目录 为什么选择 TINGEN? 01 DN 文库制备流程 含片段化功能的快速 DN 文库制备流程 (Illumina 平台 ) 02 不含片段化功能的快速 DN 文库制备流程 (Illumina 平台 ) 04 含片段化功能的快速 DN 文库制备流程 (Ion Torrent 平台 ) 05 经典

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产品简介本试剂盒提供了 DNA 文库构建所需要的酶预混体系及反应缓冲液, 包含除接头与 PCR 引物外的所有成分, 用于 illumina 二代测序平台 DNA 文库构建 和一般建库方法相比, 该试剂盒操作简单 方便, 极大地缩短了文库构建时间 另外, 试剂盒采用高保真 DNA 聚合酶进行文库富集,


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第一章 §1 1

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用 2 小时或更短的时间 此试剂盒适用于基因组 DNA 福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) 样本 ChIP DNA 和低起始量的临床样本的建库 NEXTflex Rapid DNA-Seq Kit 样品的起始量范围非常灵活, 跨越了 3 个数量级, 从 1ng 至 1μg 这是一个基于磁珠纯化 无需

124 河南农业科学第 42 卷, (HPS) ;PRRSV PCV2, [4] PRRSV CSFV ;20, PRRSV,CSFV [5-9],, 1.2 主要试剂和仪器 Real-timePCR PRRSV CSFV PCV2, 3 RotorGene, RG-3000; ND-1000 Na


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國 史 館 館 訊 06 期 張 存 武 教 授 ( 略 ) 劉 維 開 教 授 17

简介 A B 基于 Sanger 方法的传统测序方法在过去的 2 多年间一直在 DNA 序列测定方法中占据主导地位 1 但是, 随着测序方法及技术的进步, 测序通量在 Sanger 测序基础上有了极大的进步, 如今全基因组测序可在几周甚至是几天内完成 2 这些技术统称为新一代测序, 或 NGS 随着

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快速文库构建方案 各种科研文库构建指南 常用临床文库构建指南 样本纯化方案

目录 为什么选择 TINGEN? 01 DN 文库制备流程 含片段化功能的快速 DN 文库制备流程 (Illumina 平台 ) 02 不含片段化功能的快速 DN 文库制备流程 (Illumina 平台 ) 04 含片段化功能的快速 DN 文库制备流程 (Ion Torrent 平台 ) 05 经典 DN 文库制备流程 (Illumina 平台 ) 06 经典 DN 文库制备流程 (Ion Torrent 平台 ) 07 RN 文库制备推荐流程 (Illumina 平台 ) 08 Small RN 文库制备推荐流程 (Illumina 平台 ) 09 RN 文库构建方案 10 mrn 文库构建流程 10 Small RN 文库构建流程 10 临床诊断 NGS 文库构建 11 唐筛及肿瘤筛查文库构建方案 11 胚胎染色体异常筛查文库构建方案 11 科研服务 NGS 文库构建 12 科研服务文库构建方案 - 基因组 DN 12 科研服务文库构建方案 - 片段化 DN 12 常见问题解决 13 样本纯化方案 18 产品选择指南 20 一站式整体解决方案 (DN 文库 ) 20 建库模块 ( 建库模块可直接整合 ) 20 原材料 ( 可根据需求调整组合成建库模块 ) 21

TINGEN 强势进军二代测序领域! 为什么选择 TINGEN? 灵活 : 样本起始范围宽 (ng 级 -μg 级 ), 可选择购买特定功能模块或原材料, 适合科研和不同规模工业用户的选择! 高效 : 新型快速解决方案可极大减少纯化过程, 省时 省力 避免纯化过程的损耗, 大幅提升低起始量样本建库成功率! 齐全 : 作为 TINGEN 传统优势的各类核酸提取试剂, 为二代测序相关的核酸提取纯化实验提供最佳的质量保障! 便捷 : 所有产品均为原装进口, 配备中英双文说明书, 更方便阅读和使用 常规产品在中国大陆地区长期备货, 货期更短, 采购形式更为灵活 ; 大批量采购客户可提供中国仓储, 按需分配发货, 更快到达您的手中! TINGEN 都有什么? 灵活的建库模块包含建库过程中的单个或多个可合并操作的步骤, 可以和其它试剂组合用于特殊需要的工作流程 可单独选购的各种原材料, 充分的优化和调整空间, 可以适应各种特殊的实验目的或者大批量建库的需要 个性化的一站式建库解决方案, 针对不同的文库特点和样本类型, 帮您推荐适合您的建库各步所需的试剂, 适合于科研服务建库及工业客户开展 NGS 实验 快速文库构建平台特点 质量流程灵活性 与超声破碎相同的破碎 效果和测序数据质量 一管式操作, 多个反应 一步完成 可控的 DN 破碎长度 (200-800 bp) 文库构建效率高 文库产量高 更短的操作时间, 文库 制备耗时更少 宽泛的样品上样量 (1 ng to 1 µg) 良好的试验重复性 和一致性 适合高通量文库制备 及自动化 PCR free ( 50 ng) 01

