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- 治 戈
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1 生 物 工 程 学 报 Chin J Biotech 2009, January 25; 25(1): journals.im.ac.cn Chinese Journal of Biotechnology ISSN cjb@im.ac.cn 2009 Institute of Microbiology, CAS & CSM, All rights reserved 生 物 技 术 与 方 法 多 重 实 时 荧 光 PCR 检 测 牛 山 羊 和 绵 羊 源 性 成 分 曾 少 灵, 秦 智 锋, 阮 周 曦, 花 群 义, 卢 体 康, 吕 建 强, 陈 书 琨, 曹 琛 福, 张 彩 虹, 孙 洁, 陈 兵, 吴 绍 精 深 圳 出 入 境 检 验 检 疫 局, 深 圳 摘 要 : 根 据 牛 山 羊 和 绵 羊 线 粒 体 细 胞 色 素 b 基 因 序 列, 设 计 特 异 性 引 物 和 以 不 同 荧 光 素 标 记 的 Taqman 探 针 通 过 对 PCR 反 应 体 系 和 反 应 条 件 的 优 化 筛 选, 建 立 能 同 时 鉴 别 牛 山 羊 和 绵 羊 源 性 成 分 的 多 重 实 时 荧 光 PCR 方 法 采 用 本 文 方 法 与 国 标 GB/T 方 法 分 别 对 17 种 不 同 源 性 动 物 DNA 和 200 份 不 同 来 源 样 品 DNA 进 行 牛 羊 源 性 成 分 检 测, 数 据 显 示 两 者 检 测 结 果 符 合 率 达 100%, 特 异 性 相 当 与 国 标 方 法 相 比, 本 试 验 方 法 不 需 电 泳 酶 切 和 测 序, 即 可 在 一 个 PCR 反 应 中 同 时 鉴 别 检 测 牛 山 羊 和 绵 羊 3 种 源 性 成 分, 检 测 效 率 提 高 近 3 倍 ; 灵 敏 度 更 高, 比 国 标 方 法 灵 敏 10 倍 ; 适 用 性 更 广, 除 了 饲 料, 还 适 用 于 肉 品 奶 品 生 皮 和 动 物 油 脂 等 动 物 产 品 的 牛 羊 源 性 成 分 检 测 关 键 词 : 细 胞 色 素 b 基 因, 多 重 实 时 荧 光 PCR, 牛 山 羊 和 绵 羊 源 性 成 分 Multiplex fluorescent real-time PCR detection of bovine, goat and sheep derived materials in animal products Shaoling Zeng, Zhifeng Qin, Zhouxi Ruan, Qunyi Hua, Tikang Lu, Jianqiang Lü, Shukun Chen, Chenfu Cao, Caihong Zhang, Jie Sun, Bing Chen, and Shaojing Wu Shenzhen Entry-exit Inspection & Quarantine Bureau, Shenzhen , China Abstract: We designed the specific primers and TaqMan probes targeting cytochrome b genes of mitochondrial DNA from bovine, goat and sheep. We used different fluorescents to label the probes. After optimization of reaction conditions, we set up a multiplex fluorescent real-time PCR method to detect bovine, goat and sheep derived materials, simultaneously. We finished the detection tests of 17 kinds of animal DNA and 200 DNA samples from different sources with the developed method and the National Standard GB/T 20190Y-2006 routine PCR method. The coincidence rate of these two methods was 100%. Without electrophoresis or restriction digestion, the developed method could reduce the test time to one third as routine PCR and identify three kinds of animal derived materials including bovine, goat and