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声 明 本 公 司 全 体 董 事 监 事 高 级 管 理 人 员 承 诺 股 票 发 行 方 案 不 存 在 虚 假 记 载 误 导 性 陈 述 或 重 大 遗 漏, 并 对 其 真 实 性 准 确 性 和 完 整 性 承 担 个 别 和 连 带 的 法 律 责 任 根 据 证 券 法 的 规 定

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Sequencing,NGS), 为 目 前 应 用 最 广 泛 的 测 序 技 术, 相 比 第 一 代 测 序 技 术 具 有 高 通 量 低 成 本 的 特 征 二 基 本 情 况 概 述 1 基 本 情 况 上 海 序 康 医 疗 科 技 有 限 公 司 ( 以 下 简 称 序 康 医 疗

中 国 近 现 代 史 纲 要 重 要 会 议 ( 一 ) 党 的 创 建 时 期 1. 一 大 ( , 上 海 ), 中 国 共 产 党 成 立 (1) 内 容 :1 确 定 党 的 名 称 为 中 国 共 产 党 2 通 过 了 中 国 共 产 党 第 一 个 党 纲 : 以 无

发 展 为 目 标, 以 发 挥 事 务 所 党 组 织 战 斗 堡 垒 作 用 和 党 员 先 锋 模 范 作 用 为 重 点, 以 党 务 工 作 者 队 伍 建 设 为 支 撑, 以 制 度 机 制 建 设 为 保 障, 不 断 创 新 理 念 措 施 和 载 体, 在 新 的 起 点 上 全

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就 是 要 步 步 深 入 环 环 相 扣, 以 严 肃 的 态 度 严 抓 的 韧 劲, 把 全 面 从 严 治 党 的 良 好 态 势 巩 固 发 展 下 去, 做 到 真 管 真 严 长 管 长 严 开 展 两 学 一 做 学 习 教 育, 是 推 进 思 想 政 治 建 设 常 态 化 制

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标题

目 錄 壹 緒 論... 2 貳 明 時 代 背 景 一 明 代 禮 教 之 於 女 性? 母 德 婦 德... 2 二 明 代 婦 女 之 於 士 人? 經 濟 支 柱... 4 參 歸 有 光 一 仕 途... 7 二 家 庭... 7 肆 歸 有 光 文 學 裡 的 女 性 比 較 一 < 項

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院系▲

前 言 由 于 高 校 毕 业 生 就 业 问 题 的 重 要 性 和 近 年 来 大 学 生 就 业 的 严 峻 形 势, 毕 业 生 就 业 状 况 受 到 政 府 高 校 和 学 生 乃 至 全 社 会 的 高 度 关 注 大 学 生 就 业 质 量 报 告 是 监 测 和 反 馈 大 学 生

前 言 随 着 中 国 高 等 教 育 数 量 扩 张 目 标 的 逐 步 实 现, 提 高 教 育 质 量 的 重 要 性 日 益 凸 显 发 布 高 校 毕 业 生 就 业 质 量 年 度 报 告, 是 高 等 学 校 建 立 健 全 就 业 状 况 反 馈 机 制 引 导 高 校 优 化 招

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% % ,542 12,336 14,53 16,165 18,934 22,698 25, ,557 7,48 8,877 11, 13,732 17,283 22,

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1. 本文首段的主要作用是 A. 指出 異蛇 的藥用功效 說明 永之人爭奔走焉 的原因 B. 突出 異蛇 的毒性 為下文 幾死者數矣 作鋪墊 C. 交代以蛇賦稅的背景 引起下文蔣氏有關捕蛇的敘述 2. 本文首段從三方面突出蛇的 異 下列哪一項不屬其中之一 A. 顏色之異 B. 動作之異 C. 毒性之

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項 訴 求 在 考 慮 到 整 體 的 財 政 承 擔 以 及 資 源 分 配 的 公 平 性 下, 政 府 採 取 了 較 簡 單 直 接 的 一 次 性 減 稅 和 增 加 免 稅 額 方 式, 以 回 應 中 產 家 庭 的 不 同 訴 求 ( 三 ) 取 消 外 傭 徵 費 6. 行 政 長

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Supplemental information Exome sequencing identifies truncating mutations in the PRRT2 gene that cause paroxysmal kinesigenic dyskinesia Wan-Jin Chen

