文献管理与利用

文献管理与利用 王敏 中国医学科学院医学信息研究所

科研人员应具备三种能力 文献检索 检索 : 中文数据库外文数据库 文献管理 国内 : NoteExpress 医学文献王国外 : Endnote ProCite Reference Manager 文献分析 对大批量文献的分析国内 : noteexpress 国外 : Endnote TDA

信息的有效交流是学科发展的基础 检索 结果 管理 发表论文 / 知识库 数据库检索 网络检索 手工检索 结果 : 上百条上千条.PDF.CAJ? 发表论文 个人数据库

参考文献管理软件 国外 EndNote Refworks Quosa Bibloscape ProCite Reference Manager RefViz 国内 NoteExpress 医学文献王

文献管理软件主要功能 个人数据库的管理 文献资料收集 ( 在线检索下载 ) 文献资料管理 ( 全文管理 ) 笔记管理 文献分析 ( 简单统计 ) 协助撰写论文 自动编排论文或书籍的参考文献 利用杂志全文模板撰写论文

文献管理软件工作原理 IMICAMS

一 Endnote 软件介绍

Endnote 简介 Endnote Procite Endnote Web Reference Manager

几个重要概念 Library:Endnote 用来存储参考文献数据的文件, 是数据库 Filter(Import): 把检索 ( 如 PubMed) 得到的参考文献导入 Endnote 时所用的过滤方式 由于每个数据库输出的数据格式不同, 所以导入数据时应选择对应的 Filter Connections: 在 Endnote 中在线检索数据库时, 需要的链接文件 Reference Type: 参考文献类型, 如 Journal Article Book 等 Style(output): 样式, 即参考文献在文章末尾的格式, 每家杂志社的要求不尽相同

菜单栏 ( 重要内容 ) New Open Close Save Export Import Print

菜单栏 ( 重要内容 ) Cut Copy Select all Output styles Import styles Connection files Preference

菜单栏 ( 重要内容 ) New Reference Edit Reference File Attachments Find Full Text Find Duplicates

菜单栏 ( 重要内容 ) IMICAMS

菜单栏 ( 重要内容 ) Search Library Cite while you write Online search Format paper Subject bibliography Manuscript templates

使用 Endnote 的基本步骤 新建 library 收集资料 管理资料 统计分析 科研积累 / 撰写论文

第二步 : 文献资料收集 手工录入 新建题录 数据库检索结果批量导入 检索数据库 导入题录 联机检索在线数据库

手工录入 IMICAMS

数据库检索结果批量导入 IMICAMS

数据库检索结果批量导入 Display>MEDLINE

数据库检索结果批量导入 Display>MEDLINE Send To>File

数据库检索结果批量导入 IMICAMS

PubMed 数据导入 IMICAMS

在线检索 IMICAMS

在线检索并自动下载题录 IMICAMS

在线检索并自动下载题录 IMICAMS

第三步 : 管理资料 去重 库内检索 链接全文 自动链接 (find full text) 手动链接 (file attachment), 鼠标直接拖拽 不局限于 PDF 文件, 可以是图片 音乐或其它文件 Insert figure

去重 (Reference>Find Duplicates)

系统按什么原则 去重的呢?

Edit>Preference IMICAMS

用户可自定义 IMICAMS

链接全文 自动链接 (Reference>find full text)

链接全文 IMICAMS 手动链接 ( 右键 >File Attachments>Attach File)

统计分析 (Tools>Subject Bibliography)

统计分析 (Tools>Subject Bibliography) 注意 : 统计分析结果不能保存下载

撰写论文 IMICAMS

撰写论文 IMICAMS

撰写论文 IMICAMS

添加参考文献 (Insert Selected Citation)

添加参考文献 (Insert Citation)

Lancet IMICAMS New England J Medicine

Cite while you write IMICAMS

思考题 : 如果编辑人员电脑中也安装了 Endnote 软件, 那他是否能够轻松更改我写的论 文参考文献格式呢?

编辑好论文后, 请点击 Remove Field Codes

使用论文模板撰写论文 IMICAMS

Endnote 高级功能 定制功能 Import Filter Output Style Preference

Filter IMICAMS

Filter-PubMed(NLM) IMICAMS

改变输出格式 (Output Style)

调整显示格式 IMICAMS

思考题 如何将一种参考文献管理软件的文件, 导入到另一种参考文献管理软件? 如 :EndNote >NoteExpress

RefMan(RIS)Export

Refman(RIS)Export Use this style if you want to export your data from EndNote into a standard Reference Manager (RIS) format. This format can then be imported into current versions of Reference Manager.

