R 软件介绍 (3): R编程基础

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1 R 软件介绍 (3):R 编程基础 1 / 33

2 Outline 1 简介 2 选择分支 3 循环 4 编写函数 2 / 33

3 简介 1 简介 2 选择分支 3 循环 4 编写函数 3 / 33

4 简介 R 编程的目的 1 使代码更简洁 2 使代码更稳健 3 使代码运行更快 4 / 33

5 简介基本概念 1 成组表达式 (Grouped expressions) 1 命令可以用大括弧圈在一起 expr 1; ; expr m 2 这一组命令的结果是该组中最后一个命令的值 3 一个组依然是一个表达式, 它就可能放在括弧中, 放在一个更大的表达式中 2 面向对象编程 3 函数式编程 5 / 33

6 选择分支 1 简介 2 选择分支 3 循环 4 编写函数 6 / 33

7 选择分支 条件控制 : if 语句 1 if 语句用法 : if (cond) expr1 1 x <- matrix(1:12, nrow=3) 2 if (isinteger(x)) print("x is a matrix") 1 if-else 语句用法 : if (cond) expr1 else expr2 1 if (r == 4) { 2 x <- 1 3 } else { 4 x <- 3 5 y <- 4 6 } 1 注意 : 大括号的位置 7 / 33

8 向量形式 :ifelse 语句 选择分支 1 ifelse 是 if-else 条件语句的向量形式 2 用法 ifelse(condition, a, b) 3 最终返回一个和最长的参数向量同长的向量 condition[i] 为真时, 该向量对应的元素是 a[i], 否则为 b[i] 1 x <- c(6:-4) 2 sqrt(x) #- gives warning 3 sqrt(ifelse(x >= 0, x, NA)) # no warning 4 # Note: the following also gives the warning! 5 ifelse(x >= 0, sqrt(x), NA) 8 / 33

9 循环 1 简介 2 选择分支 3 循环循环语句向量化 4 编写函数 9 / 33

10 循环 循环语句 循环语句 向量化 10 / 33

11 循环循环语句 for 语句 1 用法 : for(var in seq) expr 2 在 var 访问 seq 所有可以取到的值时, expr 都会运行 1 x <- c(5, 12, 13) 2 for (i in x) print(i^2) 1 例 : 读入多个 csv 文件 11 / 33

12 循环循环语句 while 和 repeat 语句 1 while 语句用法 : repeat expr 2 repeat 语句用法 : while (cond) expr 3 关键字 break 可以用于结束任何循环, 甚至是非常规的 它是结束 repeat 循环的唯一办法 4 关键字 next 可以用来结束一次特定的循环, 然后直接跳入 下一次 循环 12 / 33

13 while 和 repeat 语句例子 循环 循环语句 1 i <- 1 2 while (i <= 10) i <- i i <- 1 6 while(true) { # similar loop to above 7 i <- i+4 8 if (i > 10) break 9 } i < repeat { # again similar 14 i <- i+4 15 if (i > 10) break 16 } 13 / 33

14 循环 向量化 循环语句 向量化 14 / 33

15 循环 向量化 apply 类函数 : R 函数式编程特点之一 1 apply 函数 2 lapply 函数 3 sapply 函数 4 tapply 函数 5 by 函数 6 aggregate 函数 7 15 / 33

16 循环向量化 apply 函数 1 在矩阵的各行或各列上调用指定的函数 2 用法 : apply(x, MARGIN, FUN, ) 3 apply() 函数并不像很多人以为的那样, 能使程序的运行速度加快 4 其优点是使程序更紧凑, 更易于阅读和修改, 并且避免产生使用循环语句时可能带来的 bug 16 / 33

17 循环向量化 apply 函数例子 1 m <- matrix(1:1000, nrow = 10) 2 colmeans(m) 3 apply(m, MARGIN = 2, FUN = mean) 4 5 apply(m, MARGIN = 2, FUN = var) 17 / 33

18 循环向量化 lapply 函数和 sapply 函数 1 这两个函数可以在列表上应用函数 2 用法 : lapply(x, FUN) 3 lapply() ( 代表 list apply) 与矩阵的 apply() 函数的用法相似, 4 对列表 ( 或强制转换 ) 的每个分量执行给定的函数, 并返回另一个列表 5 在某些情况下, lapply() 返回的列表可以转化为矩阵或向量的形式 这时候可以选择使用 sapply() ( 代表 simplified [l]apply) 18 / 33

19 循环 向量化 lapply 函数和 sapply 函数例子 x1 <- 1:10 x2 <- 21:40 x3 <- 101:200 dat3 <- list(x1, x2, x3) mean(dat3[[1]]) mean(dat3[[2]]) lapply(dat3, mean) sd1 <- lapply(dat3, sd) unlist(sd1) sapply(dat3, sd) 19 / 33