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Transcription:

新 生 儿 多 发 畸 形 分 子 诊 断 复 旦 大 学 儿 科 医 院 新 生 儿 科 周 文 浩 3-30-2013

Genetic and Genomic Medicine (Personalized Medicine) Disease 新 生 儿 天 时, 地 利, 人 和 Pre-symptomatic( 症 状 前 ) Preventive( 预 防 ) Predictive( 预 测 ) Birth Prenatal and Pre-implantation } genetic liability environmental factors

新 生 儿 常 见 综 合 征

背 景 先 天 畸 形 (Congenital abnormality,ca) NICU: 美 国,~2 万 新 生 儿 死 亡 / 年, 其 中 CA 30% 中 国 :2005,15 个 地 区 数 据, 发 生 率 10.631 美 国 : 新 生 儿 中 所 占 比 例 ~3%; 欧 洲 :2~4% March of Dimes: 我 国 出 生 缺 陷 发 生 率 51.2 (2006) 诊 断 方 法 : 既 往 根 据 特 征 性 临 床 表 现 诊 断 特 定 的 综 合 征 遗 传 学 检 测 技 术 发 展 : 染 色 体 G 带 技 术 明 确 许 多 MCA 的 染 色 体 数 目 和 结 构 异 常, 但 其 诊 断 率 仍 小 于 5% 苏 秀 娟. 中 国 公 关 卫 生.2008;24(12):1535-1536. Dolk H. Circulation,2011,123(8):841-849. Bernier P L. Semin Thorac Cardiovasc Surg Pediatr Card Surg Annu,2010,13(1):26-34.

基 因 诊 断 - 未 来 的 趋 势 遗 传 基 础 细 胞 => 核 => 染 色 体 => gene 基 因 组 (Genome) = 整 个 chromosomes/genes 基 因 结 构 : coding, promoter 突 变 :rare variant <1% 影 响 基 因 功 能

NICUs 尤 其 适 合 开 展 WGS 新 生 儿 期 3500 余 种 单 基 因 病 可 以 发 病

Number of Entries in OMIM (Updated 28032013) Prefix Autosomal X Linked Y Linked Mitochondrial Totals * Gene description 13,458 655 48 35 14,196 + Gene and phenotype, combined 124 4 0 2 130 # Phenotype description, molecular basis known 3,434 272 4 28 3,738 % Phenotype description or locus, molecular basis unknown 1,627 133 5 0 1,765 Other, mainly phenotypes with suspected mendelian basis 1,757 124 2 0 1,883 Totals 20,400 1,188 59 65 21,712

遗 传 相 关 疾 病 分 子 检 测 技 术 染 色 体 病 数 量 和 / 或 结 构 异 常 拷 贝 数 变 异 (Copy number variations,cnvs) CNVs 广 泛 存 在 于 人 类 基 因 组 采 用 多 重 探 针 扩 增 技 术 MLPA 核 型 分 析 FISH MLPA acgh 单 基 因 病 一 对 等 位 基 因 控 制 而 发 生 孟 德 尔 规 律, 称 孟 德 尔 遗 传 病 多 基 因 病 表 型 由 多 个 基 因 协 同 决 定 数 量 性 状 遗 传 多 因 子 遗 传 Sanger 测 序 二 代 测 序

染 色 体 - 基 因 - 全 基 因 组 检 测 遗 传 变 异 Microarrays 平 台 技 术 Agilent CGH 芯 片 工 作 站

拷 贝 数 变 异 ( CNVs) 检 查 染 色 体 技 术 分 辨 率 基 因 组 覆 盖 核 型 分 析 荧 光 原 位 杂 交 (FISH) Metaphase) Whole or gross regions > 5 10 Mb N/A Whole genome Probe specific 染 色 体 涂 布 (M-FISH/SKY ) 比 较 基 因 组 杂 交 芯 片 (acgh) >2 Mb Whole genome 35 to 6 Kb - <??? Whole genome

微 阵 列 芯 片 技 术 能 发 现 约 20% 发 育 障 碍 或 孤 独 症 遗 传 学 变 异, 比 核 型 分 析 检 测 结 果 显 著 高 出 5%

