SciFinder Web 源于化学, 超越化学的一站式检索平台 SciFinder Web 使用介绍 俞靓 SciFinder 培训专员 2013.11
提纲 介绍 SciFinder Web 中的新界面及内容 SciFinder Web 中的检索举例 SciFinder 中的基础检索 SciFinder 中的结构面板使用技巧 SciFinder 中的反应筛选 SciFinder 中的反应设计 SciFinder Web 网络资源 2
SciFinder 新界面 3
SciFinder 的覆盖内容 CAS REGISTRY SM >7200 万有机无机物质 >6400 万生物序列 >4 亿条实验和预测数据 物质报道文献, 回溯到 1802 年 每天更新 References References from CAplus SM >3700 万期刊, 专利, 学位论文记录. >1 万种科技期刊的覆盖 63 家专利发行机构的专利 1997 年以来的 3.65 亿条引文记录 回溯到 1800 年 每天更新 References from MEDLINE > 1900 万条生命科学相关文献 > 5600 期刊 回溯到 1946 年 每天更新 Markush Structures >98 万专利中的 Markush 结构 回溯到 1961 年 每天更新 CHEMLIST 全球范围内的法规信息 >29.7 万的化合物 1980 至今的数据 每周更新 SciFinder Reactions CASREACT CAS 提供的反应信息包含 : 反应中的结构信息 反应中所有物质的 CAS No 详细的反应条件 实验过程 >5190 万单步多不反应 >1360 万物质合成制备信息 反应回溯到 1840 反应条件起始于 2003 每天更新 4 CHEMCATS CHEMCATS 提供物质的供应商信息 >6900 万商业信息 >2100 万不同种类物质 >880 个全球范围内的供应机构 >1,005 商品目录的覆盖 每周更新 4
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SciFinder Web 中的常规检索 主题 : suzuki reaction with catalyst 使用介词来连接关键词, 点击 Search 6
主题检索的候选项 Concept 表示做了同意词的扩展 Closely associated with one another 表示同时出现在一个句子中 present anywhere in the reference 表示同时出现在一段话中 7
SciFinder 中的文献检索结果 文献分析工具 8
SciFinder 提供的引文排序 Citing Reference 9
SciFinder 中的 Analysis 领域内主要研究人员, 专家 主要研究机构, 合作伙伴, 竞争对手 主要出版杂志, 机构, 潜在投稿期刊 10
SciFinder 中的 Analysis 索引词 (Index Term): 可以帮助我们对文献的内容进行大致的了解 选择感兴趣的内容, 点击 Apply 11
SciFinder 中的 Refine Refine : 帮助用户迅速获得需要的文献中科院 12
结果集的保存 Export: Citation manager: 保存成 RIS 格式, 用于导入 EndNote 等文献管理工具 Offline Review: 保存过成 PDF,RTF 格式, 用于脱机浏览 Save: 保存在服务器上, 可登陆后查看 13
SciFinder 中的 Categorize 通过历史导航条回到任一检索界面 Categorize 系统分类功能, 基于 Index Term, 对文献依学科方向进行分类 14
SciFinder 中的 Categorize 一级目录二级目录和二级目录相关的 Index Term 选中的 Index Term 15
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SciFinder 结构绘制工具 铅笔元素周期表可变基团重复基团工具碳链工具选择工具环锁定工具旋转工具正电子 橡皮常用基团 R 基团定义工具可变位置连接工具模版工具索套选择工具原子锁定工具镜面旋转工具 C 原子和单键恢复工具 结构和反应切换功能 结构检索选择 单双键,RS 构型, 不确定键定义工具 负电子 常见环, 多元环工具
SciFinder 中的反应定义工具 反应箭头 反应角色工具 反应原子标记工具 反应位置标记工具 反应官能团列表 18
