TITLE OF PRESENTATION New Reaxys 使用介绍 Introduction to new Reaxys Value Tree Ver_2 Presented By Markus Bussen Date
TITLE OF PRESENTATION 2 提纲 New Reaxys 介绍 New Reaxys 中包含内容 New Reaxys 中的新增内容和检索功能 New Reaxys 中的结果和检索方法 New Reaxys 中的结果界面 New Reaxys 中的 Quick Search 与结果筛选方法 New Reaxys 中的 Synthesis Plan 的制作 New Reaxys 中的 Query Builder 使用介绍 New Reaxys 中检索小结
TITLE OF PRESENTATION 3 Elsevier 公司介绍 Elsevier 于 1880 年在荷兰成立, 成立之初致力于学术期刊杂志的发行和出版, 现已发展成为全球最大的科技文献出版社 Elsevier 是一家全球性公司, 总部在荷兰阿姆斯特丹, 在世界 25 多个国家雇有 7000 多名员工, 是励德爱思唯尔集团 (Reed Elsevier) 的成员
TITLE OF PRESENTATION 4 Reaxys 数据库的发展历程 2015 Q1 2016 Q3
TITLE OF PRESENTATION 5 REAXYS 数据库涵盖内容 物质商业数据库 8,433,545 substances from emolecules 文摘数据库 >53,596,146 records (from ~16,000 journal titles plus records from key patent organizations) 反应数据库 > 42,744,107 single- and multi-step reactions Reaxys 物质数据库 > 42,780,007 substances (total), 并且整合了 Emolecular 和 Pubchem 的物质信息, 总计达到 9000 万 + 的物质 理化性质数据库 > 500 million experimental properties in > 500 fields in > 130 subject areas 专利数据库 收录 7 大专利局的信息包括 WO,US,EP,CN,JP,TAIW AN and South Korea
TITLE OF PRESENTATION 6 Reaxys 收录的文献范围和涉及学科分类 Reaxys 总共收录 16,098 种期刊 涵盖与化学相关 16 个学科领域 农业及生命科学 生物化学, 分子生物学 化学工程 Chemical Engineering 化学 Chemistry 牙科学 Dentistry 宇宙科学 Earth and Planetary Science 能源 Energy 工程 Engineering 环境 Environmental Science 免疫学及微生物学 Immunology and Microbiology 材料科学 Materials Science 药学 Medicine 神经系统科学 Neuroscience 药理学 毒理学 Pharmacology, Toxicology and Pharmaceutics 物理学和天文学 Physics and Astronomy 其中包括化学最核心期刊 426 种 ( 其中收录 ACS 旗下化学最核心期刊 31 种 ) 化学相关专利 (76 年以来的 WO, US, EP),2010 年以来的所有 JP, Korea 以及 2015 年以后所有的 CN,Taiwan 对于较早文献的收录比较好, 最早的一篇文章可以追溯到 1771 年 兽医学 Veterinary 6
TITLE OF PRESENTATION 7 提纲 New Reaxys 介绍 New Reaxys 中包含内容 New Reaxys 中的新增内容和检索功能 New Reaxys 中的结果和检索方法 New Reaxys 中的结果界面 New Reaxys 中的 Quick Search 与结果筛选方法 New Reaxys 中的 Synthesis Plan 的制作 New Reaxys 中的 Query Builder 使用介绍 New Reaxys 中检索小结
TITLE OF PRESENTATION 8 New Reaxys 的登录方式 https://new.reaxys.com/
