SciFinder Web 使用介绍 刘霞妹 SciFinder 培训专员 2014.5.8 1
提纲 介绍 SciFinder Web 中的内容 SciFinder Web 新功能 SciFinder Web 中的检索和后处理 SciFinder Web 中的文献记录及主题检索 SciFinder Web 中的物质结果及物质检索方法 SciFinder Web 中的反应记录及反应检索 SciFinder Web 的注册 Q&A 2
提纲 SciFinder Web 内容 3
美国化学文摘社 Chemical Abstract Service 创建于 1907 年 ACS 的分支机构 密切关注, 索引和提炼着全球化学相关的文献和专利 最早创立了 化学文摘 总部坐落于俄亥俄州的哥伦布市 4
SciFinder 的覆盖内容 CAS REGISTRY SM >8700 万有机无机物质 >6500 万生物序列 >4 亿条实验和预测数据 物质报道文献, 回溯到 1802 年 每天更新 References References from CAplus SM >3900 万期刊, 专利, 学位论文记录. >1 万种科技期刊的覆盖 63 家专利发行机构的专利 1997 年以来的 3.65 亿条引文记录 回溯到 1800 年 每天更新 References from MEDLINE > 1900 万条生命科学相关文献 > 5600 期刊 回溯到 1946 年 每天更新 Markush Structures >100 万专利中的 Markush 结构 回溯到 1961 年 每天更新 CHEMLIST 全球范围内的法规信息 >30.9 万的化合物 1980 至今的数据 每周更新 SciFinder Reactions CASREACT CAS 提供的反应信息包含 : 反应中的结构信息 反应中所有物质的 CAS No 详细的反应条件 实验过程 >5840 万单步多步反应 >1340 万物质合成制备信息 反应回溯到 1840 反应条件起始于 2003 每天更新 CHEMCATS CHEMCATS 提供物质的供应商信息 >6500 万商业信息 >2700 万不同种类物质 >880 个全球范围内的供应机构 >990 商品目录的覆盖 每周更新 5
CAplus SM 涵盖上万种期刊及 63 个专利发行机构专利 6
CAS REGISTRY SM 是化学物质信息的 黄金标准 7
CASREACT 是检索化学反应最权威的来源 CASREACT 是世界上最大的, 更新速度最快的反应数据库 8
提纲 SciFinder Web 新功能 9
SciFinder 新功能 - 美国专利的 PDF 链接 PDF 链接 美国专利 PDF 链接新功能可以方便直接地从 SciFinder 获取美国专利的全文, 而不需要通过访问美国专利局官网 10
SciFinder 新功能 -Non-Java 结构编辑器 不需要安装 Java 插件即可编辑物质结构 11
提纲 SciFinder Web 文献检索 12
SciFinder 中的文献记录 一篇完整的文献界面包括 : 1. 题录信息 2. 摘要信息 3. 文献中重要的概念 4. 文献中重要的物质 5. 书目信息 6. 获得文献中的物质, 反应, 引文等 7. 文献中的引文信息 8. 全文链接 13
SciFinder 中的文献检索方法 功能方面 主题检索 作者名检索 机构名检索 文献标示符检索 从物质, 反应获得文献 检索方法推荐 关注某特定领域的文献 - 主题检索 关注物质有关的文献 - 先获得物质, 再获得文献 关注某科研人员的文献 - 作者名检索 14
SciFinder Web 中的主题检索 主题 : C-H activity with Pd ( 钯催化的 C-H 键活化 ) 输入检索词, 关键词之间用介词 in, on, with, of, by 等介词隔开 15
主题检索的候选项 Concept 表示做了同意词的扩展 Closely associated with one another 表示同时出现在一个句子中 present anywhere in the reference 表示同时出现在一段话中 16
SciFinder 中的 KMP KMP 是 SciFinder 提供的自动提醒功能, 能及时将最新资讯, 推送到用户的邮箱中 输入 Title, 选择提醒频率 17
SciFinder 提供的引文排序 Citing Reference 18
SciFinder 中的文献检索结果 文献分析工具 (Analyze, Refine, Categorize) SciFinder 提供强大的文献处理工具, 帮助处理文献 19
SciFinder 中的 Analyze 领域内主要研究人员, 专家 主要研究机构, 合作伙伴, 竞争对手 主要出版杂志, 机构, 潜在投稿期刊 20
