Reaxys 化學資料庫教育訓練 www.reaxys.com Elsevier 生命科學解決方案經理 Olivia Liang 梁成芝 2015.9.30
Reaxys PRESENTER NAME DATE TITLE 百萬 學術文獻發表量急遽增加 1.6 學術文獻發表量 急速增加 1.4 1.2 1 精準搜尋 節省閱讀時間 0.8 0.6 0.4 0.2 0 1920 1930 1940 1950 1960 1970 1980 1990 2000 2010 2
PRESENTER NAME DATE TITLE 3 一般資料庫的搜尋結果無法滿足化學領域的特殊需求
Reaxys PRESENTER NAME DATE TITLE 4
Reaxys 的過去與現在 承襲 Gmelin, Beilstein, 與 CrossFire 資料庫 1771 年開始 1771 1817 1881 1988 1993 2007 Gmelin Online Beilstein Online 涵蓋有機 無機 有機金屬領域 400 種核心期刊 Beilstein on STN CrossFire 1.0 資料來自超過 16000 種期刊經實驗驗證的數據 CrossFire Commander 2009 2013 三大專利資料庫 : USTPO, EPO, WIPO
Reaxys 2015 文獻資料 A Bibliographic Database >46 million records (from ~16,000 journal titles plus records from key patent organisations) Reaxys 2015 A Substance Database ~ 90 million substances (total) ~ 57 million substances (unique) 化合物 物化特性 實驗數據 化學反應 反應式 反應條件 合成路徑 A Chemical Reaction Database > 36 million single- and multi-step reactions A Property Database > 500 million experimental properties in > 500 fields in > 130 subject areas > 500 個欄位可獨立或合併搜尋 6
REAXYS 資料擷取方式 從文獻中分別擷取出化學結構 物理化學特性 藥理資訊以及化學合成反應式等資訊, 再整理 SUBSTANCES REACTIONS 及 CITATIONS 三類, 共超過 500 個欄位 > 500 個欄位可獨立或合併搜尋
PRESENTER NAME DATE TITLE 8 結構 多元化搜尋管道 分子式 合金 Reaxys Tree >500 個欄位 自動辨識關鍵字屬性 搜尋結果 HeatMap 化合物 (Substance) 反應 (Reaction) 標靶 (Target) 文獻 (Literature)
Ask Reaxys 搜尋範例 EASY OF USE Ask Reaxys A set of examples have been implemented providing users with an overview about Ask Reaxys capabilities, helping them to get the most out of this feature.
Ask Reaxys 搜尋應用範例 順丁烯二酸 +HPLC 檢測方法 (Maleic Acid+HPLC)
Ask Reaxys 切換自動辨識結果 可預覽搜尋結果, 協助判斷採用何種辨識方式
Ask Reaxys 搜尋應用範例 棉酚檢測方式 (GossypolDetection) 檢測方式 : 毛細管電泳 (Capillary electrophoresis) 檢測方式 :HPLC 檢測方式 :Flow Injection
Reaxys 搜尋架構 建立搜尋指令 搜尋結果 Ask Reaxys: 關鍵字智慧搜尋 Structure: 結構 Formula: 分子式 Alloy: 合金 Fields: 欄位 ReaxysTree: 群組搜尋 HeatMap Reaction: 反應 Substance: 化合物 Target: 標靶 Literature: 文獻 篩選分析 AutoPlan: 自動規劃合成路徑 連結外部資料庫 Analysis View 及 filter: 資料篩選 資料儲存與輸出 Report 報告格式 Export 輸出資料
一 Reaxys 搜尋架構 選擇合適的搜尋管道 結構 多元化搜尋管道 Ask Reaxys 分子式合金 Reaxys Tree 布林邏輯 使用指令結合各種搜尋條件 最完整 批次搜尋 結合多種搜尋條件 >500 個欄位 搜尋結果 化合物 (Substance) 反應 (Reaction) 文獻 (Literature)
結構搜尋 Marvin JS 無須 Java 支援 Click to start Search
Marvin JS Basic search function Drawing 畫筆 COO 搜尋官能基
Marvin JS substructure search
Marvin JS substructure search
搜尋指令 結構搜尋 廣瀨教授 : 我曾對醇類及胺類的醯化 (acylation) 反應感興趣, 一般來說胺化作用 (amination) 比酯化作用 (esterification) 更容易發生, 因此通常胺基比羥基更容易反應, 但我想找出羥基有反應而不改變胺基的反應 特殊搜尋技巧 : Substitution count Atom mapping
搜尋結果
檢視現有合成路徑 點選 VIEW SCHEME 檢視合成路徑圖
Marvin JS atom mapping 結果差異
Marvin JS Substitution Right click to add atom properties
Marvin JS Substitution 結構搜尋指令 結果差異.s6.s3.s*
