SciFinder Web 源于化学, 超越化学的一站式检索平台 广西大学 --SciFinder Web 使用介绍 陈丹 CAS 中国广州代表 2013.09.25
提纲 介绍 SciFinder Web 介绍 SciFinder Web 新界面介绍 SciFinder Web 中的检索和后处理 SciFinder Web 中的文献检索 SciFinder Web 中的物质检索 SciFinder Web 中的反应检索 SciFinder Web 特色功能 SciFinder Web 使用常见问题和网络资源 CAS is a division of the American Chemical Society. 2 Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved.
美国化学文摘社 Chemical Abstract Service 创建于 1907 年 ACS 的分支机构 密切关注, 索引和提炼着全球化学相关的文献和专利 最早创立了 化学文摘 总部坐落于俄亥俄州的哥伦布市 CAS is a division of the American Chemical Society. 3 Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved.
SciFinder Web 介绍 纸本 1907 年 光盘 1987 年 2009 年 SciFinder Web 全新登场! SciFinder Scholar 1995 年 SciFinder 2007 年 跨世纪工程 100 多年来, 全世界科学家和知识产权专家都依赖 CAS 建立和维持的最全面和权威的物质和参考文献数据库进行研究工作
SciFinder 的定位 二次文献数据库 二次文献是对一次文献进行加工整理后所产生的文献, 如书目 题录 简介 文摘等形式的检索工具书 它是查找一次文献的线索 SciFinder 覆盖化学界 98% 的文献, 内容由 CAS 编者人工编目, 文献中的重要信息被提炼总结, 成为可检索和分析的条目 SciFinder 提供对所有文献的分析 精选 分类功能, 根据用户需要筛选众多信息, 迅速锁定兴趣点
文摘数据库索引过程 机器扫描关键词 原始出版物 数据库 文摘数据库 机器扫描的优点 : 快速, 节省时间机器扫描的缺点 : 1. 语言差异 : 日文? 英文? 中文? 德文?. 2. 作者习惯 :antitumor=anticancer..
SciFinder 科学索引过程 原始出版物 CAS 科学家 CAS 编辑发行 题目摘要改写 索引词的编写 物质索引的编写 ( CAS.No., CAS Role) 信息检索者或用户
提纲 SciFinder Web 内容介绍 8
SciFinder 中的内容 期刊专利论文会议报告 Chemcats CAPlus Medline Chemlist 溶剂, 催化剂, 产率等 Registry CASReact 物质 基因 9 合成信息
SciFinder 最重要的三个数据库 包含了 CA 纸本和光盘的所有内容 3700 万条文献 期刊 专利 会议录 图书 学位论文 日更新 4500 条 全球最大, 更新最快的文献 CA plus 全球最大, 实时更新的物质 Registry 7100 万个物质,6400 万个序列 所有 CAS No. 物质 有机 无机 聚合物 混合物 核酸蛋白质序列 日更新 15000 全球最大, 更新最快的反应 CAS React 5510 万单步, 多步反应 1390 万个制备信息 周更新约 15 万
提纲 SciFinder 注册和登陆 11
SciFinder Web 的注册和登陆 SciFinder Web 的系统要求 Windows 用户支持 IE 8.x 或者 FireFox 2.x Mac 用户支持 Firefox 和 Safari Java 安装 ( 初次使用结构时自动安装 )http://www.java.com 在图书馆相关页面上找到 SciFinder Web 注册用的网址 CAS is a division of the American Chemical Society. 12 Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved.
广西大学 SciFinder Web 注册链接 CAS is a division of the American Chemical Society. 13 Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved.