SciFinder 中的 Analysis By Index Term 索引词 (Index Term): 可以帮助我们对文献的内容进行大致的了解 选择感兴趣的内容, 点击 Apply 21
SciFinder 中的 Refine Refine : 帮助用户迅速获得需要的文献 中科院 22
SciFinder 中的 Categorize 通过历史导航条回到任一检索界面 Categorize 系统分类功能, 基于 Index Term, 对文献依学科方向进行分类 23
SciFinder 中的 Categorize 一级目录 二级目录 和二级目录相关的 Index Term 选中的 Index Term 酰胺 24
结果集的保存 (Save, Print, Export) Export: (<50 篇文献 ) Citation manager: 保存成 RIS 格式, 用于导入 EndNote NoteFirst 等文献管理工具 Offline Review: 保存过成 PDF, RTF 格式, 用于脱机浏览 Save: 保存在服务器上, 可登陆后查看 25
练习 检索和转基因食品安全评估的文献, 获得近 5 年的综述文献 检索策略 : Topic Search:Genetically Modified Food with safety Refine publish year: 2008- Refine document type: Review 26
提纲 SciFinder Web 物质检索 27
SciFinder 中的物质结果界面 点击 CAS NO 进一步获得详细信息 一个完整的物质结果界面包含 : 物质详情连接 文献连接 反应连接 商品信息连接 管制品信息连接 谱图连接 实验性质连接 28
Substance Detail 查看物质详细信息 物质的的 CAS 号 分子式 结构式 化学名 别名 按照 CAS Role 分类的专利 非专利文献列表 对某类文献感兴趣, 仅需点击交叉处的 即可方便快捷地获取 29
Substance Detail 查看物质详细信息 物质的生物活性和靶点信息, 直接点击, 获得相关文献 30 30
Substance Detail 查看物质详细信息 预测数据 31
Substance Detail 查看物质详细信息 实验数据 32
Substance Detail 查看物质详细信息 物质的实验谱图 33
物质有关的反应 34
物质有关的商业来源 可以直接 Export 到 Excel 中, 又或者使用分析工具, 对商业信息进行处理 35 35
物质有关的文献信息 一键获得文献, 可以获得全部, 也可以勾选特别感兴趣的内容, 不勾选, 默认获得全部 36
SciFinder 中的物质检索方法 功能方面 物质名称,CAS No 分子式 结构式 理化性质 推荐的物质检索功能 有机物, 天然产物及衍生物 --- 结构比较方便 无机物 --- 分子式比较方便 高分子化合物 --- 首先分子式, 其次结构 37
物质名称检索 直接输入物质的英文名, 商品名, 缩写,CAS No, 俗名, 都能检索, 一次最多检索 25 个物质, 用换 行换开 38
理化性质检索 39
分子式检索 SciFinder 中的分子式的检索, 需要按照 HILL 排序方式输入, 简单来说,CH 写前面, 其他的按照字母顺序写 40
结构式检索 41
SciFinder 结构绘制工具 铅笔元素周期表可变基团重复基团工具碳链工具选择工具环锁定工具旋转工具正电子 橡皮常用基团 R 基团定义工具可变位置连接工具模版工具索套选择工具原子锁定工具镜面旋转工具 C 原子和单键恢复工具 结构和反应切换功能 结构检索选择 单双键,RS 构型, 不确定键定义工具 负电子 常见环, 多元环工具 42
SciFinder 中的反应定义工具 反应箭头 反应角色定义工具 反应原子标记工具 反应位置标记工具 反应官能团列表 43
导入.mol 或者.cxf 格式的结构 将 CAS NO 转化为物质结构 44
元素周期表 可变基团 常用官能团 R 基团 45
可变位置连接工具 重复基团定义工具 环锁定工具 ( 保证环结构不成为别的环系的一部分 ) 原子锁定工具 ( 保证原子不发生别的取代 ) 可以检索到 不能检索到 46
反应角色定义工具 原子标记工具 ( 标记反应前后相对应的原子 ) 反应位置标记工具 ( 标记反应过程中形成或断裂的键 ) 代表任意的键, 可以是单键 双键或者三键 47
精确结构检索 检索金属配合物 P t Bu t Bu N P Ni Cl BF 4 该结构中包含 : 配体金属阳离子阴离子 Bu t t Bu 48
检索界面 任何一种结构, 使用精确结构都可以检索到 49 49 49