sheep in one reaction. The developed method was approximately 10 times more sensitive than routine PCR, and was applicable to identifications of bovine, goat and sheep derived materials in feed stuff, meat, milk, pelt and grease, etc. The study showed that the developed real-time PCR method is a rapid, sensitive and efficacious detection assay for bovine, goat and sheep derived materials in animal products. Keywords: cytochrome b gene, multiplex fluorescent real-time PCR, bovine, goat and sheep derived materials Received: May 23, 2008; Accepted: November 13, 2008 Supported by: the Technology Project of Shenzhen Entry-exit Inspection & Quarantine Bureau (No. 2006SZK02), the Technology Project of Shenzhen Bureau of Science Technology & Information (No. SY B). Corresponding author: Shaoling Zeng. Tel/Fax: ; zengshaoling@gmail.com 深 圳 出 入 境 检 验 检 疫 局 科 技 项 目 (No. 2006SZK02) 和 深 圳 市 科 技 和 信 息 局 项 目 (No. SY B) 资 助
2 140 ISSN CN /Q Chin J Biotech January 25, 2009 Vol.25 No.1 随 着 国 际 贸 易 的 飞 速 发 展, 防 御 国 际 间 动 物 疫 病 传 播 的 难 度 在 加 大 目 前, 为 了 防 御 疯 牛 病 和 痒 病 经 饲 料 传 播, 检 疫 部 门 依 据 国 家 标 准 饲 料 中 牛 羊 源 性 成 分 的 定 性 检 测 定 性 聚 合 酶 链 式 反 应 (PCR) 法 (GB/T ) [1] 对 进 出 口 饲 料 进 行 牛 羊 源 性 成 分 检 测 这 是 一 般 PCR 方 法, 需 对 PCR 产 物 进 行 凝 胶 电 泳 才 能 完 成 整 个 检 测 一 旦 遇 到 可 疑 阳 性 结 果, 必 须 进 行 酶 切 鉴 定, 若 要 鉴 定 是 山 羊 还 是 绵 羊 源 性 成 分, 还 必 须 进 行 DNA 测 序 而 在 日 常 生 活 用 品 中 经 常 有 牛 山 羊 或 绵 羊 源 性 的 优 选 性 或 价 格 差 异 等 问 题 存 在 例 如, 一 般 来 说, 羊 肉 比 牛 肉 贵, 羊 奶 比 牛 奶 贵, 而 源 自 山 羊 或 绵 羊 的 肉 品 奶 品 皮 张 和 毛 绒 纤 维 均 有 价 格 差 异 随 着 改 革 开 放 的 不 断 深 入, 我 国 牛 羊 产 品 的 生 产 和 流 通 已 全 部 放 开, 在 经 济 利 益 的 驱 使 下, 一 些 不 法 分 子 为 牟 取 暴 利, 大 肆 掺 杂 使 假, 损 害 牛 羊 产 品 质 量, 破 坏 我 国 牛 羊 产 品 资 源, 也 可 能 对 我 国 出 口 的 [2, 牛 羊 产 品 在 国 际 市 场 上 的 声 誉 造 成 损 害 3] 要 杜 绝 这 些 掺 杂 使 假 的 现 象, 关 键 手 段 是 要 建 立 一 种 能 快 速 准 确 鉴 别 牛 山 羊 和 绵 羊 源 性 成 分 的 检 测 方 法, 为 上 述 产 品 的 质 量 做 本 质 上 的 把 关, 提 高 执 法 的 科 学 性 和 高 效 性, 进 一 步 提 高 检 验 检 疫 通 关 速 度 [4] 另 一 方 面, 很 多 饲 料 在 加 工 过 程 中 经 过 多 次 高 温 烘 焙, 其 中 DNA 要 受 到 影 响 而 降 解 为 许 多 仅 有 几 百 个 碱 基 的 小 片 段 [5], 如 果 检 测 目 的 片 段 太 大, 可 能 在 检 测 中 无 法 发 现 阳 性 片 段 而 受 电 泳 检 测 有 效 性 的 限 制, 一 般 PCR 难 以 采 纳 小 片 段 目 的 产 物 因 此, 基 于 时 效 性 和 准 确 性 上 的 优 势, 实 时 荧 光 PCR 技 术 已 经 在 动 物 源 性 成 分 检 测 的 很 多 项 目 上 逐 步 取 代 了 一 般 PCR 方 法, 成 为 检 测 动 物 源 性 成 分 最 