含片段化功能的快速 DN 文库制备流程 (Illumina 平台 ) 基因组 DN 文库制备 TINSeq DirectFast DN Library Prep Kit(NG201) 适用样本类型样本起始量 基因组 DN(gDN) 1 ng-1 μg 特点 含有片段化酶, 适用于基因组 大片段 DN 的快速文库构建 低起始量样本, 适合 1 ng ~ 1 μg 样本的高效转化 简便 快速, 省去多步纯化流程, 整个建库流程仅需 2.5 hr 快速一站式建库方案 (Illumina 平台适用 ) DN 片段化末端修复 尾添加接头连接 PCR 富集 ( 所需总时间 :2.5 小时 ) TINSeq FragmentationEnd repaird-tailing Module (NG301-0102) TINSeq Fast Ligation Module(NG303-0102) TINSeq NGS Library mplifi cation Module (NG304-0102) Step1 DN TINSeq FragmentationEnd repairdtailing Module gdn TINSeq FragmentationEnd repairdtailing Module gdn GC Step2 TINseq Fast Ligation Module DN 1-2 Barcode P5 P7 DN NGS PCR P5 BC 2 P7 BC 1 T T BC 1 P7 BC 2 P5 Step3 PCR P5 P7P5 P7 TINSeq FragmentationEnd repaird-tailing Module PCR T T T 02

灵活的上样量和片段处理长度 10 ng input DN 1000 ng input DN 图 1. 不同反应时间对 DN 片段化效果的影响 使用 Fragmentation Module(NG301) 对 10 ng 和 1000 ng DN 进行片段化处理 处理不同时长的反应产物经 1.8X mpure XP 微珠进行纯化后用于 ngilent 2100 分析 片段化酶与机械片段化效果比较 样本低至 1ng 建库效果比较 机械切割 超声波 酶切 厂家 N 酶促反应 Fragmentation Module 机械切割 超声破碎转座酶 Supplier I 酶切 Supplier N 酶促反应 Fragmentation Module Species %GC F.nucleatum 27 B.pertussis 67 E.coli 50 Species %GC F.nucleatum 27 B.pertussis 67 E.coli 50 图 2. 不同文库制备方案基因组覆盖的对比结果, 三种不同 GC 含量细菌基因组 DN 等摩尔混合,100 ng 混合 DN 经不同方案制备文库测序后比较基因组覆盖度 结果表明 :Fragmentation Module(NG301) 对 DN 的片段化效果与超声破碎高度一致, 均不存在切割的偏好性 图 3. 不同文库制备方案基因组覆盖的对比结果, 三种不同 GC 含量细菌基因组 DN 等摩尔混合,1 ng 混合 DN 经不同方案制备文库测序后比较基因组覆盖度 结果表明 : 即使低至 1 ng 的 DN 上样量,Fragmentation Module(NG301) 的片段化效果仍然与超声破碎方法高度一致, 没有切割偏好性 采用 PCR free 步骤测序结果比较 文库构建效率与得率统计 2 1.5 Covaris (100 ng) with PCR Fragmentation Module (100 ng) with PCR Fragmentation Module (100 ng PCR-Free) Fragmentation Module (50 ng PCR-Free) Normalized coverage 1 0.5 Species %GC F.nucleatum 27 B.pertussis 67 E.coli 50 0 0 20 40 60 80 100 GC % over 100 bp regions Library yield (nm) Input DN (ng) 图 4. 不同初始量的基因组 DN 使用 PCR 或 PCR free 的方式进行文库构建, 最终的基因组覆盖对比对 结果表明 : 使用 Fragmentation Module (NG301) 试剂及一管式操作和高效的文库构建步骤, 无论是否进行 PCR 富集, 所得到的 DN 文库在片段覆盖度分布方面均与机械破碎方法保持高度一致 图 5. 不同起始量样本 (1 10 25 50 100 500 1000 ng) 经 PCR-free 方式进行文库构建后, 使用 qpcr 对得到的文库 DN 进行定量分析结果 线性回归分析表明在广泛的上样量范围内, 文库得率均呈良好的线性关系 即使在上样量低至 1 ng 的情况下, 文库构建效率也不会降低 不同产品测序数据对比 Fragmentation 1ng Input DN 100 ng Input DN method Mapped Reads Duplication Mapped Reads Duplication Covaris Mechanical 92.96% 0.09% 93.61% 0.03% Supplier I Tagmentation 93.76% 0.28% Supplier N Enzgme-based 86.91% 0.68% 91.40% 0.06% Fragmentation Module Enzgme-based 91.92% 0.07% 94.45% 0.04% 03

