1 1 1 2 2 3 3 6 顿 7 8 BIR-MON-ROP-BRA4C-1-120518-单基因遗传病基因检测.indd 4 2012-8-17 18:13:52

背景知识 单基因遗传病是指一对等位基因发生突变所引起的遗传病, 又称孟德尔式遗传病 一种单基因遗传病可有多个相关致病基因, 但只要单个基因突变就足以发病 目前已发现的单基因遗传病有 7000 多种, 其中有 1000 多种发病机制比较明确能用于临床检测 单基因遗传病是否发病主要由遗传因素决定, 可通过基因检测确定病因, 为疾病预防与治疗提供依据 单基因遗传病基因检测可辅助临床疑似患者的诊断和治疗 ; 为有遗传病史的家庭提供生育指导 ; 对无临床症状表现者, 通过基因检测, 可以了解自身致病基因携带情况, 及早干预 单基因遗传病基因检测的分析方法有全编码区测序分析 基因缺失 / 重复分析 基因突变分析 国内单基因遗传病基因检测技术主要有多重连接探针扩增技术 (MLPA) 和 Sanger 测序法等, 其特点是筛查谱窄, 通量低, 不能广泛开展 因此, 华大临床检验中心研发了目标区域捕获高通量测序分析技术, 可提供涉及人体多个系统的单基因遗传病的临床基因检测服务 服务内容 利用目标序列捕获与高通量测序技术对外周血基因组 DNA 中目的基因的目标区域 ( 所有外显子及剪切位点序列 ) 进行捕获测序和生物信息学分析, 获取目标区域的基因变异信息, 找到可疑致病突变, 为临床诊断和突变筛查提供参考依据 目前, 华大临床检验中心可提供一百多种在中国人群中高发的单基因遗传病的基因检测服务 检测疾病列表详见附录 技术原理 目标序列捕获高通量测序技术使用一套寡核苷酸探针来捕获基因组上的目标序列, 然后使用通用引物对这些捕获到的序列进行 PCR 扩增, 最后对这些扩增产物进行高通量测序生物信息分析, 找出致病基因的突变 TARGET EXON A TARGET EXON B 1 2 3 5 6 8 4 TARGET EXON C 10000 1000 100 10 1 7 0 10 20 30 40 50 60 图 1 目标序列捕获高通量测序技术流程 1 基因组 DNA 打断 ; 2 接头连接 ; 3 芯片杂交 ; 4 芯片淋洗 ; 5 目的片段洗脱 ; 6 PCR 扩增 ; 7 质控检测 ; 8 测序分析 1

技术优势 可同时检测点突变 小的插入缺失 (<20bp) 及大片段缺失 重复 更全面 检测区域涵盖了编码区的 95% 以上, 准确度达 99% 更精准 具有强大的生物信息分析能力, 可快速准确地鉴别致病突变 ; 构建了完善的疾病突变数据库和正常人遗传多态性数据库 更专业 适合多样本量同步检测 更经济 服务范围 临床基因检测 携带者筛查 科研合作 针对有临床表型的疑似患者, 通过基因检测协助诊断 针对有家族史 表型正常的人群 针对有科学或临床意义的样本展开科研合作 2

服务流程 遗传咨询 报告解读 图 2 服务流程 经典案例 假性进行性肌营养不良症假性进行性肌营养不良症是主要由遗传因素引起的肌肉变性疾病, 临床表现主要是进行性的肌肉萎缩无力, 最常见的类型为假肥大型, 其可分为杜氏 (DMD, OMIM 310200) 和贝氏 (BMD, OMIM 310376) 两型 BMD 也称良性假肥大型肌营养不良症, 常在 10 岁以后起病, 预后较好 DMD 也称严重性假肥大型肌营养不良症, 是由编码 Dystrophin 蛋白的 DMD 基因突变所致, 属 X 染色体隐性遗传, 几乎仅见于男孩 DMD 在我国活产男婴中的发病率约为 1/3,500, 其中 2/3 是由父母遗传 因此, 对 DMD 基因进行突变位点检测对于预防和诊断肌营养不良症都具有非常重要的意义 DMD 基因 (OMIM 300377) 位于 X 染色体 (Xp21.2), 基因全长 2.22 Mb, 包含 79 个外显子, 编码区长 11,334 bp, 编码的 Dystrophin 蛋白由 3,777 个氨基酸组成 该疾病的突变类型主要为缺失型 ( 约占 60%), 还有极少病例是由微重复所致, 目前临床上针对这一类型的突变, 主要使用 MLPA 进行检测, 检出率仅为 60% ~ 70% 其余为点突变或框移突变, 散发在整个 DMD 基因的编码区 DMD 基因检出缺失 重复 图 3 正常人 DMD 基因目标区域平均测序深度和覆盖度结果显示, 目标区域所有碱基全部覆盖,> 20 覆盖度达 99.99% 3

