了解代谢组学安捷伦作为全球领先的代谢组学供应商, 始终致力于为客户提供各种尖端质谱仪器与相关信息学解决方案什么是代谢组学? 代谢组学是一门研究特定时间点所有内源性代谢物的学科, 可用于揭示细胞组织或器官的一般性生理状态生物系统中的低分子量 ( Da) 代谢物集合称为代谢组代谢

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殊尹
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1 安捷伦代谢组学解决方案您的成功之路

2 了解代谢组学安捷伦作为全球领先的代谢组学供应商, 始终致力于为客户提供各种尖端质谱仪器与相关信息学解决方案什么是代谢组学? 代谢组学是一门研究特定时间点所有内源性代谢物的学科, 可用于揭示细胞组织或器官的一般性生理状态生物系统中的低分子量 ( Da) 代谢物集合称为代谢组代谢组与生物体表型的密切联系可为基因组学和蛋白质组学提供补充信息, 有助于更加全面地了解生物系统代谢物是多种不同生物过程中的重要调节因子底物副产物以及结构单元因此, 细胞细胞培养基或生物体液中特定代谢物的存在与否能够反映生物系统的生理和功能状态方面的重要信息例如, 特定代谢物的积聚可能标志着某一生物学通路中的信号响应缺陷, 也或许是某一生物合成通路的优化安捷伦的创新型代谢组学解决方案可以为客户提供种类丰富功能强大的仪器软件和信息学工具通用软件平台能够将多种分析技术获得的结果相结合, 从而帮助您更迅速地解决充满挑战的生物学难题安捷伦与杰出的代谢组学研究人员合作开发新一代生物分析检测技术和工作流程, 用于新型代谢物和代谢物标记的发现和鉴定这些努力使产品得到了改进并最终使客户受益 2

3 适用于各种研究应用的代谢组学工具功能强大的生物学研究手段基础与临床研究对与疾病相关的代谢生物标记物进行鉴定与验证, 同时可有助于对生物学的基本了解农业确定并了解代谢途径以优化农作物开发, 提高产量及杀虫剂 / 除草剂抗性食品与营养鉴定与食品质量真伪风味和营养价值等主要特性相关的代谢物是否存在, 并辅助保健品的开发制药鉴定药物研发中的代谢物与毒性标记物环境鉴定与影响生物系统的化学物质和环境中其他刺激因子相关的代谢物生物燃料与合成生物学鉴定代谢物图谱以优化发酵过程和生物燃料生产毒理学寻找血浆和尿液中可作为药物和环境污染物接触水平替代评估指标的毒性预测性标记安捷伦质谱系统兼具鉴定与定量各种细胞代谢物所需的高采集速率和宽动态范围我们能够同时实现大海捞针般的高灵敏度与测量大海的宽覆盖范围 AMY A. CAUDY 博士唐纳利细胞和生物医学研究中心多伦多大学 3

发挥发现代谢组学的威力安捷伦行业领先的代谢组学硬件与软件产品组合结合安捷伦举世闻名的技术支持, 能够帮助您快速可靠地获取并分析数据发现代谢组学发现或非靶向代谢组学实验通常包括利用质谱联用技术的代谢物全局分析化合物分离与检测之后, 后续峰查找步骤可由安捷伦 MassHunter 软件完成随后将发现标注并鉴定出两种或两种以上样品组间丰度的统计学显著性差异 Pathway Architect

4 发挥发现代谢组学的威力安捷伦行业领先的代谢组学硬件与软件产品组合结合安捷伦举世闻名的技术支持, 能够帮助您快速可靠地获取并分析数据发现代谢组学发现或非靶向代谢组学实验通常包括利用质谱联用技术的代谢物全局分析化合物分离与检测之后, 后续峰查找步骤可由安捷伦 MassHunter 软件完成随后将发现标注并鉴定出两种或两种以上样品组间丰度的统计学显著性差异 Pathway Architect 软件中的通路分析可帮助研究人员将一系列代谢物映射到生物通路中数据采集特征发现比对与统计分析鉴定通路分析 MassHunter 软件 Mass Profiler Professional 软件分析仪器定性分析与可视化利用 METLIN 数据库和安捷伦 Fiehn 谱库的 ID 浏览器利用 KEGG 等公共数据库的 Pathway Architect Profinder 安捷伦发现代谢组学解决方案 4

