境温度变化控制种子萌发机制发生和快速进化的分子基础基于系统发育基因组学方法探讨适应不同宿主的肉苁蓉属植物水平基因转移 落粒基因序列和微卫星指纹揭示的杂草稻起源及分子进化 中国远东豹种群现状 生境选择和栖息地适宜性研究 变化环境下水蚤 (Daphnia) 群体的种间杂交及其动力学研究 结合群落系统发育 功能性状的 α 和 β 多样性探索植物群落构建机制神经网络理论在植物群落功能多样性分析中的应用 国家自然科学基金面上项目 国家自然科学基金面上项目 国家自然科学基金面上项目 国家自然科学基金面上项目 国家自然科学基金面上项目 国家自然科学基金面上项目 国家自然科学基金面上项目 国家自然科学基金面上项目 国家自然科学基金面上项目 国家自然科学基金面上项目 国家自然科学基金青年基金 国家自然科学基金青年基金 教育部科学技术项目 85 潘晓云 90 马志军 67 宋志平 57 张金屯 70 周铜水 59 牛翠娟 86 牛翠娟 110 杨继 82 王玉国 73 卢宝荣 24 冯利民 24 殷明波 国家自然科学基金委 国家自然科学基金委 国家自然科学基金委 国家自然科学基金委 国家自然科学基金委 国家自然科学基金委 国家自然科学基金委 国家自然科学基金委 国家自然科学基金委 国家自然科学基金委 国家自然科学基金委 国家自然科学基金委 2014/1/1 2017/12/ /1/1 2016/12/ /1/1 2015/12/ /1/1 2015/12/ /1/1 2016/12/ /1/1 2015/12/ /1/1 2018/12/ /1/1 2015/12/ /1/1 2017/12/ /1/1 2016/12/ /1/1 2015/12/ /1/1 2015/12/ 周淑荣教育部 2014/1/1 2016/12/31 博士点基金 12 张金屯教育部 2013/1/1 2016/12/31 38

47 43 无 LYPT- DW B 无 47 无 为新建湿地保护地 保护地晋级和确定国际重要湿地提供技术支持 上海崇明东滩湿地生态系统国家定位观测研究站运行补助 全球大象保护和中国象牙贸易问题政策研究 褐马鸡分布 数量及栖息地专项调查 人类活动对南极野生鸟类的影响分析及保护管理办法研究 省部级项目 55 陈家宽 国家林业局 / 联合国开发计划署 / 全球环境基金 2015/1/1 2016/12/31 省部级项目 6 赵斌国家林业局 2015/9/1 2016/8/31 省部级项目 12.9 张立国家林业局 2014/6/1 2015/3/31 省部级项目 40 张正旺国家林业局 2015/5/1 2016/5/1 省部级项目 10 张正旺国家海洋局 2014/1/1 2015/12/31 48 无南极鸟类保护与管理问题研究省部级项目 15 张正旺国家海洋局 2013/9/1 2015/8/ DZ JC ZX DZ 无 56 无 57 无 滴水湖水系补水平衡下的水质生态控制研究 围垦驱动的土地利用变化对生态系统碳收支的影响 : 从湿地到农田生态治理工程对栖息地生态完整性影响及食物链优化配置生态治理工程对栖息地生态完整性影响及食物链优化配置 外源基因和蛋白安全评价共性技术 堤内海三棱藨草种群重建和复壮技术研究与示范 2015 年上海生态学研究生暑期学校广西 十三五 科技规划前期战略研究上海市第二次陆生野生动物资源调查鸻鹬类专项调查 白头鹤专 省部级项目 90 吴纪华上海市科委 2014/10/ /9/30 省部级项目 40 赵斌上海市科委 2013/9/1 2016/8/31 上海市科委重大项目课题上海市科委重大项目课题 国家科技重大专项地方配套经费 上海市科委科技创新行动计划 马志军上海市科委 2013/9/1 2015/8/31 90 马志军上海市科委 2013/9/1 2015/8/ 卢宝荣上海市科委 2014/4/ /12/ 张文驹上海市科委 2014/9/ /9/30 省部级项目 30 吴纪华上海市教委 2015/1/1 2015/12/31 省部级项目 190 陈家宽广西科技厅 2015/1/1 2016/12/31 省部级项目 马志军上海市财政 2013/7/1 2015/12/31