图 4 某一男性患者 DMD 基因目标区域平均测序深度和覆盖度 45-52 号外显子测序平均深度 中位数深度接近为 0, 其余外显子测序深度均正常,>20 覆盖度达 99.99%, 提示该病人 DMD 基因的 45-52 号外显子缺失 该结果已经 Real-time PCR 证实 图 5 某一女性患者 DMD 基因目标区域平均测序深度和覆盖度经过标化后, 该样本 45-52 号外显子测序平均深度 中位数深度都为正常女性 45-52 号外显子测序平均深度和中位数深度的一半, 其余外显子测序深度均正常,>20 覆盖度达 99.99%, 提示该病人为 DMD 基因 45-52 号外显子缺失携带者 该检测结果已经 Real-time PCR 证实 图 6 某一男性患者 DMD 基因目标区域平均测序深度和覆盖度经过标化后, 该样本 51-60 号外显子测序平均深度 中位数深度接近正常男性 51-60 号外显子测序深度的 2 倍, 其余外显子测序深度均正常,>20 覆盖度达 99.99%, 提示该病人 DMD 基因 51-60 号外显子重复 该检测结果已经 Real-time PCR 证实 4

DMD 基因检出点突变 DMD 基因 (NM_004006) 变异位点 变异名称 RS-ID dbsnp 频率 * Hapmap 频率 * 千人频率 * 本地频率 * p.asn2576asn rs1801188 0.038 0.219 0 0.884 p.arg1745his p.gln625ter rs1801187 0.176 0.622 0 0.662 novel - - 0 0 p.asp882gly rs228406 0.487 0.847 0 0.890 *dbsnp 频率 : dbsnp 数据库中收录的此 SNP 的频率信息 *Hapmap 频率 :Hapmap 数据库中收录的关于此 SNP 在亚裔人种中的频率信息 * 千人频率 : 千人计划中 93 个中国人测序样本中关于此 SNP 的频率信息 * 本地频率 : 本地收集的大于 600 个正常人测序样本中关于此 SNP 的频率信息 上表为某一 DMD 患者目标区域捕获测序后, 得到的所有 DMD 基因编码区变异位点, 包括 1 个同义突变,2 个错义突变和 1 个无义突变 其中同义突变不会导致氨基酸的改变, 不影响蛋白功能, 本地频率也显示该突变为多态性位点 2 个错义突变位点的 Hapmap 频率和本地频率均显示其为多态性位点 无义突变 p.gln625ter 在 100 个正常人的发生频率为 0, 排除其为多态性位点的可能 由于杜氏 / 贝氏肌营养不良症为 X 染色体隐性遗传, 而无义突变会导致氨基酸链编译发生提前终止, 影响其蛋白功能, 因此推断 DMD 基因上的无义突变 p.gln625ter 可能为致病突变 案例小结 由于 DMD 基因外显子长度和数目比较大, 使用 Sanger 测序存在耗时 费力且成本高 等缺点,MLPA 也只能检测出缺失和重复, 因此我们采用了目标区域捕获的高通量测序方法, 可以一步解决上述所有类型的突变, 包括缺失 重复和点突变 5

送检样本要求 自收到样本30-50个工作日出具报告 详情请咨询客服电话 6 BIR-MON-ROP-BRA4C-1-120518-单基因遗传病基因检测.indd 10 2012-8-17 18:13:58

