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复 旦 大 学 基 础 医 学 院 数 字 医 学 研 究 中 心 课 题 组 拟 招 收 2017 年 入 学 的 硕 士 博 士 直 博 或 硕 博 连 读 研 究 生, 欢 迎 有 免 试 推 荐 资 格 的 同 学 前 来 咨 询 有 意 者 请 将 简 历 等 个 人 信 息 发 送 至 zjsong@fudan.edu.cn 1. 课 题 组 长 简 介 宋 志 坚 课 题 组 介 绍 姓 名 : 宋 志 坚 ( 博 士 / 教 授 / 博 士 生 导 师 ) 出 生 : 1960 年 10 月 地 址 : 东 安 路 130 号, 西 13 号 楼, 上 海 200032 数 字 医 学 研 究 中 心, 复 旦 大 学 电 话 : 021-54237054 ( 办 公 室 ) 邮 件 : 网 页 : zjsong@fudan.edu.cn http://medicine.fudan.edu.cn/show.aspx?info_lb=30&flag=2&info_id=104 2. 主 要 工 作 经 历 2000/1- 至 今, 复 旦 大 学, 数 字 医 学 研 究 中 心, 教 授 复 旦 大 学, 上 海 MICAAI 实 验 室, 主 任 1997/1-2000/1, 复 旦 大 学, 医 学 院, 副 教 授 1994/8-1999/12, 复 旦 大 学, 基 础 医 学 博 士 后 流 动 站, 博 士 后 3. 主 要 学 习 经 历 1991/3 1994/7, 西 安 交 通 大 学, 生 物 医 学 工 程 学, 博 士 1988/9 1991/2, 江 苏 理 工 大 学, 信 息 管 理 学, 硕 士 1978/3 1982/3, 山 东 理 工 大 学, 机 械 化, 学 士 4. 主 要 学 术 任 职 及 兼 职 (1) 中 华 数 字 医 学 分 会 副 理 事 长 1

(2) 中 国 生 命 电 子 学 会 副 理 事 长 (3) 中 国 解 剖 学 会 断 层 影 像 解 剖 学 专 业 委 员 会 副 主 任 5. 所 获 奖 项 获 奖 名 称 授 予 单 位 时 间 国 家 技 术 发 明 奖 二 等 奖 上 海 市 科 技 进 步 奖 二 等 奖 教 育 部 技 术 发 明 奖 二 等 奖 中 华 医 学 科 技 奖 一 等 奖 优 秀 共 产 党 员 6. 所 获 人 才 项 目 国 家 科 技 部 上 海 市 人 民 政 府 国 家 教 育 部 中 华 医 学 会 复 旦 大 学 2012 2009 2009 2008 2012 项 目 名 称 项 目 来 源 时 间 上 海 市 科 技 精 英 ( 提 名 奖 ) 上 海 市 科 委 2015 上 海 市 领 军 人 才 上 海 市 科 委 2010 上 海 市 优 秀 学 科 带 头 人 上 海 市 科 委 2009 上 海 市 优 秀 曙 光 学 者 上 海 市 科 委 2005 2

7. 代 表 论 文 * 通 讯 作 者 (1) An, Yong(#),Wang, Manning(*), Song, Zhijian(*),A novel registration method for imageguided neurosurgery system based on stereo vision,bio-medical Materials and Engineering, 2015,26:S967-S973 (2) Hu, Liang(#),Cheng, Zhaoning,Wang, Manning(*), Song, Zhijian(*),Image manifold revealing for breast lesion segmentation in DCE-MRI,Bio-medical Materials and Engineering, 2015,26:S1353-S1360 (3) Xinrong Chen,Manning Wang(*), Zhijian Song(*),Automated Global Optimization Surface- Matching Registration Method for Image-to-Patient Spatial Registration in an Image-Guided Neurosurgery System,Journal of Medical Imaging and Health Informatics,2014,4(6): 942-947 (4) Yifeng Fan,Dongsheng Jiang,Manning Wang(*), Zhijian Song(*),A new markerless patientto-image registration method using a portable 3D scanner,medical Physics,2014,41(10) (5) Deng, Weiwei,Li, Fang,Wang, Manning(*), Song, Zhijian(*),Multi-mode navigation in image-guided neurosurgery using a wireless tablet PC,Australasian Physical & Engineering Sciences in Medicine,2014,37(3): 583-589 (6) Li, Ping,Wang, Weiwei, Song, Zhijian(*),An, Yong,Zhang, Chenxi,A framework for correcting brain retraction based on an extended Finite Element Method using a laser range scanner,international Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery,2014,9(4): 669-681 (7) Omara, Akram I.,Wang, Manning,Fan, YiFeng, Song, Zhijian(*),Anatomic al landmarks for point-matching registration in image-guided neurosurgery,international Journal of Medical Robotics and Computer Assisted Surgery,2014,10(1): 55-64 (8) Lian Yanyun, Song Zhijian(*),Automated brain tumor segmentation in magnetic resonance imaging based on sliding-window technique and symmetry analysis,chinese Medical Journal, 2014,127(3): 462-468 (9) Deng, Weiwei,Li, Fang,Wang, Manning, Song, Zhijian(*),Easy-to-Use Augmented Reality Neuronavigation Using a Wireless Tablet PC,Stereotactic and Functional Neurosurgery,2014, 92:17-24 (10) Zhang, Ziqun,Zhang, Ran, Song, Zhijian(*),Skull defect reconstruction based on a new hybrid level set,bio-medical Materials and Engineering,2014,24(6): 3343-3351 (11) Li, Fang, Song, Zhijian(*),Surface-based automatic coarse registration of head scans,biomedical Materials and Engineering,2014,24(6): 3207-3214 3

