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第 卷 第 期 付 建 新 等 桂 花 组 织 基 因 表 达 中 荧 光 定 量 内 参 基 因 的 筛 选 内 参 基 因 的 分 析 利 用 两 步 法 来 进 行 分 析 在 实 时 仪!"#$#%&# 运 行 基 于 '! 染 料 的 来 检 测 内 参 基 因 的 循 环 阈 值 % 值 所 用 反 应 体 系 和 程 序 参 考 公 司 的 '! &( )( * +#, -# 试 剂 盒 的 说 明 书 反 应 体 系 为. 其 中 '! &( )( +#, -#. 上 下 游 定 量 引 物 &". 各 /. 模 板 01+. 0 1$. 用 灭 菌 双 蒸 水 补 齐 至. 扩 增 采 用 两 步 法 即 在 预 变 性 # 之 后 先 运 行 个 循 环 的 # # 再 运 行 溶 解 曲 线 阶 段 的 # & # # 通 过 观 察!2 实 时 仪 在 反 应 后 生 成 的 溶 解 曲 线 为 单 一 峰 判 定 所 用 引 物 无 非 特 异 扩 增 实 验 得 到 定 量 % 值 用 于 后 期 内 参 基 因 稳 定 性 分 析 数 据 处 理 与 分 析 本 研 究 采 用 3+"& +"&4 和!#%5 软 件 对 种 候 选 内 参 基 因 在 桂 花 不 同 组 织 中 的 表 达 稳 定 性 进 行 统 计 学 分 析 从 而 筛 选 桂 花 组 织 基 因 表 达 中 最 合 适 的 内 参 基 因 桂 花 基 因 验 证 内 参 基 因 稳 定 性 利 用 桂 花 不 同 组 织 中 基 因 表 达 模 式 验 证 筛 选 的 内 参 基 因 的 稳 定 性 其 表 达 上 游 引 物 为 下 游 引 物 为 结 果 与 分 析 候 选 内 参 基 因 引 物 评 价 以 桂 花 嫩 叶 的 01+ 为 模 板 利 用 对 引 物 表 个 候 选 内 参 基 因 扩 增 特 性 均 能 扩 增 出 与 各 候 选 内 参 基 因 预 期 大 小 一 致 的 单 : &0" 0;0%#%0# " # 0 % 0 3# 一 条 带 结 果 未 显 示 说 明 这 对 引 物 均 能 特 异 性 地 扩 增 相 应 片 段 可 以 用 于 分 析 溶 解 曲 线 分 析 表 明 这 对 引 物 的 扩 增 产 物 单 一 可 用 于 下 一 步 分 析 将 反 转 录 的 嫩 叶 基 因 名!% 扩 增 长 度 8: / / 扩 增 效 率 86 / 线 性 相 关 系 数 / 01+ 样 品 以 倍 浓 度 梯 度 稀 释 以 此 为 模 板 进 / / 行 扩 增 后 制 作 种 内 参 基 因 的 标 准 曲 / 线 结 果 表 显 示 各 内 参 基 因 的 线 性 相 关 系 / / 数 引 物 的 扩 增 效 率 为 6 7 6 符 合 对 扩 增 效 率 的 要 求 候 选 内 参 基 因 的 表 达 水 平 分 析 个 候 选 内 参 基 因 在 不 同 组 织 中 的 % 值 平 均 为 7 图 其 中 / 在 所 有 样 品 中 的 转 录 水 平 最 高 % 值 最 小 而 基 因 的 表 达 水 平 最 低 % 值 最 大 从 表 达 量 变 异 系 数 看 最 小 然 后 是 而 最 大 候 选 内 参 基 因 的 表 达 稳 定 性 分 析 本 研 究 首 先 采 用 3+"& 软 件 对 个 候 选 内 参 基 因 的 表 达 稳 定 性 进 行 分 析 图 结 果 显 示 在 不 同 组 织 中 和 基 因 的 基 因 表 达 稳 定 值 最 小 / 表 示 这 个 基 因 表 达 最 为 稳 定 其 次 是 / 和!" 和 / 是 稳 定 性 排 序 靠 后 的 个 候 选 内 参 基 因 其 中 / 的 值 最 大 / 是 最 不 稳 定 内 参 基 因 利 用 3+"& 程 序 对 内 参 基 因 的 配 对 差 异 值 # $8$9 进 行 分 析 图 发 现 所 检 测 的 # 8 低 于 程 序 默 认 取 舍 值 说 明 无 需 引 入 第 个 基 因 进 行 校 正 因 此 选 择 表 达 最 为 稳 定 的 个 内 参 基 因 即 % 值 图 不 同 组 织 中 个 候 选 内 参 基 因 的 平 均 % 值 43- * % -# " # 0 % 0 3# % %##-#

