TITLE OF PRESENTATION Embase 数据库介绍 俞靓 Elsevier 解决方案专家 s.yu.2@elsevier.com
TITLE OF PRESENTATION 2 提纲 Embase 数据库包含的内容与特色 Embase 数据库包含内容 Embase 数据库特色 Embase 数据库中的检索 Embase 中的数据记录 如何利用 Embase 数据库进行生物医学相关文献和会议内容的查询 如何利用 Embase 数据库进行药物与疾病相关文献的查询 如何利用 Embase 数据库支持循证医学系统评价的研究 Embase 数据库检索小结
TITLE OF PRESENTATION 3 Embase 数据库简介介绍 Elsevier 公司出品的, 荷兰医学文摘的 Online Database 源自 70 个国家, 超过 8600 种期刊 完全包含 Medline 有 2800 种期刊在 Medline 数据库上无法检索到 尤其是那些在北美以外国家的期刊 包含会议资源 2009 年以后新增 每年有来约 7000 个会议的超过 295 万条的会议摘要 基于 Emtree 词库的索引 MeSH 的 2.5 倍 深入的词库索引 1. Emtree 收录 > 73,000 个词汇, 约为 MeSH 的 2.5 倍 2. 每年更新 3 次 Embase.com ~ 3180 万篇文献 8600 种期刊 MEDLINE ~ 2300 万文献 5600 种期刊 PubMed ~ 2500 万篇文献
TITLE OF PRESENTATION 4 Embase 收录的文献领域 药理学 & 毒理学 12% 临床医学 11% 遗传学, 生化 & 分子生物学 10% 神经病 & 行为医学 8% 微生物 & 传染病学 7% 心脏病 & 血液学 6% 精神病 & 精神卫生学 6% 肿瘤学 5% Healthcare Policy & Management 4% 过敏 & 免疫学 4% 儿科学 4% 内分泌 & 代谢学 3% 产科 & 妇科学 3% 生物医学工程 & 医疗器械 3% 麻醉 & 重症监护学 3% 肠胃病学 2% 呼吸道医学 2% 肾脏 & 泌尿学 2% 皮肤病学 2% 其他学科 28% Including public health, basic biomedical MEDLINE 包含公共卫生 基础生物医学以及 Medline 包含的学科领域
TITLE OF PRESENTATION 5 Embase 的核心索引体系 Emtree 生命科学辞典 Emtree 生命科学辞典, 对生物医学文献进行主题分析 标引和检索时使用的权威性词表 便于检索 超过 73,000 个主题词汇以及超过 290,000 个同义词汇 海量的药物以及医疗设备检索 实时更新 化学名, 商品名, 实验室 / 研发代码, 以及超过 31,000 个药物和化合物首选词汇 (FDA, EMA and WHO) 超过 3,000 个设备和医疗设备专属词汇 (e.g. endoscopes, catheters, prostheses) 以及数千个医疗过程相关词汇 (e.g. endoscopy, catheterization) 每年 3 次更新最新的药物, 疾病, 生物体以及医疗过程的索引 ; 包括所有的 FDA 以及 EMA 记录的药物名称和 WHO 从 2000 起记录的所有国际非专利名称 (INNS). 包含词汇 包括所有的 MeSH 词汇, 并且与超过 23,000 个 CAS 号进行了链接
TITLE OF PRESENTATION EMTREE 扩展搜索 EMTREE 多级树状结构 狭义词汇 同義詞 A Key word 同義詞 B 同義詞 /de Emtree Emtree + free term text + Key Synonyms word /exp word /Br 下位階詞下位階詞彙 E 下位階詞彙 C Key word /Syn 彙 D 同义词
TITLE OF PRESENTATION 7 提纲 Embase 数据库包含的内容与特色 Embase 数据库包含内容 Embase 数据库特色 Embase 数据库中的检索 Embase 中的数据记录 如何利用 Embase 数据库进行生物医学相关文献和会议内容的查询 如何利用 Embase 数据库进行药物与疾病相关文献的查询 如何利用 Embase 数据库支持循证医学系统评价的研究 Embase 数据库检索小结
