S04.FIT)
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1 第 14 卷 第 6 期 生 命 科 学 研 究 灾 燥 造 援 员 4 晕 燥 援 6 圆 园 10 年 12 月 蕴 蚤 枣 藻 杂 糟 蚤 藻 灶 糟 藻 砸 藻 泽 藻 葬 则 糟 澡 Dec. 圆 园 10 RecA 蛋 白 介 导 的 小 粒 野 生 稻 STK 类 抗 性 基 因 富 集 文 库 的 构 建 韩 小 霞 袁 崔 玲 玲 2 袁 唐 丽 3 袁 陶 小 平 2 袁 邢 俊 杰 袁 3 袁 李 丁 袁 谢 灵 灵 袁 贺 荣 华 袁 左 佳 袁 曹 孟 良 袁 3* (1. 中 南 大 学 研 究 生 院 隆 平 分 院, 中 国 湖 南 长 沙 ;2. 湖 南 隆 平 高 科 基 因 科 技 有 限 公 司, 中 国 湖 南 长 沙 ; 3. 国 家 杂 交 水 稻 工 程 技 术 研 究 中 心, 中 国 湖 南 长 沙 ) 摘 要 院 利 用 RecA 蛋 白 的 同 源 重 组 特 性 袁 以 生 物 素 标 记 的 STK 类 抗 性 基 因 PCR 扩 增 产 物 为 探 针 袁 对 小 粒 野 生 稻 DNA 文 库 进 行 富 集 袁 构 建 了 库 容 量 为 1710 个 的 STK 类 抗 性 基 因 富 集 文 库 袁 通 过 菌 落 原 位 杂 交 筛 选 获 得 21 个 阳 性 克 隆. 其 中 10 个 阳 性 克 隆 进 行 了 两 端 测 序 袁 生 物 信 息 学 分 析 表 明 院 有 3 个 阳 性 克 隆 可 分 别 定 位 于 粳 稻 抗 性 基 因 附 近 和 抗 性 基 因 内 袁 可 能 是 新 的 候 选 抗 性 基 因 曰 有 2 个 阳 性 克 隆 可 以 在 粳 稻 上 定 位 袁 但 周 围 无 抗 性 基 因 片 段 曰 其 它 5 个 阳 性 克 隆 由 于 与 栽 培 稻 有 多 处 匹 配 袁 不 能 精 确 定 位. 关 键 词 院 RecA 蛋 白 曰 小 粒 野 生 稻 曰 菌 落 原 位 杂 交 曰 抗 性 基 因 曰 富 集 文 库 中 图 分 类 号 院 Q781 文 献 标 识 码 院 A 文 章 编 号 院 1007 鄄 7847 渊 2010 冤 06 鄄 0480 鄄 05 RecA Protein 鄄 mediated Enrichment Library Construction of Oryza minuta STK Class Resistance Genes HAN Xiao 鄄 xia 1,2,CUI Ling 鄄 ling 2,TANG Li 3,TAO Xiao 鄄 ping,xing Jun 鄄 jie 1,2,3, LI Ding 1,2,XIE Ling 鄄 ling 1,2,HE Rong 鄄 hua 1,2,ZUO Jia 1,2,CAO Meng 鄄 liang 1,2,3* (1. Longping Branch of Graduate School,Central South University,Changsha ,Hunan,China; 2. Hunan Yuan Longping Agricultural Hi 鄄 tech Gene Co.,Ltd.,Changsha ,Hunan,China; 3. China National Hybrid Rice R&D Center,Changsha ,Hunan,China) Abstract:By using the RecA protein in homologous recombination system and the PCR products of STK type biotin 鄄 labeled resistance genes as probe,an enriched library of Oryza minuta STK class resistance genes was constructed with acapacity of 1710 clones. 