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1 中 国 农 业 科 学 用 标 记 比 较 亚 洲 栽 培 稻 与 普 通 野 生 稻 的 遗 传 多 样 性 朱 作 峰 孙 传 清 付 永 彩 张 培 江 王 象 坤 中 国 农 业 大 学 植 物 遗 传 育 种 系 北 京 市 作 物 遗 传 改 良 重 点 实 验 室 北 京 安 徽 省 农 业 科 学 院 水 稻 研 究 所 合 肥 摘 要 用 对 引 物 比 较 了 份 不 同 生 态 型 的 栽 培 稻 和 份 不 同 省 区 的 普 通 野 生 稻 简 称 的 遗 传 多 样 性 发 现 在 条 多 态 性 带 中 有 栽 培 稻 特 异 带 条 普 通 野 生 稻 特 异 带 条 栽 培 稻 与 普 通 野 生 稻 的 差 异 主 要 来 自 野 生 稻 栽 培 稻 和 普 通 野 生 稻 的 平 均 基 因 多 样 性 分 别 为 和 每 一 位 点 在 栽 培 稻 中 的 等 位 基 因 平 均 为 而 在 野 生 稻 中 平 均 为 栽 培 稻 中 的 等 位 基 因 数 仅 为 野 生 稻 的 野 生 稻 材 料 间 的 平 均 遗 传 距 离 为 远 大 于 栽 培 稻 品 种 之 间 的 说 明 野 生 稻 的 遗 传 多 样 性 大 于 栽 培 稻 此 外 籼 稻 品 种 与 粳 稻 品 种 之 间 的 平 均 遗 传 距 离 也 明 显 大 于 籼! 粳 亚 种 内 品 种 间 的 遗 传 距 离 表 明 籼 粳 分 化 是 亚 洲 栽 培 稻 遗 传 分 化 的 主 流 聚 类 分 析 结 果 表 明 标 记 既 能 较 好 地 将 栽 培 稻 与 野 生 稻 分 开 又 能 较 好 地 进 行 籼 粳 稻 的 分 类 关 键 词 亚 洲 栽 培 稻 普 通 野 生 稻 遗 传 多 样 性 2 2 ƒ ( Δεπαρτ μ εντ οφ Πλαντ Γε νετιχσ αν δ Βρεε δι ν γ, Χηινα Αγριχυλτυραλ Υ νιϖερσιτψ / Βειϕινγ Κεψ Λαβορατορψ οφ Χροπ Γενετιχ Ι μ προϖε μ ε ντ, Βειϕινγ ; Ριχε Ρεσεαρχη Ινστιτυτε, Ανηυι Αχαδε μ ψ οφ Αγριχυλτυραλ Σχιενχεσ, Ηεφει ) Ορψζα σατιϖα Ο. ρυφιπογον Ησ 2 野 生 稻 由 于 长 期 处 于 野 生 状 态 经 受 各 种 自 然 灾 害 和 环 境 的 选 择 具 有 抗 病! 抗 虫! 抗 逆 以 及 雄 性 不 育 等 大 量 优 良 基 因 是 水 稻 遗 传 改 良 的 重 要 遗 传 资 源 研 究 野 生 稻 的 遗 传 多 样 性 对 于 野 生 稻 的 保 护 和 拓 宽 栽 培 稻 遗 传 基 础 具 有 重 要 意 义 孙 新 立 等 研 究 了 份 栽 培 稻 和 份 中 国 普 通 野 生 稻 的 同 工 酶 基 因 多 样 性 发 现 普 通 野 生 稻 的 遗 传 多 样 性 高 于 栽 培 稻 而 籼 稻 大 于 粳 稻 分 子 标 记 技 术 具 有 不 受 基 因 表 达 的 时 空 限 制 和 环 境 条 件 影 响 等 优 点 应 用 广 泛 王 振 山 等 利 用 对 引 物 和 ƒ 标 记 对 中 国 个 普 通 野 生 稻 自 然 群 体 和 栽 培 稻 的 遗 传 多 样 性 进 行 了 研 究 得 出 粳 稻 起 源 于 中 国 境 内! 野 生 稻 基 因 多 样 性 主 要 来 源 于 群 体 内 占 的 结 论 等 用 个 ƒ 探 针 分 析 了 收 稿 日 期 2 2 作 者 简 介 朱 作 峰 2 男 山 东 济 南 人 在 读 博 士 研 究 生 研 究 方 向 为 水 稻 杂 种 优 势 机 理 2 通 讯 作 者 为 孙 传 清 2 2