TITLE OF PRESENTATION 8 Embase 数据库特色 Pharmacovigilance 向导检索 Tips: 1. 直接输入药品名称, 并选择 Subheadings 即可进行 PV 方面的检索 2. 可以逐级展开, 查看每一步骤的检索策略, 并修改
TITLE OF PRESENTATION 9 Embase 数据库特色 Drug 检索 Tips: 1. Drug Search 提供 10 种组合条件的药物相关信息检索 2. Subheading,Rotues 等等
TITLE OF PRESENTATION 10 Embase 数据库特色 Disease 检索 Tips: 1. Disease Search 提供 9 种组合条件的疾病相关信息检索 2. Subheading,EBM 等等
TITLE OF PRESENTATION 11 Embase 数据库特色 PICO 检索 Tips: 1. Embase 中的 PICO 模块帮助科研人员直接进行循证医学相关信息的查询
TITLE OF PRESENTATION 12 提纲 Embase 数据库包含的内容与特色 Embase 数据库包含内容 Embase 数据库特色 Embase 数据库中的检索 Embase 中的数据记录 如何利用 Embase 数据库进行生物医学相关文献和会议内容的查询 如何利用 Embase 数据库进行药物与疾病相关文献的查询 如何利用 Embase 数据库支持循证医学系统评价的研究 Embase 数据库检索小结
TITLE OF PRESENTATION 13 Embase 登录界面 https://www.embase.com
TITLE OF PRESENTATION 14 Embase 中的检索结果 结果过滤工具列表检索历史及策略检索结果
TITLE OF PRESENTATION 15 Embase 中的一条记录 记录提供摘要,IndexTerm, 全文链接 Tips: 1. 每条记录的 Index Term 中都能显示命中字段, 同时 Embase 在每一个 Index Term 上都标记和该索引词相关的信息, 帮助快速了解药物在文献中的研究方向 2. Embase 为文献提供 Major Focus 索引 ( 索引词中黑体部分 ), 帮助快速聚焦文献中最关键的内容
TITLE OF PRESENTATION 16 提纲 Embase 数据库包含的内容与特色 Embase 数据库包含内容 Embase 数据库特色 Embase 数据库中的检索 Embase 中的数据记录 如何利用 Embase 数据库进行生物医学相关文献和会议内容的查询 如何利用 Embase 数据库进行药物与疾病相关文献的查询 如何利用 Embase 数据库支持循证医学系统评价的研究 Embase 数据库检索小结
TITLE OF PRESENTATION 17 思考 : 检索策略中的 3 个基本问题 检什么? 检哪里? 怎么检? 2 3 1
生物医学相关文献和会议内容的查询 TITLE OF PRESENTATION
TITLE OF PRESENTATION 19 案例 1: 检索和 CDK4/6 靶点相关的文献 Tips: 1. 选择检索范围 2. 涉及多个检索项的时候, 需要考虑之间的关系 3. 直接输入 CDK, 系统可以给出 Emtree 中相关词汇,
TITLE OF PRESENTATION 20 获得结果 Tips: 可以利用这里更多的工具, 获得更加精准的文献
TITLE OF PRESENTATION 21 Maping 工具的使用 Tips: 通过不同的匹配度进行结果的扩展或者精炼 Embase mapping options Map to preferred term in Emtree Search also as free text in all fields Explode using narrower Emtree terms 用 Emtree 中匹配的词去检索 Index Term 部分 用输入的词检索所有字段 用 Emtree 中匹配的词以及这些词的下位词检索 Index Term 部分 Search as broadly as possible Emtree 的词, 下位词, 同义词,Free Text 检索所有字段 Limit to terms indexed in articles as major focus : 将检索词锁定在 Major Focus 部分
TITLE OF PRESENTATION 22 Major Focus 结果 Tips: Embase 将所有的检索历史列举在界面, 可以随时查看, 方便结果集之间的逻辑关系 可以通过 Filter 工具进一步对结果进行筛选
