工作汇报

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故灸乘
4 years ago
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1 3.4 PubMed 的检索

2 3.4.1 数据库简介

3 出版者美国家医学图书馆国家生物技术信息中心收录数据查找医学文献利用率最高的免费数据库 >2100 万,70 余万条 / 年, 周二 - 周六每日更新英文 76% (2000 年以来 90%) 英文文摘和全文链接 >80%(5% 免费全文 ) 涉及学科领域包括生物医学保健生命科学行为科学化学和生物工程等提供与其它相关网站和 NCBI 其它分子生物资源的链接

4 数据来源与构成 1 Medline 记录标注 [PubMed - indexed for MEDLINE] 2 PreMedline 临时性医学文献, 每天接收新数据, 经 MeSH 词表标引后, 每周向 Medline 移加一次记录标注 [PubMed - in process] 3 Publisher supplied citations 出版商直接提供的文献, 标注 [PubMed - as supplied by publisher] 每天不停地向 PreMedline 传送, 一旦被 PreMedline 收录, 则改为 PubMed-in process 标记, 经主题标引后转入 Medline

5 数据来源与构成 Medline 收录 1946 年以来世界 70 多个国家和地区 39 种语言出版 ( 较老期刊涉及 60 种语言 ) 的 5,600 余种生物医学和卫生保健等核心期刊文献的题录和文摘信息截至 2012 年初有记录 1900 余万条,2010 年新增记录 70 余万条周二 ~ 周六每天更新

6 数据来源与构成 Medline 对北美地区生物医学期刊文献收录较全, 收录中文期刊 60 余种 2005 年 ~2009 年期间更新的记录 :45% 来自美国出版刊物,91% 为英文,83% 有英文文摘覆盖学科 : 生物医学和保健, 主要侧重于临床医学牙科护理学及卫生等方面 2000 年开始收录生命科学方面的文献均用 MeSH 词进行了标引

7 访问方式访问网址国外网站, 网络需要登录出校要求 IE7 以上的浏览器, 不需要安装插件免费网络资源

8 检索方式关键词检索词组检索字段检索词表检索基本检索 (Basic) 高级检索 (Advanced) 限定检索 (limits) 检索语法支持字段检索支持逻辑组合检索 (AND/OR/NOT) 支持截词运算符 (*) 支持词组检索 ( 引号 )

9 检索功能 - 最大特色检索词自动匹配功能 (automatic term mapping) 检索框中输入任何有意义的词 ( 入口词款目词 ), 系统在后台智能化地与数据库中的各类词表进行比对, 并构造检索式

10 检索功能 - 最大特色检索词自动匹配功能 (automatic term mapping) 该匹配过程将重要的词语结合在一起, 并将不规范的词语转换成规范的用词例如 : 键入 vitamin c common cold, 系统会将自动转换成如下检索式进行检索 : ( ascorbic acid [MeSH Terms] OR vitamin c[text Word]) AND ( common cold [MeSH Terms] OR common cold [Text Word])

11 检索功能 - 最大特色检索词自动匹配功能 (automatic term mapping)

12 3.4.2 检索演示

13 基本检索框可完成以下检索 : (1) 单词短语词组检索 (2) 作者检索 (3) 期刊名称检索 (4) 截词检索 (5) 组合检索

14 Knee joint 输入检索词 Knee joint 自动匹配转换进行逻辑组合 ("knee joint"[mesh Terms] OR ("knee"[all Fields] AND "joint"[all Fields]) OR "knee joint"[all Fields]) AND ("biomechanics"[mesh Terms] OR "biomechanics"[all Fields]) 出现关键词下拉菜单可从中选择所需检索词主题词 + 自由词同时检索保证查准和查全

15 MeSH Translation Table 主题词注释表自动转换匹配 Journals 主题词 (21,900 Translation 多个 Table ) 医学主题词表也叫叙词期刊注释表 (Descriptor) 检索框中输入任何 Medical Subject Headings(MeSH) 有意义的词 ( 入口主要主题词 Common Phrase, 可缩小检索范围 List 常用词组表一个主题词表达一个名词概念词款目词 ), 在, 涵盖同一主题概念的同义词或近义词数据库主题标引可避免主题概念的后台智能化地与数分散据库中的各类词表, 从而保证检索的准确全面主题词表每年更新新技术新概念主题标引滞后最新的文献最好用进行比对, 并构造自由词检索检索式, 不用主题词检索 MeSH Terms MeSH Major Topic MeSH Subheadings 检索词拆分 AND 副主题词 Author (83 Index 个 ) 作者索引表也叫限定词 (qualifiers) 主题词与相应的副主题词组配, 可以缩小检索范围 No Mapping