2 中 国 农 业 科 学 卷 来 自 中 国 江 西 东 乡! 云 南 元 江! 广 西 桂 港 个 普 通 野 生 稻 自 然 群 体 的 遗 传 多 样 性 发 现 即 使 是 在 与 栽 培 稻 隔 离 较 好 的 普 通 野 生 稻 自 然 群 体 内 也 存 在 遗 传 多 样 性 等 用 ƒ 研 究 了 亚 洲 栽 培 稻 和 普 通 野 生 稻 的 遗 传 多 样 性 发 现 野 生 稻 的 遗 传 多 样 性 大 于 栽 培 稻! 籼 稻 大 于 粳 稻 在 检 测 的 个 位 点 上 的 等 位 基 因 数 栽 培 稻 约 为 野 生 稻 的 随 机 分 布 的 标 记 在 水 稻 染 色 体 上 广 泛 而 均 匀 标 记 技 术 具 有 多 态 性 高! 稳 定 性 好 操 作 方 便 等 特 点 在 遗 传 多 样 性 分 析! 种 质 鉴 定! 指 纹 图 谱 的 构 建! 基 因 定 位 以 及 分 子 标 记 辅 助 育 种 等 研 究 领 域 广 泛 应 用 笔 者 用 标 记 对 份 中 国 普 通 野 生 稻 和 份 栽 培 稻 的 遗 传 多 样 性 进 行 初 步 探 讨 进 一 步 研 究 中 国 普 通 野 生 稻 的 遗 传 分 化! 分 类 及 其 遗 传 多 样 性 1 材 料 与 方 法 1 1 供 试 材 料 份 来 自 中 国 个 不 同 省 区 的 普 通 野 生 稻 表 和 份 来 自 不 同 国 家 和 地 区 的 栽 培 稻 表 表 1 野 生 稻 来 源 及 编 号 编 号 来 源 编 号 来 源 编 号 来 源 广 西 广 西 广 西 广 西 广 西 广 西 广 西 江 西 广 西 广 东 江 西 广 东 广 东 江 西 广 东 广 东 湖 南 广 西 广 西 广 西 云 南 广 西 云 南 云 南 广 西 云 南 广 西 广 西 广 西 江 西 广 西 广 西 广 西 广 西 表 2 栽 培 稻 品 种 及 来 源 编 号 品 种 名 来 源 编 号 品 种 名 来 源 水 源 韩 国 辽 宁 水 源 韩 国 辽 宁 密 阳 韩 国 关 东 糯 日 本 密 阳 韩 国 特 青 号 广 东 美 国 美 国 2 美 国 明 恢 福 建 ƒ 美 国 水 源 韩 国 美 国 密 阳 韩 国 美 国 美 国 辽 宁 美 国 零 轮 湖 南 美 国 盐 粳 江 苏 美 国 辽 宁 美 国 辽 宁 非 洲 辽 宁 非 洲 辽 宁 非 洲 沈 农 辽 宁 非 洲 辽 盐 号 辽 宁 非 洲 中 作 北 京 湖 南 中 作 北 京 北 京 津 稻 天 津 培 矮 湖 南 花 天 津 北 京 中 作 北 京 辽 宁 津 稻 天 津 辽 宁 晚 三 湖 南 东 农 黑 龙 江 中 浙 江 美 国

3 期 朱 作 峰 等 用 标 记 比 较 亚 洲 栽 培 稻 与 普 通 野 生 稻 的 遗 传 多 样 性 1 2 方 法 提 取 按 等 人 的 法 扩 增 反 应 及 聚 丙 稀 酰 胺 凝 胶 电 泳 检 测 Λ 反 应 体 系 中 含 引 物 Λ # Λ Λ 含 # Λ 酶 Λ # Λ Λ # Λ 模 板 ε 预 变 性 个 循 环 每 循 环 ε ε 各 引 物 所 用 的 退 火 温 度 根 据 推 荐 设 置 ε 最 后 ε 延 伸 扩 增 产 物 在 聚 丙 烯 酰 胺 凝 胶 上 分 离 用 硝 酸 银 染 色 选 择 分 布 于 水 稻 条 染 色 体 上! 扩 增 效 果 较 好 的 对 引 物 表 进 行 统 计 分 析 表 3 检 测 的 位 点 及 其 在 栽 培 稻 和 野 生 稻 中 的 等 位 基 因 数 位 点 染 色 体 等 位 基 因 数 栽 培 稻 野 生 稻 位 点 染 色 体 等 位 基 因 数 栽 培 稻 野 生 稻 数 据 统 计 与 分 析 每 对 引 物 检 测 个 位 点 视 每 条 多 态 性 带 为 个 等 位 基 因 将 观 测 到 的 每 条 带 视 为 个 性 状 有 此 带 时 赋 值 为 / 0 无 此 带 时 赋 值 为 / 0 每 份 材 料 间 的 遗 传 