21 positive clones were screened by in situ hybridi 鄄 zation and 10 of them were terminally sequenced. By bioinformatic analysis,3 clones were well matched with cloned japonica rice resistance genes or located near by resistance genes,indicating they are possible candidate resistance genes;2 clones can be mapped in the japonica rice genome,without flanking by resistance gene fregments. The other 5clones can not be mapped into the cultivated rice genome because of mutiple matches. Key words:reca protein;oryza minuta;colony in situ hybridization;resistance genes;enriched library (Life Science Research,2010,14(6):480 耀 484) 收 稿 日 期 院 2010 鄄 06 鄄 29; 修 回 日 期 院 2010 鄄 11 鄄 01 基 金 项 目 院 国 家 973 项 目 (2007CB109007); 国 家 863 重 点 项 目 (2006AA100101); 国 家 科 技 支 撑 计 划 项 目 (2007BAD77B00); 国 家 转 基 因 重 大 专 项 项 目 (2008ZX08001, 2009ZX08001 鄄 010B) 作 者 简 介 院 韩 小 霞 (1979 鄄 ), 女, 山 东 潍 坊 人, 博 士 研 究 生, 主 要 从 事 植 物 分 子 生 物 学 研 究,E 鄄 mail:xiaoxiahan54@gmail.com; * 通 讯 作 者 : 曹 孟 良 (1965 鄄 ), 男, 湖 南 长 沙 人, 中 南 大 学 教 授, 博 士 生 导 师, 主 要 从 事 植 物 分 子 生 物 学 及 作 物 遗 传 育 种 方 面 的 研 究,E 鄄 mail: mlcao@hhrrc.ac.cn.
2 第 6 期 韩 小 霞 等 院 RecA 蛋 白 介 导 的 小 粒 野 生 稻 STK 类 抗 性 基 因 富 集 文 库 的 构 建 481 小 粒 野 生 稻 (OR. Minuta)( 4n=48,BBCC) 原 产 于 亚 洲, 主 要 分 布 于 马 来 西 亚 菲 律 宾 和 印 度 尼 西 亚. 由 于 长 期 处 于 野 生 状 态, 经 受 了 各 种 逆 境 的 选 择, 具 备 对 多 种 病 虫 害 的 抗 性. 目 前 小 粒 野 生 稻 对 褐 飞 虱 白 飞 虱 黑 尾 叶 蝉 稻 蓟 马 稻 瘟 病 二 化 螟 白 叶 枯 病 纹 枯 病 和 细 菌 性 条 斑 病 的 抗 性 均 已 得 到 鉴 定, 是 栽 培 稻 抗 性 育 种 的 咱 1 暂 优 良 材 料 年 Clark 和 Magulies 在 研 究 大 肠 杆 菌 的 同 源 重 组 和 DNA 损 伤 修 复 时, 发 现 了 RecA 咱 2 暂 咱 3 暂 蛋 白. RecA 蛋 白 是 一 种 DNA 结 合 蛋 白, 由 352 个 氨 基 酸 编 码, 相 对 分 子 质 量 为 , 等 电 点 为 5.2. RecA 蛋 白 具 有 重 组 酶 活 性 和 ATP 酶 咱 4 暂 活 性, 能 特 异 地 识 别 单 链 DNA, 并 能 将 其 与 同 源 双 螺 旋 中 的 互 补 序 列 退 火, 同 时 将 另 一 条 链 咱 5 暂 排 挤 出 去, 形 成 所 谓 D 环 (D 鄄 loop). 