染 色 体 微 阵 列 芯 片 分 析 (CMA) 和 新 一 代 测 序 分 析 (NGS) 染 色 体 微 阵 列 芯 片 分 析 / DNA 核 型 分 析 (CMA) 用 于 检 测 微 缺 失 和 微 扩 增 综 合 征 用 于 检 测 染 色 体 重 排 和 异 常 用 于 检 测 先 天 性 畸 形 和 出 生 缺 陷 新 一 代 高 通 量 测 序 分 析 (NGS) 用 于 检 测 目 标 基 因 和 目 标 区 域 (ASD/ID/DD Panel) 用 于 检 测 临 床 相 关 的 外 显 子 (Clinical Exome) 用 于 整 个 外 显 子 组 研 究 用 于 整 个 基 因 组 研 究

染 色 体 微 阵 列 芯 片 分 析 和 新 一 代 测 序 的 技 术 平 台

复 旦 儿 科 转 化 中 心 200m 2 in area

QIAcube 全 自 动 DNA 抽 提 仪 ABI 3100 Sequencing QIA xtractor 全 自 动 高 通 量 DNA 抽 提 仪 15 ABI 3500XLSequencing

AB Step ONEPlus 定 量 PCR 仪 2 台 双 384 孔 ABI 9700 PCR 仪 AB Veriti 96 孔 PCR 仪 2 台 96 孔 ABI 9700 PCR 仪 2 台 Bio-Rad C1000 PCR 仪 16 QIA xcel DNA 凝 胶 电 泳 分 离 仪

新 生 儿 样 本 库 截 止 至 2013/1/30, 共 入 库 样 本 779 例

出 生 缺 陷 分 子 诊 断 基 本 思 路 常 见 综 合 征 : 疑 似 诊 断, 实 验 室 验 证 ( 细 胞 - 分 子 ) 染 色 体 病 微 缺 失 / 重 复 单 基 因 病 新 生 儿 IEM 的 筛 查 与 诊 断 ( 质 谱 -Sanger) 常 见 表 型 : 发 现 诊 断 (acgh + DNA panel) 神 经 肌 肉 心 血 管 系 统 消 化 系 统 颌 面 头 颅 畸 形 皮 肤

多 发 畸 形 的 检 测 流 程

拷 贝 数 变 异 检 测 方 法 - MLPA 多 重 探 针 扩 增 技 术 (multiplex ligationdependent probe amplification, MLPA) 一 次 针 对 40 个 序 列 高 分 辨 率 高 灵 敏 度

MLPA 筛 查 自 行 设 计 的 多 发 畸 形 MLPA 筛 查 试 剂 盒, 包 含 临 床 常 见 的 多 发 畸 形 综 合 征 Target genes Cytoband Associated diseases GABRD, SKI, TP73 1p36.3 1p36 deletion syndrome CTNND2, TERT 5p15.2 cri du chat CLIP2, ELN, LIMK1 7q11.23 Williams-Beuren syndrome (WBS) RAI1, MFAP4 17p11 Smith-Magenis TBX1, ZNF74, SNAP29 22q11.21 DiGeorge Syndrome 1 (DGS1/VCFS) OCA2, UBE3A, GABRB3 15q11q13 Prader-Willi syndrome (PWS) NSD1 5q35.3 Sotos KCNJ6-1, DYRK1A, RCAN1 21q Down EDNRB, CENPJ, ERCC5, FREM2 13q trisomy 13 MC2R 18p trisomy 18 DTNA, TCF4 18q trisomy 18

MLPA 筛 查 59 例 新 生 儿 多 发 畸 形 病 例 共 发 现 阳 性 病 例 13 例 阳 性 率 22.03% 21 三 体 7 例 5p15 缺 失 2 例 22q11 重 复 1 例 缺 失 1 例 5q35 缺 失 1 例 15q11-q13 缺 失 1 例 申 请 专 利 号 :201110288927.6

