GNU C/C++ Fortran编译器

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1 .. GNU C/C++ Fortran 编译器的使用 中国科学技术大学超级运算中心 2011 年 10 月 ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 1 / 41

2 .1 GNU C/C++ Fortran 编译器简介.2 GNU C/C++ 编译器用法.3 GNU Fortran 编译器用法.4 串行程序调试 :gdb.5 联系信息 ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 2 / 41

3 GNU C/C++ Fortran 编译器简介 GNU C/C++ Fortran 编译器为系统自带的默认编译器, 用户无需特殊设置即可使用 GNU 编译器编译 C C++ 源程序的命令分别为 gcc 和 g++ 编译 Fortran 77 和 9x 源程序的命令分别为 g77 和 gfortran: gfortran 可以直接编译 Fortran 77 源程序 g77 不可编译 Fortran 9x 源程序 ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 3 / 41

4 .1 GNU C/C++ Fortran 编译器简介.2 GNU C/C++ 编译器用法.3 GNU Fortran 编译器用法.4 串行程序调试 :gdb.5 联系信息 ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 4 / 41

5 编译命令基本格式 基本格式 : C:gcc [options] file1 [file2...] C++:g++ [options] file1 [file2...] 注意 : [ ] 表示是其内部的选项可选 文件名和选项区分大小写 ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 5 / 41

6 输入文件后缀与类型的关系 编译器默认将按照输入文件的后缀判断文件类型, 编译时也可以用编译选项强制指定 文件名 解释 动作 filename.c C 源文件 传给编译器 filename.c filename.cc filename.cc C++ 源文件 传给编译器 filename.cpp filename.cxx filename.a filename.so 库文件 传递给链接器 filename.i 已预处理的文件 传递给标准输出 filename.o 目标文件 传递给链接器 filename.s 汇编文件 传递给汇编器 ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 6 / 41

7 输出文件后缀与类型的关系 编译器默认将输出按照文件类型与后缀相对应 文件名 filename.i filename.o filename.s a.out 解释已预处理的文件, 由使用 -p 选项生成目标文件, 由添加 -c 选项生成汇编文件, 由添加 -s 选项生成默认生成的可执行文件 ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 7 / 41

8 重要编译选项 编译选项对运行速度 编译的兼容性等有影响, 以下仅仅介绍部分重要选项, 建议仔细看看编译器手册, 多加测试, 选择适合自己程序的编译选项以提高性能 ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 8 / 41

9 控制文件类型的选项 I -x language: 明确指定而非让编译器判断输入文件的类型 language 可为 : c c-header c-cpp-output c++ c++-header c++-cpp-output objective-c objective-c-header objective-c-cpp-output objective-c++ objective-c++-header objective-c++-cpp-output assembler assembler-with-cpp ada f95 f95-cpp-input java treelang 当 language 为 none 时, 禁止任何明确指定的类型, 其类型由文件名后缀决定 -c: 仅编译成目标文件 (.o 文件 ), 并不进行链接 -o file: 指定生成的文件名 -v: 详细模式, 显示在每个命令执行前显示其命令行 ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 9 / 41

10 控制文件类型的选项 II -###: 显示编译器 汇编器 链接器的调用信息但并不进行实际编译, 在脚本中可以用于捕获驱动器生成的命令行 --help: 显示帮助信息 --target-help: 显示目标平台的帮助信息 --version: 显示编译器版本信息 ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 10 / 41

11 C 语言选项 -ansi:c 模式时, 支持所有 ISO C90 指令 在 C++ 模式时, 去除与 ISO C++ 冲突的 GNU 扩展 -std=: 控制语言标准, 可以为 c89 iso9899:1990 iso9899: c99 c9x iso9899:1999 iso9899:199x gnu89 gnu99 gnu9x c+ +98 gnu++98 ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 11 / 41

12 警告选项 -fsyntax-only: 仅仅检查代码的语法错误, 并不进行其它操作 -w: 编译时不显示任何警告, 只显示错误 -Wfatal-errors: 遇到第一个错误就停止, 而不尝试继续运行显示更多错误信息 ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 12 / 41

13 调试选项 -g: 包含调试信息 -ggdb: 包含利用 gbd 调试时所需要的信息 ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 13 / 41

14 优化选项 -O[level]: 设置优化级别 优化级别 level 可以设置为 s ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 14 / 41