16 词组检索固定词组检索缩小检索范围任意词检索 "knee joint"[mesh Terms] OR ("knee"[all Fields] AND "joint"[all Fields]) OR "knee joint"[all Fields] 固定词组检索 "knee joint"[all Fields] 条条

17 截词检索末尾加 * 号, 检索出以该词为词根的所有的词截词检索将关闭自动词语匹配功能检索多个词时, 可能按词组来处理 biomechanic knee joint biomechanic*

18 字段检索 knee joints [TI] 限制在论文题名中检索输入格式 : 检索词 [ 字段名称代码 ]

19 姓名检索年 : 对论文作者的著录个数没有限制年 : 著录论文前 10 位作者,10 位以后的作者用 et al. 表示年 : 著录论文前 24 位作者, 最后一位作者为论文的最后一位作者其余的作者用 et al. 表示 2000 年至今 : 对论文作者的著录个数没有限制作者姓氏全称和名字的首字母缩写, 格式为 : 著者姓空格名字首字母缩写, 例如 :smith ja 可以和作者单位组合检索缩小检索范围, 例如 : (shi y or shi yg) and tsinghua

20 姓名检索考虑不同的英文名书写, 系统会自动执行截断检索例如 : 键入 o brien j [au], 系统将检索 o brien ja, o brien jb, o brien jc jr, o brien j 如果要关闭截词检索, 实现精确检索, 则用双引号把作者名括起来再加上作者字段名例如 : o brien j [au] 2002 年后文献可用作者全名检索, 姓名不需排序

21 期刊检索用刊名全称 Medline 形式的简称或 ISSN 号检索例如 : Journal of Biological Chemistry,J Biol Chem, 早期的期刊可能无 ISSN 号用刊名字段代码限制检索, 期刊名称检索字段标识 [ta] 或者是 [so] 例如 : medical physics[so]

22 期刊检索如果期刊名称正好是一个 MeSH 中的词, 系统会将其作 MeSH 词进行检索如果期刊名称是一个单词, 系统会在所有字段中进行检索这时最好用刊名字段代码限制检索刊名中含有括号等字符时, 忽略不键入

23 逻辑组配检索 (AND OR NOT) (Patellofemoral OR Patello femoral OR patella femoral OR Patellofemural OR Patello femural) AND joint and (Biomechanics OR movement OR motion OR moving OR track OR tracking) (Patellofemoral[All Fields] OR (Patello[All Fields] AND ("femur"[mesh Terms] OR "femur"[all Fields] OR "femoral"[all Fields])) OR (("patella"[mesh Terms] OR "patella"[all Fields]) AND ("femur"[mesh Terms] OR "femur"[all Fields] OR "femoral"[all Fields])) OR (Patello[All Fields] AND femural[all Fields])) AND ("joints"[mesh Terms] OR "joints"[all Fields] OR "joint"[all Fields]) AND (("biomechanics"[mesh Terms] OR "biomechanics"[all Fields]) OR ("movement"[mesh Terms] OR "movement"[all Fields]) OR ("motion"[mesh Terms] OR "motion"[all Fields]) OR moving[all Fields] OR ("track and field"[mesh Terms] OR ("track"[all Fields] AND "field"[all Fields]) OR "track and field"[all Fields] OR "track"[all Fields]) OR tracking[all Fields])

24 组合检索 (AND OR NOT) (Patellofemoral OR "Patello femoral" OR "patella femoral" OR Patellofemural OR "Patello femural") AND joint and (Biomechanics OR movement OR motion OR moving OR track OR tracking) (Patellofemoral[All Fields] OR "Patello femoral"[all Fields] OR "patella femoral"[all Fields] OR (Patello[All Fields] AND femural[all Fields])) AND ("joints"[mesh Terms] OR "joints"[all Fields] OR "joint"[all Fields]) AND (("biomechanics"[mesh Terms] OR "biomechanics"[all Fields]) OR ("movement"[mesh Terms] OR "movement"[all Fields]) OR ("motion"[mesh Terms] OR "motion"[all Fields]) OR moving[all Fields] OR ("track and field"[mesh Terms] OR ("track"[all Fields] AND "field"[all Fields]) OR "track and field"[all Fields] OR "track"[all Fields]) OR tracking[all Fields])