常 用 的 分 子 生 物 学 方 法 [6] 本 研 究 根 据 用 作 动 物 品 种 鉴 定 标 志 的 线 粒 体 基 因 [7 12], 选 取 其 中 细 胞 色 素 b 基 因 的 保 守 区 段, 分 别 设 计 了 针 对 牛 山 羊 和 绵 羊 源 性 成 分 的 引 物 与 探 针, 分 别 以 FAM ROX 和 HEX 荧 光 素 进 行 标 记, 牛 山 羊 和 绵 羊 源 性 成 分 的 扩 增 目 的 片 段 大 小 分 别 为 92 bp 136 bp 和 136 bp, 大 小 仅 为 国 标 方 法 目 的 片 段 的 1/2~1/3, 成 功 建 立 了 能 同 时 检 测 牛 山 羊 和 绵 羊 源 性 成 分 的 多 重 实 时 荧 光 PCR 方 法, 适 用 于 饲 料 肉 品 奶 品 生 皮 和 动 物 油 脂 等 动 物 产 品 的 牛 山 羊 和 绵 羊 源 性 成 分 的 鉴 定 1 材 料 和 方 法 1.1 样 品 DNA 样 品 来 源 于 17 种 动 物 : 牛 肉 猪 肉 狗 肉 兔 肉 鸡 肉 鸭 肉 鹅 肉 鸽 子 肉 火 鸡 肉 鸵 鸟 肉 和 鱼 肉 购 自 深 圳 超 市 ; 山 羊 肉 购 自 广 东 深 圳 和 河 南 安 阳 两 地 超 市 ; 绵 羊 肉 购 自 陕 西 西 安 和 内 蒙 古 呼 和 浩 特 两 地 超 市 ; 猫 血 在 深 圳 一 家 宠 物 医 院 采 集 ; 马 血 驴 血 和 鹿 血 在 甘 肃 兰 州 采 集 此 外, 200 份 不 同 来 源 样 品 : 本 地 收 集 的 各 种 肉 制 品 40 份 奶 品 10 份, 福 建 浙 江 等 地 的 国 产 饲 料 30 份, 由 美 国 加 拿 大 日 本 新 加 坡 马 来 西 亚 法 国 英 国 西 班 牙 等 多 个 国 家 进 口 的 肉 骨 粉 乳 清 粉 血 粉 羽 毛 粉 和 各 种 饲 料 添 加 剂 等 饲 料 样 品 76 份, 动 物 生 皮 制 品 5 份, 进 口 宠 物 饲 料 20 份, 动 物 骨 骼 5 份 和 进 口 猪 油 渣 饲 料 14 份 1.2 试 剂 和 仪 器 细 胞 / 组 织 基 因 组 提 取 试 剂 盒 和 动 物 源 性 植 物 饲 料 基 因 组 DNA 提 取 试 剂 盒 均 购 自 广 州 英 韦 创 津 生 物 科 技 有 限 公 司, 为 TIANGEN 品 牌 全 血 基 因 组 提 取 试 剂 盒 Ex Taq DNA 聚 合 酶 及 反 应 缓 冲 液 dntp MgCl 2 DNA 分 子 量 Marker DL 2000 电 泳 上 样 缓 冲 液 等 PCR 生 化 反 应 试 剂 购 自 宝 生 物 工 程 ( 大 连 ) 有 限 公 司 引 物 与 探 针 由 上 海 基 康 生 物 科 技 有 限 公 司 负 责 合 成 DNA 测 序 由 宝 生 物 工 程 ( 大 连 ) 有 限 公 司 完 成 ABI 7500 荧 光 定 量 PCR 仪 为 ABI 公 司 产 品, T-Gradient PCR 仪 为 Biometra 公 司 产 品, 5415 R 型 高 速 离 心 机 为 Eppendorf 公 司 产 品, BTS-20.M 凝 胶 成 像 仪 为 UVITec 公 司 产 品 1.3 方 法 引 物 与 探 针 的 设 计 从 GenBank 上 提 取 包 括 牛 羊 在 内 的 种 属 相 关 的 动 物 线 粒 体 基 因 序 列, 排 序 分 析 后 选 定 鉴 别 序 列 位 置, 充 分 考 虑 引 物 与 探 针 之 间 的 二 级 结 构 关 系, 进 行 Blaster 分 析 确 保 引 物 与 探 针 的 特 异 性 设 计 一 对 引 物 扩 增 牛 DNA, 一 对 通 用 引 物 扩 增 山 羊 和 绵 羊 DNA, 设 计 3 条 探 针 分 别 针 对 牛 山 羊 和 绵 羊, 以 不 同 荧 光 素 标 记, 保 证 探 针 退 火 温 度 至 少 比 引 物 高 5 o C, 各 条 引 物 之 间 或 各 条 探 针 之 间 的 退 火 温 度 相 差 不 超 过 2 o C
3 曾 少 灵 等 : 多 重 实 时 荧 光 PCR 检 测 牛 山 羊 和 绵 羊 源 性 成 分 样 品 DNA 的 提 取 血 粉 和 全 血 样 品 依 照 全 血 基 因 组 提 取 试 剂 盒 中 的 操 作 说 明 提 取 DNA 肉 品 动 物 源 性 饲 料 及 饲 料 添 加 剂 奶 品 生 皮 骨 骼 等 样 品 按 照 细 胞 / 组 织 - 基 因 组 提 取 试 剂 盒 中 的 操 作 说 明 提 取 DNA 植 物 性 饲 料 及 饲 料 添 加 剂 按 动 物 源 性 植 物 饲 料 基 因 组 DNA 提 取 试 剂 盒 中 的 操 作 说 明 提 取 DNA 猪 油 渣 等 油 脂 类 样 品 按 文 献 [13] 的 方 法 提 取 DNA 单 一 荧 光 PCR 方 法 的 建 立 引 物 与 探 针 分 组 配 对, 