Profinder 工作流程反映了生物学家进行实验设计的方式对原始数据和便于直接统计的输出结果的直观访问使我的研究团队能够专注于假设的提出与测试 Profinder 替代了我们在之前的酶发现工作中使用的 6 个软件包我们还可以让学生和科学家们进行传统生物学实验并对结果进行直接分析, 因此无需专门的分析人员 ADAM ROSEBROCK 博士唐纳利细胞和生物医学研究中心多伦多大学

5 Profinder 工作流程反映了生物学家进行实验设计的方式对原始数据和便于直接统计的输出结果的直观访问使我的研究团队能够专注于假设的提出与测试 Profinder 替代了我们在之前的酶发现工作中使用的 6 个软件包我们还可以让学生和科学家们进行传统生物学实验并对结果进行直接分析, 因此无需专门的分析人员 ADAM ROSEBROCK 博士唐纳利细胞和生物医学研究中心多伦多大学非靶向发现安捷伦已开发出用于进行全局代谢物 LC/MS GC/MS CE/MS 和 SFC/MS 分析的稳定工作流程, 支持各种反相和极性色谱分离方法利用各种离子源在 MS MS/MS 和全离子 MS/MS 数据采集模式下可采集到正负离子极性的数据安捷伦专为发现代谢组学设计的 GC/MS ( 单四极杆和 Q-TOF) 和 LC/MS(TOF 和 Q-TOF) 系统可同时获得高性能数据以及大样品组所需的重现性通路分析科学家们正面临着解析越来越大越来越复杂的数据组的严峻挑战可通过将处理后的数据组投射并显示在生物学通路中, 从而利用过去一个半世纪的研究所积累的知识解决这一难题通过将以通路为中心的工作流程融入组学实验, 科学家们能够在专注于分析的同时推动从发现到生物学见解的研究进程 Pathway Architect 是 MPP 中一款结合了公共通路数据库信息和专用软件的可视化工具, 在生物学结果理解方面能提供较好的用户体验软件可将代谢物蛋白质和基因投射到人工注释的通路中, 并将数据以图形形式投射于通路中以便进行交互式分析 5

6 靶向代谢组学靶向代谢组学实验专注于特定代谢物的定量分析, 并可采用大量样品准确测定已知或已鉴定代谢物的丰度实验通常是绝对定量分析, 并需要使用分析标准品但由于样品的化学结构和物理性质各不相同, 因此分析数百种内源性代谢物可能极具挑战因此, 为实现复杂生物样品中数百种已知代谢物的准确定量, 建立三重四极杆仪器的优化 MRM 方法至关重要三重四极杆仪器因其化合物确认的宽动态范围高定量灵敏度以及出色选择性, 是执行这一任务的最佳选择分离与检测 MRM 定量统计分析通路分析 MassHunter 软件 Mass Profiler Professional 软件分析仪器定量分析与可视化利用 KEGG 等公共数据库的 Pathway Architect 安捷伦靶向代谢组学研究解决方案 6

安捷伦的三重四极杆 LC/MS 和 GC/MS 系统可为靶向代谢组学研究提供宽动态范围内的灵敏检测, 并可提供处理大样品组所需的重现性与稳定性安捷伦靶向代谢组学解决方案结合 MassHunter 定量分析报告软件以及 MPP 分析与可视化工具, 可实现多化合物大批量分析前所未有的分析效率安捷伦质谱系统通过以下途径帮助您轻松应对靶向代谢组学研究 : 促进高丰度代谢物存在时的低丰度靶标检测