#$ 浙 江 农 林 大 学 学 报 年 月 日 图 % 软 件 分 析 # 个 候 选 内 参 基 因 的 表 达 稳 定 值! % " ( ) *(! + *, +, %,(,( ) % 图 $ % 软 件 分 析 # 个 候 选 内 参 基 因 的 配 对 差 异 值 " -. % $ -/ * " -. + *, +, %,(,( ) % 和 以 两 者 的 几 何 平 均 值 作 为 参 照 可 更 为 准 确 地 校 正 目 的 基 因 的 表 达 此 外 为 保 证 结 果 分 析 的 准 确 性 本 研 究 还 利 用 和!" 分 析 # 个 候 选 内 参 基 因 的 表 达 稳 定 性 表 $ 结 果 显 示 和!" 的 分 析 结 果 与 % 分 析 的 结 果 整 体 上 一 致 通 过 $ 个 软 件 评 价 得 到 的 稳 定 性 排 序 中 和 均 是 表 达 稳 定 性 最 高 的 个 基 因 其 次 是 和 表 明 这 个 基 因 在 不 同 组 织 中 的 表 达 较 为 稳 定 而 根 据 $ 个 软 件 的 分 析 和 & 是 表 达 稳 定 性 最 差 的 $ 个 候 选 内 参 基 因 综 合 $ 个 软 件 对 最 佳 内 参 基 因 和 最 差 内 参 基 因 的 评 价 表 ' 得 到 不 同 组 织 中 最 佳 内 参 基 因 为 和 而 & 是 最 差 内 参 基 因 桂 花 基 因 验 证 内 参 基 因 稳 定 性 为 了 验 证 筛 选 的 最 佳 内 参 基 因 稳 定 性 是 否 准 确 我 们 利 用 不 同 内 参 基 因 或 组 合 校 正 桂 花 不 同 组 织 中 基 因 的 相 对 表 达 图 ' 选 择 和 基 因 组 合 进 行 校 正 的 基 因 表 达 模 式 相 同 均 在 盛 开 花 序 中 表 达 量 显 著 高 于 其 他 组 织 在 花 蕾 嫩 叶 和 成 熟 叶 中 的 表 达 量 相 同 而 在 年 生 茎 中 表 达 量 最 低 以 稳 定 性 较 差 的 其 他 内 参 基 因 进 行 校 正 时 基 因 表 达 模 式 产 生 变 化 上 述 结 果 表 明 $ 个 软 件 对 内 参 基 因 表 达 稳 定 性 的 排 序 结 果 可 靠 证 实 和 为 不 同 组 织 中 最 佳 内 参 基 因 $ 讨 论 表 和! 分 析 " 个 候 选 内 参 基 因 的 表 达 稳 定 性 0( $ " ( ) + *, +, % )!" 基 因 名 分 析!" 分 析 稳 定 值 排 序 稳 定 值 排 序 #& ' ' $ ' # & &' $ & $& & # # 表 最 佳 内 参 基 因 和 最 差 内 参 基 因 综 合 结 果 0( ' 1%%% ( + " ( / +, % 分 析 软 件 最 佳 内 参 基 因 最 差 内 参 基 因 % 和 & 和 &!" 综 合 结 果 和 & 理 想 的 内 参 基 因 应 在 不 同 的 基 因 型 不 同 发 育 阶 段 不 同 组 织 器 官 不 同 胁 迫 条 件 下 均 恒 定 表 达 但 事 实 上 并 没 有 一 个 基 因 在 所 有 试 验 条 件 下 能 稳 定 表 达 因 此 需 要 根 据 不 同 试 验 材 料 和 不 同 试 验 处 理 条 件 下 筛 选 合 适 的 内 参 基 因 本 研 究 通 过 对 # 个 候 选 内 参 基 因 在 个 不 同 组 织 中 的 表 达 稳 定 性 进 行

