List of 107 sorghum accessions selected for the construction of sorghum diversity research set (SDRS) (Shehzad et al

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1 Supplementary Tables Supplementary Table 1. List of 107 sorghum accessions selected for the construction of sorghum diversity research set (SDRS) (Shehzad et al. 2009a) No. ID S.No. Stock Cultivar Name Origin Geography No. 1 3(TD) E 9 Chad Africa 2 6(JP) OOTOYO-MURA ZAIRAI Japan East Asia 3 7(KR) HANGETSUTOSUI Korea East Asia 4 10(KR) KOUSHUU ZAIRAISHU Korea East Asia 5 11(KR) CHAL WAXY SORGHUM Korea East Asia 6 20(CN) AI HUI China East Asia 7 27(IN) Y. E. (I. P.) INT. TYPE India South Asia 8 30(MA) AIT BRAHIM Morocco Africa 9 31(MA) CODY Morocco Africa 10 32(MA) KOURNIANIA Morocco Africa 11 33(MA) PHATSAI Morocco Africa 12 35(MA) SCHROCK Morocco Africa 13 38(ZA) ESHOME S.Africa Africa 14 46(PK) COL/PAK/1989/IBPGR/2386(2) Pakistan South Asia 15 53(NG) ZA113 DAWA PAS PARA Nigeria Africa 16 54(IR) PI VULGARE Iran Southwest Asia 17 57(JP) TAKAKIMI Japan East Asia 18 60(PK) COL/PAK/1991/IBPGR/2724(2) Pakistan South Asia 19 63(SD) HEGARI MALOWAR Sudan Africa 20 65(ZA) E 232 INGWARUMA PEARLY S.Africa Africa 21 66(ZA) AW 70/12 DL/59/1532 S.Africa Africa 22 67(ZA) E 233 BARNARD RED S.Africa Africa 23 70(JP) IKEDACHO MATSUO ZAIRAI Japan East Asia 24 77(IN) KALJANPUR India South Asia 25 79(NP) EC Nepal South Asia 26 80(NP) JUNELO Nepal South Asia 27 81(DZ) MN 401 Algeria Africa 28 84(SD) DINDERAWI 1 Sudan Africa 29 86(ZA) RED KAFIR S.Africa Africa 30 88(TD) PI Chad Africa 31 89(AF) PI Q 2/3/56 Afghanistan South Asia 32 90(IN) SC NO.0217 CI1197 India South Asia 33 91(JP) KOUCHI OUKAWA ZAIRAI Japan East Asia 34 92(LS) MAKHOTLONG I Lesotho Africa 35 93(CN) NUO GAO LIANG China East Asia 36 97(CN) ER BAI SHE YAN China East Asia 37 98(JP) DANGOMOROKOSHI Japan East Asia (JP) TOKIBI Japan East Asia (PK) COL/PAK/1989/IBPGR/2420(1) Pakistan South Asia (PK) COL/PAK/1989/IBPGR/2427(5) Pakistan South Asia (PK) COL/PAK/1989/IBPGR/2439(1) Pakistan South Asia (PK) COL/PAK/1989/IBPGR/2444(1) Pakistan South Asia (PK) COL/PAK/1989/IBPGR/2550(1) Pakistan South Asia (PK) COL/PAK/1989/IBPGR/2553(4) Pakistan South Asia (PK) COL/PAK/1989/IBPGR/2411(1) Pakistan South Asia (JP) HIMEKI ZAIRAI Japan East Asia (JP) KIKUCHI ZAIRAI Japan East Asia (IN) GOOSENECK India South Asia (PK) COL/PAK/1989/IBPGR/2416(2) Pakistan South Asia (PK) COL/PAK/1989/IBPGR/2592(7) Pakistan South Asia

2 (List of SDRS continue) No. ID S.No. Stock Cultivar Name Origin Geography No (UG) S. VULGARE Uganda Africa (UG) S. VULGARE Uganda Africa (KR) KOUBOUSHI Korea East Asia (SD) REDBINE 655 Sudan Africa (ET) MORABA 74 Ethiopia Africa (ET) THIBA RED Ethiopia Africa (UG) E 276 FRAMIDA Uganda Africa (SD) E 1089 Sudan Africa (IN) MARIANGARIJORA MUDDAHIHAL India South Asia (JP) AKAHO Japan East Asia (KH) BATTANBAN Cambodia Southeast Asia (NG) AS 4547 JARDIRA Nigeria Africa (JP) KANAGAWAZAIRAI Japan East Asia (IN) DHOOTI ANEHULA India South Asia (IN) RABI YANGAR JORA MITHUGADUR India South Asia (IL) HAZERA 6014 Israel Southwest Asia (KE) AKLMOI WHITE Kenya Africa (SD) LAMBAS Sudan Africa (SD) DINDERAWI 1 Sudan Africa (SD) WAD UMM BENEIN Sudan Africa (SD) MUGBASH WHITE Sudan Africa (ZA) S.BASUTORUM DL/60/97 S.Africa Africa (ZA) EAR FROM PIETESBURG DL/60/107 S.Africa Africa (ZW) WAD YABOO 132/53 Zimbabwe Africa (ZW) CAPE COLO 28/53 Zimbabwe Africa (NG) MN 1277 MUHEYAR Nigeria Africa (AF) PI Q2/3/56 Afghanistan South Asia (CN) LIAOZA 1 China East Asia (KR) MOCTAC LOCAL Korea East Asia (SD) B-112 Sudan Africa (KR) SENKINHAKU Korea East Asia (MM) AS 5781 HUAN SA PHAUNG AH LPYSU Myanmar Southeast Asia (IN) AS 4136 MASAKA LUWEMEA India South Asia (ET) SC112 Ethiopia Africa (ET) GIZA 3/59 Ethiopia Africa (UG) UGANDA L1 Uganda Africa (TZ) AS 4637 NHORONGO NENPI Tanzania Africa (TZ) E 37 Tanzania Africa (ZW) TSETA LOCAL NATURE TYPE 27/51 Zimbabwe Africa (CG) E 17 Congo Africa (NG) KA 24 Nigeria Africa (KR) CHOONCHAN LOCAL Korea East Asia (CN) BIG WHITE HULL China East Asia (CN) XIONG YUE 334 China East Asia (LS) TENANT WHITE Lesotho Africa (LS) NYAKASOBA BEST Lesotho Africa (TW) Taiwan East Asia (JP) Japan East Asia (PK) Pakistan South Asia (PK) Pakistan South Asia (SD) E 1091 Sudan Africa (SD) TONJI Sudan Africa (ET) PI Ethiopia Africa (KE) E 959 Kenya Africa (KE) PI C Kenya Africa (CF) MILO PET. 139/51 EX TANGANYIKA Central Africa Africa (BD) ALLAKH Bangladesh South Asia