15 预处理选项 -C: 预处理时保留 C 源文件中的注释 -D name: 预处理时定义宏 name 的值为 1 -D name=def: 预处理时定义 name 为 def -U name: 预处理时去除的任何 name 初始定义 -undef: 不预定义系统或 GCC 声明的宏, 但标准预定义的宏仍被定义 -dd: 显示源文件中定义的宏及其值到标准输出 -di: 显示预处理中包含的所有文件, 包括文件名和定义时的行号信息 -dm: 显示预处理时源文件中定义的宏及其值, 含定义时文件名和行号 -dn: 与 -dd 类似, 但只显示源文件中定义的宏, 而不显示宏值 -E: 预处理.c 文件, 将结果发给标准输出, 不进行编译 汇编或链接 -I< 头文件目录 >: 指明头文件的搜索路径 -M: 打印 make 的依赖关系到标准输出 -MD: 打印 make 的依赖关系到文件 file.d,file 是编译文件的根名字 -MM: 打印 make 的依赖关系到标准输出, 但忽略系统头文件 -MMD: 打印 make 的依赖关系到文件 file.d, 其中 file 是编译的文件的根名字, 但忽略系统头文件 -P: 预处理每个文件, 并保留每个 file.c 文件预处理后的结果到 file.i ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 15 / 41

16 链接选项 -pie: 在支持的目标上生成位置无关的可执行文件 -s: 从可执行文件中去除所有符号表 -rdynamic: 添加所有符号表到动态符号表中 -static: 静态链接所需的库 -shared: 生成共享目标而不是可执行文件, 必须在编译每个目标文件时使用 -fpic 选项 -shared-libgcc: 使用共享 libgcc 库 -static-libgcc: 使用静态 libgcc 库 -u <symbol>: 确保 symbol 未定义, 强制链接一个库模块来定义它 -I< 头文件目录 >: 指明头文件的搜索路径 -l< 库文件 >: 指明所链接的库名, 如库为 libxyz.a, 可用 -lxyz 指定 -L< 库目录 >: 指明库的搜索路径 -B< 路径 >: 设置寻找可执行文件 库 头文件 数据文件等路径 ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 16 / 41

17 CPU 平台相关选项 -mtune=cpu-type: 设置优化针对的 CPU 类型, 可为 : generic core2 k8 opteron 等 -march=cpu-type: 设置指令针对的 CPU 类型, 可为 : generic core2 k8 opteron 等 -mieee-fp 和 -mno-ieee-fp: 浮点操作是否严格按照 IEEE 标准 ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 17 / 41

18 约定成俗的选项 -fpic: 生成位置无关的代码以用于共享库 -fpic: 如果目标机器支持, 将生成位置无关的代码 -fopenmp: 编译 OpenMP 并行程序 -fpie 和 -fpie: 与 -fpic 和 -fpic 类似, 但生成的位置无关代码只能链接到可执行文件中 ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 18 / 41

19 串行及 OpenMP 并行程序编译举例 将 C 程序 yourprog.c 编译为可执行文件 yourprog: gcc o yourprog yourprog.c 将 C 程序 yourprog.c 编译为目标文件 yourprog.o: gcc c yourprog.c 将使用 lapack 库的 C 程序 yourprog.c 编译为可执行文件 yourprog: gcc o yourprog L/opt/lib llapack yourprog.c 将 C 程序 yourprog.c 静态编译为 O3 优化的可执行文件 yourprog: gcc O3 static o yourprog yourprog.c 将 C++ 程序 yourprog.cpp 编译为可执行文件 yourprog: g++ o yourprog yourprog.cpp 将 OpenMP 指令并行的 C 程序 yourprog-omp.c 编译为可执行文件 yourprog-omp: gcc o yourprog omp fopenmp yourprog.c ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 19 / 41

20 编译时出错信息格式 n e t l o g. c : In f u n c t i o n ' main ' : n e t l o g. c : 8 4 : 7 : e r r o r : ' f o r ' loop i n i t i a l d e c l a r a t i o n s a r e only a l l o w e d i n C99 mode netlog. c : 8 4 : 7 : note : use option std =c99 or std =gnu99 to compile your code 源文件名 : 函数中 源文件名 : 行数 : 列数 : 错误类型 : 具体说明 源文件名 : 行数 : 列数 : 注解 : 解决办法 ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 20 / 41