CHFU 已 经 开 展 的 项 目 Prader-Willi/Angelman 综 合 征 (PWS/AS) Beckwith-Wiedemann 综 合 征 (BWS) DiGeorge 综 合 征 Williams 综 合 征 假 肥 大 性 肌 营 养 不 良 (DMD) 脊 髓 性 肌 肉 萎 缩 症 (SMA) 常 见 多 发 畸 形 筛 查 Trisomy 21 Trisomy 18 Trisomy 13 DiGeorge Prader willi Sotos 1p36 Williams Smith Magenis 92838 邢 丽 之 子 BWS + 94913 秦 刘 BWS - 103067 高 梓 豪 DiGeorge + 85381 韩 久 熠 PWS + 85838 林 丽 玉 之 子 PWS + 88579 胡 元 张 新 PWS + 95156 罗 依 PWS + 103905 李 泽 淇 PWS + 75889 王 以 蓝 PWS - 85644 雷 晓 敏 之 子 PWS - 87421 刘 云 之 子 PWS - 82798 朱 怡 亭 SMA + 85117 华 奕 晨 SMA + 105230 王 立 华 之 子 106821 丁 智 思 多 发 畸 形 筛 查 多 发 畸 形 筛 查 - +

基 因 组 拷 贝 数 变 异 分 析 syn CHD 31 例 综 合 征 型 先 天 性 心 脏 病 全 基 因 组 拷 贝 数 变 异 分 析 CNVs 467 (dup>150 kb,del>50 kb) 不 包 含 基 因 的 区 段 128 个 ; 假 阳 性 和 X,Y 染 色 体 CNVs54 个 进 入 人 工 分 析 的 CNVs 285 正 常 人 拷 贝 数 变 异 220 个 (DGV) 罕 见 CNVs 65 (18/31 例 ) 大 小 从 50Kb-~77.9Mb 重 复 48 个, 缺 失 17 个

基 因 组 拷 贝 数 变 异 分 析 syn CHD File CN State Type Chromosom e Min Max Size (kbp) Cytoband Start Cytoband End 34 1 Loss 1 245741133 249212628 3471.495 q44 q44 126 3 Gain 2 178368487 179210709 842.222 q31.2 q31.2 360 3 Gain 5 33931982 34403401 471.419 p13.2 p13.2 129 3 Gain 5 34489 1973126 1938.637 p15.33 p15.33 4 3 Gain 7 46845 679025 632.18 p22.3 p22.3 34 3 Gain 7 114325311 159118443 44793.132 q31.1 q36.3 213 3 Gain 10 16850794 17017337 166.543 p13 p13 42 1 Loss 16 18538083 18654410 116.327 p12.3 p12.3 67 3 Gain 17 12007508 12282546 275.038 p12 p12 已 知 综 合 征 表 型 - 基 因 型 比 较 对 比 DECIPHER 和 CHD-Wiki 数 据 库 表 型 - 基 因 型 比 较 临 床 意 义 不 明 功 能 验 证 67 3 Gain 17 11092445 11444646 352.201 p12 p12 126 3 Gain 18 7076088 7576365 500.277 p11.31 p11.23

8 号 染 色 体 短 臂 复 杂 重 组 2 例 病 例 1: 腭 裂 ; 单 心 室 二 尖 瓣 闭 锁 大 动 脉 转 位 肺 动 脉 狭 窄 及 房 缺 CNVs:8p23.3-8p23.1 缺 失 和 8p23.1-8p11.1 重 复 病 例 2: 小 下 颌 ; 永 存 左 上 腔 静 脉, 右 肺 动 脉 起 始 部 狭 窄, 卵 圆 孔 未 闭 ; 右 足 外 翻 CNVs:8p23.3-8p23.1 缺 失 和 8p23.1-8p11.2 重 复 与 DECIPHER 数 据 库 ISCA 数 据 库 比 对 : 具 有 与 区 段 1 缺 失 大 小 相 同 且 有 表 型 信 息 的 病 例 30 例, 其 中 3 例 均 具 有 心 脏 表 型 具 有 与 区 段 2 缺 失 大 小 相 同 且 有 表 型 信 息 的 病 例 22 例, 其 中 16 例 有 心 脏 表 型 重 合 区 段 为 位 于 8p23.1 上 748Kb 大 小, 包 含 基 因 MTMR9 FAM167A BLK 及 XKR6

5p15.3 microdeletion syndrome G2P1 G37 +1 BW 1875g 特 殊 面 容 : 右 侧 低 位 耳, 耳 前 坠 生 物, 左 右 鼻 唇 沟 不 对 称, 面 颊 横 裂, 小 下 颌 颅 顶 部 颅 骨 缺 损 ; 隐 睾 ; 头 颅 CT 示 脑 沟 回 浅, 双 侧 乳 突 积 液