(12) Mao, Yihao,Liu, Hong,Ye, Rong,Shi, Yonghong(*), Song, Zhijian(*),Detection and segmentation of virus plaque using HOG and SVM: Toward automatic plaque assay,biomedical Materials and Engineering,2014,24(6): 3187-3198 (13) Hu, Liang,Wang, Manning, Song, Zhijian(*),Manifold-based feature point matching for multi-modal image registration,international Journal of Medical Robotics and Computer Assisted Surgery,2013,9(1): e10-e18 (14) 王 巍 伟, 李 萍, 章 琛 曦, 宋 志 坚 (*), 脑 组 织 牵 拉 变 形 矫 正 的 XFEM 建 模 及 其 验 证, 中 国 生 物 医 学 工 程 学 报,2013,( 01): 38-45 (15) Wang, Manning, Song, Zhijian(*),Optimal number and distribution of oints selected on the vertebra for surface matching in CT-based spinal navigation,computer Aided Surgery,2013, 18(3-4): 93-100 (16) 姚 旭 峰, 宋 志 坚 (*), 磁 共 振 弥 散 张 量 成 像 纤 维 束 追 踪 算 法 的 研 究 进 展, 医 学 研 究 杂 志, 2012,( 06): 174-176 (17) Man Ning Wang, Zhi Jian Song(*),Classification and Analysis of the Errors in Neuronavigation, NEUROSURGERY,2011,68(4): 1131-1143 (18) Zhang, Chenxi,Wang, Manning, Song, Zhijian(*),A Brain-Deformation Framework Based on a Linear Elastic Model and Evaluation Using Clinical Data,IEEE TRANSACTIONS ON BIOMEDICAL ENGINEERING,2011,58(1): 191-199 (19) Wang, Man Ning, Song, Zhi Jian(*),Properties of the target registration error for surface matching in neuronavigation,computer AIDED SURGERY,2011,16(4): 161-169 (20) Chen, Yiyong,Shi, Yonghong, Song, Zhijian(*),Differences in the architecture of low-grade and high-grade gliomas evaluated using fiber density index and fractional anisotropy, JOURNAL OF CLINICAL NEUROSCIENCE,2010,17(7): 824-829 (21) Wang, Manning, Song, Zhijian(*),Guidelines for the placement of fiducial points in imageguided neurosurgery,international JOURNAL OF MEDICAL ROBOTICS AND COMPUTER ASSISTED SURGERY,2010,6(2): 142-149 (22) Wang Manning, Song Zhijian(*),Distribution Templates of the Fiducial Points in Image-Guided Neurosurgery,NEUROSURGERY,2010,66(3): 143-150 8. 研 究 方 向 及 成 果 研 究 方 向 : 计 算 机 辅 助 手 术 ; 医 学 图 像 处 理 ; 虚 拟 现 实 技 术 在 医 学 中 的 应 用 博 士 招 生 专 业 :(1) 生 物 医 学 工 程 专 业 ( 专 业 代 码 :083100), 隶 属 基 础 医 学 院 (101) (2) 医 学 信 息 学 ( 专 业 代 码 :1001Z2), 隶 属 基 础 医 学 院 (101) 硕 士 招 生 专 业 :(1) 生 物 医 学 工 程 专 业 ( 专 业 代 码 :107200), 隶 属 基 础 医 学 院 (101) 4