利 用 RecA 蛋 白 可 诱 导 单 链 DNA 与 其 同 源 双 链 DNA 配 对, 在 酌 鄄 s 鄄 ATP 存 在 条 件 下 形 成 稳 定 的 异 源 三 链 结 构 的 特 性, 通 过 单 链 探 针 的 富 集, 将 含 同 源 区 的 片 段 或 质 粒 浓 度 提 高, 从 而 大 大 减 少 后 期 文 库 筛 选 的 工 作 量. 本 实 验 室 利 用 RecA 蛋 白 的 同 源 重 组 特 性, 将 候 选 抗 性 基 因 克 隆 技 术 与 磁 珠 富 集 文 库 技 术 相 结 合, 根 据 已 克 隆 植 物 STK 类 抗 性 基 因 的 氨 基 酸 保 守 结 构 域 设 计 引 物,PCR 扩 增 获 得 探 针, 构 建 了 小 粒 野 生 稻 STK 类 抗 性 基 因 富 集 文 库, 并 进 一 步 通 过 菌 落 原 位 杂 交 筛 选 获 得 阳 性 克 隆, 对 其 进 行 两 端 测 序, 生 物 信 息 学 比 对, 确 定 阳 性 克 隆 在 栽 培 稻 上 的 定 位 信 息, 最 后 将 其 转 化 并 进 行 田 间 表 型 鉴 定, 验 证 功 能. 1 材 料 与 方 法 1.1 材 料 小 粒 野 生 稻 基 因 组 液 体 文 库 ( 本 实 验 室 用 双 元 可 转 化 载 体 pcambia1301 自 行 构 建 ). 1.2 菌 株 和 试 剂 农 杆 菌 EHA105 菌 株, 大 肠 杆 菌 DH10B 菌 株, 均 为 本 实 验 室 保 存. QIAEX 域 胶 纯 化 试 剂 盒 和 Plasmid Midi Kit 质 粒 纯 化 试 剂 盒 均 购 自 Qiagen, 酌 鄄 s 鄄 ATP 购 自 Sigma 公 司,RecA 蛋 白 生 物 素 标 记 探 针 杂 交 检 测 试 剂 盒 NEBlot Phototope Kit 和 显 色 试 剂 盒 Phototope 鄄 Star Detection Kit 购 自 NewEngland BioLabs 公 司 ;Hybond 鄄 N+ membranes 购 自 Amersham Biosciences 公 司 ;Biotin 鄄 21 鄄 dutp Taq DNA 聚 合 酶 EcoR 吁 限 制 性 内 切 酶 购 自 Takara 公 司. 磁 力 架 购 自 Promega 公 司, 其 它 生 化 试 剂 均 购 自 Amresco 公 司. 1.3 方 法 引 物 设 计 引 物 设 计 靶 标 序 列 参 考 水 稻 STK 类 抗 性 基 咱 6 暂 因 蛋 白 序 列 氨 基 酸 保 守 结 构 域, 上 下 游 结 构 域 分 别 为 :FG(K/V/I/S)VY(K/R)G 和 D(V/I)YS (F/Y)G(V/I/M), 结 合 普 通 野 生 稻 密 码 子 使 用 频 率 及 水 稻 STK 类 抗 性 基 因 密 码 子 使 用 偏 好 性 设 计. STK 类 抗 性 基 因 上 游 引 物 :STK1f1:5 忆 鄄 TTC GGC AAG GTG TAC AAG GG 鄄 3 忆 ;STK1f2: 5 忆 鄄 TTC GGC AAG GTG TAC AAA GG 鄄 3 忆 ; STK1f3:5 忆 鄄 TTC GGC AAG GTC TAC AAG GG 鄄 3 忆 ;STK1f4:5 忆 鄄 TTC GGC ATC GTG TAC AAG GG 鄄 3 忆.STK 类 抗 性 基 因 下 游 引 物 :STK1r1:5 忆 鄄 AT GCC GAA GCT GTA GAT GTC 鄄 3 忆 ;STK1r2: 5 忆 鄄 AT GCC GAA GCT GTA GAT ATC 鄄 3 忆 ;STK1r3: 5 忆 鄄 AT GCC GAA GCT GTA CAC GTC 鄄 3 忆 ;STK1r4: 5 忆 鄄 AT GCC GAA GCT GTA GAC GTC 鄄 3 忆. 