差 异 按 的 方 法 求 算 遗 传 距 离 即 ξψ ξ ψ 式 中 ξ 和 ψ 分 别 为 Ξ 和 Ψ 两 材 料 的 总 片 段 数 ξψ 为 两 材 料 的 公 共 片 段 数 根 据 所 得 的 遗 传 距 离 用 法 进 行 聚 类 分 析 并 绘 制 树 状 图 遗 传 多 样 性 评 价 多 态 位 点 的 平 均 等 位 基 因 数 Απ Απ Ε Απι/ νπ 式 中 Απι 为 第 ι 个 多 态 位 点 上 的 等 位 基 因 数 νπ 为 所 检 测 的 多 态 位 点 的 总 数 平 均 基 因 多 样 性 Ησ Ησ = 1 1/ ν Ε θ 2 ιϕ 式 中 θιϕ 为 第 ι 个 位 点 第 ϕ 个 等 位 基 因 的 频 率 ν 为 检 测 的 位 点 数 2 结 果 与 分 析 2 1 栽 培 稻 与 野 生 稻 的 遗 传 多 样 性 比 较 个 标 记 总 共 检 测 到 条 多 态 性 带 其 中 仅 在 栽 培 稻 中 出 现 的 有 条 占 仅 在 普 通 野 生 稻 中 出 现 的 有 条 占 因 此 栽 培 稻 与 普 通 野 生 稻 的 差 异 主 要 来 自 野 生 稻 栽 培 稻 和 普 通 野 生 稻 的 平 均 基 因 多 样 性 分 别 为 和 每 一 位 点 在 栽 培 稻 中 的 等 位 基 因 变 幅 为 个 平 均 为 而 野 生 稻 中 的 为 个 平 均 为 栽 培 稻 中 的 等 位 基 因 数 仅 为 野 生 稻 的 由 此 可 见 无 论 是 平 均 基 因 多 样 性 和 单 个 位 点 的 等 位 基 因 数 均 说 明 中 国 普 通 野 生 稻 遗 传 多 样 性 大 于 栽 培 稻 2 2 聚 类 分 析 根 据 求 遗 传 距 离 用 法 对 所 有 材 料 进 行 聚 类 分 析 并 绘 制 成 树 状 图 图 由 图 可 看 出 所 有 的 供 试 材 料 可 大 致 分 为 两 群 即 野 生 稻 群 和 栽 培 稻 群 其 中 份 栽 培 稻 分 为 个 亚 群 其 中 来 自 韩 国 的 水 源! 密 阳 系 统 的 品 种 及 中 国 的 特 青! 晚 三! 中 等 南 方 早! 中 籼 品 种 聚 为 籼 稻 亚 群 来 自 非 洲 和 美 国 的 光 壳 稻 聚 为 一 类 并 且 与 东 北! 华 北 等 地 的 粳 稻 处 于 粳 稻 亚 群 培 矮!! 及 等 籼 粳 中 间 型 聚 为 一 类 在 份 普 通 野 生 稻 中 广 西 普 通 野 生 稻!! 和 广 东 的 与 籼 稻 亚 群 近 而 广 西 普 通 野 生 稻! 及 广 东 的!

4 中 国 农 业 科 学 卷 ƒ 图 30 对 引 物 对 34 份 普 野 和 52 份 栽 培 稻 的 聚 类 分 析 树 状 图 Ο.ρυφιπογον Ο.σατιϖα

5 期 朱 作 峰 等 用 标 记 比 较 亚 洲 栽 培 稻 与 普 通 野 生 稻 的 遗 传 多 样 性 与 粳 稻 亚 群 较 近 其 它 普 通 野 生 稻 聚 在 两 个 亚 群 中 其 中 江 西 普 通 野 生 稻!!! 等 份 材 料 聚 在 一 起 而 来 自 云 南 的!! 在 聚 类 图 中 的 位 置 也 很 近 而 且 都 位 于 普 通 野 生 稻 群 中 以 上 结 果 表 明 标 记 既 能 较 好 地 区 分 栽 培 稻 与 野 生 稻 也 能 将 栽 培 稻 中 的 籼 粳 分 开 份 广 西 普 通 野 生 稻 和 份 广 东 普 通 野 生 稻 在 个 群 中 都 有 分 布 这 表 明 广 东 和 广 西 普 通 野 生 稻 的 分 化 程 度 较 深 刻 已 发 生 不 同 程 度 的 籼 粳 分 化 而 云 南! 