TITLE OF PRESENTATION 9 New Reaxys 中拥有更广泛的专利覆盖 New Reaxys 收录更多的亚太区域的专利 World US Europe Japan S. Korea China Taiwan 2014 2015 2016 2017 July 2016 September 2016 December 2016 2017 更多的源自亚洲专利中的物质将陆续添加到 New Reaxys 中
TITLE OF PRESENTATION 10 New Reaxys 的简洁界面让初次使用者快速获得最权威信息 可使用自然语言和结构检索, 一键获得所有相关信息
TITLE OF PRESENTATION 11 New Reaxys 智能识别搜索意图并给出结果选项 New Reaxys 智能解析搜索意图 1 2 认为是反应 3 提供其他可供选择的检索选项
TITLE OF PRESENTATION 12 New Reaxys 的 Query Builder 提供交互式的信息查询 不同条件选择 Tips: New Reaxys 的 Query Builder 允许通过各种条件组合来做针对性检索
TITLE OF PRESENTATION 13 New Reaxys 中的数据会更加标准化, 规范化 Tips: New Reaxys 所有相关的数据都集中在一起, 以列表形式呈现, 并可直接使用
TITLE OF PRESENTATION 14 New Reaxys 中的过滤分析工具提供交互式预览便于快速评估 选择其中一个选项后, 可以在其他选项中看到这个选项在其他选项中所占有的比例
TITLE OF PRESENTATION 15 提纲 New Reaxys 介绍 New Reaxys 中包含内容 New Reaxys 中的新增内容和检索功能 New Reaxys 中的结果和检索方法 New Reaxys 中的结果界面 New Reaxys 中的 Quick Search 与结果筛选方法 New Reaxys 中的 Synthesis Plan 的制作 New Reaxys 中的 Query Builder 使用介绍 New Reaxys 中检索小结
TITLE OF PRESENTATION 16 New Reaxys 中的结果界面 物质结果 检索 Tips: 物质的各类理化性质, 包括谱图, 生物活性, 物性数据等, 直接点开各个不同的选项进行查看 检索 Tips: 物质的结构信息, 可以通过放大镜图标放大结构, 鼠标悬停在结构上, 可以看到更多的结构选项和直接合成路线的功能 检索 Tips: 物质的相关的合成路线, 所有反应, 以及文献链接, 实现从物质到反应或者文献的跳转
TITLE OF PRESENTATION 17 New Reaxys 中的结果界面 物质的理化性质界面 检索 Tips: Reaxys 中拥有大量的物质理化性质, 谱图数据, 且能直接给出具体数值, 检测条件, 以及原始文献出处, 帮助用户更好的链接到原文
TITLE OF PRESENTATION 18 New Reaxys 中的结果界面 生物活性数据 检索 Tips: Reaxys 会摘录原始文献中的和生活活性有关的内容和数据, 整理成表格提供给用户 该化合物的 EC50 数据和检测方法
TITLE OF PRESENTATION 19 New Reaxys 中的结果界面 反应结果 检索 Tips: 1. Reaxys 中的反应会将相同的反应进行整理, 用通过点击 Show All Detail, 获取相同底物和产物反应的不同条件 2. Reaxys 会提取原文中的 Experimental Procedure, 帮助用户快速获得原文中的反应操作流程 3. Reaxys 提供该条反应的 Similar Reaction 检索, 获得和这条反应反应中心一样的反应, 帮助寻找更多的可能的反应条件
TITLE OF PRESENTATION 20 New Reaxys 中的结果界面 Show All Detail 检索 Tips: 1. Reaxys 中的反应会将相同的反应进行整理, 用通过点击 Show All Detail, 获取相同底物和产物反应的不同条件, 每条反应都有各自对应的参考文献, 并提供原文链接,
TITLE OF PRESENTATION 21 New Reaxys 中的结果界面 Experimental Procedure 检索 Tips: Reaxys 提供摘自原文作者的 Experimental Procedure, 提供详细的反应操作细节
TITLE OF PRESENTATION 22 New Reaxys 中的结果界面 Similar Reaction 检索 Tips: 通过 Reaxys 提供的 Similar Reaction Search, 获得和原有反应在反应中心一致, 但是依据附属原子不同级别变化的类似反应