不含片段化功能的快速 DN 文库制备流程 (Illumina 平台 ) 片段化 DN 文库制备 TINSeq Fast DN Library Prep Kit (NG202) 适用样本类型 样本起始量 DN 片段 0.25 ng-1 μg 特点 适用于片段化 DN 的快速文库构建 低起始量样本, 适合 0.25 ng ~ 1 μg 样本的高效转化 简便 快速, 省去多步纯化流程, 整个建库流程仅需 2 hr 快速一站式建库方案 (illumina) 末端修复 尾添加接头连接文库富集 所需总时间约 2 小时 TINSeq End repaird-tailing Module (NG302-0102) TINseq Fast Ligation Module (NG303-0102) TINSeq NGS Library mplifi cation Module (NG304-0102) Step1 TINSeq End repaird-tailing Module Step2 TINseq Fast Ligation Module DN 1-2 Barcode P5 P7 DN NGS PCR P5 BC 2 P7 BC 1 T T BC 1 P7 BC 2 P5 Step3 PCR P5 P7P5 P7 TINSeq NGS Library mplification Module PCR T T T 04

含片段化功能的快速 DN 文库制备流程 (Ion Torrent 平台 ) 基因组 DN 文库制备 适用样本类型 样本起始量 基因组 DN(gDN) 1 ng-1 μg Step1 TINSeq DN Fragmentation Module (NG305) Step2 Step3 05

经典 DN 文库制备流程 (Illumina 平台 ) 片段化 DN 文库制备 TINSeq DN Library Prep Kit for illumina(ng103) 适用样本类型样本起始量 DN 片段 10 ng-1 μg 特点 高度优化经典建库流程, 高文库转化效率 反应模块冻干包装, 操作简便, 性能稳定 适合 10 ng ~ 1 μg 样本的高效转化 TINSeq DN Library Prep Kit for illumina Workflow End Repair MPure Purification -Tailing MPure Purification dapter Ligation MPure Purification 30 min 25 min 30 min 25 min 15 min 25 min Step1 Step2 NG205-0102 NG203-0102 NG206-0102 Step3 NG202-0102 NG206-0102 Step4 NG201-0102 Step5 TINSeq NGS Library mplification Module (NG304-0102) 06

经典 DN 文库制备流程 (Ion Torrent 平台 ) 片段化 DN 文库制备 TINSeq DN Library Prep Kit for ion torrent(ng104) 适用样本类型 样本起始量 DN 片段 10 ng-1 μg 特点 适合于 ion torrent 平台的高效文库转化流程 反应模块冻干包装, 操作简便, 性能稳定 适合 10 ng ~ 1 μg 样本的高效转化 TINSeq DN Library Prep Kit for ion torrent Workflow End Repair MPure XP Purification dapter LigationNick Repair MPure XP Purification 20 min 25 min 15 min5 min 25 min Step1 Step2 NG205-0102 NG203-0102 NG206-0102 Step3 NG201-0102 NG208-0102 Step4 TINSeq NGS Library mplification Module (NG304-0102) 07

RN 文库制备推荐流程 (Illumina 平台 ) Step1 Step2 Step3 NG212-01 NG209-0102 Step4 NG207-0102 NG204-0102 NG201-0102 Step5 NG205-0102 NG203-0102 NG206-0102 Step6 NG202-0102 NG206-0102 Step7 NG201-0102 Step8 TINSeq NGS Library mplification Module (NG304-0102) 08

Small RN 文库制备推荐流程 (Illumina 平台 ) Step1 NG210-01 Step2 Step3 NG211-0102 Step4 NG212-01 NG209-0102 Step5 TINSeq NGS Library mplification Module (NG304-0102) 09

Illumina平台流程原材料RN 文库构建方案 mrn 文库构建流程 mrn 片段化 第一链 cdn 合成 第二链 cdn 合成 末端修复 尾添加 接头连接 PCR 富集 TINSeq FragmentationEnd TINSeq Fast repaird-tailing Module (NG301-0102) Ligation Module (NG303-0102) EnzScript M-MLV DN 聚合酶 I T4 DN 聚合酶 T4 DN 连接酶 (RNase H - ) (NG212-01) (NG204-0102) RN 酶 H (NG205-0102) Klenow 片段 Klenow 片段 ( exo-) (NG202-0102) (NG201-0102) RN 酶抑制剂 (NG209-0102) EnzScript M-MLV (RNase H - ) (NG212-01) (NG207-0102) T4 DN 连接酶 (NG201-0102) DN 聚合酶 I (NG204-0102) RN 酶 H (NG203-0102) T4 多聚核苷酸激酶 (NG206-01-2) T4 DN 聚合酶 (NG205-0102) Klenow 片段 T4 DN 连接酶 (NG201-0102) Bxt X DN 聚合酶 RN 酶抑制剂 (NG207-0102) (NG203-0102) (NG208-0102) (NG209-0102) T4 DN 连接酶 T4 多聚核苷酸激酶 (NG201-0102) (NG206-01-2) Illumina 平台流程Ion Torrent 平台流 TINSeq NGS Library mplifi cation Module (NG304-0102) TINSeq NGS Library mplifi cation Module (NG304-0102) Small RN 文库构建流程 端接头连接引物杂交 端接头连接第一链 cdn 合成 PCR 富集 T4 RN 连接酶 2 ( 截短型 ) (NG210-01) T4 RN 连接酶 1 (NG211-0102) EnzScript M-MLV (RNase H - ) (NG212-01) RN 酶 H (NG207-0102) RN 酶抑制剂 (NG209-0102) TINSeq NGS Library mplifi cation Module (NG304-0102) 10