华大已发表的文章 Yi Shi, Yingrui Li, Dingding Zhang, et al. Exome sequencing identifies ZNF644 mutations in high myopia. PLoS Genet; Published June 9, 2011. Junling Wang, Xu Yang, Kun Xia, et al. TGM6 identified as a novel causative gene of spinocerebellar ataxias using exome sequencing. Brain; Published November 23, 2010. Xiaoming Wei, Fan Jin, Yinghui Ye, et al. A novel mutation of IDS gene in a chinese patient with mucopolysaccharidosis by next-generation sequencing. Clinica Chimica Acta; Published November 20, 2011. Xiaoming Wei, Xiangchun Ju, Xin Yi, et al. Identification of sequence variants in genetic disease-causing genes using targeted next-generation sequencing. Plos One; Published December 21, 2011. 备注 : 本产品手册提及的单基因遗传病检测项目的检测结果不能作为疾病诊断的唯一依据, 建议临床医生结合受检者家族史 临床表现和其他辅助检查结果综合判断 7

附录 单基因遗传病检测基因列表 疾病系统 中文名称 英文名称 检测基因/位点 Joubert综合征 Joubert Syndrome and Related Disorders INPP5E,TMEM216,TMEM67,OFD1,NPHP1,CC2D2A,CEP 290,ARL13B,AHI1, RPGRIP1L Meckel综合征 Meckel syndrome CC2D2A,CEP290,RPGRIP1L,TMEM67 常染色体/X连锁隐性痉挛性截瘫 CYP7B1,SPG7,SPG11,ZFYVE26,SPG20,SPG21, L1CAM,PLP1,SLC16A2 常染色体显性痉挛性截瘫 ATL1,SPAST,NIPA1,KIAA0196,KIF5A,HSPD1,BSCL2, REEP1,ZFYVE27 小儿异染性脑白质营养不良 ARSA MECP2-Related Disorders(Classic 新生儿重症脑病 神经系统 Severe Neonatal Encephalopathy, PPM-X Syndrome) 幼婴癫痫性脑病 (1,2,3型) ARX,CDKL5,SLC25A22 遗传性共济失调性多发性神经炎 样病 Refsum综合征 PEX1,PEX2,PEX26 Arts综合征 Arts Syndrome PRPS1 Hereditary Motor and Sensory 胼胝体发育不全及周围神经病变 Neuropathy with Agenesis of the Corpus Callosum SLC12A6 Friedreich共济失调 FXN Friedreich Ataxia 共济失调伴选择性维生素E缺乏 症 TTPA 沙勒沃伊-萨格奈常染色体隐性遗 传痉挛性共济失调 SACS 神经元蜡样质脂褐质沉积症1型 Lipofuscinoses PPT1 HTT 亨廷顿舞蹈病 多系统 MECP2 结节性硬化病 Tuberous Sclerosis Complex TSC1,TSC2 马凡综合征 Marfan Syndrome FBN1 侏儒-面部毛细血管扩张综合征 布卢姆综合征 Bloom's Syndrome BLM 8 BIR-MON-ROP-BRA4C-1-120518-单基因遗传病基因检测.indd 12 2012-8-17 18:13:58