TITLE OF PRESENTATION 23 New Reaxys 中的结果界面 文献结果界面 检索 Tips: 1. Reaxys 中的文献都会经过 Reaxys 专家进行人工索引, 提炼其中的 Index Term, 物质, 反应, 帮助用户进行文献分类和索引, 以及文献, 物质, 反应的相互跳转
TITLE OF PRESENTATION 24 New Reaxys 中的结果界面 文献结果界面 检索 Tips: 鼠标悬停在结构上, 可以直接进行物质相关的检索
TITLE OF PRESENTATION 25 提纲 New Reaxys 介绍 New Reaxys 中包含内容 New Reaxys 中的新增内容和检索功能 New Reaxys 中的结果和检索方法 New Reaxys 中的结果界面 New Reaxys 中的 Quick Search 与结果筛选方法 New Reaxys 中的 Synthesis Plan 的制作 New Reaxys 中的 Query Builder 使用介绍 New Reaxys 中检索小结
TITLE OF PRESENTATION 26 New Reaxys 中的检索 Tips: 1. Quick Search 2. Query Builder 3. Results 4. Synthesis Planner 5. History New Reaxys 中的 Quick Search, 简单, 直接的检索方式
TITLE OF PRESENTATION New Reaxys 检索案例 1 物质相关检索 Presented By Date
TITLE OF PRESENTATION 28 Quick Search 检索案例 1 检索吉非替尼这个药物 获得药物的相关信息 获得药物的 NMR 谱图数据 获得药物的晶型数据和对应文献 检索 Tips: 在 Quick Search 界面启动 Marvin JS 结构编辑器, 进行结构编辑
TITLE OF PRESENTATION 29 Marvin JS 结构编辑器使用 选择工具, 橡皮, 健定义, 链, 正负电子 元素周期表以及常用原子 重复基团, R 基团,R 基团链接端, 反应定义工具 A: 原子属性定义工具 常见的环, 官能团,Reaxys 的 Generic Group 定义
TITLE OF PRESENTATION 30 结构的绘制 Tips: Reaxys 中的结构绘制, 可以直接通过物质名称导入
TITLE OF PRESENTATION 31 New Reaxys 中的检索 Tips: Reaxys 会自动依据输入的内容进行检索判断, 给出不同的结果集, 包括物质, 反应等内容
TITLE OF PRESENTATION 32 New Reaxys 中的物质结果 Tips: Reaxys 编辑人员会阅读文献原文, 直接提取和理化性质相关的数据, 录入到 Reaxys 中, 并整理成列表, 供研究人员使用,
TITLE OF PRESENTATION 33 New Reaxys 中的物质理化性质 NMR 谱图数据 Tips: Reaxys 编辑人员会摘录和谱图有关的结果数据, 条件, 直接录入到 Reaxys 中, 供科研人员使用
TITLE OF PRESENTATION 34 New Reaxys 中的物质理化性质 晶型数据 Tips: Reaxys 编辑人员会摘录和晶型有关的描述, 并给出原文的位置所在
TITLE OF PRESENTATION 35 New Reaxys 中的物质相关的文献 Tips: 在物质界面, 可以一键获得和这个物质有关的所有文献
TITLE OF PRESENTATION 36 New Reaxys 的文献筛选 Tips: Reaxys 的 Index Term(Reaxys Tree) 分析, 帮助从概念角度出发, 筛选对应的文献
TITLE OF PRESENTATION 37 获得文献 通过 Index Term(Reaxys Tree) 分析 Physico chemical analysis methods Spectroscopical analysis NMR spectroscopy
TITLE OF PRESENTATION 38 其中的一篇 Tips: 从 Reaxys 的索引体系中, 可以对文献内容有个大致的判断
TITLE OF PRESENTATION New Reaxys 检索案例 2 反应相关检索 Presented By Date
TITLE OF PRESENTATION 40 Quick Search 检索案例 2 检索以下的反应 吡啶环 2,3,4 位上存在一个硝基还原成氨基 吡啶环 6 位上存在一个 Cl 检索 Tips: 在 Quick Search 界面启动 Marvin JS 结构编辑器, 进行结构编辑