分 别 将 STK1f1 STK1f2 STK1f3 和 STK1f4 等 量 混 合 作 为 上 游 引 物, 将 STK1r1 STK1r2 STK1r3 和 STK1r4 等 量 混 合 作 为 下 游 引 物 富 集 文 库 筛 选 探 针 的 制 备 咱 7 暂 利 用 CTAB 法 提 取 小 粒 野 生 稻 基 因 组 DNA, 作 为 制 备 探 针 的 模 板. 探 针 模 板 制 备 PCR 反 应 体 系 为 25 滋 L:ddH 2 O17.25 滋 L,DNA 模 板 1 滋 L (50 ng), 10 伊 PCR buffer( 含 Mg 2+ )2.5 滋 L,10 mmol/ldntps 2 滋 L,5 滋 mol/l 的 上 下 游 引 物 各 1.0 滋 L,5 U/ 滋 LTaq 酶 0.25 滋 L. PCR 扩 增 条 件 为 :95 益 预 变 性 3min,95 益 变 性 1min,55 益 退 火 40 s,72 益 延 伸 1min, 共 34 个 循 环, 最 后 72 益 延 伸 7min. PCR 扩 增 产 物 经 1.5% 琼 脂 糖 凝 胶 电 泳 分 离, 用 QIAGEN 胶 回 收 试 剂 盒 回 收 目 标 片 段, 再 以 回 收 片 段 作 为 探 针 制 备 模 板, 探 针 制 备 PCR 反 应 体 系 为 50 滋 L:ddH 2 O29.5 滋 L, DNA 模 板 2 滋 L(100 ng),10 伊 PCR buffer( 含 Mg 2+ ) 5.0 滋 L,10 mmol/ldntps 4 滋 L,10 mmol/l Biotin 鄄 21 鄄 dutp 5 滋 L,5 滋 mol/l 上 下 游 引 物 各 2.0 滋 L, 5U/ 滋 LTaq 酶 0.5 滋 L. 反 应 程 序 参 照 模 板 制 备 程 序, 其 中 延 伸 时 间 由 1min 延 长 为 2min. PCR 反 应 产 物 用 QIAGEN 胶 回 收 试 剂 盒 回 收, 并 检 测 调 整 探 针 浓 度 至 50 mg/l.
3 482 生 命 科 学 研 究 圆 园 10 年 富 集 效 率 的 检 测 富 集 效 率 检 测 参 照 试 剂 盒 RecActive TM Gene Enrichment Kit 提 供 的 方 法 ( 略 有 改 动 ) 进 行. 设 置 1 颐 内 参 文 库, 采 用 长 度 分 别 为 bp 的 生 物 素 标 记 探 针 检 测 富 集 效 率 富 集 文 库 的 构 建 富 集 文 库 构 建 步 骤 参 照 试 剂 盒 RecActive TM Gene Enrichment Kit 提 供 的 方 法 ( 略 有 改 动 ) 进 行. 获 得 的 富 集 液 体 文 库 转 化 DH10B 感 受 态 细 胞. 挑 取 单 克 隆 并 培 养 于 384 孔 板, 获 得 基 因 组 富 集 平 板 文 库. 为 提 高 富 集 效 率, 采 用 Plasmid Midi Kit 质 粒 纯 化 试 剂 盒 回 收 全 部 克 隆, 按 照 上 述 方 法 进 行 二 次 富 集 菌 落 原 位 杂 交 筛 选 富 集 文 库 杂 交 筛 选 探 针 制 备 模 板 同 富 集 探 针 制 备 模 板, 杂 交 探 针 标 记 步 骤 和 富 集 文 库 筛 选 步 骤 参 考 Biolabs 公 司 的 NEBlot Phototope Kit 及 Phototope 鄄 咱 8 暂 Star Detection Kit 试 剂 盒 ( 略 有 改 动 ) 进 行 富 集 阳 性 克 隆 的 鉴 定 及 序 列 分 析 采 用 EcoR 吁 酶 切 鉴 定 阳 性 克 隆, 并 挑 取 酶 切 图 谱 不 同 的 克 隆 进 行 两 端 测 序, 结 果 用 NCBI 数 据 库 