7 安捷伦的三重四极杆 LC/MS 和 GC/MS 系统可为靶向代谢组学研究提供宽动态范围内的灵敏检测, 并可提供处理大样品组所需的重现性与稳定性安捷伦靶向代谢组学解决方案结合 MassHunter 定量分析报告软件以及 MPP 分析与可视化工具, 可实现多化合物大批量分析前所未有的分析效率安捷伦质谱系统通过以下途径帮助您轻松应对靶向代谢组学研究 : 促进高丰度代谢物存在时的低丰度靶标检测为用户提供宽动态范围内的高灵敏度测定维持较低变异性从而实现大样品组的可靠定量确保稳定的性能与快速的数据采集以便匹配快速色谱轻松回顾分析方法和数据以实现大样品组的批处理利用简单或高级统计分析以及 MPP 软件中的可视化工具有效对比多个样品可对发现代谢组学研究中所提出的通路进行重新验证安捷伦的 Mass Profiler Professional 软件中包括相关性分析工具, 可测定任意两个变量间成对关系的强度和方向性样品元数据图提供与聚类分析相关的样品分组模式的可视线索 7

为您的代谢组学研究需求度身定做的软件安捷伦提供用于处理复杂代谢物数据的高级分析软件特征可由 MassHunter 定量分析软件或 Profinder 提取 Profinder 是最先进的特征查找解决方案软件支持以下两种不同的数据挖掘工作流程 :1. 非靶向特征提取以及 2.

8 为您的代谢组学研究需求度身定做的软件安捷伦提供用于处理复杂代谢物数据的高级分析软件特征可由 MassHunter 定量分析软件或 Profinder 提取 Profinder 是最先进的特征查找解决方案软件支持以下两种不同的数据挖掘工作流程 :1. 非靶向特征提取以及 2. 靶向特征提取提取出的特征随后将在 MPP( 用于质谱数据的综合性生物统计学与可视化工具 ) 中进行分析您可利用 MPP 对大样品组数据进行校准归一化对比和可视化还可以将元数据加入到分析中以帮助寻找复杂样品数据中的关系 MPP 支持查找不同样品组或实体间的相关性您可以使用 ANOVA PCA 相关性聚类分析分类预测或自己编写的 R 脚本进行统计学显著性差异分析图 7. MassHunter Profinder 可对非靶向模式下获取的数据进行稳定的特征提取软件专为快速分析而设计, 通过简单而友好的图形界面 (GUI) 即可实现大量数据文件的分析您还可在 MPP 中对照 METLIN 个人化合物数据库和谱库或安捷伦 Fiehn GC/MS RTL 代谢组学谱库, 通过匹配保留时间和谱图对特征进行标注 MPP 软件可帮助您阐明代谢组学实验中的差异安捷伦的 Mass Profiler Professional 软件包括主成分分析 ANOVA 聚类算法与分类预测等多变量分析工具, 可将大样品组数据有效转化为有意义的信息 8

在代谢组学研究中, 化合物鉴定是一个主要瓶颈为应对这一挑战, 我很荣幸能与安捷伦科技公司合作协助其开发 METLIN 数据库以及 MS/MS 质谱库, 我更期待能继续与安捷伦合作开发出有益于代谢组学界的全新工具 GARY SIUZDAK 博士, SCRIPPS 质谱中心高级主管通路分析仅了解与观察到与差异有关的代谢物或蛋白质远远不够, 您需要了解其中的生物学意义 MPP 的

蛋白质转录物和基因导出并用于其他程序以新建通路导向实验例如, 可将给定通路的蛋白质标识导出用于创建靶向多肽分析实现代谢组学与其他组学的整合虽然基因组学转录组学蛋白质组学代谢组学在产业和学术中应用广泛, 但这些实验单独进行时往往不足以在组学实验中通常产生的高水平噪音之中揭示有意义的相关性但在某些情况下, 将多个组学的数据综合在一起可得到足够的限制条件, 大大降低了假阳性率