21 .1 GNU C/C++ Fortran 编译器简介.2 GNU C/C++ 编译器用法.3 GNU Fortran 编译器用法.4 串行程序调试 :gdb.5 联系信息 ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 21 / 41

22 编译命令基本格式 基本格式 : 4.x.y 版本编译器 : gfortran [options] file1 [file2...] 3.x.y 版本编译器 :g77 [options] file1 [file2...] 注意 : [ ] 表示是其内部的选项可选 文件名和选项区分大小写 后续内容为关于 4.x.y 版本 gfortran 的,3.x.y 版本的 g77 有所不同 ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 22 / 41

23 输入文件后缀与类型的关系 编译器默认将按照输入文件的后缀判断文件类型, 编译时也可以用编译选项强制指定 文件名 解释 动作 filename.a 目标库文件 传给编译器 filename.f filename.for 固定格式的 Fortran 源文件 被 Fortran 编译器编译 filename.ftn filename.i filename.fpp filename.fpp filename.f 固定格式的 Fortran 源文件 自动被 Fortran 编译器预处理后再被编译 filename.for filename.ftn filename.f90 自由格式的 Fortran 源文件 被 Fortran 编译器编译 filename.i90 filename.f90 自由格式的 Fortran 源文件 自动被 Fortran 编译器预处理后再被编译 filename.s 汇编文件 传递给汇编器 filename.so 库文件 传递给链接器 filename.o 目标文件 传递给链接器 ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 23 / 41

24 输出文件的后缀与类型的关系 编译器默认将输出按照文件类型与后缀相对应 文件名 解释 生成方式 filename.o 目标文件 编译时添加 -c 选项生成 filename.so 共享库文件 编译时指定为共享型, 如添加 -shared, 并不含 -c filename.mod 模块文件 编译含有 MODULE 声明时的源文件生成 filename.s 汇编文件 编译时添加 -S 选项生成 a.out 默认生成的可执行文件 编译时没有指定 -c 时生成 ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 24 / 41

25 重要编译选项 编译选项对运行速度 编译的兼容性等有影响, 以下仅仅介绍部分重要选项, 建议仔细看看编译器手册, 多加测试, 选择适合自己程序的编译选项以提高性能 gfortran 支持所有 gcc 选项 ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 25 / 41

26 控制 Fortran 语言类型的选项 -ffree-form 和 -ffixed-form: 声明源文件是自由格式还是固定格式, 默认从 Fortran 90 起的源文件为自由格式, 之前的 Fortran 77 等的源文件为固定格式 -fdefault-double-8: 设置 DOUBLE PRECISION 类型为 8 比特 -fdefault-integer-8: 设置 INTEGER 和 LOGICAL 类型为 8 比特 -fdefault-real-8: 设置 REAL 类型为 8 比特 -fno-backslash: 将反斜线 (\) 当作正常字符 ( 非转义符 ) 处理 -ffixed-line-length-<n>: 设置固定格式源代码的行宽为 n -ffree-line-length-<n>: 设置自由格式源代码的行宽为 n -fmax-identifier-length=<n>: 设置名称的最大字符长度为 n, Fortran 95 和 200x 的长度分别为 31 和 65 -fimplicit-none: 禁止变量的隐式声明, 所有变量需显式声明 -fcray-pointer: 支持 Cray 指针扩展 -fopenmp: 编译 OpenMP 并行程序 -std=<std>: 指明 Fortran 标准,std 可以为 gnu f95 f2003 legacy -M<dir> 和 -J<dir>: 指定编译时保存生成的模块文件目录 -fconvert=<conversion>: 指定对无格式 Fortran 数据文件表示方式, 其值可为 :native, 默认值 ;swap, 在输入输出时从大端 (big-endian) 到小端 (little-endian) 交换比特, 或相反 ;big-endian, 用大端方式读写 ; little-endian, 用小端方式读写 ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 26 / 41

27 一般选项 -c: 仅编译成目标文件 (.o 文件 ), 并不进行链接 -o file: 指定生成的文件名 -v: 详细模式, 显示在每个命令执行前显示其命令行 -###: 显示编译器 汇编器 链接器的调用信息但并不进行实际编译, 在脚本中可以用于捕获驱动器生成的命令行 --help: 显示帮助信息 --target-help: 显示目标平台的帮助信息 --version: 显示编译器版本信息 ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 27 / 41