48 58 SHCG M CB 项调查及同步调查 不同种源油用牡丹遗传分化式样及其与表型及主要经济性状的关联分析基于鸣声标记的强脚树莺种群监测研究 植物群落物种组成对气候变化的响应 省部级项目 100 杨继上海市绿化局 2013/1/1 2015/12/31 博士后科学基金 973 项目子课题 CB 减数分裂共性和特性的分子基础 973 项目子课题 AA02A FY 无 医学知识库与临床决策支持系统研发 藏东南动物资源综合考察与重要类群资源评估 辽宁丹东鸭绿江口湿地国家级自然保护区生物多样性野外监测 863 项目 10 国家科技基础性工作专项 40 夏灿伟 课题负责人 : 葛学军课题参与 : 张文驹 宋志平 王玉国课题负责人 : 孔宏智课题参与 : 杨继项目主持 : 刘雷项目参与 : 南蓬项目主持 : 雷富民项目参与 : 张正旺 中国博士后科学基金会 2014/1/1 2015/12/31 科技部 2014/1/1 2018/12/31 科技部 2011/1/1 2015/8/31 科技部 2012/1/1 2016/12/31 科技部 2014/5/1 2019/4/30 环境保护部 20 马志军环境保护部 2015/5/1 2015/12/31 40

49 2015 年度在研横向项目 序号 项目名称 项目编号 项目负责人 委托单位 总经费 ( 万元 ) 课题开始时间 课题结束时间 1 胶州少海湖生态控藻运行技术无屈云芳胶州市少海发展管理处 /3/ /12/31 2 滨海湿地保护管理战略研究 ( 东亚 - 澳大利亚迁徙路线上候鸟关键栖息地保护研究 ) 无张正旺美国美尔森基金会 /3 2015/10 3 巨人科技园景观水域生态控藻系统维护 屈云芳 上海巨人友缘生物科技有限公司 /3/ /3/31 4 喜旱莲子草 microrna 分析无杨继上海辰山植物园 /3/1 2015/12/ 上海自然博物馆 ( 上海科技馆分馆 ) 展示工程图文系统文字撰写项目 南麂列岛国家海洋自然保护区潮间带生物群落结构分析 ZBZS13033 钟扬上海自然博物馆 /10/1 2015/12/31 无韩洁中国环境科学研究院 /7 2015/12 7 濒危物种公众宣传教育项目无张立菲兰德基金会项目 /1 2016/12 8 北京市第二次陆生野生动物资源同步调查无张正旺北京园林绿化局 /1 2016/6 9 河南董寨国家级自然保护区第二次科学考察 KJHX 张正旺河南董寨自然保护区 /5 2016/12 10 褐马鸡适宜栖息地的时空动态研究 KJHX 张正旺 山西庞泉沟国家级自然保护区管理局 /5 2015/12 41

50 2015 年度获批准项目 序号项目批准号项目名称负责人项目类别批准金额项目来源开始日期结题日期 高山蓍异源四倍体复合体后物种形成期的演化 第三纪孑遗植物三桠乌药的种群分化成因研究 中国野生亚洲象受胁状况及其适应性机制研究 基于共线性基因分类的蛋白质功能注释研究 以黄瓜蛋白质功能注释为例 人为扰动对渤海湾水鸟栖息地利用和繁殖成功率的影响研究 普通野生稻边缘种群对气候变暖的适应性响应 海南岛从天然林到人工林 : 过程 模式与生态效应 放牧对盐沼土壤生物功能群和碳氮过程的影响及其机制 迁徙停歇地的食物资源变化对鸻鹬类食物利用 能量积累及活动性的影响 郭延平 面上项目 63 国家自然基金委 2016/1/1 2019/12/31 王红芳 面上项目 70 国家自然基金委 2016/1/1 2019/12/31 张立 面上项目 63 国家自然基金委 2016/1/1 2019/12/31 庞尔丽 面上项目 63 国家自然基金委 2016/1/1 2019/12/31 张正旺 面上项目 67 国家自然基金委 2016/1/1 2019/12/31 宋志平 面上项目 73.5 国家自然基金委 2016/1/1 2019/12/31 肖向明 面上项目 60 国家自然基金委 2016/1/1 2019/12/31 吴纪华 面上项目 63 国家自然基金委 2016/1/1 2019/12/31 马志军 面上项目 68 国家自然基金委 2016/1/1 2019/12/31 42