疾病系统中文名称英文名称检测基因 / 位点 Pallister-Hall 综合征 Pallister-Hall Syndrome GLI3 多系统 Wolfram 综合征 肌 - 眼 - 脑病 WFS1-Related Disorders (DFNA6/14/38 Nonsyndromic Low- Frequency Sensorineural Hearing Loss (WFS1-Related Low-Frequency Sensory Hearing Loss) Muscular dystrophydystroglycanopathy (congenital with brain and eye anomalies) WFS1 FKRP,POMGNT1 史蒂克勒氏综合征 COL11A1,COL11A2,COL2A1,COL9A1 舒 - 戴二氏综合征 Shwachman-Diamond Syndrome SBDS 耳鼻喉 非综合征型耳聋 ( 包括常染色体显性 常染色体隐性 X 连锁遗传 ) AD /AR /X-Linked Nonsyndromic Hearing Impairment ACTG1,CCDC50,CDH23,CLDN14,COCH,DFNB31,DFNA5, DFNB59,DIAPH1,ESPN,ESRRB,EYA4,GJB2,GJB3, GJB6,GRHL2,GRXCR1,HGF,KCNQ4,LHFPL5,LOXHD1, LRTOMT,MARVELD2,MIR96,MYH14,MYH9,MYO15A,MY O1A,MYO3A,MYO6,MYO7A,OTOA,OTOF,PCDH15,POU3F 4,POU4F3,PRPS1,RDX,SIX1,SLC17A8,SLC26A4,SLC26A 5,STRC,TECTA,TMC1,TMIE,TMPRSS3,TPRN,TRIOBP,USH1 C,WFS1,m.1555A>G,m.1494C>T 延森氏综合征 ;Mohr- Tranebjaerg 综合征 Neuronopathy Syndrome TIMM8A 1 2 3 4 7 Osteogenesis imperfecta, type 1,2,3,4,7 COL1A1,COL1A2,CRTAP 单纯性三角头畸形 Osteoglophonic dysplasia FGFR1 假性软骨发育不全 Pseudoachondroplasia COMP Jackson-Weiss 颅缝早闭综合征 Jackson-Weiss syndrome FGFR2 骨骼肌及结缔组织 先天性软骨发育不全 Achondroplasia FGFR3 遗传性家族性颅面骨发育不全 Crouzon syndrome FGFR2 Apert 综合征 Apert syndrome FGFR2 CLCN7-Related Osteopetrosis (including AD Osteopetrosis Type II 骨硬化症 渐冻人症 Related AR Osteopetrosis (ARO), Intermediate Autosomal Osteopetrosis (IAO) ) Amyotrophic Lateral Sclerosis CLCN7 SOD1,FUS,SETX,TARDBP,ANG,VAPB,FIG4,ALS2 9

疾病系统中文名称英文名称检测基因 / 位点 进行性假肥大型肌营养不良症 Dystrophinopathies(Becker Muscular Dystrophy (BMD), DMD- Associated Dilated Cardiomyopathy, Duchenne Muscular Dystrophy (DMD)) DMD 先天性肌强直 ; 先天性肌弛缓 Myotonia Congenita(AD,AR) CLCN1 多发性骨骺发育异常 (MED) SLC26A2,COMP, COL9A1, COL9A2, COL9A3, MATN3 Emery-Dreifuss 型肌营养不良 Emery-Dreifuss Muscular Dystrophy EMD,LMNA B Limb-Girdle Muscular Dystrophy (LGMD) Type 1B LMNA 2i 2j Limb-Girdle Muscular Dystrophy (LGMD) type 2i,2j TTN,FKRP 骨骼肌及结缔组织 Marshall 综合征 Marshall Syndrome COL11A1 多巴反应性肌张力障碍 ( 张力障碍 ) Dopa-Responsive Dystonia GCH1 脊髓性肌萎缩 Spinal Muscular Atrophy SMN1 腓骨肌萎缩症 Charcot-Marie-Tooth Neuropathy Type 1 LITAF,EGR2,NEFL,PMP22,MPZ,PRPS1 特雷彻 - 柯林斯综合征 Treacher Collins Syndrome 1 TCOF1 Weissenbacher-Zweymuller 综合征 Weissenbacher-Zweymuller Syndrome COL11A2 进行性肌阵挛性癫痫 Unverricht-Lundborg Disease CSTB 胫骨肌营养不良症 Udd Distal Myopathy (Tibial muscular dystrophy) TTN 新生儿致命的软骨发育不良 Schneckenbecken Dysplasia SLC35D1 泌尿生殖系统 Alport 综合征 ( 遗传性肾炎 ) 常染色体显性多囊性肾病 Collagen IV-Related Nephropathies (Alport Syndrome and Thin Basement Membrane Nephropathy) COL4A3,COL4A4,COL4A5 PKD1,PKD2 10