对 牛 山 羊 绵 羊 鹿 马 驴 猪 猫 狗 兔 鱼 鸡 鸭 鹅 鸽 子 火 鸡 和 鸵 鸟 共 17 种 不 同 动 物 DNA 进 行 检 测, 验 证 引 物 与 探 针 的 扩 增 有 效 性 和 特 异 性, 建 立 分 别 检 测 牛 山 羊 和 绵 羊 源 性 成 分 的 单 一 荧 光 PCR 方 法 将 DNA 模 板 分 别 为 牛 山 羊 和 绵 羊 的 荧 光 PCR 阳 性 扩 增 产 物 送 宝 生 物 ( 大 连 ) 有 限 公 司 进 行 DNA 克 隆 测 序, 分 析 比 对 序 列, 确 定 阳 性 扩 增 产 物 是 否 为 目 的 源 性 成 分 引 物 探 针 dntp Mg 2+ 浓 度 Taq 酶 用 量 和 反 应 条 件 的 优 化 分 别 以 牛 山 羊 和 绵 羊 为 研 究 对 象, 反 应 体 系 设 定 为 50 μl, 筛 选 引 物 探 针 dntp 和 Mg 2+ 的 最 佳 浓 度 引 物 浓 度 由 0.25 μmol/l~0.6 μmol/l 以 0.05 μmol/l 递 增, 探 针 浓 度 由 0.1 μmol/l~ 0.45 μmol/l 以 0.05 μmol/l 递 增, dntp 浓 度 由 mmol/l ~0.25 mmol/l 以 mmol/l 递 增, Mg 2+ 浓 度 由 0.75 mmol/l~2.5 mmol/l 以 0.25 mmol/l 递 增 Taq 酶 用 量 以 单 位 U 计 算, 由 1 U~5 U 以 0.5 U 递 增 每 次 试 验 采 用 等 量 模 板 和 只 设 一 个 变 量, 以 Ct 值 荧 光 增 量 和 平 台 期 等 因 素 为 考 察 依 据, 每 个 成 分 的 浓 度 筛 选 重 复 实 验 3 次, 若 结 果 稳 定, 可 确 定 为 最 佳 浓 度 值 根 据 引 物 与 探 针 的 退 火 温 度, 以 优 化 好 的 反 应 体 系 摸 索 PCR 最 佳 反 应 条 件, 在 95 o C 1~12 min; 95 o C 15~30 s, 55 o C~63 o C 35~60 s 35~45 个 循 环 的 范 围 内 反 复 进 行 试 验, 每 次 试 验 采 用 等 量 模 板, 每 个 反 应 条 件 重 复 试 验 3 次, 以 Ct 值 荧 光 增 量 平 台 期 和 耗 时 等 因 素 为 考 察 依 据, 确 定 最 佳 反 应 条 件 单 一 荧 光 PCR 检 测 方 法 的 相 对 灵 敏 度 实 验 将 提 取 的 牛 山 羊 和 绵 羊 来 源 的 DNA 模 板 原 液 进 行 梯 度 稀 释, 即 , 等 8 个 梯 度, 以 优 化 好 的 反 应 体 系 和 反 应 条 件, 分 别 进 行 牛 山 羊 和 绵 羊 源 性 成 分 的 荧 光 PCR 检 测 溶 解 曲 线 检 测 和 PCR 产 物 电 泳 检 测 然 后 各 取 一 份 使 用 国 标 GB/T 20190Y-2006 方 法 进 行 牛 羊 源 性 成 分 的 PCR 检 测, 电 泳 后 观 察 结 果 以 上 每 组 检 测 必 须 重 复 5 次, 每 个 检 测 设 置 2 个 平 行 试 验, 只 有 当 每 种 方 法 的 5 次 重 复 试 验 与 所 有 平 行 试 验 结 果 都 一 致 时, 才 确 定 为 该 种 方 法 能 检 测 到 的 最 低 模 板 梯 度 此 时, 比 较 2 种 方 法 能 检 测 到 的 最 低 模 板 梯 度, 完 成 相 对 灵 敏 度 分 析 [14] 多 重 实 时 荧 光 PCR 方 法 的 建 立 2 对 引 物 和 3 条 探 针 组 合 起 来, 模 板 采 用 等 比 例 混 合 的 牛 山 羊 和 绵 羊 DNA 原 液, 参 照 方 法 对 多 重 实 时 荧 光 PCR 反 应 体 系 中 的 引 物 探 针 dntp Mg 2+ 浓 度 Taq 酶 用 量 和 反 应 条 件 进 行 优 化 [15,16], 并 完 成 溶 解 曲 线 检 测 多 重 实 时 荧 光 PCR 方 法 的 特 异 性 和 相 对 灵 敏 度 实 验 对 17 种 动 物 DNA 以 及 牛 山 羊 和 绵 羊 DNA 模 板 原 液 的 等 比 例 混 合 样 进 行 多 重 实 时 荧 光 PCR 检 测, 考 察 检 测 方 法 的 特 异 性 依 照 方 法 1.3.5, 分 别 利 用 多 重 实 时 荧 光 PCR 方 法 和 国 标 GB/T 20190Y 方 法 对 牛 山 羊 和 绵 羊 的 梯 度 模 板 液 进 行 检 测, 比 较 2 种 方 法 能 检 测 到 的 最 低 模 板 梯 度, 完 成 相 对 灵 敏 度 分 析 样 品 检 测 分 别 采 用 多 重 实 时 荧 光 PCR 方 法 和 国 标 GB/T 20190Y-2006 方 法 对 200 份 不 同 来 源 的 DNA 样 品 进 行 牛 羊 源 性 成 分 检 测, 进 一 步 验 证 多 重 荧 光 PCR 方 法 的 特 