3 Supplementary Table 2 Chemical properties of the contaminated soil Parameter Soil ph (H 2 O) Value 4.5 Soil ph (KCl) 4.1 C/N (%) N HCl-extractable Cd (mg/kg) N HCl-extractable Cd (mg/kg) 2.24

4 Supplementary Table 3 Correlation between Cd concentrations in the parts of shoots measured in 2013 and a) One month after planting 2014 LB 2014 LS 2013 LB 0.63** 2013 LS 0.77** b) Two months after planting 2014 LB 2014 LS 2014 NO 2013 LB 0.47* 2013 LS 0.37* 2013 NO 0.27 c) After heading 2014 LB 2014 LS 2014 NO 2014 PA 2013 LB 0.79** 2013 LS 0.96** 2013 NO 0.82** 2013 PA 0.82** * Significant at P = ** Significant at P = LB, leaf blade; LS, leaf sheath; NO, nodes and internodes; PA, panicles.

5 Supplmentary Table 4 Correlations in Cd concentrations of plant parts between twomonth-old plants (2M) and plants after heading (AH). 2M LB 2M LS 2M NO AH LB 0.46** 0.51** 0.36* AH LS 0.33* 0.57** 0.48** AH NO 0.53** 0.66** 0.59** AH PA ** 0.37* * Significant at P = ** Significant at P = LB, leaf blade; LS, leaf sheath; NO, nodes and internodes; PA, panicles.

6 Supplementary Figure Captions Supplementary Fig. 1 Structure analysis using burn-in length of 10 5 and MCMC cycles of 10 6 classified the population into three sub-populations (J), where J is varied from 1 to 10. Circles represent independent runs for each value of J. Each run for J was repeated three times. Supplementary Fig. 2 Linkage disequilibrium (LD) plot generated by 181 SSR loci. Each cell represents the relationship between two markers with color codes showing the level of significance. Supplementary Fig. 3 Cd concentrations (μg g 1 dry wt.) in the fourth leaves of 106 sorghum varieties grown under hydroponic conditions. The numbers at left indicate the SDRS landraces and BTx623 (BTx). Error bars represent ±SE (n = 5). Supplementary Fig. 4 Correlation between Cd concentrations in the xylem sap and the fourth leaves a) plants grown under hydroponic conditions. b) plants grown under field conditions. Supplementary Fig. 5 Correlations between Cd concentrations (μg g 1 dry wt.) in xylem sap and fourth leaves of plants grown under hydroponic conditions and field conditions. a) Cd concentrations in the fourth leaves. r 2 = b) Cd concentrations in xylem saps. r =

7 Supplementary Fig. 6 Cd amounts (μg) accumulated in plant parts 2 months after planting. The numbers at left indicate the SDRS landraces and BTx623. Dark gray bars: leaf blades; light gray bars: leaf sheaths; medium gray bars: nodes/internodes. Error bars represent ±SD (n = 4). Supplementary Fig. 7 Cd amounts (μg) accumulated in plant parts after heading. The numbers at left indicate the SDRS landraces and BTx623. Dark gray bars: leaf blades; light gray bars: leaf sheaths; medium gray bars: nodes/internodes; striped bars: panicles. Error bars represent ±SD (n = 4). Supplementary Fig. 8 Association analysis of 181 SSR markers and eight traits studied on Cd accumulation in year 2013 and 2014.

8 Supplementary Figures Supplementary Fig. 1

9 Supplementary Fig. 2

10 Supplementary Fig. 3

11 Supplementary Fig. 4 a) b)

12 Supplementary Fig. 5 a) b)

13 Supplementary Fig. 6

14 Supplementaty Fig. 7

15 Supplementaty Fig. 8

261225 0 . 1 . () 2 100 LP 100 100 100 1 40 3 22 23 35 87% 2 83 7 30% 1 2% 0 1% 2 7% 2 4% 2 9% 2 7% 3 7% 0 10 11 51% 19 81% 0 1% 2 9% LP 100% 45 5 11 11 23 100% 43 14 34% 2 5% 2 5% 9 22% 7 17% 100% 20

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