TITLE OF PRESENTATION 23 Filter 工具的使用 Tips: 1. Embase 能帮助检索到很多 Medline 检索不到的文献 2. Study Tpye 分析, 帮助获得文献涉及的最直接的研究方向
TITLE OF PRESENTATION 24 更多的 Filter 工具 Diseases Tips: 1. Disease 分析, 帮助从疾病领域出发, 对文献进行筛选, 获得这个靶点可能从事的疾病的研究 2. 在 Subheading 中可以获得更加细节性的内容, 包括药物治疗, 不良反应等, 3. 一些在研 / 上市的药物名称也可以通过这种方式获得
TITLE OF PRESENTATION 25 更多的 Filter 工具 Drugs Tips: 1. 进一步的 Durg 分析可以从药物的角度帮助获得文献中涉及到的药物不良反应, 药物联用, 药物比较等细节性的内容 2. 所有的检索, 筛选历史全部位于 History 的部分, 用于掌握结果的检索逻辑
TITLE OF PRESENTATION 26 其中的一条记录 Tips: 打开记录可以看到记录中更加详细的内容
TITLE OF PRESENTATION 27 文献中的细节性信息 细节信息解读 : 1. Palbociclib, 在文献中提到过的不良药物反应, 关节痛, 疲劳, 潮热, 恶心, 中性粒细胞减少 2. Palbociclib, 涉及的药物联用, 氟维司群, 来曲唑, 曲妥珠单抗等 3. 治疗领域,BC,ER+ BC
TITLE OF PRESENTATION 28 案例 2: 检索 2016 年 ASCO 会议中的报道
TITLE OF PRESENTATION 29 输入会议名称 建议输入会议的完整名称
TITLE OF PRESENTATION 30 检索到的结果 Tips: 1. 可以利用左侧分析工具进行过滤筛选 2. 也可以利用 Embase 对于结果集的组合进行筛选, 考虑, 如何从当前结果集中筛选出 Bladder Cancer 有关的报道
TITLE OF PRESENTATION 31 重新做一次关于 Bladder Cancer 的检索 Tips: 直接通过单前页面, 进行 Bladder Cancer 的检索, 添加引号, 并选择 Major Focus,
TITLE OF PRESENTATION 32 对已经检索到的 2 个结果集进行逻辑操作 Tips: 1. 通过 History 处可以直接对结果集进行逻辑操作, 2. 逻辑操作后的结果集亦可看到检索历史来源
TITLE OF PRESENTATION 33 最后的结果 从 Source 的分析可以看到,Medline 中没有任何会议相关记录
TITLE OF PRESENTATION 34 案例小结 检索前的思考, 检什么, 检哪里, 怎么检 Searching Mapping 的使用 Filter 工具的使用 Combine 工具的使用
药物和疾病相关文献的查询 TITLE OF PRESENTATION
TITLE OF PRESENTATION 36 案例 3 检索 Opdivo 的相关文献
Mapping 的选择 TITLE OF PRESENTATION 37
Major Focus 的结果 TITLE OF PRESENTATION 38
TITLE OF PRESENTATION 39 Filter 工具的使用 如何获得和药物临床有关的文献? Filter By Study Types
TITLE OF PRESENTATION 40 其中的一条结果 细节性内容 : 1. 安全性, 活性 2. 开放标签, 单臂, 多中心 II 期实验 3. 剂量 3mg/Kg,2 周一次注射, 一共 6 周
TITLE OF PRESENTATION 41 利用 History 返回最初的结果集 Tips: 利用 Subheadings, 或者 Diseases 过滤可以获得更多细节性内容
继续使用 Filter 工具获得和 Opdivo 药物联用的文献 TITLE OF PRESENTATION 42
最后的结果 TITLE OF PRESENTATION 43
TITLE OF PRESENTATION 44 比较一下接下来的 2 张片子上的数据 (Page 1) Searching Steps: 1. Drug Search Opdivo,Major focus 2. Subheadings 过滤拿到 201 篇和 Drug Combination 的文献