結構搜尋其他設定選項 REAXYS 可以針對您的需求, 搜尋各式各樣的衍生物 和畫好的結構相同 衍生物 相似結構 其他條件
建立搜尋指令 - 分子式 Molecular Formula Fe 2 O 3 Fe 3 O 4 C34* 將滑鼠移到元素上方即可預覽該元素詳細資訊 影片介紹 Query Builder 26
建立搜尋指令 - 合金 Alloy Ti-6Al-4V Pb/C yttria/zirconia ceramics 合金成分合金比例 ( 範圍 ) Ti Y2O3 Pb Al ZrO2 C V 合金成分比例單位 是否允許含有其他成分 或者您也可以使用 Advanced Search
欄位搜尋
新增欄位 Fields 文獻搜尋預設欄位 直接點選
REAXYS TREE POLYCONDENSATION 按下 Search
範例 CASNo. 批次搜尋 1. 選擇 IMPORT 上傳搜尋指令 (XML 或 TXT 檔案 )
範例 CASNo. 批次搜尋 檢視搜尋結果 LOG FILE
合併搜尋條件 --History 結合多個搜尋條件 萊克多巴胺 + 毒性 (Ractopamine+Toxicity)
二 Reaxys 搜尋結果與分析 精準篩選搜尋結果 搜尋結果 化合物 (Substance) 反應 (Reaction) 文獻 (Literature) 合成路徑規畫 連結外部資料庫 小分子資料 供應商資料 篩選功能 :Analysis View 及 28 種 Filter 子結構篩選 Substructure
PRESENTER NAME DATE TITLE 建立合成計畫 Synthesis Plans 35
建立合成計畫 PRESENTER NAME DATE TITLE 36
Analysis View 視覺化分析系統 範例 : 使用環保溶劑, 合成反應的產率分布
結果畫面相似結構搜尋 DISCOVERABILITY 結構相似性排序 Similarity sorting - 結果畫面可直接點 Find similar 做相似結構搜尋 - 相似搜尋結果可依照相似性排序
反應搜尋結果 儲存勾選的反應資料 排序 查看包裝價格
PubChem 搜尋結果 切換至 PubChem 資料庫
文獻搜尋結果 連結至 Scopus ( 世界大學排名採用系統 ) COLLABORATION Citations Author names, which can also be found in Scopus are now hyperlinks, so that information about affiliation and publications can be immediately looked up in Scopus.
三 Reaxys 搜尋結果分析及輸出 輸出報告與同儕分享討論 搜尋結果 化合物 (Substance) 反應 (Reaction) 文獻 (Literature) 合成路徑規畫 資料庫連結 篩選功能 :Analysis View 及 28 種 Filter 多元資料儲存或輸出方式 檔案格式 :E-mail HTML 網頁 PDF 可儲存 : 搜尋條件 化合物 反應 文獻 合成路徑優點 : 適合儲存少量資料 操作簡便 格式簡明 保留超連結 檔案格式 :PDF XML Word Excel 電子實驗記錄本 書目資料 可儲存 : 化合物 反應 文獻 合成路徑優點 : 可大量輸出搜尋結果 多種檔案格式可與進階分析軟體相容
多樣化結果輸出功能 --REPORT 搜尋紀錄輸出 輸出結果 反應搜尋結果輸出 化合物搜尋結果輸出 文獻搜尋結果輸出
輸出搜尋結果 https://www.reaxys.com/reaxys/printing/reaxy s_anonymous_20150513_102021_206.pdf
分享搜尋結果 PDF EXPORT RESULT
個人化功能 註冊及登錄 輸入英文資料 個人化功能 1. Report: 輸出報告 2. History: 搜尋紀錄 3. My Alerts: 新知通報 4. MySettings: 個人化設定 密碼建議包含大小寫 數字及特殊符號 (*_.) 點擊送出資料
1. Report 多樣化結果輸出功能 (REPORT): 只要有如 : 搜尋條件 搜尋結果及合成計畫等 圖示處皆可輸出至 REPORT,
多樣化結果輸出功能 --REPORT 搜尋紀錄輸出 輸出結果 反應搜尋結果輸出 化合物搜尋結果輸出 文獻搜尋結果輸出
2. History 搜尋紀錄 (HISTORY): 保存重要搜尋結果 如 : 搜尋條件 搜尋結果及合成計畫等 49
合併搜尋 結合多個搜尋條件
3. My Alerts 新知通報 (MY ALERTS): 訂閱常用搜尋條件, 隨時閱讀最新資料 輸入名稱 51
4. My Setting 個人化設定 (MY SETTINGS): 修改個人資料 修改密碼 或依照自己的喜好設定 REAXYS 介面 如, 更換繪圖軟體 挑選常用搜尋欄位等等 修改使用介面設定 修改個人資料 修改密碼 52
4. My Setting 個人化設定 (MY SETTINGS): 修改個人資料 修改密碼 或依照自己的喜好設定 REAXYS 介面 如, 更換繪圖軟體 挑選常用搜尋欄位等等 更換結構繪圖軟體
線上資源 WEBINAR & HELP Ease of Use: 首頁上方, 不定期提供產品最新消息, 如資料庫更新 線上講座訊息等 Help 包含線上短片 線上講座 操作手冊 搜尋範例及其他常見 Q&A 或是您也可以直接聯繫我們的客服人員
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近期活動 ChemSearchChallenge chemistrysearcher.elsevier.com 即日起至 11/30 止 http://goo.gl/xfakzm 如果你的朋友問你, 該如何馬上去除狗身上的臭味, 你多快可以找到另他驚豔的方法並展現自己的化學搜尋實力呢?
Thank you! 相關網頁 www.reaxys.com( 首頁 ) taiwan.elsevier.com( 台灣官網 ) www.facebook.com/reaxysclub(fb 粉絲團 )