20 循环向量化 tapply 函数 1 用于一个向量按照分类变量 ( 因子 ) 分组统计 2 用法 : tapply(v, INDEX, FUN) 3 其中 X 通常是一向量 ; INDEX 是一个列表对象, 且该列表中的每一个元素都是与 X 有同样长度的因子 ; FUN 是需要计算的函数 4 利用 tapply 实现类似于 Excel 里的数据透视表的功能 ( 同时使用多个 ) 20 / 33

21 循环向量化 tapply 函数的例子 1 iris <- readtable(file="clipboard", sep = "\t", header = T) 2 3 mean(iris[iris$species=="a",1]) 4 tapply(iris[,1],iris[,5],mean) 5 tapply(iris[,1],iris[,5],var) 21 / 33

22 循环向量化 by 和 aggregate 函数 1 by( ) 函数用于矩阵或数据框按照分类变量 ( 因子 ) 进行分成子集统计 2 by() 用法 : by(x, INDEX, FUN) 3 aggregate() 函数用于同时对多个向量按照分类变量 ( 因子 ) 进行分组统计 4 aggregate() 用法 : aggregate(x, by, FUN) 5 注意 : aggregate() 中的分类变量要使用列表 (list) 对象类型 22 / 33

23 循环向量化 by 和 aggregate 函数的例子 1 by(iris[,1:4], iris[,5], function(x) mean(asmatrix(x))) 2 3 aggregate(iris[,1:4], list(iris[,5]), mean) 4 aggregate(iris[,1:4], list(iris[,5]), sd) 23 / 33

24 循环 向量化 apply 类函数总结 24 / 33

25 向量化 循环 向量化 1 避免循环, 加快速度 2 简化代码 1 x1 <- 1: x2 < : # for loop 5 y1 <- vector() 6 systemtime(for(i in 1:100000) y1[i] <- x1[i]+x2[i]) 7 8 # vectorize 9 systemtime(y2 <- x1+x2) 25 / 33

26 编写函数 1 简介 2 选择分支 3 循环 4 编写函数 26 / 33

27 编写函数函数概述 1 函数是一种特殊的对象 2 函数主要用于操作处理对象 3 有系统自带函数, 也可以自己定义函数 4 系统自带函数都存放在库 (library) 中 5 一些最基本的系统函数是直接用 C 语言写的, 其他的都是使用 R 语言写的, 使用 R 语言写的和用户自定义函数没有本质区别 27 / 33

28 编写函数几类特殊的函数 1 泛型函数 (generic function): 根据使用的对象不同, 从而得到不同结果的函数称为泛型函数 如 summary 2 置换函数 (replacement functions): 任何左边不是变量名的赋值语句都可以看作是 " 置换函数 " 如 " [<- ", " names<- " 3 二元运算符 : 具有 %anything% 的形式 4 匿名函数 : 没有指定函数名的函数 28 / 33

29 编写函数函数的基本操作 1 查看函数内容 : 输入函数名称, page() 在新窗口中查看 2 修改函数内容 : edit() 3 查看函数的参数 : formals(), 查看函数的主体 : body() 4 查看泛型函数的所有具体函数 : methods() 29 / 33

30 编写函数编写自定义函数 1 R 语言允许用户创建自己的函数 (function) 对象 2 自定义函数是通过下面的语句形式定义的 : name <- function(arg1, arg2, ) expression 1 其中 arg1, arg2 是参数, expression 是成组表达式 2 参数可以被设定一些默认值 使用函数时如果默认值适合你要做的事情, 则可以省略这些参数 30 / 33

31 编写函数函数返回值 1 函数的返回值可以是任何 R 对象 尽管返回值通常为列表形式, 其实返回值甚至可以是另一个函数 2 可以通过显式地调用 return(), 把一个值返回给主调函数 3 如果不使用这条语句, 默认将会把最后执行的语句的值作为返回值 31 / 33

32 返回值的例子 编写函数 1 oddcount1 <- function(x) { 2 k <- 0 3 for (n in x) { 4 if (n %% 2 == 1) k <- k+1 # 计算奇数的个数 5 } 6 return(k) 7 } 8 9 oddcount2 <- function(x) { 10 k < for (n in x) { 12 if (n %% 2 == 1) k <- k+1 13 } 14 k 15 } oddcount3 <- function(x) { 18 k < for (n in x) { 20 if (n %% 2 == 1) k <- k+1 21 }} 32 / 33

33 编写函数函数式编程 R 中函数式编程三种工具 : 1 匿名函数 2 函数列表 3 闭包 33 / 33

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