TITLE OF PRESENTATION 45 比较一下接下来的 2 张片子上的数据 (Page 2) Searching Steps: 1. Drug Search Opdivo,Major focus 2. Drug 选择 Opdivo 过滤拿到 122 篇和 Drug Combination 的文献
Embase 数据库在循证医学和系统评价中的应用 TITLE OF PRESENTATION
TITLE OF PRESENTATION 47 循证医学和系统评价的关键因素 提出问题搜寻证据评估证据得出结论后效评价 PICOS 1. 选择关键词 2. 构建搜寻指令 3. 查找文献 4. 判断证据等级 Embase.com MEDLINE P = Patient I = Intervention C = Comparison/control O = Outcome
TITLE OF PRESENTATION 48 Embase 中的 PICO 模块帮助快速建立检索式 Tips: Embase 中的 PICO 检索能帮助用户通过最直观的检索途径进行全面的文献调研 Population, Patient, Problem Intervention Comparison Outcome
TITLE OF PRESENTATION 49 案例 4: PICO 检索下面的相关文献 使用 SSRI ( 选择性血清素回收抑制剂 ) 治疗抑郁症儿童或青少年是否会增加其自杀风险? Browse Emtree Patient Intervention Comparison Outcomes depression SSRI Suicide 交集 PICO 或多个关键词 ( 筛选研究类型 )
TITLE OF PRESENTATION 50 PICO 检索构建 Step 1 搜索范围的定义 Tips: 搜索范围的定义, 也可以针对每个字段进行定义
TITLE OF PRESENTATION 51 PICO 检索构建 Step 2 输入 PICO 所有的检索条件 Patient Intervention Comparison Outcomes depression SSRI Suicide 每一个字段在输入的时候都可以调整检索范围
PICO 检索构建 Step 2 全部条件输入后的结果 TITLE OF PRESENTATION 52
TITLE OF PRESENTATION 53 检索到的结果 使用 Filter 进行过滤
TITLE OF PRESENTATION 54 结果处理 添加更多的条件 Tips: Age 的选项不只是年龄的数据,
TITLE OF PRESENTATION 55 更多的用于循证医学的筛选 Tips: 1. Embase 直接给出了专门用于 EBM 的筛选, 可以快速用于 CR,SR,Meta 分析方面文献的获得 2. 更多零散方面的证据可以通过 Study Type 来获得, 如 Case Report,Cohort Analysis 等
最后的结果 TITLE OF PRESENTATION 56
检索策略的输出 TITLE OF PRESENTATION 57
TITLE OF PRESENTATION 58 检索结果的输出 支持多种结果的输出, 可以导入到各种文献管理软件中
TITLE OF PRESENTATION 59 提纲 Embase 数据库包含的内容与特色 Embase 数据库包含内容 Embase 数据库特色 Embase 数据库中的检索 Embase 中的数据记录 如何利用 Embase 数据库进行生物医学相关文献和会议内容的查询 如何利用 Embase 数据库进行药物与疾病相关文献的查询 如何利用 Embase 数据库支持循证医学系统评价的研究 Embase 数据库检索小结
TITLE OF PRESENTATION 60 Embase 检索小结 Embase 中完全包含 Medline 的内容, Embase 中还包含更多的会议记录, 以及更多的非英文文献 Embase 中拥有强大的 Emtree 索引词库, 帮助用户能更加精准的找到文献 Embase 的 Drug,Disease,PICO 等检索模块, 能帮助用户在最短时间内, 创建最精准的检索式 Embase 的强大过滤工具, 能帮助用户通过不同的手段进行文献方面的筛选和过滤
Thank you! TITLE OF PRESENTATION