试剂盒试剂盒原材料 模块临床诊断 NGS 文库构建 唐氏及肿瘤筛查文库构建方案 游离核酸末端修复 尾添加接头连接 PCR 富集 Illumina 平台流程Ion torrent 平台流程模块原材料 TINSeq Fast DN Library Prep Kit (illumina) (NG102-0102) ( 所需时间 2 hr) 血清 血浆游离 DN 提取试剂盒 (DP339) TINSeq DN Library Prep Kit for illumina(ng103-0102) ( 所需时间 3.5-5 hr) TINSeq End repaird-tailing Module (NG302-0102) TINseq Fast Ligation Module (NG303-0102) TINSeq NGS Library mplifi cation Module (NG304-0102) TINSeq NGS Library mplifi cation Module (NG304-0102) T4 DN 聚合酶 (NG205-0102) Klenow 片段 (NG203-0102) T4 多聚合核苷酸激酶 (NG206-0102) Klenow ( exo-) (NG202-0102) T4 DN 连接酶 (NG201-0102) TINSeq 单索引接头 (Illumina) (NG214-010203) TINSeq NGS Library mplifi cation Module (NG304-0102) TTINSeq DN Library Prep Kit for ion torrent( 所需时间 2-3 hr) T4 DN 聚合酶 (NG205-0102) Klenow 片段 (NG203-0102) T4 多聚合核苷酸激酶 (NG206-0102) T4 DN 连接酶 (NG201-0102) Bst X DN 聚合酶 (NG208-0102) 染色体异常筛查文库构建方案 DN 片段化末端修复 尾添加接头连接文库富集 Illumina 平台流程Ion Torrent 平台流程原材料模块试剂盒试剂盒原材料 TINSeq DirectFast DN Library Prep Kit (illumina) (NG101-0102) ( 所需时间 2.5 hr) TINSeq Fast DN Library Prep Kit (illumina) (NG102-0102) ( 所需时间 2 hr) TINSeq DN Library Prep Kit for illumina(ng103-0102) ( 所需时间 3.5-5 hr) TINSeq FragmentationEnd repaird-tailing Module (NG301-0102) TINSeq End repaird-tailing Module (NG302-0102) TINseq Fast Ligation Module(NG303-0102) TINSeq NGS Library mplifi cation Module (NG304-0102) TINSeq NGS Library mplifi cation Module (NG304-0102) T4 DN 聚合酶 (NG205-0102) Klenow 片段 (NG203-0102) T4 多聚合核苷酸激酶 (NG206-0102) Klenow ( exo-) (NG202-0102) T4 DN 连接酶 (NG201-0102) TINSeq 单索引接头 (Illumina)(NG214-010203) TINSeq DN Library Prep Kit for ion torrent( 所需时间 2-3 hr) TINSeq DN Fragmentation Module(NG305-0102) T4 DN 聚合酶 (NG205-0102) Klenow 片段 (NG203-0102) T4 DN 连接酶 (NG201-0102) Bst X DN 聚合酶 T4 多聚合核苷酸激酶 (NG206-0102) (NG208-0102) 11