TITLE OF PRESENTATION 41 结构的定义 结构绘制步骤 : 1: 用套索选择工具选择吡啶上的 3 个 C 原子 2: 用链工具中的不定位取代健将吡啶和 NO2,NH2 相接 3: 用反应定义工具, 指定反应前后 NO2 到 NH2 的变化
TITLE OF PRESENTATION 42 检索功能的选择和检索 检索 Tips: 1:As Drawn, 和所画结构完全一致的反应 2:Substructure, 亚结构反应检索, 会展开所有 H, 可以设定所有原子开放还是杂原子开放
TITLE OF PRESENTATION 43 上传结果并检索 Tips: New Reaxys 中当执行检索后, 会可以通过 Preview 功能先预览下结果, 可以通过预览大致判断下结果
TITLE OF PRESENTATION 44 最终的结果 Tips: 检索到结果后, 可以通过旁边的工具进行筛选
TITLE OF PRESENTATION 45 Quick Search 检索案例 案例的衍生 检索以下的反应 吡啶环 2,3,4 位上存在一个硝基还原成氨基 吡啶环 6 位上存在一个任意的取代 添加可以有取代的位点, 继续用 As Draw 进行检索
TITLE OF PRESENTATION 46 如何绘制 Tips: 1: 使用原子属性定义工具 A, 选择原则属性, 打开原子属性列表 2: 选择.S+, 给 6 位 C 原子添加最大可取代的取代基数 4
TITLE OF PRESENTATION 47 最后的结果 Tips: 可以使用 Reaxys 的分析工具对反应进行筛选
TITLE OF PRESENTATION 48 Reaxys 中的反应筛选 Tips: Reaxys 提供 11 种反应筛选工具, 帮助科研人员从大量反应中快速筛选出相关反应, 发现一些未知的信息 Document Type 帮助分析反应的出处, Reaxys 还收录一些源自和 Reaxys 编辑之间沟通的邮件
TITLE OF PRESENTATION New Reaxys 检索案例 3 文献相关检索 Presented By Date
TITLE OF PRESENTATION 50 Quick Search 检索案例 3 检索涉及 Suzuki 反应催化剂有关的文献, 看看是否有一些和催化剂活性有关的文献报道 Quick Search 中输入 Catalyst for Suzuki Coupling
New Reaxys 中的基于不同条件的智能检索 TITLE OF PRESENTATION 51
TITLE OF PRESENTATION 52 New Reaxys 中的文献检索结果 可以使用 New Reaxys 中的分析工具, 对文献进行筛选
TITLE OF PRESENTATION 53 New Reaxys 文献分析工具 Tips: New Reaxys 提供 9 种文献分析工具 1. Index term(list): 基于索引词的分析 2. Index term(reaxys Tree): 基于概念组的分 析 3. Publication Year: 基于出版年限的分析 4. Document Type: 基于文献类型的分析 5. Authors: 基于作者的分析 6. Patent Assignee: 基于专利权人的分析 7. Journal Title: 基于期刊名称的分析 8. Substance Classes: 基于反应中心结构的分析 9. Reaction Classes: 基于反应类型的分析
TITLE OF PRESENTATION 54 New Reaxys 中的文献筛选工具 Tips: Index Term 是 Reaxys 的编辑人员在阅读完文献后给予文献的一些描述性的词汇, 帮助用户能更好的了解文献中的重要内容
TITLE OF PRESENTATION 55 New Reaxys 中的文献筛选工具 ( 续 ) Tips: 在选定 Index Term 后, 可以通过 Limit to 或者 Exclude, 来获取包含这个索引词, 或者不包含这些索引词的文献
TITLE OF PRESENTATION 56 提纲 New Reaxys 介绍 New Reaxys 中包含内容 New Reaxys 中的新增内容和检索功能 New Reaxys 中的结果和检索方法 New Reaxys 中的结果界面 New Reaxys 中的 Quick Search 与结果筛选方法 New Reaxys 中的 Synthesis Plan 的制作 New Reaxys 中的 Query Builder 使用介绍 New Reaxys 中检索小结