点击 URL 创建 SciFinder Web 账号 开始创建 SciFinder Web 帐号 创建 ID 所用的 IP 不能是代理服务器的 IP 14
点击 URL 创建 SciFinder Web 账号 用户若要成功注册 ID 可以使用学校域名的邮箱 ( 即 ***@gxu.edu.cn 邮箱 ; 同时为广西大学的师生开通了使用公共邮箱注册 SciFinder 账号的功能 15
设置用户名及密码注意事项 用户名 : 必须是唯一的, 且包含 5-15 个字符 它可以只包含字母或字母组合 数字和 / 或以下特殊字符 : -( 破折号 ) _( 下划线 ). ( 句点 ) @( 表示 at 的符号 ) 密码 : 必须包含 7-15 个字符, 并且至少包含三个以下字符 : 字母 混合的大小写字母 数字非字母数字的字符 ( 例如 @ # % & *) 密码设置小技巧 : 1: 不要和账号中有重复的字符 2: 密码格式最好是 abc@123 16
使用这个链接登陆 SciFinder 注册成功获得自己的帐号后, 在学校 IP 范围内的任意电脑上打开网页 Https://Scifinder.cas.org, 后输入自己的 SF 用户名和密码即可使用 SciFinder Web http://scifinder.cas.org / http://origin-scifinder.cas.org 17
提纲 新界面介绍 18
SciFinder 登陆界面 http://scifinder.cas.org 输入 SciFinder 帐号和密码 19
SciFinder 于 2013.6.25 推出更简洁的检索新界面 可用的检索方法 保存保存过的结果集集 保存过的结果集 邮件提醒结果集 可用的检索方法
强大的功能选项更加明显和直观 21
提纲 SciFinder Web 文献检索介绍 22
示例 1: 主题检索 --- 调血脂药物他汀类药物的研究 据国外研究报道, 全球高血压患者已达 6 亿多人, 比例高达 10% 他汀类药物 (statins) 的问世, 成为心血管类药物发展史上新的里程碑 在国际医药市场上畅销的诸多调血脂治疗药物中, 他汀类药物依然是 领头羊 辉瑞的 立普妥 ( 阿托伐他汀 ), 连续九年蝉联全球医药领军品种销售桂冠, 让辉瑞赚取了 800 亿美元的收入, 在 2011 年底之前, 很可能要突破总共 1000 亿美元的单药销售世界纪录 这是医药史上第一个突破千亿美元大关的重磅药之王 立普妥的专利在 2011 年到期, 面临仿制药的挑战
SciFinder 中的文献检索 主题检索举例 : 抗高胆固醇血症的他汀类药物 Statins with hypercholesterolemia 检索方法 介词 of, with, by 24
主题检索的候选项 Concepts 表示做了同意词的扩展 Closely associated with one another 表示同时出现在一个句子中 were present anywhere in the reference 表示同时出现在一段话中 25
如何在大量文献中发现最关键信息? 文献的后处理工具 获得与选取文献相关的物质 反应, Save 以书签格式保存在服务器上 Print 打印所选文献 Export 下载所选文献 Note: 1. Save 指保存在服务器上, 需要登陆 SciFinder 才能打开 2. Export 指保存在电脑中, 可以保存成 rtf pdf txt 文档 26
文献的后处理功能, 帮助我们缩小文献范围 限定工具提供 7 种限定方法, 包括主题词, 作者名, 机构名, 文献类型等 分析工具提供 12 种分析方法, 包括索引词, 作者名, 机构名, 文献类型, 期刊名称, 出版年限等 27
本课题的核心研究人员是谁? 核心研究机构有哪些? Analysis 文献的分析工具 Author Name 作者名分析, 了解本领域的主要研究人员 Company-Organization 组织机构分析, 了解本领域的核心研究机构, 有哪些国际机构参与, 寻找国际合作伙伴 28
对文献进行多角度分析 文献中出现了哪些重要概念? 文献主要涉及到哪些学科?
课题的国内外研究进展? Refine 限定工具 文献类型分析, 通过综 述文献快速了解国内外 的研究进展 30
根据课题需要定位具体的研究主题 Categorize 系统分析工具 生物技术领域药用物质具体药物 这是您已经研究的领域 这是您感兴趣的研究领域 一级学科 二级学科 研究主题 您不了解, 但感兴趣的研究领域 除了 SciFinder, 其他数据库均无法做到如此精确的分类 Categorize 功能会自动为您做具体的分类, 您可以通过 SciFinder 获得新的创造灵感 31
遗传学和蛋白质化学 32
如何查看具体的一篇文献? 33
一篇文献的详细信息 当原文摘要不足以反应全文内容时 : 重新编写摘要 SciFinder 收录的 70% 的文献和专利重新编写摘要 文献的基本信息 34
文献中出现的重要的概念, 帮助您对文献内容进行迅速把握 点击查看物质的详细信息 详细的物质索引, 如 CAS 号 物质名称 物质的用途 35
获取文献中的相关物质 36
文献检索小结 主题检索时, 使用介词作为连接 尽量选择包含 Concept 和 Closed Associated with 的候选项 通过 SciFinder 的 Analyze/Refine 功能来缩小检索的范围 尝试将不同的 Analyze/Refine 功能组合起来用, 会有更多的收益 使用 Categorize 可以让系统来实现自动分类 更多细节化内容, 请参考 www.igroup.com.cn/cas 37