5P 探 针 46,XY,r(5)(p15.2q35)[88]/45,XY,-5[5]/47,XY,r(5),+r(5)[3]/46,XY,dic 复 旦 大 学 附 属 儿 科 医 院 r(5;5)[3]/ 46,XY,r(5)(p15.2q31)[1]

NICUs 尤 其 适 合 开 展 WGS 新 生 儿 期 3500 余 种 单 基 因 病 可 以 发 病

检 测 方 法 -Sanger 测 序

1.Congenital Adrenal Hyperplasia 21-hydroxylase deficiency (21-OHD) is the most common cause Autosomal recessive disorders Clinical Diagnosis Females : Virilization affects maturation, growth (leading to tall stature), and sex hormone-sensitive areas (external genitalia, skin, and hair) Males with virilization in childhood (i.e., pseudoprecocious puberty) Any infant with a salt-losing crisis in the first four weeks of life Testing 17-hydroxyprogesterone (17-OHP) Classic 21-OHD CAH. >20,000 ng/dl Non-classic 21-OHD CAH. 2,000 to 15,000 ng/dl Plasma renin. Plasma renin activity (PRA): ACTH stimulation test Electrolytes http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/nbk1171/

Congenital Adrenal Hyperplasia http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/nbk1171/

http://www.hgmd.org/

Congenital Adrenal Hyperplasia 编 号 住 院 号 姓 名 年 龄 临 床 诊 断 检 测 项 目 12F690 100987 冯 歆 一 6 天 CAH CYP21A2 12F778 101719 舒 艳 艳 之 子 17 天 CAH CYP21A2 12F1058 107856 王 坤 琪 16 天 CAH CYP21A2 12F778 Exon 变 异 SNP 号 Exon7 c.833dupt,p.l278ffsx5 杂 合 Exon4 c.518t>a,p.i173n 杂 合 rs6475 Exon1 c.29_31deltgc,p.l10p 杂 合 rs28381641 Exon2-intron c.289+9c>t 杂 合 rs6462 Exon7 c.806g>c,p.s269t 杂 合 rs6472 Exon10 c.1473g>a,p.p491p 杂 合 rs6446 Exon10 c.1481g>a,p.s494n 杂 合 rs6473 c.833dupt,p.l278ffsx5: 终 止 杂 合 突 变, 导 致 蛋 白 短 截 为 严 重 突 变 c.518t>a,p.i173n 杂 合 突 变 已 知 CAH 的 严 重 致 病 突 变 已 经 报 道 与 CAH 有 关 的 位 点 c.806g>c,p.s269t c.1481g>a,p.s494n

2.UGT1A1 与 新 生 儿 黄 疸

3. 最 新 开 发 的 新 生 儿 相 关 检 测 项 目 疾 病 性 质 基 因 外 显 子 数 GCK 10 新 生 儿 高 胰 岛 素 血 症 AR 多 见 KCNJ11 1 ABCC8 39 INS 3 X-LINK OTC 10 AR ASL 16 先 天 性 高 氨 血 症 AR ASS1 16 AR NAGS 7 AR CPS1 40 AR ARG1 8 色 素 失 禁 症 XD NEMO 10

Sanger 测 序 NGS : 一 次 对 几 十 万 到 几 百 万 条 DNA 分 子 进 行 测 序 二 代 测 序 Ion Torrent 平 台

新 一 代 测 序 技 术 用 于 NICU 的 研 究 目 标 捕 获 靶 基 因 : 捕 获, 富 集, 多 重 标 签, 新 一 代 测 序, 数 据 分 析

NGS 数 据 产 生 和 分 析 流 程 由 测 序 中 心 产 生 海 量 的 数 据 采 用 NextGENe, GenomeQuest, DNANexus 等 软 件 联 合 进 行 数 据 分 析 Image modified from DNANexus Website

NICUs 尤 其 合 适 开 展 WGS 在 生 后 28 内,3528 种 单 基 因 病 可 以 发 病 在 美 国,>20% 婴 儿 死 亡 由 CA 所 致 DNA 诊 断 项 目 有 限, 认 识 不 足, 近 20 年 突 破 甚 少 新 生 儿 筛 查 项 目 限 于 代 谢 为 主 早 期 的 发 现 有 助 于 早 期 干 预