异 性 在 每 一 个 检 测 试 验 中 采 用 同 管 等 量 的 DNA 模 板, 每 份 DNA 样 品 的 每 种 方 法 检 测 必 须 重 复 2 次, 每 次 均 设 置 2 个 平 行 试 验, 只 有 当 每 种 方 法 的 2 次 重 复 试 验 与 所 有 平 行 试 验 结 果 都 一 致 时, 才 确 定 该 份 DNA 样 品 的 检 测 结 果, 否 则 需 重 新 进 行 检 测 最 后, 分 别 比 对 2 种 方 法 对 每 一 份 DNA 样 品 的 检 测 结 果 是 否 一 致, 计 算 2 种 方 法 的 检 测 结 果 符 合 率 2 结 果 2.1 单 一 荧 光 PCR 检 测 方 法 的 建 立 设 计 一 对 引 物 B-F 和 B-R 扩 增 牛 DNA, 一 对 通 用 引 物 G-O-F 和 G-O-R 扩 增 山 羊 和 绵 羊 DNA, 各 条
4 142 ISSN CN /Q Chin J Biotech January 25, 2009 Vol.25 No.1 引 物 的 退 火 温 度 介 于 55 o C~56 o C 之 间 ; 探 针 B-probe ( 牛 ) 以 FAM 标 记, G-probe( 山 羊 ) 以 ROX 标 记, O-probe ( 绵 羊 ) 以 HEX 标 记, 各 条 探 针 的 退 火 温 度 介 于 70 o C~72 o C 之 间 ; 牛 山 羊 和 绵 羊 DNA 扩 增 的 目 的 片 段 大 小 分 别 为 92 bp 136 bp 和 136 bp 3 种 单 一 荧 光 PCR 方 法 对 17 种 不 同 动 物 DNA 的 检 测 结 果 表 明 方 法 的 特 异 性 良 好, 不 存 在 交 叉 反 应 DNA 测 序 结 果 表 明, 荧 光 PCR 阳 性 扩 增 产 物 的 序 列 分 别 与 预 期 序 列 一 致, 分 别 确 定 为 牛 山 羊 和 绵 羊 源 性 成 分 2.2 引 物 探 针 dntp Mg 2+ 浓 度 Taq 酶 用 量 和 反 应 条 件 的 优 化 经 筛 选 分 别 确 定 了 3 种 单 一 荧 光 PCR 的 反 应 体 系 (50 μl) 和 反 应 条 件, 各 成 分 浓 度 Taq 酶 用 量 和 反 应 条 件 见 表 1 表 1 优 化 后 的 牛 / 山 羊 / 绵 羊 源 性 成 分 单 一 荧 光 PCR 反 应 体 系 (50 μl) 和 反 应 条 件 Table 1 The optimized reaction system and program of single fluorescence real-time PCR detection for bovine, goat or sheep-derived materials (50 μl) Animal derived Primer (μmol/l) Probe (μmol/l) dntp (mmol/l) Mg 2+ (mmol/l) Taq enzyme dosage(u) PCR program Bovine derived o C 2 min, 40 cycles of 95 o C 15 s and 60 o C 35 s Goat derived o C 2 min, 40 cycles of 95 o C 20 s and 60 o C 40 s Sheep derived o C 2 min, 40 cycles of 95 o C 20 s and 58 o C 40 s 图 1 牛 源 性 成 分 荧 光 PCR(A) 溶 解 曲 线 (B) 和 电 泳 (C) 检 测 的 灵 敏 度 试 验 结 果 Fig. 1 Results of sensitivity tests of fluorescent real-time PCR (A), dissociation (B) and electrophoresis (C) detection for bovine derived materials. M: DL 2000 DNA marker; 1 8: template dilution of 10 0, 10 1, 10 2, 10 3, 10 4, 10 5, 10 6, 10 7 ; 9: negative control (NTC). 图 2 山 羊 源 性 成 分 荧 光 PCR (A) 溶 解 曲 线 (B) 和 电 泳 (C) 检 测 的 灵 敏 度 试 验 结 果 Fig. 2 Results of sensitivity tests of fluorescent real-time PCR (A), dissociation (B) and electrophoresis (C) detection for goat derived materials. M: DL 2000 DNA marker; 1 8: template dilution of 10 0, 10 1, 10 2, 10 3, 10 4, 10 5, 10 6, 10 7 ; 9: NTC.