9 在代谢组学研究中, 化合物鉴定是一个主要瓶颈为应对这一挑战, 我很荣幸能与安捷伦科技公司合作协助其开发 METLIN 数据库以及 MS/MS 质谱库, 我更期待能继续与安捷伦合作开发出有益于代谢组学界的全新工具 GARY SIUZDAK 博士, SCRIPPS 质谱中心高级主管通路分析仅了解与观察到与差异有关的代谢物或蛋白质远远不够, 您需要了解其中的生物学意义 MPP 的 Pathway Architect 模块可在生物学通路上对数据进行交互式筛选映射和可视化模块支持两种类型的通路分析 : 一种是基于发表文献自然语言处理的文献衍生的网络分析 ; 另一种则专门设计用于分析注释公共生物学通路, 例如 KEGG BioCyc 和 Wikipathways 实验数据将投射到上述通路中, 用户可在其中对数据进行筛选放大或选择选择一条或多条通路后可将一系列代谢物蛋白质转录物和基因导出并用于其他程序以新建通路导向实验例如, 可将给定通路的蛋白质标识导出用于创建靶向多肽分析实现代谢组学与其他组学的整合虽然基因组学转录组学蛋白质组学代谢组学在产业和学术中应用广泛, 但这些实验单独进行时往往不足以在组学实验中通常产生的高水平噪音之中揭示有意义的相关性但在某些情况下, 将多个组学的数据综合在一起可得到足够的限制条件, 大大降低了假阳性率 Mass Profiler Professional 的 Pathway Architect 模块可进行单组学分析或多组学联合分析, 从而使您能够发现通常受影响的通路并帮助您更快速地找到可靠答案嘌呤代谢 KEGG 通路中的节点 ( 青色 ) 代表代谢物 ; 与节点相连的是 HeatStrip, 用于总结不同条件下的平均丰度差异值 HeatStrip 上的青色色条表示代谢物 ; 黄色色条表示基因表达的结果 9

安捷伦代谢组学解决方案 GC/MS 仪器和软件 5977A 系列 GC/MSD 系统

代谢组学谱库这一不断增加的代谢组学谱库是与 Oliver Fiehn 博士合作研发的,

是最大的商用代谢组学数据库谱库提供预编程的完整 GC/MS 分析方法以及 GC/MS

10 安捷伦代谢组学解决方案 GC/MS 仪器和软件 5977A 系列 GC/MSD 系统 Agilent 5977A 系列 GC/MSD 系统是业内仪器类型最全功能最丰富的气相色谱气质联用系统及其软件产品大家族中最新的一位成员 7000C 三重四极杆气质联用系统即使是面对最复杂的基质,7000C 三重四极杆气质联用系统仍能提供最精确的定量结果和可靠的定性结果 7200B 四极杆飞行时间气质联用系统 7200B 系列 GC/Q-TOF 系统包含完善的反吹配置, 全新阐释了 Agilent 7890B GC 久经验证的分离能力安捷伦 Fiehn GC/MS 代谢组学谱库这一不断增加的代谢组学谱库是与 Oliver Fiehn 博士合作研发的, 包含约 900 种常见代谢物的 GC/MS EI 谱图和保留时间索引供检索, 是最大的商用代谢组学数据库谱库提供预编程的完整 GC/MS 分析方法以及 GC/MS 代谢组学分析文档, 可最大程度提高研究效率 10 MassHunter 定性软件支持利用根据色谱解卷积进行查找算法对安捷伦 GC/MSD 文件进行特征提取将提取到的特征峰与安捷伦 Fiehn GC/MS 代谢组学谱库对比以进行鉴定