51 获 奖 编号名称类别等级授奖单位获奖时间完成人 著作名称 基础生态学 作者 牛翠娟, 娄安如, 孙儒泳 总字数 ( 千 著作与译著 撰写字数 ( 千字 ) 出版单位书号 IBSN 出版日期 高等教育出版社 年 7 月 中国雉类郑光美 高等教育出版社 年 12 月 中国鸟类生态大图鉴 生态学 郭冬生, 张正旺 李博 张大勇 王德华等 重庆大学出版社 年 5 月 高等教育出版社 2015 年 12 月 授权专利 名称编号类别完成人情况完成人国家类型 43

52 队伍建设 在人才队伍建设方面, 实验室坚持人才引进与培养并重, 为人才发展营造独立 自由的制度环境与良好的研究平台 从实验室的目标定位与长期发展需求出发, 重点引进青年千人 有潜力优秀博士后和博士 通过国家各种人才计划和项目经费, 积极为中青年教师争取国外进修学习机会 2015 年引进青年教师 2 人, 在国家留学基金委资助下赴国外一流大学做访问学者 3 人 实验室固定人员 61 人, 其中正高 34 人, 副高 14 人, 讲师 2 人, 工程实验 8 人, 科研助理 3 人, 56 人具有博士学位 其中院士 2 人, 长江学者特聘教授 3 人, 杰青 3 人, 千人计划 1 人, 优青 1 人, 教育部新 ( 跨 ) 世纪人才 9 人, 在国际学术组织与期刊任职 12 人 1. 人才情况 姓名荣誉称号获得年份 孙儒泳院士 郑光美院士 张大勇国家杰青基金获得者, 长江学者特聘教授 卢宝荣国家杰青基金获得者, 长江学者特聘教授 钟 扬 国家杰青基金获得者, 长江学者特聘教授, 教育部新世纪人才 肖向明千人计划 张全国优秀青年基金中组部拔尖人才计划 葛剑平教育部跨世纪人才 吴纪华教育部新世纪人才 宋志平教育部新世纪人才 邓文洪教育部新世纪人才 周淑荣教育部新世纪人才 赵斌教育部新世纪人才 牛登科教育部新世纪人才 傅萃长教育部新世纪人才

53 2. 学术组织任职情况 序号姓名组织或机构中文名称担任职务任职开始任职结束 1 郑光美世界雉类协会主席 2007 终身 2 郑光美中国动物学会常务理事 李博 教育部自然保护与环境生态类专业教学指导委员会 副主任委员 李博中国生态学会理事 卢宝荣国家生物安全委员会委员 2004/1/1 6 卢宝荣国务院学科评议组成员 2008/10/1 7 马志军中国动物学会鸟类学分会常务理事 马志军上海市动物学会副理事长 牛翠娟北京市水产学会常务理事 10 牛翠娟两栖爬行动物学会理事 11 张正旺中国动物学会副理事长 张正旺 中华人民共和国濒危物种科学委员会 委员 张正旺教育部教学指导委员会委员 张雁云中国动物学会鸟类学分会秘书长 张雁云 国际物种存活委员会雉类专家组 16 张立国际生物科学联合会 17 张立国际保护生物学会 委员 伦理委员会委员中国执委会委员 中国委员会秘书长 张立中国动物学会副秘书长 刘定震中国动物学会动物行为学分会常务理事 2015/9 2019/8 45

54 3. 学术期刊任职情况 序号专家姓名期刊名称职务任职开始任职结束 1 李博 PLoS ONE 编委 李博 Ecological Research 副主编 李博 Journal of Evolution and Systmatics 副主编 李博 Ecological Processes 编委 卢宝荣 AoB PLANTS 编委 马志军 Bird Conservation International 副主编 马志军 Ecological Research 编委 马志军 Stilt 编委 张大勇 Acta Oecologica 编委 张立 Conservation Biology 编委 赵斌 Wetlands 副主编 周淑荣 Journal of Ecology Associate editor 郑光美 Avian Research 主编 李博植物生态学报副主编 李博植物多样性副主编 李博生态学报编委 李博杂草科学副主编 李博生物安全学报编委 卢宝荣科学通报编委 马志军 Avian Research 编委 马志军动物学杂志编委 牟溥植物生态学报编委 23 牟溥 Journal of Forest Research 编委 24 牛翠娟中国海洋大学学报 ( 英文版 ) 编委