Blast 软 件 与 已 测 序 水 稻 序 列 进 行 比 对 分 析. 2 结 果 与 分 析 2.1 探 针 的 制 备 与 检 测 采 用 STK 类 抗 性 基 因 上 下 游 混 合 引 物 扩 增 小 粒 野 生 稻 DNA, 扩 增 产 物 胶 回 收 后 浓 度 调 至 50 mg/l, 做 为 生 物 素 标 记 探 针 制 备 的 模 板, PCR 扩 增 获 得 长 度 约 500 bp 的 生 物 素 标 记 探 针 ( 见 图 1), 并 将 其 纯 化, 浓 度 调 至 50 mg/l 备 用. 1 2 bp 2.2 富 集 效 率 的 检 测 利 用 自 制 的 内 参 文 库 和 长 度 分 别 为 625 bp 和 396 bp 的 探 针 进 行 富 集, 通 过 多 次 富 集 表 明 两 种 探 针 富 集 效 率 相 差 不 大, 均 稳 定 在 3000 耀 5000 之 间. 故 采 用 二 次 富 集 的 方 法, 以 提 高 富 集 效 率. 2.3 富 集 文 库 的 制 备 和 阳 性 克 隆 的 获 得 通 过 二 次 富 集 的 方 法, 获 得 库 容 量 为 1710 的 富 集 文 库. 对 富 集 文 库 用 菌 落 原 位 杂 交 法 筛 选, 获 得 20 个 阳 性 克 隆 ( 见 图 2). 图 2 小 粒 野 生 稻 部 分 富 集 文 库 杂 交 检 测 结 果 1 院 探 针 模 板 阳 性 对 照 曰 2 院 小 粒 野 生 稻 富 集 文 库 384 孔 板 原 位 杂 交. Fig.2 Part of the Minuta enriched library hybridization results 1:The probe template positive control;2:384 鄄 pore plate in situ hybridization of the minuta enrichments. 2.4 富 集 阳 性 克 隆 的 酶 切 分 析 挑 取 阳 性 克 隆 扩 增 并 小 规 模 抽 提 质 粒, 经 EcoR 吁 酶 切 后 1% 琼 脂 糖 电 泳 并 进 行 酶 切 图 谱 分 析 ( 图 3). 20 个 阳 性 克 隆 经 酶 切 验 证 后, 去 重 复, 获 得 10 个 阳 性 克 隆, 编 号 分 别 为 XES3 鄄 1E4 XES3 鄄 1F17 XES3 鄄 1G16 XES3 鄄 1K18 XES3 鄄 3B6 ES3 鄄 3H18 XES3 鄄 3M6 XES3 鄄 4B6 XES3 鄄 4H3 XES3 鄄 5D 图 1 STK 生 物 素 标 记 探 针 电 泳 检 测 1 院 Marker 玉 曰 2 院 STK 生 物 素 标 记 探 针. Fig.1 Electrophoresis test of STK biotin 鄄 labeled probe 1:Marker 玉 ;2:STK biotin 鄄 labeled probe. 图 3 部 分 阳 性 克 隆 文 库 质 粒 EcoR 吁 酶 切 1% 琼 脂 糖 凝 胶 电 泳 1 院 1 耀 10 kb Marker 曰 2 院 pcambia1301 空 载 体 EcoR 吁 酶 切 曰 3 耀 10 院 部 分 阳 性 克 隆 EcoR 吁 酶 切 曰 11 院 Lambda DNA/ Hind 芋 Marker. Fig.3 Part of positive clones digested by EcoRV and their electrophoresis in 1% agaros 1: 1 耀 10 kb Marker; 2: pcambia1301 by EcoR 吁 restriction digestion;3 耀 10:part of genomic plasmids by EcoR 吁 restriction digestion;11:lambda DNA /Hind 芋 Marker.