精确结构检索 检索金属配合物 P t Bu t Bu N P Ni Cl BF 4 该结构中包含 : 配体金属阳离子阴离子 Bu t t Bu 19
结构式检索 精确检索 20
检索界面 任何一种结构, 使用精确结构都可以检索到 21 21
我想获得以下的一系列物质 CHO N CHO N CHO N CHO Cl NH Cl NH Cl N H Cl N H N N O Cl N CHO Cl N CHO Cl N H H H CHO Cl N H CHO 22
结构定义 用亚结构检索获得所有的物质 23
亚结构检索结果 24
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SciFinder 反应检索 检索中的筛选 吡啶环的 3,4 位存在任意的非 C,H 原子或基团 检索在 6 位引入 Cl 的反应 Q Q Q Q N Cl N 26
定义反应结构 大多数科研工作者, 刚开始都会画成这样 但是, 这样足够吗? 尝试 SciFinder 中的初步检索 27
亚结构检索, 帮助获得所有的相关反应 亚结构检索反应, 帮助在最大范围内获得刚兴趣的内容 28
SciFinder 中的反应筛选 我们获得 5400+ 反应 反应筛选第一步是 Group By Document, 这样可以让来自同一篇文献的反应合并掉 29
简单的看一下这些反应 吡啶环系发生破坏, 不是我们想要的 30
反应中的 Refine 工具, 添加环锁定 环锁定工具, 当使用亚结构检索时, 不允许发生稠环 31
锁定环后的结果 继续浏览 这条反应, 完全符合我们的要求 32
锁定环后的结果 继续浏览 这条反应, 原来的 6 位上就有 Cl, 不符合我们的要求 33
锁定环后的结果 继续浏览 这条反应, 或许符合我们的要求 34
思考 : 什么样的反应是我们想要的 第一条反应 :6 位 H 变成 6 位 Cl 肯定是我们想要的 第二条反应 :6 位 Cl 变成 6 位 Cl 肯定不是我们想要的 第三条反应 :6 位非 H 非 Cl 变成 6 位 Cl 有可能是我们想要的 不同的人在这里的选择不一样, 我们先假设只想获得第一类的反应 35
继续使用 Refine 36
这是我们想要的反应 所有的反应都符合我们的结构要求 在吡啶环的 6 位存在 H 到 Cl 的变化 37
一些值得思考的问题 并不是所有的科研工作者, 一开始就能准确的定义反应结构 建议先大致浏览下反应结果集, 然后去思考如何去除我们不想要的反应 使用 Analyze/Refine 工具, 或其他的检索策略, 去除不想要的反应. 38
案例的衍生 在刚才的检索过程中, 我们认为以下的反应不是我们想要的反应 但是, 如果我们认为, 符合要求, 那该如何处理? 39
将结果保存在网络上 使用导航条返回曾经检索过的界面. 保存结果到网络上. 40
Refine 工具来获取不需要的反应 因为我们很明确的知道, 我们不需要这类反应 所以可以先获得这些反应, 然后去除他们既可 41
使用 Combine 去除不想要的反应 这些是我们不想要的 如果将这些反应去除掉, 那么剩下的就是我们的目标反应 42
需要的反应结果集 43
检索策略 所有反应 不想要的反应 使用 Combine 44
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SciFinder 中的反应设计 检索要求 单一芳环上存在 Br 或者 I 寻找脱 Cbz 的反应条件 一步反应 定义困难 : 如何定义这个环系, 杂环?C 环? Cbz 和环的连接方法 46
有些人会这么定义 反应中心定义正确, 但是会出现问题 47
检索出来的结果 存在我们想要的结果集 48
但是, 更多的是 存在大量的环与 Cbz 不在一个结构上的反应 49
SciFinder 中的碎片反应检索 这种类型的反应, 需要先去检索和反应相关的物质 50
亚结构物质检索, 获得所有可能的反应物 需要定义为单一组分和具备反应物或者试剂角色的物质 51
所有可能的反应物 获得所有的可能的反应物, 并获得这些物质作为反应物的反应 52
可能反应物所参与的反应 这里的反应中的反应物都包含我们要求的结构, 但是还缺少反应中心的定义 53
第一次限定, 获得单步反应 限定反应步数为一步反应 54
第二次限定, 限定反应中心 反应中心沿用之前的定义 55
限定后的结果 都是我们想要的反应结果 56
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