SciFinder Web使用介绍 俞靓 SciFinder培训专员

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Transcription:

SciFinder Web 使用培训 刘衍兰 SciFinder 培训专员 2015.5

提纲 介绍 SciFinder Web 中的内容 SciFinder Web 中的新功能 SciFinder Web 中的检索和后处理 SciFinder Web 中的文献记录及主题检索 SciFinder Web 中的物质结果及物质检索技巧 SciFinder Web 中的反应检索及 SciPlanner 功能 SciFinder Web 检索注意事项 2

美国化学文摘社 Chemical Abstract Service 创建于 1907 年 ACS 的分支机构 密切关注, 索引和提炼着全球化学相关的文献和专利 最早创立了 化学文摘 总部坐落于俄亥俄州的哥伦布市 3

SciFinder 的覆盖内容 CAS REGISTRY SM >9500 万有机无机物质 >6500 万生物序列 >4 亿条实验和预测数据 物质报道文献, 回溯到 1802 年 每天更新 References References from CAplus SM >3900 万期刊, 专利, 学位论文记录. >1 万种科技期刊的覆盖 63 家专利发行机构的专利 1997 年以来的 3.65 亿条引文记录 回溯到 1800 年 每天更新 References from MEDLINE > 1900 万条生命科学相关文献 > 5600 期刊 回溯到 1946 年 每天更新 Markush Structures >100 万专利中的 Markush 结构 回溯到 1961 年 每天更新 CHEMLIST 全球范围内的法规信息 >30.8 万的化合物 1980 至今的数据 每周更新 SciFinder Reactions CASREACT CAS 提供的反应信息包含 : 反应中的结构信息 反应中所有物质的 CAS No 详细的反应条件 实验过程 >5760 万单步多不反应 >1350 万物质合成制备信息 反应回溯到 1840 反应条件起始于 2003 每天更新 CHEMCATS CHEMCATS 提供物质的供应商信息 >7500 万商业信息 >2600 万不同种类物质 >880 个全球范围内的供应机构 >1,005 商品目录的覆盖 每周更新 4

提纲 介绍 SciFinder Web 中的内容 SciFinder Web 中的新功能 SciFinder Web 中的检索和后处理 SciFinder Web 中的文献记录及主题检索 SciFinder Web 中的物质结果及物质检索技巧 SciFinder Web 中的反应检索及 SciPlanner 功能 SciFinder Web 检索注意事项 5

Non-Java 结构面板 6

SciFinder 和 ChemDraw 整合 7

PatentPak- 自动的专利流程工具 1. 主要专利机构的可检索的专利全文 2. 链接到多语种的专利族原文 3. 定位专利中化合物出现的页码 4. 专利中的化合物进行 SciFinder 检索 8

提纲 介绍 SciFinder Web 中的内容 SciFinder Web 中的新功能 SciFinder Web 中的检索和后处理 SciFinder Web 中的文献记录及主题检索 SciFinder Web 中的物质结果及物质检索技巧 SciFinder Web 中的反应检索及 SciPlanner 功能 SciFinder Web 检索注意事项 9

SciFinder 中的文献记录 一篇完整的文献界面包括 : 1. 题录信息 2. 摘要信息 3. 文献中重要的概念 4. 文献中重要的物质 5. 书目信息 6. 获得文献中的物质, 反应, 引文等 7. 文献中的引文信息 10

SciFinder 中的文献检索方法 功能方面 主题检索 作者名检索 机构名检索 文献标示符检索 从物质, 反应获得文献 检索方法推荐 关注某特定领域的文献 - 主题检索 关注物质有关的文献 - 先获得物质, 再获得文献 关注某科研人员的文献 - 作者名检索 11

SciFinder Web 中的主题检索 主题 :Biodegradation of cellulose( 纤维素生物降解 ) 使用介词 (of, with, in) 来连接关键词 12