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示例 2: 物质检索 阿托伐他汀的研究进展 HO COONa OH F H N NH O 通用名 阿托伐他汀 英文名 Atorvastatin 商品名 进口, 立普妥 (Lipitor); 国产, 阿乐 尤佳 原研企业 华纳 - 兰伯特
SciFinder Web 中的物质检索方式 结构检索 -------- 精确结构检索 (Exact search) 亚结构检索 (Substructure search) 相似结构检索 (similarity stearch) 分子式检索 性质检索 物质标识符检索 CAS RN, 化学名称 ( 通用名 商品名 俗名等 ) 40
物质名称或 CASNo 检索 分子式检索
结构式检索 ---SciFinder 结构绘制工具 结构和反应切换功能橡皮铅笔 元素周期表可变基团重复基团工具碳链工具选择工具环锁定工具旋转工具 常用基团 R 基团定义工具可变位置连接工具模版工具索套选择工具原子锁定工具镜面旋转工具 C 原子和单键恢复工具 结构检索选择 单双键,RS 构型, 不确定键定义工具 正电子 负电子 常见环, 多元环工具
结构式检索 精确结构检索 (Exact search) 亚结构检索 (Substructure search) 相似结构检索 (similarity stearch) 可根据物质的属性 种类和被研究方向进行检索限定 43
获得参考文献 反应 商品 管制信息 谱图信息 实验性质
Substance Detail- 物质详情 CAS 号 分子式 结构式 化学名 别名 按照 CAS Role 分类的专利 非专利文献列表 对某类文献感兴趣, 仅需点击交叉处的即可方便快捷地获取
实验数据
生物活性标记和靶点标记 列出立普妥生物活性研究的分类及参考文献 比如 : 抗高血压 心血管试剂等 利用物质中的靶点标记功能, 快速了解立普妥在不同靶点中的研究情况
立普妥的相关文献和反应信息 可以选择物质在反应中的角色 可以选择所有的文献, 或者根据分类获得特定研究方向的文献
立普妥的合成方法 49
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三种物质检索的区别 查找一模一样的结构 : 精确结构检索 (Exact Search) 获得物质的盐, 聚合物, 混合物, 配合物等, 母体结构不能修改, 不能修饰 查找衍生物 : 亚结构检索 (Substructure Search) 所画的结构必须存在, 母体结构不能修改, 但可以被修饰 查找类似物 : 相似结构检索 (Similarity Search) 获得相似度在 60 分以上的结构, 母体结构可以修改, 也可以被修饰, 用相似度来控制获得的结果 CAS is a division of the American Chemical Society. 51 Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved.
提纲 介绍 SciFinder 中的内容 SciFinder 的注册和登陆 SciFinder 中的检索和后处理 SciFinder 中的文献检索 SciFinder 中的物质检索 SciFinder 中的反应检索 SciFinder 特色功能 SciFinder 网络资源平台 CAS is a division of the American Chemical Society. 52 Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved.
提纲 SciFinder Web 反应检索 53
SciFinder Web 的应用举例 CAS is a division of the American Chemical Society. 54 Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved.
SciFinder 结构绘制工具 铅笔 橡皮 结构和反应切换功能 元素周期表可变基团重复基团工具碳链工具选择工具环锁定工具旋转工具正电子 常用基团 R 基团定义工具可变位置连接工具模版工具索套选择工具原子锁定工具镜面旋转工具 C 原子和单键恢复工具 反应检索选择 单双键,RS 构型, 不确定键定义工具 负电子 常见环, 多元环工具
反应角色定义工具 原子标记工具 ( 标记反应前后相对应的原子 ) 反应位置标记工具 ( 标记反应过程中形成或断裂的键 ) 代表任意的键, 可以是单键 双键或者三键 CAS is a division of the American Chemical Society. 56 Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved.
反应检索 特定物质之间的反应 精确反应检索帮助获得特定物质之间的反应, 点击确定 CAS is a division of the American Chemical Society. 57 Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved.