LC/MS INSTUMENTS AND SOFTWARE LC/MS 仪器和软件 6200

ppm 的典型质量精度以及埃摩尔级的灵敏度仪器具有 5 个数量级的线性动态范围以及最高每秒 20

MS/MS 功能外, 其他功能均与 6200 系列 TOF LC/MS 相同典型质量精度 (2-4 ppm

6400 系列三重串联四极杆 LC/MS 拥有最长的正常运行时间, 可用于大样品组的分析

METLIN 个人化合物数据库与谱库 METLIN 个人化合物数据库包含约 80000 种化合物, 其中包括

11 LC/MS INSTUMENTS AND SOFTWARE LC/MS 仪器和软件 6200 系列精确质量飞行时间质谱 6200 TOF LC/MS 是分析与鉴定低分子量化合物的理想选择, 具有 1-2 ppm 的典型质量精度以及埃摩尔级的灵敏度仪器具有 5 个数量级的线性动态范围以及最高每秒 20 张谱图的谱图采集速率, 可完美匹配 UHPLC 的强大分离能力 6500 系列精确质量四极杆飞行时间质谱除 MS/MS 功能外, 其他功能均与 6200 系列 TOF LC/MS 相同典型质量精度 (2-4 ppm MS/MS) 使小分子化合物的鉴定结果更加可靠, 并且能够减少数据库检索中的假阳性结果谱图采集速率高达每秒 50 张 MS/MS 谱图, 可完美匹配 UHPLC 的强大分离能力 6400 系列三重四极杆液质联用系统亚飞克级灵敏度可检测低丰度组分凭借超快速 MRM 离子对与稳定可靠的性能, 6400 系列三重串联四极杆 LC/MS 拥有最长的正常运行时间, 可用于大样品组的分析通用离子光学元件使您在研究进程从发现进入到验证时轻松实现从安捷伦 Q-TOF 到三重四极杆的方法转换 METLIN 个人化合物数据库与谱库 METLIN 个人化合物数据库包含约种化合物, 其中包括种脂类应用 TOF 和 Q-TOF 数据, 可以通过精确质量和 / 或保留时间数据库检索进行鉴定检索包含 9000 余种化合物的 MS/MS 谱库可实现更可靠的代谢物鉴定 11

12 了解详细信息查找安捷伦客户服务中心安捷伦客户服务中心 : , ( 手机用户 ) 联系我们 : LSCA-China_800@agilent.com 在线询价 : 安捷伦科技大学 : 浏览和订阅 Access Agilent 电子期刊 : 本文中的信息说明和指标如有变更, 恕不另行通知安捷伦科技 ( 中国 ) 有限公司, 年 9 月 24 日, 中国出版 CHCN

了解代谢组学安捷伦作为全球领先的代谢组学解决方案供应商, 可为研究者提供各种尖端仪器与创新型信息学解决方案什么是代谢组学? 代谢组学是针对内源性代谢物 ( 又称为代谢组 ) 的研究, 而代谢组则是多种物理化学性质不同的低分子量 ( Da) 化合物的集合代谢组测量提供了生物系统功能

了解代谢组学安捷伦作为全球领先的代谢组学解决方案供应商, 可为研究者提供各种尖端仪器与创新型信息学解决方案什么是代谢组学? 代谢组学是针对内源性代谢物 ( 又称为代谢组 ) 的研究, 而代谢组则是多种物理化学性质不同的低分子量 ( Da) 化合物的集合代谢组测量提供了生物系统功能您的成功之路安捷伦代谢组学解决方案了解代谢组学安捷伦作为全球领先的代谢组学解决方案供应商, 可为研究者提供各种尖端仪器与创新型信息学解决方案什么是代谢组学? 代谢组学是针对内源性代谢物 ( 又称为代谢组 ) 的研究, 而代谢组则是多种物理化学性质不同的低分子量 (50-1500 Da) 化合物的集合代谢组测量提供了生物系统功能状态的相关重要信息代谢组与生物体表型的密切联系可为基因组学和蛋白质组学提供补充信息