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1.... 3 2.... 4 3.... 5 4.... 6 5.... 7...7...7...8...11 6.... 17 7.... 18 2

1. PET/CT (PET) X (CT) PET CT PET/CT CT PET PET 511 kev (LOR) 3

2. Functional PET imaging using targeted molecular probes has become very important in many drug development using small animal models. However, probe uptakes limited to specific targeted areas greatly increase diagnostic difficulty. However, small animal PET/CT scanners have now been recognized as a powerful diagnostic modality. PET/CT scanner provides hardware image fusion capabilities which will make interpretation of PET images much easier due to the anatomical landmarks offered by CT scans. In addition, the CT data can be used to correct PET scans for photon attenuation. The thesis of two-year project is the development of a quantitative imaging system that provides accurate bio-distribution measurement of positron-labeled molecular images for combined 3D PET/CT scanners. The imaging system consists of two major research tasks: (1) automatic CT image segmentation, and (2) accurate estimation of attenuation correction factors for PET imaging. An automatic segmentation algorithm based of fuzzy clustering will be developed for whole-body CT image. After image segmentation, each region of the partitioned CT image, representing one type of material, is then assigned a unique attenuation coefficient of 512 kev photons. The corresponding ACF can be computed via accurately forward projection the 512keV attenuation image. It is anticipated that the newly developed system can provide some quantitative PET image using the co-registered CT image for small animals. 4

3. (microct) (micropet) 511 kev 5

4. PET/CT (PET) X (CT) PET CT PET/CT CT PET PET PET/CT 6

5. 511 kev 1 (Cluster Analysis) CT (Homogeneity) 7

Centroid Euclidean Distance 2 M Distance x, = x jp µ ip p= 1 1 2 µ µ i x j M N N*M M 1 C-Means Clustering ^ µ C C ( x ) ( x µ ) 2 1 if min j i P ωi j 0 otherwise P( ω ) i x j 1 0 8

1973 Bezdek Fuzzy K-Means Clustering, FCM P( ω ) i x j 0 1 0 1 FCM Cost Function J fuz = c i n j ( x ) b P ωi j x j µ i b b b b 2 P( ω ) i x j 2 µ x x P( ω ) i x j µ P( ω i x j ) P( ω ) i x j µ µ 1 2 J ( x j µ i) fuz = 0 P( ωi xj) = P( ωi xj) c 1 2 i ( x j µ i) 1 b 1 1 b 1 (4) 9

b { P( ωi xj) xj } P( ωi xj) J fuz = 0 µ = µ i n j= 1 i n b j= 1 FCM µ i FCM C 4 P( ω ) N*C P( ω ) i x j i x j N C 5 µ i ( k 1) ( k ) µ µ. = ( k ) µ. FCM k=k+1 10-5 [13] FCM x FCM Homogeneous 10

FCM FCM In-homogeneity FCM FCM CT CT CT Gaussian Distribution f () x = ( x µ ) 1 2 2σ e 2πσ 2 FCM CT Partial Volume Effect CT PET PET CT Forward Projection LOR CT LOR PET 10 PET CT PET FCM 11

Feature Extraction 25 j= 1 ( x j x) 2 S = 2 24 25 Standard Deviation CT CT FCM CT CT FCM FCM CT Table 1 CT CT CT CT Soft Tiisue FCM 3 CT 4 12

FCM 4 10 FCM FCM 6 CT FCM Fig. 2 FCM FCM 13

3*3 FCM 3 Fig. 5 CT FCM CT FCM FCM FCM 3 Hypothesis Testing 3 99.7% 3 Fig. 3(a) CT Fig. 3(b) FCM 14

FCM a b c d Fig. 3(d) CT FCM FCM 15

Fig. 3(c) FCM FCM (a) (b) Figure 4. (a) INER microct images, (b) Segmentation results. Fig 4 INER micropet PET/CT 16

6. CT FCM FCM FCM Hierarchical CT PET 17

7. 1. Raghu Krishnapuram and James M. Keller. A possibilistic approach to clustering. IEEE Transactions on Fuzzy Systems, Vol. 1, pp. 98-110, 1993; 2. M. Xu, P. D. Cutler, and W.K. Luk. Adaptive, segmented attenuation correction for whole-body PET imaging. IEEE Transactions on Nuclear Science, Vol. 43, pp. 331-336, 1996. 3. S R Cherry et al, MicroPET: A high resolution PET scanner for imaging small animals, IEEE Trans. Nucl. Sci., 44, 1161 6, 1997. 4. PE Kinahan, DW Townsend, T Beyer, D Sashin, Attenuation correction for a combined 3D PET/CT scanner, Med Phys., Vol. 25, No. 10, pp. 2046-2053, 1998 5. Thomas Beyer, David W. Townsend and Tony Brun, et al. A Combined PET/CT Scanner for Clinical Oncology. The Journal of Nuclear Medicine, Vol. 41: 1369-1379, 2000. 6. S R Cherry and S S Gambhir, Use of positron emission tomography in animal research, ILAR J, 42 219 32, 2001 7. S S Gambhir et al, Imaging transgene expression with radionuclide imaging technologies, Neoplasia 2 118 38, 2000. 8. Richard O. Duda, Peter E. Hart and David G. Stork. Pattern Classification. Wiley-Interscience, 517-530, 2001. 9. H Zaidi, M Diaz-Gomez1, A Boudraa and D O Slosman. Fuzzy clustering-based segmented attenuation correction in whole-body PET imaging. Physics in Medical Biology, Vol. 47, 1143 1160, 2002. 10. Heiko Schoder, Yusuf E. Erdi, Steven M. Larson and Henry W. D. Yeung. PET/CT: a new imaging technology in nuclear medicine. European Journal of Nuclear Medicine and Molecular Imaging Vol. 40, pp. 1419-1437, 2003. 11. Paul E. Kinahan, Bruce H. Hasegawa, and Thomas Beyer. X-Ray-Based Attenuation Correction for Positron Emission Tomography/Computed Tomography Scanners. Seminars in Nuclear Medicine 2003; XXXIII: 166-179 12. S Cherry, In vivo molecular and genomic imaging: new challenges for imaging physics, Phys. Med. Biol., Vol. 49, No. 3, pp. R13-R48, 2004. 13. AM Alessio, PE Kinahan, PM Cheng, H Vesselle, JS Karp, PET/CT scanner instrumentation, challenges, and solutions, Radiol Clin North Am., Vol. 42, No. 6, pp. 1017-1032, 2004. 14. David W. Townsend, Jonathan P.J. Carney, Jeffrey T. Yap and Nathan C. Hall. PET/CT Today and Tomorrow. The Journal of Nuclear Medicine, Vol. 45, pp. 4S-14S, 2004. 15. Vibhu Kapoor, Barry M. McCook and Frank S. Torok. An Introduction to PET/CT Imaging. RadioGraphics, Vol. 24, pp. 523-543, 2004. 16. Patrick L Chow, Fernando R Rannou and Arion F Chatziioannou. Attenuation correction for small animal PET tomographs. Physics of Medical Biology Vol. 50, pp. 1837-1850, 2005. 18