疾病系统中文名称英文名称检测基因 / 位点 常染色体隐性多囊性肾病 PKHD1 泌尿生殖系统 肾病型胱氨酸症 (including Nephropathic ) CTNS 巴特综合征 4A 型 BSND 局灶性节段性肾小球硬化症 (1,2,3,5 型 ) Focal Segmental Glomerulosclerosis Type 1,2,3,5 ACTN4,TRPC6,CD2AP,INF2 视网膜色素变性 ( 包括常染色体显性 常染色体隐性 /X 连锁 ) ABCA4,BEST1,CA4,CERKL,CNGA1,CNGB1,CRB1,CRX,EYS, FSCN2,IDH3B,IMPDH1,KLHL7,LRAT,MERTK,NR2E3,NRL, PDE6A,PDE6B,PRCD,PROM1,PRPF3,PRPF31,PRPF8,PRP H2,RGR,RHO,RLBP1,ROM1,RP1,RP2,RP9,RPE65,RPGR, SAG,SEMA4A,SNRNP200,TOPORS,TULP1,USH2A 尤塞氏综合征 (2A,1D,3,2C 型 ) Usher Syndrome Type 2A,1D,3,2C USH2A,CDH23,CLRN1,GPR98 Waardenburg 综合征 (4A,2A,1,2D,4C,4B 型 ) Waardenburg syndrome type 4A,2A,1,2D,4C,4B EDNRB,MITF,PAX3, SNAI2, SOX10, EDN3 视觉系统 眼白化病 (X 连锁,1 型 ) Ocular Albinism, X-Linked,Type 1 GPR143 年龄相关性黄斑变性 (2,10,11,4,7,9 型 ) ABCA4,TLR4,CST3,CFH,HTRA1,C3 先天性视网膜劈裂症 RS1 (including Norrie Disease (ND), 遗传性眼球萎缩病 Prematurity (ROP), Coats Disease, X- NDP 免疫系统 X 连锁重症联合免疫缺陷 X-Linked Severe Combined IL2RG 半乳糖血症 Galactosemia GALT 遗传性果糖不耐症 Hereditary Fructose Intolerance ALDOB 内分泌及代谢系统 先天性甲状腺功能减退症 (1,4,5 型 ) Congenital Hypothyroidism, Nongoitrous 1,4,5 TSHR,TSHB,NKX2-5 苯丙酮尿症 Phenylalanine Hydroxylase (Including PAH Hyperphenylalaninemia (HPA), Phenylketonuria (PKU), Variant PKU) 11

疾病系统中文名称英文名称检测基因 / 位点 先天性肾上腺皮质增生症 Adrenal Hyperplasia CYP21A2 枫糖尿病 ( 支链酮酸尿症 ) Maple Syrup Urine Disease BCKDHA,BCKDHB,DBT 肝豆状核变性 Wilson Disease ATP7B 瓜氨酸血症 Citrullinemia type I,type II ASS1,SLC25A13 精氨酸琥珀酸尿症 ASL Citrin 缺乏症 SLC25A13 精氨酸酶缺乏症 鸟氨酸转移酶缺乏症 ARG1 Hyperornithinemia- Hyperammonemia-Homocitrullinuria SLC25A15 Syndrome 氨甲酰磷酸合成酶缺乏症 Carbamoylphosphate synthetase I CPS1 内分泌及代谢系统 鸟氨酸氨基转移酶缺乏症 Ornithine Aminotransferase OAT 极长链酰基辅酶 A 脱氢酶缺乏症 Very Long-Chain Acyl-Coenzyme A ACADVL 短链酰基辅酶 A 脱氢酶缺乏症 Short-Chain Acyl-CoA Dehydrogenase ACADS 中链酰基辅酶 A 脱氢酶缺乏症 Medium-Chain Acyl-Coenzyme A ACADM 3- 羟酰辅酶 A 脱氢酶缺乏症 3-Hydroxyacyl-Coenzyme A HADH Long-chain 3-hydroxyacyl-CoA 长链 3- 羟烷基辅酶 A 脱氢酶缺乏症 HADHA 戊二酸血症 ⅡA,B,C 型 Glutaric acidemia IIA,B,C ETFA,ETFB,ETFDH 天冬氨酰葡萄糖胺尿症 Aspartylglycosaminuria AGA 原发性高草酸盐尿症 2 型 Primary Hyperoxaluria Type 2 GRHPR 高胱氨酸尿症 CBS,MTHFR 遗传性酪氨酸血症 1 型 Tyrosinemia Type 1 FAH 12