主题检索的候选项 concept 表示做了同意词的扩展 closely associated with one another 表示同时出现在一个句子中 present anywhere in the reference 表示同时出现在一段话中 13

SciFinder 中的文献检索结果及后处理 文献分析 限定工具 系统分类工具 SciFinder 提供强大的文献处理工具, 帮助处理文献 14

SciFinder 提供的引文排序 Citing Reference 15

SciFinder 中的 Analyze 领域内主要研究人员, 专家 主要研究机构, 合作伙伴, 竞争对手 主要出版杂志, 机构, 潜在投稿期刊 16 16

SciFinder 中的 Analyze- Index Term 索引词 (Index Term): 可以帮助我们对文献的内容进行大致的了解 17

SciFinder 中的 Refine 出版年限限定 : 获取 2010 年至今的最新文献信息 18

SciFinder 中的 Categorize Categorize 系统分类功能, 基于 Index Term, 对文献依学科方向进行分类 19

SciFinder 中的 Categorize 一级目录 二级目录 和二级目录相关 的 Index Term 选中的 Index Term 纤维素酶 20

SciFinder 中的 KMP 随时跟踪科研最新进展 题目 设置有效期 设置提醒频率 21

结果集的保存 Export: Citation manager: 保存成 RIS 格式, 用于导入 EndNote 等文献管理工具 Offline Review: 保存过成 PDF,RTF 格式, 用于脱机浏览 Save: 保存在服务器上, 可登陆后查看 22

SciFinder 主题检索小结 关键词的选择以及关键词用介词连接 候选项选择含有 concept 和 closed associated with 的选项 使用 citing reference 排序可以获得被引用次数最多的文献 使用 KMP 功能跟踪科研进展 使用 Analyze, Refine 和 categorize 进行后处理 结果集的保存 23

提纲 介绍 SciFinder Web 中的内容 SciFinder Web 中的新功能 SciFinder Web 中的检索和后处理 SciFinder Web 中的文献记录及主题检索 SciFinder Web 中的物质结果及物质检索技巧 SciFinder Web 中的反应检索及 SciPlanner 功能 SciFinder Web 检索注意事项 24

SciFinder 中的物质结果界面 一个完整的物质结果界面包含 : 物质详情连接 文献连接 反应连接 商品信息连接 管制品信息连接 谱图连接 实验性质连接 25

SciFinder 中的物质检索方法 功能方面 物质名称,CAS No 分子式 结构式 理化性质 推荐的物质检索功能 有机物, 天然产物及衍生物 --- 结构比较方便 无机物 --- 分子式比较方便 高分子化合物 --- 首先分子式, 其次结构 26

物质名称检索 直接输入物质的名称,CAS No, 俗名, 都能检索, 一次最多检索 25 个物质, 用换行换开 27

理化性质检索 28

分子式检索 SciFinder 中的分子式的检索, 需要按照 HILL 排序方式输入, 简单来说,CH 写前面, 其他的按照字母顺序写 29

Tabular Inorganic Substance 检索 检索 AL0.33Fe0.07Mg0.67(CO3)0.02(CN)0.43(OH)2 分子式检索的检索式 :C N.C O3. Al. Fe. HO. Mg 30

结构式检索 31

SciFinder 结构绘制工具 铅笔元素周期表可变基团重复基团工具碳链工具选择工具环锁定工具旋转工具正电子 橡皮常用基团 R 基团定义工具可变位置连接工具模版工具索套选择工具原子锁定工具镜面旋转工具 C 原子和单键恢复工具 结构和反应切换功能 结构检索选择 单双键,RS 构型, 不确定键定义工具 负电子 常见环, 多元环工具 32

精确结构检索案例 检索丙烯酸丁脂和丙烯酸羟乙酯作为单体的聚合物信息 33

34

检索结果集 35

案例研究 对某一结构进行改造, 看是否有更好的新结构 36

Substructure Search 用于检索结构的修饰物 这些物质的核心结构都和母核一致, 只是多了些修饰 37

Atom Attachment 直接限定感兴趣的修饰位点 对支链 O 的修饰研究 对苯环对位修饰研究 对特定位点的修饰了解, 帮助了解该位点都已经有了什么类型的修饰研究, 便于开创新的修饰结构, 也可配合文献调研, 获得与构效关系有关的判断 38