WGS 在 NICU 应 用 的 实 践 Male, 33 weeks, Family history - Cultures and herpesvirus PCR - Sci Transl Med 4, 154ra135 (2012)

CMH064 CMH064 The phenotype of baby was atypical for KIDS, de novo GJB2 mutations Severe neonatal lethal disorders of the skin, keratitis-ichthyosisdeafness syndrome ( 角 膜 炎, 鱼 鳞 病 耳 聋 综 合 征, KIDS,OMIM number 148210) Sci Transl Med 4, 154ra135 (2012)

二 代 测 序 Ion Torrent 平 台 的 建 立 CH Boston CH Fudan

Ion Torrent 平 台 结 果 验 证 ( 一 代 测 序 ) AMACR CYP7B1 CYP27A1 HSD3B7 JAG1 AGL LIPA MUT c.25g>ga rs3195676 c.524g>ga rs10941112 c.829g>ga rs2278008 c.602t>tc rs2287939 c.635t>ta normal c.45_46het_delag c.262g>gc c.585a>g rs9938550 c.440-15t>t/c rs1131695(c.765c>c/t,p.y255y) c.2026t>t/g c.2917-32dupa rs1051419(c.3417t>c,p.y1139y) rs1051421(c.3528c>c/t,p.y1176y) c.3343 G>G/A(rs2230307) c.46a>c(rs1051338) c.796g>a c.729-730instt rs8589 Mutation call 93.75% (15/16)

复 旦 儿 科 转 化 中 心 项 目 性 发 育 异 常 (SRY 基 因 ) 先 天 性 肾 上 腺 皮 质 增 生 症 (21 羟 化 酶 基 因 ) X 连 锁 慢 性 肉 芽 肿 病 (CYBB 基 因 ) X 连 锁 无 丙 种 球 蛋 白 血 症 (BTK 基 因 ) 先 天 性 胸 腺 发 育 不 全 综 合 征 (DiGeorge) 遗 传 性 耳 聋 (GJB2 基 因 ) 遗 传 性 耳 聋 (SLC26A4 基 因 ) 遗 传 性 耳 聋 ( 氨 基 糖 甙 类 耳 毒 性 12srRNA 基 因 ) 遗 传 性 肝 内 胆 汁 淤 积 征 (ABCB4 基 因 ) 遗 传 性 肝 内 胆 汁 淤 积 征 (ABCB11 基 因 ) 家 族 性 肝 内 胆 汁 淤 积 PFIC1 型 (ATP8B1 基 因 ) 先 天 性 胆 汁 酸 合 成 障 碍 1 型 (HSD3B7 基 因 ) 先 天 性 胆 汁 酸 合 成 障 碍 2 型 (AKR1D1 基 因 ) 先 天 性 胆 汁 酸 合 成 障 碍 3 型 (CYP7B1 基 因 ) 先 天 性 胆 汁 酸 合 成 障 碍 4 型 (AMACR 基 因 ) 固 醇 27 羟 化 酶 缺 陷 ( 轻 度 胆 汁 淤 积 )(CYP27A1) Alagille 综 合 征 (JAG1 基 因 ) Citrin 缺 陷 病 (SLC25A13 基 因 ) 非 结 合 胆 红 素 血 症 (UGT1A1 基 因 ) 肝 豆 状 核 变 性 (ATP7B 基 因 ) 糖 原 累 积 症 1a 型 (G6PC1 基 因 ) 糖 原 累 积 症 1b 型 (SLC37A4 基 因 ) 糖 原 累 积 症 II 型 (GAA 基 因 ) 糖 原 累 积 症 III 型 (AGL 基 因 ) 糖 原 累 积 症 IV 型 (GBE1 基 因 ) 甲 基 丙 二 酸 血 症 合 并 高 胱 胺 酸 尿 症 (MMACHC) 甲 基 丙 二 酸 血 症 (MUT 基 因 ) 酪 氨 酸 血 症 1 型 (FAH 基 因 ) 丙 酸 血 症 (PCCA PCCB 基 因 ) 高 乳 糜 微 粒 血 症 (LPL 基 因 ) α1 抗 胰 蛋 白 酶 缺 乏 症 (AAT 基 因 ) 囊 性 纤 维 化 (CFTR 基 因 ) 尼 曼 皮 克 氏 病 A/B 型 (SMPD1 基 因 ) 尼 曼 皮 克 氏 病 C 型 (NPC1 NPC2 基 因 ) 肾 病 综 合 征 激 素 抵 抗 相 关 基 因 假 肥 大 性 肌 营 养 不 良 (DMD) 脊 髓 性 肌 肉 萎 缩 症 (SMA) 婴 儿 痉 挛 (Rett 综 合 征 )(CDKL5 基 因 ) Rett 综 合 征 (MECP2 基 因 ) 婴 儿 痉 挛 / 癫 痫 (ARX 基 因 ) 结 节 性 硬 化 (TSC1 TSC2 基 因 ) 神 经 纤 维 瘤 病 (NF1 NF2 基 因 ) 神 经 精 神 发 育 障 碍 相 关 基 因 筛 查 (NRXN1 CDKL5 PTEN MECP2 SHANK3) 孤 独 症 / 错 构 瘤 (PTEN 基 因 ) 孤 独 症 谱 系 障 碍 (NRXN 基 因 ) 神 经 纤 维 瘤 1 型 样 综 合 征 (SPRED1) 视 网 膜 母 细 胞 瘤 基 因 (RB1 基 因 ) 中 性 粒 细 胞 减 少 症 (HAX1 基 因 ) 范 可 尼 贫 血 (FANCA FANCC FANCG 基 因 ) Prader-Willi/Angelman 综 合 征 (PWS/AS) Beckwith-Wiedemann 综 合 征 (BWS) Williams 综 合 征 Wolman Disease(LIPA 基 因 ) 常 见 多 发 畸 形 筛 查 (10 种 遗 传 综 合 征 )