案例 2: 我想获得以下的一系列物质 CHO N CHO N CHO N CHO Cl NH Cl NH Cl N H Cl N H N N O Cl N CHO Cl N CHO Cl N H H H CHO Cl N H CHO 要求 :1 4~6 元的饱和或不饱和的碳环或杂环 2 该环不能发生并环 50
结构定义 R=C N O 1-3 任意键 锁定环 用亚结构检索获得所有的物质 51
亚结构检索结果 52
练习 用结构检索二茂铁 检索策略 绘制两个环戊二烯 绘制一个铁 精确检索, 选择配位化合物 53
提纲 SciFinder Web 反应检索 54
SciFinder Web 中的反应记录 1. 反应分组功能 2. 反应排序功能 3. 反应后处理功能 4. 反应全景及实验过程 5. SciPlanner 55
SciFinder 反应检索 Allow variability only as specified: 仅在特定位点发生变化 Substructure: 亚结构检索, 允许有更多取代情况 56
反应检索界面 高级检索 57
精确反应检索结果 58
Group by Document 按照出处文献分类显示 来自同一篇文献的反应都被整合到一起并集中显示 59
Group by Transformation 按照反应类型分类显示 同一类反应被整合到一起并以通式结构集中显示 ; 仅适用于单步反应, 未被分类的反应显示在结果集最后 60
Sort by-experimental Procedure 获得有实验步骤的 反应结果集 61
Find Additional Reactions 获取附加反应 附加反应通常为半反应, 显示在反应检索结果的最后面 62
反应中生成键的定义 检索要求 : 环上的单键一定要被还原 其他具体取代不限 63
将反应式画入, 进行亚结构检索 64
进行亚结构检索, 得到初步的反应结果集 65
使用 Refine 限定结构式, 使检索更加精确 1. 加上环锁定, 避免并环现象 ; 2. 使用原子标记工具, 增强精准性 3. 若要求双键两端碳原子不发生取代, 加上原子锁定 ; 66
限定之后的结果集 67
练习 检索从硝基吡啶还原成吡啶氨的反应, 检索策略 分别绘制硝基吡啶和吡啶氨 中间绘制箭头, 确定反应物和产物 68
提纲 SciFinder Web 注册 69
SciFinder Web 的注册和登陆 SciFinder Web 的系统要求 Windows 用户支持 IE 9.x 或者 FireFox 2.x Mac 用户支持 Firefox 和 Safari Java 安装 ( 初次使用结构时自动安装, 建议安装 Java 7) 在图书馆相关页面上找到 SciFinder Web 注册用的网址 70
点击 URL 创建 SciFinder Web 账号 开始创建 SciFinder Web 帐号 创建 ID 所用的 IP 不能是代理服务器的 IP 71
点击 URL 创建 SciFinder Web 账号 注册邮箱可使用学校域名的邮箱或者公共邮箱 72
设置用户名及密码注意事项 用户名 : 必须是唯一的, 且包含 5-15 个字符 它可以只包含字母或字母组合 数字和 / 或以下特殊字符 : -( 破折号 ) _( 下划线 ). ( 句点 ) @( 表示 at 的符号 ) 密码 : 必须包含 7-15 个字符, 并且至少包含三个以下字符 : 字母 混合的大小写字母 数字非字母数字的字符 ( 例如 @ # % & *) 密码设置小技巧 : 1: 不要和账号中有重复的字符 2: 密码格式最好是 abc@123 73
对新 ID 的 Email 确认 需要点击邮件中的确认链接 Http://scifinder.cas.org 74 74
SciFinder Web 常见问题 并发用户数已满, 请稍后再试 75
SciFinder Web 常见问题 账号或密码错误, 请在 username 处填写, 截图, 并与图书馆联系 请勿重复注册 76
SciFinder Web 常见问题 任何需要反馈给图书馆的问题, 都请点击测试 IP 地址的链接 http://www.cas.org/cgi-bin/casip 将页面截图下来, 一并发给图书馆 并抄送给我们 77
SciFinder Web 网络在线资源平台 www.igroup.com.cn/cas 资源下载 :PDF 文件在线演示 :Flash 演示网络培训 : 不定期的网络专题培训 SciFinder QQ 答疑群 207211509 78
Thank You 刘霞妹 SciFinder 培训专员 Mail:Echo@igroup.com.cn Tel:020-83274076-604 QQ:1802142035 79