试剂盒原材料原材科研服务 NGS 文库构建 科研服务文库构建方案 基因组 文库类型 DN 片段化末端修复 尾添加接头连接文库富集 基因组文库 TINSeq DirectFast DN Library Prep Kit (illumina) (NG101-0102) ( 所需时间 2.5 hr) 宏基因组文库 单细胞基因组扩增文库 TINSeq Fast DN Library Prep Kit (illumina) (NG102-0102) ( 所需时间 2 hr) TINSeq DN Library Prep Kit for illumina(ng103-0102) ( 所需时间 3.5-5 hr) TINSeq NGS Library mplifi cation Module (NG304-0102) Illumina 模块平台流程Ion torrent 平台流程模块试剂盒TINSeq FragmentationEnd repaird-tailing Module (NG301-0102) TINSeq End repaird-tailing module (NG302-0102) TINseq Fast Ligation Module (NG303-0102) TINSeq NGS Library mplifi cation Module (NG304-0102) T4 DN 聚合酶 T4 DN 连接酶 Klenow( exo-) (NG205-0102) (NG202-0102) (NG201-0102) Klenow 片段 TINSeq 单索引接头 (NG203-0102) T4 多聚合核苷酸激酶 (NG206-0102) (Illumina) NG214-010203) TINSeq DN Library Prep Kit for ion torrent( 所需时间 2-3 hr) TINSeq DN Fragmentation Module (NG305-0102) T4 DN 聚合酶 (NG205-0102) Klenow 片段 (NG203-0102) T4 多聚合核苷酸激酶 T4 DN 连接酶 (NG201-0102) Bst X DN 聚合酶 (NG208-0102) (NG206-0102) 科研服务文库构建方案 片段化 DN 料文库类型末端修复 尾添加接头连接文库富集 库 小片段 DN 文库 RD 文库 外显子文库 区段 DN 文库 BS-Seq 文库 Target-BS 文库 RRBS-Seq 文库 羟甲基化文库 ChIP-Seq 文库 MeDIP 文库 Hi-C 文库 ITS 扩增文库 16S rdn 文库 Illumina 试剂盒模块平台流程Ion torrent 平表观遗传类文库PCR 产物文库原材料试剂盒 TINSeq End repaird-tailing Module (NG302-0102) T4 DN 聚合酶 (NG205-0102) Klenow 片段 (NG203-0102) T4 多聚合核苷酸激酶 (NG206-0102) 18S rdn 文库 T4 DN 聚合酶 T4 DN 连接酶 (NG201-0102) (NG205-0102) Bst X DN 聚合酶 Klenow 片段 (NG208-0102) 原材料DN 文台流程(NG203-0102) T4 多聚合核苷酸激酶 (NG206-0102) TINSeq Fast DN Library Prep Kit (illumina) (NG102-0102) ( 所需时间 2 hr) TINSeq DN Library Prep Kit for illumina(ng103-0102) ( 所需时间 3.5-5 hr) Klenow ( exo-) (NG202-0102) TINSeq DN Library Prep Kit for ion torrent( 所需时间 2-3 hr) TINseq Fast Ligation Module (NG303-0102) T4 DN 连接酶 (NG201-0102) TINSeq 单索引接头 (Illumina)NG214-010203) TINSeq NGS Library mplifi cation Module (NG304-0102) TINSeq NGS Library mplifi cation Module (NG304-0102) 12

常见问题解决 Q NGS 文库的片段大小分布 一般是怎样的? Q 配制 TINSeq DirectFast DN Library Prep Kit (NG101) 文库制 备反应体系时, 混匀方式对试验结果有影响吗? NGS 文库 DN 片段一般在 200 bp- 800 bp 范围内分布 不恰当的混匀方式 ( 涡旋 剧烈振荡等 ) 会造成文库片段分布出现异常 ( 如下图 ), 从而影响文库质量 故而当配制 5 FE Enzyme Mix 的片段化反应液时, 请使用移液器 轻柔吸打混匀, 或用指尖轻弹混匀 注意不要使用涡旋混匀 WGS Supplier K Covaris Correct mixing Vortex mixing Incorrect mixing 不同方法构建得到的 NGS 文库片段大小分布相 似效果 混匀方式错误对结果造成的影响 Q 构建得到的文库 DN 浓度低? a) DN 质量差, 含抑制物使用高质量的 DN 样本, 以免抑制酶活性 b) 采用 PCR-free 方式构建 DN 文库时,DN 上样量不足当片段化 DN 的上样量超过 50 ng 时, 可在文库构建过程中不进行 PCR 扩增 如果文库拷贝数过低不能进行直接测序, 可在接头连接完成后对 DN 文库进行 PCR 扩增 c)rn 污染造成起始 DN 定量不准确基因组 DN 纯化过程中可能存在 RN 污染, 进而导致 DN 定量不准确, 使文库构建时 DN 上样量不足 可用 RNase 对 DN 进行处理, 以除去 RN Q -1 a) 出现小片段 (60 bp-120 bp) DN 文库在电泳分析中出现异常条带 小片段一般为接头片段或接头所形成的二聚体, 使用 gencourt MPure XP 微珠进行纯化可以有效去除这些接头片段, 保证测序质量 b) 文库经 PCR 富集后出现大片段接头连接后文库 DN 片段的大小会增加 120 bp, 若添加接头后 DN 片段增大幅度超过 120bp, 则可能为 PCR 扩增过度, 导致产生了片段扩增异常 减少 PCR 循环数可以避免这种情况的发生 c) 接头连接后文库 DN 片段大小异常本试剂盒接头长度为 60 bp, 则当片段两端被连接接头后, 其长度只会增加 120 bp 如果使用非本试剂盒推荐的接头, 请联系供应商提供接头长度等相关信息 请确保试验流程及操作遵守操作手册所描述的步骤进行 d) 接头连接前 DN 片段大小异常此问题产生的原因可能是在 DN 片段化过程中使用了错误的反应条件 不同的 DN 上样量应使用不同的反应时间 若 DN 上样量大于 10ng, 我们推荐以 12 min 反应时间作为起始时间进行优化, 此时产生的片段大小主要为 300-500 bp 范围 用户可根据自己的需求在此时长基础上增加或减少 2-4 min 优化得到所需大小的 DN 片段 13