第!! 卷第 " 期 图# %&'()* + 付建新等' 桂花组织基因表达中荧光定量 KL, 内参基因的筛选 C!$ 不同内参基因或组合校正桂花不同组织中!"#$%&'!$ 基因的相对表达,*-./&0* *12)*33&45 -*0*-3 46!"#$%&'!$ &5 7&66*)*5/ /&33(*3 (3&5' 7&66*)*5/ )*6*)*58* '*5*3 4) )*6*)*58* '*5* 849:&5./&45 64) 54)9.-&;./&45 研究! 筛选得到桂花不同组织中最佳内参基因为!"$()$ 和!"*+#<! 为后续桂花不同组织中目标基因 表达规律的研究奠定了基础" 目前! = 个统计分析软件 '*>4)9! >4)9%&57*) 和?*3/@**2*) 常用于确定不同植物材料或试验条件下 最佳的内参基因#AB $=B $A!$C$" 然而! = 个软件在许多物种中的分析结果存在差异! 如芝麻 ',-./0/ 123140/#A$! 黄花蒿 (56,/1-1..220.#$D$和牛奶子 78.,.920-0/:,88.6.#$E$" 在本研究中! = 个软件的分析结果整体排序一 致%图 < 和表 = &"!"$()$ 和!"*+#< 基因在 '*>4)9 和 >4)9%&57*) 的稳定性排序中并列第一! 而?*3/" @**2*) 软件评价!"$()$ 为表达最为稳定的内参基因!!"*+#< 基因以微弱差距排列第二" 综合 = 个软 件分析结果确定!"$()$ 和!"*+#< 基因为桂花不同组织中最佳内参基因" 有研究证实' 选择 < 个或 < 个以上的内参基因作参照! 可以减弱单一内参变化的影响! 不同内参表达的相似性有助于增加结果的可 靠度及精确度 #=B <F!<$$! 因此确定!"$()$ 和!"*+#< 基因组合为桂花不同组织中表达分析的内参基因可更 为准确地校正桂花不同组织中目的基因的表达结果",G> %).3")*-./*7 5(8-*.) 2)4/*&5 &是小 H 蛋白家族的一类! 在真核生物进化过程中比较保守! 在许多 细胞生理进程过程中发挥着重要的作用 #<<!<+$",G> 同源基因 $()=! 是金鱼草 (26155;120/ /.<0- 中 I,J" KL, 分析常用的内参基因 #<"!<A$" 通过对矮牵牛 =,6021. ;>:513. 开花过程中相关候选内参基因的筛选! 证 实 $()$ 是矮牵牛中稳定表达的内参基因之一 #<C$" 与 (#%! 7?$! 和 %*+ 等其他传统内参基因相比! 将,G> 基因作为内参基因进行研究和应用 的报道较少 " 本研究证实 $()$ 在桂花不同 组织中稳 定表达! 是最佳内参基因之一" 此外! $()$ 被证实是桂花不同品种中表达量最为稳定的内 参基因 #$=$" 与 $() 基因相同!!"*+#< 在桂花不同组织中也稳定表达! 是另一个最佳内参基因" 作为一个传统内参基因! *+# 基因在拟南芥 (5.:13@A-1-6;.81.2. #<D!=M$! 月季 $@-. ;>:513. #!$$! 侧柏 =8.6>48.30- @51,26.81- #!<$ 等物 种的 内参基因筛选中均表现最佳" 本研究发现!"$D' 在桂花不同组织中表达最不稳定! 不适合作为内参基因在桂花中应用" 同样! 在 丹参 '.8B1. /1861@55;1C. #!!$! 牡丹 =.,@21. -0""50614@-. #!+$! 大白菜 +5.--14. 5.A. 332N A,D12,2-1- #D$ 和西瓜 #16! 50880-8.2.60-#$A$中!!"$D' 基因也被证实是表达最不稳定的内参基因" 这可能与 $D' 基因在样品中高丰度