二 代 测 序 平 台 panel 设 计 (EA/TEF) OMIM Gene Tests Review Literatures Our data - CNV MGI ZFIN CHD7 NM_017780.3 SOX2 NM_003106.3 MYCN NM_005378.4 RFX6 NM_173560.3 HOXD13 NM_000523.3 SEMA3E NM_012431 ZIC3 NM_003413.3 ITGA6 NM_001079818 ITGB4 NM_000213 RMRP ENST00000363046(misc_RNA) OMIM FGFR2 NM_000141 PTEN NM_000314.4 CHX10, VSX2 NM_182894.2 FGFR3 NM_000142 GLI, GLI1 NM_005369 CTNND2 NM_001332.2 SLC17A5 NM_012434.4 FANCA NM_000135 RECQL4 NM_004260.3 COL3A1 NM_000090.3 FBN2 NM_001999.3 SALL1 NM_002968 GLI3 NM_000168.5 Gene Review DST NM_001723 MID1 NM_000381 FANCB NM_152633 CHRD NM_003741 NOG NM_005450.4 CTNNB1 NM_001904 DYNC2H1 NM_001377 EFNB2 NM_004093.3 FOXP4 NM_001012426 FUZ NM_025129 GLI2 NM_005270 GLI3 NM_000168.5 MGI pheno MEOX2 NM_005924.4 PCSK5 NM_001190482 NKX2-1 NM_001079668 RARA NM_000964 RARB NM_000965 SHH NM_000193.2 SOX2 NM_003106.3 SOX4 NM_003107.2 IFT172 NM_015662.1 RAB25 NM_020387.2 RIPK4 NM_020639.2 MTRNR2L6 NM_001190487 Region-7q34 PRSS1 NM_002769 PRSS2 NM_002770 TRY6 non-coding RNA 17q21.33 COL1A1 NM_000088 22q11 WNT7B NM_058238 FBLN1 NM_001996

总 结 Ion Torrent PGM + panel 快 速 高 通 量 降 低 数 据 分 析 难 度 MLPA + acgh 作 为 染 色 体 的 微 缺 失 / 微 重 复 的 检 测 方 法 通 过 上 述 方 法 技 术 的 建 立 single gene /region - whole genome 适 合 自 身 特 点 及 发 展 方 向 的 遗 传 相 关 疾 病 筛 查 检 测 诊 断 体 系

NICU, Ion Torrent 测 序 被 用 来 研 究 一 个 假 定 的 多 药 耐 药 大 肠 杆 菌 爆 发 四 个 疑 似 爆 发 菌 株 测 序, 超 广 谱 β- 内 酰 胺 酶 的 bla(ctx-m-15) J Clin Microbiol. 2013.