5 曾 少 灵 等 : 多 重 实 时 荧 光 PCR 检 测 牛 山 羊 和 绵 羊 源 性 成 分 单 一 荧 光 PCR 检 测 方 法 的 相 对 灵 敏 度 实 验 按 方 法 1.3.5, 经 多 次 试 验 后, 确 定 牛 山 羊 和 绵 羊 源 性 成 分 单 一 荧 光 PCR 的 最 低 检 测 限 分 别 达 到 和 10 4 模 板 梯 度, 荧 光 PCR 溶 解 曲 线 和 PCR 产 物 电 泳 等 检 测 结 果 分 别 如 图 1 (A B C), 图 2 (A B C) 和 图 3 (A B C) 按 方 法 1.3.5, 经 多 次 试 验 后, 确 定 国 标 GB/T 20190Y-2006 方 法 进 行 牛 羊 ( 山 羊 和 绵 羊 ) 源 性 成 分 PCR 的 最 低 检 测 限 分 别 达 到 和 10 3 ( 图 4~6) 灵 敏 度 比 对 试 验 结 果 表 明, 本 研 究 采 用 的 荧 光 PCR 方 法 比 国 标 方 法 灵 敏 约 10 倍 2.4 多 重 实 时 荧 光 PCR 方 法 的 建 立 经 筛 选 优 化, 确 定 50 μl 反 应 体 系 中 各 成 分 的 终 浓 度 分 别 为 : 1 Ex Taq 酶 反 应 缓 冲 液, dntp 为 0.25 mmol/l, MgCl 2 为 2.5 mmol/l, 引 物 B-F B-R G-O-F 和 G-O-R 均 为 0.4 μmol/l, 牛 探 针 B-probe 为 0.3 μmol/l, 山 羊 探 针 G-probe 为 0.3 μmol/l, 绵 羊 探 针 Ovi-probe 为 0.2 μmol/l, Ex Taq 酶 5 U 优 化 后 确 定 的 反 应 条 件 为 : 95 o C 2 min, 40 个 循 环 的 95 o C 15 s 和 58 o C 40 s, 总 耗 时 大 约 75 min 对 17 种 动 物 DNA 模 板 分 别 进 行 多 重 实 时 荧 光 PCR 检 测, 能 特 异 性 地 检 测 出 牛 山 羊 和 绵 羊 DNA, 与 其 他 14 种 动 物 DNA 无 交 叉 反 应 ( 图 7) 对 牛 山 羊 和 绵 羊 DNA 原 液 的 等 比 例 混 合 模 板 进 行 多 重 实 时 荧 光 PCR 检 测, 能 同 时 检 测 出 3 种 动 物 DNA ( 图 8) 分 别 对 牛 山 羊 绵 羊 DNA 和 三 者 DNA 的 等 比 例 混 合 模 板 的 多 重 实 时 荧 光 PCR 产 物 进 行 溶 解 曲 线 检 测, 结 果 显 示, 3 种 单 一 DNA 模 板 的 PCR 产 物 的 溶 解 温 度 很 接 近, 介 于 79.4 o C~82.1 o C 之 间, 混 合 模 板 的 PCR 产 物 的 溶 解 曲 线 积 累 显 示 为 一 个 峰 ( 图 9) 图 4 GB/T 20190Y-2006 牛 源 性 成 分 PCR 检 测 的 灵 敏 度 试 验 结 果 Fig. 4 Results of sensitivity tests of GB/T 20190Y-2006 method detection for bovine derived materials. M: DL 2000 DNA Marker; 1 8: template dilution of 10 0, 10 1, 10 2, 10 3, 10 4, 10 5, 10 6, 10 7 ; 9: NTC. 图 3 绵 羊 源 性 成 分 荧 光 PCR(A) 溶 解 曲 线 (B) 和 电 泳 (C) 检 测 的 灵 敏 度 试 验 结 果 Fig. 3 Results of sensitivity tests of fluorescent real-time PCR (A), dissociation (B) and electrophoresis (C) detection for sheep derived materials. M: DL 2000 DNA marker; 1: NTC; 2 9: template dilution of 10 0, 10 1, 10 2, 10 3, 10 4, 10 5, 10 6, 图 5 GB/T 20190Y-2006 羊 源 性 成 分 PCR 检 测 对 山 羊 DNA 的 灵 敏 度 试 验 结 果 Fig. 5 Results of sensitivity tests of GB/T 20190Y-2006 method detection for goat derived materials. M: DL 2000 DNA Marker; 1: NTC; 2 9: template dilution of 10 7, 10 6, 10 5, 10 4, 10 3, 10 2, 10 1, 10 0.