1 浙 江 农 林 大 学 学 报 年 月 日 表 达 有 关 参 考 文 献!"#"$!"% %# &' "!"&! $"(!"% )*' ')*'+!,, (%-&. / / 0+ 1 1 ' *.. / '23 3 %&"4!"% %#!"& 5!"!!"! $"(!"% )*',!+ &%,-, " $!"&!"% ((%$6!% ",!"#7 "!, #% %&"4!"% / ((",!% -,,, $%% $ $,!!. / / 8+ 88 9 88 1 :2;)./, )'' / ) 3/ $$! %&"4!"% %#!"& 5!"!!" ')*',! -7 %&!"$ " %# &!"( "! $%!%.!/ / + $61,%"+ -1$6 1 <= *6% 3." >"?= @" " =$% ((7 "&(% (! $%%!"%,!6%$7 " -"%7!6 " " # $%%$ %7 <% $! #%A. #&'! & 8 + 1 9 8 '; 2 ; '2? ; 3 $!"% $6$!"4!"% %# $%! %", $,"%>7, "!!"%!%!6 $%! %", $$&!"%, %!" &""%,"!6 #%,%(&! %# &$ % %.!& #& + 9? "-" ;2 <% &" <2 '"6% ",!"#"$!"%,!!" %# # $ #% & > ("% 7" -7 5!"!!"!"& )*'. # 1 1+ 1 9?= % <2 '"@" ) <"! $!"% %# "!- # $ #% 5!"!!"!"& (%7 & $6" $!"% " #$$ $," #%A"!,,,"##! -"%!"$! $%,"!"%. + 1 9 B B"%7% = (" B" $!"% %# # $ #% 5!"!!"!"& )*'," #%A -,,%(&! " *;100 %# 6," *6" $--! ( ( (). #&* # 0 1+ 0 < 2 2'? <%C(" "!!,,+, "&"!.!& 0 1+ 0 9 8 0 < 2 ;2. < ",$, %# "&(%&! " 5!"#"$!"% %# >("%, "!!,, $!"%.!& ' + 11 9 111 00 = ;' ; )2B. %&"4!"% %# 5')*',!+!6 $"!7 %#,%(!" 7!&! "$ >("&! $%,"!"% ($"#"$ ",!"% %# # $. +(! + 9 1 0 ;<. <; = " :",!"% %# 6%C(" "! $%!% #%!,7" >("% " "$ -7 5!"!!"!"& )*'.!&!(&* $ + 9 80 01 <= *6% 3." >"?= ",!"#"$!"% %# "!- # $ #% >("% % &"4!"% "!6 5!"!!"!"& )*' 7" %# A! %&!6 &$ % %. #, 08 + 01188,%"+ 0010@% (% 01188 0 )333 ;? *<2) )'=2; *!&"!"% %#!- 6%C(","##!"7!,!!, &( "!"!7+!(>$-,!%% " ("A" $%!"%.!&, + 8 9 808 08 '*2 ' ; '< 2 ",!"#"$!"%,!"% %# A # $ " *($ &$$ #% $$! %&"4!"% %#!"& 5!"!!" ')*',!.! #! 0 0+ 0 9 0 0 2= "6." >" =2 " 7 ",!"#"$!"% %# "!- # $ #% >("% %&"4!"% " 5')*' 7" " A!&%. #, 0 + 0,%"+ 0010@% (% 0 0 <2= <"7" *<." A *"5" " $!"% %# "- # $ #% >("%!," -7! $"(!"% 5!"!!"!"& )*' " "!$6",,"##! >("&! $%,"!"%. # ( 00 + 0 9 81 0 周 良 云 莫 歌 王 升 等 基 于 实 时 荧 光 定 量 )*' 对 镉 处 理 下 黄 花 蒿 内 参 基 因 稳 定 性 的 分 析. 中 国 中 药 杂 志 0 8+ 9

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