25 knee joint biomechanics (5806 条 ) knee joint AND biomechanics (5806 条 ) Knee AND joint AND biomechanics (6465 条 ) ("knee joint"[mesh Terms] OR ("knee"[all Fields] AND "joint"[all Fields]) OR "knee joint"[all Fields]) AND ("biomechanics"[mesh Terms] OR "biomechanics"[all Fields]) ("knee joint"[mesh Terms] OR ("knee"[all Fields] AND "joint"[all Fields]) OR "knee joint"[all Fields]) AND ("biomechanics"[mesh Terms] OR "biomechanics"[all Fields]) ("knee"[mesh Terms] OR "knee"[all Fields] OR "knee joint"[mesh Terms] OR ("knee"[all Fields] AND "joint"[all Fields]) OR "knee joint"[all Fields]) AND ("joints"[mesh Terms] OR "joints"[all Fields] OR "joint"[all Fields]) AND ("biomechanics"[mesh Terms] OR "biomechanics"[all Fields]) 用 AND 组合可拆分词组

26 高级检索 (ADVANCED SEARCH) Alzheimer and (transcranial magnetic stimulation or rtms) 经颅磁刺激治疗阿兹海默症

27 词表检索 ( MeSH )

28 词表检索 ( MeSH )

29 输入题录信息, 查找特定文献刊名要准确, 缩写要标准 ; 著者姓名不区分大小写 Current Biology 2011 Oct 25; 21(20): Blimp1 expression predicts embryonic stem cell development in vitro

30 3.4.3 检索结果输出

31 医学图书馆介绍结果显示方式选择正在进行 MeSH 主综述论文题标引的文献免费全文未处理文献已经完成 MeSH 主题标引的文献

32 Clipboad: 剪贴板, 暂存需下载记录, 多项检索后一起保存最多保存 500 条记录保留时间停止操作后 8 小时以内邮件发送, 最多 200 篇文献 File: 纯文本格式可选择保存如不选择, 默认保存所有检索结果

33 3.4.4 个性化服务功能

34 3.4.5 Pubmed 衍生产品

35 Pubmed PICO 主要面向临床医生, 以问题的形式进行查询 P: Adolescent or adolescence or teen or teenager or youth or child I: sibutramine or Meridia O: obese or obesity or overweight or weight loss

37 3.5 Embase.com 3.6 Best Practice

38 3.5 Embase.com 3.6 Best Practice

39 3.7 原文的查找

40 注意事项 -1 咨询馆员本馆收藏免费资源邻近馆收藏直接获取馆际互借搜索引擎世界馆收藏个人 / 机构收藏社交网络 40

41 3.8 小结与提示

42 注意事项 -1 提示 -1 重视文献调研和追踪, 舍得花时间和精力短期 : 据美国科学基金会统计, 一个科研人员花费在查找和消化科技资料上的时间需占全部科研时间的 51%, 计划思考占 8%, 实验研究占 32%, 书面总结占 9% 由上述统计数字可以看出, 科研人员花费在科技出版物上的时间为全部科研时间的 60% 长期 : 信息提供帮助, 改变生命轨迹, 提高生命质量 42

43 提示 -2 出版者 ( 权威性 ) 收录时间 ( 完整性 ) 数据库关注点学科范围 ( 专指性 ) 文献类型 ( 综合性 ) 更新时间 ( 时效性 ) 使用方式 ( 便利性 )

44 注意事项 -1 提示 -3 重视专业网站和网络资源的利用例如 : 产品信息大多以网页形式发布在各产品生产经营企业网站上, 这些网页信息大多被搜索引擎收录医疗器械产品医药产品类研究课题, 除了检索文献数据库外, 充分利用各类搜索引擎进行检索, 充分利用网上产品数据库, 包括政府网站上的医药产品数据库信息咨询公司的产品数据库药品生产认证机构网站上的认证信息等 44