6 144 ISSN CN /Q Chin J Biotech January 25, 2009 Vol.25 No.1 图 6 GB/T 20190Y-2006 羊 源 性 成 分 PCR 检 测 对 绵 羊 DNA 的 灵 敏 度 试 验 结 果 Fig. 6 Results of sensitivity tests of GB/T 20190Y-2006 method detection for sheep derived materials. M: DL DNA marker; 1: NTC; 2 9: template dilution of 10 7, 10 6, 10 5, 10 4, 10 3, 10 2, 10 1, 图 8 牛 山 羊 和 绵 羊 三 种 DNA 混 合 模 板 液 的 多 重 实 时 荧 光 PCR 检 测 结 果 Fig. 8 Results of multiplex fluorescent real-time PCR detection for mix-template of DNA from bovine, goat and sheep. 图 7 17 种 动 物 DNA 的 多 重 实 时 荧 光 PCR 检 测 结 果 Fig. 7 Results of multiplex fluorescent real-time PCR detection for DNA samples from 17 animals. 2.5 多 重 实 时 荧 光 PCR 方 法 的 相 对 灵 敏 度 实 验 按 方 法 和 1.3.7, 经 多 次 试 验 后, 确 定 多 重 实 时 荧 光 PCR 方 法 对 牛 山 羊 和 绵 羊 源 性 成 分 的 最 低 检 测 限 分 别 达 到 和 10 4 模 板 梯 度, 与 单 一 荧 光 PCR 检 测 低 限 一 致, 比 国 标 方 法 大 约 灵 敏 10 倍 2.6 样 品 检 测 结 果 按 方 法 1.3.8, 分 别 采 用 多 重 实 时 荧 光 PCR 方 法 和 国 标 方 法 对 本 室 收 集 的 200 份 不 同 来 源 DNA 样 品 进 行 牛 羊 源 性 成 分 检 测 检 测 结 果 表 明, 多 重 实 时 荧 光 PCR 方 法 具 有 良 好 的 特 异 性, 与 国 标 方 法 的 检 测 结 果 符 合 率 为 100%, 未 出 现 假 阳 性 或 假 阴 性 结 果, 两 种 方 法 的 检 测 结 果 比 对 见 表 2 3 讨 论 当 前, 动 物 源 性 成 分 检 测 受 到 越 来 越 多 的 关 注, 已 广 泛 应 用 到 饲 料 加 工 食 品 和 皮 革 等 多 个 领 域 图 9 牛 山 羊 绵 羊 DNA 和 3 种 DNA 混 合 模 板 的 多 重 实 时 荧 光 PCR 产 物 溶 解 曲 线 检 测 结 果 Fig. 9 Results of dissociation test of multiplex fluorescent real-time PCR products from bovine, goat, sheep and their mix-template DNA. 我 国 检 验 检 疫 部 门 主 要 对 进 出 口 饲 料 进 行 牛 羊 源 性 成 分 检 测, 目 的 是 防 止 疯 牛 病 痒 病 等 动 物 性 疾 病 通 过 贸 易 途 径 传 入 我 国, 而 一 些 国 家 甚 至 还 颁 布 法 规 禁 止 在 反 刍 类 动 物 饲 料 中 添 加 和 使 用 任 何 动 物 源 性 饲 料 [17] 但 在 日 常 生 活 中, 其 实 很 多 消 费 者 都 对 一 些 生 活 品 的 动 物 源 性 成 分 表 示 关 心 例 如, 目 前 市 场 上 广 泛 宣 传 羊 奶 比 牛 奶 营 养 价 值 高, 特 别 是 孕 妇 喝 羊 奶 对 胎 儿 发 育 有 良 好 作 用, 市 面 上 纷 纷 涌 现 专 业 供 应 羊 奶 的 订 购 点, 还 声 称 采 用 高 新 技 术 去 除 了 羊 奶 腥 味, 口 感 更 好, 不 过 价 格 比 牛 奶 要 贵 1~2 倍 一 些 加 工 肉 制 品, 如 肉 干 肉 肠 和 肉 丸 等, 由 于 添 加 了 大 量 香 料, 消 费 者 进 食 时 很 难 分 辨 是 否 为 某 种 肉 类 制 品, 而 不 同 肉 类 制 品 的 价 格 差 异 又 很 大, 如 果 缺 乏 相 关 的 检 验 监 管, 不 法 商 人 就 有 鱼 目 混 珠 的 机 会 利 用 本 研 究 建 立 的 多 重 实 时 荧 光 PCR 方 法 和 国
7 曾 少 灵 等 : 多 重 实 时 荧 光 PCR 检 测 牛 山 羊 和 绵 羊 源 性 成 分 145 表 2 多 重 实 时 荧 光 PCR 方 法 和 GB/T 20190Y-2006 方 法 的 样 品 检 测 比 对 结 果 Table 2 Comparison of results detected by multiplex fluorescent real-time PCR and GB/T 20190Y-2006 method Test method Kinds of animal source Feed Meat Milk Pelt Others Total Total Multiplex fluorescent real-time PCR GB/T 20190Y-2006 Bovine derived Goat derived Sheep derived Negative Bovine derived Goat/sheep derived Negative 标 GB/T 20190Y-2006 方 法, 对 本 研 究 收 集 的 