28 警告选项 -fsyntax-only: 仅仅检查代码的语法错误, 并不进行其余操作 -w: 编译时不显示任何警告, 只显示错误 -Wfatal-errors: 遇到第一个错误就停止, 而不尝试继续运行 ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 28 / 41

29 调试选项 -g: 包含调试信息 -ggdb: 包含利用 gbd 调试时所需要的信息 ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 29 / 41

30 优化选项 -O[level]: 设置优化级别 优化级别 level 可以设置为 s ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 30 / 41

31 预处理选项 -C: 保留预处理的 C 源文件中的注释 -D name: 在预处理中定义宏 name 的值为 1 -D name=def: 在预处理中定义 name 为 def -U name: 去除预处理中的任何 name 初始定义 -undef: 不预定义系统或 GCC 声明的宏, 但标准预定义的宏仍被定义 -dd: 显示源文件中定义的宏及其值到标准输出 -di: 显示预处理中包含的所有文件, 包括文件名和定义时的行号 -dm: 显示预处理时源文件中定义的宏及值, 含定义时文件名和行号 -dn: 与 -dd 类似, 但只显示源文件中定义的宏, 而不显示宏值 -E: 预处理各文件, 将结果发给标准输出, 不进行编译 汇编或链接 -I< 头文件目录 >: 指明头文件的搜索路径 -M: 打印 make 的依赖关系到标准输出 -MD: 打印 make 的依赖关系到文件 file.d,file 是编译文件的根名字 -MM: 打印 make 的依赖关系到标准输出, 但忽略系统包含 -MMD: 打印 make 的依赖关系到文件 file.d, 其中 file 是编译的文件的根名字, 但忽略系统头文件 -P: 预处理每个文件, 并保留每个 file.c 文件预处理后的结果到 file.i ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 31 / 41

32 链接选项 -pie: 在支持的目标上生成位置无关的可执行文件 -s: 从可执行文件中去除所有符号表 -rdynamic: 添加所有符号表到动态符号表中 -static: 静态链接所需的库 -shared: 生成共享目标而不是可执行文件, 必须在编译每个目标文件时使用 -fpic 选项 -shared-libgcc: 使用共享 libgcc 库 -static-libgcc: 使用静态 libgcc 库 -u <symbol>: 确保符号 symbol 未定义, 强制连接一个库模块来定义它 -I< 头文件目录 >: 指明头文件的搜索路径 -l< 库文件 >: 指明所需链接的库名, 如库为 libxyz.a, 则可用 -lxyz 指定 -L< 库目录 >: 指明库的搜索路径 -B< 路径 >: 设置寻找可执行文件 库 头文件 数据文件等路径 ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 32 / 41

33 平台相关选项 -mtune=cpu-type: 设置优化针对的 CPU 类型, 可为 : generic core2 k8 opteron 等 -march=cpu-type: 设置指令针对的 CPU 类型, 可为 : generic core2 k8 opteron 等 -mieee-fp 和 -mno-ieee-fp: 浮点操作是否严格按照 IEEE 标准 ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 33 / 41

34 约定成俗的选项 -fno-automatic: 将每个程序单元的本地变量和数组声明具有 SAVE 属性 -ff2c: 与 g77 和 f2c 生成的代码兼容 -fno-underscoring: 不在名字后添加 _ 注意:gfortran 默认行为与 g77 和 f2c 不兼容, 为了兼容需要加 -ff2c 选项 除非使用者了解与现有系统环境的集成, 否则不建议使用 -fno-underscoring 选项 -funderscoring: 对外部名字没有 _ 的加 _, 以与一些 Fortran 编译器兼容 -fsecond-underscore: 默认 gfortran 对外部名称添加一个 _, 如果使用此选项, 那么将添加两个 _ 此选项当使用-fno-underscoring 选项时无效 此选项当使用 -ff2c 时默认启用 -fpic: 生成位置无关的代码以用于共享库 -fpic: 如果目标机器支持, 将生成位置无关的代码 -fpie 和 -fpie: 与 -fpic 和 -fpic 类似, 但生成的位置无关代码只能链接到可执行文件中 ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 34 / 41