45 提示 -4 注意灰色文献的收集和利用 TERTIARY LITERATU RE Informatio n Retrieval 丁香园微访谈

46 提示 -5 注意最新资讯和动态信息的利用会议信息 : 香山会议高登会议优先出版丁香园

47 提示 -6 数据库收录数据不完整 EMBASE 4,800 种期刊, 其中包括 1,800 种特有期刊 Medline 1800 种特有期刊

48 提示 -6 数据库收录数据不完整 EMBASE 4,800 种期刊, 其中包括 1,800 种特有期刊摘引自

49 提示 -6 数据库收录数据不完整 CPCI:Annual Meeting of the Society-for-Neuroscience ( Annual and Meeting and Society and Neuroscience )

50 提示 -6 数据库收录数据不完整中国知网 (CNKI)- 中国学术期刊网络出版总库 1994 年至今 ( 部分回溯至创刊 ),9,437 种, 医药卫生类 1202 种, 核心期刊 251 种独家收录 229 种维普 (VIP)- 中文科技期刊全文数据库万方数据 - 数字化期刊全文数据库 1989 年至今 ( 部分回溯至 1955 年 ), >12,000 种, 医药卫生类 1997 种, 核心刊 332 种 1998 年至今 ( 部分回溯至 1985 年 ), >6,000 种, 医药卫生类 1135 种, 核心刊 687 种中国科技论文在线预印本 (>5500 篇 )

51 提示 -6 数据库收录数据不完整学位论文 : 中山大学第四军医大学

52 提示 -7 注意不同来源文献信息之间的隐含联系 Swanson 教授 : 基于非相关文献的知识发现 1986 年,Swanson 发现, 雷诺氏病是一种病因和治疗方法均未知的血液循环紊乱疾病有的文献记载了部分雷诺氏病患者血液中有些异常 ( 如血液黏度偏高 ), 又有一些文献记载了食用鱼油能纠正这些异常 ( 如它可降低血液黏度 ) Swanson 将 34 篇论述血液变化可导致雷诺氏病的生物医学文献分为一组 (A), 而降 25 篇论述食用鱼油可引起血液某种变化的生物医学文献分为另一组 (C), 通过雷诺氏病主题词 (B) 将两组文献类型在一起在此基础上,Swanson 提出科学假设 : 食用鱼油会对雷诺氏病患者有益当时, 这一假设并未以任何形式公开发表过, 学术界尚未发现食用鱼油与雷诺氏病之间的联系两年后, 这个科学假设被临床实验所证实后来,Swanson 通过文献研究又发现了偏头痛与镁的 11 条被忽略掉的联系他在 1998 年发表的文章中提出了镁的缺乏可能引起偏头痛的假设, 后来也被临床实验和脑中镁含量的检测报告所证实

53 提示 -7 收集不同来源信息, 注意对比分析和综合评价 ( 鉴别 ) 案例 : 螺内酯能治疗心衰吗? (1) 一位住院医师立即从 The New England Journal of Medicine 网页上检索一篇文献他对这篇文献摘要的快速复习和根据自己临床经验判断螺内酯对这位病人应该有正面效果, 他的依据是这是一项有 1663 名严重心力衰竭患者参加的随机安慰剂对照临床实验打算给这位病人处方 25 mg 的螺内酯

54 提示 -7 收集不同来源信息, 注意对比分析和综合评价 ( 鉴别 ) 案例 : 螺内酯能治疗心衰吗? (2) 另一位住院医师在 ACP Journal Club 上检索了一篇结构性摘要和螺内酯相关文献述评从这个摘要中, 她很快发现参与该研究的病人在进入实验前就已经在开始使用血管紧张素转化酶抑制剂她的建议是, 或许应该在使用螺内酯前先用血管紧张素转化酶抑制剂治疗

55 提示 -7 收集不同来源信息, 注意对比分析和综合评价 ( 鉴别 ) 案例 : 螺内酯能治疗心衰吗? (3) 在 Clinical Evidence 寻找关于充血性心力衰竭治疗的概述这篇概述引用了一个系统综述, 其中比较了血管紧张素转化酶抑制剂和安慰剂对充血性心力衰竭患者的作用, 总病例数超过了 7000 结果显示血管紧张素转化酶抑制剂降低了全部实验亚群的死亡风险

56 结束语贝时璋 ( 实验 / 细胞生物学家 ) 对科学家来说, 最快乐的事情就是待在实验室里做实验或在图书馆里看书贝时璋祝愿能体会和享受到利用图书馆的快乐! 欢迎光临医学与生命科学图书馆!

57 结束语文献查找有困难, 毫不客气找图书馆! 任平邮件电话 : 医学与生命科学图书馆