4 第 6 期 韩 小 霞 等 院 RecA 蛋 白 介 导 的 小 粒 野 生 稻 STK 类 抗 性 基 因 富 集 文 库 的 构 建 富 集 阳 性 克 隆 的 测 序 分 析 对 阳 性 克 隆 进 行 两 端 测 序, 序 列 与 栽 培 稻 序 列 进 行 比 对, 结 果 表 明 :XES3 鄄 1G16 XES3 鄄 1E4 XES3 鄄 3B6 XES3 鄄 3H18 和 XES3 鄄 4H3 可 以 定 位 于 粳 稻 相 应 染 色 体 区 段,XES3 鄄 1K18 XES3 鄄 4B6 XES3 鄄 3M6 XES3 鄄 5D3 XES3 鄄 1F17 由 于 与 粳 稻 有 多 处 匹 配, 无 法 精 确 定 位. 在 上 述 5 个 可 以 定 位 的 阳 性 克 隆 中,XES3 鄄 1G16 XES3 鄄 1E4 和 XES3 鄄 3H18 可 定 位 于 粳 稻 抗 性 基 因 附 近 或 抗 性 基 因 内, 可 能 为 新 的 候 选 抗 病 基 因,XES3 鄄 4H3 XES3 鄄 3B6 可 以 在 粳 稻 上 定 位, 但 周 围 无 抗 性 基 因 片 段. 其 中 XES3 鄄 1G16 左 端 与 XES3 鄄 3H18 右 端 均 可 定 位 于 粳 稻 第 5 染 色 体 > ref NC_ 鄄 区 段, BLAST2 软 件 分 析 两 端 序 列, 结 果 表 明 2 个 克 隆 应 该 是 同 一 片 段 以 不 同 方 向 插 入 载 体 造 成 的. 该 定 位 区 段 包 括 基 因 Os05g 末 端 1kb 片 断,Os05g 注 释 为 蛋 白 激 酶, 含 有 STK 保 守 结 构 域 ; 定 位 点 下 游 6.6 kb 处 有 基 因 Os05g , 该 基 因 含 有 抗 性 基 因 候 选 片 段 ; 两 者 另 一 端 与 栽 培 稻 序 列 均 无 匹 配, 推 断 该 克 隆 极 有 可 能 包 含 抗 性 基 因. XES3 鄄 1E4 可 定 位 于 粳 稻 第 6 染 色 体 >ref NC_ 鄄 之 间, 而 鄄 之 间 基 因 Os06g 为 候 选 抗 性 基 因, 此 克 隆 含 有 此 抗 性 基 因 约 1.3 kb 的 编 码 区 片 断, 因 此 该 克 隆 可 能 为 新 的 候 选 抗 性 基 因. 另 外 两 个 阳 性 克 隆 XES3 鄄 4H3 XES3 鄄 3B6 均 可 定 位 于 粳 稻 第 6 染 色 体 >ref NC_ 鄄 区 段, BLAST2 软 件 分 析 表 明 此 两 克 隆 是 同 一 片 断 正 反 插 入 载 体 造 成 的, 定 位 区 段 包 括 基 因 Os06g 的 全 部 和 Os06g 基 因 的 大 部 分 序 列, 两 基 因 注 释 均 为 假 定 的 保 守 蛋 白, 但 保 守 结 构 域 分 析 表 明 两 基 因 并 不 含 STK 结 构 域. 5 个 不 能 在 栽 培 稻 上 精 确 定 位 的 阳 性 克 隆 中,XES3 鄄 1K18 XES3 鄄 4B6 XES3 鄄 3M6 XES3 鄄 5D3 两 端 与 粳 稻 均 有 多 处 匹 配,XES3 鄄 1F17 左 端 与 粳 稻 有 多 处 高 匹 配, 右 端 与 栽 培 稻 序 列 无 匹 配. 3 讨 论 基 于 RecA 的 富 集 文 库 构 建 技 术 建 立 和 完 善 经 历 了 一 系 列 过 程. 早 在 1986 年 Rigas 利 用 RecA 的 重 组 特 性, 采 用 生 物 素 标 记 的 探 针 筛 选 质 粒 文 库, 这 是 RecA 蛋 白 用 于 文 库 筛 选 的 初 次 咱 9 暂 报 道. Honiberg 利 用 RecA 的 重 组 特 性, 对 同 源 双 链 DNA 筛 选, 建 立 了 富 集 方 法, 随 着 研 究 的 深 入 该 技 术 得 到 不 断 细 化 和 优 化, 并 被 广 泛 应 咱 10~14 暂 用 于 文 库 和 双 链 DNA 的 筛 选 年 Active motif 公 司 推 出 RecActive TM Gene Enrichment Kit 试 剂 盒, 为 研 究 者 提 供 了 一 种 全 新 高 效 的 从 文 库 溶 液 中 快 速 分 离 和 富 集 目 的 基 因 或 基 因 组 DNA 克 隆 的 手 段. 