-2 a) 片段化时间未优化 如果片段化的 DN 过小或过大, 请参考说明书中提供的 DN 片段大小随片段化反应时间变化图进行反应时长的初 步确定, 并以此时长为对照, 额外设置延长或缩短 3 min 的反应体系对片段化时间进行较为准确的判断 -3 片段化处理后 DN 的大小分布出现异常 a) 片段化试剂融化方式不正确, 或融化后未完全混匀 将 5 FE Enzyme Mix 试剂置于冰上融化 一旦融化, 轻弹管底将试剂混匀, 注意不要涡旋混匀! b) 用于上样的 DN 溶液中含有 EDT 或其他污染物在 DN 纯化步骤中除去盐离子和螯合剂对于试验的成功尤为重要 如果 DN 溶解于 1XTE, 可采用说明书中提供的方法进行片段化 如果不确定溶液中的 EDT 浓度, 则建议对 DN 进行纯化, 然后将其溶解于去离子水中进行后续反应 c) 起始 DN 定量不准确片段化处理后 DN 的大小与 DN 上样量密切相关 在片段化处理前, 使用 Qubit Picogreen 等方法对 DN 进行精确定量有助于确定反应体系中 DN 的准确用量 d) 配制反应体系时未遵循说明书进行片段化反应体系的配制必须严格按说明书所述在冰上进行, 为了保证最好的效果, 所有反应组份也均应置于冰上, 并在完全冷却后再进行反应体系的配制 配制完成后请轻弹或吸打混匀, 切不可涡旋! 使用 TINSeq DirectFast DN Library Prep Kit(NG101) 需要注意的问题 1 必须使用高纯度 DN 进行文库构建 DN 完整度较好 : 电泳条带 30 kb 以上, 无拖尾现象 OD 260230 : >1.5 OD 260280 : 1.7-1.9 2 DN 上样量必须准确建议采用 Qubit Picogreen 方法对 DN 进行定量, 而不宜使用 Nanodrop 进行定量 3 必须明确 DN 溶液中 EDT 的含量 EDT 对片段化反应影响较大, 若 EDT 含量高, 则需要对 DN 进行纯化才能够进行后续试验 4 片段化反应液必须在冰上配制片段化反应过程对反应温度和时间敏感 ( 尤其是添加 Enhancer 后 ), 为了保证反应时间的准确性请于冰上配制反应体系 5 片段化反应时间必须准确片段化步骤的反应时间将直接影响片段化产物的大小, 从而对文库中 DN 片段的大小分布造成影响 14

样本库构建的第一步就是高质量的核酸提取 TINGEN 作为中国核酸提取的龙头企业 拥有针对于各种不同样本和起始量 的专业解决方案 中华骨髓库 项目 累计提供超过 80万人份 血液基因组提取产品 全球结核病筛查 项目 提供超过 10万人份 病毒检测产品 手足口和流感 疫情 累计提供超过 800万人份 产前及新生儿早期筛查 工作 累计提供 超过 120万人份 医疗样本检测产品 中国最大的健康人群样本库 工程 汶川地震 灾区食品安全检查 累计提供 超过 2.5万次 细菌检测产品 提供核酸自动化提取解决方案 15

专业生产 品质稳定 洁净生产车间 严格控制 品质保证 德国莱茵ISO认证--专业管理控制 --环境洁净度控制在10万级以上 从研发 采购到生产 物流 每个产品从 参照GMP标准建设的洁净生产车间 保证了环 诞生之日起全程在德国莱茵TUV认证的 境的洁净 是产品稳定可靠的基础保证 ISO 9001质量管理体系下严格进行 中央水处理系统--保证最纯净的供水 专业生产用Millipore大型中央水处理系统 利用 RO反渗透技术及紫外杀菌等纯化处理 结合多 层级交换柱及滤膜 去除重金属 细菌 有机 物 毒素等污染 保证研发及生产用水纯净 获得北京市食品药品监督管理局认可 授 水质标准 电阻率18.2 MΩ cm 予 第一类医疗器械生产备案凭证 具 TOC<5 ppb 内毒素<0.001 EUml 第一类医疗器械生产备案认证企业 有第一类医疗器械备案产品的研发 生 产 质检资格 目前已经有微量基因组 生产过程控制--保证产品品质 DN 干血斑DN等10余种核酸提取试 生产过程中引入SP系统全过程管理 使生产管 剂盒获得第一类医疗器械凭证 理规范 可控 批量化 自动化生产 确保产品批间差降至最 低 专业人员培训机制及监控考核系统 最大化降低 人为误差 每一个产品单元都可以一直追溯到原料层面 技术培训 定期的质量意识 安全 技术培训 不断提高质 量意识和生产技术能力 16 质量过程控制 从原料 半成品到成品进行严格质量控制及层层监测 生产全过程 跟踪检查 监督 过程文件严格记录 对洁净区 纯水系统的定期 专人检测 确保系统正常运行 与总公司联合建立严苛的质量检测 流程及质量控制标准 贯穿始终的质量提升项目 确保质检体系随 市场要求的变化不断提升