55 25 吴纪华生物多样性编委 吴纪华土壤编委 张大勇植物生态学报编委 28 张大勇生物多样性编委 29 张大勇 Journal of Plant Ecology 编委 张金屯 ISRN Biodiversity 编委 张金屯 The Open Journal of Forestry 编委 张金屯 生态学报 编委 张金屯 生态学杂志 编委 张金屯 林业科学 编委 张金屯植物生态学报编委 张立兽类学报编委 张全国生物多样性编委 张雁云生物学通报编委 张正旺 Avian Research 编委 张正旺 野生动物学报 副主编 张正旺 生态学报 编委 张正旺 动物学杂志 编委 张正旺 湿地科学 编委 周淑荣植物生态学报编委

56 4. 本学科中青年教师国外访学进修情况 序号姓名访问地点内容时间 1 牛翠娟 University of Michigan, USA 高级访问学者 2014/7-2015/1 2 廖万金 University of Toronto, Canada 访问学者 2015/1/ /8/27 3 寇晓军 University of British Columbia, Canada 访问学者 2015/3-2016/3 4 张雁云 Queens University, Canada 教学合作 2015/7/ 张金屯 Queens University, Canada 教学合作 2015/7/

57 人才引进 夏灿玮 主要教育经历 : 博士 : 北京师范大学, 动物学, 硕士 : 北京师范大学, 动物学, 学士 : 南开大学, 微电子专业, 主要工作经历 : 北京师范大学, 生态学博士后, 主要研究内容 : 鸟类的鸣唱行为 获奖 : 2013 中国鸟类学会中国鸟类学研究生学术新人奖 2012 教育部 国务院学位办博士研究生学术新人奖 2015 北京师范大学优秀博士论文, 指导教师, 张雁云 近五年发表的主要论文 : 1. Xia CW, Wei CT, Zhang YY. (2015) Territory tenure increases with repertoire size in brownish-flanked bush warbler. PLoS ONE 10: e Xia CW, Wei CT, Lloyd H, Liu JY, Wu Q, Zhang YY. (2014) Dawn singing intensity of the male brownishflanked bush warbler: effects of territorial insertions and number of neighbors. Ethology 120: Xia CW, Liu JY, Zhang YY. (2013) Are different song types used in different contexts in brownish-flanked bush warblers? Zoological Science 30: Xia CW, Liu JY, Alström P, Wu Q, Zhang YY. (2013) Is the soft song of the brownish-flanked bush warbler an aggressive signal? Ethology 119: Xia CW, Lin XL, Liu W, Lloyd H, Zhang YY. (2012) Acoustic identification of individuals within large avian populations: a case study of the brownish-flanked bush warbler, south-central China. PLoS ONE 7: e

58 聂 明 主要教育经历 : 博士 : 复旦大学, 生态学, 硕士 : 上海师范大学, 微生物学, 学士 : 湖南农业大学, 食品科学与工程, 主要工作经历 : University of Aberdeen, 研究员,2014- University of Wyoming, 博士后, 南昌大学, 讲师, 硕士生导师, 主要研究内容 : 全球环境变化对生态系统过程影响 学术兼职 : Frontiers in Microbiology(SCI 收录刊物,IF = 3.941) 编委 上海市引智项目专家 近五年发表的主要论文 : 近年以第一作者或通讯作者发表 SCI 论文 20 篇, 其中一区 SCI 论文 5 篇, 二区 SCI 论文 5 篇, 包括 Ecology Letters Global Ecology and Biogeography Scientific Reports 等 研究成果被 Nature Ecology Letters Trends in Ecology & Evolution Global Change Biology New Phytologist 等杂志引用 1. Nie M, Bell C, Wallenstein MD, Pendall E. (2015) Increased plant productivity and decreased microbial respiratory C loss by plant growth-promoting rhizobacteria under elevated CO 2. Scientific Reports 5: Nie M, Pendall E, Bell C, Wallenstein MD. (2014) Soil aggregate size distribution mediates microbial climate change feedbacks. Soil Biology & Biochemistry 68: Nie M, Pendall E, Bell C, Gasch CK, Raut S, Tamang S, Wallenstein MD. (2013) Positive climate feedbacks of soil microbial communities in a semi-arid grassland. Ecology Letters 16: Nie M, Lu M, Bell J, Raut S, and Pendall. (2013) Altered root traits due to elevated CO 2 : a meta-analysis. Global Ecology and Biogeography 22:

59 人才培养 为了使实验室人才培养尽快与国际接轨, 实验室重新修订了研究生培养方案, 在课程设置方面尽量与世界一流大学看齐, 部分研究生课程聘请国内外著名学者上课 并借助依托单位研究生课程建设项目的资助, 对研究生课程设置进行调整, 实行研究生教育的深化改革 实验室还利用高校 985 工程 人才培养经费 国家留学基金委项目和导师课题经费资助学生参加国内外学术会议 短期学习交流及与国外著名高校联合培养博士研究生 2015 年共资助 16 研究生参加国际学术会议,4 位研究生赴国外短期学习交流,16 位研究生参加国内学术会议 以在读研究生为第一作者发表 SCI 论文 50 篇 实验室主办的 第十一届生态学暑期高级讲习班 得到 上海市研究生暑期学校 项目资助, 以 生物多样性与全球变化 为主题, 邀请生态学研究领域的杰出科学家, 采用多元化的教学方法, 讲授国际热点研究内容, 着重提高研究生掌握学科前沿和方法的能力, 为全国生态学专业的优秀研究生提供向国际顶尖生态学家学习与交流的机会 2015 年实验室有 32 位研究生获博士学位,39 位研究生获硕士学位, 出站博士后 2 人 其中与企业联合培养硕士研究生 1 人, 与国外大学联合培养博士研究生 1 人 新入学博士研究生 26 人, 硕士研究生 41 人, 外国留学生 4 人, 进站博士后 4 人 张雁云教授指导的已毕业博士夏灿玮获 2015 年度北京师范大学优秀博士论文 51

60 1. 研究生参加国际会议情况 序号参会形式研究生参加会议名称主办单位 / 地点会议时间导师 1 口头报告肖文宏 2015 年美国生态学年会美国生态学会 / 美国巴尔的摩 2015/8/9-14 葛剑平 2 其它曹慧芬 3 其它张艳聪 4 其它宋佳 5 其它张博文 6 其他曹慧芬 7 其他张艳聪 8 其他张博文 9 其他刘兵 10 其他郝雨 11 其他刘兵 12 其他孙莹 13 其他韩夏 14 其他周婕 15 其他张博文 16 其他刘鹏 Workshop on Phylogenetic Networks Workshop on Phylogenetic Networks Workshop on Phylogenetic Networks Workshop on Phylogenetic Networks 第二届国际农业基因组学大会 第二届国际农业基因组学大会 第二届国际农业基因组学大会 第二届国际农业基因组学大会 第十届国际基因组学大会 (ICG-10) 第十届国际基因组学大会 (ICG-10) 第十届国际基因组学大会 (ICG-10) 第十届国际基因组学大会 (ICG-10) 第十届国际基因组学大会 (ICG-10) 第十届国际基因组学大会 (ICG-10) 估计动物占有率和丰度的专业培训课程 新加坡国立大学 / 新加坡 2015/7/26-8/1 林魁 新加坡国立大学 / 新加坡 2015/7/26-8/1 林魁 新加坡国立大学 / 新加坡 2015/7/26-8/1 林魁 新加坡国立大学 / 新加坡 2015/7/26-8/1 林魁 Nature Genetics 杂志 中国农业科学院 中国科学院 福建农林大学 / 中国深圳 Nature Genetics 杂志 中国农业科学院 中国科学院 福建农林大学 / 中国深圳 Nature Genetics 杂志 中国农业科学院 中国科学院 福建农林大学 / 中国深圳 Nature Genetics 杂志 中国农业科学院 中国科学院 福建农林大学 / 中国深圳 2015/11/16-18 林魁 2015/11/16-18 林魁 2015/11/16-18 林魁 2015/11/16-18 林魁 深圳华大基因研究院 / 中国深圳 2015/10/22-25 林魁 深圳华大基因研究院 / 中国深圳 2015/10/22-25 林魁 深圳华大基因研究院 / 中国深圳 2015/10/22-25 林魁 深圳华大基因研究院 / 中国深圳 2015/10/22-25 林魁 深圳华大基因研究院 / 中国深圳 2015/10/22-25 林魁 深圳华大基因研究院 / 中国深圳 2015/10/22-25 林魁 美国史密斯保护生物研究所 / 美国 2015/3 张立 2. 研究生参加国内会议情况 序号研究生参加会议名称主办单位 / 地点 1 王蔼英 2 李雨桐 3 马月 4 姜丹 物种多样性性 : 理论和实践学术研讨会 四川大学 IBC 2017 组委会和 JSE 编辑部 / 成都 物种多样性性 : 理论 四川大学 IBC 2017 组委会和 JSE 编 和实践学术研讨会 辑部 / 成都 物种多样性性 : 理论 四川大学 IBC 2017 组委会和 JSE 编 和实践学术研讨会 辑部 / 成都 第十一届全国野生动 中国动物学会兽类学分会 中国生态 物生态与资源保护学 学会动物生态专业委员会 中国野生 术研讨会 动物保护协会科技委员会 / 南京 参会形式 会议时间 导师 其他 2015/10/9-11 廖万金 其他 2015/10/9-11 廖万金 其他 2015/10/9-11 白伟宁 报告 2015/11/16-18 韩洁 52