35 串行及 OpenMP 并行程序编译举例 将 Fortran 77 程序 yourprog.for 编译为可执行文件 yourprog: gfortran o yourprog yourprog.for 将 Fortran 90 程序 yourprog.f90 编译为可执行文件 yourprog: gfortran o yourprog yourprog.f90 将使用 lapack 库的 Fortran 90 程序 yourprog.f90 编译为可执行文件 yourprog: gfortran o yourprog L/opt/lib llapack yourprog.f90 将 Fortran 90 程序 yourprog.f90 编译为目标文件 yourprog.o: gfortran c yourprog.f90 将 Fortran 90 程序 yourprog.f90 静态编译为 O3 优化的可执行文件 yourprog: gfortran O3 static o yourprog yourprog.f90 将 OpenMP 指令并行的 Fortran 90 程序 yourprog-omp.f90 编译为可执行文件 yourprog-omp: gfortran o yourprog omp fopenmp yourprog.f90 ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 35 / 41

36 编译时出错信息格式 NOlihm. f90 : : n2nd =0; npr=0 1 Error : Symbol ' npr ' a t ( 1 ) has no IMPLICIT type 源文件名 : 行数 : 列数 : 源文件,1 指示出错位置 错误类型 : 具体说明 ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 36 / 41

37 .1 GNU C/C++ Fortran 编译器简介.2 GNU C/C++ 编译器用法.3 GNU Fortran 编译器用法.4 串行程序调试 :gdb.5 联系信息 ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 37 / 41

38 GNU 程序调试器 gdb 简介 GNU 调试器 gdb 可用于调试 C/C++ Fortran 等语言编写的程序, 程序编译时需要添加 -g 编译选项 基本启动方式 : gdb [ help] [ nx] [ q] [ batch] [ cd=dir] [ f] [ b bps] [ tty=dev] [ s symfile] [ e prog] [ se prog] [ c core] [ x cmds] [ d dir] [prog [core procid]] gdb [options] args prog [arguments] 注意 : 程序本身含有参数时, 前面需要用 --args 指定, 否则不起作用 ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 38 / 41

39 gdb 启动参数 -b bps: 指定远程调试时的线速, 波特率或者比特 / 每秒 -batch: 以批处理模式运行 -x FILE( 和.gdbinit) 中的命令, 退出值为 0 时表示成功运行指定的所有命令, 否则表示有错误发生 -c FILE, -core=file: 指定使用 core 文件 -cd=directory: 以 directory 目录为其工作目录 -e FILE, -exec=file: 指定使用的可执行文件 -h, -help: 显示帮助信息 -se=file: 从文件 file 中读取符号表, 并当可执行文件使用 -q, -quiet: 安静模式, 启动时不显示版权等信息 -tty=device: 以设备 device 做为标准输入输出设备 --args: 将可执行文件名后面的参数传递给此可执行文件 -tui: 以带有专门源代码显示窗口的模式运行 -write: 支持写入可执行和 core 文件 -x FILE, -command=file: 指定启动 gbd 后执行的操作命令 ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 39 / 41

40 进入 gdb 后的操作 进入 gdb 后的命令非常多, 这里仅仅解释几个主要的, 详细的请进入 gdb 后利用 help 命令查看, 里面的信息以及命令比 man gdb 多得多 break [file:]function: 设置 [file 中的 ] 名字为 function 的函数断点 run [arglist]:[ 以 arglist 参数列表 ] 启动程序 bt: 显示程序的堆栈 stack print expr: 打印表达式的值 c: 继续运行因为断点等终止的程序 next: 执行程序中的下一行语句, 如此行是函数, 将执行完此函数 edit [file:]function: 编辑当前停止行的代码 list [file:]function: 打印当前停止行附近的代码 step: 执行行程序中的下一行语句, 如此行是函数将进入函数内 help [name]: 显示 [GDB name 命令或 ] 一般 GDB 信息 quit: 退出 GDB ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 40 / 41

41 .1 GNU C/C++ Fortran 编译器简介.2 GNU C/C++ 编译器用法.3 GNU Fortran 编译器用法.4 串行程序调试 :gdb.5 联系信息 ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 41 / 41

42 联系信息 李会民 : 办公室 : 科大东区新科研楼 A 座网络信息中心二楼 205 室办公电话 : 电子信箱 :hmli@ustc.edu.cn 个人主页 : 中国科大超算平台 : ( 中国科大超算中心 ) Intel 编译器的使用 2011 年 10 月 42 / 41

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