Refman(RIS)Export

http://www.endnote.com/ IMICAMS

课间休息 IMICAMS

二 NoteExpress 软件介绍

http://www.library.imicams.ac.cn/news/shownews.aspx?id=2269 软件下载 :http://www.reflib.org/support/cgi-bin/download_sch.cgi?code=zgyikeyuan 软件使用图文教程 :http://www.reflib.org/download_chs.htm#tutorials 技术支持论坛 :http://www.reflib.org/supportcn/cgi-bin/forum_show.cgi

http://www.library.imicams.ac.cn/news/shownews.aspx?id=2269

文献管理软件主要功能 个人数据库的管理 文献资料收集 ( 在线检索下载 ) 文献资料管理 ( 全文管理 ) 笔记管理 文献分析 ( 简单统计 ) 协助撰写论文 自动编排论文或书籍的参考文献 利用杂志全文模板撰写论文

文献管理软件工作原理 IMICAMS

菜单栏 IMICAMS

菜单栏 IMICAMS

菜单栏 IMICAMS

菜单栏 IMICAMS

菜单栏 IMICAMS

第一步 : 新建 Library 默认 : 首次启动会打开自带的 Sample 示例题录数据库, 该数据库存放在 我的文档 目录下 建议 : 正式使用时建立自己的新的数据库

第一步 : 新建 Library Documents\NoteExpress \Libraries\sample.nel

文件 -> 新建数据库

第二步 : 文献资料收集 手工录入 新建题录 数据库检索结果批量导入 检索数据库 导入题录 导入自己计算机中保存的文件 / 文件夹 联机检索在线数据库

NoteExpress 特色 IMICAMS

手工录入 题录 -> 新建题录

手工录入 在题录列表栏处点击鼠标右键

数据库检索结果题录导入 各大数据库导入 NE 的大体步骤是一致的, 只是不同的数据库在具体的操作上细节不一致 注意 : 导入的题录格式例 : PubMed(medline) Embase(Endnote) WOS(save to plain text) CNKI(NoteExpress)

数据库检索结果批量导入 Display>MEDLINE Send To>File

WOS Save to plain text

NoteExpress

导入文件 IMICAMS

红色标识表示有附件

导入目录 IMICAMS

在线检索结果导入 NoteExpress 本身集成了 CNKI, 万方, 维普, ISI,PubMed 等数据库, 可以在软件中通过统一的 界面检索, 检索结果直接保存到自身数据库中

CNKI 在线检索 IMICAMS

第三步 : 资料管理 树形结构管理 自定义显示表头字段 本地检索 查重 标识 批量链接 批量编辑 / 替换 回收站 数据库的拷贝

树形结构管理IMICAMS 在文件夹处点击鼠标右键 或者用鼠标拖动文件夹改变文件夹位置

自定义显示表头字段 选择符合个人需要的题录字段 在表头处点击鼠标右键

本地检索 快速查找数据库中的题录 请输入检索词

标识 ( 特色功能 ) 选择题录点击鼠标右键

查重 查找重复题录

量替换 ( 特色功能 ) IMICAMS

批量编辑 IMICAMS

批量链接 ( 特色功能 )_1 IMICAMS

批量链接 ( 特色功能 )_2 IMICAMS

附件的位置 IMICAMS

回收站 回收站中题录可以恢复, 避免错删误删带来的损失

统计分析 通过 NoteExpress 对文献信息进行多种统计分析 分析结果能导出为 txt 和 csv 等多种格式, 方便做出精准的报告

第四步 : 撰写论文 与 EndNote 类似 插入引文 / 编辑引文 格式化参考文献 / 去除格式化 国外期刊手稿模板 不同 : 增加了国内中文期刊的参考文献格式

实例操作 IMICAMS

主要功能 导入文件 查重 标记 批量编辑 批量链接

http://www.reflib.org/wiki/index.php/%e9%a6%96%e9%a1%b5

Easy to say, difficult to do! There is no royal road to learning.

Thank you! Good Luck!

联系方式 王敏 010-65122062 minwang98@126.com