年中考核报告

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1 Avizo 软件的数据分析和图像分割 报告人 : 张凯 课题组 : 多学科同步辐射形貌站 报告提纲 1 2 应用例子 1:Avizo 的数据分析功能 DEI-CT 应用例子的原理和实验参数确定 2: 样品孔洞直径测量 3 应用例子 3: 分水岭图像分割算法 4 Avizo 的使用总结

2 volume data/images/foam/foam.am 图像处理的基本流程 : 1. 滤波 2. 二值化 3. 分割 4. 测量 5. 数据分析 6. 数据过滤 添加 Median Filter 命令去除噪声 添加 Interactive Thresholding 命令进行图像分割 滤波 二值化

3 添加 Separate Objects 命令分割连接在一起的样品 添加 Label Analysis 命令,Intensity image=foam.am, 统计分析面积 体积等 分割与信息统计 Label Analysis 属性窗口 Label Analysis 生成的电子表格信息 包含表面积, 体积, 中心点坐标, 每个孔洞会被编号 复制 导出表格数据 升级排序 直方图 寻找当前数据对于样品点

4 样品筛选 点击 图标, 查找对应样品点 点击直方图按钮查看统计信息 添加 Analysis Filter 命令, 剔除不需要的样品点 样品筛选

5 添加 Sieve Filter 命令, 把样品分类显示 样品分类 应用例子 2: 样品孔洞直径测量

6 data/tutorials/fireedition/foamporo.am 图像处理的基本流程 : 1. 载入数据 2. 二值化分割 3. 图像开运算 4. 样品分离 5. 数据分析 6. 创建自定义测量内容 7. 数据结果 载入数据, 添加 ortho slice 命令显示图像 添加 Interactive Thresholding 命令进行图像分割 原始数据显示 图像分割后

7 添加 Opening 命令进行除噪声, 平滑 Opening 运算前 Opening 运算后 添加 separate 命令把连接在一起的样品分开 Separate 运算前 Separate 运算后

8 添加 Label Analysis, 开始进行测量计算 Intensity Image: FoamPora.am 点击 按钮 属性窗口 自定义测量内容 点击 1, 新建 group 点击 2, 选择测量项目点击 3, 添加测量项目

9 在 Label Analysis 属性窗口中更改测量内容, 获得直径信息 在 Label Analysis 属性窗口中自定义球型检测函数 1.Label Analysis 属性窗口点击 按钮 2. 点击上图图标

10 输入自定义公式 在 Label Analysis 属性窗口中更改测量内容, 获得球型检测信息

11 应用例子 3: 分水岭图像分割算法 最方便, 最简单的分割方法是 Threshold 命令 很多时候不是很有效!

12 分水岭算法的概念及原理分水岭分割方法, 是一种基于拓扑理论的数学形态学的分割方法, 其基本思想是把图像看作是测地学上的拓扑地貌, 图像中每一点像素的灰度值表示该点的海拔高度, 每一个局部极小值及其影响区域称为集水盆, 而集水盆的边界则形成分水岭 分水岭的概念和形成可以通过模拟浸入过程来说明 在每一个局部极小值表面, 刺穿一个小孔, 然后把整个模型慢慢浸入水中, 随着浸入的加深, 每一个局部极小值的影响域慢慢向外扩展, 在两个集水盆汇合处构筑大坝, 即形成分水岭 分水岭的计算过程是一个迭代标注过程 不需要了解原理, 只需会使用 data/sandpack/sandpack128-filtered.am 1. 载入图像 2. 用 Non-Local Means 滤波 3. 添加 Edit New Label Field 命令

13 1. 将 Inside 更改为 Pore Space 2. 添加 Grains 材料 3. Tool 中选取 Threshold Tool. 4. 选取 All slices 5. 选取 Grains 和 Pore Space 的阈值 选择分水岭算法

14 1. 在 Landscape image 中, 选择 Create a new gradient image. 2. 在 Output catchment bassins 中选择 side-byside 3. Apply

15 Threshold 命令的分割结果不是很好 添加 Watershed Segmentation wizard 命令

16 设定要区分的材料为 3 种 软件提示进行梯度计算, 点击 Apply

17 设置合适的阈值, 能够显示不同密度物质之间的边界, 改变 Slice Number 检查各个断层图 设置合适的阈值, 标记材料

18 设置合适的阈值, 标记材料 设置合适的阈值, 标记材料

19 完成分割算法 生成 Basins 点击 Basins 属性框按钮 查看分割结果

20 Avizo 的使用总结 Avizo 的数据处理流程 流程 数据导入 常用命令 File-> Open data as 视图工具栏 Open data 图像滤波 Smoothing, Median, Median, Unsharp masking, Sobel 断层切片显示 Ortho Slice,Slice 3D 图像显示 Isosurface, Volume Render,Volume edit

21 Avizo 的数据处理流程 常用命令 图像分割 Threshold,multiple threshold,interactive threshold Watershed Segmentation wizard, Edit New Label Field, 形态学命令 :closing,opening,separate 分割图像显示 Generate surface,surface view 数据定量分析 Label Analysis,Line,angle,Line probe,point probe 3D 动画 0 Mover maker,camera Orbit, Camera Orbit Avizo 的常用滤波函数分类 使用目的 : 减少噪声, 提高图像质量, 方便图像分割和图像显示 平滑图像的滤波函数 : Median filter, Non-Local Means filter, and Anisotropic Diffusion filter. 提高图像对比度的滤波函数 : Unsharp masking 边缘检测滤波函数 : Sobel 原始图像 Median Unsharp masking Sobel

22 得到优质的原始图像数据是关键!! 谢谢! Thanks for Your Time!

Volume 2.Number 5.2007 Volume 2.Number 5.2007 Volume 2.Number 5.2007 Volume 2.Number 5.2007 Volume 2.Number 5.2007 Volume 2.Number 5.2007 Volume 2.Number 5.2007 Volume 2.Number 5.2007 Volume 2.Number

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