江 西 和 湖 南 的 普 通 野 生 稻 都 分 布 在 普 通 野 生 稻 群 中 而 且 江 西 的 普 通 野 生 稻 和 云 南 的 普 通 野 生 稻 各 自 距 离 较 近 为 尚 未 发 生 籼 粳 分 化 的 原 始 型 这 与 孙 传 清 等 用 ƒ 标 记 对 供 试 材 料 的 的 研 究 结 果 基 本 一 致 从 由 不 同 材 料 间 的 遗 传 距 离 表 可 以 看 出 野 生 稻 材 料 间 的 平 均 遗 传 距 离 为 远 大 于 栽 培 稻 品 种 之 间 的 平 均 遗 传 距 离 也 说 明 野 生 稻 之 间 的 差 异 大 于 栽 培 稻 品 种 之 间 的 差 异 另 外 籼 稻 品 种 与 粳 稻 品 种 之 间 的 平 均 遗 传 距 离 也 明 显 大 于 籼! 粳 亚 种 内 品 种 间 的 遗 传 距 离 用 标 记 再 次 证 明 籼 粳 分 化 是 亚 洲 栽 培 稻 遗 传 分 化 的 主 流 表 4 不 同 材 料 间 平 均 遗 传 距 离 普 通 野 生 稻 内 Ο.ρυφιπογον 栽 培 稻 内 Ο.σατιϖα 栽 培 稻 与 野 生 稻 间 Ο.ρυφιπογον Ο.σατιϖα 籼 亚 种 内 粳 亚 种 内 籼 粳 间 3 讨 论 平 均 遗 传 距 离 与 其 野 生 祖 先 普 通 野 生 稻 相 比 栽 培 稻 的 基 因 多 样 性 下 降 杂 合 度 降 低 等 位 基 因 数 减 少 笔 者 检 测 野 生 稻 与 栽 培 稻 在 个 位 点 上 的 遗 传 多 样 性 差 异 发 现 栽 培 稻 的 等 位 基 因 数 约 为 野 生 稻 的 先 前 笔 者 曾 检 测 了 野 生 稻 和 栽 培 稻 的 个 ƒ 位 点 得 到 栽 培 稻 的 等 位 基 因 数 约 为 野 生 稻 的 的 结 果 等 通 过 对 同 工 酶 进 行 研 究 也 发 现 栽 培 稻 的 等 位 基 因 数 约 为 野 生 稻 的 不 同 标 记 的 研 究 结 果 相 互 支 持 由 此 可 以 初 步 得 出 栽 培 稻 的 等 位 基 因 约 为 野 生 稻 的 的 结 论 也 说 明 从 野 生 稻 中 发 掘 当 前 育 种 急 需 的 高 产! 优 质! 多 抗! 广 适 新 基 因 具 有 巨 大 的 潜 力 本 研 究 与 笔 者 以 前 用 ƒ 标 记 检 测 遗 传 多 样 性 的 结 果 基 本 一 致 相 对 ƒ 标 记 标 记 能 较 好 地 区 分 不 同 生 态 型 的 水 稻 品 种 此 外 与 ƒ 相 比 基 于 技 术 的 标 记 技 术 不 仅 操 作 简 便 而 且 经 济 实 用 更 有 利 于 标 记 辅 助 选 择 的 实 施 水 稻 全 基 因 组 测 序 的 完 成 将 发 现 更 多 的 引 物 为 野 生 稻 种 质 资 源 的 研 究 与 利 用 提 供 强 有 力 的 工 具 Αχτα Γε νετιχ Σινιχα 孙 新 立 才 宏 伟 王 象 坤 水 稻 同 工 酶 基 因 多 态 性 及 非 随 机 组 合 现 象 研 究 遗 传 学 报 ƒ ϑουρ2 ναλοφ Αγριχυλτυραλ Βιοτεχηνολογψ 王 振 山 朱 立 煌 刘 志 勇 王 象 坤 野 生 稻 天 然 群 体 限 制 性 片 段 长 度 多 态 性 ƒ 研 究 农 业 生 物 技 术 学 报 ± Οριγιν ανδ Διφφερ2 εντιατιον οφ Χηινεσε Χυλτιϖατε δ Ριχε ± Ορψζα ρυφιπογον Ο.σατιϖα ƒ Τηε2 ορ. Αππλ. Γενετ. Μολ. Γεν. Γενετ. 2 Πλαντ Μολεχυλαρ Βιολογψ Μαννυαλ Μολεχυλαρ Εϖολυτιοναρψ Γενετιχ Σχι. Βυλλ. Υνιϖ. Κανασ ± 2 Σχιεντια Αγριχυλτυρα Σινιχα 孙 传 清 王 象 坤 普 通 野 生 稻 和 亚 洲 栽 培 稻 核 基 因 组 的 ƒ 分 析 中 国 农 业 科 学 Ορψζα ϑπν. ϑ. Γενετ

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