本 研 究 中 的 方 法 正 是 参 考 该 试 剂 盒, 经 过 多 次 试 验 验 证 形 成 的 技 术 路 线, 但 富 集 效 率 低 于 RecActive TM Gene Enrichment Kit 试 剂 盒, 故 采 用 二 次 富 集 以 提 高 富 集 效 率. 应 用 该 技 术 只 需 知 道 目 的 基 因 的 很 短 的 序 列 ( 约 200 耀 600 bp), 制 备 成 生 物 素 标 记 的 双 链 DNA 探 针. RecA 蛋 白 介 导 探 针 DNA 与 文 库 中 目 的 基 因 形 成 互 补 DNA D 鄄 loop 结 构, 再 加 入 链 霉 亲 和 素 包 被 的 磁 珠, 即 可 用 磁 力 架 捕 获 目 的 基 因. 目 的 基 因 经 转 化 和 分 离 培 养 后, 可 得 到 大 量 含 有 目 的 序 列 的 克 隆, 经 菌 落 原 位 杂 交 筛 选, 即 可 进 一 步 获 得 目 的 基 因 克 隆. 本 研 究 直 接 采 用 STK 类 抗 性 基 因 PCR 回 收 产 物 为 探 针, 与 以 STK 类 抗 性 基 因 TA 克 隆 为 探 针 相 比, 省 去 了 繁 琐 的 TA 克 隆 制 备 和 测 序 工 作, 也 增 加 了 产 物 的 不 可 预 测 性, 本 实 验 室 对 以 TA 克 隆 制 备 探 针 获 得 的 阳 性 克 隆 进 行 测 序, 结 果 表 明 测 序 的 5 个 克 隆 中 有 4 个 含 有 抗 性 基 因 咱 15 暂 的 保 守 序 列, 说 明 以 包 含 抗 性 基 因 片 段 的 TA 克 隆 为 探 针, 具 有 效 率 高, 目 标 明 确 的 优 点. 而 直 接 以 PCR 扩 增 产 物 为 探 针, 则 增 加 了 产 物 的 不 可 预 测 性, 但 同 时 也 增 加 了 获 得 新 的 抗 性 基 因 的 可 能 性. 对 获 得 的 阳 性 克 隆, 本 研 究 进 行 了 生 物 信 息 学 方 面 的 分 析, 确 定 3 个 阳 性 克 隆 为 新 的 候 选 抗 咱 16 袁 17 暂 病 基 因. 鉴 于 水 稻 白 叶 枯 和 稻 瘟 病 病 害 流 行, 研 究 条 件 也 比 较 成 熟, 我 们 计 划 重 点 对 该 3 个 克 隆 进 行 转 化 工 作, 并 对 转 基 因 植 株 进 行 田 间 白 叶 枯 接 种 鉴 定 和 室 内 稻 瘟 病 接 种 鉴 定, 以 期 获 得 抗 性 转 基 因 植 株. 参 考 文 献 渊 References 冤 院 [1] 曹 孟 良. 利 用 全 基 因 组 基 因 嵌 入 突 变 体 库 发 掘 野 生 稻 有 利 基 因 及 其 超 级 杂 交 稻 分 子 育 种 应 用 [J]. 分 子 植 物 育 种 (CAO Meng 鄄 liang. Strategies on exploring the favorable genes of wild rice and developing super hybrid rice based on whole 鄄 genome knock 鄄 in mutant library[j]. Molecular Plant Breed 鄄
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供 试 材 料 试 验 试 剂 和 仪 器 基 因 组 提 取 分 析 方 法 反 应 体 系 最 佳 配 比 的 筛 选 退 火 温 度 对 扩 增 效 果 的 影 响
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