疾病系统中文名称英文名称检测基因 / 位点 戊二酸血症 I 型 Glutaric acidemia type I GCDH 异戊酸血症 Isovaleric acidemia IVD 法布瑞氏症 Fabry disease GLA 克拉伯病 Krabbe Disease GALC 尼曼 - 皮克病 (A,B,C 型 ) Niemann-Pick Disease, Type A,B,C NPC1,NPC2,SMPD1 糖原累积病 (3,12,13,1a,2,0,11,5,14,9 c,4 型 ) Glycogen storage disease,type 3,12,13,1a,2,0,11,5,14,9c,4 AGL,ALDOA,ENO3,G6PC,GAA,GYS1,LDHA,PYGM,PGM1, PHKG2,GBE1 新生儿永久性糖尿病 Diabetes mellitus, permanent neonatal GCK,KCNJ11,INS,ABCC8,PDX1 粘多糖贮积病 Ⅰ 型 Mucopolysaccharidosis Type I (Including Hurler Syndrome (MPS I H), Hurler-Scheie Syndrome (MPS I H/S), Scheie Syndrome (MPS I S) ) IDUA 内分泌及代谢系统 粘多糖贮积症 Ⅱ 型 Mucopolysaccharidosis type II IDS 羟类固醇脱氢酶缺陷症 STEROL C5-DESATURASE-LIKE SC5DL 3-methylcrotonyl-CoA carboxylase 3- 甲基巴豆酰辅酶 A 羧化酶缺乏症 MCCC1,MCCC2 丙二酰辅酶 A 脱羧酶缺乏症 Malonyl-CoA decarboxylase MLYCD 丙酸血症 Propionic Acidemia PCCA,PCCB 丙酮酸羧化酶缺乏症 丙酮酸脱氢酶复合物 E3 结合蛋白缺乏症 丙酮酸脱氢酶磷酸酶缺乏症 PYRUVATE DEHYDROGENASE COMPLEX, E3-BINDING PROTEIN SUBUNIT PYRUVATE DEHYDROGENASE PHOSPHATASE CATALYTIC SUBUNIT 1; PDP1 PC PDHX PDP1 丙酮酸脱羧酶缺乏症 PYRUVATE DEHYDROGENASE, ALPHA POLYPEPTIDE; PDHA1 PDHA1 长链酰基辅酶 A 脱氢酶缺陷症 ACYL-CoA DEHYDROGENASE, LONG- CHAIN; ACADL ACADL 甘氨酸脑病 Glycine encephalopathy GLDC,AMT,GCSH 13

疾病系统中文名称英文名称检测基因 / 位点 高脯氨酸血症 (1 型和 2 型 ) Hyperprolinemia type I and type II ALDH4A1,PRODH 高甲硫氨酸血症 MAT1A 凝血因子 Ⅴ 缺乏症 Factor V Leiden Thrombophilia F5 甲基丙二酸血症 Methylmalonic Acidemia MUT,MMAA,MMAB,MCEE,MMADHC 酪氨酸羟化酶缺乏症 TH 内分泌及代谢系统 酪氨酸血症 (1,2,3 型 ) Tyrosinemia Type 1,2,3 HPD,TAT,FAH 硫解酶缺乏症 ACAT1 肉毒碱棕榈酰转移酶缺乏症 CPT1A,CPT2 神经节苷脂贮积症 GM1 gangliosidosis,gm2- gangliosidosis, AB variant GLB1,GM2A 双氢嘧啶脱氢酶缺乏症 Dihydropyrimidine dehydrogenase DPYD 先天性糖蛋白糖基化缺陷 Ia 型 PMM2 组氨酸血症 HAL 营养不良型大疱性表皮松解 Dystrophic Epidermolysis Bullosa (Includes: Dominant Dystrophic Epidermolysis Bullosa; Recessive Dystrophic Epidermolysis Bullosa, Generalized Other; Recessive Dystrophic Epidermolysis Bullosa, Severe Generalized) COL7A1 交界型大疱性表皮松解症 ( 赫利茨型 ) (Herlitz) LAMA3,LAMB3,LAMC2 皮肤 毛发和指甲 先天性角化不全症 Dyskeratosis congenita, autosomal dominant /autosomal Recessive/Xlinked DKC1,NOP10,NHP2,TERT,TINF2,TERC 各型鱼鳞病 ( 寻常型除外 ) Congenital Ichthyosis ABCA12,STS,TGM1,ALOX12B,ALOXE3,KRT1,SLC27A4,KR T2,KRT10,NIPAL4,ST14,CYP4F22,ALDH3A2,MBTPS2 I,II keratosis palmoplantaris striatai,ii DSG1,DSP,KRT1 有汗型外胚层发育不良 GJB6 14

