如何利用 SciFinder 解决药学研究中的常见问题 李虹 SciFinder 培训专员 2014.10
提纲 药学研究中的常见问题讨论 常见问题在 SciFinder 中的解决方案及策略讨论 中药在 SciFinder 检索时的注意事项 2
药学研究时的关注热点 如何查找具有某一类骨架或母核的药物? 如何设计一条完整的逆合成反应路线? 如何查找药物剂型, 制剂方面的信息? 如何查找药物药代动力学方面的研究内容? 如何查找药物构效关系方面的研究内容? 如何查找药物的毒理, 病理研究内容? 如何查找药物体内外实验研究? 如何快速定位到药物的靶点信息? 如何查找药物的理化性质, 谱图信息, 检测手段等分析学研究信息? 如何去查找某一味中药或者同种属中研究过哪些中药? 3
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SciFinder Web 中的检索举例 络活喜 CAS No:111470-99-6 商品名称 :Norvasc 英文名称 :Amlodipine Besylate 通用名 : 苯磺酸氨氯地平片 (Amlodipine Besylate) 分子式 :C26H31ClN2O8S 5
物质信息检索的策略 涉及具体药物的信息检索的关键是先检索到该物质 Step 1: 选择适合的检索途径 功能方面 物质名称,CAS No 分子式 结构式 理化性质 推荐的物质检索功能 有机物, 天然产物及衍生物 --- 结构比较方便 无机物 --- 分子式比较方便 高分子化合物 --- 首先分子式, 其次结构 6
物质信息检索的策略 Step 2: 点击 substance identifier, 输入物质名称 7
物质信息检索的策略 Step 3: 进入物质详情, 获得药物靶点信息 8
物质信息检索的策略 Step 4: 进入物质详情, 获得药物理化性质信息 详细的理化性质数据 : 溶解度, 酸碱度, 粘度, 油脂分配系数, 结构性质, 热力学常数等等 9
物质信息检索的策略 Step 5: 进入物质详情, 获得药物谱图信息 详细的谱图数据 : 氢谱, 红外光谱, 质谱, 拉曼光谱, 紫外可见光谱等... 10
文献信息检索的策略 由结构信息获取文献, 然后在文献结果集中筛选药剂, 药代, 药理, 药分等研究领域的文献 一键获得文献, 可以获得全部, 也可以勾选特别感兴趣的内容, 不勾选, 默认获得全部 11
药剂学文献信息检索策略 Step 1: 由结构信息获取文献 Step 2: 选择 Catagorize 系统分类功能进行筛选 12
药剂学文献信息检索策略 Step 3: 选择 Biotechnology,medicine, 与药剂相关的词条 13
药代动力学文献信息检索策略 Step 1: 由结构信息获取文献 Step 2: 选择 Catagorize 系统分类功能进行筛选 14
药代动力学文献信息检索策略 Step 3: 选择 Biology,Organisms, 获得所有动物模型的研究 15
药理学文献信息检索策略 Step 1: 由结构信息获取文献 Step 2: 选择 analyse, CA section title,pharmacology, 点击 keep analysis 16
药理学文献信息检索策略 获得体外实验文献的检索方法 Step 3: 选择 refine,research topic, 输入 vitro 17
药物构效关系文献检索策略 Step 1: 由结构信息获取文献 Step 2: 选择 refine, 输入 QSAR 进行筛选 18
药物分析学文献信息检索策略 Step 1: 由结构信息获取文献, 选择 analytical study 19
药物分析学文献信息检索策略 Step 2: 选择 analyse,index term 进行筛选, 获得药物检测手 段, 分析方面的文献 20
药物结构检索策略 从结构检索开始, 获得结构信息 Step 1: 点击结构检索, 打开结构面板 21
药效组分成盐检索策略 Step 1: 点击结构检索, 打开结构面板 Step 2: 在结构面板中绘入核心成分, 精确结构检索 22
药效组分成盐检索策略 Step 3: 使用 analyse,refine 筛选结果集 23
药物结构中特定位点上修饰的检索策略 Step 1: 点击结构检索, 打开结构面板 Step 2: 在结构面板中绘入药物结构, 亚结构检索 24
药物结构中特定位点上的修饰的检索策略 Step 3: 点击 refine, 选择 atom attachment 25
药物结构中特定位点上的修饰的检索策略 Step 4: 选择需要修饰的位点, 进行查看 26
药物查新研究需求检索策略 从结构检索开始, 获得结构信息 Step 1: 点击结构检索, 打开结构面板 28
药物查新研究需求检索策略 Step 2: 通过结构面板绘入新化合物结构 在 CAS Registry 数据库中没有找到相关物质, 说明是新化合物 但化合物是新的, 并不代表没有被专利保护, 需要在 Marpat 数据库中进行初步的专利评估 28
药效团拼接检索策略 Step 1: 点击反应检索, 打开结构面板 Step 2: 在结构面板中绘入多个药效团结构 29
药效团拼接检索策略 Step 3: 亚结构检索 Step 4:advanced search 中选择 single component 30
药效团拼接检索策略 Step 5: 使用 analyse,refine 筛选目标物质 31
药物合成反应研究需求检索策略 Step 1: 点击反应检索, 打开结构面板 Step 2: 在结构面板中绘入反应信息 32
药物合成反应研究需求检索策略 Step 3: 利用 SciPlanner 初步设计合成路线 33
药学研究问题的策略总结 Step 1: 对于具体的一个药物, 无论是药物的分析研究, 药理研究, 制剂研究, 药代研究, 构效研究都是从物质检索入手, 链接获得相关的文献 Step 2: 然后通过文献的后处理功能, 分别使用 analyse,refine, 或 catagorize 进行筛选 Step 3: 对于药物化学研究方向, 主要掌握反应的定义, 药效团拼接反应制备的检索, 以及结构修饰的检索策略 34
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中药在 SciFinder 检索时的注意事项 检索举例当归中文学名 : 当归拉丁学名 : Angelica sinensis 有效成分 : 香豆素类化合物 36
中药的检索 从主题词检索开始, 获取文献信息 Step 1: 点击主题词检索, 输入当归的拉丁名称 37
中药中天然组分的检索策略 从结构检索开始, 获取结构信息 Step 1: 点击结构面板, 画入骨架结构, 38
中药在 SciFinder 检索策略总结 Step 1: 对于植物药或中药中的化学成分, 检索方式与西药的检索策略一致, 使用物质检索途径 Step 2: 对于传统的中药, 使用主题词进行检索, 并且使用中药的拉丁名称进行检索 Step3: 对于中药中某一类天然成分的检索, 在结构面板中画入骨架结构进行检索 39
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