TITLE OF PRESENTATION 57 Reaxys 的 Synthesis Plan 是全球最先进的合成路线设计工具 给吉非替尼制定合成计划 Step1: 检索到吉非替尼 Step2: 导入合成计划 Tips: 1: 通过前述的操作找到物质 2: 鼠标悬停在结构上, 看到 Synthesize 3: 点击, 打开 Synthesis Plan, 这里选择手动
TITLE OF PRESENTATION 58 Synthesis Plan 添加感兴趣的反应 可以添加多条反应在一个 Plan 中, 用于比较
TITLE OF PRESENTATION 59 添加好的结果界面 Tips: 1: 通过添加多条反应, 可以用来评估反应信息 2: 点击虚线的地方, 可以查看条件, 或者隐藏, 移除反应
TITLE OF PRESENTATION 60 继续的扩充反应路线 Tips: 在 Synthesis Plan 上可以对任意一个物质进行同样的 Synthesis 的操作, 可以将更多的反应添加进来
TITLE OF PRESENTATION 61 最后的结果 可以对 Synthesis Plan 进行导入, 导出或者保存等操作
TITLE OF PRESENTATION 62 提纲 New Reaxys 介绍 New Reaxys 中包含内容 New Reaxys 中的新增内容和检索功能 New Reaxys 中的结果和检索方法 New Reaxys 中的结果界面 New Reaxys 中的 Quick Search 与结果筛选方法 New Reaxys 中的 Synthesis Plan 的制作 New Reaxys 中的 Query Builder 使用介绍 New Reaxys 中检索小结
TITLE OF PRESENTATION 63 New Reaxys 的 Query Builder 检索案例 检索以下物质 天然存在的 30 个 C 原子 有抗菌效应的 光学旋光度在 75-80 Tips: Reaxys 的 Query Builder 可以将科研人员的想法付诸实践
TITLE OF PRESENTATION 64 检索需求分析 需求涉及 4 个方面 分子式, 理化性质,Key Word, 源自天然产物 Step 1: 添加分子式条件,C30*
TITLE OF PRESENTATION 65 条件的添加 Step 2: 添加天然产物的条件, 在右侧 Forms 里面选择天然产物, 拖动至左侧, 并选择 Find Any
TITLE OF PRESENTATION 66 条件的添加 Step 3: 添加 Key Word,antimicrobi*, 用 * 通配符表示任意字符
TITLE OF PRESENTATION 67 条件的添加 Step 4: 添加 Physical Data, 其中找到旋光度, 输入数值 75-80
TITLE OF PRESENTATION 68 执行检索 Step5: 选择物质检索
最后的检索结果 TITLE OF PRESENTATION 69
TITLE OF PRESENTATION 70 案例的衍生 刚才的案例说 30 个 C, 如果我要求是 28 或者 30 个 C 该如何检索 Tips: 在分子式检索下面, 添加一个分子式的条件, 需要注意的是, 要和之前的分子式条件成为一个组别,Group, 然后添加 C28*, 并将两个分子式之间的逻辑关系换成 OR
TITLE OF PRESENTATION 71 最终的结果 可以同时检索到 C28,C30 的天然产物
TITLE OF PRESENTATION 72 提纲 New Reaxys 介绍 New Reaxys 中包含内容 New Reaxys 中的新增内容和检索功能 New Reaxys 中的结果和检索方法 New Reaxys 中的结果界面 New Reaxys 中的 Quick Search 与结果筛选方法 New Reaxys 中的 Query Builder 使用介绍 New Reaxys 中检索小结
TITLE OF PRESENTATION 73 New Reaxys 检索小结 New Reaxys 从大量文献中摘取和物质性质相关的所有数据, 帮助科研人员获得标准化, 规范化, 格式化的物性数据列表及参考文献 New Reaxys 中的 Query Builder 检索帮助科研人员通过简便的方式, 获得精准, 跨学科的精确答案 New Reaxys 中的结构面板, 能实现科研人员绝大部分的结构绘制要求, 帮助科研人员用最直接的方式获得相应的物质和反应
TITLE OF PRESENTATION