疾病系统中文名称英文名称检测基因 / 位点 皮肤 毛发和指甲 掌跖角化病 ( 掌跖硬化病 ) Palmoplantar keratoderma KRT1,KRT9,KRT16 多发性内分泌腺瘤病 (2 型 ) RET 神经纤维瘤病 NF1,NF2 遗传性肿瘤 遗传性多发性外生骨疣 ; 软骨肉瘤 (1 型 2 型 ) Osteochondromas Type I,Type II EXT1,EXT2 遗传性乳腺癌 BRCA1 and BRCA2 Hereditary Breast and Ovarian Cancer BRCA1,BRCA2 遗传性非息肉性结直肠癌 (Lynch 综合征 )(1,2,5,8 型 ) Colorectal cancer, hereditary nonpolyposis, (type 1,2,5,8) MLH1, MSH2, MSH6, PMS2 透克氏症 Turcot syndrome APC,MLH1, MSH2, MSH6, PMS2 黑斑息肉综合征 Peutz-Jeghers syndrome STK11 家族性腺瘤性息肉病 (Includes: Familial Adenomatous Polyposis, Gardner Syndrome, Turcot APC ) 消化系统 Gilbert 综合征 Gilbert syndrome UGT1A1 囊性纤维化 CFTR-Related Disorders(Includes: CFTR Absence of the Vas Deferens) Alagille 综合征 ( 先天性肝内胆管发育不良症 ) Alagille Syndrome JAG1,NOTCH2 进行性家族性肝内胆汁瘀积 cholestasis ATP8B1,ABCB11,ABCB4 心血管系统 QT 间期延长综合征 LONG QT SYNDROME 1 KCNQ1 扩张型心肌病 1A 型 Cardiomyopathy, dilated, 1A LMNA 范可尼贫血 Fanconi Anemia FANCA,FANCB,FANCC,BRCA2,FANCD2,FANCE,FANCG,FA NCI,BRIP1,FANCL,FANCM,PALB2,RAD51C,SLX4 血液淋巴系统 共济失调性毛细血管扩张症 Ataxia-Telangiectasia ATM Diamond-Blackfan 贫血 ( 先天性纯红细胞再生障碍性贫血 ) Diamond-Blackfan Anemia RPS26,RPS24,RPS17,RPL35A,RPL5,RPL11,RPS7,RPS10, RPS19 X 连锁铁粒幼细胞贫血 ; 红细胞生成性原卟啉症 ALAS2 15

疾病系统中文名称英文名称检测基因 / 位点 血液淋巴系统 备注 先天性纯巨核细胞再障血小板减少症 thromboc ytopenia (CAMT) MPL 血友病 Hemophili a A,B F8,F9 疾病检测技术 : 亨廷顿舞蹈病仅检测三核苷酸重复 ; 常染色体显性多囊肾检测 PKD1 基因 (8 10 13 15 17 19 22-29 31-40 45 46 外显子 ) 和 PKD2 全部编码区, 脊髓性肌萎缩检测技术包括 qpcr 检测 7 号外显子缺失和 Sanger 筛查点突变 ; 极长链酰基辅酶 A 脱氢酶缺乏症检测 ACADVL 基因除 2 号外显子的全部编码区, 血友病检测包括高通量测序技术检测 F8,F9 基因和长片段 PCR 检测 F8 基因 1 号内含子和 22 号内含子内的倒位 ; Gilbert 综合征和先天性肾上腺皮质增生症采用 Sanger 测序 16

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