61 5 施禄也 6 刘婷 7 宋佳 8 李佳旺 9 张博文 10 郝雨 11 张艳聪 12 曹慧芬 第十一届全国野生动物生态与资源保护学术研讨会全国计算生物学与生物信息学学术会议全国计算生物学与生物信息学学术会议全国计算生物学与生物信息学学术会议全国计算生物学与生物信息学学术会议全国计算生物学与生物信息学学术会议全国计算生物学与生物信息学学术会议全国计算生物学与生物信息学学术会议 中国动物学会兽类学分会 中国生态学会动物生态专业委员会 中国野生动物保护协会科技委员会 / 南京中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专业委员会 / 中国北京中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专业委员会 / 中国北京中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专业委员会 / 中国北京中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专业委员会 / 中国北京中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专业委员会 / 中国北京中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专业委员会 / 中国北京中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专业委员会 / 中国北京 报告 2015/11/16-18 韩洁 其他 2015/04/15-17 林魁 其他 2015/04/15-17 林魁 其他 2015/04/15-17 林魁 其他 2015/04/15-17 林魁 其他 2015/04/15-17 林魁 其他 2015/04/15-17 林魁 其他 2015/04/15-17 林魁 13 张文逸动物生理生态学南京师范大学生科院 / 南京口头报告 2015/10/15-19 牛翠娟 14 李文杰 15 施禄也 16 姜丹 动物生态与野生动物保护动物生态与野生动物保护动物生态与野生动物保护 动物生态学会 / 南京 口头报告 2015/11/15-19 牛翠娟 动物生态学会 / 南京口头报告 2015/11/15-19 韩洁 动物生态学会 / 南京口头报告 2015/11/15-19 韩洁 3. 研究生国际交流情况 序号姓名出国时间回国时间地点 ( 国家 / 地区及高校 ) 国际交流项目名称或主要交流目的 1 阙品甲 2015/1 2015/4 英国 / 英国巴斯大学 / 短期交流学习 2 赵鑫峰 2015/9 2015/12 英国 / 埃克塞特大学 短期交流学习 3 范鹏来 2015/ /1 英国 /Salford 大学 短期交流学习 4 朱冰润 2015/5 2015/6 荷兰 / 格罗宁根大学 短期交流学习 53

62 学术交流与合作 2015 年实验室承办国际学术会议两次 全国性学术会议一次和地区性学术会议两次 邀请国外学者访问讲学 26 人, 国内学者访问讲学 2 人, 出国参加国际学术会议 5 人, 参加国内学术会议 16 人 主持国内外国际合作项目 4 项, 其中包括高等学校学科创新引智计划 1 项 国家自然科学基金国际合作项目 1 项 在高等学校创新引智基地项目资助下, 国内引智团队与国外团队定期开展学术交流讨论, 与英国牛津大学 帝国理工大学 约克大学 埃克塞特大学 瑞士苏黎世大学等国际一流大学合作研究已取得了初步成果 在国家自然科学基金国际交流与合作项目的支持下, 实验室与俄罗斯豹地国家公园签署了合作协议, 联合开展虎豹研究 第 12 届中美碳联盟年会 54

63 第八届海峡两岸生命科学与技术论坛 第二届保护生物学论坛 葛剑平教授团队与俄罗斯豹地国家公园签署合作协议 引智基地学术交流 1. 承办学术会议情况 会议名称会议类型主办单位名称 承办单位名称 主席会议日期人数 第 12 届 USCCC 年会全球性复旦大学复旦大学赵斌 第 12 届环境丰容国际会议 第八届海峡两岸生命科学与技术论坛 第二届保护生物学论坛 上海市植物学会青年研讨会 全球性 环境丰容国际研讨会组委会 北京师范大学 / 北京市动物园 刘定震 地区性北京师范大学北京师范大学葛剑平 全国 国际保护生物学会中国委员会 北京师范大学魏辅文 地区性上海市植物学会复旦大学秦路平

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