整合全球资源 实现规模生产 全球原材料采供链 天根依托全球统一采供链 筛选300多家国际供应商 采用高品质原 料 对所有原材料100%严格质检以保证品质及批间稳定 自动化生产 各种自动化生产设备的广泛采用不仅提高了生产效率 而且更有利于 控制产品品质的均一性及稳定性 减少人为操作产生的误差 自动化 设备涵盖了试剂 耗材的生产到包装各环节 规模化实现全球化 随着国际市场需求的不断增加 天根不断提升生产规模及生产能力 为了适应国际化市场的快速发展 天根自2013年起陆续将所有产品标 签英文化 全球供应产品实行统一生产 分别包装 各种自动化生产设备的广泛采用也大大提高了生产效率 保证了全球 业务的快速发展 大型数控仓储系统 多种存储温度分区管理 常温区 15 25 常温库区 低温区 2 8 冷库区 -20 冷库区 -80 超低温库区 先进数控 24 h 365天温度监控 24小时数控检测 数据波动超出正常范围时 将有 即时系统短信通知相关责任人 保证第一时间快速处 理 维持温控安全 17

基因组提取试剂盒提取材料不同样本纯化方案 细菌 细菌基因组 DN 提取试剂盒 (DP302) 植物基因组 DN 提取试剂盒 (DP305) 植物 适用范围不同 新型植物基因组 DN 提取试剂盒 (DP320) 高效植物基因组 DN 提取试剂盒 (DP350) 酵母海洋动物病毒粪便 酵母基因组 DN 提取试剂盒 (DP307) 海洋动物组织基因组 DN 提取试剂盒 (DP324) 病毒基因组 DNRN 提取试剂盒 (DP315) 粪便基因组 DN 提取试剂盒 (DP328) 土壤 土壤基因组 DN 提取试剂盒 (DP336) 血液 组织 细胞 血液 细胞 组织基因组 DN 提取试剂盒 (DP304) 血液基因组 DN 提取试剂盒 (0.1-1 ml)(dp348) 血液 中量血液基因组 DN 提取试剂盒 (0.5-3 ml)(dp332) 医疗样本 血凝块 大量血液基因组 DN 提取试剂盒 (3-10 ml)(dp333) 0.1-1 ml 血凝块基因组 DN 提取试剂盒 (DP335) 干血斑 干血斑 DN 提取试剂盒 (DP334) 微量样品 微量样品基因组 DN 提取试剂盒 (DP316) 口腔拭子 口腔拭子基因组 DN 提取试剂盒 (DP322) FFPE 石蜡包埋组织 DN 快速提取试剂盒 (DP330) 石蜡包埋组织 DN 提取试剂盒 (DP331) 18

子生物学自动化产品高质量RN 提取系列产品DP441 多糖多酚植物总 RN 提取试剂盒分DP329 磁珠法血液基因组 DN 提取试剂盒 DP341 磁珠法动物组织基因组 DN 提取试剂盒 磁珠法系列 DP438 磁珠法病毒 DNRN 提取试剂盒 DP342 磁珠法植物基因组 DN 提取试剂盒 DP119 N96 磁珠法质粒 DN 小提试剂盒 N96 系列 自动化仪器 DP338 N96 植物基因组 DN 提取试剂盒 DP337 N96 新型植物基因组 DN 提取试剂盒 DP314 N96 血液基因组 DN 提取试剂盒 DP114 N96 高纯质粒 DN 小提试剂盒 DP115 N96 快速质粒 DN 小提试剂盒 DP119 N96 磁珠法质粒 DN 小提试剂盒 DP213 N96 DN 产物纯化试剂盒 OSE-M16 TGuide M16 自动核酸提取仪 OSE-M48 TGuide M48 自动核酸提取仪 OSE-P400600 TEasy P 400600 自动化移液工作站 DP430 细胞 细菌总 RN 提取试剂盒 DP431 动物组织总 RN 提取试剂盒 DP432 植物总 RN 提取试剂盒 DP433 血液总 RN 提取试剂盒 DP443 高效血液总 RN 提取试剂盒 DP420 微量样品总 RN 提取试剂盒 DP439 石蜡切片总 RN 提取试剂盒 19