可以提前设定一些限定条件 58
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反应检索中的分析功能 催化剂分析溶剂分析
反应检索中的限定功能 产率限定 反应步骤数限定
反应信息和反应过程 反应的整体概述, 每一步的溶剂, 温度, 反应条件 62
反应信息和反应过程 反应实验历程的获取 63
相似反应的获取 对于单步反应, 可以进行相似反应检索 相似反应检索, 依据和反应中心的相似程度, 查询反应中心彼此相似的反应
选择相似级别 对于选择是全部反应中检索相似反应, 还是在当前结果集中检索相似反应 选择相似反应的相似限制 Broad: 仅反应中心相似 Miedum: 反应中心及附属原子和键 Narrow: 反应中心及扩展的原子和键
反应检索 --- 检索对反应位置和原子有特定要求的反应 吡啶环的 3,4 位存在任意的非 C,H 原子或基团 检索在 6 位引入 Cl 的反应 Q Q Q Q N Cl N 66
定义反应结构 大多数科研工作者, 刚开始都会画成这样 但是, 这样足够吗? 尝试 SciFinder 中的初步检索 67
亚结构检索, 帮助获得所有的相关反应 68
SciFinder 中的反应筛选 -- 我们获得 5700+ 条反应 69
简单的看一下这些反应 第一条获取符合我们的要求 第二条, 吡啶环系发生破坏, 不是我们想要的 70
反应中的 Refine 工具, 添加环锁定 环锁定工具, 当使用亚结构检索时, 不允许发生稠环 71
锁定环后的结果 这条反应, 原来的 6 位上就有 Cl, 不符合我们的要求 这条, 或许满足我们的要求, 这里需要大家思考, 到底需要什么类型的反应, 如果只想获得从 H 变成 Cl 的 72
继续使用 Refine 73
这是我们想要的反应 所有的反应都符合我们的结构要求 在吡啶环的 6 位存在 H 到 Cl 的变化 74
一些值得思考的问题 并不是所有的科研工作者, 一开始就能准确的定义反应结构 建议先大致浏览下反应结果集, 然后去思考如何去除我们不想要的反应 使用 Analyze/Refine 工具, 或其他的检索策略, 去除不想要的反应. 75
提纲 SciFinder Web 新功能 76
SciFinder Web 特色功能 Markush 检索 直接检索和结构有关的专利, 用于做初步的专利评估 77
新功能 依据物性检索物质 检索具有特定物化属性物质, 满足医药 材料 分析 物化等专业的需求 SciFinder - 不可或缺的内容, 准确无误的结果
新功能 引文排序 依据被引次数排序 通过直观的数字了解文章的在此研究领域的状况, 方便统计及分析 79
新功能 CAS No 与结构的转换 帮助用户直接通过 CAS No 获得物质结构, 并进行检索, 节省大量结构绘制时间 SciFinder - 不可或缺的内容, 准确无误的结果
新功能 快速浏览 通过放大图标, 能快速浏览文献中的相关信息, 提高浏览效率 SciFinder - 不可或缺的内容, 准确无误的结果
新内容 物质的靶点和生物活性标记的添加 物质靶点和生物活性标记的添加, 对于药学和生物学用户能更好的了解物质已经研究过的方向 SciFinder - 不可或缺的内容, 准确无误的结果
新功能 SciPlanner 更加直接的管理结果的方法 自由组合反应, 方便有机专业用户设计反应路线及撰写相关报告 SciFinder - 不可或缺的内容, 准确无误的结果
SciFinder Web 新功能 按照反应类型分类排序 芳香烃的酰胺烷基化反应 Friedel-Crafts 反应 ( 付克反应 ) 脂肪酸的脱羧反应 CAS is a division of the American Chemical Society. 84 Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved.
新内容 spectra from Wiley ~51,000 NMR spectra ( 1 H, 13 C, 19 F, 29 Si, and 31 P) in early October ~139,000 NMR spectra ( 1 H, 13 C, 19 F, and 31 P) in 4Q12 Additional spectral data increases ability to characterize and assess purity of compounds. 85
提纲 SciFinder Web 使用常见问题和网络资源 86
SciFinder Web 常见问题 并发用户数已满, 请稍后再试 CAS is a division of the American Chemical Society. 87 Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved.
SciFinder Web 常见问题 账号或密码错误, 请在 username 处填写, 截图, 并与图书馆联系 88
SciFinder Web 常见问题 任何需要反馈给图书馆的问题, 都请点击测试 IP 地址的链接 http://www.cas.org/cgi-bin/casip 将页面截图下来, 一并发给图书馆 并抄送给我 89
自主学习平台 -------Learning solution https://cas.cyberu.com/ SciFinder - 不可或缺的内容, 准确无误的结果
SciFinder Web 网络在线资源平台 www.igroup.com.cn/cas 资源下载 :PDF 文件 在线演示 :Flash 演示 网络培训 : 不定期的网络专题培训 CAS is a division of the American Chemical Society. 91 Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved.
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