(2) 医 学 信 息 学 ( 专 业 代 码 :1001Z2), 隶 属 基 础 医 学 院 (101) 研 究 成 果 : 本 课 题 组 先 后 完 成 多 项 国 家 自 然 科 学 基 金 国 家 高 技 术 研 究 发 展 计 划 重 点 项 目 上 海 市 科 委 科 技 攻 关 重 点 项 目 上 海 市 经 信 委 科 技 创 新 专 项 基 金 等 纵 向 科 研 任 务 近 年 来 在 国 内 外 权 威 学 术 期 刊 上 发 表 学 术 论 文 50 余 篇 先 后 获 2012 年 国 家 技 术 发 明 二 等 奖 2008 年 教 育 部 技 术 发 明 二 等 奖 2009 年 上 海 市 科 技 进 步 二 等 奖 2009 年 上 海 市 教 学 成 果 二 等 奖 等 科 教 奖 项 主 持 研 制 Excelim-04 型 神 经 导 航 和 Spine Nav 型 脊 柱 导 航 两 项 高 新 技 术 产 品, 并 在 全 国 获 得 推 广 使 用, 开 展 导 航 手 术 2 万 余 例, 市 场 占 有 率 接 近 20% 为 我 国 医 疗 装 备 的 技 术 创 新 及 高 端 医 疗 设 备 的 国 产 化 做 出 了 突 出 贡 献 具 体 研 究 方 向 包 括 : (1) 计 算 机 辅 助 手 术 技 术 以 神 经 外 科 为 例, 计 算 机 辅 助 手 术 系 统 的 工 作 原 理 是 : 术 前 使 用 CT MRI 等 成 像 设 备 对 病 人 进 行 医 学 图 像 扫 描, 然 后 利 用 这 些 图 像 在 系 统 中 建 立 图 像 空 间, 术 中 通 过 将 其 与 患 者 头 部 所 在 的 病 人 空 间 进 行 空 间 配 准, 得 到 从 病 人 空 间 到 图 像 空 间 的 坐 标 变 换 手 术 过 程 中 利 用 上 述 空 间 变 换 将 导 航 探 针 在 病 人 空 间 中 的 位 置 变 换 到 图 像 空 间 当 中 去, 并 叠 加 显 示 在 图 像 上, 从 而 利 用 图 像 上 虚 拟 探 针 相 对 于 图 像 的 位 置 来 定 位 真 实 探 针 相 对 于 病 人 解 剖 结 构 的 位 置, 达 到 帮 助 医 生 准 确 定 位 正 常 组 织 和 病 变 部 位 的 目 的 实 验 室 正 在 研 究 针 对 神 经 外 科 脊 柱 外 科 前 列 腺 穿 刺 手 术 等 不 同 应 用 方 向 的 计 算 机 辅 助 手 术 系 统, 涉 及 的 具 体 研 究 内 容 包 括 : 基 于 计 算 机 视 觉 表 面 重 建 的 空 间 配 准 医 学 图 像 的 分 割 和 肿 瘤 自 动 识 别 多 模 态 医 学 图 像 的 可 变 形 配 准 基 于 生 物 力 学 模 型 的 变 性 矫 正 等 工 作 5

(2) 基 于 平 板 电 脑 的 增 强 现 实 导 航 技 术 本 研 究 采 用 无 线 通 信 技 术, 将 病 人 的 导 航 信 息 传 输 到 位 于 医 生 身 旁 的 平 板 电 脑 上, 并 叠 加 现 实 在 平 板 电 脑 拍 摄 的 当 前 场 景 中 这 样 医 生 可 以 直 接 看 到 虚 拟 的 病 变 组 织 相 对 于 病 人 的 真 实 位 置 这 项 技 术 不 但 可 以 解 决 视 野 切 换 问 题, 还 可 以 减 小 定 位 误 差, 减 少 手 术 时 间, 降 低 手 术 风 险, 具 有 重 要 的 临 床 意 义 (3 术 中 脑 移 位 / 变 形 建 模 以 及 模 拟 技 术 研 究 本 研 究 将 有 限 元 (Finite Element Method, FEM) 和 扩 展 有 限 元 (extended Finite Element Method, XFEM) 应 用 于 线 弹 性 / 非 线 性 生 物 力 学 模 型 来 矫 正 术 中 由 于 开 颅 牵 拉 或 者 切 割 引 起 的 脑 组 织 变 形 这 项 技 术 对 于 辅 助 医 生 准 确 识 别 与 切 除 脑 部 病 变 组 织, 避 免 损 伤 重 要 神 经 或 功 能 区 等 具 有 重 要 临 床 意 义 术 中 牵 开 变 形 模 拟 术 中 牵 开 变 形 6