产品选择指南 一站式 DN 文库构建试剂盒 产品名称目录号规格目录价 TINSeq DirectFast DN Library Prep Kit (illumina) 含有片段化酶, 适用于基因组 大片段 DN 的快速文库构建 低起始量样本, 适合 1 ng ~ 1 μg 样本的高效转化 简便 快速, 省去多步纯化流程, 整个建库流程仅需 2.5 hr TINSeq Fast DN Library Prep Kit (illumina) 适用于片段化 DN 的快速文库构建 低起始量样本, 适合 0.25 ng ~ 1 μg 样本的高效转化 简便 快速, 省去多步纯化流程, 整个建库流程仅需 2 hr TINSeq DN Library Prep Kit for illumina 高度优化经典建库流程, 高文库转化效率 反应模块冻干包装, 操作简便, 性能稳定 适合 10 ng ~ 1 μg 样本的高效转化 TINSeq DN Library Prep Kit for ion torrent 适合于 ion torrent 平台的高效文库转化流程 反应模块冻干包装, 操作简便, 性能稳定 适合 10 ng ~ 1 μg 样本的高效转化 NG101-01 24 次 6432 元 NG101-02 96 次 23600 元 NG102-01 24 次 5680 元 NG102-02 96 次 19800 元 NG103-01 24 次 5180 元 NG103-02 96 次 17500 元 NG104-01 24 次 5180 元 NG104-02 96 次 17500 元 建库模块 ( 建库模块可直接整合 ) 产品名称 目录号 规格 目录价 基因组 DN 建库模块 (Illumina 平台适用 ) TINSeq FragmentationEnd Repaird-Tailing Module NG301-01 24 次 3580 元 NG301-02 96 次 11560 元 TINSeq End repaird-tailing Module NG302-01 24 次 2400 元 NG302-02 96 次 7680 元 TINseq Fast Ligation Module NG303-01 24 次 2500 元 NG303-02 96 次 8980 元 TINSeq NGS Library mplification Module NG304-01 24 次 1760 元 NG304-02 96 次 6480 元 基因组 DN 建库模块 (ion torrent 平台适用 ) TINSeq DN Fragmentation Module NG305-01 24 次 720 元 NG305-02 96 次 2400 元 20

DN 文库构建原材料 ( 可根据需求调整组合成建库模块 ) 产品名称 目录号 规格 (U) 目录价 DN 建库原材料 (Illumina 平台适用 ) T4 DN 连接酶 ( 快速 ) NG201-01 24000 720 元 NG201-02 240000 4380 元 Klenow ( exo-) ( 高浓度 ) NG202-01 1500 760 元 NG202-02 10000 3350 元 Klenow 片段 NG203-01 500 1000 元 NG203-02 2500 3080 元 T4 DN 聚合酶 NG205-01 300 780 元 NG205-02 2000 3080 元 T4 多聚合核苷酸激酶 NG206-01 1500 850 元 NG206-02 10000 4580 元 DN 建库原材料 (ion torrent 平台适用 ) T4 DN 连接酶 ( 快速 ) NG201-01 24000 720 元 NG201-02 240000 4380 元 Klenow 片段 NG203-01 500 1000 元 NG203-02 2500 3080 元 T4 DN 聚合酶 NG205-01 300 780 元 NG205-02 2000 3080 元 T4 多聚合核苷酸激酶 NG206-01 1500 850 元 NG206-02 10000 4580 元 Bst X DN 聚合酶 NG208-01 8000 980 元 NG208-02 40000 4380 元 21

RN 文库构建原材料 ( 可根据需求调整组合成建库模块 ) 产品名称 目录号 规格 (U) 目录价 RN 建库原材料 (Illumina 平台适用 ) T4 DN 连接酶 ( 快速 ) NG201-01 24000 720 元 NG201-02 240000 4380 元 Klenow ( exo-) ( 高浓度 ) NG202-01 1500 760 元 NG202-02 10000 3350 元 Klenow 片段 NG203-01 500 1000 元 NG203-02 2500 3080 元 DN 聚合酶 I NG204-01 500 500 元 NG204-02 5000 3080 元 T4 DN 聚合酶 NG205-01 300 780 元 NG205-02 2000 3080 元 T4 多聚合核苷酸激酶 NG206-01 1500 850 元 NG206-02 10000 4580 元 RN 酶 H NG207-01 500 500 元 NG207-02 5000 3080 元 RNse 抑制剂 NG209-01 4000 670 元 NG209-02 20000 3080 元 尿嘧啶 DN 糖基化酶 (UNG) NG213-01 1000 508 元 NG213-02 10000 4080 元 EnzScript M-MLV (Rnase H-) NG212-01 10000 1080 元 Small RN 建库原材料 (illumina 平台适用 ) T4 RN 连接酶 1 NG211-01 1500 780 元 NG211-02 10000 3800 元 EnzScript M-MLV (Rnase H-) NG212-01 10000 1080 元 T4 RN 连接酶 2( 截短型 ) NG210-01 500 3800 元 RN 酶 H NG207-01 500 500 元 NG207-02 5000 3080 元 RNse 抑制剂 NG209-01 4000 670 元 NG209-02 20000 3080 元 修订日期 2016 年 10 月 北京地址 : 北京市海淀区西小口路 66 号东升科技园 ( 北领地 )C 区 7 号楼电话 : 010-59822688 传真 : 010-59822788 技术支持 : 010-5982266159822665 免费咨询 : 800-990-6057 E-mail: people@tiangen.com 400-810-6057 上海地址 : 上海市漕溪路 258 弄 27 号航星商务楼 1 号楼 606 室电话 :021-38653846 传真 :021-64074836 E-mail: sh@tiangen.com