200 份 不 同 来 源 样 品 进 行 牛 羊 源 性 成 分 检 测, 两 者 的 检 测 结 果 一 致, 没 有 出 现 假 阳 性 或 假 阴 性 结 果, 检 测 符 合 率 达 100% 其 中, 购 买 的 10 份 奶 品 中 有 鲜 牛 奶 3 份 鲜 羊 奶 3 份 牛 奶 饮 品 2 份 和 羊 奶 饮 品 2 份, 但 检 测 后 发 现 没 有 任 何 一 份 样 品 中 含 有 山 羊 或 绵 羊 源 性 成 分, 其 中 9 份 样 品 含 牛 源 性 成 分, 1 份 样 品 无 任 何 牛 或 羊 源 性 成 分, 检 测 结 果 与 产 品 宣 传 相 差 甚 远, 情 况 令 人 担 忧 收 集 的 5 份 牛 羊 生 皮 样 品 中, 经 检 测 只 有 1 份 牛 皮 和 2 份 山 羊 皮 与 商 品 名 相 符, 1 份 商 品 名 为 山 羊 皮 的 检 测 结 果 为 绵 羊 源 性, 1 份 生 皮 样 品 不 含 任 何 牛 羊 源 性 成 分, 是 假 冒 商 品 从 本 地 6 家 专 营 东 山 羊 火 锅 或 烤 肉 的 食 店 收 集 山 羊 肉, 经 检 测 仅 有 3 家 羊 肉 为 山 羊 源 性, 另 外 3 家 羊 肉 均 为 绵 羊 源 性, 表 明 某 些 食 店 存 在 以 绵 羊 肉 替 代 山 羊 肉 欺 骗 消 费 者 的 情 况 鉴 于 山 羊 奶 比 牛 奶 贵, 山 羊 肉 比 绵 羊 肉 贵, 而 羊 皮 又 以 山 羊 皮 为 好 且 价 格 较 高, 一 些 商 家 经 常 掺 杂 使 假 谋 取 暴 利 通 过 多 重 实 时 荧 光 PCR 方 法 的 检 测, 可 快 速 有 效 地 鉴 别 牛 山 羊 和 绵 羊 源 性 成 分, 杜 绝 这 些 不 法 行 为 此 外, 对 本 室 自 2003 年 至 今 收 集 的 106 份 进 口 饲 料 进 行 检 测, 其 中 从 12 份 牛 肉 骨 粉 中 检 测 到 2 份 山 羊 源 性 成 分 和 10 份 绵 羊 源 性 成 分, 说 明 在 一 些 进 口 牛 肉 骨 粉 中 还 不 同 程 度 地 掺 入 了 山 羊 或 绵 羊 组 织, 而 这 些 都 是 疯 牛 病 和 痒 病 传 播 的 高 风 险 物 质, 应 当 引 起 检 疫 部 门 的 高 度 重 视 本 研 究 建 立 的 多 重 实 时 荧 光 PCR 方 法, 通 过 特 异 性 探 针 在 进 行 PCR 过 程 中 检 测 荧 光 增 量 得 知 检 测 结 果, 能 在 一 个 PCR 反 应 中 同 时 检 测 出 牛 山 羊 和 绵 羊 源 性 成 分 对 17 种 不 同 动 物 DNA 样 品 和 200 份 不 同 来 源 DNA 样 品 进 行 多 重 实 时 荧 光 PCR 和 国 标 GB/T 20190Y-2006 一 般 PCR 检 测, 实 验 结 果 表 明, 与 国 标 方 法 相 比, 多 重 实 时 荧 光 PCR 检 测 方 法 具 有 以 下 优 势 : 1) 将 PCR 检 测 周 期 从 至 少 4 h 减 少 到 1 h 左 右, 检 测 效 率 提 高 近 3 倍, 免 去 了 一 般 PCR 检 测 鉴 定 可 疑 阳 性 样 品 必 须 进 行 的 酶 切 电 泳 和 DNA 测 序 等 步 骤 ; 2) 除 了 能 特 异 性 鉴 定 检 测 出 牛 羊 源 性 成 分, 还 能 同 时 区 分 山 羊 和 绵 羊 源 性 成 分 ; 3) 相 对 灵 敏 度 试 验 结 果 表 明, 检 测 灵 敏 度 比 国 标 方 法 大 约 高 出 10 倍 ; 4) 实 用 性 更 广, 不 仅 适 用 于 饲 料 样 品 的 检 测, 还 适 用 于 肉 品 奶 品 生 皮 和 动 物 油 脂 等 多 种 动 物 产 品 的 牛 山 羊 和 绵 羊 源 性 成 分 检 测, 是 防 止 商 家 掺 假 牟 利 的 有 效 手 段 REFERENCES [1] 国 家 标 准 GB/T 饲 料 中 牛 羊 源 性 成 分 的 定 性 检 测 定 性 聚 合 酶 链 式 反 应 (PCR) 法. [2] Li S, Wang JH, Gao JX, et al. Detection of cattle and sheep-derived materials in feed products of ruminant feed and animal-derived feed in shaanxi province. Prog Vet Med, 2007, 28(4): 李 胜, 王 建 华, 高 巨 星, 等. 陕 西 省 反 刍 动 物 饲 料 产 品 和 动 物 源 性 饲 料 中 牛 羊 源 性 成 分 检 测. 动 物 医 学 进 展, 2007, 28(4): [3] [4] htm. [5] Ebbehoj EF, Thomsen PD. Species differentiation of heated meat products by DNA hybridization. Meat Sci, 1990, 30(3): [6] Liu XH, Ma GP, Shi XJ, et al. Advance in the detection methods of commercial animal-derived materials. Prog Vet Med, 2007, 28(10): 刘 旭 辉, 马 贵 平, 史 喜 菊, 等. 商 品 中 动 物 源 性 成 分 检 测 方 法 的 研 究 进 展. 动 物 医 学 进 展, 2007, 28(10):
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