Similarity Search 用于检索结构的类似物 结构都存在相似性, 但是又和原结构有不同的地方 39

提纲 介绍 SciFinder Web 中的内容 SciFinder Web 中的新功能 SciFinder Web 中的检索和后处理 SciFinder Web 中的文献记录及主题检索 SciFinder Web 中的物质结果及物质检索技巧 SciFinder Web 中的反应检索及 SciPlanner 功能 SciFinder Web 检索注意事项 40

SciFinder Web 中的反应记录 1. 反应分组功能 2. 反应排序功能 3. 反应后处理功能 4. 反应全景及实验过程 5. SciPlanner 41

SciFinder 中的反应定义工具 反应箭头 反应角色工具 反应原子标记工具 反应位置标记工具 反应官能团列表 42

反应精准性定义工具 原子标记工具 原子标记工具标记反应前后必须匹配的原子, 主要用于反应中心的定义 43

反应精准性定义工具 键标记工具 键标记工具, 用于标记反应过程中必须发生变化的键 44

SciFinder 反应检索 Allow variability only as specified: 仅在特定位点发生变化 Substructure: 亚结构检索, 允许有更多取代情况 45

反应检索界面 46

精确反应检索结果 47

Group by Document 按照出处文献分类显示 来自同一篇文献的反应都被整合到一起并集中显示 48

Group by Transformation 按照反应类型分类显示 同一类反应被整合到一起并以通式结构集中显示 ; 仅适用于单步反应, 未被分类的反应显示在结果集最后 49

获得有实验步骤的反应结果集 50

反应结果集的分析限定工具 反应分析类型 : 作者姓名 出版语言 催化剂 出版年代 机构名称 反应步数 文献类型 产率 期刊名称 试剂 实验步骤 溶剂 反应的限定功能 : 反应式产率反应步数反应类型排除的反应类型不参与反应的基团 51

Sciplanner- 反应路线设计, 创建反应路线报告 案例 : 氟康唑合成路线设计 52

检索结果编辑平台 鼠标直接拖拽至编辑平台 53

选择感兴趣的中间体的反应路线并发送到 Sciplanner 54

55

将相同的物质拖动到一起进行重叠 56

获取反应相关文献 57

选择文献信息发送到 SciPlanner 58

添加相应的文献信息 59

检索结果的保存与导出 Export 功能输出反应路线报告 60

检索结果内容 1. 反应路线信息 2. 反应条件信息 61

3. 反应物质信息 62

提纲 介绍 SciFinder Web 中的内容 SciFinder Web 中的新功能 SciFinder Web 中的检索和后处理 SciFinder Web 中的文献记录及主题检索 SciFinder Web 中的物质结果及物质检索技巧 SciFinder Web 中的反应检索及 SciPlanner 功能 SciFinder Web 检索注意事项 63

SciFinder Web 的注册和登陆 SciFinder Web 的系统要求 Windows 用户支持 IE 9.x 或者 FireFox 2.x Mac 用户支持 Firefox 和 Safari Java 安装 ( 初次使用结构时自动安装, 建议安装 Java 7) 鉴于 360 浏览器以及 360 安全卫士会对 SciFinder 的使用造成一定的影响, 建议大家最好不要使用 360 浏览器 64

SciFinder Web 网络在线资源平台 www.igroup.com.cn/cas 资源下载 :PDF 文件 在线演示 :Flash 演示 网络培训 : 不定期的网络专题培训 65

Comprehensive Content Sophisticated Analysis Unprecedented Results Thank You 刘衍兰 SciFinder 培训专员 Mail:tony@igroup.com.cn QQ 答疑 : 516761793 66